苯硫脲尝味遗传大实验

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(4)取 1 片光面纸,点 5uL 灭菌水、2uL 6× 加样缓冲液,再加入 5uL PCR 产物制成10uL DNA 样品。 (5)在凝胶上选择相邻的加样孔。用10ul 的吸液头 分别依次加入5uL Marker I 对照,各小组12uL PCR 产物电泳样品(互相比较) (6)根据电泳槽的长度把电泳仪的电压调至120V (10V/cm),电泳20~30min。(注意正负电极的位置连 接正确)。 (7)把凝胶小心放入盛有 EB的搪瓷盘中,染色 10分钟 后,取出用自来水浸泡10min 。 (8)放入凝胶成像系统中拍照。
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遗传学大实验注意事项
1.实验的每一步都要详细地记录操作内容、时间、步 骤、结果等,以备查询。 2.对任何自己不熟悉的实验仪器都不要随意操作(尤 其是微量移液器)。在操作的过程中发现任何意外的 现象都要及时向任课教师汇报。 3.在实验的过程中制造的任何垃圾都要丢到垃圾筐里 (或先放在自己的桌面一角),严禁随地投弃!特别 注意对废弃细菌的杀灭和有毒垃圾的定点投放。 4.实验结束后要把用过的器皿清洗后归放整齐并清点数 目,向教师汇报征得同意后方可离开实验室。
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4.6 PTC 基因PCR 产物酶切
4.6.1 实验材料 4.6.1.1 主要仪器设备 高压蒸气灭菌锅、高速离心机、小型瞬时离心机、涡旋振 荡器、磁力搅拌器、恒温水浴锅、恒温干热议、制冰机、 紫外分光光度计、微量移液器、冰箱、-80℃超低温冰箱。 洁净、经121℃高压灭菌20min 的1.5 mL 灭菌微量离心 管、微量移液器吸头(枪头),离心管架,一次性医用无 菌PE 手套,塑料饭盒,记号笔。
www.ppt5u.com 图 2.2 味盲者PTC 尝味基因编码区(CDS)序列
图2.3 味盲者PTC 多肽
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味盲者的PTC 编码区有五个限制性内切 Fnu4H1 的识别位点(识别序列5’-GC↓NGC3’),如果是尝味者,则其第785 位SNP 恰好 形成了一个额外的Fnu4H1 识别位(GCTGC)。 因此可以利用这个SNP 造成的限制性位点多态 性,设计引物扩增包含785 位SNP 位点的PTC 基因编码区的一部分,然后用Fnu4H1切割扩增 产物,根据是否能把扩增产物切开而判定是某 个人的单倍型(haplotype)。
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(3 )把梳子插到凝胶灌制模具的正确位置 后缓缓倒入胶溶液。胶溶液倒至与模具的矮 边缘相平即可。在桌面上静置10-20 分钟待 胶完全凝固.(剩下的胶溶液封口后留待以 后再熔化使用),小心拔出梳子,凝胶没入 电泳槽电泳液中,凝胶上有样品孔的一侧要 朝向电泳槽的负极。
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1.实验目的
(1)测定人群中PTC 尝味基因的表现型和基因型,理 解孟德尔遗传基因型与表现型的对应关系。 (2)了解酶切扩增多态序列(cleaved amplified polymorphic sequence,CAPS) (又称为PCR-RFLP)技术的原理,学会用CAPS 技术 检测单核苷酸多态性 (SNPs)。在分子水平上测定PTC 尝味的基因型。 (3)计算群体中PTC 尝味的基因频率,判断群体是否 达到Hardy-weiberg 平衡。
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PTC 尝味能力是受单基因控制的孟德尔遗传 性状,是由位于7 号染色体上(7q35-7q36)的 一种苦味味觉感受器基因TAS2R38 决定的,属 于常染色体不完全显性遗传。尝味者中显性基因 T的纯合子(TT)能尝出1/750,000~ 1/6,000,000 的PTC 溶液的苦味,杂合子(Tt) 只能尝出1/ 480,000~l/380,000 的PTC 溶液的苦味。因此 可以利用对PTC 的尝味能力测定家族中的基因传 递和人群中的基因频率。
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4. 实验步骤
