药物靶标发现与筛选ppt演示课件
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《抗肿瘤药物筛选》课件
体外模型筛选
体外模型筛选是在体外模拟人 体肿瘤环境，通过培养肿瘤细 胞或组织来评估药物的抗肿瘤 效果。
体外模型包括细胞培养、组织 切片等，通过测量细胞凋亡、 坏死等指标来评估药物效果。
体外模型筛选具有操作简便、 成本低等优点，但与人体环境 仍存在差异，结果仅供参考。
基因组学和蛋白质组学筛选
1
基因组学和蛋白质组学筛选是通过高通量技术检 测基因和蛋白质的表达水平，以寻找与抗肿瘤药 物效果相关的生物标志物。
总结词
针对特定肿瘤细胞的抗肿瘤药物筛选是通过对肿瘤细胞进行 基因和蛋白质组学分析，寻找能够抑制或杀死肿瘤细胞的药 物。
详细描述
首先，通过基因和蛋白质组学技术对肿瘤细胞进行分析，确 定肿瘤细胞的特性和异常表达的基因和蛋白质。然后，利用 这些信息筛选出能够抑制或杀死肿瘤细胞的药物。最后，通 过实验验证这些药物的抗肿瘤效果。
案例三
总结词
蛋白质组学技术可以分析肿瘤细胞中蛋白质的表达和功能，从而筛选出具有抗肿瘤作用 的药物。
详细描述
蛋白质组学技术可以对肿瘤细胞中蛋白质的表达和功能进行全面分析，发现蛋白质的异 常表达和功能异常。通过比较正常细胞和肿瘤细胞的蛋白质表达谱，可以筛选出具有抗 肿瘤作用的药物。这些药物可能通过干扰肿瘤细胞的信号转导、代谢或细胞周期等过程
人工智能在抗肿瘤药物筛选中的应用
数据挖掘与分析
01
利用人工智能技术对大规模的基因组、临床试验等数据进行挖
掘和分析，发现潜在的抗肿瘤药物靶点和治疗方案。
预测模型与辅助决策
02
建立预测模型，根据患者的基因组、临床特征等信息，预测其
对不同药物的反应和疗效，为医生提供辅助决策支持。
自动化实验平台
03
药物筛选基础知识PPT课件
药物筛选的流程
样品准备
从各种来源获取大量化合物或 混合物，并进行预处理，以便
进行后续的筛选实验。
筛选模型建立
根据研究目的和筛选目标，建 立合适的生物或化学筛选模型 ，用于评估化合物的生物活性 或药理作用。
筛选实验实施
按照建立的筛选模型，对预处 理的样品进行实验，记录实验 结果并进行初步分析。
活性化合物筛选
针对神经性疾病的药物靶点筛选
利用神经元细胞系和小鼠模型，通过蛋白质组学方法，筛选出与神经性疾病相关 的蛋白质，作为潜在的药物靶点。
03
化合物筛选
化合物筛选的方法
基于细胞活性的筛选
高通量筛选
通过检测细胞对化合物的反应，评估 化合物的生物活性。
利用自动化技术对大量化合物进行快 速、高效的筛选。
基于酶活性的筛选
药物副作用问题
许多已上市的药物存在严重的副作用，这给患者带来极大的风险和困 扰。如何降低药物副作用是药物筛选面临的重要挑战之一。
药物筛选的未来发展方向
人工智能与机器学习在药物筛选中的应用
01
随着人工智能和机器学习技术的发展，越来越多的研究开始探
索其在药物筛选领域的应用，以提高筛选效率和精准度。
精准医疗与个性化药物
药物筛选基础知识PPT课件
• 药物筛选概述 • 药物靶点筛选 • 化合物筛选 • 细胞模型筛选 • 药物筛选的挑战与未来发展
01
药物筛选概述
药物筛选的定义
药物筛选
是指在大量化合物或混合物中快速、准确地找出具有特定生物活性或药理作用 的物质的过程。
特定生物活性或药理作用
指能够影响生物体内特定生理、生化过程或病理过程，并产生一定生物效应的 物质。
药物。
药物发现与药物筛选ppt课件
八、样品数据库信息表
化 合 物 数 据 库
中国医学科学院 药物研究所
SupplierUnit Supplier SerialNumber Structure O O S O O O N N N N S N N 医科院药物所 徐世平 6300 Tutor Deliv erDate Source Sample_No. Beijing_No. Amount Solv ent StereoInf ormation MolName Stability Recry stalSolv ent FurtherSupply C 16H20N6O5S2 SampleIndicator Activ ity _Indicator 440.5030 Appearance Purity Object Mp XSP3-5 SampleNum.
