假单胞菌科 黄单胞菌属
植物病原细菌概述
2.布克氏菌属(Burkholderia)
布克氏菌属是由假单胞菌属中的rRNA第二组独立 出来的。
茄青枯布克氏菌(B.solanacearum)能引起多种作 物,特别是茄科植物的青枯病。
在组合培养基上形成光滑、湿润、隆起和灰白色 的菌落。
病菌的寄主范围很广,可以为害30余科,100多 种植物。病害的典型症状是全株呈现急性凋萎, 病茎维管束变褐,横切后用手挤压可见有白色菌 脓温出。
1.土壤杆菌(Agrobacterium)
土壤杆菌属是薄壁菌门根瘤菌科的一个成员,土壤习居菌、菌体 短杆状,单生或双生,鞭毛1—6根,周生或侧生。好气性,代谢 为呼吸型。革兰氏反应阴性,无芽孢。
营养琼脂上菌落为圆形、隆起、光滑,灰白色至白色,质地粘稠。 不产生色素。
大多数细菌都带有除染色体之外的另—种遗传物质,一种大分子 的质粒,它控制着细菌的致病性和抗药性等,如侵染寄主引起肿 瘤症状的质粒称为“致瘤质粒”(tomor inducine plasmid,俗称 为 Ti 质 粒 ) , 有 的 能 引 起 寄 主 产 生 不 定 根 的 “ 致 发 根 质 粒”(rhizogen inducine plasmid,比俗称Ri质粒)。
二、植物病原线虫的主要类型
1.粒线虫属(Anguina)
• 粒线虫属线虫大都寄生在禾本科植 物的地上部,在茎、叶上形成虫瘿, 或者破坏子房形成虫瘿。
• 粒线虫属至少包括l 7个种。模式 种为小麦粒线虫(A.tritici ),也 是该属最主要的植物病原线虫,引 起小麦粒线虫病,有时也危害黑麦。
病菌可以在土中长期存活,是土壤习居菌。病菌 可随土壤、灌溉水和种薯、种苗传染与传播。侵 染的主要途径是伤口,高温多湿有利发病。
(完整版)常见微生物的界、门、纲、目、科、属、种中英文对照
常见微生物界(Domain)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界(Domain)Bacteria细菌Archaea古生菌门(Phylum)Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型(α)变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目,红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目,球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科(family)Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科,叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科,产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科,红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科,冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科,互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属(Genus)Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。
黄单胞菌属的分类研究进展
黄单胞菌属的分类研究进展黄单胞菌属的分类研究进展郭亚辉(河北省邯郸农业高等专科学校05引起植物病害的细菌约有300多种,广义的细菌是原核生物界中引起各种植物病害的一类最大的群体.黄单胞菌属的所有种都是植物病原细菌,引起植物病害症状多为叶斑,叶枯,少数为萎蔫,溃疡.黄单胞菌属(Xa.thomo.a~)属于薄壁菌门,假单胞菌科,菌体短杆状,0.4--1.0×L2—3.0m,根极生鞭毛,严格好气性,革兰氏染色阴性.DNA中的G+C含最为63--71moi铀.细菌的分类地位和分类系统曾有过多次变动,迄今仍不完善.过去,黄单胞菌属的分类单一利用寄主的专化性划分种,即从一株寄主植物上分离到新的黄单胞菌菌株,便定为一个种,由此过多地命名了许多不适当的种.在第七版的伯杰氏手册中,黄单胞菌属包括125个种,但细菌分类学家认为这些种除了在致病的寄主范围和症状方面略有不同外,很少有细菌学方面的差异.在第八版的伯杰氏手册中,除保留5个种外,其它的病菌都安排在甘兰黑腐黄单胞菌下,称为不同的致病变种,这样,在甘兰黑腐黄单胞菌种内有120个致病变种,黄单胞菌属共有6个种.近年来,分子遗传学技术引入到细菌的分类中,分子遗传学技术包括G+Ctool嘶测定,DNDNA分子杂交,16sRNA寡聚核苷酸序列分析,核糖体蛋白的组成分析等多种分类方法.7l5.)/在黄单胞菌属的分类研究中,DNDNA分子杂交的方法用的较多.此方法的原理是提取细菌的DNA,在108~C高温下DNA分子的双链解离成单链状态(变性),待冷却到60—75℃时,其解离的单链又会互相结合(复性),重新形成双链的DNA.不同细菌的DNA混在一起令其变性后再复性,在重新结合成双链的过程中,不同细菌的DNA单链也能结合成双链,其结合率的高低随菌株的亲缘关系远近而定.Murata等最早采用DNA—DNA杂交试验对黄单胞菌属的分类进行研究,提出了50铀DNA结合值作为.种的命名依据. 后来,Schroth等广泛根据蛋白质PAGE, FAME,RFLP及rRNA谱型分析和DNA —DNA杂交实验结果,证明在油菜黄单胞菌种下的致病变种群体中存在异质性,认为黄单胞菌DNA同源值矩阵应作为属下种和致病变种重新分类的依据.1995年, L.V auterin用DNA—DNA杂交的方法对黄单胞菌属的183个菌株进行了分类分析,结合BiologGN微板分析自动系统的生理生化测定,将黄单胞菌株分为20个DNA基因组,而把对植物无致病能力的放在一组为未归类组,20个DNA基因组可以认为是20个种.同一基因组菌株之间DNA结合值水平较高,约为80一iO0嘶,而不同基因组菌株之间DNA结合值低于第4期郭亚辉:黄单胞菌属的分类研究进展515O%,所以,60—7O%DNA同源值可作6,.codiae变叶木黄单胞菌为黄单胞菌属内同种菌系的最低标准.7,.bramei雀麦黄单胞菌对于命名的更改,尽可能使其命名与8,.cucurbitd8瓜类黄单胞菌植物病理学名称相关,并且遵守国际细菌9,.axonopodis地罐草黄单胞菌学命名规砌,在来自不同寄主植物的致病l0,.oryzae水稻黄单胞菌变种构成一个新种的情况下,采用一个普ll,.vaSicola维管束黄单胞菌遍,通用的名称,如树生黄单胞菌为树术l2,.pisi豌豆黄单胞菌上的病原物.