(1)讲解实验目的、实验原理、实验技术路线。 (2)讲解口腔上皮细胞总DNA 的快速提取、基因PCR 扩 增、DNA 电泳、PCR 产物纯化、DNA 酶切、遗传学分析等实验方法及注意事 项。 (3)讲解高压蒸气灭菌锅、高速离心机、小型瞬时离心机、 电泳仪、水平电泳槽、涡旋振荡器、磁力搅拌器、电子天 平、PCR 仪、微波炉、紫外分光光度计、电磁炉、恒温 水浴锅、恒温干热议、凝胶成像仪、制冰机、超净工作台、 通风橱、恒温振荡摇床、37℃培养箱、pH 计、微量移液 器、冰箱、-80℃超低温冰箱等主要仪器设备以及必须的 电脑软件的使用方法、注意事项;
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4.3
人口腔上皮细胞总 DNA 的提取
4.3.1 实验材料 4.3.1.1 主要仪器设备 高压蒸气灭菌锅、磁力搅拌器、电子天平、超净 工作台、恒温水浴锅、涡旋振荡器、高速离心机、 恒温振荡摇床、微量移液器、电磁炉、冰箱、 -80℃超低温冰箱、计时器、pH 计。 洁净、经 121℃高压灭菌 20min 的量筒、烧杯、螺口试剂 瓶、牙签、1.5 mL灭菌微量离心管、微量移液器 吸头(枪头),离心管架,一次性医用无菌 PE 手套、乳胶手套、口罩,记号笔。
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4.2.1.2 试剂和材料 (1)材料:受试者为全体修读遗传学大实验的学生。
(2)试剂:苯硫脲(PTC)结晶,娃哈哈纯净水。
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4.2.1.3 溶液配制 (1)原液(1 号液):称取PTC 结晶0.65 g,加 娃哈哈纯净水500 ml,在室温(20℃左右)下溶解 l~2d(经常摇晃)(或60℃水浴中1 h 充分溶 解),PTC 浓度约为1/750,过滤灭菌。 (2)稀释液:用娃哈哈纯净水逐级稀释原液2~14 倍,编为2-14 号(表4.1)。 将配好的14 种浓度 的PTC 溶液,过滤灭菌,分别置于灭菌过的100 ml 螺口试剂瓶中。另取娃哈哈纯净水作为第15 号液。
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第一处:145 位,味盲者为G145 (编码丙氨酸ala),尝味者为C145(编 码脯氨酸pro); 第二处:785 位,味盲者为T785(编 码缬氨酸val),尝味者为C785(编码丙 氨酸ala); 第三处:886 位,味盲者为A886(编 码异亮氨酸ile),尝味者为G886(码缬 氨酸val)。
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因此味盲者PTC 多肽中三处对应的氨 基酸分别是ala49、val262 和ile262,被称 为AVI 等位基因,而尝味者的三处是pro49、 ala262 和val262,被称为PAV 等位基因 (图2.2,2.3)。
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4.5.2. 试剂和材料 (1)材料:受试者PTC 基因PCR 产物 (2)试剂:Tris 碱,冰乙酸,Na2EDTA.2H2 O, 溴化乙锭,琼脂糖,Marker I 4.5.3. 溶液配制 (1)50× TAE 电泳缓冲液(储存液,pH约8.5 ):Tris 碱 242g,57.1ml 冰乙酸,37.2g Na2 EDTA.2H2 O ,去离子水定容至1L (2)1× TAE 电泳缓冲液(工作液):取 50×TAE 电泳缓冲液,去离子水稀释50倍
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2. 实验原理
2.1 苯硫脲尝味的遗传形式
苯硫脲(phenylthiocarbamide,PTC)是硫脲的 苯基衍 生物(图2.1),为白色结晶粉末,因含有硫代酰胺基 (N-C=S)官能团而有苦涩味。能尝1/750,000~1/50,000 PTC 浓度溶液味道的人(苦涩味,少数人感到甜味)称 为苯硫脲“尝味者(taster)”;只能尝出PTC 浓度大于 1/24,000 溶液的味道(甚至对PTC 的结晶物也尝不出苦 味)的人称为苯硫脲“味盲者(nontaster)”。
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4.5.2 实验方法
