分子生物学实验思考题答案演示教学
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分子生物学实验思考
题答案
分子生物学实验思考题答案
实验一、基因组DNA的提取
1、为什么构建DNA文库时,一定要用大分子DNA?
答、文库的大小(即数目)取决于基因组的大小和片段的大小,片段大则文库数目小一些也可以包含99%甚至以上的基因组。而文库数目小则方便研究人员操作和文库的保存。所以构建文库要用携带能力大的载体克隆尽量大的DNA片段.
2、如何检测和保证DNA的质量?
答、用凝胶电泳看,有没有质白质和RNA等物质的污染,还可以测OD,用OD260/280来判断,当OD260/OD280< 1.8,表示蛋白质含量较高当OD260/OD280> 2.0,表示RNA含量较高当OD260/OD280=1.8~2.0,表示DNA较纯。
实验二、植物总RNA的提取
1、RNA酶的变性和失活剂有哪些?其中在总RNA的抽提中主要可用哪几种?
答、有DEPC,Trizol,氧钒核糖核苷复合物,RNA酶的蛋白抑制剂以及SDS,尿素,硅藻土等;在总RNA提取中用PEPC,Trizol
2、怎样从总RNA中进行mRNA的分离和纯化。
答、、利用成熟的mRNA的末端具有polyA尾的特点合成一段oligo(dT)的引物,根据碱基互补配对原则,可将mRNA从总RNA中分离出来
实验四、大肠杆菌感受态细胞的制备
1、感受态细胞制备过程中应该注意什么?
答、A)细菌的生长状态:不要用经过多次转接或储于4℃的培养菌,最好从-80℃甘油保存的菌种中直接转接用于制备感受态细胞的菌液。细胞生长密度以刚进入对数生长期时为宜,可通过监测培养液的OD600 来控制。DH5α菌株的OD600为0.5时,细胞密度在5×107 个/mL左右,这时比较合适。密度过高或不足均会影响转化效率。
B)所有操作均应在无菌条件和冰上进行;实验操作时要格外小心,悬浮细胞时要轻柔,以免造成菌体破裂,影响转化。
C)经CaCl2处理的细胞,在低温条件下,一定的时间内转化率随时间的推移而增加,24小时达到最高,之后转化率再下降(这是由于总的活菌数随时间延长而减少造成的);D)化合物及无机离子的影响:在Ca2+的基础上联合其他二价金属离子(如Mn2+或Co2+)、DMSO或还原剂等物质处理细菌,可使转化效率大大提高(100-1000倍); E)所使用的器皿必须干净。少量的去污剂或其它化学物质的存在可能大大降低细菌的转化效率;
2、感受态细胞制备可用在哪些研究和应用领域?
答、在基因工程中将质粒导入受体细胞是如果受体细胞是细菌则将它用Ca2+处理变为感受态细胞质粒进入。
实验五、质粒在大肠杆菌中的转化和鉴定
1、在热激以后进行活化培养,这时的培养基中为什么不加入抗生素?
答、活化培养用的一般是SOC培养基,这种培养基比LB培养基营养,此时进行的活化培养只是为了让大肠杆菌迅速复苏,恢复分裂活性,此时的细胞还不具抗性,加入抗生素会细胞会死亡。
2、什么是质粒?根据在细菌中的复制,质粒有几种类型?用于基因重组的主要用到哪些质粒?
答、质粒是细菌体内的环状DNA分子。
质粒也是作为细菌遗传载体的一部分,但通常其携带的基因对细菌而言必要性要比核内DNA的小很多。比如,抗性基因,荧光蛋白基因等等。
根据质粒随细胞分裂而分裂的次数,将其分为两类:一类是严紧型质粒,当细胞染色体复制一次时,质粒也复制一次,每个细胞内只有1~2个质粒;另一类是松弛型质粒,当染色体复制停止后仍然能继续复制,每一个细胞内一般有20个左右质粒。
常用于基因重组的质粒是pBR322质粒,因为其基因测序已经完成,而且它携带了两个标记基因,一个是氨苄青霉素抗性基因Apr,另一个是四环素抗性基因Tetr。
实验六、质粒DNA的分离纯化和鉴定
1、在实验过程中,加入的EDTA、SDS分别起什么作用?
答、EDTA可以结合DNA酶等,可以抑制其活性;SDS主要是裂解细菌和沉淀蛋白。
2、乙酸钾在实验过程中主要起什么作用?
答、主要是在分离过程中起着中和PH的作用,DNA经碱(NaoH)裂解后,染色体DNA氢键断裂,双螺旋解开,质粒DNA氢键断裂,互补链不能完全分离,再经乙酸钾中和成中性后则复性离心就可以达到分离的效果。
3、氯仿在核酸的提取过程中有何作用?
答、克服酚的特点,加速有机层和液相的分层。最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中迹量酚。
4、本实验整个过程中应该注意些什么?
答、1、提取过程应尽量保持低温;
2、提取质粒DNA过程中除去蛋白质很重要,采用酚、氯仿去除蛋白质要比单独用酚或者氯仿要好,要将蛋白尽量除干净需多次抽提。
3、沉淀DNA一般使用冰乙醇,在低温条件下放置时间稍长可以使沉淀完全。沉淀DNA 也可以使用异丙醇(一般使用等体积),且沉淀完全,速度快,但常把盐沉淀,所以多数还是用乙醇。
实验七、聚合酶链式反应——一般原理和技术
1、降低退火温度对反应有何影响?
答、变性所需的加热温度取决于模板及 PCR 产物双链 DNA 中的 G+C 含量。双链 DNA 中的 G+C 的比率越高,则双链 DNA 分离变性的温度也就越高。变性所需的时间与 DNA 分子的长度相关,DNA 分子越长,在特定的变性温度下使双链 DNA 分子完全分离所需的时间就越长。若变性温度太低或变性时间太短,则只能使 DNA 模板中富含 AT 的区域产生变性,当 PCR 循环中的反应温度降低时,部分变性的 DNA 模板又重新结合成双链 DNA,从而导致 PCR 的失败。非特异性条带数增多。
2、PCR 循环次数是否越多越好?为何?
答、循环次数越多,非特异性产物的量亦随之增多。
3、PCR技术可应用与哪些方面?举例。
答、1、核酸的基础研究:基因组克隆
2、不对称PCR制备单链DNA用于DNA测序