广泛靶向代谢组-国家杰青专利代谢技术
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一、研究概述
20世纪80年代,英国帝国理工大学Nicholson教授首次提出了代谢组学的概念,被誉为“国际代谢组学之父”。2005年,加拿大基因委员会投资750万美元创建了“人类代谢组计划”(HMP),最终构建了HMDB代谢组数据库。在这十年来,代谢组学检测技术也经历了由核磁(NMR)转向气质联用(GCMS)再到液质联用(LCMS)的发展历程,检测结果的有效信息量也有了10倍的提升。代谢组学相较于其他组学的优势在于:(1)据估计,人类含有约6500种小分子代谢物,尽管新的和更灵敏的测量技术正逐步揭示更多的化学物种,然后代谢物的数量仍然可能比在人类中发现估计的25000个基因、100000个转录组和1000000个蛋白质少;(2)代谢组检测的是基因组、转录组和蛋白组的可变性下游表型,从而可以提供高度整合的生物学状态概况;(3)代谢组学是一种精确和无创的工具,用于识别药物治疗作用和可能的毒理学效应,并分离遗传学、微生物活性和营养对整体代谢表型的作用
二、广泛靶向代谢组
目前,代谢组学的研究主要包括靶向代谢组和非靶向代谢组。靶向代谢组(Targeted metabolomics):少数已知代谢物定性和定量检测,具有灵敏度高、定性定量准确的特点;非靶向代谢组(Untargeted metabolomics):同时检测数百乃至数千种代谢物(包括已知和未知代谢物),但其灵敏度较之靶向代谢组低1-2个数量级,定性定量准确性也相对较差。今天小编介绍的就是一种整合了非靶向和靶向代谢物检测技术优点的新型代谢组检测技术——广泛靶向代谢组(Widely Targeted Metabolome)。
广泛靶向代谢组(Widely Targeted Metabolome)作为第二代或者新一代靶向代谢组(Next Generation Metabolome)技术,区别于现有代谢物检测方法,该技术平台建立了LC-MS/MS代谢物标品数据库,整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点,可以检测覆盖18大类,2500多个代谢物,实现了高通量、高灵敏、广覆盖的靶向代谢物检测。广靶技术作为一项核心专利技术,早于2013在《Molecular Plant》(IF:9)杂志上发表题为《A Novel Integrated Method for
Application in the Study of Rice Metabolomics》的方法学文章。
产品简介
广泛靶向代谢组(Widely Targeted Metabolome):广泛靶向代谢组学技术基于QQQ
三重四级杆的靶向检测原理和MRM的黄金定量模式,结合千种自建标品数据库,同时达到定性准、通量高、定量黄金标准的检测模式。其技术特点如下:
1.高通量——一次定性、定量检测到600+代谢物
2.高灵敏——检测下限达到pg级
3.定量准——AB6500+三重四极杆定量黄金标准
4.定性准——自建MWDB标品数据库(千标建库)
5.广覆盖——覆盖kegg中近200个pathway
三、应用方向
近两年利用广泛靶向代谢组学新技术已在Nat Genet、Nat Commun、PNAS、Plant Cell、Plant J、Mol Plant、Curr Opin Plant Biol等杂志发表论文多篇,代表着代谢组学研究最新发展方向。
1.疾病生物标志物biomaker的筛选
1)期刊:Nature IF=32
研究内容:发现前列腺癌重要标志物-肌氨酸
Title:Metabolomic profile s delineate potential role for sarcosine in prostate cancer progression. 2)期刊:Hepatology IF=14.971
研究内容:肝癌血清标志物大队列人群研究
Title:A Large-Scale,Multicenter Serum Metabolite Biomarker Identification Study for the Early Detection of Hepatocellular Carcinoma
2.肠道菌群+代谢组研究人体肠道健康
1)期刊:Gut microbiota IF=14.9
研究内容:肠道微生物+代谢组学研究运动员与宅男宅女的肠道代谢差异。Title:The microbiome of professional athletes differs from that of more sedentary subjects in composition and particularly at the functional metabolic level
2)期刊:Nature Immunology IF=20.1
研究内容:肠道菌群+代谢研究I型糖尿病
Title:Gut microbial metabolites limit the frequency of autoimmune T cells and protect against type1diabetes
3.转录+代谢研究疾病机制
期刊:Scientific Reports IF=5.2
研究内容:代谢组学与转录组学研究子宫颈癌
Title:A Comprehensive Analysis of Metabolomics and Transcriptomics in Cervical Cancer.
4.药效研究:确定药物药效,缩短临床时限,降低新药研发经费
期刊:Translational psychiatry,IF=5.5
研究内容:苏拉明能逆转成年老鼠的自闭症状。
Title:Reversal of autism-like behaviors and metabolism in adult mice with single-dose antipurinergic therapy.
迈维代谢于2015年成立于武汉国家生物产业基地——光谷生物城生物创新园,是中国代谢组领域的知名企业,专注于创新代谢组技术在生命科学研究与医学健康两大领域的应用,创造性开发了以“广泛靶向”专利技术为核心的高通量、超灵敏、广覆盖代谢组技术平台,建立了含有5000多种代谢物的专属数据库,搭建了基于代谢组的多组学数据整合分析流程,相关技术成果近年来在Cell、Nature Genetics、Nature Communications、PNAS等国际学术期刊发表,并应邀在国际代谢组学年会、国际动植物基因组大会、全国罕见病大会、中药生物技术学会等会议作大会报告,引领代谢组学发展新方向。