当新种不包括以前的油菜黄l3,.melonis甜瓜黄单胞菌单胞菌致病变种的代表菌株时,刚建议重l4,.sicat0r辣椒黄单胞菌新命名.’15,campe~frfs甘蓝黄单胞菌新的黄单胞菌分类系统的2O个种名如l6,.fran~l”c8s透明黄单胞菌下:l7,.hyacinthf风信子黄单胞菌1,.fragarae草毒黄单胞菌l8,.f8icola茶黄单胞菌2,.hortorum花草黄单胞菌lg.sacchari甘蔗黄单胞菌3,.populi杨树黄单胞菌20,.albilineans甘蔗白条黄单胞菌4,.arbolicola树生黄单晦菌21,.尚束归组黄单胞菌5,.caSavae木薯黄单胞菌(1j王大耜细菌分类基础科学出越社1977h~b:idizationasataxonomictoolfor[2)林万明细菌DNA中G+C含量测定和桉酸phytopath—ogenlcbacteria.JapsnAg分子杂置技术殛其在细菌分类鉴定中拘应用rlcultareResearchQnar(er~.yl975科学出版社分析微生物专辑73:549—553[3)任欣正主编植物病原细菌的分类和鉴定[6]V attterinL.Rec’~asslficationofXan一生国高等农业院校教材农业出发社1994thomonas,InternationalJoaraalof(4)林万明细菌分子遗传学分类鉴定注上海systematiecterio’.Ey,19997:科学技术出版社1990472—489(5)Mn~ataN,Improvs~DNA—DNA(上接59页)[1)张树政等社1984C2)谢舜珍等299--264[3)施巧琴等[4)豫家立等136一l42参考文献酶豁耕工业(下册)科学出版655—670微生物193986(3):微生物100292(6):真菌199314(2)[5)Ibrahim?C.0.etalAgIicBiolchum198791(8):2145—2191[6)黄建忠等工业微生物199525(3):1J8[T)MotoyasuJO.etal:.FermentThchnol1986.94(5):韩7—3T1(8)Okumara,S.etal:AgrieBioIthem,1978?40,655[9)孙万儒药物生物技水19993(4):238--245[1o)曹i鼠挂等生物化学与生物物理进展1895 22(1)lS--I3。
假单胞菌属菌落形态
假单胞菌属菌落形态
假单胞菌属是一类革兰氏阴性的细菌,通常具有典型的菌落形态。
以下是假单胞菌属常见的菌落形态特征:
1. 大小:假单胞菌属的菌落通常较大,直径可达1-2毫米。
2. 形状:假单胞菌属的菌落常呈圆形或半圆形。
3. 颜色:假单胞菌属菌落的颜色多样,通常为白色、黄色、橙色或绿色等。
4. 质地:假单胞菌属菌落质地较软,触摸时较松散。
5. 光泽:假单胞菌属菌落通常具有光滑的表面,呈半透明或透明状。
6. 边缘:假单胞菌属菌落的边缘较整齐,呈光滑或带状。
总体来说,假单胞菌属的菌落形态具有较大、圆形、多色、质地松散、颜色透明等特征。
但需要注意的是,不同的假单胞菌属菌株可能会有一定的差异,具体的菌落形态可能会略有不同。
因此,在鉴定假单胞菌属菌株时,需结合其他生理生化特征和分子生物学方法进行综合分析。
非发酵菌()
微生物检验
❖ 鉴定:氧化酶(-),明胶液化试验(+), 七叶苷(+),赖氨酸脱羧酶(+), 氧化分解葡萄糖。
药敏试验
❖ 含内酰胺酶。 ❖ 临床治疗首选磺胺类和奎诺酮类抗生素。 ❖ 对亚胺培南天然耐药 ❖ 不用K-b法做药敏试验。
嗜麦芽窄食单胞菌初步鉴定要点
❖ 在血平板和MAC上生长良好 ❖ 氧化酶(-) ❖ OF试验氧化型 ❖ 赖氨酸脱羧酶阴性 ❖ 可产黄色色素 ❖ 抗生素的敏感方式
黄杆菌属
❖ 3.存在于水、土壤和蔬菜中,还可从口腔、上呼 吸道、皮肤中检出,是条件致病菌,也是引起医 院感染的常见菌。可引起术后感染、菌血症、在 新生儿及婴幼儿的化脓性脑膜炎中分离出脑膜败 血性黄杆菌比例较高。
黄杆菌属
❖ 4. G-杆菌,需氧代谢,血琼脂培养基生长 良好,典型菌落为淡黄色,氧化酶、触酶、磷酸 酶阳性。
毛抗原。
❖抵抗力:耐潮湿、干燥、紫外线,不耐热和消
毒剂,临床分离的菌株多耐药。
铜绿假单胞菌检验
❖ 1.标本采集 按疾病和检查目的,分别采 取不同的标本:患
者的血液、脑脊液、胸(腹)水、脓液、分泌液、痰、 尿液、十二指肠引流液、粪便等;医院病区或手术 室的空气、水、地面、把手、医疗诊断器械及生活 用品。
检验程序
检验方法
❖直接镜检:G-杆菌
❖分离培养:在普通培养基生长良好,
经18—24h形成圆形、扁平隆起、湿润菌落。 琼脂被染成绿色或黄绿色,约80%-90% 产生绿脓素或荧光素。在血平板上表现为: 菌落大而扁平、湿润、边缘不齐;有金属 光泽;有生姜样芳香气味;菌落周围有宽 大的兰绿色透明溶血环。
❖ 抗原检测和分型:
微生物检验
❖ 分离培养:血平板形成圆形、灰白 色、光滑、边缘整齐、直径23mm的菌落。洛菲不动杆菌菌落 小,1-1.5mm。溶血不动杆菌可出 现溶血。MAC平板生长良好,鲍 曼不动杆菌可呈轻微红色。
假单胞菌属解析
尿、分泌物等临床标本可直接接种在血平板上,血液标本可先于 20℃~30℃进行增菌后再接种血平板分离。不能在35℃或37℃进行 培养,以免发生假阴性。本菌鞭毛3根以上,42℃不能生长,不产 生绿脓素,可以与铜绿假单胞菌相区别。本菌的最低鉴定特征有: 单端鞭毛3根以上,动力阳性;氧化分解葡萄糖,不分解麦芽糖, 氧化酶阳性,精氨酸水解阳性,明胶液化阳性;可产生荧光素, 不产生绿脓素,4℃生长,42℃不生长。
铜绿假单胞菌耐药机制的研究, 对监控医院内感染菌群、 检测其 耐药性、 指导抗生素的合理利用极为重要。同时, 由于铜绿假单 胞菌分布广泛, 可以推知其耐药机制在其他病原菌中也极可能广泛 存在, 对铜绿假单胞菌耐药机制的研究对其他许多病原菌的控制也 具有指导意义。
铜绿假单胞菌的耐药机理主要有 4 种, 一是产生抗生素灭活酶或 抗生素修饰酶; 二是改变抗菌药物的作用靶位, 逃避抗菌药物的抗 菌作用; 三是膜屏蔽与主动外排, 限制药物到达作用靶位; 四是形 成生物膜。
被检验的肉含有荧光假单胞菌
2.临床意义
荧光假单胞菌(P.fluorescens)存在于土壤和水等环境中,常与
