遗传算法及遗传编程_OK

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②在[0, 1]区间内产生一个均匀分布的随机数r。
③ 若r≤q1,则染色体x1被选中。
若qk-1<r≤qk(2≤k≤N), 则染色体xk被选中。
qi P( x j )
j 1
i
比例选择法(轮盘赌)
举例
染色体的适应度和所占的比例
锦标赛选择法
基本思想
每次随机选取K个个体,比较之后选择其中适应度最高 的个体做为下一代种群的父体,这个过程反复进行N次。
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20世纪60年代中期,美国Michigan(密西 根)大学的John Holland提出了位串编码技 术,这种编码既适合于变异又适合杂交操 作,并且他强调将杂交作为主要的遗传操 作。随后,Holland将该算法用于自然和人 工系统的自适应行为的研究之中,并于 1975年出版其开创性的著作《Adaptation in Natural and Artificial Systems》。后来, Holland与他的学生们将该算法加以推广并 应用到优化及机器学习等问题之中,而且 正式定名为遗传算法。遗传算法的通用编 码技术及简单有效的遗传操作为其广泛的 应用和成功奠定了基础。
解 (1) 设定种群规模 , 编码染色体,产生初始 种群。 将种群规模设定为 4 ;用 5 位二进制数编码 染色体;取下列个体组成初始种群S1: s1= 13 (01101), s2= 24 (11000) s3= 8 (01000), s4= 19 (10011)
(2) 定义适应度函数,
取适应度函数:f (x)=x2
4
自然选择学说
自然选择学说认为,生物要生存下去,就必须进行生存斗 争。生存斗争包括种内斗争、种间斗争以及生物与无机环境之 间的斗争三个方面。在生存斗争中,具有有利变异(mutation)的 个体容易存活下来,并且有更多的机会将有利变异传给后代, 具有不利变异的个体容易被淘汰,产生后代的机会也少得多。 因此,凡是在生存斗争中获胜的个体都是对环境适应性比较强 的。达尔文把这种在生存斗争中适者生存、不适者淘汰的过程 叫做自然选择。达尔文的自然选择学说表明,遗传和变异是决 定生物进化的内在因素。
遗传算法的生物进化模型
选择 遗传 变异
优胜劣汰 保持特性 产生新特性
遗传算法的基本术语

编码:从问题域到遗传域的映射。即性状与基因的DNA序列的映射


解码:从遗传域到问题域的映射。即将DNA序列解释成个体的性状
适应度:种群的某个个体对生存环境的适应程度。适应度高的个体 可以获得更多的繁殖机会,而适应度低的个体,其繁殖机会就会比 较少,甚至逐渐灭绝 选择:以一定概率从种群中选择若干个体的操作。一般而言,选择 就是基于适应度的优胜劣汰的过程 交叉:在一个或多个染色体的相同位置处被切断,分别交换组合形 成新的染色体
遗传算法基本要素与实现技术

交叉算子
选择是对优秀个体的复制,不能产生新个体,交叉对相互 配对的染色体按某种方式相互交换其部分基因,从而形成 两个新的个体。交叉操作是产生新个体的主要方法

主要关注
1. 2. 3.
如何对染色体进行配对 如果确定交叉点的位置 如何进行部分基因交换
随机配对
将选择出的种群中的M个个体以随机的方式
最优解与具有最大适应值得个体相对应。 适应值能够反映个体质量的差异。 计算量应尽可能小

例:当优化问题为maxf(x),适应度函数可取为f(x)
当优化问题为minf(x),适应度函数可取为-f(x)
个体适应度评价
f ( x)
f ( x)
f ( x)
f ( x)
f ( x)
f ( x)
F(x)

某个优化问题含有6个变量,则它的一个基因表达为
X: 2.50 9.54 3.25 0.25 4.25 7.00
对应的表现型为 x=[2.50,9.54,3.25,0.25,4.25,7.00]
编码与解码
符号编码
个体基因值取自一个无数值含意,而只有代码含义的符号集。 符号集可以是字母,也可以是数字序号。 如血型A,B,AB,O可以分别用[a,b,c,d]表示,或者 [a1,a2,a3,a4],也可表示为[1,2,3,4]
■ M :种群规模
■ T :最大换代数

