RNA转录后加工
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✓Ⅰ类和Ⅱ类内含子含有RNA自我切割的能力 ，称为自我剪接。
与分支点相结合，形成剪 接前体，并进一步与U4， U5，U6 snRNP三聚体相结 合，形成60S的剪接体， 进行RNA前体分子的剪接 。
勇于开始，才能找到成 功的路
4. RNA的可变剪接
✓变位剪接 在高等真核生物中，内含子通常是
有序或组成性地从mRNA前体中被剪接 ，然而，在个体发育或细胞分化时可以 有选择性地越过某些外显子或某个剪接 点进行变位剪接，产生出组织或发育阶 段特异性mRNA。
✓参与剪接的snRNP包括U1，U2，U5，U4， U6，他们根据所含有的sn RNA而命名，每个 snRNP 含有一个snRNA 和几种蛋白质。
U1 sn RNP与5’ 剪接位点的结合 是剪接开始的第 一步。
• U1 snRNA以碱基互补的方 式识别mRNA前体5剪接 点，由结合在3 剪接点上 游富含嘧啶区的U2AF识别 3 剪接点并引导U2 snRNP
✓在自然状态下，它们以核糖核蛋白颗粒（ snRNP 和 scRNP)形式存在，俗称snurps 和 scyrps
✓在核仁中也存在着一类小的RNA，称为核仁 小RNA （small nucleolar RNA, sno RNA),它 们在核糖体RNA的加工中起作用。
✓snRNP：ribonucleo protein particle（许多相 对分子质量较小的核内RNA（snRNA, small nuclear RNA)以及与这些RNA结合的核蛋白 ，参与mRNA的剪接。
真核生物rRNA的转录后加工
✓5’大多直接由切割产上， 3‘大多由切割及其后续的 修整反应产生。
✓加工过程需要蛋白质参与 ✓需要一组核仁小RNA（
small nucleolar RNA)的参 与，它们可能是和rRNA 序列配对后形成可被核酸 内切酶识别的二级结构
3.7.4 真核生物mRNA的剪接
✓ 按照内含子方向，左边的称为5剪接位点（5 splice site,又叫供体位点（donor site),右边的称为3剪接位 点（3 splice site) 又叫受体位点（acceptor site).
✓GT—AG法则：
序列分析表明，几乎每个内含子5’端起 始的两个碱基都是GT，而3’端最后两个碱 基总是AG，由于这两个碱基的高度保守性 和广泛性，有人把它称为GT—AG法则，即 ：5’GT．．．．．．AG 3’。
✓内含子和外显子 间的边界没有保 守序列
真核生物tRNA的加工
✓内含子的剪接 ✓3‘端添加CCA ✓核苷酸修饰。
3.7.3 真核生物rRNA的转录后加工
✓真核生物有4种rRNA，即5.8s rRNA、 18s rRNA、 28s rRNA、 5s rRNA。其中，前三 者的基因Leabharlann Baidu成一个转录单位，产生47S 的前体 ，并很快转变成45S前体。
RNA转录后加工
2020年4月22日星期三
3.7.1真核生物RNA中的内含子
✓真核基因大多是断裂的。一个基因可由多个 内含子和外显子间隔排列而成。
✓内含子在真核生物中所占的比例很高，甚至 超过99%
3.7.2 真核生物tRNA前体的转录后加工
✓长度和序列没有 共同性，一般1646个核苷酸
✓位于反密码子下 游
✓ 第一步中释放的外显子的游离3羟基攻击3剪接位点 中的键。内含子3 剪接点被切断，套索结构释放， 同时，外显子连在一起。
✓ 内含子的套索结构被切开，形成线状并很快被释放 。
✓在剪接反应前后，磷酸二酯键的数目是不变 的，只是由原来的外显子-内含子之间的两 个5-3 磷酸二酯键变为两个外显子之间的5 -3 和内含子本身的套索结构中的5 -2 磷酸 二酯键。
剪接信号
P102
✓5GU ✓3AG ✓富含嘧啶区域 ✓分支点序列： Py80NPy87Pu75APy95
2. RNA剪接中的两步转酯反应套5端索的是保通守过G内的含5位子
与分支点保守的A 的2为形成磷酸二 酯键而产生的。
