分子生物学第六章:DNA损伤与修复

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分子生物学基础-RNA的生物合成和损伤修复

分子生物学基础-RNA的生物合成和损伤修复

A-T,G-C
A-U,T-A,G-C
21
目录
第一个内容
参与转录的主要物质
The reagent of transcription
22
目录
一、转录模板
• 结构基因:能转录出RNA的DNA区段 • 不对称转录(asymmetric transcription):
在DNA双链分子上,一股链可转录,另一股链 不转录
26
目录
DNA聚合酶在启动DNA链延长时需要引 物存在,而RNA聚合酶不需要引物就能 直接启动RNA链的延长。
RNA聚合酶和DNA的特殊序列——启动 子(promoter)结合后,就能启动RNA合成。
27
目录
核心酶 (core enzyme) 全酶 (holoenzyme)
28
目录
真核生物的RNA聚合酶
调控序列
结构基因
5
RNA-pol
3
3
5
30
目录
调控序列中的启动子是RNA聚合酶结合模 板DNA的部位,也是控制转录的关键部位。 原核生物以RNA聚合酶全酶结合到DNA的 启动子上而起动转录,其中由σ亚基辨认启 动子,其他亚基相互配合。
对启动子的研究,常采用一种巧妙的方法
即RNA聚合酶保护法。
31
茎环(stem-loop)/发夹(hairpin)结构
46
目录
RNA-pol
5
3
3
5
5pppG
茎环结构使转录终止的机理
• 使RNA聚合酶变构,转录停顿; • 使转录复合物趋于解离,RNA产物释放。
47
目录
第三个内容 真核生物的转录过程
The Process of Transcription in Eukaryote

分子生物学 6 DNA 损伤、修复和重组

分子生物学 6 DNA 损伤、修复和重组

吖啶橙、原黄素、吖黄素等吖啶类染料 嵌合到DNA碱基对之间 base addition /deletion / frameshift mutation
DNA损伤(DNA damage)
自发损伤: 脱氨基/ 脱嘌呤 外源损伤: 1. 氧化损伤 (需氧细胞) 活性氧:超氧化物,过氧化氢和羟自由基(· OH) 8-氧鸟嘌呤,2-氧腺嘌呤,5-甲酰尿嘧啶 2. 烷基化损伤 影响DNA复制和转录时的解旋 多数是间接诱变 3. 加成损伤 嘧啶二聚体 苯并芘(肝脏细胞色素P-450) 双环氧物-G 芳基化试剂 黄曲霉毒素B1(肝致癌剂)
DNA损伤、修复和重组
突变和突变发生
(mutation and mutagenesis) DNA损伤(DNA damage) DNA修复(DNA repair) 重组(recombination)
突变概念
突变(mutation) DNA分子碱基序列的可遗传改变 突变体(mutant) 与野生型(+)相对 突变剂(mutagen) 突变发生(mutagenesis) 自发突变(spontaneous mutation) 诱发突变(induced mutation)
突变类型 1. DNA碱基序列改变的多少 单点突变(point mutation) 碱基替换(base substitution) 转换(transition) A-T G-C 颠换(transversion)A-T T-A 碱基增加(base addition) 碱基删除(base deletion) 多点突变(multiple mutation)
BER
5' 3' UvrABC 3' 5' 3' 5' Pol I (或δ和ε) 5' 3' DNA glycosylase 5' 3' AP内切核酸酶 5' 3' 进一步酶切

