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一个Step By Step教程:使用Mimics导入图像...

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/viewthread.php?tid=842137&extra=page%3 D3%26amp%3Bfilter%3Dtype%26amp%3Btypeid%3D403 一个Step By Step教程:使用Mimics导入图像裸数据各位医生搞研究的时候,往往找不到数据来源。

国外的很多实验室和组织的网站提供了一些图像。

然而,大多数是裸数据的文件。

我在前一个帖子中提到Mimics能处理裸数据图像,但是还不太具体。

下面我StepByStep地介绍一下怎么导入裸数据。

跟我做就可以了~1.首先到网站,然后点击Download New Dataset。

进入我们需要的下载页面。

2.我们以第四行的腹部扫描图像为例,点击左边图片进行下载,同时给出的留意5条重要信息。

参见图1。

针对这幅图像,5条重要信息(参考我上一个帖子"Mimics到底支持怎样的图像格式")为:1)每张图像的大小:512x5122)一共有多少张图像:174层3)在每一层中,像素的间距是多大:0.8398x0.8398(水平间距和垂直间距一般相等)4)层和层之间的距离有多大?3.25)每个像素的数据有多大?16Bit,也就是两字节,数据类型为short我们知悉了上述信息,并且有了图像文件,就可以开始导入图像裸数据了。

3.将下载来的压缩包stent16.raw.zip解压,得到一个单文件stent16.raw。

在其属性中可以看到其大小是91,226,112字节。

如图2所示。

4.打开Mimics,在File菜单下选择Import Images,选择刚才的stent16.raw文件,并注意点选导入对话框下方的Manual Import选项,进入手工转换图像对话框。

5.将第2步中记录的5个信息,输入到这个对话框的对应位置,如图3所示。

下面详细解释每个改动的部分:File Structure中:a) File Header Size是指图像文件头部的大小。

mimics中文版教程(持续更新版0812)

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第二章Mimi本教程的第二个例子中,我们将为你展示Mimics的一些基本功能,所要讨论的主题如下:●打开工程Opening the Project●窗口化Windowing●二值化Thresholding●区域增长Region Growing●建立3D表示Creating a 3D representation●显示3D表示Displaying a 3D representation●STL+过程STL+ Procedures●生成STL文件Generating a STL file●RP分层过程RP Slice procedures●生成一个轮廓文件Generating a contour file●生成支持文件Generating supports●结果视图View of the end result1.打开工程在文件菜单栏中,选择打开工程选项(或者直接用快捷键Ctrl+O),打开对话框中将显示工作目录中所有工程,双击打开mimi.mcs文件。

所有的图片都被打开并显示在三个视图中,右边视图是轴视图(xy-view或者axial view),左侧上面的视图是前视图(xz-view或者coronal view),左侧下面的视图是侧视图(yz-view或者sagittal view)。

不同颜色的交叉线代表了每个视图的等高线(contour lines),每条指示线能够标记相关视图的切片。

你可以在任意视图的CT图片的任意位置直接用鼠标点击你想要操作的位置,交叉线的位置将会到达你所点的位置,所有试图将更新显示为相关的切片。

如果视图中有些方位标记有错需要修改,在File > Change Orientation中打开窗口你可以通过右键鼠标选择正确的方位。

在菜单栏View > Indicators中可以选择分别关闭刻度线(Trick Marks)、交叉线(Intersection Lines)、分片位置(Slice Position)、方位字符(Orientation strings)指示器。

mimics教程

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mimics教程第一单元什么是MimicsMimics是Materialise公司的交互式的医学影像控制系统,即为Materiaise's interactive medical image control system.它是模块化结构的软件,可以根据用户的不用需求有不同的搭配。

下面是这些模块的介绍:MIMICS软件介绍MIMICS是一套高度整合而且易用的3D图像生成及编辑处理软件,它能输入各种扫描的数据(CT、MRI),建立3D模型进行编辑,然后输出通用的CAD(计算机辅助设计)、FEA(有限元分析),RP(快速成型)格式,可以在PC机上进行大规模数据的转换处理。

MEDCAD模块:MEDCAD模块是医学影像数据与CAD之间的桥梁,通过双向交互模式进行沟通,实现扫描数据与CAD 数据的相互转换。

在MIMICS的项目中建立CAD项目的方法有以下两种:1. 轮廓线建模:在分割功能状态下,MIMICS自动在分离出的掩模上生成轮廓线,MEDCAD能在给定误差的条件下自动生成一个局部轮廓线模型,进而用于医用几何学CAD模型中。

创建的CAD模型的可能方法:-B样条曲线及曲面-点,线,圆,曲面,球体,圆柱体等所有这些实体均可以iges格式输出到CAD软件中制做植入体,另一个典型的运用是用MEDCAD模块做统计分析,如测量很多不同股骨头的数据,为建立标准股骨头植入体时作参考。

2. 参数化或交互式CAD建模可在2D或3D视图中直接创建CAD对象,或者用参数设置的方式创建(如定义圆心、半径来创建一个圆),创建后可用鼠标进行交互式编辑。

方便设计验证:为验证CAD植入体的设计,MIMICS输入STL文件格式在2D视图及标准视图中显示,或在3D视图中显示,用透明方式显示解剖关系,使用这一方法可以快速实现医学影像数据在CAD设计软件中的调用。