优势和局限性
高效、低耗自动化程度高 机理明确、结果误差小 信息量大、比较范围大 药理作用不明确
13
药物发现简史
——药物筛选方法比较
原始方法 现代方法 高通量筛选
观察对象
筛选规模 筛选方向 样品用量
人
零散 随机 不定
动物
小规模<100/日 定向 1—5克
细胞、分子
大规模>1000/日 随机/一药多筛 1—5微克
高通量药物筛选就是应用分子细胞水平的药物活性评 价方法（模型），通过自动化手段，对大量样品进行 生物活性或药理作用的检测，发现新药的过程。高通
量药物筛选的规模至少为每日筛选数千个样品。
16
高通量药物筛选——理论基础
传统药理学研究
动物模型 ↓ 药效学筛选 ↓ 活性化合物 ↓ 分子细胞水平研究 ↓ 作用机理研究 ↓
主动寻找
最新抗肿瘤药物筛选课件
2.基本技术路线
①基因的选择与实验设计
根据表达谱数据库选择5000-10000 个与发育及疾病相关的基因，制备药 物筛选芯片。
②芯片的制备
③细胞的培养与药物刺激
根据目的药物及表达谱芯片数据库中细胞 表达谱选择适当的细胞系，用适当计量的药物 加入细胞培养液中，不同的时间取样，抽提刺 激前后的mRNA。
二 微生物学筛选方法
(抗肿瘤抗生素)
1.噬菌体法 2.细菌变种法 3.抗代谢法
1.噬菌体法
噬菌体：是一类能感染微生物的病毒
（1）抗噬菌体法：干扰DNA代谢的抗生素如放线菌 素、博来霉素常能抑制噬菌体在细菌细胞内的生长， 从而不产生噬菌体颗粒而出现抗噬菌体的现象。
（2）溶原性菌诱导法：除烈性噬菌体外，还有一种 噬菌体，其基因组直接螯合到细菌染色体DNA，不复 制，因其大部分基因功能受到了“阻遏物”阻抑， 这种带前噬菌体的菌株称温和性或溶原性菌。但是 当“阻遏物”的量由于细胞内或环境因子（物理、 化学）而降低时，溶原性就不能维持，前噬菌体开 始生长，是细菌裂解，称为诱导作用。一些抗肿瘤 抗生素有诱导能力。
应用：药物体内初筛。
模型建立方法
实体瘤建立 1.小块瘤体接种法 2.肿瘤细胞悬液接种法 3.培养细胞移植法
治疗方案：接种后生长至可触及即可治疗，依药物 特性及研究目的确定方案，可给药一次，或连续 几次，或一周几次连续几周。
疗效评价： 肿瘤抑制率＝（对照组瘤重－给药组瘤重）/对照组
瘤重×100％
腹水瘤建立及评价：
（3）用碘酒、酒精消毒蛋壳。敲碎蛋壳把鸡胚移入平皿中， 加入EagleFs培养液5-10ml，然后，可选择在鸡胚尿囊膜血管 网的任何位置放置小块明胶海绵作为筛选抗血管生成药物的 载体，然后加入不同浓度的血管生成抑制剂。
药物作用靶点(课堂PPT)
• Overington JP, Al-Lazikan IB, Hopkinsal. How many drug targets are there? Nat Rev Drug Discov, 2006, 5(12) : 993-996.