食物(鸡蛋、血、牛乳等)腐败有关,可作为咽部的正常菌群存 在,是人类少见的条件致病菌,偶从泌尿道感染病人尿中分离出。 由于具有嗜冷性,可在冰箱储存血液中繁殖,若输入含有此菌的 血库血液,可导致病人不可逆性的休克而死亡。
铜绿假单胞菌-防治原则
加强一些特殊病房及检查室、诊疗器械的消毒管理。 避免医务人员与病人之间的交叉感染。 治疗过程中,应合理选择有效抗生素。
铜绿假单胞菌的耐药机制研究
铜绿假单胞菌常引起菌血症、肺炎、泌尿系统感染 烧伤感染和囊 性纤维化继发感染等疾病, 由于其耐药菌株不断产生, 耐药性不断 变化, 已成为医院内获得性感染最严重的条件致病菌之一。
假单胞菌属ppt课件
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被检验的肉含有荧光假单胞菌
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2.临床意义
荧光假单胞菌(P.fluorescens)存在于土壤和水等环境中,常与
食物(鸡蛋、血、牛乳等)腐败有关,可作为咽部的正常菌群存 在,是人类少见的条件致病菌,偶从泌尿道感染病人尿中分离出。 由于具有嗜冷性,可在冰箱储存血液中繁殖,若输入含有此菌的 血库血液,可导致病人不可逆性的休克而死亡。
3. 运用血清学实验,噬菌体分型做医院内感染的追踪调查
铜绿假单胞菌的菌落分型
典型型 大肠菌样型 粘液型 侏儒型 粗糙型
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2019
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菌落光滑凸起 成粘液状
粘液型(麦康凯平板)
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2019
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粘液型(血平板)
细小,无光泽 半透明菌落
侏儒型(麦康凯平板)
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2019
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菌落呈灰绿色 大小不一 扁平湿润 边缘不规 则呈伞状伸展 表面常可 见金属光泽
假单胞菌在环境的生物修复方面进行了广泛的研究, 大体可分为有机 物污染和重金属污染的生物修复两大类。
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由恶臭假单胞菌及荧光假单胞菌等革 兰氏阴性短杆菌引起。患病初期可见 鱼的体表有点状白色黏液物附着并逐 渐蔓延扩大,严重时鳞片基部充血、 竖起,鳞片脱落,体表及鳍基部充血, 肝、肾充血,靠边缓游不吃食,不久 即死亡。
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血平板检验
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斯氏假单胞菌
1.细菌特性 革兰阴性杆菌,一端单鞭毛,运动活泼;最适生长 温度35℃,4℃不生长,大部分菌株在42℃生长,氧化 葡萄糖产酸,在6.5%高盐培养基中可生长;营养要求 不高,普通平板可生长,新分离菌株在培养基上可形 成特征性干燥、皱缩样菌落,黏附于琼脂表面难以移 动,可产生黄色色素,无荧光。
病害的主要种类介绍
细菌性病害的防治方法
农业防治
选用抗病品种,加强田间管理,合理施肥和浇水 ,保持田间通风良好。
化学防治
使用对细菌性病害有效的农药,如农用链霉素、 新植霉素等,注意交替使用和合理混用。
生物防治
利用对细菌性病害有拮抗作用的微生物进行生物 防治,如使用枯草芽孢杆菌等。
04
病毒性病害
病毒性病害的特点
由病毒引起
病毒性病害是由病毒引起的, 不同于其他由细菌或真菌引起
的病害。
传染性强
病毒可以通过昆虫、汁液、染 病植物等途径传播,传染性强 。
症状多样化
病毒性病害的症状多样化,常 见的有花叶、黄化、畸形、坏 死等。
防治困难
由于病毒结构简单,复制速度 快,防治病毒性病害较为困难
。
常见病毒性病害种类
烟草花叶病
感染烟草花叶病的烟草叶片出现花斑,严重 时叶片皱缩、畸形。
番茄病毒病
感染番茄病毒病的番茄植株出现花斑、坏死 等症状,严重影响产量和品质。
黄瓜绿斑病
感染黄瓜绿斑病的黄瓜叶片出现黄绿相间的 斑纹,严重时叶片枯死。
病毒性病害的防治方法
选用抗病品种
选用对病毒具有较强抗性的品种是防治病毒性病害的有效方法。
农业防治
加强田间管理,合理施肥、浇水、除草等,提高植物的抗病能力。
利用有益微生物或其代谢产物对病害 进行防治,具有安全、环保、高效的 优点。
化学防治
使用化学药剂对病害进行防治,但需 要注意药剂的选择和使用方法,避免 对环境和植物造成污染和伤害。
02
真菌性病害
真菌性病害的特点
形态多样
真菌性病害的形态多种多样,包括叶斑、腐烂、坏死等。
侵染循环复杂
嗜麦芽窄食单胞菌
试验结果
试验结果
该菌含有β-内酰胺酶,临床治疗首选磺胺类;TMP/SMZ;喹诺酮类;环丙沙星或替卡西林/克拉维酸。嗜麦 芽窄食单胞菌对亚胺培南天然耐药,临床不应选用。尚无标准方法用于嗜麦芽窄食单胞菌单位耐药性检测,药敏 试验纸片法仅有三种抗菌药物:头孢他啶,米诺环素,复方磺胺有判断折点。
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4.嗜麦芽寡养单胞菌的生物学性状:嗜麦芽寡养单胞菌为专性需氧的非发酵型革兰氏阴性极生多鞭毛杆菌, 在血平板上有强的氨味,无溶血;在营养琼脂上显示灰黄色素或无色素,菌落边缘光滑,呈淡黄色或灰白色,直 径0.5mm~1mm,中央突起。还原硝酸盐为亚硝酸盐,氧化酶阴性,强解脂性,DNase阳性,水解明胶和七叶苷,赖 氨酸脱羧酶阳性。在氧化发酵试验中,产酸缓慢或不显产酸,但分解麦芽糖。
2.嗜麦芽窄食单胞菌具有复杂的耐药机制,外膜通透性低,对多种抗生素不易渗透,可产生多种β-内酰胺 酶,如青霉素酶,头孢菌素L2酶以及金属锌酶,因此对β-内酰胺类,氨基糖苷类,喹诺酮类抗生素耐药,同时 对碳青霉烯类抗生素也耐药。由于嗜麦芽窄食单胞菌的耐药性较强,一旦发现该菌感染应及时根据药敏报告合理 用药。
生化反应
生化反应
