高性能计算

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• 5、软件子系统(系统软件包括操作系统、编程语言、并行环境、
数学库、性能调优工具、管理软件、调度软件)
高性能计算设备拓扑
Internet
外网 内网 路由器 防火墙 千兆交换机
局域网
管理节点
存储节点
存储阵列
wenku.baidu.com
远程
以太网 Infiniband
光纤网 KVM网
机房
管理千兆 交换机
计算节点
高速Infiniband 交换机
•4、流体力学/分子动力学 主要应用软件:CFD(Ansys、Fluent)工程计算 软件
了解用户研究方向:流体材料、空气动力、 化学反应
了解关键词:并行效果高,动态负载均衡
CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
2、需要大内存
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•5、量子化学 主要应用软件:ADF 了解用户研究方向:物理光谱、分子计算、 材料计算
支持GPGPU 的生物计算软件-AxRecon
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•1、计算物理
•主要应用软件:VASP 了解用户研究方向:物理计算方向有金属、半导体、绝缘体 了解关键词:Kpoint 4X4X4 8X8X8 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
2、CPU及Kpoint 硬盘选型:I/O量小,SATA 网络选型:跟进Kpoint 软件线性比:高
本地KVM
控制台
如何做好HPC的销售工作
• 1、熟悉HPC的核心
a) CPU (basic、standard、advanced) b) 熟悉Linpack的算法 c) 两代主流CPU直接的比较 d) 熟悉内存和硬盘及Raid技术 e) 了解用户计算软件应用情况 f) 了解用户计算网络环境需求
• 2、了解我们能为用户做什么
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•2、计算材料 •主要应用软件:Materials Studio
了解用户研究方向:分子材料模拟、高分子材料
了解关键词:分子动力学;显示输出
CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
2、材料不需要大内存,分子动力 学需要
硬盘选型:材料I/O量小,选择SATA,分子动
2、需要大内存 硬盘选型:I/O量大,SAS 网络选型:千兆网
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•6、理论化学计算 主要应用软件: NAMD+CHARMM;GROMACS;AMBER 了解用户研究方向:理论化学研究;材料计 算;分子
动力学
了解关键词:并行效果高
CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
如何做好HPC的销售工作之GPU 应用
•应用方向:1、生命科学 2、自制程序
厂商
GPGPU硬件产品 Tesla 系列GPGPU
编程环境
应用情况
CUDA
应用软件的
较为广范的 支持
如何做好HPC的销售工作之GPU 应用
支持GPGPU 的生物计算软件-GROMACS
支持GPGPU 的生物计算软件-NAMD 支持GPGPU 的生物计算软件-HMMER 支持GPGPU 的生物计算软件-MUMmerGPU
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•3、计算数学 主要应用软件:Gaussian 了解用户研究方向:科研基础软件
了解关键词:需要CPU高主频,并行效果差 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
2、不需要大内存 硬盘选型:I/O量大,SAS 网络选型:不建议跨节点,需跨节点选择IB
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
高性能计算(HPC)机组成
• 1、计算子系统(可包含CPU、GPU、多路子节点) • 2、网络子系统(管理网络;计算网络(Ethernet、IB)) • 3、存储子系统(本地存储、并行存储) • 4、管理子系统(对整个高性能计算平台运行性能进行实时
监控和管理功能,同时还实现用户交互接口,用户可以方便地登录到 高性能计算平台,申请功能服务器及硬件资源,启动、停止自己功能 服务器功能。)
理论浮点峰值= CPU主频×CPU每个时钟周期执行浮点运算的次数×系统中CPU核心数目
所以理论值和实际值是有差距的,目前要求Linpack的人在逐渐减少
如何做好HPC的销售工作
• Raid 技术 a) Raid 0 b) Raid 1 c) Raid 5 • 计算网络 a) 千兆网络 b) Infiniband 高速计算网络
a) 机群硬件系统搭建 b) 机群软件系统安装
如何做好HPC的销售工作
•Linpack 理论峰值计算 什么是Linpack?
是国际上主流测试HPC浮点运算能力的工具,影响其数值要素为:硬件、 软件及执行参数。 硬件:CPU、内存、网络 软件主要指:MPI 、数学库(函数库) 执行参数指:矩阵规模(计算一元N次方程矩阵,采用高斯消元法(就是 我们说的代入法),通常有100、1000、N即自定义三种。)
了解关键词:并行效果高,动态负载均衡
CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
2、不需要大内存 硬盘选型:I/O量小,SATA
如何做好HPC的销售工作之应用 篇
•6、材料计算 主要应用软件:wien2k 了解用户研究方向:材料计算、电导率 了解关键词:并行效果低 CPU选型:advanced 内存选型:1、根据CPU
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