DNA损伤检测和修复的分子生物学机制

DNA损伤检测和修复的分子生物学机制

DNA损伤检测和修复的分子生物学机制DNA是我们身体内最重要的生物大分子之一,它携带着我们的遗传信息,控制着身体的生长和发育。

然而,DNA分子可以受到各种外界因素的损伤,包括紫外线、化学污染、放射性物质等等。

一旦DNA受到损伤,就可能引发突变、基因失活以及肿瘤的发生。

因此,及时检测和修复DNA损伤是维持人体健康的重要过程。

在这篇文章中,我们将讨论DNA损伤检测和修复的分子生物学机制。

DNA损伤检测我们的细胞可以通过一系列分子信号来检测DNA损伤。

在DNA分子发生突变或者受到损伤的时候,会激活一些细胞内的信号传导通路,从而产生一系列生物学响应。

其中最重要的信号通路之一便是ATM/ATR通路。

在这个通路中,ATM 和ATR是两个重要的检测分子,它们可以在DNA损伤发生后,通过检测DNA损伤信号的强度和类型,来调节DNA损伤的修复过程。

ATM/ATR通路的检测过程包含了多个重要的分子。

首先,是ATM和ATR两种蛋白激酶,它们会在DNA受损后被激活。

其次,便是Chk1和Chk2两种蛋白激酶。

这两种酶分别是由ATM和ATR激活的,在细胞中起到了重要的调节作用。

最后,还有p53蛋白,它是受到ATM/ATR通路调节的另一个主要靶标。

当DNA 损伤信号被检测到时,p53蛋白会被激活,并且会通过调节细胞周期进程和细胞凋亡,来控制细胞的增殖和生长。

DNA损伤修复一旦DNA损伤信号被检测到,细胞会启动DNA修复机制,去修复受损的DNA分子,从而保证DNA信息的完整性。

DNA损伤修复包含了多个不同的过程和机制,其中最为重要的是以下几种:1.同源重组修复同源重组修复是一种非常常见的DNA修复方式。

这种方式依赖于细胞内的同源性染色体,在DNA损伤修复时会使用同源染色体的相同部分来修复受损的DNA分子。

这样,细胞可以快速而准确地修复受损的DNA分子,避免产生突变和基因缺失。

2.核切修复核切修复是一种精细的DNA修复方式。

这种修复方式依靠细胞内的多个酶类,来扫描和修复受损的DNA分子。

分子生物学第5章、第6章

分子生物学第5章、第6章

•DNA分子内或分子间发生遗传信息的重新组合,称为 遗传重组,或基因重排。→ 重组DNA •真核生物基因组间重组多发生在减数分裂时同源染 色体之间的交换;细菌及噬菌体的基因组为单倍体, 来自不同亲代两组DNA之间可通过多种形式进行遗传 重组。 •DNA重组对生物进化起着关键的作用。 •重组分类:同源重组(homologous recombination) 、 位点特异性重组(site-specific recombination)、 转座重组(transposition recombination)和 异常重组(illegitimate recombination)。
1. 互变异构体:碱基发生烯醇式-酮式互变异构或者氨 基-亚氨基互变异构时,使碱基错配。 2. 脱氨基作用:碱基上氨基自发脱落,或在诱变剂的 作用下脱去氨基,则C→U、A →I、G →X,引起子 链错误。 3. DNA聚合酶“打滑”:DNA复制时发生碱基的环出现 象,引起一个或数个碱基的插入或缺失,易发生于 几个相同碱基串联的部位。 4. 活性氧(O3)引起的诱变:①氧化碱基与C、A配对, 造成GC → TA颠换,这种损伤可以积累;②H2O2造成 的DNA氧化损伤,此类损伤一般能被修复。
核苷酸切除修复
错配修复
错配修复对 DNA复制忠实 性的贡献力达 102-103,DNA 子链中的错配 几乎完全都被 修正,充分反 映了母链的重 要性。
大肠杆菌甲基化引 导的错配修复
重组修复
易错修复和SOS反应
•SOS反应:当DNA损伤广泛难以继续复制时,由此而
诱发出一系列复杂的反应。
•这种修复特异性低,对碱基的识别、选择能力差。
5.3.4 基因突变的后果
基因突变的后果主要是生物功能的丧失。 某一基因突变后使其所表达的蛋白质或酶失活, 有时还会引起多种酶的缺乏。 有些突变可产生功能获得性显性表现型。 典型的人体细胞突变每个基因每代发生率为107~10-5,但并非所有的突变都会导致疾病。

分子生物学中的DNA复制与修复

分子生物学中的DNA复制与修复

分子生物学中的DNA复制与修复DNA(脱氧核糖核酸)是生物体内一种十分重要的分子,它承担着遗传信息的传递和保存。

DNA的复制和修复是研究生物基础学科中的重要课题,了解它们的机理有助于加深对生命活动的理解,因此也是分子生物学中的重要研究内容之一。

一、DNA复制DNA复制是一个生物体内的基本过程,它可以维持基因的传递和遗传信息的稳定,也是生物体繁殖和细胞分裂所必须的过程之一。

在DNA复制过程中,一条DNA分子通过特定的酶和蛋白质进行复制,生成两条完全相同的DNA分子。

DNA分子为双螺旋结构,由两条互补的单链组成,每个单链上的碱基可以与对应的互补碱基形成两个碱基之间的氢键,稳定这种双链结构。

在复制过程中,DNA酶会解开双链结构,连接到单链上,根据互补规则,以已有的单链为模板,合成新的单链。

当DNA酶复制分子到达等待复制的区域时,就会分解双链结构,将合成新的合成链与原始链分开,直到整个链复制完成。

DNA复制是生命体内一项重要的细胞功能,它至关重要地影响着生物体的发育和演化。

在此过程中,DNA分子负责遗传信息的传递和保存,保证生物体传递其基因和重要生命活动所需的信息。

同时,由于环境因素的不断变化,DNA的基因组也需要不断更新,使生物体适应新的环境并延续生命活动的时间。

二、DNA修复DNA复制在生物体内是高度正常的过程,但是有时DNA分子会受到来自环境因素的损伤,如辐射,化学物质等,而这些损伤可能导致修改,删除或添加DNA分子上的碱基,从而破坏其信息质量。

为了维持良好的基因组,并减少生物体感染癌症和其他疾病的风险,生物体必须有一套完善的DNA修复机制,帮助修复和保护DNA分子。

DNA修复主要包括四种机制:直接修复,错配修复,核苷酸切除修复和复制损伤绕过修复。

直接修复是指从DNA分子中去掉已损坏的碱基,在基因组中填补一个缺口。

错配修复是指在生物体细胞复制过程中的错误出现,导致DNA发生错误匹配的情况,而错配修复可以帮助纠正这些错误。

医学分子生物学 DNA的损伤和修复

医学分子生物学 DNA的损伤和修复

42
43
(四)、错配修复
错配修复碱基来源:校正活性所漏校的碱基
使复制的保真性提高102~103倍
错配修复 系统(MRS Mismatch Repair System)
+ ----- A----- ------C--DNA mismatch
DNApol (ξ = 10-8) 经第二次校正ξ = 10-11 44
CTC GAG
镰形红细胞贫血病人Hb (HbS) β亚基 肽链 N-val · ·leu · · · · his thr pro val glu ······ C 基因
CAC GTG
18
(三) DNA链断裂

磷酸二酯键的断裂和脱氧戊糖的破坏是引起DNA链断
裂的直接原因。

碱基的破坏和脱落在DNA链上形成的不稳定位点是
5
紫外线的致损伤作用 ∧ ---嘧啶二聚体 (TT dimer )
…C T T A…
U.V.
6
(二)自由基致DNA损伤

自由基:指能够独立存在,核外带有未配对电子的
原子和分子。

自由基的产生可以是外界因素与体内物质共同作用
的结果。

自由基可导致碱基、核糖、磷酸基的损伤,引起DNA
的结构和功能异常。
37
后复制修复、E.coli的挽回系统
E.coli 存活%
w.t. UvrA+ RecA+
uvr arec aU.V 计量
该 系 统 存 在 的 实 验 证 据
38
★ Rec-A. gene 以某种方式参与DNA损伤修复
♦ Rec修复系统比切除修复系统更有效 ♫ Uvr系统负责切除二聚体 ♫ Rec系统负责消除没有被切除的二聚体 可能造成的后果