氧化酶试验阴性,分解葡萄糖、麦芽糖,不分解木糖和甘露醇,葡萄糖OF为氧化型(缓慢),动力、明胶、赖 氨酸脱羧酶和硝酸盐还原试验均阳性,精氨酸双水解酶、鸟氨酸脱羧酶、枸橼酸盐和脲酶试验均阴性 。
不动杆菌属非发酵菌的分类假单胞菌科rRNAI群rRNAIII群rRNAV群
根瘤菌科 黄杆菌科 莫拉菌科莫拉菌属 玫瑰单胞菌属
不动杆菌属 人苍白杆菌
与鉴定方法相关的分组
第一组 有动力,极鞭毛: 假单胞菌科 rRNA群I~V 第二组 有动力,周鞭毛: 产碱杆菌科 产碱杆菌属 第三组 无动力,OXI(+): 黄杆菌科 黄杆菌属 华丽杆菌属 稳杆菌属 第四组 无动力,OXI(-) 不动杆菌属
不发酵葡萄糖有氧方式代谢
缺乏糖酵解酶类 代谢必须在有氧环境中进行
不是细菌分类的正式名称 是对一大群细菌 的统称 包括不同的科、属、种
非发酵菌的分类和命名
与肠杆菌科不同,非发酵菌不能简单地归 于具有明显特征的某一菌科,且很多非发酵 菌的正确分类问题仍未解决 主要的非发酵菌分为6个科 1 分类不明 其余不属于以上菌科的非发酵菌暂时归类 于分类学尚未明确的细菌
临床少见 体弱 免疫力低下患者感染 菌血症 氧化酶阳性 不分解糖 醇或反应很弱 短波 紧密螺旋单极鞭毛
生长缓慢 48h 可见菌落 深黄到橘黄色素 七液苷阳性 区别于其他产碱假单胞菌
rRNA V
寡养单胞菌属或窄食单胞菌属
嗜麦芽寡氧单胞菌
寡养单胞菌属生物学特性
嗜麦芽寡养单胞菌名称变化 1961年嗜麦芽假单胞菌 1983年嗜麦芽黄单胞菌 1993年嗜麦芽寡养(窄食)单胞菌
伯克菌属生物学特性
葱头伯克菌
G-杆菌 氧化利用葡萄糖 氧化酶阳性 弱阳
多根极鞭毛
伯克菌属生物学特性
葱头伯克菌 生长无特殊要求 黄色菌落 赖氨 酸阳性 氨基糖甙类 天然耐药 SXT 敏感 常用药物 植物病原菌葱头腐烂和人类的坏疽 水源和潮湿表面
伯克菌属生物学特性
唐菖蒲伯克菌
黄色无荧光菌落
土生单胞菌 不是人类致病菌
常见致病菌的分类
沙雷菌属
粘质沙雷菌
变形菌属
奇异、普通变形杆菌
摩根菌属
摩根杆菌
耶尔森菌属
鼠疫杆菌
弧菌科
弧菌属
霍乱弧菌
巴斯德菌科
嗜血菌属
流感杆菌,副~
巴斯德菌属
多杀杆菌
G+球菌、需氧或兼性厌氧性球菌
细球菌科
细球菌属
四联球菌
葡萄球菌属
金葡菌,表皮~,腐生~
链球菌科
链球菌属
β型溶血(化脓性链球菌)
非β型溶血(B组链球菌,肺炎链球菌,草绿色链球菌)
肠球菌属
粪肠球菌,屎肠球菌
双球菌属
G+厌氧球菌
消化球菌科
消化球菌属
消化球菌
G-厌氧球菌
小费氏球菌
形成芽孢的杆菌或球菌
芽孢杆菌科
芽孢杆菌属
炭疽杆菌
梭形芽孢杆菌属
破伤风杆菌,产气荚膜杆菌,肉毒杆菌,难辨梭菌,败毒梭菌
G+无芽孢杆菌
放线菌科
放线菌属
伊氏,牛型~
G-厌氧杆菌
类杆菌科
类杆菌属
脆弱类杆菌
其他
棒状杆菌科
分支杆菌科
分支杆菌属
结核杆菌,麻风杆菌
奴卡菌科
奴卡菌属
星形,巴西~
螺旋体
立克次体
支原体
衣原体
类(section)
科(family)
属(genus)
种(species)
G(-)需氧杆菌
(非发酵菌)
假单胞菌科
假单胞菌属
铜绿假单胞菌
洋葱假单胞菌
微小假单胞菌
黄单胞菌属
嗜麦芽黄单胞菌军团菌科 Nhomakorabea军团菌属
植物病害及病原分类(按科属系统分类)
Pantoea stewartii
玉米枯萎病
三、致病病毒引起的植物病害
病毒是一种由核酸和蛋白质两种主要成分组成的极微小颗粒,比细菌还小,必须用电子显微镜高度放大后才能看到。能通过昆虫、植物的各种繁殖方式进行传染。得病后,叶子或花出现黄绿相间的花叶、斑驳、皱缩、黄化、局部坏死、叶子皱缩、节间变短、植物矮小、丛生、生长畸形等。植物病毒共分为9个科(或亚科),47个病毒属,729个种或可能种。其中DNA病毒只有1个科,5个属;RNA病毒有8个科,42个属,624种,占病毒总数的85.60%。根据核酸的类型和链数,可将植物病毒分为五大类群:第一类群是双链DNA病毒,有2个病毒属,31个种;第二类群为单链DNA病毒,1个科,3个病毒亚组,74个种;第三类群为双链RNA病毒,2个科,5个病毒属,41个种;第四类群为负单链RNA病毒,包括2个科,4个病毒属,25个种。第五类群为正单链RNA病毒,涉达5个科,33个病毒属,558种。
密执棒形杆菌种
马铃薯环腐亚种
侵染为害五种茄属植物,马铃薯环腐病
诡谲亚种
花叶亚种
内布拉斯加亚种
密执安亚种
韧皮部杆菌属(2个种)
柑橘黄龙病菌
柑橘黄龙病(类菌质体引起)
柑橘青果病菌
柑橘青果病(黄枯病、黄少病)
链霉菌属
马铃薯接产疥疮病菌
马铃薯疥疮病、马铃薯疮痂病
劳尔氏菌属(Ralstonia)
劳尔氏菌
可危害30余科100多种植物,特别是茄科植物,能引起多种作物青枯病
座囊菌目
球腔菌属
引起山茶、月季等多种花木叶斑病
伯克利球腔菌:花生黑斑病
落花生球腔菌:花生褐斑病
球座菌属
浆果球座菌
葡萄房枯病
葡萄球座菌
细菌属名
1 产水菌门(Aquificae)1.1 产水菌纲(Aquificae)2 热袍菌门(Thermotogae)2.1 热袍菌纲(Thermotogae)3 热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)3.1 热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)4 恐球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)4.1 恐球菌纲(Deinococci)5 产金菌门(Chrysiogenetes)5.1 产金菌纲(Chrysiogenetes)6 绿弯菌门(Chloroflexi)6.1 绿弯菌纲(Chloroflexi)6.2 厌氧绳菌纲(Anaerolineae)7 热微菌门(Thermomicrobia)7.1 热微菌纲(Thermomicrobia)8 硝化螺旋菌门(Nitrospira)8.1 硝化螺旋菌纲(Nitrospira)9 脱铁杆菌门(Deferribacteres)9.1 脱铁杆菌纲(Deferribacteres)10 蓝藻门(Cyanobacteria)10.1 蓝藻纲(Cyanobacteria)11 绿菌门(Chlorobi)11.1 绿菌纲(Chlorobia)12 变形菌门(Proteobacteria)12.1 α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)12.2 β-变形菌纲(Betaproteobacteria)12.3 