✓ 由UACUAAC的保守A通过2 羟基对5剪接位点发动 亲核攻击，内含子5 端切开，内含子5 端的保守G 的5位与分支点保守的A的2位形成磷酸二酯键（5 -2 磷酸二酯键）而产生套索结构。
✓转酯反应(transesterification)
酯键从一个位置转移到另一个位置。
3. RNA剪接大多发生在剪接体上
✓细胞核中的小分子RNA称为细胞核小RNA（ small nuclear RNA, snRNA）
✓细胞质中的小分子RNA称为细胞质小RNA（ small cytoplasmic RNA, scRNA)
hnRNP
RNA剪接真 正识别的是 hnRNP，而 不是前体 mRNA
1. RNA序列决定了剪接的发生位点
✓比较不同基因的核苷酸序列发现, mRNA前 体中内含子的两端边界存在共同的序列，这 些序列结构可能是产生 mRNA前体剪接的 信号。
✓ 内含子两端序列不能互补；
✓ 连接区序列高度保守, GT-AG法则。序列分析表明 ，几乎每个内含子5’端起始的两个碱基都是GT， 而3’端最后两个碱基总是AG，由于这两个碱基的 高度保守性和广泛性，有人把它称为GT—AG法则 ，即：5’GT．．．．．AG 3’。
5. I 类和II类内含子
根据内含子的结构特点及其剪接机制把他们划 分为:
✓I类内含子 ✓II类内含子 ✓细胞核RNA（GU-AG, AU-AC)
✓低等真核生物、细菌-Ⅰ类内含子 ✓细胞器（线粒体，叶绿体）-Ⅱ类内含子。
✓Ⅰ类和Ⅱ类内含子是根据它们的内部组成分 类的。每种内含子都可以折叠成典型的二级 结构。
核不均一RNA(hnRNA, heterogeneous nuclear RNA)
✓由于初级转录产物逐步被加工，所以核内 RNA分子的大小很不一致，所以称为核不均 一RNA（heterogeneous nuclear RNA, hnRNA）包括mRNA的前体，也包括其他 的转录物。
✓核糖核蛋白颗粒（hnRNP，heterogeneous nuclear ribonucleoprotein particle）： 蛋白质包围着hnRNA。
与分支点相结合，形成剪 接前体，并进一步与U4， U5，U6 snRNP三聚体相结 合，形成60S的剪接体， 进行RNA前体分子的剪接 。
勇于开始，才能找到成 功的路
4. RNA的可变剪接
✓变位剪接 在高等真核生物中，内含子通常是
有序或组成性地从mRNA前体中被剪接 ，然而，在个体发育或细胞分化时可以 有选择性地越过某些外显子或某个剪接 点进行变位剪接，产生出组织或发育阶 段特异性mRNA。
✓参与剪接的snRNP包括U1，U2，U5，U4， U6，他们根据所含有的sn RNA而命名，每个 snRNP 含有一个snRNA 和几种蛋白质。
U1 sn RNP与5’ 剪接位点的结合 是剪接开始的第 一步。
• U1 snRNA以碱基互补的方 式识别mRNA前体5剪接 点，由结合在3 剪接点上 游富含嘧啶区的U2AF识别 3 剪接点并引导U2 snRNP
✓在自然状态下，它们以核糖核蛋白颗粒（ snRNP 和 scRNP)形式存在，俗称snurps 和 scyrps
✓在核仁中也存在着一类小的RNA，称为核仁 小RNA （small nucleolar RNA, sno RNA),它 们在核糖体RNA的加工中起作用。
✓snRNP：ribonucleo protein particle（许多相 对分子质量较小的核内RNA（snRNA, small nuclear RNA)以及与这些RNA结合的核蛋白 ，参与mRNA的剪接。
真核生物rRNA的转录后加工
✓5’大多直接由切割产上， 3‘大多由切割及其后续的 修整反应产生。
✓加工过程需要蛋白质参与 ✓需要一组核仁小RNA（
small nucleolar RNA)的参 与，它们可能是和rRNA 序列配对后形成可被核酸 内切酶识别的二级结构
3.7.4 真核生物mRNA的剪接
✓ 按照内含子方向，左边的称为5剪接位点（5 splice site,又叫供体位点（donor site),右边的称为3剪接位 点（3 splice site) 又叫受体位点（acceptor site).
