基因重组与基因工程《生物化学》复习提要
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基因重组与基因工程
第一节 DNA的重组
自然界不同物种和个体之间的基因转移和重组是经常发生的,它是基因变异和物种演变、进化的基础。
一、同源重组
同源重组:发生在同源序列间的重组称之,又称基本重组。以E.coli的同源重组为例,了解同源重组机制的Holliday模型(1964年)
结果可产生片段重组体和拼接重组体两种重组体。
二、细菌的基因转移与重组
(一)接合作用
概念:当细胞与细胞、或细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA就可以从一个细胞(细菌)转移至另一细胞(细菌),此类型的DNA转移,称之。
只有某些较大的质粒,才能通过接合作用从一个细胞移至另一细胞。质粒双链DNA中的一条链就会切割、产生单链缺口,切口单链DNA通过鞭毛连接桥向另一细胞转移,随后在两细胞内分别以单链DNA为模板合成互补链。
(二)转化作用
1、概念:通过自动获取或人为地供给外源DNA,使细胞或培养的受体
细胞获得新的遗传表型,这就是转化作用。即由外来DNA引起生物类型的改变过程。
2、本质:外来DNA重组(整合)到宿主细胞内表达新的蛋白质,(经过
复制、转录、翻译)——→经过转化,遗传类型改变。
但是,由于较大的外源DNA不易透过细胞膜,因此自然界发生的转化作用效率并不高,染色体整合几率则更低。
(三)转导作用
概念:当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来,再次感染另一(受体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组即为转导作用。
常见:噬菌体感染宿主时伴随基因转移;噬菌体感染宿主有两种结局:1)溶菌生长途径——噬菌体DNA在宿主菌内迅速增殖,产生新的病毒颗粒,溶解细菌,释放新生噬菌体;
2)溶源菌生长途径——噬菌体DNA整合进宿主染色体,随宿主DNA 复制而被动复制。
三、位点特异的重组
位点特异的重组:由整合酶催化、在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。
(一)λ噬菌体DNA的整合
(二)细菌的特异位点重组
沙门氏菌H片段倒位决定鞭毛相转变
(三)免疫球蛋白基因的重排
四、转座重组
概念:大多数基因在基因组内的位置是固定的,有些基因可以从一个位置移动到另一位置,这种由插入序列和转座子介导的基因移位或重排,称为转座。
(一)插入序列转座——两种形式
1、保守性转座:是插入序列从原位迁至新位;
2、复制性转座:是插入序列复制后,其中的一个复制本迁移至新位,另一个仍保留在原位。
(二)转座子转座
概念:转座子就是可从一个染色体位点转移至另一位点的分散的重复序列。
第二节重组DNA技术
一、重组DNA技术(或称基因工程)相关概念:
1、DNA克隆(分子克隆):应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质
(同源的或异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体DNA 接合成一具有自我复制能力的DNA分子——复制子(replicon),继而通过
转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称基因克隆或重组DNA (recombinant DNA) 。
基因工程(genetic engineering) ——实现基因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,又称重组DNA工艺学。
2、工具酶:在重组DNA技术中,常需要一些基本工具酶进行基因操作。
故称之。
如:限制性核酸内切酶、DNA连接酶、DNA聚合酶Ⅰ、Klenow片段、反
转录酶、多聚核苷酸激酶、末端转移酶、碱性磷酸酶
限制性核酸内切酶
定义:限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE)是识别DNA的特异序列, 并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。
分类:Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ(基因工程技术中常用Ⅱ型)
Ⅱ类酶识别序列特点——回文结构
切口:平端切口、粘端切口
三类特殊性质的II型限制性内切酶:同功异源酶、同尾酶、可变酶
3、目的基因:需要特异表达的特定的DNA片段;这些感兴趣的基因或DNA
序列就是目的基因或目的DNA。
目的基因类型:cDNA和基因组DNA
3、基因载体:
定义:为携带目的基因,实现其无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用
的一些DNA分子。
常用载体:质粒DNA、噬菌体DNA、病毒DNA
载体的选择标准:能自主复制;具有两个以上的遗传标记物,便于重组体的筛选和鉴定;有克隆位点(外源DNA插入点),常具有多个单一酶切位点,称为多克隆位点;分子量小,以容纳较大的外源DNA。
1.质粒
质粒——细菌染色体外的小型环状双链DNA分子
特点:
能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传信息, 会赋予宿主细胞一些遗传性状。这也是筛选转化子细菌的根据。
2. 噬菌体(phage)
λ噬菌体DNA改造系统:
λgt系列(插入型,适用cDNA克隆)
EMBL系列(置换型,适用基因组克隆)
λ噬菌体DNA分子为双链线状,其末端分别具有突出的12bp的互补单链,是天然的粘性末端,称为COS位点。当感染细菌后,λ噬菌体借COS 位点互补连接形成双链环状结构。
λ噬菌体作为载体具有两个特点:
(1) λ噬菌体生长繁殖所必需的序列位于其左右两臂上含有30%的DNA是噬菌体生长所必需的。
(2) λ噬菌体的成熟需要包装,当与外源DNA片段重组后的大小介于原来的78%~105%之间时,重组的DNA分子才可包装为成熟的的λ噬菌体颗粒。
可将λ噬菌体载体分为插入型和置换型:
-----插入型允许克隆的外源DNA片段较小,一般为7kb以下;
-----置换型载体允许外源DNA代替自身的生长非必需区,可容纳30kb的外源DNA。
其他:
酵母人工染色体 (yeast artificial chromosome, YAC)
细菌人工染色体 (bacterial artificial chromosome, BAC)
动物病毒DNA改造的载体(如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒)
二、重组DNA技术基本原理
DNA克隆的基本原理和过程:目的基因的获取;克隆载体的选择和构建;
外源基因与载体的连接;DNA导入受体菌;重组体的筛选;克隆基因的扩增与表达