体外乙酰化
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体外乙酰化/去乙酰化实验方法
1. GST蛋白表达纯化
接菌:
3mL LB+ 3ul 抗生素+ 一个菌落(经BL-21转化后的)37℃ 225rpm摇菌过夜。
IPTG:
100 mL LB + 100ul 抗生素+ 1ml 菌液,37℃ 225rpm 4h;
4h后,每瓶(100ml)菌液 + 40ul IPTG,30℃ 225rpm 2h;
100ml菌液分装2个50ml离心管,离心4℃,5000rpm,10min,弃上清,置于-20℃保存备用。
GST:
1.将-20℃保存的细胞(一管50ml离心管,另一管保留)置于冰上,加入3ml
冰预冷的PBS,重悬细胞,再加入150ul Triton-100(20%);
2.将重悬好的细胞转移到15ml离心管中;
3.将超声波细胞破碎仪预热10min;
4.向15ml离心管中加入5ul PIC, 5ul PMSF, 5ul Na
3VO
4
;
5.破碎细胞:次数:6-8次,间隔:60-120s,每次:10-15s
(实际使用:次数:6;间隔:60’’,每次:10’’);
6.beads预处理:用前混匀,133ul beads,离心4℃,2500rpm,5min,弃上清
(吸取33ul上清,弃之),得100ul beads (2个样品) ;
7.用1ml PBS洗1次beads,混匀,离心4℃,2500rpm,5min,弃上清,+ 150ul
PBS重悬,分装4管,每管62.5ul;
8.将破碎后的3ml样品分装到2个Ep管中,离心4℃,13000rpm,15min,将
上清转移至分装好的beads管中,4℃摇床摇匀过夜or RT 摇床摇匀1h;
9.离心4℃,2500rpm,5min,弃上清;
10.加入预冷PBS 1ml,混匀,离心4℃,2500rpm,5min,弃上清;
11.重复步骤10两遍,即用PBS洗3次;
12.每1个Ep管中加入100ul PBS(即:每3ml原样品对应2支Ep管),4℃保
存。
制备PAGE胶样品:
GST后的样品,取30ul置于已经标记的Ep管中,加入30ul loading Buffer,将该Ep管管盖上扎孔,煮沸5min,置于冰上备用,或-20℃保存。
PAGE 电泳,200V, 40min左右;
电泳后,用考马斯亮蓝染色,过夜,观察并记录结果,如若需要,拍照保存。
2.体外乙酰化反应
在1.5mlEP管中配置乙酰化反应体系,
总体积50ul:
GST-底物:5ug
GST-乙酰化酶: 1ug
Ac-coA: 20uM
Tris-HCl(pH8.0):50uM
EDTA: 0.1mM
DTT: 1mM
甘油: 10%
混匀,30℃,反应1个小时。
反应后,Western blot 用抗乙酰化赖氨酸的抗体(CST)检测乙酰化效果。3.体外去乙酰化反应
乙酰化反应的产物,用去乙酰化反应缓冲液洗涤一次,配置去乙酰化反应体系,总体积50ul:
GST-Ac-底物:5ug
GST-去乙酰化酶:1ug
NAD+: 60uM
Tris-HCl(pH8.0): 25uM
NaCl: 137mM
KCl: 2.7mM
MgCl2: 1mM
30℃,反应1个小时。
反应后,Western blot 用抗乙酰化赖氨酸的抗体(CST)检测乙酰化效果。