南开大学结构生物学第一讲-1 结构生物学-课程介绍
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术出版社，2002年
6. Campbell等著，孙之荣等译，探索基因组学、蛋白质组学和 生物信息学，科学出版社，2004年.
1. 文 献 述 评 报 告(PPT)
分子材料专业：魏哲昊 同学--化学生物学 数学与应用数学专业：马文凯 同学--生物统
计数学模型 信息学院微电子专业：张世欣 同学--生物芯
Structural biology-Towards the structure of the mammalian signal recognition particle
Structural biology-Transcription factor complexes
Structural biology-Trends in protein evolution inferred from sequence and structure analysis
structio biology-Molecular dynamics simulations of biomolecule
structio biology-Molecular dynamics simulations of biomolecules
structio biology-Musing on the structural organization of the exosome complex
列举科学史上生命科学与其它学科交叉促进并导致重大科 学发现的事例，请给予评说。
如何看待复杂生命形式具有简单统一的物理、化学本质？ 试探讨生命复杂性是如何形成的。
其它与结构生物学相关的任意主题。
更多的文献请查阅相关栏目
structio biology-Measuring conformational dynamics of biomolecules by single molecule fluorescence spectroscopy
structio biology-Observing single biomolecules at work with the atomic force microscope
structio biology-Progress in protein structure prediction
structio biology-Protein dynamics from NMR
在报告后列出你所查阅的参考文献，并在文中引用 处标明该文献的序号。
字数在1,000字以上（不含参考文献列表部分）。
相关问题提示
人类基因组计划带来什么重要的科学问题？对生命科学研 究的内容、手段有何影响？
如何看待后基因组时代生命科学研究所面临的法律、道德、 伦理等社会科学问题？
阐述结构生物学的主要研究内容、方法，或举例说明某些 方法和技术在结构生物学研究中的应用。
4、E-mail: xzfeng@ Tel:2350-7022(office)
（办公室地址：分子生物学研究所一楼126室）
5、课程大纲和讲义可在下述 电子信箱学习或下载。
（xizeng.feng@ )
课程提纲
第一章 结构生物学简介（3学时）
第一节 结构生物学诞生的科学背景 第二节 结构生物学的发展历史 第三节 结构生物学的研究内容 第四节 结构生物学的研究方法
参考资料
1. 杨铭，《结构生物学概论》，北京大学医学出版社，北京，
2002。
2. 刘次权，白春礼等，《结构分子生物学》，高等教育出版社，
北京，1997。
3. 阎隆飞，孙之荣，《蛋白质分子结构》，清华大学出版社，
北京，1999。
4. 王大成，《蛋白质工程》，化学工业出版社，北京，2002。 5. 郝柏林、张淑誉，生物信息学手册（第二版），上海科学技
Structural biology-Unraveling hot spots in binding interfaces-progress and challenges
片 生物技术专业：张志云-表面生物学-2006-
11-8 生物科学专业：鲍梦寒-分子营养-2005级
课程学习研究论文要求
围绕结构生物学的相关问题（参见后面）写一篇中 文或英文调研报告，要求：
在2008年1月16日课堂打印上交给老师，报告第1 页上方请注明你的姓名、学号、院系；
鼓励表达自己的观点，而且必须保证你提交的报告 没有经过任何其他人的帮助；
结构生物学
Structural Biology
冯喜增 教授、博导 南开大学生命科学学院 生物活性材料教育部重点实验室
Tel: 2350-7022（Office）E-mail: xzfeng@
结构生物学是当前分子生物学中的一个重 要前沿学科，它是在分子层次上从结构角 度特别是从三维结构的角度来研究和阐明 当前生物学中各个前沿领域的重要学科问 题，是一个包括生物学、物理学、化学和 计算数学等多学科交叉的，以结构（特别 是三维结构）测定为手段，以结构与功能 关系研究为内容，以阐明生物学功能机制 为目的的前沿学科。
第一节 肌红蛋白和血红蛋白) (1) 第二节 酶的催化作用 (1) 第三节 免疫系统的分子识别 (2) 第四节 核酸与蛋白质的相互作用 (2) 第五节 糖蛋白 (1) 第六节 生物膜 (1)
第七章 结构生物学的研究方法简介 （8学时）
第一节 生物学大分子的计算机模拟 第二节 X-射线晶体学 第三节 电子晶体学与电镜三维重构 第四节 多维核磁共振波谱学 第五节 各种谱学方法等
Structural biology-The role of metal ions in RNA catalysis