γ-变形菌纲(Gammaproteobacteria)12.4 δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)12.5 ε-变形菌纲(Epsilonproteobacteria)13 厚壁菌门(Firmicutes)(低G+C革兰氏阳性菌)13.1 梭菌纲(Clostridia)13.2 柔膜菌纲(Mollicutes)13.3 芽孢杆菌纲(Bacilli)14 放线菌门(Actinobacteria)(高G+C革兰氏阳性菌)14.1 放线菌纲(Actinobacteria)15 浮霉菌门(Planctomycetes)15.1 浮霉菌纲(Planctomycetacia)16 衣原体门(Chlamydiae)16.1 衣原体纲(Chlamydiae)17 螺旋体门(Spirochaetes)17.1 螺旋体纲(Spirochaetes)18 纤维杆菌门(Fibrobacteres)18.1 纤维杆菌纲(Fibrobacteres)19 酸杆菌门(Acidobacteria)19.1 酸杆菌纲(Acidobacteria)20 拟杆菌门(Bacteroidetes)20.1 拟杆菌纲(Bacteroidetes)20.2 黄杆菌纲(Flavobacteria)20.3 鞘脂杆菌纲(Sphingobacteria)21 梭杆菌门(Fusobacteria)21.1 梭杆菌纲(Fusobacteria)22 疣微菌门(Verrucomicrobia)22.1 疣微菌纲(Verrucomicrobiae)23 网团菌门(Dictyoglomi)23.1 网团菌纲(Dictyoglomi)24 芽单胞菌门(Gemmatimonadetes) 24.1 芽单胞菌纲(Gemmatimonadetes) 产水菌门(Aquificae)产水菌纲(Aquificae)产水菌目(Aquificales)产水菌科(Aquificaceae)产水菌属(Aquifex) (Calderobacterium) (Hydrogenobaculum)氢杆菌属(Hydrogenobacter) (Hydrogenothermus) (Persephonella) (Sulfurihydrogenibium) (Thermocrinis)科未定(Balnearium)除硫杆菌属(Desulfurobacterium)热弧菌属(Thermovibrio)热袍菌门(Thermotogae)热袍菌纲(Thermotogae)热袍菌目(Thermotogales)热袍菌科(Thermotogaceae)热袍菌属(Thermotoga) (Fervidobacterium)(Geotoga)(Marinitoga)(Petrotoga)热袍菌属(Thermosipho)热脱硫杆菌门(Thermodesulfobacteria)热脱硫杆菌纲(Thermodesulfobacteria)热脱硫杆菌目(Thermodesulfobacteriales)热脱硫杆菌科(Thermodesulfobacteriaceae)热脱硫杆菌属(Thermodesulfobacterium)(Thermodesulfatator)恐球菌-栖热菌门(Deinococcus-Thermus)恐球菌纲(Deinococci)恐球菌目(Deinococcales)恐球菌科(Deinococcaceae)恐球菌属(Deinococcus) (注:依据希腊语δεινος / deinos,与“恐龙”的dino-同源)栖热菌目(Thermales)栖热菌科(Thermaceae)栖热菌属(Thermus)海栖热菌属(Marinithermus)亚栖热菌属(Meiothermus)海洋栖热菌属(Oceanithermus)火山栖热菌属(Vulcanithermus)产金菌门(Chrysiogenetes)产金菌纲(Chrysiogenetes)产金菌目(Chrysiogenales)产金菌科(Chrysiogenaceae)产金菌属(Chrysiogenes)绿弯菌门(Chloroflexi)绿弯菌纲(Chloroflexi)绿弯菌目(Chloroflexales)绿弯菌科(Chloroflexaceae)绿弯菌属(Chloroflexus)绿线菌属(Chloronema)太阳发菌属(Heliothrix)玫瑰弯菌属(Roseiflexus)颤绿菌科(Oscillochloridaceae)颤绿菌属(Oscilochloris)爬管菌目(Herpetosiphonales)爬管菌科(Herpetosiphonaceae)爬管菌属(Herpetosiphon)厌氧绳菌纲(Anaerolineae)厌氧绳菌目(Anaerolineales)厌氧绳菌科(Anaerolineaceae)厌氧绳菌属(Anaerolinea)暖绳菌属(Caldilinea)热微菌门(Thermomicrobia)热微菌纲(Thermomicrobia)热微菌目(Thermomicrobiales)热微菌科(Thermomicrobiaceae)热微菌属(Thermomicrobium)硝化螺旋菌门(Nitrospira)硝化螺旋菌纲(Nitrospira)硝化螺旋菌目(Nitrospirales)硝化螺旋菌科(Nitrospiraceae)硝化螺旋菌属(Nitrospira)钩端螺菌属(Leptospirillum)磁杆菌属(Magnetobacterium)热脱硫弧菌属(Thermodesulfovibrio) 脱铁杆菌门(Deferribacteres)脱铁杆菌纲(Deferribacteres)脱铁杆菌目(Deferribacterales)脱铁杆菌科(Deferribacteraceae)脱铁杆菌属(Deferribacter) (Denitrovibrio)(Flexistipes)地弧菌属(Geovibrio)科未定(Synergistes)暖发菌属(Caldithrix)蓝藻门(Cyanobacteria)蓝藻纲(Cyanobacteria)注:本文采用的Bergey's手册中蓝藻内的分类,不论目科属,均为形态分类,其中目在手册中为“Subsection”而非“Order”,目、科均未列名称,此处目名称为习习用法,科不列名称;属除Halospirulina和Trichodesmium之外均标为“形态属”(Form Genus)而非“属”(Genus)。
常见微生物的界、门、纲、目、科、属、种中英文对照#(精选.)