RP-SLICE模块:Rp-slice模块在MIMICS与多数RP机器之间建立SLICE格式的接口,RP-Slice 模块能自动生成RP模型所需的支撑结构。

应用MIMICS软件对髋臼后柱顺行螺钉骨性通道参数的测量

应用MIMICS软件对髋臼后柱顺行螺钉骨性通道参数的测量

应用MIMICS软件对髋臼后柱顺行螺钉骨性通道参数的测量徐嵩【摘要】目的运用MIMICS软件重建骨盆3D模型,研究髋臼后柱骨性结构,测量髋臼后柱顺行拉力螺钉骨性通道参数,为临床安全置入髋臼后柱螺钉提供理论依据.方法随机收集2017年1月~12月我院CT室健康成人的完整骨盆图像数据30例,男女各15例,应用Mimics软件重建骨盆3D模型.以坐骨结节为出钉点在髋臼后柱顺行置入虚拟螺钉,测量后柱顺行拉力螺钉骨性通道安全区的参数,比较各个参数在不同性别间的差异.结果螺钉AB及AC的长度、与矢状面夹角及与冠状面夹角在不同性别之间比较,差异有统计学意义(<0.05).螺钉AD的长度、与矢状面夹角在不同性别之间比较,差异有统计学意义(<0.05);螺钉AD的长度与冠状面的夹角在不同性别之间比较,差异无统计学意义(>0.05).结论在髋臼后柱存在一个近似\"四面体\"的安全骨性通道,安全入钉点区域呈\"三角形\".在安全骨性通道内置入6.5 mm的拉力螺钉在矢状面及冠状面可以有一定的调整角度.利用MIMICS软件有助于髋臼后柱拉力螺钉骨性通道的解剖学研究,为临床安全置钉提供理论依据.【期刊名称】《医学信息》【年(卷),期】2018(031)024【总页数】3页(P98-100)【关键词】MIMICS;髋臼后柱;拉力螺钉;骨性通道;3D重建【作者】徐嵩【作者单位】天津市宁河区医院骨二科,天津 301500【正文语种】中文【中图分类】R687.3髋臼骨折(fracture of acetabulum)是一种特殊类型的骨盆骨折,在青壮年中最常见,受伤机制为高能量损伤引起。

随着我国经济飞速发展,工业生产及建筑业生产事故和交通事故逐渐增加,骨盆骨折及髋臼骨折的发生率也呈现出上升趋势[1]。

对累及后柱的髋臼骨折,目前常规的手术方法是切开复位钢板内固定,伴随骨科领域微创理念及技术的不断发展,最近几年微创治疗髋臼骨折成为创伤骨科研究的热门课题,经皮逆行螺钉固定骨盆髋臼骨折在临床上得到广泛开展[2]。

mimics 教程-唐

mimics 教程-唐

Edit mask in 3D
在mask red 上去掉髌骨和胫骨
• 1.新建mask red,并选中 • 2.点击edit mask in 3D,将目标区域选中在出现 的3D框框中 • 3.按住鼠标右键,转动,确认目标区域全部在框 中 • 4.单击空格键,将右下3D框全屏 ,在edit mask in 3D 对话框中选择remove, 用circle(lasso) 工具圈出髌骨和胫骨,然后点击remove • 5.关闭对话框,3D, red 5
Crop
• 利用该工具可以选择某一局部进行操作。
去掉多余的骶骨
• 1.新建mask blue • 2.点击crop,出现框框,将骶骨选入框中, 点击ok • 3.然后blue 3D,仅选中区域重建出来,得到 3D结果blue 6
Morphology operation
• 可以进行erode、dilate、open、close等操 作
一 数据导入
二 工具使用
Thresholding
• 点击threshold,在出现的对话框中重建组 织的阈值,或者以其为参考,拉动峰图中 的竖线调节。 • 同样,可以在右侧导航栏中,点击new,新 建一个mask,用同样的方法调节阈值。
Region growing
• 点击region growing ,鼠标此时变为双十 字,将双十字在axial 288层面,点击股骨 干,然后出现新的mask: yellow.接着对 yellow ,3D calcualte.
Boolean operation 胫骨
• 用mask “复制”减去mask “fuchsia”得到胫骨
选择fuchsia
Multiple slice edit
Red slice

Mimics17.0软件教程(最完整版)-3

Mimics17.0软件教程(最完整版)-3
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步骤 F:按“确定”按钮将材质指定给 FEA 网格。FEA 网格的元素将根据其材质着色:
然后,可以将此体积网格与材质指定一起导出(在这种情况下,只有 E-模量)。 注意:对于不同的范围或不同的遮罩材质指定,也可以使用不同的表达式。有关详细信息,请查看有关使用查 找文件分配材料的部分。
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将此表面重命名为小转子: 接下来,从 remesh 工具栏设置自动重读操作,如下所示:
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从 3-matic 中的左侧边栏中启用“查看三角形”选项以查看三角形。结果如下所示。 53
步骤 E:如果网格仍然包含一组小三角形。这些可以使用保留质量的减少三角形来删除。转到 remesh->quality preserve reduce triangles(或使用质量 保留 remesh 工具栏中的三角形缩减图标)。以下是股骨病例的推荐参数:质量阈值 0.4、迭代次数 4、最大几 何误差 0.3 mm、最大边缘长度 5 mm。
步骤 C:输入密度表达式以将每个材质的灰度值转换为密度。对于本教程,我们将使用以下表达式:密度=13.4+1017*灰度值。 步骤 D:通过取消选择“密度”和“泊松系数”之前的选择框,选择只写出导出文件中的 E 模量材料属性。对于 E-模 量,我们将使用以下表达式:E-模量=-388.8+5925*密度。 步骤 E:检查将在“材质编辑器”中指定的材质的值:
步骤 C:在这个步骤中,我们将提高网格的质量。如上所述,我们已经检查了网格的质量。要提高质量,请转到 remesh->auto remesh(或使用 auto 重读工具栏中的重读图标)并使用以下参数:质量阈值:0.4,几何错误:0.2,控制三角形边缘长度关闭,迭代 次数:4。 现在大多数三角形都达到了所需的质量,但是边缘长度仍然是不同的。通过选择“最大边长度”参数,可以控制曲 面网格的密度。低值将导致大量三角形。要了解网格中存在的边缘长度,请使用“测量”工具栏快速测量,或选择 检查测量作为最小边缘长度或最大边缘长度。

