如何用NCBI和uniprot数据库查找目的蛋白的氨基酸序列或目的基因的碱基序列(mRNA序列)

运用NCBI数据库查找目的蛋白序列或目的碱基序列

第1种方法

1.打开NCBI官网，并选择Gene菜单，如下图。

2.在搜索栏内输入想要查找的蛋白名称或基因名称，此处以基因RSK2为例，如图。

3.在搜索结果中查找目的蛋白，注意Description栏会标明物种信息，以human为例，Aliases 栏会列出目的蛋白的各种别名。

4.在Searchresult页面中点击你要找的蛋白名称（Name/Gene ID），进入页面并在页面找到“”“NCBI Reference Sequences (RefSeq)”条目，并在其子条目中找到“mRNA and Protein(s) ”，查找mRNA碱基序列点击NM，查找蛋白氨基酸序列点击NP，以下以查找mRNA碱基序列为例如下：

点击NM-004586.2进入页面后如下：

在页面下方会列出mRNA的序列：

第2中方法

1.进入Uniplot数据库，在搜索栏中直接输入要查找的基因或蛋白名称，如下图：

2.进入以下页面：

3.在搜索结果Entry name栏中会列出不同物种选项，且会有Protein names及Gene names，点击所要选择物种蛋白，进入以下页面。

4.点击页面页面左侧的Sequence栏，并找到Sequence databases，其下面表格中有RefSeq i，其中包含NP及NM。

5.此处以查找mRNA为例，点击NM，页面会跳转至NCBI的查找页面，如下：