17
2. 上市药物靶点的类别
• 生物化学分类: 上市小分子和生化药靶点, 50%以上属4 个关键生化类别: G-蛋白偶联受体(26.8%),核受体(13%),配体门控性离子通道(7.9%)及电 压门控离子通道(5.5%) 。其他包括青霉素结合蛋白,髓过氧化酶,神经递 质,DNA拓扑异构酶,纤维结合蛋白,细胞色素P450等。
试剂特异结合并产生临床疗效的分子结构。不包括药理学和生物化学研究工 具以及相关技术。得出的结论：目前的分子药物靶点数目为218个。 • Overington 等(2006)提出有价值的评估: 药物数量减至1357种。所有药物通 过324个靶标起作用,其中266个为人类基因衍生的,其余为病原体靶标。 • 小分子药物作用于248种蛋白,其中207个靶标由人体基因组编码;口服小分子 药物靶标227个,其中186个为人类基因靶标。
14
药物研发需要生物学,化学,电脑 物理,仪器分析等多个领域合作
15
五. 靶点药物开发概况
• 现代药物开发是基于特定靶寻找先导化合物,进而筛选候选药物的过程。 • 人类基因组研究结果预测: 有600种小分子靶点,1800多蛋白质靶点,及
2100种基因治疗和siRNA治疗靶点。 • 失败教训: 近20年对高选择性靶点的集中研发,候选新药经临床试验后
ad靶向治疗药物38葡萄糖苷酶小肠内水解糖苷键生成单糖葡萄糖激酶gk醛糖还原酶ar二肽肽激酶dpp蛋白激酶cpkc蛋白酪氨酸激酶ptk和蛋白酪氨酸磷酸酶ptp一氧化氮合酶nos血管紧张素转换酶ace肉碱酯酰转移酶cpt糖代谢酶蛋白磷酸化酶39天然靶点药物研究模式已知确立大量提取物的筛选几百种可组合活性比较找出作用强的几中细胞组织动物实验可委托临床试验酶活性测定40天然药物提取分离与制备提取分离新方法
17
2. 上市药物靶点的类别
• 生物化学分类: 上市小分子和生化药靶点, 50%以上属4 个关键生化类别: G-蛋白偶联受体(26.8%),核受体(13%),配体门控性离子通道(7.9%)及电 压门控离子通道(5.5%) 。其他包括青霉素结合蛋白,髓过氧化酶,神经递 质,DNA拓扑异构酶,纤维结合蛋白,细胞色素P450等。
试剂特异结合并产生临床疗效的分子结构。不包括药理学和生物化学研究工 具以及相关技术。得出的结论：目前的分子药物靶点数目为218个。 • Overington 等(2006)提出有价值的评估: 药物数量减至1357种。所有药物通 过324个靶标起作用,其中266个为人类基因衍生的,其余为病原体靶标。 • 小分子药物作用于248种蛋白,其中207个靶标由人体基因组编码;口服小分子 药物靶标227个,其中186个为人类基因靶标。
14
药物研发需要生物学,化学,电脑 物理,仪器分析等多个领域合作
15
五. 靶点药物开发概况
• 现代药物开发是基于特定靶寻找先导化合物,进而筛选候选药物的过程。 • 人类基因组研究结果预测: 有600种小分子靶点,1800多蛋白质靶点,及
2100种基因治疗和siRNA治疗靶点。 • 失败教训: 近20年对高选择性靶点的集中研发,候选新药经临床试验后
ad靶向治疗药物38葡萄糖苷酶小肠内水解糖苷键生成单糖葡萄糖激酶gk醛糖还原酶ar二肽肽激酶dpp蛋白激酶cpkc蛋白酪氨酸激酶ptk和蛋白酪氨酸磷酸酶ptp一氧化氮合酶nos血管紧张素转换酶ace肉碱酯酰转移酶cpt糖代谢酶蛋白磷酸化酶39天然靶点药物研究模式已知确立大量提取物的筛选几百种可组合活性比较找出作用强的几中细胞组织动物实验可委托临床试验酶活性测定40天然药物提取分离与制备提取分离新方法