串口屏MINIC教程1-设置变量使用教程V1.0

串口屏MINIC教程1-设置变量使用教程V1.0
Technical Note
MINIC 教程-设置变量 V1.0
工程技术笔记
类别 关键词 摘要
内容 设置变量 通过 MINIC 教程 DEMO 讲述如何使用 MINIC 设置变量值。
修订历史
版本 V1.0
日期 2019/05/17
MINIC 教程-设置变量 V1.0
原因 创建文档
编制 林青田
审查 刘启鑫
在实现教程 DEMO 前需要作以下三个准备: 1. 硬件平台, 2. UI 素材, 3. MINIC 编辑器。 4.1.1 硬件平台 该例程使用大彩基本型 7 寸串口屏 DC80480B070 为验证开发平台。如图 4- 1 所示
图 4- 1 基本型 7 寸串口屏
其他尺寸的大彩串口屏均可借鉴此教程。 4.1.2 UI 素材准备
MINIC 教程-设置变量 V1.0
目录
1. 适合范围...........................................................................................................1 2. 开发环境版本...................................................................................................2 3. 概述...................................................................................................................3
MINIC 教程-设置变量 V1.0
1. 适合范围

mimics教程

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mimics教程第一单元什么是MimicsMimics是Materialise公司的交互式的医学影像控制系统,即为Materiaise's interactive medical image control system.它是模块化结构的软件,可以根据用户的不用需求有不同的搭配。

下面是这些模块的介绍:MIMICS软件介绍MIMICS是一套高度整合而且易用的3D图像生成及编辑处理软件,它能输入各种扫描的数据(CT、MRI),建立3D模型进行编辑,然后输出通用的CAD(计算机辅助设计)、FEA(有限元分析),RP(快速成型)格式,可以在PC机上进行大规模数据的转换处理。

MEDCAD模块:MEDCAD模块是医学影像数据与CAD之间的桥梁,通过双向交互模式进行沟通,实现扫描数据与CAD数据的相互转换。

在MIMICS的项目中建立CAD项目的方法有以下两种:1. 轮廓线建模:在分割功能状态下,MIMICS自动在分离出的掩模上生成轮廓线,MEDCAD能在给定误差的条件下自动生成一个局部轮廓线模型,进而用于医用几何学CAD模型中。

创建的CAD模型的可能方法:-B样条曲线及曲面-点,线,圆,曲面,球体,圆柱体等所有这些实体均可以iges格式输出到CAD软件中制做植入体,另一个典型的运用是用MEDCAD模块做统计分析,如测量很多不同股骨头的数据,为建立标准股骨头植入体时作参考。

2. 参数化或交互式CAD建模可在2D或3D视图中直接创建CAD对象,或者用参数设置的方式创建(如定义圆心、半径来创建一个圆),创建后可用鼠标进行交互式编辑。

方便设计验证:为验证CAD植入体的设计,MIMICS输入STL文件格式在2D视图及标准视图中显示,或在3D视图中显示,用透明方式显示解剖关系,使用这一方法可以快速实现医学影像数据在CAD设计软件中的调用。

RP-SLICE模块:Rp-slice模块在MIMICS与多数RP机器之间建立SLICE格式的接口,RP-Slice 模块能自动生成RP模型所需的支撑结构。

Mimics8.01简易教程

Mimics8.01简易教程

1、Mimics8.01教程--入门级------import 导入图1Mimics 导入图片只能导入bmp格式的图片,可使用图片处理王转换图片的格式。

如上图所示,点击FILE后,菜单里显示两种导入方法:一为open project;二为import images(其中又分为自动导入,半自动导入,手动导入三种)。

下文分述之:①open project:即导入工程文件,mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后,程序自带工程文件demon.mcs,mimi.mcs,femur.mcs等,当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。

②import imagesauto-import:自动导入,即我们选定路径及文件后,系统自动导入,此限于mimics支持的dicom文件。

点击import images后弹出import images 菜单,左上角显示"1",即第1步,左侧为路径选择栏,右侧为内容,找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后,右侧即显示其中的内容,并默认全部选中状态,可点击下方next(或可选择需要导入的图像,然后点击next),进入第2步,如方才选中的图像参数一致(即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心)则显示为一个部分,如否,则分成几个部分分别显示,然后点击convert。

如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框,此时需手动设置图像的方向,移动鼠标至图像中标为"X”的部位,右键单击,选择top或bottom等。

