生物质谱
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生物质谱
早期有机质谱主要用于测定普通的有机小分子,对多肽、蛋白质及其他生物大分子难测定。
因:1.分子量太大
2.气化高温分解。
80年代后,发明了快原子轰击电离(FAB),电喷雾电离(ESI)和基质辅助激光解吸电离(MALDI)。生物大分子可转变成气相离子。产生了生物质谱。
Biomass Spectrometry
有机质谱及其联用技术在生物医药学中的应用
快原子轰击电离(FAB)
1981原理:在进样探头放样品,溶于底物(甘油或硫化甘油),惰性气体(Ar)电离后,加速,使之具有较高的动能,在原子枪(atom gun)内进行电荷
交换反应:
Ar+(高动能的)+ Ar(热运动的)→Ar(高动能的)+ Ar+(热运动的)
高动能的Ar原子束再轰击样品分子使其离子化,样品离子进入质谱。
适用于难汽化,极性强的大分子。
注意:FAB质谱图中会出现基质分子产生的相应的峰及基质分子与样
品分子的结合峰。
电喷雾电离(ESI)
1984用于质谱
原理:样品溶液从毛细管出,电场、气流使成雾状带电液滴,蒸发,
液滴变小,离子从液滴出来,通过锥孔,透镜进质谱仪。
20世纪90年代中期,ESI出现纳喷雾离子源(nanoelectrospray ionization source),纳升流速,分析灵敏度提高,且少至0.5uL的样品溶液可得到30min稳
定喷雾,有充分机会进行质谱参数优化和许多串联质谱分析。
基质辅助激光解吸电离(MALDI)
MALDI可使热敏感或不挥发的化合物由固相直接得到离子。
1988原理:混合物(样品加基质)真空下受激光照,基质分子能有效的吸收激光的能量,成基质离子,碰撞样品,使样品分子解吸附进入气相并得
到电离,进质谱仪。
MALDI适用于生物大分子,如肽类,核酸类化合物。可得到分子离子
峰,无明显碎片峰。
1995Hillenkamp 用MALDI-TOF 测定短杆菌肽S合成酶,分子量为
512000u
R. Nelson 用MALDI-TOF测定单克隆人体免疫球蛋白抗体,分子量为
982000u
以后R.D.Smith 用ESI/FT-ICR-MS测定DNA片段,分子量为1.1 10 8 u
应用范围:
生物大分子的分子量测定
肽序列分析(根据其质谱中的碎片离子来推导)
鉴别生物大分子的构象
蛋白质中二硫键、糖基化(glycosylation site)、磷酸化(phosphorylation) 连接点
用ESI观察非共价键相互作用的研究
I.生物大分子的分子量测定
用MALDI-TOF 测定,多数只得单电荷离子,质谱图中的谱峰与样品各组分的质量数由一一对应关系。所以MALDI-TOF-MS最适合分析多肽及蛋白质混合物。
在ESI-MS时,易形成多电荷离子[M+nH]n+或[M-nH]n-。要确定电荷态。
a.低分辨状态下测电荷态
对于任意两峰M1 =(M+n)/n M2 =(M+[n+1])/n+1 相邻两峰相差一个电荷数计算多电荷离子所带电荷数,进而换算出该离子带单电荷时的质量,一般根据多个多电荷峰计算多个质量后取平均值。
b.高分辨状态下测电荷态
可分辨出单个离子峰的同位素峰,任意两峰之间质荷比的差值,计算其倒数(电荷值)。由电荷数可计算该多电荷离子的单电荷分子离子质量。
II.肽质量指纹谱(peptide mass fingerprinting, PMF)鉴定技术
蛋白质被酶切位点专一的蛋白酶水解,得到的肽片段质量图谱。由实验测得的蛋白质酶解肽段质量数在蛋白质数据库中检索,寻找相似肽指纹谱的蛋白质。
最有效的仪器: MALDI-TOF-MS 每个谱峰代表一种肽段
III. 多肽、蛋白质、DNA片段的序列分析
蛋白质的一级结构:以肽链结构为基础的肽链线型序列
串联质谱仪可直接测定肽段的序列,多肽被电离后,各种键会断裂,形成强度不同的离子。肽键断裂形成b n 、y n系列离子。推断氨基酸连接顺序。
Roepstorff 和Fohlman 建议如下式:
a 、
b 、
c 型离子保留肽链的N 末端,电荷留在离子C 端 x 、y 、z 型离子保留肽链C 端,电荷留在离子N 端
b 型和y 型离子在质谱图中较多见,丰度较高。还会b-H 2O 和y-NH 3等离子形式
与PMF 谱图相比,串联质谱技术获取的肽序列谱图相对复杂,需计算软件帮助计算识别b 、y 等个系列离子。
区别肽质谱离子来自C 端或N 端,衍生方法:N-乙酰化, 甲酯化
分析肽序列方法: FAB/CID
BOC —Gly —Ala —D —Val —Leu —Ile —Obzl
BOC = t-butyloxy carbonyl Bzl = benzyl
H 2N
C
C
N C
N C
N C
COOH
C R 1
O R 2O R 3O R 4H
H C H x 3y 3
z 3x 2y 2
z 2x 1
y 1
z 1a 1
b 1
c 1a 2
b 2
c 2
a 3
b 3
c 3
H 2N
C C
O
R 1
H
H 3N
C N C
COOH R 3
R 4
O H H
H
b 1y"2
H H H
BOC NH CH 2C O
NH CH 3C O NH CH CH (3)2C O NH CH CH 2CH
(CH 3)2
NH CH C O CH(CH 3)C 2H 5C O OBzl
y 4y 3y 2y 1b 1
b 2b 3