药物靶标发现与筛选PPT课件
药物靶标发现与筛选的前景
基因组学和蛋白质组学的发展
随着基因组学和蛋白质组学技术的不断发展，将为药物靶标发现与筛选提供更广泛和深入 的视角。
人工智能和机器学习技术的应用
人工智能和机器学习技术有助于从大量数据中挖掘有用的信息，提高药物靶标发现与筛选 的效率和准确性。
免疫疗法和基因疗法的兴起
免疫疗法和基因疗法等新兴治疗方法的兴起，将为药物靶标发现与筛选提供新的方向和机 会。
案例三：代谢性疾病药物靶标发现与筛选
总结词
代谢性疾病是一类常见的慢性疾病，代谢性疾病药物 靶标发现与筛选对于代谢性疾病的治疗具有重要意义 。
详细描述
代谢性疾病药物靶标发现与筛选主要涉及代谢组学、糖 生物学和脂类生物学等领域的研究。通过对糖、脂肪、 蛋白质等代谢物质的深入研究，科学家们可以发现代谢 性疾病中关键的分子靶点，进而筛选出具有调节代谢平 衡和缓解症状的药物候选物。这些药物候选物经过临床 试验验证后，可以用于代谢性疾病治疗，降低患者的血 糖、血脂和血压水平，预防心血管疾病和糖尿病等并发 症的发生。
虚拟筛选方法
虚拟筛选方法
利用计算机模拟技术，对大规模 化合物库进行虚拟筛选，发现具 有潜在活性的小分子化合物，从
而筛选潜在的药物靶标。
数据库构建
建立大规模化合物库和靶标数据库， 为虚拟筛选提供数据基础。
分子对接模拟
利用分子对接技术，模拟小分子化 合物与靶标蛋白的相互作用，预测 其活性，进一步筛选潜在的药物靶 标。
药物靶标筛选提供依据。
基因表达谱分析
通过比较正常和疾病状态下的基 因表达谱，发现差异表达的基因，
进一步筛选潜在的药物靶标。
蛋白质组学筛选方法
蛋白质组学筛选方法
利用蛋白质组学技术，如质谱分析和 蛋白质芯片等，发现与疾病相关的蛋 白质，从而筛选潜在的药物靶标。
抗肿瘤药物筛选ppt课件
生长因子、胰岛素样生长因子、以及细胞因子白介素-6.
白介素-8等.这些因子能够诱导刺激肿瘤增殖和迁移.而且, 肿瘤细胞与毛细血管形成结构上的密切关系.此外,肿瘤细 胞和血管细胞具有相互作用.一方面血管内皮细胞产生的 各种生长因子和细胞因子对肿瘤生长起到生长刺激作用; 17
★抑制血管生成药物的筛选方法
子靶点.利用多种多样的分子靶点,将可能发现具有
各种分子作用机制的药物.
• 3.研制靶向性药物. 包括抗体药物和针对特定分
子靶点的小分子抑制剂.
26
动物实验疗效评价
• 动物实验疗效评价是发现新药的依据.不管
采用何种分子靶点和相应的检测方法进行 初筛,都必须经过动物实验疗效评价.动物体 内实验反映药物疗效与毒性的综合结果,是 体外方法与模型不能取代的决定性环节.
是B型精原细胞,其次是A型精原细胞,然后依次为
精子细胞、
精母细胞、精子.
15
• 精原细胞法阳性和抗肿瘤作用的相关性尤
以在抗生素和植物药中较为明显.
• 用精原细胞法检测72种抗生素,精原细胞法
阳性的13种抗生素,据已报道资料均属抗肿 瘤抗生素,其中9种在临床上有一定疗效.
• 精原细胞法阴性的59种抗生素中,除又霉素、
抗肿瘤药物筛选
1Leabharlann 抗肿瘤药物筛选• 是新药发现与开发的重要环节.通常是指从
样品到活性检测至动物实验疗效各个
阶段的工作.