细胞的DNA损伤与修复

细胞的DNA损伤与修复

揭示生命活动规律和疾病发生机制
阐明细胞周期调控与DNA损伤修复的关系
细胞周期调控机制确保DNA在复制和分裂前得到完整修复,从而维持基因组的稳定性。
揭示遗传性疾病的发生机制
基因突变或DNA损伤修复缺陷可能导致遗传性疾病的发生,如癌症、神经退行性疾病等 。
探究环境因素对DNA损伤的影响
紫外线、化学物质、辐射等环境因素可能导致DNA损伤,进而诱发疾病。
02
伦理与社会问题
关注基因隐私、基因歧视等伦理和社会问题,制定合理的 法律法规进行规范。
03
未来发展方向
深入研究DNA损伤修复的分子机制和网络调控,探索新的 治疗策略和方法;加强跨学科合作,推动基础研究与临床 应用的转化;关注新兴技术如人工智能、单细胞测序等在 DNA损伤修复研究中的应用前景。
THANKS
在DNA损伤识别过程中,可能会存在一些误差来源,如损伤感应蛋白的 误识别、信号传导途径的异常激活等。
这些误差可能会导致修复过程的不准确或延迟,从而增加细胞突变和癌 变的风险。
因此,细胞需要采取一系列措施来减少这些误差的发生,如通过冗余机 制确保损伤识别的准确性、通过负反馈机制避免信号传导途径的过度激 活等。
化学物质
许多化学物质如烷化剂、交联剂等能与DNA发生反应,导致DNA 结构改变和功能丧失。
氧化应激
细胞内活性氧物质过多可引发氧化应激反应,导致DNA氧化损伤 。
细胞周期调控在DNA修复中作用
01
细胞周期检查点
细胞周期检查点可识别DNA损伤并阻止细胞进入下一个周期阶段,为
DNA修复提供时间。
02
DNA修复与细胞周期的关系
特定DNA修复过程发生在细胞周期的特定阶段,如G1/S期、G2/M期

DNA的损伤、修复和突变

DNA的损伤、修复和突变

图5-6 烷基化碱基的直接修复
5.1.2.2 切除修复
先切除受损的碱基或核苷酸,重新合成正常的核苷酸, 再经连接酶重新连接,前后经历识别、切除、重新合成和重 新连接四步。 由于这些酶的作用不需可见光激活,也叫暗修复。切除 修复不仅能消除由紫外线引起的损伤,也能消除由电离辐射 和化学诱变剂引起的其他损伤。切除修复一般发生在下一轮 DNA复制之前,又称复制前修复。 切 除 修 复 分 为 碱 基 切 除 修 复 (BER) 和 核 苷 酸 切 除 修 复 (NER)。BER直接识别具体的受损碱基,识别的标记是受损碱 基的化学变化,而NER识别损伤对DNA双螺旋结构造成的扭 曲。BER中还有一类专门修复DNA复制中产生错配碱基对的 机制,称为错配修复(MMR)。
相同的DNA也只有一对,如果DNA的损伤或遗传信息的改变 不能更正,对体细胞就可能影响其功能或生存,对生殖细胞
则可能影响到后代。
DNA损伤的后果
DNA 修复机制
短期效应
生理功能紊乱 细胞死亡 异常增生和代谢
基因表达异常 细胞增殖减少 基因组不稳定
信号传导异常
长期效应
老化 肿瘤 疾病
所以在进化过程中生物细胞所获得的修复DNA损伤 的能力就显得十分重要,也是生物能保持遗传稳定性之 奥秘所在。 在细胞中能进行修复的生物大分子也就只有DNA, 反映了DNA对生命的重要性。 另一方面,在生物进化中突变又是与遗传相对立统 一而普遍存在的现象,DNA分子的变化并不是全部都能 被修复成原样的,正因为如此生物才会有变异、有进化。
③去除损伤。2个切口之间的带有损伤的DNA片段被去
除。 ④填补缺口。由DNA聚合酶完成。
⑤缝合切口。由DNA连接酶完成。
核苷酸切除修复(NER)主要用来修复导致DNA结

DNA损伤与修复

DNA损伤与修复
• 线粒体的氧化损伤: 单链断裂、双链断裂、碱基修饰、 DNA交联、 烷化损伤
• 线粒体的损伤修复: 碱基切除修复、错配修复
.
48
DNA 修复
•维持 DNA序列的保真性; •可在复制前后进行; •有多种修复机制来纠正DNA损伤; •DNA 修复失败可能导致突变和肿瘤。
.
49
细胞周期检查点控制
真核生物细胞DNA受到损伤时细胞除了诱导 修复基因的转录外,还可暂时阻断细胞周期, 防止受损DNA继续复制,如无法修复,则可诱 导细胞进入凋亡。这些都是细胞通过细胞周期 检查点控制(checkpoint control,又称关卡 控制)对DNA损伤的应答反应。
.
44
RecA-P的三种功能
a、 DNA 重组活性 b、 与S.S. DNA结合活性 c、 少数蛋白的proteinase活性
当DNA正常复制时 (无复制受阻,无DNA损伤, 无TT dimer) RecA-p不表现proteinase活性
.
45
当DNA复制受阻/ DNA damaged
细胞内原少量表达的RecA-p
• 3.皮肤和眼对日光敏感。
• 4.病情随年龄逐渐加重,多数患者于20岁前因恶 性肿瘤而死亡。
• 5.组织病理 晚期出现表皮非典型性增生、日光角
化及鳞癌和基底细胞癌等. 恶性肿瘤。
61
着色性干皮病患儿脸部特征
.
62
着色性干皮病背部,
着色性干皮病组织切片
.
63
着色性干皮 病的并发症
.
64
着色性干皮病的治疗
• 导致DNA断链: 磷酸二酯键上的氧被烷基化 • 导致DNA链交联
.
11
碱基类似物、修饰剂对DNA的改变

