ChemOffice软件操作及使用
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ChemDraw文件的扩展名为“cdx”,执行【File】/【Save As】菜单命令,即 可保存。
➢ 图形的旋转与缩放 ➢ 检查结构错误和整理结构式 ➢ 根据化合物名称得到结构式 ➢ 根据结构得出化合物命名 ➢预测核磁共振化学位移 ➢分子结构估计性质 ➢元素周期表 ➢ 符号、字体和颜色 ➢ 快捷菜单和快捷键 ➢绘制化学反应式 ➢绘制实验装置
执行【Structure】/Check Structure】功能自动执行
执行【Structure】/【Convert Name to Structure】菜单命令 如aspirin、EDTA、morphine、2acetoxybenzoic acid等
2.2.2 结构绘制功能
1. 简单的无机反应式和有机分子式 ChemDraw中可以一次性输入反应式文本,在应用“Formula” 进行优化,其Formula格式化的智能程度较其他软件有所增 强。 2. Fischer(费舍尔)投影式 3. Haworth(霍沃思)投影式 4. Newman(纽曼)投影式 5. 立体化学
ChemDraw可在Win9X/Win2000/WinXP下运行。双击 ,程序打开后,窗口主界面与一般Windows软件相似,依
次为菜单栏、工具栏和文档区以及状态栏,工具栏提供 了很多常用的化学分子及化学键。 ❖ 使用时只用鼠标点一下工具栏中所需工具,移动鼠标到 编辑区后,鼠标指针变为“+”,再在文档区的合适位置点击 鼠标,则分子结构式就会出现,使用十分方便 ❖ 支持Windows剪贴板,所有结构式可以方便地剪贴到 Word文档中,而当要修改时,只需在Word文档中双击结 构式,即可打开ChemDraw进行修改。
1. Fischer(费舍尔)投影式
下图为葡萄糖分子的Fischer投影式
单键工具 文本工具
➢首先使用单键绘制工具建立主碳链接,重点是要确保下一个单键 紧接在上一个单键的下面(鼠标会提示)。完成后仍然使用单键绘 制工具建立其他C—H和C—OH键,也要保证每个键之间的链接点, 最后使用文本输入工具输入文字,View菜单的Analysis Window功
O
H 2N
CH C
OH
CH2
N NH
H OH
HO H
HO
H OH
H OH
OH
HO H
HO H
HO
H
OH OH
H
OH
模板
垂直工具栏上的【模板】按钮包含了常用的和重要的模板如多种较 复杂的分子种类和玻璃仪器模板
箭头、轨道、绘图元素、括弧、化学符号、询问工具 模板
氨基酸模板 芳香族、双环、生物艺术模板 玻璃仪器模板 构象异构体模板 环戊二烯、环烷模板 DNA、RNA模板
wk.baidu.com
官能团模板 己糖模板 苯环模板
多面体模板
立构中心模板
超分子模板
绘图实例
➢ 绘制阿司匹林结构式
O
O O
利用模板按左图绘制出简式;
单击选取框按钮,选中画好的阿司匹林结构式;
执行【Structure】/【Clean Up Structure】菜单命 令,整理图形到最佳状态。
OH
asp irin
➢ 图形存盘
能可以提供一些当前结构的简单信息
这根直线其实是五个单键连起来的
2. Haworth(霍沃思)投影式 下图为α-D-葡萄糖的Haworth投影式
➢首先建立一个六元环(环己烷),选中六元环并旋转90度(用鼠标或Object菜单的Rotate命令),用 文本输入工具把六元环中的一个碳原子变为氧原子,然后使用单键工具栏建立其他化学键。
2.1 简介
美国剑桥(CambridgeSoft)公司()其最新版本ChemOffice Ultra 2010是目前世界上最优秀、最重要和最权 威的桌面化学办公应用软件,集强大的应用功能于一身,为化学工作者提供了优秀的化学辅助系统。
➢它既可以轻松的绘出分子结构图和化学反应方程式、实验室仪器装置和化学工艺流程图等,并应用到字 处理软件中; ➢而且可以将化合物名称直接转为结构图,省却绘图的麻烦; ➢也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合 物名称。
ChemOffice软件操作及使用
第1篇 分子模拟设计及计算
化学编辑排版和分子模拟设计与计算
四川天一学院 --张 毅 副教授
第1篇 分子模拟设计及计算
四川天一学院 张 毅 副教授
化学办公软件
第二部分 ChemOffice 软件的使用 2. 1 简 介 2. 2 ChemDraw的使用 2. 3 Chem3D的使用 2. 4 ChemFinder的使用
ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组件
主
主工具栏
格式栏
菜单栏
界
结构工具栏
面
模板工具栏
状态栏
绘图区
套索 实键 双键 虚键 切割键 切割楔键 黑体键 黑体楔键 空心楔键 波浪键 表格 长链 环丙烷环 环戊烷环 环庚烷环 环己烷椅式 环戊二烯环