。
• 一般常用以下几种方法:
• 1. 肿瘤细胞组织培养筛选方法
• 2. 微生物学筛选方法
• Antitumor durg screening
2
1. 肿瘤组织细胞培养筛选方法
• 细胞培养法是筛选抗肿瘤药物比较常用的
白介素-8等.这些因子能够诱导刺激肿瘤增殖和迁移.而且, 肿瘤细胞与毛细血管形成结构上的密切关系.此外,肿瘤细 胞和血管细胞具有相互作用.一方面血管内皮细胞产生的 各种生长因子和细胞因子对肿瘤生长起到生长刺激作用; 17
★抑制血管生成药物的筛选方法
子靶点.利用多种多样的分子靶点,将可能发现具有
各种分子作用机制的药物.
• 3.研制靶向性药物. 包括抗体药物和针对特定分
子靶点的小分子抑制剂.
26
动物实验疗效评价
• 动物实验疗效评价是发现新药的依据.不管
采用何种分子靶点和相应的检测方法进行 初筛,都必须经过动物实验疗效评价.动物体 内实验反映药物疗效与毒性的综合结果,是 体外方法与模型不能取代的决定性环节.
是B型精原细胞,其次是A型精原细胞,然后依次为
精子细胞、
精母细胞、精子.
15
• 精原细胞法阳性和抗肿瘤作用的相关性尤
以在抗生素和植物药中较为明显.
• 用精原细胞法检测72种抗生素,精原细胞法
阳性的13种抗生素,据已报道资料均属抗肿 瘤抗生素,其中9种在临床上有一定疗效.
• 精原细胞法阴性的59种抗生素中,除又霉素、
抗肿瘤药物筛选
1Leabharlann 抗肿瘤药物筛选• 是新药发现与开发的重要环节.通常是指从
样品到活性检测至动物实验疗效各个
阶段的工作.
。
• 一般常用以下几种方法:
• 1. 肿瘤细胞组织培养筛选方法
• 2. 微生物学筛选方法
• Antitumor durg screening
2
1. 肿瘤组织细胞培养筛选方法
• 细胞培养法是筛选抗肿瘤药物比较常用的
药物作用靶点课件
流通过程中价格翻十几倍,造成药价过高。研发好药不如搞定几家医院! • 4）无证经营和超范围经营, 买卖、出租、出借许可证等屡禁不止。 • 5）零售药店和生产企业不规范。80%以上购药者会向药店销售员咨询,大多数最
后采纳其意见选药。但药店销售人员70%以上未经正规医药知识培训。销售员为 “厂家提成”而向顾客推荐高价药。 一些药企取得GMP等认证后,为节约成本和迅速获利而降低生产条件和管理。
我国药物创新和研发存在的问题
中和药业
• 1．研发经费不足。全国药物研发总投入少于美国的辉瑞公司。 • 2．技术水平有限,研发团队建设不力。药物行业是技术密集型行业。
没有几个企业真正投入技术力量研发新药,无研发部门或研发部门转行。 国外药企研发人员占从业员30%,我国不到4%,且大多从事技术型改造。 • 3．主流研发机构与药企合作不成熟。研究机构重文章,企业重市场。 • 4. 宏观政策影响大,缺乏总体规划,高税收和逐年降价使企业濒临停产。 • 5. 知识产权问题日益突出。外国药企纷纷加大在中国的知识产权保护。 在国外上市的新药中几乎不可能有新药供国内药企仿制。美国、日本、 欧盟批准的新药在化合物专利、制备工艺专利、适应症专利、用法用量 专利都获得相应的保护。
涌现,可成果寥寥无几,有国际影响的创新药一个都没有。” • 49年以来,我国自主研发、有国际影响的“新药”仅两个,50年代合成的二巯
基丁二酸钠和60年代开发的青蒿素。60年代至今,无一原创药诞生。 • 我国每年都有上百新药被注册,而美国、英国一年难出几例新药
文档仅供参考，不能作为科学依据，请勿模仿；如有不当之处，请联系本人改正。
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四. 基于靶标的药物设计
后采纳其意见选药。但药店销售人员70%以上未经正规医药知识培训。销售员为 “厂家提成”而向顾客推荐高价药。 一些药企取得GMP等认证后,为节约成本和迅速获利而降低生产条件和管理。
我国药物创新和研发存在的问题
中和药业
• 1．研发经费不足。全国药物研发总投入少于美国的辉瑞公司。 • 2．技术水平有限,研发团队建设不力。药物行业是技术密集型行业。
没有几个企业真正投入技术力量研发新药,无研发部门或研发部门转行。 国外药企研发人员占从业员30%,我国不到4%,且大多从事技术型改造。 • 3．主流研发机构与药企合作不成熟。研究机构重文章,企业重市场。 • 4. 宏观政策影响大,缺乏总体规划,高税收和逐年降价使企业濒临停产。 • 5. 知识产权问题日益突出。外国药企纷纷加大在中国的知识产权保护。 在国外上市的新药中几乎不可能有新药供国内药企仿制。美国、日本、 欧盟批准的新药在化合物专利、制备工艺专利、适应症专利、用法用量 专利都获得相应的保护。
涌现,可成果寥寥无几,有国际影响的创新药一个都没有。” • 49年以来,我国自主研发、有国际影响的“新药”仅两个,50年代合成的二巯
基丁二酸钠和60年代开发的青蒿素。60年代至今,无一原创药诞生。 • 我国每年都有上百新药被注册,而美国、英国一年难出几例新药
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四. 基于靶标的药物设计