Structural biology-Theoretical and computational models of ion channels
Structural biology-Theory and simulation Macromolecular assemblages
第一节 结晶状态的蛋白质的特征 第二节 蛋白质的结构层次 第三节 稳定蛋白质构象的作用力 第四节 蛋白质结构分类 第五节 蛋白质折叠问题
第五章 蛋白质与Βιβλιοθήκη 酸的相互作用第一节蛋白质与核酸相互作用力分类 第二节蛋白质与DNA的相互作用 第三节蛋白质与RNA的相互作用
第六章 生物大分子的结构与功能 (8学时)
structio biology-The CCPN project-an interim report on a data model for the NMR community
structio biology-The end of the (DNA) line
structio biology-The ends of the affair-Capping and polyadenylation
这门学科的核心内容是蛋白质及其复合物、 组装体和由此形成的细胞各类组分的三维 结构、运动和相互作用，以及它们与正常 生物学功能和异常病理现象的关系。
仅在蛋白质晶体学领域中就有11名科学家 获得诺贝尔奖。
本课程着重讲述结构生物学的基本原理、 研究方法和最新进展。
通过本课程的学习，使学生掌握结构生物 学的基本概念和原理,培养和建立以生物分 子的空间结构为基础来解释和理解生命现 象、揭示生命规律的观念和思维方法，并 对结构生物学领域的最新进展有所了解。
structio biology-Stretching single molecules into novel conformations using the atomic force microscope
structio biology-structural view of mitochondriamediated apoptosis
第二章 核酸的结构原理（6学时）
第一节 核酸的基本结构单位 第二节 DNA的结构 第三节 RNA的结构 第四节 染色体的结构 第五节 基因组
第三章 基因组测序计划和结构基因组学 (3学时)
第一节 人类基因组计划 第二节 后基因组时期新的研究领域 第三节 结构基因组计划
第四章 蛋白质结构原理（4学时）
课程安排
1、时间：每周三上午1～2节（8:00-9:40） 教室：第二主教学楼-102教室 学时：每周2学时（总计182=36学时）
2、学分：2学分 3、成绩考核方式：
成绩评定按平时20%+期中30%+期末50%的综合评价方式。 1次文献述评报告(PPT)（分次在课堂讨论），占总成绩20％; 1次学习研究论文（期末完成），占总成绩20％; 其他：期中20%+期末40%，占总成绩60％。
6. Campbell等著，孙之荣等译，探索基因组学、蛋白质组学和 生物信息学，科学出版社，2004年.
1. 文 献 述 评 报 告(PPT)
分子材料专业：魏哲昊 同学--化学生物学 数学与应用数学专业：马文凯 同学--生物统
计数学模型 信息学院微电子专业：张世欣 同学--生物芯
Structural biology-Towards the structure of the mammalian signal recognition particle
Structural biology-Transcription factor complexes
Structural biology-Trends in protein evolution inferred from sequence and structure analysis
structio biology-Molecular dynamics simulations of biomolecule
structio biology-Molecular dynamics simulations of biomolecules
structio biology-Musing on the structural organization of the exosome complex
列举科学史上生命科学与其它学科交叉促进并导致重大科 学发现的事例，请给予评说。
如何看待复杂生命形式具有简单统一的物理、化学本质？ 试探讨生命复杂性是如何形成的。
其它与结构生物学相关的任意主题。
更多的文献请查阅相关栏目
structio biology-Measuring conformational dynamics of biomolecules by single molecule fluorescence spectroscopy
structio biology-Observing single biomolecules at work with the atomic force microscope
structio biology-Progress in protein structure prediction
structio biology-Protein dynamics from NMR
在报告后列出你所查阅的参考文献，并在文中引用 处标明该文献的序号。
字数在1,000字以上（不含参考文献列表部分）。
相关问题提示
人类基因组计划带来什么重要的科学问题？对生命科学研 究的内容、手段有何影响？
如何看待后基因组时代生命科学研究所面临的法律、道德、 伦理等社会科学问题？
阐述结构生物学的主要研究内容、方法，或举例说明某些 方法和技术在结构生物学研究中的应用。