常见微生物界(Domain)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界(Domain)Bacteria细菌Archaea古生菌门(Phylum)Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型(α)变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目,红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目,球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科(family)Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科,叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科,产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科,红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科,冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科,互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属(Genus)Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属最新文件仅供参考已改成word文本。
农作物的细菌属及其代表的种
重要的细菌属及代表的种1.黄单胞菌属(Xanthomonas)黄单胞菌属为薄壁菌门的成员。
菌体短杆状,多单生,少数为双生,单鞭毛,极生,无荚膜,革兰氏染色反应阴性,好气性。
代谢为呼吸型,无发酵型。
氧化酶反应阴性,过氧化氢酶反应阳性。
对营养要求不高,供给简单的碳水化合物和其他无机盐多数都可生长,一般在培养基上不产生色素,但菌体含有一种黄色的类胡罗素。
营养琼脂培养基上呈蜜黄色、光滑货粘稠的菌落。
绝大多数成员为植物病原细菌,为害植物引起叶斑坏死或者枯死等症状。
本属细菌下重要的种有:野油菜黄单胞菌(甘蓝黑腐病菌)、水稻黄单胞菌,重要的变种有:野油菜黄单胞菌禾草致病变种、野油菜黄单胞菌柑橘致病变种、水稻白叶枯病菌。
2.劳尔氏菌属(Ralstonia)劳尔氏菌属是从假单胞杆菌属中分离出的,其中茄科植物的青枯病菌是众所周知的重要病原菌。
普通细菌培养基上菌落隆起、光滑、湿润、灰白色至白色。
有些菌株在培养基上可分泌水溶性褐色素而使培养基变褐色。
在灭菌的马铃薯薯块上,则能使其变成深褐色至黑色。
病菌的寄主范围很广,可侵染30多科的一百多种植物,马铃薯、烟草、番茄等茄科的青枯病发生非常严重。
种下分类多样化,不同菌株的寄生专化性不同,寄生在番茄、马铃薯、花生上的是同一类型,而烟草上的则是另外一种。
典型的症状是全株急性凋萎,感病茎秆维管束变褐,横切后用手挤压有白色菌脓溢出。
病菌在土壤中可长期存活,可随土壤、灌溉、种薯、种苗传播。
侵染主要途径是伤口,高温高湿条件有利于发病。
3.假单胞杆菌属(Pseudomonas)该属是薄壁假单胞菌科的模式属。
菌体短杆状略弯,单生,鞭毛1~4根,极生,没有荚膜,革兰氏染色反应阴性,严格好气性。
代谢为呼吸型,无发酵型。
氧化酶反应阴性,少数阳性,过氧化氢酶反应阳性。
对营养要求不高,供给简单的有机碳水化合物和其他无机盐一般都能生长。
营养琼脂培养基上呈灰白色、圆形、隆起的菌落,有荧光反应,有些种产生褐色素扩散到培养基中。
常见微生物的界、门、纲、目、科、属、种中英文对照
常见微生物界(Domain)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)、属(Genus)、种(Species)中英文对照界(Domain)Bacteria细菌Archaea古生菌门(Phylum)Proteobacteria 变形菌门Bacteroidetes 拟杆菌门Actinobacteria 放线菌门Gemmatimonadetes 芽单胞菌门Acidobacteria 酸杆菌门Planctomycetes 浮霉菌门Verrucomicrobia 疣微菌门Chloroflexi 绿弯菌门Nitrospirae 硝化螺旋菌门Firmicutes 厚壁菌门Chlorobi 绿菌门Cyanobacteria 蓝藻细菌门Fibrobacteres 纤维杆菌门Elusimicrobia 迷踪菌门Armatimonadetes 装甲菌门Euryarchaeota 广古菌门Chlamydiae 衣原体Crenarchaeota 泉古菌门Tenericutes 无壁菌门Spirochaetes 螺旋体属Alphaproteobacteria 甲型(α)变形杆菌纲Gammaproteobacteria 丙型变形菌纲Betaproteobacteria β-变形菌纲Actinobacteria 放线菌门、纲Cytophagia 纤维粘网菌Gemmatimonadetes 芽单胞菌门、纲Deltaproteobacteria δ-变形菌纲Acidobacteria-6 酸杆菌门Acidimicrobiia 酸微菌纲Verrucomicrobiae 疣微菌纲Opitutae 丰佑菌纲Nitrospira 消化螺菌属Thermomicrobia 热微菌门Bacteroidia 拟杆菌纲Bacilli 杆菌Chloroflexi 绿弯菌门Anaerolineae 厌氧绳菌纲Clostridia 梭状芽胞杆菌Elusimicrobia 迷踪菌门Ktedonobacteria 纤线杆菌纲Thermoplasmata 热原体纲Chlamydiia 衣原体Thaumarchaeota 奇古菌门Mollicutes 柔膜菌纲Methanomicrobia 甲烷微菌纲Holophagae 全噬菌纲Spirochaetes 螺旋体属Xanthomonadales 黄单孢菌目Sphingomonadales 鞘脂单胞菌目Burkholderiales 伯克霍尔德氏菌目Actinomycetales 放线菌目Cytophagales 噬纤维菌目Myxococcales 粘球菌目Acidimicrobiales 酸微菌目Rhizobiales 根瘤菌目Sphingobacteriales 鞘脂杆菌目Flavobacteriales 黄杆菌目Caulobacterales 柄杆菌目Rhodospirillales 红螺菌目Alteromonadales 交替单胞菌目Enterobacteriales 肠杆菌目Verrucomicrobiales 