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PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
一、基因靶标
3、基因敲除（knock-out) 技术
PNAS 1999; 96(22): 1283eme
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
Copyright restrictions may apply.
Immunohistochemical staining for TH and alpha-tubulin in the SN of an MPTP mice model
TH
alpha-tubulin
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
Copyright restrictions may apply.
Cell death activity of differentially expressed genes in PD Upregulated genes
药物靶标发现与筛选
基因靶标 核糖核酸靶标
蛋白靶标
1
一、基因靶标
1、在基因数据库中搜寻药物靶标 （1）表达序列标志(expressed sequence tag, EST)数据库 （2）归纳逻辑设计程序
2
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’ 端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完 整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到 7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。EST 来源于 一定环境达水平。
用INH处理INH 耐药的结核菌株 用乙硫异烟胺处理INH 耐药的结核菌株
Temporal profile of INH-induced expression of selected genes.
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
Roles of INH-induced genes in the context of a proposed pathway for mycolic acid (结核环脂酸) biosynthesis.
DNA selection and ligation strategy ）， 芯片/DNA选择结扎技术
11
基因芯片（Gene Chip）通常指DNA芯片，其基本 原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上，然后 与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进 而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛 化到生物芯片（biochip）、微阵列（Microarray）、 DNA芯片（DNA chip），甚至蛋白芯片。
Cell 1998; 92(4): 573-585
Tissue Distribution of Rat prepro-orexin and Orexin Receptor mRNAsA Cell 1998; 92(4): 573-585
Localization of prepro-orexin mRNA and Immunoreactive Peptide in Adult Rat Brain
Cell 1998; 92(4): 573-585
Up-Regulation of prepro-orexin mRNA in Fasted Rats
Cell 1998; 92(4): 573-585
一、基因靶标
2、基因芯片技术 （1）普通基因芯片 （2）ChIP-DSL （coupling ChIP with a
Copyright restrictions may apply.
Downregulated genes
Amino Acid Sequences of Orexins (食欲素) and Orexin Receptors(A) Structures of mature orexin-A and -B peptides
19
An inhibitory glycine synapse
GLYT: 甘氨酸酸转运子
Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
A glutamate synapse.
GMS:修饰后的NMDA受体 Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
INH(异烟阱)-induced mRNA expression profiles monitored by microarray hybridization analysis.
