第三章 蛋白质化学
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第三章蛋白质化学
蛋白质功能的多样性
●1. 催化功能-酶
●2. 调控功能-激素、基因调控因子
●3. 贮存功能-乳、蛋、谷蛋白
●4. 转运功能-膜转运蛋白、血红/血清蛋白
●5. 运动功能-鞭毛、肌肉蛋白
●6. 结构成分-皮、毛、骨、细胞骨架
●7. 支架作用-接头蛋白
●8. 防御功能-免疫球蛋白
●9. 其他功能
生老病死,万物轮回(蛋白质层次)●生(诞生、生长):在酶催化下老细胞
计划性凋亡和新细胞的再生、活细胞的代谢
----(新陈代谢)
●老?蛋白质功能普遍衰退
●病?个别蛋白质的功能障碍
●死?蛋白质功能的全部停止/分解
蛋白质——生物功能分子
●单细胞生物
多细胞动物
细胞水平
●为什么人体细胞有不同的形状?
细胞内有支撑体
●?
●功能蛋白大多为球状
蛋白质的含氮量
蛋白氮占生物组织所有含氮物质的绝大部分
大多数蛋白质含氮量接近于16%
蛋白质含量 = 每克样品中含氮的克数 6.25
凯氏定氮法
二、蛋白质的水解
●常用盐酸或硫酸
●优点:水解产物不消旋
●缺点:Trp被沸酸完全破坏含羟基Ser、Thr、Tyr部分分解 Asn、Gln酰胺基被水解
(二)碱水解
一般用6M Na(OH)2或4M Ba(OH)2
●
●缺点:许多AA受到不同程度的破坏
部分水解产物发生消旋化
●优点:Trp不受破坏
(三)酶水解
●蛋白酶的作用
●优点:条件温和、常温、常压
无旋光异构、氨基酸不被破坏
●缺点:水解不完全、中间产物多
蛋白质水解
酸/碱能将蛋白完全水解
得到各种AA的混合物
酶水解一般是部分水解
得到多肽片段和AA的混合物
氨基酸是蛋白质的基本结构单元
什么是α-氨基酸
●----C-C-C-C-COOH
γβα
●----C-C-C-C(NH2)-COOH α-氨基酸●----C-C-C(NH2)-C-COOH β-氨基酸●----C-C(NH2)-C-C-COOH γ-氨基酸(一)构成蛋白质的氨基酸
●按照酸碱性质分类
1、中性AA
按照侧链基团的不同又分为:
●脂肪族氨基酸
●芳香族氨基酸
●含-OH氨基酸
●含S氨基酸
●亚氨基酸
2、酸性AA
●甘氨酸没有手性
●其余19种AA都具有旋光性
●脯氨酸是α-亚氨基酸
●其余都是α-氨基酸
根据侧链R基的性质分为:
●非极性氨基酸(疏水氨基酸)
●极性氨基酸(亲水氨基酸)
—酸性氨基酸
—碱性氨基酸
—非解离极性氨基酸
根据侧链R基的性质分为:
●脂肪族、芳香族、杂环族氨基酸
必需及非必需氨基酸
可见光区:无吸收
远紫外和红外区:都吸收
近紫外区(220—300nm):Tyr/Trp/Phe
紫外吸收光谱原因:
-C=C-C=C-C=C-C=C-
●不同pH条件下两性离子的状态发生变化
氨基酸的等电点
●当溶液为某一pH值时,AA主要以兼性离子的形式存在,分子中所含的正负电荷数目正好相等,净电荷为0。这一pH值即为AA的等电点(p I)。
●在p I时,AA在电场中既不向正极也不向负极移动,即处于两性离子状态。
● H+ + A-
● K平衡= [H+]*[A-]/[HA]
● pK平衡= pH - lg [A-] / [HA]
● pH = pK平衡+ lg [A-] / [HA]
●对于侧链含有可解离基团的AA
●p I取决于两性离子两边p K’值的算术平均值
●酸性AA:p I = (p K’1 + p K’R-COO-)/2
●碱性AA:p I = (p K’2 + p K’R-NH2 )/2
三、氨基酸的重要化学反应(一)由α-氨基参加的反应
1、与亚硝酸反应
2、与甲醛的反应
——生成羟甲氨基衍生物
3、酰化反应
——氨基中的H被酰基取代而酰化
O COONa 在弱碱中 CH2 O C Cl + H2N CH 后酸化
R
O COOH
CH2 O C N CH +Na++Cl-
H R
N-端分析法
特点:能够不断重复循环,将肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。
(1)与NaOH等形成盐
(2)成酯
NH2干燥,HCl R CH COOH + C2H5OH
回流
R CH COOC2H5 + H2O
●在pH=5~7的溶液中氨基酸(除Pro和HPro外)和蛋白质都能与茚三酮反应,最终形成蓝紫色化合物
●反应分下面两个步骤进行:
第一步 AA被氧化成CO2、NH3和醛
茚三酮被还原成还原型茚三酮。
第二步还原型茚三酮同另一个茚三酮分子
及NH3缩合生成有色物质。蓝色化合物
●① Pro和Hpro无游离氨基,
只能形成黄色化合物(440nm)
●②可鉴定某化合物是否有可能是AA