疣微菌目Opitutales 丰佑菌目Gemmatimonadales 芽单胞菌目Nitrospirales 硝化螺旋菌目Pseudomonadales 假单胞菌目Planctomycetales 浮霉菌目Bacteroidales 拟杆菌目Syntrophobacterales 互营杆菌目Bacillales 芽孢杆菌目Thiotrichales 硫发菌目Rhodobacterales 红细菌目,红杆菌目Methylophilales 噬甲基菌目Nitrosomonadales 亚硝化单胞菌目Streptophyta 木霉菌目Clostridiales 梭菌目Legionellales 军团菌目Bdellovibrionales 蛭弧菌目Rubrobacterales 红色杆菌目Caldilineales 暖绳菌目Herpetosiphonales 爬管菌目Chloroflexales 绿弯菌目Rickettsiales 立克次氏体目Acidobacteriales 酸杆菌目Micrococcales 微球菌目Rhodocyclales 红环菌目Stramenopiles 不等鞭毛类Chlamydiales 衣原体目Ktedonobacterales 纤线杆菌目Neisseriales 奈瑟菌目Oceanospirillales 海洋螺菌目Anaeroplasmatales 厌氧原体目Natranaerobiales 盐碱厌氧菌目Halanaerobiales 盐碱厌氧菌目Procabacteriales 普罗卡杆菌目Sphaerobacterales 球杆菌目Methylococcales 甲基球菌目Chlorophyta 绿藻门Holophagales 全噬菌目Methanosarcinales 八叠球菌目,球菌目Bifidobacteriales 双歧杆菌目Methanomicrobiales 甲烷微菌目Aeromonadales 气单胞菌目Spirochaetales 螺旋体目Desulfuromonadales 除硫单胞菌目科(family)Sphingomonadaceae 鞘脂单胞菌科Xanthomonadaceae 黄单胞菌科Cytophagaceae 噬纤维菌科Oxalobacteraceae 草酸杆菌科Nocardioidaceae 类诺卡氏菌科Comamonadaceae 丛毛单胞菌科Caulobacteraceae 柄杆菌科Sphingobacteriaceae 鞘脂杆菌科Flavobacteriaceae 黄杆菌科Sinobacteraceae 华杆菌科Rhodospirillaceae 红螺旋菌科Hyphomicrobiaceae 生丝微菌科Polyangiaceae 多囊粘菌科Erythrobacteraceae 赤杆菌科Enterobacteriaceae 肠杆菌科Verrucomicrobiaceae 疣微菌科Geodermatophilaceae 地嗜皮菌科Opitutaceae 丰佑菌科Streptomycetaceae 链霉菌科Alteromonadaceae 交替单胞菌科Micrococcaceae 微球菌科Actinosynnemataceae 束丝防线菌科Micromonosporaceae 微单胞菌科Pseudomonadaceae 假单胞菌科Planctomycetaceae 浮霉菌科Nannocystaceae 侏囊菌科Syntrophobacteraceae 互营杆菌科Sporichthyaceae 鱼孢菌科Streptosporangiaceae 链孢囊菌科Bradyrhizobiaceae 慢生根瘤菌科Piscirickettsiaceae 鱼立克次体科Rhizobiaceae 根瘤菌科Microbacteriaceae 微杆菌科Pseudonocardiaceae 假诺卡氏科Bacillaceae 芽孢杆菌科Intrasporangiaceae 间孢囊菌科Nitrospiraceae 硝化螺旋菌科Methylophilaceae 噬甲基菌科Phyllobacteriaceae 叶杆菌科,叶瘤菌科Alcaligenaceae 产碱菌科,产碱杆菌科Nitrosomonadaceae 亚硝化单胞菌科Rhodobacteraceae 红杆菌科Thermomonosporaceae 高温单胞菌科Glycomycetaceae 糖霉菌科Acetobacteraceae 醋杆菌科Mycobacteriaceae 分支杆菌科Hyphomonadaceae 生丝单胞菌科Rubrobacteraceae 红色杆菌科Cystobacteraceae 孢囊杆菌科Caldilineaceae 暖绳菌科Rhodobiaceae 红菌科,红游动菌科Burkholderiaceae 伯克氏菌科Coxiellaceae 柯克斯体科Bdellovibrionaceae 蛭弧菌科Acidobacteriaceae 酸杆菌科Clostridiaceae 梭菌科Paenibacillaceae 类芽孢杆菌科Bacteriovoracaceae 噬菌弧菌科Myxococcaceae 粘液球菌科Cellulomonadaceae 纤维素单胞菌科Beijerinckiaceae 拜叶林克氏菌科Frankiaceae 弗兰克氏菌科Rhodocyclaceae 红环菌科Planococcaceae 动球菌科Methylocystaceae 甲基孢囊菌科Nocardiaceae 诺卡式菌科Chloroflexaceae 绿屈挠菌科Thermoactinomycetaceae 高温放线菌科Staphylococcaceae 葡萄球菌科Alicyclobacillaceae 环脂酸芽孢杆菌科Nocardiopsaceae 拟诺卡式菌科Legionellaceae 军团菌科Ktedonobacteraceae 纤线杆菌科Gemmatimonadaceae 芽单胞菌科Moraxellaceae 莫拉氏菌科Corynebacteriaceae 棒状杆菌科Parachlamydiaceae 副衣原体科Cystobacterineae 孢囊杆菌亚目Aurantimonadaceae 橙单胞菌科Bogoriellaceae 博格利亚湖菌科Methylobacteriaceae 甲基杆菌科Rickettsiaceae 立克次氏体Brucellaceae 布鲁氏菌科Lachnospiraceae 毛螺菌科Neisseriaceae 奈瑟氏菌科Halomonadaceae 盐单胞菌科Anaeroplasmataceae 厌氧原体科Peptococcaceae 消化球菌科,冻球菌科Halanaerobiaceae 盐厌氧菌科Peptostreptococcaceae 消化链球菌科Dermabacteraceae 皮杆菌科Procabacteriaceae 普洛卡杆菌科Kineosporiaceae 