用INH处理INH 敏感 的结核菌株(红:INH处 理的;绿:INH未处理的)
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
首先从样品组织中提取mRNA ,在逆转录酶的作用下用 oligo ( dT) 作为引物进行RT -PCR 合成cD片段根据载体多克隆位点设计引物进行 两端一次性自动化测序,这就是EST 序列的产生过程。
Quantitative real-time RT-PCR of upregulated or downregulated genes randomly selected from the libraries of human normal SN (黑质)and PD's SN
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
一、基因靶标
3、基因敲除（knock-out) 技术
PNAS 1999; 96(22): 1283eme
PNAS 2007; 104（2): 4852-4857
E2-induced gene expression and the biological relevance of direct ER target genes
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
Copyright restrictions may apply.
Immunohistochemical staining for TH and alpha-tubulin in the SN of an MPTP mice model
TH
alpha-tubulin
Kim, J.-M. et al. DNA Res 2006 13:275-286; doi:10.1093/dnares/dsl016
Copyright restrictions may apply.
Cell death activity of differentially expressed genes in PD Upregulated genes
药物靶标发现与筛选
基因靶标 核糖核酸靶标
蛋白靶标
1
一、基因靶标
1、在基因数据库中搜寻药物靶标 （1）表达序列标志(expressed sequence tag, EST)数据库 （2）归纳逻辑设计程序
2
EST是从一个随机选择的cDNA 克隆进行5’端和3’ 端单一次测序获得的短的cDNA 部分序列,代表一个完 整基因的一小部分,在数据库中其长度一般从20 到 7000bp 不等,平均长度为360 ±120bp 。EST 来源于 一定环境达水平。
用INH处理INH 耐药的结核菌株 用乙硫异烟胺处理INH 耐药的结核菌株
Temporal profile of INH-induced expression of selected genes.
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
Roles of INH-induced genes in the context of a proposed pathway for mycolic acid (结核环脂酸) biosynthesis.
DNA selection and ligation strategy ）， 芯片/DNA选择结扎技术
11
基因芯片（Gene Chip）通常指DNA芯片，其基本 原理是将指大量寡核苷酸分子固定于支持物上，然后 与标记的样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进 而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的概念现已泛 化到生物芯片（biochip）、微阵列（Microarray）、 DNA芯片（DNA chip），甚至蛋白芯片。
Cell 1998; 92(4): 573-585
Tissue Distribution of Rat prepro-orexin and Orexin Receptor mRNAsA Cell 1998; 92(4): 573-585
Localization of prepro-orexin mRNA and Immunoreactive Peptide in Adult Rat Brain
Cell 1998; 92(4): 573-585
Up-Regulation of prepro-orexin mRNA in Fasted Rats
Cell 1998; 92(4): 573-585
一、基因靶标
2、基因芯片技术 （1）普通基因芯片 （2）ChIP-DSL （coupling ChIP with a
Copyright restrictions may apply.
Downregulated genes
Amino Acid Sequences of Orexins (食欲素) and Orexin Receptors(A) Structures of mature orexin-A and -B peptides
19
An inhibitory glycine synapse
GLYT: 甘氨酸酸转运子
Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
A glutamate synapse.
GMS:修饰后的NMDA受体 Trends Pharmacol Sci. 2005;26(6):283-286
INH(异烟阱)-induced mRNA expression profiles monitored by microarray hybridization analysis.
用INH处理INH 敏感 的结核菌株(红:INH处 理的;绿:INH未处理的)
PNAS 1999; 96(22): 12833-12838.
首先从样品组织中提取mRNA ,在逆转录酶的作用下用 oligo ( dT) 作为引物进行RT -PCR 合成cD片段根据载体多克隆位点设计引物进行 两端一次性自动化测序,这就是EST 序列的产生过程。
Quantitative real-time RT-PCR of upregulated or downregulated genes randomly selected from the libraries of human normal SN (黑质)and PD's SN