分子生物学第六章 DNA的损伤、修复和基因突变
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核酸内切酶(UvrABC)、Pol I、连接酶等共同完成。UvrABC在错
配的碱基包括二聚T的两侧都作一个切口,切下包含损伤在内的 12bp的单链片段,留下的缺口由 Pol I修补,最后由DNA 连接酶
连接。
(三)错配修复 是根据模板的遗传信息来修复错配的碱基,因此修复 时要区分模板链和新生链。大肠杆菌中有错配修复系统, 可识别子代链上错配的碱基,这种错配修复系统识别的依 据是甲基化。
--------------A------------ 复制 --------Br- U------------ →
--------------A-------------------------G-------------------------T------------ + --------------U------------
结构上的变型(胸腺嘧啶二聚体) 2、光复活
1、酶-DNA复合 物
3、酶释放
2、烷基化的碱基:如O6-甲基鸟嘌呤在O6-甲基鸟嘌呤转甲基酶 的作用下将O6-甲基鸟嘌呤甲基转移给酶分子上的一个半胱氨酸 残基。
(二)、切除修复
清除错配的碱基,包括二聚T,再以另一条链为模板,合成新
的一股DNA代替。 切除修复是一种多步骤的酶反应过程。在大肠杆菌中主要由
(四)重组修复或易错修复
在DNA复制过程中,如果模板DNA受到了损伤,则复制受到抑制。 此时可由重组修复系统来完成这一工作。其作用机制为先复制
后修复。当复制进行到损伤部位时,此时复制跨越损伤部位,
继续在其下游约1Kb重新开始复制。新生子链的缺少部分,由 互补链的相应片段转移到缺口处,损伤部位随后由切除修复或
滑移容易造成缺失,在生长链
上容易造成插入。
2、胸腺嘧啶二聚体:紫外线照射能使相邻嘧啶,尤其是胸腺嘧
啶形成环丁基二聚体,二聚体的存在使正常的碱基配对难以发
生。
3、链的断裂:电离辐射、博莱霉素(bleomycin)等化学试剂可
作用于DNA链,使单股或双股DNA的磷酸二酯键断裂,而且能
使脱氧核糖裂解,在链的3`-端产生磷酸乙醇酸。 4、DNA链的交联:
A· TG· transition C
三、错配碱基的掺入:如由突变基因编码具有缺陷的聚合酶,
核酸酶或其它蛋白质,导致碱基发生错配。
(一)结构畸变 1、碱基的缺失、插入:吖啶类、 溴乙锭等物质其分子扁平,容 易嵌入到DNA碱基平面间,从
而导致在复制、重组过程中缺
失或插入碱基。聚合酶在复制 过程中发生滑移,如在模板链
与DNA修复有关的一组基因,产生一系列的蛋白来应急, 此反应称为SOS反应。其引发过程与RecA蛋白的活化有关。
Pol II可越过损伤部位,进行易错修复。
基因突变
• 所有生物基因组中的DNA并不稳定,很容 易发生各种各样的、可以遗传的改变,即 基因突变(mutation)。
• 按突变的形式,可以将突变分为碱基替换 (base substitution)、缺失(deletion)和插 入(insertion)等。
enol form
2. 1st round of replication
H
O
Br
AGCTTCCTA TCGAAGGAT
AGCTBCCTA TCGAGGGAT
:A
3. 2nd round of replication
AGCTBCCTA TCGAAGGAT AGCTCCCTA TCGAGGGAT
Keto form 5-BrU
↓
---------G-------- ----------A----------------C-------- ----------U--------
OH
H
O
Br
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AGCTTCCTA TCGAAGGAT
:G
1. Base analog incorporation
AGCTBCCTA TCGAAGGAT
SSB,Pol III,核酸外切酶,连接酶等。错配修复发生在
GATC的邻近处(如GAmTC 1000bp以内)MutH(错配修复酶) 内切酶活力在未甲基化链GATC序列中G的5`外侧切割,成为
待修复链的标志,1)错配位于切割点的5`-侧,未甲基链按
3`→5`方向由核酸外切酶降解直至错配碱基在内,再由Pol III以模板链为信息,合成新的正确的子链;2)错配位于切 割点的3`-侧时,由核酸外切酶VII 或RecJ蛋白按5`→3`方 向降解未甲基链,直至包含错配碱基在内。
第六章 DNA的损伤、 修复和基因突变
DNA的复制是一个高度保真的过程,但在复制过程 中总有少量未被纠正的错误存在,此外DNA还可能 受到各种理化因素的损害,这种差错和损伤如不被 纠正,则会导致突变,甚至机体的死亡。
DNA损伤的来源 一、碱基脱落
酸和热都能影响糖苷键而使碱基脱落,其它已改变的碱基
也可被专一的DNA糖基化酶除去,形成无嘌呤或无嘧啶的位 点(AP位点)。
E. coli中DNA的5`-GATC序列中A的N6都是甲基化的
(由DAM甲基化酶负责),复制后短时间内子代链DNA暂时 为半甲基化状态,成为识别模板链和新合成链的基础,可
将错配的碱基识别出来,并将其切除。
其机制不完全清楚。这一系统包括多种酶系:Dam甲化酶, Mut H,Mut L,MutS(矫正酶,错配修复酶),解旋酶III,
诱发突变:辐射诱变、紫外线照射、化学诱变
基因突变的后果 • 功能丧失 功能丧失可能是部分的或全部的。 • 功能获得 很多机制可以产生功能获得的显性表现型。 • 癌症发生 并非所有的突变都会导致疾病,一个正常细 胞转变成恶性肿瘤需要以多种特异性的突 变同时发生为条件。
烷化剂、丝裂霉素、
光活化的补骨脂等, 可使DNA双股链间形 成交联。
DNA的修复系统
一、直接修复: 1、二聚T:几乎所有生物的细胞中都已发现光复活酶(DNA光解酶)
(photoreactivationase,PR酶)。DNA中的嘧啶二聚体可通过可见光(300600nm)的活化下由光复活酶催化胸腺嘧啶二聚体分解为单体。其分子机制: PR酶先与DNA链上的二聚T结合形成复合物,这种复合物以某种方式吸收可 见光并利用光能切断胸腺嘧啶二聚体之间的两个C-C键,使二聚T变为单体, PR酶释放。
直接修复系统修复。重组修复涉及多种酶,其中最重要的是
RecA蛋白。
创伤 重组
修复 重组后的亲代DNA
修复后的亲代DNA
(五)SOS修复 SOS修复是一种旁路修复系统。在修复过程中错误率很高。 有时虽然合成了与亲本一样长的DNA链,但常常是没有功 能的。
DNA受到严重损伤时,会引起细胞产生一系列变化,启动
二、碱基的改变 由于物理化学因素导致碱基之间的改变,表现为一个嘧 啶换成另一个嘧啶,或一个嘌呤换成另一个嘌呤。 1、烷化剂:硫酸二甲酯、甲烷磺酸甲酯等烷化剂与碱基 中的亲核基团作用生成烷基化碱基。
2、亚硝酸: 甲基化的胞嘧啶→脱氨→T 胞嘧啶→脱氨→U 碱基类似物:5-溴尿嘧啶(Br-U)与T相似,可与A配对, 也能与G配对,结果使A:T→G:C