(1)配制 1.2%琼脂糖凝胶:称取 0.6g 琼 脂糖粉,放入三角瓶,加入50ml 1 × TAE电 泳缓冲液,放入微波炉中加热,并不断取出 混匀,注意观察烧瓶中的琼脂糖粉末,直至 完全熔解(烫,戴手套)。50ml 正好倒一 块大胶(切不可让胶溶液溢出到微波炉中! )。 (2)将胶液置桌面上室温冷却致热但不烫手 (约50-60℃)。
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4.2.2 实验方法 (1)让受试者正坐,仰头张嘴伸舌,用滴管滴2~3 滴 15 号液于受试者舌根部,让受试者慢慢咽下反复咂嘴 品味液体尝味,然后用纯净水做同样的试验,交替给 受试者尝味,避免受试者的臆意猜测而影响结果的准确。 (2)询问受试者能否鉴别此两种溶液的味道。 (3)若不能鉴别或鉴别不准,则依次用 14~1 号溶液 重复试验,直到能明确鉴别出PTC 的苦味为止。 (4)复尝味3 次,3 次结果相同时,才是可靠。 (5)记录所品出苦味的液体的编号和稀释浓度。
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4.2 PTC 尝味能力的测定
4.2.1 实验材料 4.2.1.1 主要仪器设备 高压蒸气灭菌锅、磁力搅拌器、电子天平、超 净工作台、恒温水浴锅、冰箱。 洁净、经121℃高压灭菌20min 的容量瓶、量 筒、烧杯、螺口试剂瓶,一次 性医用无菌PE 手套、乳胶手套、塑料滴管,一次 性纸杯,记号笔。
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(3)0.5mg/ml 溴化乙锭(EB)(1000 储 存液):50mg 溴化乙锭溶于100mL dd water,4C 避光储存)。 (4) 溴化乙锭(EB)工作液:0.5mg/ml EB (1000 储存液),去离子水稀释 1000倍。 (注:EB为扁平分子,可以嵌入DNA,为潜在 诱变剂,接触时须带一次性医用无菌PE手套, 但也不是洪水猛兽,不小心溅到皮肤上时,不 会被皮肤吸收只是停留在表面,用大量流水冲 洗即可)。
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2.2 人类苯硫脲尝味的基因
人类的 PTC 尝味基因Homo sapiens taste receptor, type 2, member38(TAS2R38)(NM_176817),又名PTC、 T2R38 或 T2R61。绝大多数尝味者与味盲者的区别 在于三处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs):
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注:统计民族、生源地是想调查PTC 味盲分布与民族和地理位置是否有 相关性。(此生源地统计的不是受试者户籍所在地,而是其家族或家 庭成员长期生活的地方)
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4.5 PTC 基因PCR扩增产物的电泳检测
4.5.1. 主要仪器设备 高速离心机、小型瞬时离心机、电泳仪、水 平电泳槽、电子天平、微波炉、凝胶成像仪、 制冰机、超净工作台、通风橱、微量移液器、 冰箱、-80℃超低温冰箱。 洁净、经121℃高压灭菌20min 的、微量移 液器吸头(枪头),离心管架, PCR管架,三 角瓶,一次性医用无菌 PE手套,记号笔,保 鲜袋,微波炉用手套,三角瓶,搪瓷盘。
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4.3
人口腔上皮细胞总 DNA 的提取
4.3.1.2 试剂和材料 (1)材料:每实验小组选取 1 名受试者,用灭 菌牙签刮取口腔上皮细胞。 (2)试剂:灭菌水,pH 标准液,细胞基因组 DNA 提取试剂盒
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4.3
人口腔上皮细胞总 DNA 的提取
4.3.2 实验方法 (1)在 1.5 ml 灭菌微量离心管中加入 100 µL 灭菌水。 (2)受试者用无菌牙签轻刮口腔腮内侧,刮下来 的细胞在灭菌水中漂洗。 (3)涡旋振荡器涡旋振荡混匀 10 s, (4)离心机瞬时离心 10 s。 (5)沸水浴中煮沸 5 min。 (6)离心机 13200rpm 离心 2 min。 (7)基因组 DNA 4˚C 保存备
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