Pipeline Pilot 在化学信息学中的运用

Pipeline Pilot（PP）是美国Accelrys公司旗下用于信息整合和流程定制的软件，是一款功能强大的信息整合和流程定制的科学平台，其在优化研究创新周期、提高工作效率与减少研究和IT经费方面能发挥巨大作用。

通过Pipeline Pilot，用户不仅能够整合和挖掘杂乱无章的海量研究数据，自动化数据的分析流程，而且还可以实现企业级的研究成果快速分析、可视化与共享，提升大范围的协作能力。

Pipeline Pilot Chemistry 模块提供了多种对化合物的筛选和学习方法，实现化合物的性质计算、分析和处理等功能，并能将您的化合物与其他数据库中的化合物进行对比，发现其中性质独特、结构新颖的分子。

另外还能快速枚举和分析组合化学的反应产物，识别一系列化合物中的公共子结构，实现第三方处理程序与Pipeline Pilot 的无缝连接，自动执行对化合物的全部分析过程。

授课对象：
药物设计者，化学信息学者，药物化学家。

课程安排：
本课程教学的主要内容包括两个部分：
一、Pipeline Pilot基础内容培训
? Pipeline Pilot基础架构简介
? Pipeline Pilot操作界面介绍
? 构建第一个protocol
? 熟悉Pipeline Pilot的Components
? 基本的数据操作和筛选
? PilotScript介绍
? 数据的合并
? Subprotocol的创建和处理
? 将构建好的Protocols发布到Web Services
? 课程讨论及答疑
二、Pipeline Pilot 在化学信息学中的运用
? Pipeline Pilot Chemistry模块概述
? 计算化合物的理化性质
? 标准化和处理分子结构
? 分子指纹的介绍和使用
? 化合物的相似性搜索
? 化合物的聚类分析
? 分子筛选：子结构、类药性、HTS筛选
? 组合化学库的设计：通过化学反应和R基团方法
? 生成SAR（构效关系）Table
? 识别化合物的MCSS（最大公共子结构）
? 利用生物等电子体进行先导化合物优化
? 枚举化合物的互变异构体和立体化合物结构
? 课程讨论及答疑
1、根据学员感兴趣的问题及在PP学习过程中常遇见的问题进行生动的讲述。

2、所有学员都能够上机操作，并有工程师进行现场答疑。

3、每节课都会留出一定的时间进行讨论交流，并进行答疑。