小RNA测序数据处理和分析流程
合集下载
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
#流程大放送#小RNA测序数据处理和分析
知因无限
介绍
Small RNA是一类重要的体内调节分子，主要包括miRNA、piRNA和siRNA。可参与基因转录后调控，调节细胞生长、分化，以及个体发育、生殖等重要生物学过程。Small RNA测序是研究生物样品小RNA的最主要方法之一，首先采用胶分离技术，收集样品中18-30nt 的RNA片段；再利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的数百万条小RNA序列信息。
该项技术可用于以下研究
1.观察疾病发生过程中病灶部位内部miRNA的表达异常，确定与疾病相关miRNA
2.基于小RNA样本的新miRNA预测和新miRNA的调控靶基因预测
数据处理和分析流程图
预期示例图展示
示例1 A图为测序序列分类，B图为每个类别中序列长度分布，C图为miRNA表达水平聚
类
示例2 miRNA、靶基因与miRNA上游TF网络图
示例3 miRNA预测结果示意图