DNA损伤修复的分子机制与应用

DNA损伤修复的分子机制与应用

DNA损伤修复的分子机制与应用DNA损伤是指DNA分子遭受到物理、化学和生物因素等外界因素的损害,如紫外线、化学药物、离子辐射和自由基产生的氧化应激等。

如果DNA损伤不得到及时有效的修复,则可能导致细胞功能紊乱、突变或者甚至细胞凋亡,从而引起严重的疾病,如肿瘤、神经系统疾病或者免疫系统失调等。

因此,DNA损伤修复是生命过程中不可或缺的一环。

DNA损伤的分子机制DNA损伤修复是一个由复杂的分子和细胞机制组成的过程。

人类DNA损伤修复主要分为直接修复、碱基切除修复、核苷酸互补修复和非同源端连接修复四种机制。

这些机制将DNA损伤相对应的修复酶系统分为六大类。

1. 直接修复:直接修复是指在没有需要修复的物质的情况下,酶直接修复DNA底物。

人类DNA直接修复酶主要包括甲基转移酶(MTAs)和光降解酶(PHRs)两类。

2. 碱基切除修复:碱基切除修复是指在DNA序列中的碱基或核苷酸产生损害后,DNA内突变切除修复过程中需要将有缺陷的区域切除,然后进行新的碱基对替换的修复。

人类碱基切除修复系统主要包括DNA糖基酶(UDGs)、自旋壳豆菇碱基脱氧核酸(APE)和草酰胺-DNA-苏氨酸-肽酰酶(AGT)等。

3. 核苷酸互补修复:核苷酸互补修复主要用于对DNA两个链之间特定的断裂部位进行修复。

人类核苷酸互补修复包括自体DNA重联酶(LIG1或LIG3)、封闭解旋酶(PNKP)和糖基化链切割酶(APEX1)等。

4. 非同源端连接修复:非同源端连接修复常常用于因外源因素引起的DNA损伤或者双链DNA中存在的结构与修复。

这些损伤包括双链断裂和铂类药物所致的DNA结构。

重组蛋白C(XRCC4)、DNA终端连接酶(XLF)和 DNA依赖性蛋白激酶(DNA-PK)是人类非同源端连接修复的重要酶。

DNA损伤修复的应用DNA损伤修复的应用在医学、生物学、科技和工业等领域都具有重要意义。

其中,主要的应用有以下几个方面:1. 诊断:DNA损伤修复酶在DNA修复过程中发挥重要作用,其基因的缺失或突变可能导致遗传性疾病的发生。

《分子生物学》试卷(DNA损伤与修复)

《分子生物学》试卷(DNA损伤与修复)

《分子生物学》试卷(DNA损伤与修复)(课程代码)班级姓名学号一、名词解释(每小题﹡分,共﹡分)1.DNA 损伤2. 点突3.DNA修复4.核苷酸切除修复5.碱基切除修复6.重组修复7.错配修复8. 嘧啶二聚体9. AP位点10. 着色性干皮病二、单项选择题(从下列各题所给备选答案中选出一个正确的答案,并将其序号填在题干后的括号内。

1.腺嘌呤以亚氨基形式存在时,可以与配对 AA. 胞嘧啶B. 胸腺嘧啶C. 鸟嘌呤D. 次黄嘌呤E. 黄嘌呤2.胸腺嘧啶以烯醇式形式存在时,可以与配对C A. 腺嘌呤 B. 胞嘧啶 C. 鸟嘌呤 D. 次黄嘌呤 E. 黄嘌呤3.胞嘧啶以亚氨基形式存在时,可以与配对 BA. 胸腺嘧啶B. 腺嘌呤C. 鸟嘌呤D. 次黄嘌呤E. 黄嘌呤4.鸟嘌呤以烯醇式形式存在时,可以与配对 CA. 腺嘌呤B. 胞嘧啶C. 胸腺嘧啶D. 次黄嘌呤E. 黄嘌呤5. E.coli 错配修复过程中,识别错配核苷酸的是 EA. HelicaseB. RecJC. mut LD. mut HE. mut S6. E.coli错配修复过程中,在错配位点附近切断错配核苷酸所在的一条DNA链 DA. HelicaseB. RecJC. mut LD. mut HE. mut S7. DNA损伤修复机制中,主要修复可影响碱基配对而扭曲双螺旋结构的DNA损伤. CA. 错配修复B. 直接修复C. 核苷酸切除修复D. 碱基切除修复E. 重组修复8. DNA损伤修复机制中,主要针对DNA单链断裂和小的碱基改变. DA. 错配修复B. 直接修复C. 核苷酸切除修复D. 碱基切除修复E. 重组修复9. 紫外线照射使DNA 分子碱基之间形成二聚体, 其中最常见的形式是 DA. C-CB. C-TC. T-UD. T-TE. U-C10.E.coli核苷酸切除修复过程中,UvrA的作用是 AA. 识别损伤部位B. 解旋双链C. 3’末端内切D. 5’末端内切E. DNA合成11.E.coli核苷酸切除修复过程中,UvrD的作用是 BA. 识别损伤部位B. 解旋双链C. 3’末端内切D. 5’末端内切E. DNA合成12. 人类核苷酸切除修复过程中,在损伤点3’端切割DNA单链 DA. XPAB. RPAC. XPCD. XPGE. XPF-ERCC113. 人类核苷酸切除修复过程中,在损伤点5’端切割DNA单链 EA. XPAB. XPBC. XPCD. XPGE. XPF-ERCC114. 转录偶联核苷酸切除修复过程中,识别受损DNA EA. RNA聚合酶B. CSAC. CSBD. CSA/CSB复合物E. RNA聚合酶/CSA/CSB复合物15. DNA 双链断裂的感应因子是 AA. ATMB. ATRC. Chk1D. Chk2E. Cdc25A16.识别碱基改变的感应因子是 BA. ATMB. ATRC. Chk1D. Chk2E. Cdc25A三、多项选择题(从下列各题所给备选答案中选出一个或多个正确的答案,并将其序号填在题干后的括号内。

