微卫星标记及其在动物遗传育种中的应用
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涉及 D N A结 构 , 通常与表型无关 , 这 种 方 法 可在 较 短 时 间 内 ,使 用非 常 低廉 的费用 检 测 出 1 个 群 体 的 全 部 有 害基 因。家 畜 中用 分 子遗 传 学 基 因技 术 研 究 发 现 的遗传 缺 陷 , 多 数是使 用 微卫 星标 记发 现 的。
义 和深 远 的应 用前 景 。1 9 8 9年 , 有 学 者提 出了对微 卫
交, 这 些 差 异会 表 现为 有无 杂 交 带产 生 , 即产 生微 卫
星D N A指 纹 图。
利 用微 卫 星位 点 和某些 功 能基 因位 点 或 Q T L间 的连 锁关 系 ,可将 一 些功 能基 因定 位在 染 色 体 上 或
组 中的位置 , 这是 “ 位置克隆 ” 的首要 一步 , 借 此来 调控改 良动物生产性能。 目 前, 猪、 牛、 绵羊和鸡 的遗 传图谱 已经制作 出来 , 其 中大部分是微卫星标记。 微卫 星早期用于制作 D N A指纹 图来进行个体
作者 简介 : 孙庆 华 ( 1 9 7 8 一) , 男, 硕士, 畜 牧师 , 从事 动物遗传
微 卫 星技术 是 2 O世 纪 8 0年 代 末期 发 展 起 来 的
能 有效 区别 不 同物 种 、不 同群 体 及 不 同基 因型 个 体
和品种 ( 系) 鉴定 。由于不 同个 体 、 品种 ( 系) 或 群体
在 被 检测 位 点上 存 在 一定 差 异 ,因此通 过 电泳及 杂
的分 子标 记 , 可作 为第 二代 分 子标记 。微 卫星 标记 广 泛分 布 于各 真 核生 物基 因组 中, 且 随机 分布 。微卫 星 D N A( Mi c r o s a t e l l i t e ) 是 一类 以 1 - 6 b p的核 苷 酸 为 基 本单 位 ,呈 串联 重 复状 散 在 分 布于 整个 基 因组 的重 复序列 , 具有数量多 , 分布广且均匀 , 多 态 性 丰 富 和 分 析快 速 方便 等 一 系列 优 点 ,并 具 有 重要 的理 论 意
机制是 D N A复制和修复过程中碱基活动 、 错配和减
数分 裂 过程 中姐妹 染 色单 体 的不均 等交 换 。
2 应 用 现 状
现 在微 卫 星标 记 已被作 为 富含 信 息 又 易获 得 的 基 因标 记 , 用 于 构 建 遗 传 连 锁 图谱 、 基 因, 控 制 数 量
性 状 基 因座 位 ( Q T L) 定位 , 亲缘 关 系 分 析 以及 预 测
养殖技术顾 问 2 0 1 3 . 5
示 动 物所 带 遗传 信 息 的 内容 ,准 确确 定 Q T L在 基 因
星序列存在 困难 ; 微卫星位点的获得较为繁琐 , 花费 较 大 ,须 进 行基 因文 库构 建 ,分 子 杂 交 等一 系 列 工
作, 分 析 成本 高 , P C R扩 增 产物 在 检测 过程 中常 出现 “ 影 子 带 ”和一 些 没有 被 扩增 的无 效基 因 , 都 会 给 鉴
他 材料 稳定 , 因此用 来预 测杂 种优 势更 为准确 。 用 微 卫 星标 记 鉴 定 基 因位 点 的 等位 基 因 时 , 仅
1 结构特点及产 生机 理
微卫星又称简单序列重复 ( S S R) , 是 指 以少 数 几个核苷酸 ( 多数为 2 — 4个 ) 为 单位 多 次 串联 重 复 的D N A序列 。微卫 星标 记 由核 心序 列和 两侧 保守 的 侧翼 序 列 构 成 。保 守 的侧 翼序 列 使 微 卫 星 特异 地 定 位 于染 色 体某 一 区域 ,核 心 序列 重 复 数 的 差异 则 形 成微 卫 星 的高度 多态 性 。一 般认 为 , 微卫 星多 态性 的
检 测 动物 个 体基 因型 ,统 计 出动 物 群 体水 平 上 微卫
星座位等位基因的数 目及频率 ,并结合分子遗传学 和数量遗传学原理 ,计算 出各个 品种的平均遗传杂 合 度 和彼 此 间 的遗 传 距离 ,然后 进 行 多个 品种 群 间 的聚类分析 , 从而初步评估该 品种的遗传多样性 , 品 种间的亲缘远近和遗传分化关系。 杂 种 优 势 的大小 在 一 定 程度 上 取 决 于亲 本 间遗 传差异的大小 , 即遗传距离。有人用 D N A多态性测 定 品种或 品系间的差异 ,并据此得 出遗传距离 比其
连锁群中, 在家 禽 ( 畜) 中 已有很 多这 方 面报 道 。此 外, 还可 将 一些 Q T L定 位在 染色 体上 或连 锁群 中 。 利 用 微卫 星 D N A 多态 性 和 共显 性 等遗 传 特 点 ,
星 的分 离 和 P C R技 术 对 微 卫 星 位 点 变 异 特 性 的 研 究, 并 揭 示 了它 的一 些 重 要性 质 , 把 微 卫 星作 为 多 态 D N A标 记 来 进行 群体 进 化研 究 , 核 基 因研究 , 遗传 连 锁分 析 和基 因组 作 图及基 因定位 , 可 能会起 到 重要 的 作用 。 本 文就 微卫 星标记 的特点及 其在 动物遗 传育 种 中的应 用进 行 阐述 , 并 对其 存在 的 问题进行 分 析 。
3 存 在 问题 及 分 析
微 卫 星标 记 是 动物 遗 传 育种 中非 常理 想 的分 子
遗传标记 , 但在具体应用 中也存在一些问题。如微卫
星 研究 起 步 较 晚 , 已知 的微 卫 星位 点较 少 , 获 得 微 卫
杂种 优势 等方 面 。
构建高精度动物遗传连锁 图谱的 目的就是要揭
繁 育 改 良
微 卫 星 标 记 及 其 在 动 物 遗 传 育 种 中 的 应 用
孙庆 华 陈 小兵 2
( 1 . 黑龙 江省杜 尔伯 特 蒙 古族 自治县 畜牧 兽 医兽 医局 黑龙 江杜 尔伯特 1 6 6 2 0 0 ,
2 . 黑龙 江 省杜 尔伯特 蒙古族 自治县职 教 中心 黑龙 江杜 尔伯 特 1 6 6 2 0 0)
育种及畜牧技术推广工作 。
பைடு நூலகம்
定过程带来 困难等 。随着生物芯 片技术 的发展及广
泛应用 , 可尝试将其与微卫星标记结合起来 , 可 以加 速微卫星位点 的筛选 , 微卫星分析时间 , 提高效
率, 也更加有利 于 “ 非 分析 中的应用 , 同时进
『 生D N A 技术 ”在微 卫 星 见模 杂交 检测 。