基因检测案例12-青光眼
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基因检测案例12|青光眼
疾病简介
青光眼是一种具有遗传异质性的视神经退行性病变,表现为视网膜神经节细胞的丢失、典型性视野改变和视神经萎缩。眼压升高是青光眼主要的危险因素。原发性青光眼主要分为三种类型:原发性开角型青光眼、原发性闭角型青光眼和原发性先天性青光眼。ASB10 、OPTN、WDR36和Myoc基因突变致常显遗传原发性开角型青光眼。CYP1B1基因突变致常隐遗传原发性先天性青光眼;CYP1B1基因与Myoc双基因遗传致常隐遗传原发性先天性青光眼。
CYP1B1基因简介及遗传方式
细胞色素P450家族CYP1B1亚家族中的成员CYP1B1基因位于染色体2p22-p21区域的 GLC1A 位点上,Vincent等研究发现其除了与PCG致病有关外,还与POAG的发病有关。CYP1B1基因包括3个外显子和2个内含子,外显子长度分别为371、1044和 3707bp;内含子长度分别为390和3032bp,2个内含子都是以GT序列开始而以AT序列结束,内含子3’末端上游是富含嘧啶的区域,编码区起始于第2个外显子的5’末端而在第3个外显子内结束。据推
测,编码的开放阅读框是由长度为1629bp组成的总共编码543个氨基酸的 CYP1B1蛋白。CYP1B基因突变使其底物褪黑素减少,引起代谢物堆积于前房,引起眼压升高,形成POAG。
CYP1B1基因变异类型
HGMD数据库中收录的CYP1B1基因变异有261种,95%以上为点突变或小片段缺失/插入,4%为大片段插入缺失,CYP1B1基因以常染色体隐性的方式遗传,引起原发性开角型青光眼3型和先天性青光眼;同时也能与Myoc双基因遗传致先天性青光眼。
案例分享
临床症状
先证者,女,4岁,临床诊断为先天性青光眼,先证者亲属无相关症状,为散发病例。
检测项目
眼科遗传病基因检测。
检测方法
从受检者外周血中提取基因组DNA,构建基因组文库,通过探针杂交捕获相关的目的基因外显子及相邻部分内含子区域,进行富集。富集的目的基因片段通过高通量测序平台Nova 6000进行测序,对明确的致病性变异,采用Sanger测序进行验证。
检测结果
检出一个与受检者临床表型匹配的致病性基因变异。
备注:按照美国医学遗传学与基因组学学会(ACMG)制定的遗传变异分类标准,变异分为以下5种类型,Pathogenic表示致病的变异;Likely pathogenic 表示可能致病的变异;Benign 表示良性的变异;Likely benign 表示可能良性的变异;Uncertain significance 表示意义不明确的变异。AD 表示常染色体显性遗传;AR 表示常染色体隐性遗传;X-linked 表示X连锁遗传。
遗传解析
1. CYP1B1 (OMIM 601771) 基因突变常引起原发性开角型青光眼3型和先天性青光眼,以常染色体隐性的方式遗传。
2.被检先证者携带以下杂合突变(1)CYP1B1 c.517G>A;p.Glu173Lys,杂合突变,此突变已被HGMD数据库收录,已有文献报道为致病突变【见参考文献1-2】。(2)CYP1B1 c.266T>C;p.Leu89Pro,杂合突变,此突变已被HGMD数据库收录,已有文献报道为高度可疑致病突变【见参考文献3-5】。
3.受检者基因诊断与临床表型相符,为致病突变可能性大。
遗传咨询建议
(1)经验证受检者父母各携带一个突变位点,受检者父母将来再生育时,后代患病的概率为25%,且男女患病概率均等。
(2) 受检者与不携带CYP1B1基因变异的配偶生育时,后代均为不发病的携带者;具体建议进行遗传咨询。
金标准验证
参考文献
1.El-Ashry (2007) J Glaucoma 16, 104
2.Chen (2015) Int J Clin Exp Med 8: 14538 [Additional case report]
3.Qiao (2011) Invest Ophthalmol Vis Sci 52 A3300
4.López -Garrido (2013) Ophthalmology 120: 716 [Additional report]
5.Medina-Trillo (2016) Acta Ophthalmol 94: 555560 [Functional characterisation].