设置完成,点击OK。

Semi-automatic import:半自动导入,当导入的文件格式为BMP或TIFF 时,会弹出BMP/TIFF import对话框,以设置部分参数,见下图:图2图3 点击convert即可。

2、调整视窗图4鼠标放到红色叉号处右击分别选择试图角度,调整好的角度如下图所示图5点击OK即可。

Mimics17.0软件教程(最完整版)-3

Mimics17.0软件教程(最完整版)-3
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3-Matic 将打开,部件已加载以便重新加热。选择零件并单击“创建检查场景”按钮以检查网格 的质量。
有几个形状参数可用于测量三角形的质量。对于这个例子,我们将使用 height/base(n)参数。 此参数是三角形高度和底部之间的标准化比率值。完全等边三角形的质量为 1,非常差的三角形的 质量为 0。在“质量参数”部分中,从“形状度量”下拉框中选择“高度/基准(N)”。
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时,0.1 的值是好的。同样,输入体积网格参数。在本例中,选择要分析体积元素的形状度量为纵横比(A)。 在这里也定义适当的柱状图间隔。
单击应用后,可以在日志窗口中找到质量分析的结果。 当你对网格的质量满意时,关闭模拟重洗器。通过选择对象并按键盘上的 ctrl+c 来复制对象。打开“模拟”窗口, 按 ctrl+v 将对象粘贴到那里。体积网格将在“项目管理”部分的“有限元网格”选项卡中可用。然后可以将这些网格 导出到 FEA 软件中。 材料分配 从重新定义的对象创建体积网格后,可以在模拟中执行材质指定。可以看到“有限元网格”选项卡中列出的网 格。
步骤 C:输入密度表达式以将每个材质的灰度值转换为密度。对于本教程,我们将使用以下表达式:密度=13.4+1017*灰度值。 步骤 D:通过取消选择“密度”和“泊松系数”之前的选择框,选择只写出导出文件中的 E 模量材料属性。对于 E-模 量,我们将使用以下表达式:E-模量=-388.8+5925*密度。 步骤 E:检查将在“材质编辑器”中指定的材质的值:
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您也可以尝试卷网格中的本地重读函数。使用以下设置尝试卷网格化操作: 56
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您将得到如下类似的结果:
步骤 H:您也可以将线性 tet-4 元素转换为非线性 tet-10 体积元素。在 要执行此操作,请转到“重做”->“转换体积网格”或选择“重做”选项卡中的图标。通过单击零件选择实体,并选择转 换类型 tet4 到 tet10。

mimics新手教程

mimics新手教程

mimics10.01教程--入门级(二)------import 导入2011-05-11 0:241.如上图所示,点击FILE后,菜单里显示两种导入方法:一为open project;二为import images(其中又分为自动导入,半自动导入,手动导入三种)。

下文分述之:①open project:即导入工程文件,mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后,程序自带工程文件demon.mcs,mimi.mcs,femur.mcs等,当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。

②import imagesauto-import:自动导入,即我们选定路径及文件后,系统自动导入,此限于mimics支持的dicom文件。

点击import images后弹出import images 菜单,左上角显示"1",即第1步,左侧为路径选择栏,右侧为内容,找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后,右侧即显示其中的内容,并默认全部选中状态,可点击下方next(或可选择需要导入的图像,然后点击next),进入第2步,如方才选中的图像参数一致(即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心)则显示为一个部分,如否,则分成几个部分分别显示,然后点击convert。

如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框,此时需手动设置图像的方向,移动鼠标至图像中标为"X”的部位,右键单击,选择top或bottom等。

设置完成,点击OK。

Semi-automatic import:半自动导入,当导入的文件格式为BMP或TIFF 时,会弹出BMP/TIFF import对话框,以设置部分参数,见下图:一般手动更改红色箭头所标示的Slice Distance,Pixel Size数值,然后点击OK即可,,如导入错误,则说明其余数值有变动,应向CT扫描人员索取变动信息并填入,余同前。

Magics13.0教程

Magics13.0教程

5.1 生成支撑
Support Generation 工具简介
对单个零件生成支撑,同时进入支撑生成编辑模式。 对选中的零件生成支撑,同时退出支撑生成模式。 手动支撑,没有支撑生成,同时进入支撑生成编辑模式,需要手动添加支撑。 加载已存在的支撑文件 卸载选中零件的支撑。
选中要添加支撑的零件,点击 Support Generation-刻,软件自动生成支撑并进入支撑编辑模式。
穿孔 点击图标或菜单栏 Tools – Perforator,操作后弹出 The Perforator 窗口。 穿孔功能可以创建横穿零件的孔,这个功能在处理镂空文件时非常有用。 注意:默认情况下“Keep subtracted parts”(保留去掉的部分)复选框不被勾选,这样创建 的穿孔部分将丢失,如果用户需要保存穿孔部分,必须确认此复选框被勾选。
图 4.7.3 镜像 点击图标或菜单栏 Tools -- Mirror,操作后弹出 Mirror Part(s)窗口。 镜像功能用于围绕一个点或面来移动或旋转零件,也可以在镜像的基础上创建一个复件。
创建复件
复制 点击图标或菜单栏 Tools -- Duplicate,操作后弹出 Duplicate Part(s)窗口。 复制命令可以实现零件的自动复制,复件自动命名为“copy _ of _ part xxx”。用户可以 预先设定参数来摆放复件。 注意:也可以沿 Z 轴方向复制零件,这个功能对于可以在三维方向摆放零件的设备来说很 方便。
抽壳 点击图标或菜单栏 Tools – Hollow Part,操作后弹出 Hollow Part 窗口。 抽壳功能用于创建具有两个壳的镂空零件,代替重量过大的实体零件,这样可以节省材 料和加工时间。 注意: 1 若是封闭实体抽壳后需在表面打孔,否则光固化做完后,液态树脂无法排出。 2 在抽壳中,零件会产生内外两个壳,内壳会包含大量的三角面片,用户可以可以通过在抽 壳的高级选项中设置以减少三角面片的数量。