4、E-mail: xzfeng@ Tel:2350-7022(office)
（办公室地址：分子生物学研究所一楼126室）
5、课程大纲和讲义可在下述 电子信箱学习或下载。
（xizeng.feng@ )
课程提纲
第一章 结构生物学简介（3学时）
第一节 结构生物学诞生的科学背景 第二节 结构生物学的发展历史 第三节 结构生物学的研究内容 第四节 结构生物学的研究方法
参考资料
1. 杨铭，《结构生物学概论》，北京大学医学出版社，北京，
2002。
2. 刘次权，白春礼等，《结构分子生物学》，高等教育出版社，
北京，1997。
3. 阎隆飞，孙之荣，《蛋白质分子结构》，清华大学出版社，
北京，1999。
4. 王大成，《蛋白质工程》，化学工业出版社，北京，2002。 5. 郝柏林、张淑誉，生物信息学手册（第二版），上海科学技
Structural biology-Unraveling hot spots in binding interfaces-progress and challenges
片 生物技术专业：张志云-表面生物学-2006-
11-8 生物科学专业：鲍梦寒-分子营养-2005级
课程学习研究论文要求
围绕结构生物学的相关问题（参见后面）写一篇中 文或英文调研报告，要求：
在2008年1月16日课堂打印上交给老师，报告第1 页上方请注明你的姓名、学号、院系；
鼓励表达自己的观点，而且必须保证你提交的报告 没有经过任何其他人的帮助；
结构生物学
Structural Biology
冯喜增 教授、博导 南开大学生命科学学院 生物活性材料教育部重点实验室
Tel: 2350-7022（Office）E-mail: xzfeng@
结构生物学是当前分子生物学中的一个重 要前沿学科，它是在分子层次上从结构角 度特别是从三维结构的角度来研究和阐明 当前生物学中各个前沿领域的重要学科问 题，是一个包括生物学、物理学、化学和 计算数学等多学科交叉的，以结构（特别 是三维结构）测定为手段，以结构与功能 关系研究为内容，以阐明生物学功能机制 为目的的前沿学科。
第一节 肌红蛋白和血红蛋白) (1) 第二节 酶的催化作用 (1) 第三节 免疫系统的分子识别 (2) 第四节 核酸与蛋白质的相互作用 (2) 第五节 糖蛋白 (1) 第六节 生物膜 (1)
第七章 结构生物学的研究方法简介 （8学时）
第一节 生物学大分子的计算机模拟 第二节 X-射线晶体学 第三节 电子晶体学与电镜三维重构 第四节 多维核磁共振波谱学 第五节 各种谱学方法等
Structural biology-The role of metal ions in RNA catalysis
Structural biology-Theoretical and computational models of ion channels
Structural biology-Theory and simulation Macromolecular assemblages
第一节 结晶状态的蛋白质的特征 第二节 蛋白质的结构层次 第三节 稳定蛋白质构象的作用力 第四节 蛋白质结构分类 第五节 蛋白质折叠问题
第五章 蛋白质与Βιβλιοθήκη 酸的相互作用第一节蛋白质与核酸相互作用力分类 第二节蛋白质与DNA的相互作用 第三节蛋白质与RNA的相互作用
第六章 生物大分子的结构与功能 (8学时)
structio biology-The CCPN project-an interim report on a data model for the NMR community
structio biology-The end of the (DNA) line
structio biology-The ends of the affair-Capping and polyadenylation
这门学科的核心内容是蛋白质及其复合物、 组装体和由此形成的细胞各类组分的三维 结构、运动和相互作用，以及它们与正常 生物学功能和异常病理现象的关系。
仅在蛋白质晶体学领域中就有11名科学家 获得诺贝尔奖。
本课程着重讲述结构生物学的基本原理、 研究方法和最新进展。
通过本课程的学习，使学生掌握结构生物 学的基本概念和原理,培养和建立以生物分 子的空间结构为基础来解释和理解生命现 象、揭示生命规律的观念和思维方法，并 对结构生物学领域的最新进展有所了解。
structio biology-Stretching single molecules into novel conformations using the atomic force microscope
structio biology-structural view of mitochondriamediated apoptosis
第二章 核酸的结构原理（6学时）
第一节 核酸的基本结构单位 第二节 DNA的结构 第三节 RNA的结构 第四节 染色体的结构 第五节 基因组
第三章 基因组测序计划和结构基因组学 (3学时)
第一节 人类基因组计划 第二节 后基因组时期新的研究领域 第三节 结构基因组计划
第四章 蛋白质结构原理（4学时）
课程安排
1、时间：每周三上午1～2节（8:00-9:40） 教室：第二主教学楼-102教室 学时：每周2学时（总计182=36学时）
2、学分：2学分 3、成绩考核方式：
成绩评定按平时20%+期中30%+期末50%的综合评价方式。 1次文献述评报告(PPT)（分次在课堂讨论），占总成绩20％; 1次学习研究论文（期末完成），占总成绩20％; 其他：期中20%+期末40%，占总成绩60％。