微生物的分类和鉴定

第十章微生物的分类和鉴定

一、名词解释：

01.系统学（systematics）：是研究生物多样性及其分类和演化关系的科学。分子

系统学是检测、描述并揭示生物在分子水平上的多样性及其演化规律的科学。研究内容包括了群体遗传结构、分类学、系统发育和分子进化等领域。

02.系统树：在研究生物进化和系统分类中，常用一种树状分支的图型来概括各

种（类）生物之间的亲缘关系，这种树状分支的图型也称为发育树（phylogenetic tree）。

03.分子系统树：通过比较生物大分子序列差异的数值构建的系统树称为分子系

统树。

04.微生物分类学（microbial taxonomy）：是一门按微生物的亲缘关系把它们安

排成条例清楚的各种分类单元或分类群的科学，其具体任务有三，即分类、鉴定和命名。

05.分类（classification）：根据文献资料，经过科学的归纳和理性的思考，整理

成一个科学的分类系统。即解决从个别到一般或从具体到抽象的问题。06.鉴定（identification）：通过详细观察和描述一个未知名称纯种微生物的各种

性状特征，然后查找现成的分类系统，以达到对其知类、辨名的目的。即解决从一般到特殊或从抽象到具体的问题

07.命名（nomenclature）：为一个新发现的微生物确定一个新学名的过程。

08.培养物（culture）：是指一定时间一定空间内微生物的细胞群或生长物。如微

生物的斜面培养物、摇瓶培养物等。如果某一培养物是由单一微生物细胞繁殖产生的，就称之为该微生物的纯培养物（pure culture)。

09.菌株（strain）：从自然界分离得到的任何一种微生物的纯培养物，都可以称

为微生物的一个菌株；用实验方法（如通过诱变）所获得的某一菌株的变异型，也可以称为一个新的菌株，以便与原来的菌株相区别。菌株是微生物分类和研究工作中最基础的操作实体。

10.标准菌株：指能代表这个种的各典型性状的一个被指定的菌株。

11.种群（population）：也有人译为群体、居群或群丛等，是指一定空间中同种

个体的组合。每一个物种在自然界中的存在，都有一定的空间结构，在其分散的、不连续的居住场所或分布区域内，形成不同的群体单元，这些群体单元就称为居群。

12.种（species）：是生物分类中基本的分类单元和分类等级。它是一大群表型特

征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属的其他物种有明显差异的一大群菌株的总称。

13.型（form / type）：常指亚种以下的细分，当同种或同亚种不同菌株之间的性

状差异，不足以分为心的亚种时，可以细分为不同的型。例如，按抗原特征的差异分为不同的血清型；按对噬菌体裂解反应的不同分为不同的噬菌型等等。

14.亚种/变种（subspecies / variety）：当某一个种内的不同菌株存在少数明显而

稳定的变异特征或遗传性而又不足以区分成新种时，可以将这些菌株细分成两个或更多的小的分类单元—亚种。亚种是正式分类单元中地位最低的分类等级。变种是亚种的同义词。

15.真菌（fungi）：是不含叶绿体、化能有机营养、具有真正的cell核，含有线

粒体、以孢子进行繁殖、不运动的典型的真核微生物。

16.粘菌（slime molds）：又称粘质霉菌，是非光合营养的真核微生物，不含叶绿

素，吞噬方式摄食，产孢子和子实体等表型特征使它们介于真菌和原生动物之间。

17.热原体（Thermoplasma）：在古生菌中，有一类无细胞壁的原核生物很像支

原体，由于他们无细胞壁、嗜热、嗜酸、行好氧化能有机营养，所以称为热原体。

二、填空：

01.细菌分类鉴定的主要文献是《伯杰氏细菌学鉴定手册》。

02.对生物系统发育进行研究，最合适的揭示各类生物亲缘关系的大分子物质是

rRNA，特别是16SrRNA。

03.rRNA序列测定和分析方法有：寡核苷酸编目法和全序列分析法。

04.对于序列目录资料进行分析比较，常采用相似性系数和序列印迹法来比较各

微生物之间的亲缘关系。

05.系统树分为无根树和有根树两种形式

06.在系统树图型中分枝的末端和分枝的连接点，称为结（nod），代表生物类群；

分枝末端的结代表仍生存的种类。

07.构建分子系统树，最常用的是最节省分析法或称简约法。这种推断谱系的原

则是：在所有可能的谱系关系中，涉及进化改变的序列特征数最少的谱系是最可信的。

08.20世纪70年代，Woese根据16SrRNA（18SrRNA）序列分析，将生物界分

为三界（后改称三个域）：古细菌、真细菌、真核生物。1990年他又把它们改成为Bacteria（细菌）、Archaea（古生菌）和Eukarya（真核生物），并构建了三界（域）生物的系统树。

09.分类单元（taxon，复数taxa）是指具体的分类群。它有七个基本的分类等级

（或分类阶元）即：界、门、纲、目、科、属、种。在微生物分类中，还有一些非正式的类群术语，如种以上的有群、组系；亚种以下的有培养物、菌株、居群、型。

10.根据国际命名法规，证实分类单元的学名，必须用拉丁词或其他词源经拉丁

化的词命名，种名的命名是用双名法（binominal nomenclature）。命名，即种的学名由属名加种名加词两部分组合而成。

11.微生物数据存储、检索和分析中心是世界微生物数据中心（WDC）。我国微

生物资源数据库（MRDC）包括微生物的性状库、产品市场信息库、名称库、

名词库、国际交流用RKC代码库和一个微生物数值分析软件包MINTS。12.微生物多样性是生物多样性的一个重要组成部分，生物多样性包括遗传多样

性、物种多样性和生态系统多样性等。

13.产甲烷古生菌进行自养生长时，CO2是碳源，利用H2作为CO2的还原剂以

合成有机物，利用甲烷发酵或乙酸盐呼吸来获取能量，乙酸可以刺激生长。

14.所有的产甲烷古生菌都能利用NH4＋作为氮源，少数种可以固定分子态的氮。

15.绝大多数的超嗜热古生菌专性厌氧，以硫作为电子受体，进行化能有机营养

或化能无机营养的厌氧呼吸产能代谢。

16.超嗜热古生菌种的热网菌属（Pyrodictium）的细胞最高能在110℃生长，产

生占细胞总量80%的一种蛋白质，这种蛋白质有两种酶活性，一种是催化ATP合成的酶活性；另一种活性是作为一种分子伴侣（Molecular chaperon）。

17.目前已知最古老的真核生物是双滴虫（Diplomonads）和微孢子虫

（Microsporidia），他们具有细胞核，但没有线粒体。

18.根据核糖体RNA序列分析，藻类的系统发育是离散性很明显的异质类群。

三、问答题：

1. 16SrRNA公认为谱系分析的“分子尺”的原因是什么？

答：（1）rRNA参与生物蛋白质的合成过程，其功能是任何生物都必不可少，而且在生物进化史中，其功能保持不变。（2）在16SrRNA分子中既含有高度保守的序列区域，又有中度保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化