乳腺癌致病基因BRCA1的生物信息学分析

当代化工研究

丄 O I I Chenmical I ntermediate

生物制药■与研究2019•01乳腺癌致病基因BRCA1的生物信息学分析

*辛艾玲

(成都七中实验学校四川610000)

摘要：BRCA1作为乳腺癌关键蛋白参与了乳腺癌和卵巢癌的发生，本文对BRCA1基本特性进行了初步的分析，通过分析其整体的亲疏水 性，氨基酸组成，表明BRCA1倾向是核蛋白，整体呈亲水性•使用PS0RT2分析工具对BRCA1亚细胞定位进行领测，表明BRCA1蛋白主要分 布在细胞核中.利用MEGA软件进行BRCA1系统发育分析，结果表明人BRCA1与猿的BRCA1亲缘关系高度相近•最后，采用同源建模（比较建 模）方法构建了BRCA1蛋白的三级结构，从建模质量评估显示预测结果准确。

关鍵词：BRCA1蛋白；三级结构预测；亚细胞定位预测；系统发育分析

中图分类号：R文献标识码：A

Bioinformatics Analysis of Pathogenic gene BRCA1 in Breast Cancer

Xin Ailing

(Experimental School of Chengdu No.7Middle School,Sichuan,610000)

A bstract: BRCA1, as a key p rotein in breast cancer, is involved in the occurrence o f b reast cancer and ovarian cancer. This p aper makes a preliminary analysis o f t he basic characteristics ofBRCAl. By analyzing its overall hydrophilicity and h ydrophobicity and a mino acid c omposition, it shows that BRCA1 tends to be nucleoprotein and o verall shows hydrophilic. By using P SORT2 analysis tool to cany out the p rediction on the location o f

B RCA1 subcells, it indicats that BRCA 1 protein is mainly distributed in the nucleus. By making phylogenetic analysis o f B RCA1 using MEGA software, it s howed t hat the g enetic relationship between human BRCA1 and a pe BRCA1 was highly s imilar. Finally, the three-level s tructure ofBRCAl protein was constructed by the method o f h omologous modeling (comparative modeling), and the p rediction results were accurate f rom the modeling quality evaluation.

K ey w ords i BRCA1 protein；Three-level structure p rediction；subcellular localization p rediction；phylogenetic analysis

1背景

近些年，我国女性乳腺癌的发病几率逐渐升高，特别 是在一线城市的发病率很高。目前，乳腺癌已位居女性恶性 肿瘤首位，在家族中会发生家族聚集现象，且发病年龄逐渐 年轻化，极大地威胁着我国妇女的身体健康，我们需对此引 起重视。乳腺癌易感基因（BRCA1)是乳腺癌的危险因素之

一，是目前为止发现的与乳腺癌相关的最重要的抑癌基因。它在遗传性乳腺癌患者中有较高的突变率，已成为评估女性 患乳腺癌风险和指导方案选择的重要分子标志物。其生物 功能广泛，对细胞周期，基因转录，D N A修复等功能均有影 响。BRCA1蛋白是一种由BRCA1基因产生的由1863个氨基酸组 成的多功能区核蛋白，它与其它肿瘤抑制因子和信号传感器 等形成复合物，在D N A修复损伤，转录调控，细胞周期的调 节和泛素化方面起着重要作用。本论文就BRCA1蛋白的氨基 酸组成、疏水性、亚细胞定位、系统发育分析和它的蛋白

质结构进行了分析，我们希望这些结果对于更进一步地了解 BRCA1与乳腺癌的关系起到一定作用。

2.材料与方法

⑴人蛋白氣基酸序列

从uniprot上下载人Brcal蛋白氨基酸序歹|J(FAST格式），

以人Brcal蛋白序列为例：

>sp|P38398|BRCAl_HUMAN Breast cancer type 1 susceptibility protein 0S=Homo sapiens OX=9606 G N=B R C A1 PE=1 SV=2

M DLSALRVEEVQN V IN AM Q K ILECPICLELIKEPVSTK CD H IFCK FCM LK LLN Q K K G PSQ

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