✓GT—AG法则：
序列分析表明，几乎每个内含子5’端起 始的两个碱基都是GT，而3’端最后两个碱 基总是AG，由于这两个碱基的高度保守性 和广泛性，有人把它称为GT—AG法则，即 ：5’GT．．．．．．AG 3’。
✓内含子和外显子 间的边界没有保 守序列
真核生物tRNA的加工
✓内含子的剪接 ✓3‘端添加CCA ✓核苷酸修饰。
3.7.3 真核生物rRNA的转录后加工
✓真核生物有4种rRNA，即5.8s rRNA、 18s rRNA、 28s rRNA、 5s rRNA。其中，前三 者的基因Leabharlann Baidu成一个转录单位，产生47S 的前体 ，并很快转变成45S前体。
RNA转录后加工
2020年4月22日星期三
3.7.1真核生物RNA中的内含子
✓真核基因大多是断裂的。一个基因可由多个 内含子和外显子间隔排列而成。
✓内含子在真核生物中所占的比例很高，甚至 超过99%
3.7.2 真核生物tRNA前体的转录后加工
✓长度和序列没有 共同性，一般1646个核苷酸
✓位于反密码子下 游
✓ 第一步中释放的外显子的游离3羟基攻击3剪接位点 中的键。内含子3 剪接点被切断，套索结构释放， 同时，外显子连在一起。
✓ 内含子的套索结构被切开，形成线状并很快被释放 。
✓在剪接反应前后，磷酸二酯键的数目是不变 的，只是由原来的外显子-内含子之间的两 个5-3 磷酸二酯键变为两个外显子之间的5 -3 和内含子本身的套索结构中的5 -2 磷酸 二酯键。
剪接信号
P102
✓5GU ✓3AG ✓富含嘧啶区域 ✓分支点序列： Py80NPy87Pu75APy95
2. RNA剪接中的两步转酯反应套5端索的是保通守过G内的含5位子
与分支点保守的A 的2为形成磷酸二 酯键而产生的。
✓ 由UACUAAC的保守A通过2 羟基对5剪接位点发动 亲核攻击，内含子5 端切开，内含子5 端的保守G 的5位与分支点保守的A的2位形成磷酸二酯键（5 -2 磷酸二酯键）而产生套索结构。
✓转酯反应(transesterification)
酯键从一个位置转移到另一个位置。
3. RNA剪接大多发生在剪接体上
✓细胞核中的小分子RNA称为细胞核小RNA（ small nuclear RNA, snRNA）
✓细胞质中的小分子RNA称为细胞质小RNA（ small cytoplasmic RNA, scRNA)
hnRNP
RNA剪接真 正识别的是 hnRNP，而 不是前体 mRNA
1. RNA序列决定了剪接的发生位点
✓比较不同基因的核苷酸序列发现, mRNA前 体中内含子的两端边界存在共同的序列，这 些序列结构可能是产生 mRNA前体剪接的 信号。
✓ 内含子两端序列不能互补；
✓ 连接区序列高度保守, GT-AG法则。序列分析表明 ，几乎每个内含子5’端起始的两个碱基都是GT， 而3’端最后两个碱基总是AG，由于这两个碱基的 高度保守性和广泛性，有人把它称为GT—AG法则 ，即：5’GT．．．．．AG 3’。
5. I 类和II类内含子
根据内含子的结构特点及其剪接机制把他们划 分为:
✓I类内含子 ✓II类内含子 ✓细胞核RNA（GU-AG, AU-AC)
✓低等真核生物、细菌-Ⅰ类内含子 ✓细胞器（线粒体，叶绿体）-Ⅱ类内含子。
✓Ⅰ类和Ⅱ类内含子是根据它们的内部组成分 类的。每种内含子都可以折叠成典型的二级 结构。
核不均一RNA(hnRNA, heterogeneous nuclear RNA)
✓由于初级转录产物逐步被加工，所以核内 RNA分子的大小很不一致，所以称为核不均 一RNA（heterogeneous nuclear RNA, hnRNA）包括mRNA的前体，也包括其他 的转录物。
✓核糖核蛋白颗粒（hnRNP，heterogeneous nuclear ribonucleoprotein particle）： 蛋白质包围着hnRNA。