合成生物学研究进展

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林 章凛 ,张艳 ,王胥 ,刘鹏
( 清 华 大 学 化 学 工 程 系 ,北 京 1 0 0 0 8 4 )
摘要 :合成生物 学是以工程化设计思路 ,构建标准化 的元器件和模块 ,改造 已存在的天然系统或者从 头合成全新 的人工生命体 系,实现在化学品合成 ( 包括材料、能源和天然化合物 ) 、医学、农业 、环境等领域 的应用 。人们利
a p p l i e d t o t h e i f e l d s o f c h e mi c a l s nt y h e s i s ( i n c l u d i n g ma t e i r a l s , b i o f u e l s a n d n a t u r a l c o mp o u n d s ) , me d i c a l i n d u s t r y ,
t o mo d i f y t he na t u r a l l i f e s ys t e ms o r t he de n ov o s y nt h e s i s o f n e w l i f e s ys t e ms . Sy n t he t i c bi o l o y g h a s b e e n wi d e l y
产 生 渐进 性 的 、渗 透 性 的但 颠 覆 性 的意 义 。 关键 词 : 合成 生物 学 :生 化 工 程 ;代 谢 ;元 器 件 ;模 块 ;基 因线 路 ; 化 学 品 合 成 ; 基 因 组
DOI :1 0 . 1 1 9 4 9  ̄ . i s s n . 0 4 3 8 - 1 1 5 7 . 2 0 1 5 0 6 4 8 中图分类号:Q ຫໍສະໝຸດ Baidu 8 1 文献标志码 :A 文章编 号:0 4 3 8 —1 1 5 7( 2 0 1 5 )0 8 —2 8 6 3 —0 9
r e p r o g r a m l i f e s y s t e ms t o p e r f o r m s p e c i i f c f u n c t i o n s .M o d u l a r i z e d me t a b o l i c p a t h wa y s a r e o p t i mi z e d i n t h e c e l l u l a r c h a s s i s t o r e a l i z e t h e b i o l o g i c a l p r o d u c t i o n o f b u l k a n d i f n e c h e mi c a l s ,s u c h a s b u t a n o l ,i s o b u t a n o l ,
用基 本 的 生物 学元 件 设计 和 构 建 了基 因开 关 、振 荡 器 、放 大 器 、逻 辑 门、 计 数 器 等 合 成 器 件 , 实 现对 生命 系统 的
重新编程 并执 行特殊功 能。模块化处理生物 的代谢途径 ,并在底盘细胞上进行组装和优化,可以实现 大宗化学 品 和精 细化 学品的合成 。 目前人们 已经在丁醇 、异丁醇 、青蒿素和紫杉醇等化合物的生物合成上取得 了重要进展 。 近年来还 发展 了多种基 因组编辑和组装技术 ,可精确地对基 因组进行编辑 ,人们还成功地合 成了噬菌体基 因组 、 支原体基 因组和酵母基 因组 。在未来 的 5 0 ~1 0 0年 内,合成生物学将对人类 的医疗、化学 品制造 ( 含药品 ) 、军事
a g r i c u l t u r e nd a e n v i r o n me n t a l p r o t e c t i o n . Bi o l o g i c a l p a r t s a r e u s e d t o c o n s t r u c t s nt y h e t i c mo d u l e s s u c h a s t o g g l e
Re c e nt a dv a nc e s i n s yn t he t i c bi o l o g y
LI N Zha ng l i n, ZHANG Yan, W ANG Xu, LI U Pe ng
( De p a r t me n t o f C h e m i c a l E n g i n e e r i n g ,T s i n g h u a U n i v e r s i t y ,B e j i i n g 1 0 0 0 8 4 ,C h i n a )
Ab s t r a c t : S y n t h e t i c b i o l o g y i s t h e e n g i n e e i r n g d e s i g n a n d c o n s t r u c t i o n o f s t a n d a r d i z e d p a r t s , d e v i c e s a n d mo d u l e s
s wi t c h ,s y nt he t i c o s c i l l a t o r ,ge ne t i c a mp l i ie f r ,bi o l o g i c ga t e s a nd c e l l ul a r c o u n t e r .Th e s e s nt y he t i c m o d u l e s
第6 6 卷 第8 期 2 0 1 5 年 8 月

工 学

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Aug us t 201 5
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速 写 麓
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