一般为20-100
一般为100-500
Pc :交叉率(crossover rate)就是参加交叉运 算的染色体个数占全体染色体总数的比例,取 值范围一般为0.4~0.99。 rate)是指发生变异的基 因位数所占全体染色体的基因总位数的比例, 取值范围一般为0.0001~0.1。
(3) 计算各代种群中的各个体的适应度 , 并
对其染色体进行遗传操作,直到适应度最高的个
体(即31(11111))出现为止。
首先计算种群S1中各个体 s1= 13(01101), s2= 24(11000) s3= 8(01000), s4= 19(10011) 的适应度f (si) 。 容易求得 f (s1) = f(13) = 132 = 169 f (s2) = f(24) = 242 = 576 f (s3) = f(8) = 82 = 64 f (s4) = f(19) = 192 = 361
F(x) F(x)
F(x)=f(x)+C
遗传算法基本要素与实现技术

选择算子
适应度较高的个体被遗传到下一代群体中的概率较大,适应度较低的个体被 遗传到下一代群体中的概率较小。
父体的选择是从当前种群中选择能够产生后代的一些个体的过程。选择策略
对算法性能会产生举足轻重的影响。选择压力反映了最好个体被选择的程度。
二进制编码染色体的变异
具体步骤

随机产生一个与个体编码串长度等长的屏蔽字W= 12 l i 为[0,1]间的随机数 按下列规则对基因进行变异

i Pm,则父代基因第i位变异 若
i > Pm,则父代基因第i位不变异 若
浮点编码染色体的变异
浮点编码变异
算法中的一些控制参数:
遗传算法及遗传编程
Ⅰ遗 传 算 法
生物进化
什么是遗传算法 (Genetic Algorithm)
生命自从在地球上诞生以来,就开始了漫长的生
物演化历程,低级、简单的生物类型逐渐发展为 高级、复杂的生物类型。这一过程已经由古生物 学、胚胎学和比较解剖学等方面的研究工作所证 实。生物进化的原因自古至今有着各种不同的解 释,其中被人们广泛接受的是达尔文的自然选择 学说。 生物进化
低级, 简单 高级, 复杂
3
达尔文
达尔文(Charles Robert Darwin,1809- 1882)英国博物学家,进化论的奠基人。1809年2 月12日,出生于英国医生家庭。 1825年至1828年在爱丁大学学医,后进入剑桥大学 学习神学。1831年从剑桥大学毕业后,以博物学家的 身份乘海军勘探船“贝格尔号(Beagle)”作历时5年 (1831-1836)的环球旅行,观察和搜集了动物、植 物和地质等方面的大量材料,经过归纳整理和综合分 析,形成了生物进化的概念。1859年出版《物种起源 (On the Origin of Species)》一书,全面提出以自 然选择(Theory of Natural Selection)为基础的进 化学说。自然选择的进化学说对各种唯心的神造论、 目的论和物种不变论提出根本性的挑战。使当时生物 学各领域已经形成的概念和观念发生根本性的改变。
二进制编码染色体的交叉
多点交叉
多点交叉的破坏性可以促进解空间的搜索
二进制编码染色体的交叉
均匀交叉
两个配对个体的染色体每个基因位以相同的交叉概率进行交 换 具体步骤
随机产生一个与个体编码串长度等长的屏蔽字W= 12 l
按下列规则交叉两个父本的基因
若i=0,则父代第i个基因不相互交换 若i=1,则父代第i个基因相互交换


遗传算法的基本思想
遗传算法基本要素与实现技术
编码与解码 问题域(解空间) 优化变量 二进制编码 浮点数编码 符号编码 . . .
映射
遗传域(基因空间) 优化变量的代码表示
编码与解码
二进制编码