dna损伤和损伤修复的区别

dna损伤和损伤修复的区别

DNA损伤和损伤修复是细胞内发生的两个相关但不同的过程。

DNA 损伤指的是DNA分子上的结构或序列发生改变,可以由内外源因素引起,如化学物质、辐射、代谢产物等。

而DNA损伤修复则是细胞为了保持基因组的完整性和稳定性,而采取的一系列机制和途径来修复DNA损伤。

DNA损伤可以分为多种类型,包括碱基损伤、单链断裂、双链断裂等。

这些损伤会导致DNA分子的结构和相邻碱基之间的连接发生破坏,进而影响到DNA的正常功能。

DNA损伤的形成可能会导致细胞突变、凋亡甚至癌症等严重后果。

因此,细胞需要及时进行修复来保证DNA 的完整性和稳定性。

DNA损伤修复是一种高度保守的细胞机制,通过一系列复杂的过程来修复DNA损伤。

主要的修复机制包括:直接修复、错配修复、碱基切除修复和双链断裂修复等。

在直接修复中,细胞会利用酶类或其他分子直接还原、拆除或修复损坏的DNA结构。

错配修复主要用于修复碱基配对错误所导致的损伤,通过一系列酶的协同作用来修复错误的碱基配对。

碱基切除修复则是通过酶的作用将损伤的碱基切除,并由DNA合成酶填充新的碱基。

双链断裂修复是最复杂的修复机制,当DNA发生严重的双链断裂时,细胞会启动多个途径来修复断裂的DNA链。

DNA损伤修复的过程通常包括四个关键步骤:捕捉、识别、去除和替换。

首先,细胞会通过一些特定的蛋白质来捕捉和识别DNA上的损伤部位。

然后,这些蛋白质会协同作用,将受损的DNA部分切除或修复。

最后,DNA合成酶会填充缺失的碱基或连接两条断裂的DNA 链,以恢复DNA的完整性。

DNA损伤修复在维护基因组的稳定性和完整性方面起着重要的作用。

如果DNA损伤不能及时修复,可能会导致细胞周期停滞、突变的积累甚至细胞死亡。

此外,DNA修复缺陷也与许多遗传性疾病和癌症的发生相关。

总结起来,DNA损伤和损伤修复是细胞内密切相关的两个过程。

DNA 损伤指的是DNA分子上的结构或序列发生改变,而DNA损伤修复是细胞为维持基因组完整性而采取的一系列机制和途径。

DNA损伤和修复机制的分子生物学研究

DNA损伤和修复机制的分子生物学研究

DNA损伤和修复机制的分子生物学研究DNA是所有生命体的遗传物质,也是生物体内最重要的分子之一。

然而,DNA在生物体内难以避免地会受到各种损伤,如化学性质变化、放射性损害、缺少或错误的复制,以及各种物理性质的损害等等。

这些损伤会对DNA结构产生不同程度的影响,而当它们超过了人体细胞自身的修复能力时,就会引起一系列恶性病变的发生。

因此,人类长期以来一直在探索DNA损伤和修复机制的分子生物学研究,以期能够更好地理解DNA分子和其在生物体内的功能,从而提高人类医学的治疗和防治效果。

DNA损伤的种类和来源DNA损伤的种类繁多,主要包括:碱基失配、氧化损伤、单链断裂、双链断裂、化学损伤和放射性损伤等等。

这些损伤可能来自于生物的内部代谢过程,也可能来自于外部环境。

例如,紫外线、X射线、氧化压力、化学物质、烟草等都可以导致DNA分子的不同形式的损伤。

其中最常见的大概是碱基失配了,它是指一个DNA链的碱基顺序错误地被插入到了DNA链中。

DNA修复机制的分类在这些众多的DNA损伤中,人类细胞已经发展出了各种不同的DNA修复机制,以应对不同的损伤类型。

DNA修复分为5类:错配修复、碱基切除修复、直接修复、双链断裂修复和非同源修复。

每个类别的修复分为不同的路径,以应对不同程度的DNA损伤。

错误配对修复错配对修复(MMR)是一种在DNA双链中修复错误的碱基配对的过程。

MMR是在常规DNA复制中起作用的,在DNA合成时使错误的DNA配对被纠正。

MMR需要一些特殊的蛋白,它们可以检测错误的碱基匹配并将错配的碱基删除。

碱基切除修复碱基切除修复(BER)是一种修复单个损坏碱基的机制,它可以修复氧化、甲基化和甲基基化之类的DNA损伤。

BER需要利用DNA聚合酶,将一个翻译后面的碱基切除。

这些崩坏碱基之后,DNA聚合酶可以将氧化的碱基切除,然后该处遗失的碱基会被一个基碧替换,修复DNA链。

直接修复直接修复,顾名思义,是直接修复DNA链上出现的损伤,而不是切除损伤。

DNA损伤和修复的分子机制和生物学功能研究

DNA损伤和修复的分子机制和生物学功能研究

DNA损伤和修复的分子机制和生物学功能研究DNA是构成生命的基本物质,在细胞内掌控着生命的活动。

然而,由于环境因素、代谢过程及细胞自身的复制等原因,DNA容易遭受外界损伤,对细胞、组织和器官的正常化功能产生影响。

因此,维持DNA的完整性对保持细胞和生物体的正常生命活动至关重要。

DNA损伤与修复的分子机制和生物学功能一直是科学家研究的热门领域。

DNA损伤的种类及产生原因DNA损伤的种类繁多,包括单链断裂、双链断裂、补体交叉连接、碱基缺失、碱基修饰、核苷酸诱变等。

它们的产生原因也有很多,如环境因素(紫外线、辐射、污染物等)、热应激、代谢产物(如羟自由基等)和细胞内自身复制产生的错误等。

DNA损伤与人类疾病损伤的DNA会导致细胞分裂失控和突变等重要的生物学变化,可能引起多种疾病,如肿瘤、衰老、神经退行性疾病等。

因此,研究DNA损伤和修复机制对于预防和治疗诸如癌症等疾病具有重要意义。

DNA损伤的修复机制DNA损伤后怎样修复?人体的细胞拥有许多复杂但精细的DNA修复机制,主要包括:直接反式修复、单切修复、碱基切除修复、重联修复和错配修复等。

每种修复途径在细胞内有着不同的作用,能对各种类型的DNA损伤采取特异性的修复策略。