动孢囊菌科Methylococcaceae 甲基球菌科Syntrophomonadaceae 单胞菌科,互营单胞菌科Oscillochloridaceae 颤绿菌科Chlamydomonadaceae 【植物】衣藻科Holosporaceae 全胞菌科Gordoniaceae 戈登氏菌科Shewanellaceae 希万氏菌科Aeromonadaceae 气单胞菌科Geobacteraceae 地杆菌科Brevibacteriaceae 短杆菌科Porphyromonadaceae 紫单胞菌科Xanthobacteraceae 黄色杆菌科Spirochaetaceae 螺旋体科Propionibacteriaceae 丙酸杆菌科属(Genus)Janthinobacterium 紫色杆菌属Flavobacterium 黄杆菌属Thermomonas 热单胞菌属Mycoplana 枝动杆菌属Sorangium 堆囊菌属Opitutus 丰佑菌属Sphingomonas 鞘脂单胞菌属Streptomyces 链霉菌属Lysobacter 溶杆菌属Cellvibrio 纤维弧菌属Pedobacter 地杆菌属Aeromicrobium 气微菌属Rhodoplanes 红游动菌属Pseudomonas 假单胞菌属Planctomyces 浮霉状菌属Phenylobacterium 苯基杆菌属Pseudoxanthomonas 假黄色单胞菌属Sphingobium 鞘脂菌属Nannocystis 侏囊菌属Variovorax 贪噬菌属Luteimonas 单胞菌属Gemmata 出芽菌属Saccharothrix 糖丝菌属Prosthecobacter 突柄杆菌属Pirellula 小梨型菌属Acidovorax 食酸菌属Lentzea 伦茨氏菌属Streptosporangium 链孢子囊菌属Bacillus 芽孢杆菌属Caulobacter 茎菌属Nocardioides 类诺卡氏菌属Stenotrophomonas 寡养单胞菌Nitrosovibrio 弧菌属Actinoplanes 游动放线菌属Rubrivivax 红肠命菌属Glycomyces 糖霉菌属Agrobacterium 土壤杆菌属Mesorhizobium 中慢生根瘤菌属Agromyces 壤霉菌属Mycobacterium 分枝杆菌属Chondromyces 粒杆粘细菌属Novosphingobium 新鞘氨醇菌属Actinomadura 马杜拉放线菌属Nonomuraea 野野村菌属Catellatospora 链孢菌属Geodermatophilus 地嗜皮菌属Nitrospira 硝化螺菌属Pseudonocardia 假诺卡氏菌属Sporocytophaga 生孢噬胞菌属Bdellovibrio 蛭弧菌属Asticcacaulis 不粘杆菌属Sinorhizobium 中华根瘤菌Hydrogenophaga 噬氢菌属Rubrobacter 红色杆菌属Dactylosporangium 指孢囊菌属Sphingobacterium 鞘氨醇杆菌属Brevundimonas 短波单胞菌属Jiangella 姜氏菌属Burkholderia 伯克霍尔德菌Achromobacter 无色杆菌属Hyphomicrobium 生丝微菌属Pedomicrobium 土微菌属Paenibacillus 类芽孢杆菌Phyllobacterium 叶杆菌属Cellulomonas 纤维菌属Pilimelia 水生角质菌属Arthrobacter 节细菌属Saccharopolyspora 糖多孢菌属Myxococcus 粘球菌Amycolatopsis 拟无枝酸菌Phaeospirillum 褐螺菌属Promicromonospora 原小单孢菌属Cellulosimicrobium 纤维菌属Sporichthya 游鱼孢菌属Chloronema 绿线菌属Nocardia 诺卡氏菌属Pimelobacter 脂肪杆菌属Paracoccus 副球菌属Bosea 氏菌属Staphylococcus 葡萄球菌属Planomicrobium 动性微菌属Rhodoferax 红育菌属Rhodobacter 红杆菌属Hymenobacter 薄层菌属Saccharomonospora 糖单胞菌属Cytophaga 噬细胞菌属Ralstonia 罗尔斯通菌属Rathayibacter 拉氏杆菌属Gemmatimonas 芽单胞菌属Alicyclobacillus 杆菌属Clostridium 梭菌属Corynebacterium 棒状杆菌属Cupriavidus 贪铜菌属Caldilinea 暖绳菌属Azorhizophilus 嗜氮根瘤菌属Rhodococcus 红球菌属Legionella 军团杆菌Brevibacillus 短芽孢杆菌属Polaromonas 单胞菌属Acinetobacter 不动杆菌属Georgenia 乔治菌属Actinocorallia 珊瑚状防线菌属Cryptosporangium 隐孢菌属Comamonas 丛毛单胞菌属CandidatusProtochlamydia Asteroleplasma 无甾醇原体属Sporosarcina 芽孢八叠球菌属Azospirillum 固氮螺菌属Magnetospirillum 磁螺菌属Roseomonas 玫瑰单胞菌属Prauserella 氏菌属Coprococcus 粪球菌属Prauseria 布劳氏菌属Thermoactinomyces 高温防线菌属Methylobacterium 甲基杆菌属Brachybacterium 短状杆菌属Azoarcus 固氮弧菌属Beijerinckia 拜叶林克氏菌属Virgibacillus 枝芽孢菌属Syntrophomonas 互营单胞菌属Geobacillus 土芽孢杆菌属Parachlamydia 副衣原体属Anaeromyxobacter 厌氧粘细菌属Oscillochloris 颤绿菌属Procabacter 普罗卡杆菌属Methanosarcina 甲烷八叠球菌属Microbacterium 微杆菌属Methylophaga 噬甲基菌属Methanoculleus 甲烷囊菌属Methylocaldum 甲基暖菌属Rickettsia 立克次氏体Alkaliphilus 嗜碱菌属Cryobacterium 冷杆菌属Shewanella 希瓦氏菌属Gordonia 戈登氏菌属Psychrobacter 嗜冷杆菌属Serratia 沙雷氏菌属Spirochaeta 螺旋体属Leptolyngbya 鞘丝藻属Caloramator 喜热菌属Dietzia 迪茨氏属Hyphomonas 生丝单胞菌属Yersinia 耶尔森氏鼠疫杆菌属Microlunatus 小月菌属Anaerolinea 厌氧绳菌属Brevibacterium 短杆菌属。