二进制编码是遗传算法中最常用、最原始的一种编码方法,它将 原问题的解空间映射到二进制空间上,然后进行遗传操作。找到 最优个体后再通过解码过程还原原始的数据形式。 二进制编码的串长度 l 取决于求解的精度
2015-1-18
遗传算法的起源
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遗传算法的生物学基础
遗传学的基本结论
1. 生物的所有遗传信息都包含在其染色体中,染色体决定了生物的 性状 2. 染色体是由基因及其有规律的排列所构成.遗传和进化过程发生 在染色体上 3. 生物的繁殖过程是由基因的复制过程来完成的 4. 通过染色体间的交叉和变异会产生新的物种,使生物呈现新的性 状 5. 对环境适应性好的基因或染色体比适应性差的基因或染色体有更 多的机会遗传到下一代
选择方法
比例选择法(轮盘赌)
锦标赛选择法
比例选择法(轮盘赌)

基本思想
各个个体被选中的概率与其适应度大小成正比。 设群体大小为M ,个体 i 的适应度大小为F ( xi ) ,则 个体 i 被选中的概率为
Pi
F ( xi )
F (x )
i 1 i
M
比例选择法(轮盘赌)
①计算各基因适应度值和选择概率及累计概率

编码公式
U max U min
2l wk.baidu.com 1
l
解码公式
x U min ( bi 2i 1 )
i 1
U max U min
2l 1
编码与解码


浮点编码
个体的基因值用某一范围内决策变量的一个浮点数来表示, 个体的编码长度等于其决策变量的个数。 浮点编码使用的是决策变量的真实值
均匀交叉
例如
浮点编码染色体的交叉
线性交叉
交叉公式
子个体=父个体1*f+父个体2*(1-f)
f为[0,1]间的均匀分布随机数
遗传算法基本要素与实现技术
变异算子
将个体染色体编码串中的某些基因位编码与字符集 的其它字符替换
二进制编码染色体的变异
编码字符集为{0,1},变异操作就是将变异点上的基因 取反(即若是1,则取0,若是0,则取1) 变异点是按概率Pm在染色体基因位上指定的
s4 0.31
s30.06
s1 0.14 s2 0.49
赌轮选择示意
在算法中赌轮选择法可用下面的子过程来模拟:
① 在[0, 1]区间内产生一个均匀分布的随机数r。
② 若r≤q1,则染色体x1被选中。
③ 若qk-1<r≤qk(2≤k≤N), 则染色体xk被选中。 其中的 qi称为染色体xi (i=1, 2, …, n)的累计概率, 其计算 公式为

遗传算法基本要素与实现技术
个体适应度评价
为正确计算个体的遗传概率,个体的适应度必须为正 数或者为零,不能为负数。 适应函数的作用是对每一个个体指定一个适应值,使 得我们可以区分种群中个体的好坏,适应值越大,个体越 好,反之。适应函数是区分种群中个体好坏的唯一方式, 是进行选择的基础。
设计适应函数遵循原则
■ Pm :变异率(mutation
遗传算法流程图
编码
生成初始种群
计算适应度
解码
终止?
N
Y
输出
结束
选择—复制
交叉
变异 生成新一代种群
遗传算法应用举例
例 利用遗传算法求解区间[0,31]上的二次 函数y=x2的最大值。
Y
y=x 2
31
X
分析
原问题可转化为在区间[0, 31]中搜索能 使y取最大值的点a的问题。那么,[0, 31] 中 的点x就是个体, 函数值f(x)恰好就可以作为x的 适应度,区间[0, 31]就是一个(解)空间 。这 样, 只要能给出个体x的适当染色体编码, 该问 题就可以用遗传算法来解决。
组成M/2对配对个体组,交叉操作就是在这些 配对个体组中的两个个体之间进行
二进制编码染色体的交叉
单点交叉
基因位数为 l ,交叉点k的范围为[1, l -1],在该点为分界相互交 换变量(保证第一个交叉点左边子串不交换)
例如:
子个体1 子个体2
0 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 1 0 1 0 1 0 1 1 0 1 0
再计算种群S1中各个体的选择概率。 选择概率的计算公式为
P( xi ) f ( xi )
f (x )
j 1 j
N
由此可求得 P(s1) = P(13) = 0.14
P(s2) = P(24) = 0.49
P(s3) = P(8) = 0.06
P(s4) = P(19) = 0.31
● 赌轮选择法
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