生物力学网e3biomecha点com-MIMICS入门图解

生物力学网e3biomecha点com-MIMICS入门图解

图 8:加添没包括的下齿
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Edit 工具里的 Threshold 选项其实是相当于 Erase 选项再另加一个 HU 阈值的条件。
第六步: 消去视图杂音
因为该病人安装了金属义齿,在照 X 光时有很强的杂音(如图 9) 。
图 9:消去 CT 图像噪音
以上简单介绍仅仅是入门最基本的参考。 MIMICS 还有许多强大的功能可加利用,从 而做出非常生动的效果。 这些内容将以读者的研究兴趣(骨,软组织,血管等) ,器官组织 (脑,肝,肾等)加以介绍。 有兴趣的读者也可将您的经验告知,可在后续课程中加以介绍。 预告: 软件使用进阶:HIP 软件使用高级:仿真 软件使用精通:MIMICS 建模与流体力学分析
图 2:选择合适的 HU 阈值
使用 Tools Profile Line, 探测牙齿的 HU 值,找出合适的门槛值(threshold) (图 3) 。
图 3:选择合适的门槛值实行图像分割
使用合适的门槛值分割后形成一个பைடு நூலகம்骨遮盖层(图 4) 。
3
图 4:选择合适的门槛值实行图像分割
遮盖层形成一个特殊的图层, 在它上面的操作对其他图层没有影响。如果有几个遮盖层, 则选中的那个才起作用。
图 1:Mimics 界面
Mimics 包含有丰富的图像分离(image segmentation)工具。既可自动,亦可手动。同时它也有 CAD 工具来创建三维物体如圆柱,方体,球等。规则的三维物则可象搭积木一样由这些基 本单位组成,或由第三方 CAD 软件引入。 三个视图的使用也很方便。鼠标点在一个视图的目标物上时,另两个视图相应改变,显示出 该物体的三维位置。
继续使用 Edit – Erase 工具,把没有削去的上齿在轴视图里消除(有两层) (图 7) 。

mimics10.01教程

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mimics10.01教程--入门级(二)------import 导入2011-05-11 0:241.如上图所示,点击FILE后,菜单里显示两种导入方法:一为open project;二为import images(其中又分为自动导入,半自动导入,手动导入三种)。

下文分述之:①open project:即导入工程文件,mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后,程序自带工程文件demon.mcs,mimi.mcs,femur.mcs等,当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。

②import imagesauto-import:自动导入,即我们选定路径及文件后,系统自动导入,此限于mimics支持的dicom文件。

点击import images后弹出import images 菜单,左上角显示"1",即第1步,左侧为路径选择栏,右侧为内容,找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后,右侧即显示其中的内容,并默认全部选中状态,可点击下方next(或可选择需要导入的图像,然后点击next),进入第2步,如方才选中的图像参数一致(即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心)则显示为一个部分,如否,则分成几个部分分别显示,然后点击convert。

如果定位参数缺失或不能识别则进入change orientation对话框,此时需手动设置图像的方向,移动鼠标至图像中标为"X”的部位,右键单击,选择top或bottom等。

设置完成,点击OK。

Semi-automatic import:半自动导入,当导入的文件格式为BMP或TIFF 时,会弹出BMP/TIFF import对话框,以设置部分参数,见下图:一般手动更改红色箭头所标示的Slice Distance,Pixel Size数值,然后点击OK即可,,如导入错误,则说明其余数值有变动,应向CT扫描人员索取变动信息并填入,余同前。

mimics中文教程

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简介
Mimics 是处于扫描数据和模型、STL 格式,CAD 和有限无分析之间的界面 软件。是可以处理所有通用扫描格式的具有 3D 可视化功能的图像处理包。
还提供了其它的使用 STL 快速成型或直接分层格式的模型支持界面支持。也 就是说可以提供给 CAD 或者有限元网格的使用软件。
Materialise 公司的医学图像处理系统软件是个可视化工具,用于 CT 图像和 MRI 图像分割、3D 渲染。
2 STL +模块 STL +模块通过三角化格式提供的界面选项,通过三角片文件,Mimics STL+模块提供
了 Mimics 与所有快速成型系统的接口,为了提高 RP 模型的精度,这些文件在生成的时候 采用了双线性和中值插值算法。
计算参数通过对一些计算参数的设定 ,STL+模块可以减少输出文件中 的三角面片的数 目,可以对图像进行插值,还可以对 3D 文件进行光顺处理。这里有两种计算三角形数目的 方法:矩阵减少和三角形减少。矩阵减少允许象素的分组生成三角形。三角形减少可以减少 网格中三角形的数目。这可以快速的操作文件。
本软件使用户能够控制 CT 扫描和 MRI 扫描的正确划分过程。例如,可以去 除因金属植入物导致的图像失真。可以根据医学参数精确定义物体的成像或者分 析。在建立 3D 医学图像时也不需要特别的专业知识。
为了定义和计算所需的数据,有专门独立的软件来建立医疗对象( S)模型 实现所有快速原型系统的创建。
分割 这一功能可将一个对象分成彼此独立的 3D 模型,然后建立多个不同的局部 3D 模型。 融合 融合功能将所选的不同模型变成一个模型。 镜像 镜像功能可以将选定的对象沿一个设定的平面或一个巳有平面(从人体数据分析或 MEDCAD 得来)镜像生成新的对象,可以选取多个对象进行镜像操作。 重定位 对象可以被转化或者旋转。对每种操作,对象都能被调整到客户需要的合适大小 和位置。客户可以选择相应的对象操作限制。可以选择的有:轴向移动,平面移动,绕轴旋 转和绕点旋转。当然,无限制操作也是可选项之一。通过配准功能 ,客户可以利用标志点简 单的重定位对象。也可以利用鼠标定位对象。 5 FEA Module 有限元分析模块