不同的DNA修复机制相互配合,构成了一个复杂的修复网络,有效保障了细胞DNA的完整性。

DNA修复的生物学功能DNA损伤和修复机制一直是分子生物学、生物化学、毒理学、生理学和生物医学等领域的研究热点,也在许多前沿学科和交叉学科中得到广泛应用。

1. 对于基本理论的推进具有重要意义研究DNA损伤和修复机制能推进DNA修复生物学的基本理论,并揭示DNA 损伤和修复机制与细胞周期调控、基因表达和染色质结构等方面的联系,进而拓展了生物学的全局认识。

2. 在工业污染物、辐射、致癌物等危害物质的防护方案中有重要应用DNA损伤与修复机制也在日常保健和职业安全中有重要的应用价值。

通过对各种污染物如辐射、化学物质等产生的影响进行研究,制定出一系列的防护方案,有效保证了人们的生命健康。

分子生物学复习资料-绝对重点

分子生物学复习资料-绝对重点

分子生物学复习资料(第一版)一名词解释1 Southern blot / Northern blot—DNA斑迹法 / RNA转移吸印技术。

是为了检测待检基因或其表达产物的性质和数量(基因拷贝数)常用的核酸分子杂交技术。

二者均属于印迹转移杂交术,所不同的是前者用于检测DNA样品;后者用于检测RNA样品。

2 cis-acting element / trans-acting factor—顺式作用元件 / 反式作用因子。

均为真核生物基因中的转录调控序列。

顺式作用元件是与结构基因表达调控相关、能被基因调控蛋白特异性识别和结合的特定DNA序列,包括启动子和上游启动子元件、增强子、反应元件和poly(A)加尾信号。

反式作用因子是能与顺式作用元件特异性结合、对基因表达的转录起始过程有调控作用的蛋白质因子,如RNA 聚合酶、转录因子、转录激活因子、抑制因子。

3VNTR / STR—可变数目串联重复序列 / 短串联重复。

均为非编码区的串联重复序列。

前者也叫高度可变的小卫星DNA,重复单位约9~24bp,重复次数变化大,变化高度多态性;后者也叫微卫星DNA,重复单位约2~6 bp,重复次数约10~60次,总长度通常小于150bp 。

(参考第7题)4 viral oncogene / cellular oncogene—病毒癌基因 / 细胞癌基因。

病毒癌基因指存在于逆转录病毒中、体外能使细胞转化、体内能导致肿瘤发生的基因;细胞癌基因也叫原癌基因,指存在于细胞内,与病毒癌基因同源的基因序列。

正常情况下不激活,与细胞增殖相关,是维持机体正常生命活动所必须的,在进化上高等保守。

当原癌基因的结构或调控区发生变异,基因产物增多或活性增强时,使细胞过度增殖,从而形成肿瘤。

第1 页/共16 页5 ORF / UTR—展开阅读框 / 非翻译区。

均指在mRNA中的核苷酸序列。

前者是特定蛋白质多肽链的序列信息,从起始密码子开始到终止密码子结束,决定蛋白质分子的一级功能;后者是位于前者的5'端上游和3'端下游的、没有编码功能的序列,主要参加翻译起始调控,为前者的多肽链序列信息改变为多肽链所必须。

分子生物学中的DNA修复机制

分子生物学中的DNA修复机制

分子生物学中的DNA修复机制DNA修复是维持细胞遗传信息稳定性的重要过程,它能够修复DNA分子在复制或受损过程中产生的错误和损伤,以保证细胞的正常功能和生存。

DNA修复机制是一个复杂而精密的系统,包括多个互相协作的修复途径。

本文将重点介绍几种重要的DNA修复机制。

一、错配修复(Mismatch Repair)错配修复是一种纠正DNA复制过程中产生的碱基配对错误的机制。

在细胞中,错配修复主要通过识别新合成的DNA链与模板链之间的不匹配碱基进行修复。

这个过程依赖于一组特定的酶,包括错配修复酶(MutS、MutL和MutH)等。

这些酶能够识别不匹配的碱基对,并切割出错误的碱基,然后由DNA聚合酶和DNA连接酶进行修复,最终恢复正确的碱基配对。

二、核苷酸切除修复(Nucleotide Excision Repair)核苷酸切除修复是一种修复DNA链上存在的各种损伤和修复DNA中的致突变因子的机制。

在核苷酸切除修复过程中,损伤部位周围的DNA序列被切除,然后由DNA聚合酶和DNA连接酶进行修复。

核苷酸切除修复主要通过两个亚型来完成,分别是全局基因组核苷酸切除修复(Global Genomic NER)和转录耦合核苷酸切除修复(Transcription-Coupled NER)。

全局基因组核苷酸切除修复主要修复细胞中非转录区域的DNA损伤,而转录耦合核苷酸切除修复主要修复转录区域的DNA损伤。

三、双链断裂修复(Double-Strand Break Repair)双链断裂修复是一种修复DNA双链断裂的机制。

DNA双链断裂是一种严重的DNA损伤,如果不及时修复,会导致细胞死亡或致癌。

双链断裂修复主要包括非同源末端连接(Non-homologous End Joining,NHEJ)和同源重组(Homologous Recombination,HR)两种机制。

NHEJ是一种快速但不精确的修复方式,它直接连接两个断裂的DNA末端,不需要同源序列。

【遗传学结课论文】DNA损伤与修复

【遗传学结课论文】DNA损伤与修复

中国农业大学课程论文(2012-2013学年秋季学期)论文题目: DNA 损伤与修复课程名称: 遗传学 任课教师: 朱登云 郭岩班 级: 生物111班学 号: *********** 名:***DNA损伤与修复摘要 DNA—作为生物体生存及繁衍的重要遗传信息—对于生物体的正常生存至关重要。

