人类基因组计划(Human Genome Project)
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人类基因组计划
(Human Genome Project,HGP)
1.什么是人类基因组计划:
人类基因组计划是由美国能源部和NIH联合做出的,自1990年开始,争取在15年内完成的目标。
即:鉴定人体DNA估计约8万个基因,测序构成人DNA的30亿个碱基,贮存这些信息于databases(数据库)并发展data analysis的工具。
(1)实际包括两部分工作,一是mapping,一是sequencing,故先前叫做“Mapping and Sequencing the human genome”.而Mapping又分为遗传连锁图谱和物理图谱。(2)HGP是第一个庞大的科学事业,会引起一些由此计划暴发出来的伦理、法律、社会学上的诸多争论。(DOE熟悉大科学模式;生物学家习惯小科学模式,应完美结合。
该计划会引发出许多商业和法律,社会学和论理学方面的问题。)
(3)为了有助于这些目标的实现,还要研究一些非人生物体的遗传图谱。(包括E.coli、酵母、秀丽隐杆线虫、果蝇、实验用小鼠等模式生物。)
(4)在植物方面,美国农业部集中研究玉米和南芥菜(Arabidopsis)基因组,我国科学家提出了水稻基因组计划。
2.背景:
早在1984年Utah州Alta城的专业会议(DOE环境与健康研究办公室,OHER 和国际环境诱变剂和致癌物防护委员会,ICPEMC协办)。开始讨论HG DNA全序列测定的前景。
1985年5月由Sinsheimer组织专门会议提出测定HG全序的动议。
DOE为何操办:(1)DOE承担低水平辐射和其它环境因素引起的遗传性损伤的监测,即需要在108bp的DNA中检测出一个碱基的改变,此项任务与HG全序列测定有关并且
任务同等艰巨;(2)DOE已在两个国家实验室对复杂基因开展了工作,即1988年的国家基因文库计划(NG Library Project),在Laurence Livermore国家实验室(LLNL)中纯化单种染色体并构建单个染色体文库。另一个基础性工作是1983年在Los Alamos National Laboratory(LANL)建立DNA顺序信息库Gene Bank。DOE特别在信息科学上具有经验和优势,还是大科学模式计划上的内行。
NIH 的参与又是必不可少的。(习惯于资助对特定科学进行检验的小型项目。还未主持过大科学模式的Project)。
终于1988年10月DOE与NIH在HGP的实施管理上达成协议(Science 241,1596 1988)。这样,同年二月由国家科学委员会(NRC)的专家组拟定的“人类基因组的图谱和测序”的专题报告才得以走向实现。
在1984-1989年间,在HGP从动议到实施这一漫长岁月里,许多有关技术上的进步和成就也是促成此事的重要因素。
1990年10月正式启动。
3.何谓基因组:
Genome is all the DNA in an organism, including its genes.
Gene: 携带制造为生物体所需要蛋白质的信息。
Because all the organisms are related through similarities in DNA sequences , insight gained from nonhuman genome often lead to new knowledge about human biology.
4.弄懂DNA有什麽实际的 benefits?
(1)关于不同个体间DNA变异后果的知识将引导我们得到解决诊断、治疗以及某一天能够预防上千种危害我们的疾病的革命性的新手段、新途径和新方法。
(2)除提供了解人类生物学的思路之外,探知非人生物体的DNA sequences能够导致了解它们的天然潜在能力(natural capabilities ),看其中能够用来解决人类保健,能源和环境净化上的挑战性课题。(Francis S Collins, head of HGP ,or National center for
HG Research)
5.中国:
重点是研究我们特有的致病基因的图谱和定序。现阶段是Hunting of Hereditary Disease Gene以及与白血病细胞分化有关的基因研究。后来有又加上重要功能基因。
向外表述为:“Identification of disease genes and genes with important biological function is one of the major targets of the HGP in China.”
上述工作分别在南北两中心分担,即国家人类基因组南方研究中心(陈竺),和北方研究中心(强伯勤)。
进入1999年事情起了变化:杨焕明博士回国后,主张力争中国要参加实质性工作。1999年9月1日,在国际基因组计划第5次战略会议(伦敦)上,争取到第3号染色体短臂上3000万bp的测序任务。首先条件之一:中国要遵守“百慕大原则”,即HGP的精神,所有合格的数据都应在24小时内上网。至此占世界人口20%的中国负责测定HG 中的1%序列,成为第6个参加HGP实质性工作的国家。在30亿bp的测序上,美国承担54%。英国33%,日本7%,法国2.8%,德国2.2%。中国要在仅有的8个月内完成相当于德国的一半,法国的三分之一的工作量。设立的HGP中国实验室对外称呼:“华大基因研究中心”。
结果,仅用半年时间,于2000年4月底超额完成了3000万bp的“工作框架图“。
中国还有自己的水稻基因组计划。(2001年10月12日完成“工作框架图”)
我们的原则是:“有所为、有所不为”。
6.提前完成计划:
2000年6月26日,参与HGP的美国、日本、英国、法国、德国和中国等6国科学家向全世界公布了人类基因组的工作草图,完成了人类科学史上里程碑式的创举。工作图覆盖了97%的基因组,85%的基因组序列已经被组装起来。
同日,美国总统Clinton和英国首相Blair代表美、英、法、德、日本和中国等六国