Mimics 软件教程 最完整版

Mimics 软件教程 最完整版
单击“确定”完成切割。 切割将创建一个新的三维模型,polyplanecut yellow。要拆分此模型,请转到“模拟”菜单并选择“拆分”。在“拆分” 对话框中,选择 polyplanecut yellow 3D 模型并选择“最大零件”。这样你只会保留股骨轴。
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股骨和植入物的重熔
股骨和植入物现在必须在 3-matic 中修复。要执行此操作,请转到 FEA 菜单并选择 Remesh。这将显示以下对 话框:
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切割方向仍可以修改。当光标停留在红色箭头的中心时 更改为重定位图标,按住鼠标左键。通过移动鼠标,可以更改切割平面的方向。
按住鼠标左键可更改切割平面的方向。 要完成切割,切割平面应完全穿过骨骼。因此需要增加深度。在“使用多平面切割”对话框中,单击“属性”。在“属 性”对话框中,将深度更改为 50 mm。
2。每次从“文件”菜单中选择“导入图像”,计算机都会重新启动。 导入图像时,MIMICS 会尝试联系已连接的 SCSI 设备。它导致问题的原因是这些设备中的一个(或多个)发出 错误消息。在 mimics 中,有一个功能可以阻止来自某些设备的消息,这样这个问题就不会再发生了。打开“模 拟”,然后从“文件”菜单中选择:“选项”->“高级 SCSI”。在出现的对话框中,禁用启用 SCSI 复选框。单击“确 定”,重新启动模拟,然后再次尝试导入。
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选择植入物和股骨轴,然后单击“确定”。模拟记忆将打开,显示三个选项卡,三维视图,植入物的检查场景,股 骨的检查场景。 我们将首先结合股骨轴和植入物。然后再对组合网进行重熔和分离。
创建非歧管组件
非流形组件是一个具有多个部分的对象,例如在本例中植入物放置在切割的股骨内。这个物体有一个共同的界 面,在我们的例子中是股骨植入界面。创建这样的对象时,希望两个部分的公共曲面相同。为此,我们使用创 建非流形装配操作。此操作将两个网格合并为一个网格,并在接口处保持节点连续性。 转到三维视图,然后从“重读”菜单中选择->创建非歧管组件(或使用 在重熔工具栏中创建非流形部件图标)。 作为主要实体,通过左键单击股骨选择股骨轴。现在单击相交实体并选择植入物。单击“应用”组合两个网格

MIMICS

MIMICS

LOGOMIMICSENTer注:1、部分资料来自Matlab论坛和Materialise网站2、NO COMPETING INTERESTS一、什么是MIMICS?二、MIMCS能为我们做什么?三、如何操作MIMICS?MIMICS=MIMIC+S ?Mimics是比利时Materialise公司的交互式医学影像控制系统,即Materialise’s Interactive Medical Image Control System的缩写,是一个模块化的软件。

MIMICS是一套高度整合而且易用的3D 图像生成及编辑处理软件,它能输入各种扫描的数据(CT、MRI),建立3D模型进行编辑,然后输出通用的CAD(计算机辅助设计)、FEA(有限元分析),RP(快速成型)格式,CFD(计算流体力学)格式,可以在“普通电脑”上进行大规模数据的转换处理。

什么是MIMICS ?MIMICS 的模块RAFEA MedCADSTL+BasicModelMIMICS基础模块1、三维图像处理Mimics可以用于诊断,手术计划和演习,Mimics包含通往快速原型的柔性接口,它可以建立有特色的分割对象。

对于灰度值图像,Mimics有着综合的分割方法。

它可以处理任意数目的图像切层(允许矩形图像)。

唯一的限制是用户的计算机有限内存。

处理图像的界面提供了几种分割和可视化的工具。

分割工具分割Mask用于使感兴趣区域高亮显示。

Mimics允许用户利用不同的分割Mask定义和处理图像。

什么是MIMICS?编辑(画,擦,局部阈值)手动编辑功能可以画,擦或者利用局部阈值重建部分图像。

编辑功能一般用于消除噪音和分离结构。

动态区域增长动态区域增长运用某个灰度值范围内的灰度值连接性分割对象。

它可以进行CT图片中的腱和神经的简单分割,同时提供了MRI图像的全面有力的工具。

形态学操作形态学在Mask上进行操作(腐蚀,膨胀,打开和关闭)。

所有的这些功能从原Mask中移除或者增加象素并复制到目标Mask中。

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第二章Mimi本教程的第二个例子中,我们将为你展示Mimics的一些基本功能,所要讨论的主题如下:●打开工程Opening the Project●窗口化Windowing●二值化Thresholding●区域增长Region Growing●建立3D表示Creating a 3D representation●显示3D表示Displaying a 3D representation●STL+过程STL+ Procedures●生成STL文件Generating a STL file●RP分层过程RP Slice procedures●生成一个轮廓文件Generating a contour file●生成支持文件Generating supports●结果视图View of the end result1.打开工程在文件菜单栏中,选择打开工程选项(或者直接用快捷键Ctrl+O),打开对话框中将显示工作目录中所有工程,双击打开mimi.mcs文件。

