药物靶标发现与筛选ppt演示课件
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Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
Copyright restrictions may apply.
Immunohistochemical staining for TH and alpha-tubulin in the SN of an MPTP mice model
药物靶标发现与筛选
基因靶标 核糖核酸靶标
蛋白靶标
1
一、基因靶标
1、在基因数据库中搜寻药物靶标 （1）表达序列标志(expressed sequence tag, EST)数据库 （2）归纳逻辑设计程序
2
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’ 端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完 整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到 7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。EST 来源于 一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库, 因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。
Cell 1998; 92(4): 573-585
Tissue Distribution of Rat prepro-orexin and Orexin Receptor mRNAsA Cell 1998; 92(4): 573-585
Localization of prepro-orexin mRNA and Immunoreactive PБайду номын сангаасptide in Adult Rat Brain
Copyright restrictions may apply.
Downregulated genes
Amino Acid Sequences of Orexins (食欲素) and Orexin Receptors(A) Structures of mature orexin-A and -B peptides
INH(异烟阱)-induced mRNA expression profiles monitored by microarray hybridization analysis.
用INH处理INH 敏感 的结核菌株(红:INH处 理的;绿:INH未处理的)
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
首先从样品组织中提取mRNA ,在逆转录酶的作用下用 oligo ( dT) 作为引物进行RT -PCR 合成cDNA ,再选 择合适的载体构建cDNA 文库,对各菌株加以整理,将每 一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行 两端一次性自动化测序,这就是EST 序列的产生过程。
Quantitative real-time RT-PCR of upregulated or downregulated genes randomly selected from the libraries of human normal SN (黑质)and PD's SN
用INH处理INH 耐药的结核菌株 用乙硫异烟胺处理INH 耐药的结核菌株
Temporal profile of INH-induced expression of selected genes.
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
Roles of INH-induced genes in the context of a proposed pathway for mycolic acid (结核环脂酸) biosynthesis.
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
一、基因靶标
3、基因敲除（knock-out) 技术
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
The ChIP-DSL scheme
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
DNA selection and ligation strategy ）， 芯片/DNA选择结扎技术
11
基因芯片（Gene Chip）通常指DNA芯片，其基本 原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上，然后 与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进 而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛 化到生物芯片（biochip）、微阵列（Microarray）、 DNA芯片（DNA chip），甚至蛋白芯片。
19
An inhibitory glycine synapse
GLYT: 甘氨酸酸转运子
Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
A glutamate synapse.
GMS:修饰后的NMDA受体 Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
TH
alpha-tubulin
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
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Cell death activity of differentially expressed genes in PD Upregulated genes
Cell 1998; 92(4): 573-585
Up-Regulation of prepro-orexin mRNA in Fasted Rats
Cell 1998; 92(4): 573-585
一、基因靶标
2、基因芯片技术 （1）普通基因芯片 （2）ChIP-DSL （coupling ChIP with a
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Immunohistochemical staining for TH and alpha-tubulin in the SN of an MPTP mice model
药物靶标发现与筛选
基因靶标 核糖核酸靶标
蛋白靶标
1
一、基因靶标
1、在基因数据库中搜寻药物靶标 （1）表达序列标志(expressed sequence tag, EST)数据库 （2）归纳逻辑设计程序
2
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’ 端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完 整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到 7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。EST 来源于 一定环境下一个组织总mRNA 所构建的cDNA 文库, 因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。
Cell 1998; 92(4): 573-585
Tissue Distribution of Rat prepro-orexin and Orexin Receptor mRNAsA Cell 1998; 92(4): 573-585
Localization of prepro-orexin mRNA and Immunoreactive PБайду номын сангаасptide in Adult Rat Brain
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Downregulated genes
Amino Acid Sequences of Orexins (食欲素) and Orexin Receptors(A) Structures of mature orexin-A and -B peptides
INH(异烟阱)-induced mRNA expression profiles monitored by microarray hybridization analysis.
用INH处理INH 敏感 的结核菌株(红:INH处 理的;绿:INH未处理的)
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
首先从样品组织中提取mRNA ,在逆转录酶的作用下用 oligo ( dT) 作为引物进行RT -PCR 合成cDNA ,再选 择合适的载体构建cDNA 文库,对各菌株加以整理,将每 一个菌株的插入片段根据载体多克隆位点设计引物进行 两端一次性自动化测序,这就是EST 序列的产生过程。
Quantitative real-time RT-PCR of upregulated or downregulated genes randomly selected from the libraries of human normal SN (黑质)and PD's SN
用INH处理INH 耐药的结核菌株 用乙硫异烟胺处理INH 耐药的结核菌株
Temporal profile of INH-induced expression of selected genes.
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
Roles of INH-induced genes in the context of a proposed pathway for mycolic acid (结核环脂酸) biosynthesis.
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
一、基因靶标
3、基因敲除（knock-out) 技术
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
The ChIP-DSL scheme
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
DNA selection and ligation strategy ）， 芯片/DNA选择结扎技术
11
基因芯片（Gene Chip）通常指DNA芯片，其基本 原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上，然后 与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进 而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛 化到生物芯片（biochip）、微阵列（Microarray）、 DNA芯片（DNA chip），甚至蛋白芯片。
19
An inhibitory glycine synapse
GLYT: 甘氨酸酸转运子
Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
A glutamate synapse.
GMS:修饰后的NMDA受体 Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
TH
alpha-tubulin
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
Copyright restrictions may apply.
Cell death activity of differentially expressed genes in PD Upregulated genes
Cell 1998; 92(4): 573-585
Up-Regulation of prepro-orexin mRNA in Fasted Rats
Cell 1998; 92(4): 573-585
一、基因靶标
2、基因芯片技术 （1）普通基因芯片 （2）ChIP-DSL （coupling ChIP with a