基因组的稳定性经常会受到DNA 损伤的威胁.,然而,高度致密的染色质结构却极大地妨碍了DNA 修复的进行。

因此,真核生物细胞中必须有一套精确的机制来克服染色质这一天然的屏障。

因此,在长期的进化中,生物体演化出了若干机制来修复因为各种内外因素而发生的DNA损伤。

本文主要介绍了目前已知的四种诱变机制并着重阐述其对应的五种主要的DNA损伤修复机制,最后对DNA损伤修复机制在生物学和医学领域的应用进行了展望关键词 DNA 损伤修复表观遗传学一、引言DNA储存着生物体赖以生存和繁衍的遗传信息,因此维护DNA分子的完整性对细胞至关紧要。

外界环境和生物体内部的许多因素都经常会导致DNA分子的损伤或改变。

如果DNA的损伤或改变不能被修复,将影响细胞乃至生物体的生存。

所以细胞修复DNA损伤的能力十分重要。

DNA损伤是指在生物体生命过程中DNA双螺旋结构发生的任何非正常改变。

其中因自然条件引起的突变称为自发突变(spontaneous mutation),其突变频率很低(约为10-6-10-10)。

另外一种为因存在诱变剂(mutagen)导致的DNA损伤,因突变率相比于自发突变较高,常作为生物学及医学领域研究的重要对象及材料。

主要诱变作用机制有4种:碱基类似物(base analog);碱基修饰物(base modifier);嵌入染料(intercalating dye);紫外线(ultraviolet)。

针对DNA损伤,生物体在长期进化过程中,也获得了对DNA损伤的修复功能。

目前已知的DNA损伤修复机制大致有5种:直接修复——修复嘧啶二聚体或甲基化DNA;切除修复——切除突变的碱基或核苷酸片段;错配修复——恢复错配;重组修复——复制后的修复,越过损伤部位重新启动停滞的复制叉;SOS修复——紧急修复,导致变异。