所有的图片都被打开并显示在三个视图中,右边视图是轴视图(xy-view或者axial view),左侧上面的视图是前视图(xz-view或者coronal view),左侧下面的视图是侧视图(yz-view或者sagittal view)。

不同颜色的交叉线代表了每个视图的等高线(contour lines),每条指示线能够标记相关视图的切片。

你可以在任意视图的CT图片的任意位置直接用鼠标点击你想要操作的位置,交叉线的位置将会到达你所点的位置,所有试图将更新显示为相关的切片。

如果视图中有些方位标记有错需要修改,在File > Change Orientation中打开窗口你可以通过右键鼠标选择正确的方位。

在菜单栏View > Indicators中可以选择分别关闭刻度线(Trick Marks)、交叉线(Intersection Lines)、分片位置(Slice Position)、方位字符(Orientation strings)指示器。

窗口右侧的滚动条可以用来转动视图中的图片。

在当前工程中(Mimi),所有的视图是正确的。

如果你想在图片集中除去某些不合适的图片,用教程案例1中的方法,在File > Organize Images中进行操作。

2. 窗口化首先,我们必须把不同视图中的图片对比度调整到一个合适的值。

对比度的增强,有助于选择不同密度的部分,例如骨头和脑肿瘤,这个操作可以在任何时候做。

可以在工程管理器的对比度标签中改变之对比度标签显示了工程的直方图,并且用一条线代表了“窗口”,灰度值或者HU值低于这条线的起点值的地方将会显示为黑色,所有灰度值在这条线终点值之上的将显示为白色,灰度值在窗口值之间的地方将显示为渐变的灰色。

你可以单击鼠标左键拖动“窗口线”到想要的位置来改变“窗口”的大小,要想移动“窗口”,选择那条线并拖动到新的位置即可。

你也可以在标签底部选择预先定义好的窗口。

下面将描述想要获得一个好的分片掩膜需要进行的步骤。

一个分片掩膜是你所感兴趣的像素所组成的一个你可以进行处理的对象。

一般可以建立多个独立的或者不独立的掩膜,不同的掩膜用不同的颜色标记。

通常要获得最终的掩膜可能需要几个不同的掩膜来相互操作而得到。

3. Thresholding二值化二值化保留分割对象的图片中灰度值大于或等于阈值的像素,有时需要定义阈值的上界和下界,分割掩膜将保留所有灰度值在上下界之间的像素。

例如,比较小的阈值选择病人的软组织比较容易,阈值比较大则只会保留比较稠密的部分。

定义上界和下界阈值选择神经部分就比较容易。

如何定义一个好的阈值取决于建模的目的,如果你想要一个好看的模型,建议使用比较小的阈值,因为这样建出的模型洞比较少;相反,如果是为了建立义肢的模型服务的话就推荐使用比较大的阈值。

单击Threshold按钮。

通过Threshold Toolbar的滑动条来改变阈值选择一个合适的阈值的窍门:看不同的图片,你可以改变图片:●使用arrow,page up和page down●使用窗口右边的滑动条●移动切片指示器单击Profile按钮在轴视图中穿过骨头画一条线:在软组织地方单击鼠标左键来标记起始点,拖动鼠标穿过骨头后单击,这样沿着这条线就产生一个强度截面,这些直横线代表了你现在的阈值。

点击Start Thresholding,上下拖动下界直线来设定一个好的阈值。

如果你想要一个好看的模型,就选择比软组织强度平衡水平稍高一些的阈值;如果你想做一个义肢模型,就把线拖到软组织平衡水平和骨头最大值之间。

当选择好合适的阈值时,单击End Thresholding保存当前阈值。

过程中你可能需要放大图片的局部,方法如下:首先,从zoom按钮旁的下拉菜单,选择Box,点击Zoom按钮,这是光标显示为一个小型放大镜,在图片上单击鼠标左键,划定放大的区域矩形之后放开则放大,若要返回到整个图片,单击Unzoom按钮对Mini来说,一个好的阈值大约是270(Hounsfield scale),阈值在Threshold工具栏的Min.box 中显示。

要结束阈值选择,单击Apply按钮。

在Thresholding操作之后,将创建一个绿色掩膜,在一个工程中你可以有不同的掩膜,但你只能在有效掩膜上进行操作,在工程管理器重的掩膜选项卡中选取掩膜则该掩膜变为有效掩膜(被激活)。

如果工程管理器没打开,在菜单栏view中选择工程管理器按钮如果想隐藏某些掩膜,点击对应的眼镜即可。

4. Region growing 区域增长区域增长工具能够将二值化得到的分割分成几块,同时去除漂浮像素单击Region growing按钮或快捷键Ctr+R,鼠标的光标现在显示为十字,同时可看到Region Growing窗口在屏幕上显示。