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48
4.直接插入嘌呤
DNA链上嘌呤的脱落造成无嘌呤位点,能被
DNA嘌呤插入酶(insertase)识别结合,并在K+
存在下催化游离的嘌呤碱基或脱氧核苷与DNA无
嘌呤部位形成糖苷键。且催化插入的碱基有高
度专一性、与另一条链上的碱基严格配对,使
DNA完全恢复。
49
三、碱基切除修复(Base
Excision Repair,BER)
35
第二节
错配修复
DNA修复
DNA的修复主要类型:
直接修复
切除修复 重组修复 跨损伤修复 (SOS修复)
36
一、错配修复
在DNA复制过程中, DNA聚合酶能够利用
其3ˊ一5ˊ外切核酸酶活性去除错配核苷酸,但
是这种校正作用并不十分可靠, 某些错配核苷酸
可能逃避检测, 出现于新合成的DNA链中。 错
胞嘧啶
O6-乙基鸟嘌呤 胸腺嘧啶
25
(一)烷化剂对DNA的损伤 2.碱基脱落 烷化鸟嘌呤的糖苷键不稳定,容易脱 落形成DNA上的无碱基位点,复制时可以 插入任何核苷酸,造成序列的改变。
26
(一)烷化剂对DNA的损伤
3.断链
DNA链的磷酸二酯键上的氧也容易被 烷基化,结果形成不稳定的磷酸三酯键, 易在糖与磷酸间发生水解,使DNA链断裂。
不识别任何特殊的碱基损失,而是识 别双螺旋形状的改变;修复时切除含有损 伤碱基的那一段 DNA。
54
55
56
核苷酸切除修复 (大肠杆菌)
紫外线诱导uvrA、 uvrB、uvrC和uvrD 四种基因表达
UvrA:识别损伤 部位 UvrB:解旋双链
57
UvrC:
5ˊ末端内切
UvrB: 3ˊ末端内切
27
(一)烷化剂对DNA的损伤
4. 交联 烷化剂有两类, 一类是单功能基烷化剂,如甲基甲烷碘酸,只能 另一类是双功能基烷化剂,如化学武器氮芥、硫
使一个位点烷基化; 芥等,一些抗癌药物如环磷酰胺、苯丁酸氮芥、丝裂
霉素等,某些致癌物如二乙基亚硝胺等均属此类,其 两个功能基可同时使两个位点烷基化。
Production of thymine dimer by ultraviolet light irradiation.
17
皮肤因受紫外线照射而形成二聚体的频率
可达每小时5×104/细胞,紫外线不能穿透皮
肤,因此损伤只局限在皮肤中。此外,紫外线 照射还能引起DNA链断裂等损伤。
18
(二) 电离辐射引起的DNA损伤
75
常见的DNA损伤及其修复机制
DNA损伤因素
X射线、氧自由基 、烷化剂 自发脱碱基
DNA损伤类型
修复机制
单链断裂、无碱基位点、氧化性 碱基切除修 碱基(如8-氧鸟嘌呤)尿嘧啶 复
紫外线和多环芳烃 环丁烷嘧啶二聚体等大的紫外线 核苷酸切除 光产物和稳定的多环芳烃化合物 修复 等大分子DNA加合物
抗癌药(如顺铂和 双链断裂和链间交联 丝裂霉素)
mut S 扫描新生链中错配碱基 mut L 激活内切核酸酶mutH mut H 识别非甲基化DNA链; 酶切含错配碱
基的DNA区段
38
错配修复
39
Mis-paired bases
错配修复
(大肠杆菌)
40
错配修复(大肠杆菌)
41
2. 真核细胞错配修复机制
42
43
44
错配修复 (人)
45
58
UvrD:解 旋酶
59
60
核苷酸切除修复 (基因组修复–人)
61
核苷酸切除修复 (转录偶联修复 -人类)
62
GGR 和TCR的共同修复通路
63
64
五、重组修复
大肠杆菌重组修复
65
五、重组修复
根据 DNA 末端连接需要的同源性分为: 同源重组:需要多种蛋白参与,在减数分裂、细胞
有丝分裂后期S/G2期起主要作用。
非同源末端连接:DNA分子之间不需要广泛的同源
性,主要是在免疫球蛋白重组时对DNA双链进行连接,
在细胞有丝分裂G1/G0期起主要作用。
66
同源重组修复DNA双链断裂(人)
67
非同源末端连接修复DSB
68
六、 SOS修复
正在复制的DNA聚合酶可能遇到尚未修复的 DNA损伤,例如胸腺嘧啶二聚体或无嘌呤位 点,复制体必须设法跨越损伤进行复制,或 者被迫暂停复制。即使细胞不能修复这些损 伤,自动防故障系统能够使复制体绕过损伤 部位,这一机制就是跨损伤DNA合成。
第六章
DNA损伤与修复
DNA damage and repair
汤 立 军 中南大学生物科学与技术学院 分子生物学研究中心
1
哺乳动物细胞DNA损伤的发生频率
2
3
4
第一节 DNA损伤的原因及后果
烷化剂 复制错误 紫外线 碱基类似物 碱基脱落或部分脱落 电离辐射 修饰剂 活性氧族 物 化 自 理 学 发 因 因 性 素 素
环(cyclobutane ring)连成二聚体,其中最容易形成
的是T-T二聚体。二聚体导致复制不能进行。
15
16
O
H N CH3 H N
O
CH3
UV
H N
O
CH3 CH3
O
H N
O
N
Thymine
H
O
N
Thymine
H
O
N O
4 5 5 6 6
H O
4
H
dimer
N
O
Thymine
3 2 1
Fig. 21-
32
பைடு நூலகம்
3. 插入(insertion)指一个或一段核苷酸插入DNA链。 4. 倒位或转位(transposition) 指DNA链重组使其中 一段核苷酸链方向倒臵、或从一处迁移到另一处。
5. DNA断裂
33
34
突变或诱变对生物可能产生4种后果: ①致死性; ②丧失某些功能; ③改变基因型(genotype)而不改变表现型 (phenotype); ④发生有利于物种生存的结果,使生物进化。
黄曲霉素B (攻击碱基)
30
DNA 损伤类型
碱基脱落 碱基修饰 & 去氨基化 链内交联 DNA-蛋白质 交联 DNA链断裂
DNA 重组
31
四、DNA损伤的后果
DNA损伤后分子最终改变,有以下几种类型:
1. 点突变(point mutation) DNA链上单一碱基的
变异。嘌呤替代嘌呤(A与G之间的相互替代)、嘧啶 替代嘧啶(C与T之间的替代)称为转换(transition) ;嘌呤变嘧啶或嘧啶变嘌呤则称为颠换 (transvertion)。 2. 缺失(deletion) DNA链上一个或一段核苷酸消失。
配修复系统能够发现和修复这些错配核苷酸。
37
1. E.coli错配修复机制
错配修复系统组成(Mismatch repair system)
DNA腺嘌呤甲基化酶(m6A甲基化酶) 解旋酶 Helicase 、SSB、外切核酸酶 (Ⅰ、Ⅶ、X和 RecJ)、DNA polymerase Ⅲ、连接酶
MCE (mismatch correct enzyme)
双链断裂修 复(同源重 组修复和末 端连接)
错配修复 76
复制错误和烷化剂 碱基错配和缺失(插入)
The End
77
着色性干皮病患儿脸部特征
78
着色性干皮病背部
着色性干皮病组织切片
二、直接修复
1. DNA断裂口直接修复 在 DNA 5ˊ -P 端和 3ˊ -OH端未受损伤的 情况下,连接酶能够直接修复DNA的断裂口。
46
2. 光复合酶直接修复二聚体
47
3. 直接修复烷基化碱基 O6-甲基鸟嘌呤甲基转移酶。 甲基从DNA转移至烷基转移酶上,已经甲基化 的酶不能再转变为非甲基化酶,因此,此种修复又 称为该酶的自杀性修复。
(apurine,
apyrimidine site,
AP)。
11
复制时可以插入任何核苷酸。 脱落碱基后的脱氧核糖3ˊ端的磷酸二酯 键易被水解,造成DNA链断裂。 在哺乳动物细胞基因组中,每天每个细 胞因N-糖苷键自发水解约丢失10 000个 嘌呤碱基和200个嘧啶碱基。
12
4.碱基修饰与链断裂
28
(二)
碱基类似物、修饰剂对DNA的损伤
人工合成的碱基类似物如5-溴尿嘧啶、5-氟尿嘧
啶、2-氨基腺嘌呤等,其结构与正常碱基相似,进入
细胞能替代正常碱基掺入到DNA链中而干扰DNA复制。
例如5-溴尿嘧啶的结构与胸腺嘧啶十分相近。
29
碱基类似物、修饰剂对DNA的改变
5-BrdU ( 5-BrdU-A; 5-BrdU-G) 酮式 烯醇式 亚硝酸盐能使C脱氨基变成U (C→U) 羟胺能使T脱甲基变成C (T→C)
指切除和替换由内源性化学物作用产生的 DNA碱基损伤, 是切除修复的一种。 受损碱基移除是由多个酶来完成的。 主要针对DNA单链断裂和小的碱基改变 及氧化性损伤。
50
51
52
碱基切除修复(人)
53
四、核苷酸切除修复
(nucleotide excision repair)
体内识别 DNA 损伤最多的修复通路。
MCI假说(mobile charge interaction) 直接与DNA分子链发生作用,作用的靶 点是DNA分子中移动的电子。
21
电离辐射引起DNA损伤的类型
产生-OH自由基,导致碱基变化 脱氧核糖分解
DNA链断裂 交联 包括DNA链交联和DNA-蛋白质交联
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