选取源掩膜(这里取Green)和目标掩膜(一个新掩膜),在感兴趣的对象(头骨的一部分)的绿色区域单击鼠标左键,此时程序开始计算新的分割,所有当前分割对象中与标记点相连接的点将组成一个新的掩膜,这个新的分割标记为黄色。

点击Close按钮关机Region growing 窗口在视图工具栏中选择Yellow掩膜,隐藏绿色掩膜之后可检查Yellow掩膜是否正常。

在不同图片中(不同视角?)检查掩膜当检查图片之后,如果一切正常,则可以建立3D图形了。

提示:在区域增长之前必须进行二值化,因为二值化以后所有之前做的工作都没掉了。

5. 创建一个3D表示在掩膜标签中你能够看到所有之前创建的掩膜以及他们各自的阈值,这些掩膜的名字是Green和Yellow,被选中的掩膜则为active的。

现在你暂时还知道Yellow掩膜包含头盖骨,但一个月之后,当你重新载入该工程的时候,你可能很难记起你所存储的结果,因此,最好重命名掩膜,方法为单击Yellow为可编辑状态,输入新名字即可。

单击Calculate 3D按钮“Calculate 3D Models”对话框显示这时你可以选择用哪些掩膜来创建3D模型,多选的话只需按住Ctrl键选择即可,这个例子中只选择skull掩膜,单击Calculate按钮,则生成一个3D对象你可以设置所生成模型的可视化质量,这个只是在屏幕上显示的效果,不影响你在RP机器上实际创建的模型。

当然,质量越低,生成模型的时间越少,且之后加载的时候占用的内存也就越少。

6. 显示一个3D表示你可以在右边垂直的3D工具栏上设置不同生成的3D模型的可见性,这也可以在工程管理器的3D对象标签中点击小眼镜来设置。

当3D图像加载之后,可进行以下操作:●通过按钮来旋转模型,此按钮在3D窗口的右侧,或者点击鼠标右键移动来旋转●通过按钮来选择不同的标准视角,如顶部,前面,底部等●通过按钮来进行缩放,通过按钮进行移动●右键选择Color选项,可以改变模型的颜色点击Toggle Transparency按钮可以设置模型显示为透明的,你可以单击3D对象标签的透明度一栏的按钮选择不同的透明程度(high-medium-low-opaque)要改变背景颜色,可以到View > 3D Background Color选择你喜欢的颜色7. STL+过程PS:STL = STL文件,一种3D模型文件格式STL(ST ereo Lithography的缩写),是一种为快速原型制造技术服务的三维图形文件格式。

在Mimics和STL+之间的中间文件格式可以为以下几种:●“.3dd”文件●掩膜●3D对象你可以通过点击工程管理器的掩膜标签中的Export 3dd按钮或者主工具栏的Export > 3dd来生成一个skull.3dd文件,单击Save按钮之后.3dd文件将被保存在MedData文件夹中。

这一步并不是必须的,机器文件的计算也可以直接在掩膜或者3D对象上进行。

单击工程管理器中的掩膜标签上选择动作列表中的STL+按钮,一个窗口将出现,有三个不同的标签提供三种选择。

选择掩膜标签,选择skull掩膜并点击Add按钮,如果想选择3D对象的话就选择3D标签。

请注意,可以选择多个掩膜,或者多个3D对象,但不能太难过同时选择掩膜和3D对象如果你有兴趣为快速成型(Rapid Prototyping)创建中间文件,或者导出一个STL或VRML文件,请继续看下面的教程:在选择了掩膜或者.3dd文件和按了Add按钮之后,文件会出现在输出区域,如果愿意你可以改变输出文件名,比如为skull选择输出格式,有许多不同的输出格式,如STL,VRML7.1生成STL文件点击Next按钮,将会出现转换到STL对话框你可以使用屏幕截图中的所有参数,进一步的关于参数的解释可以查询手册,也可以点击help按钮选择合适的参数,然后单击Finish按钮,将生成一个STL文件8.快速成型(RP,Rapid Prototyping)分层过程8.1 RP分层过程在RP分层对话框中,你可以由一个掩膜或者3dd文件生成一个轮廓文件,由一个轮廓文件生成一个支持文件8.2 生成一个轮廓文件在工程管理器的掩膜标签中选择动作列表中的RP Slice按钮,从刚刚打开的RP分层窗口的掩膜标签中选择skull掩膜,点击Add按钮,掩膜将在下面的区域中显示,选择SLI 输出格式。

单击Next按钮,出现转换到RP格式对话框,你可以使用对话框中的参数点击Next按钮,出现计算参数对话框,按如下显示填写值单击Finish按钮,计算开始然后生成一个SLI文件若要计算支持结构,继续看教程:8.3 生成支持为了建立一个Stereolithography对象,要用RP分层模块处理分层文件直接生成一个支持文件。

打开RP分层窗口,选择轮廓文件标签,在输入格式区域选择.SLI选项,选择你之前创建的文件,点击Add按钮当一个轮廓文件被选择时,点击Next按钮,打开下面所示窗口:注意:也可以为Stratasys machines产生分层文件,请参考STL+指导手册查看如何在快速切片(Quickslice)中使用这些文件该程序默认,所以整个模型都被支持,然而这并不必要。

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