蓬罩 橡皮 文本 笔 箭头 轨道 绘图元素 基元 化学符号 弧形 原子反应 模板 环丁烷环 环己烷环 环辛烷环 环己烷椅式 苯环
2.2 ChemDraw的使用
2.2.1 概述 2.2.2 化学结构绘图 2.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 2.2.4 ChemProp-分子物理化学性质计算和标准命名 2.2.5 原子轨道和分子轨道图的制作
2.2.1 概述
ChemDraw奉行的理念是:化学家能 懂的,ChemDraw也应该能懂
包含三大模块
1. ChemDraw模块——化学结构绘图 是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件,是国际上论文期刊指定的格式。 2. Chem3D模块——分子构型与仿真分析 具有完整的界面及功能,提供工作站级的3D分子轮廓图及分子轨道特性分析,并和数种量子化学
软件结合在一起。 3. ChemFinder模块——化学信息搜寻整合系统 智能型的快速化学搜索引擎。可以建立化学数据库、储存及搜索,也可以使用现成的化学数据库。
分子式和结构式是化学家的语言 目录
主要内容
第一部分:化学结构绘制软件ChemWin 1. ChemWin简介 2.键、环、箭头箭头工具 3.编辑工具、原子标记、轨道、组合工具、菜单命令等 第二部分:集成化学软件桌面系统ChemOffice 1. Chem Draw 2.Chem 3D 3.ChemFinder 第三部分:数学公式及长篇文章排版 1.Mathtype 2.长篇文章排版
➢ 图形的旋转与缩放 ➢ 检查结构错误和整理结构式 ➢ 根据化合物名称得到结构式 ➢ 根据结构得出化合物命名 ➢预测核磁共振化学位移 ➢分子结构估计性质 ➢元素周期表 ➢ 符号、字体和颜色 ➢ 快捷菜单和快捷键 ➢绘制化学反应式 ➢绘制实验装置
执行【Structure】/Check Structure】功能自动执行
执行【Structure】/【Convert Name to Structure】菜单命令 如aspirin、EDTA、morphine、2acetoxybenzoic acid等
2.2.2 结构绘制功能
1. 简单的无机反应式和有机分子式 ChemDraw中可以一次性输入反应式文本,在应用“Formula” 进行优化,其Formula格式化的智能程度较其他软件有所增 强。 2. Fischer(费舍尔)投影式 3. Haworth(霍沃思)投影式 4. Newman(纽曼)投影式 5. 立体化学
ChemDraw可在Win9X/Win2000/WinXP下运行。双击 ,程序打开后,窗口主界面与一般Windows软件相似,依
次为菜单栏、工具栏和文档区以及状态栏,工具栏提供 了很多常用的化学分子及化学键。 ❖ 使用时只用鼠标点一下工具栏中所需工具,移动鼠标到 编辑区后,鼠标指针变为“+”,再在文档区的合适位置点击 鼠标,则分子结构式就会出现,使用十分方便 ❖ 支持Windows剪贴板,所有结构式可以方便地剪贴到 Word文档中,而当要修改时,只需在Word文档中双击结 构式,即可打开ChemDraw进行修改。
1. Fischer(费舍尔)投影式
下图为葡萄糖分子的Fischer投影式
单键工具 文本工具
➢首先使用单键绘制工具建立主碳链接,重点是要确保下一个单键 紧接在上一个单键的下面(鼠标会提示)。完成后仍然使用单键绘 制工具建立其他C—H和C—OH键,也要保证每个键之间的链接点, 最后使用文本输入工具输入文字,View菜单的Analysis Window功
O
H 2N
CH C
OH
CH2
N NH
H OH
HO H
HO
H OH
H OH
OH
HO H
HO H
HO
H
OH OH
H
OH
模板
垂直工具栏上的【模板】按钮包含了常用的和重要的模板如多种较 复杂的分子种类和玻璃仪器模板
箭头、轨道、绘图元素、括弧、化学符号、询问工具 模板
氨基酸模板 芳香族、双环、生物艺术模板 玻璃仪器模板 构象异构体模板 环戊二烯、环烷模板 DNA、RNA模板
wk.baidu.com
官能团模板 己糖模板 苯环模板
多面体模板
立构中心模板
超分子模板
绘图实例
➢ 绘制阿司匹林结构式
O
O O
利用模板按左图绘制出简式;
单击选取框按钮,选中画好的阿司匹林结构式;
执行【Structure】/【Clean Up Structure】菜单命 令,整理图形到最佳状态。
OH
asp irin
➢ 图形存盘
能可以提供一些当前结构的简单信息
这根直线其实是五个单键连起来的
2. Haworth(霍沃思)投影式 下图为α-D-葡萄糖的Haworth投影式
➢首先建立一个六元环(环己烷),选中六元环并旋转90度(用鼠标或Object菜单的Rotate命令),用 文本输入工具把六元环中的一个碳原子变为氧原子,然后使用单键工具栏建立其他化学键。
2.1 简介
美国剑桥(CambridgeSoft)公司()其最新版本ChemOffice Ultra 2010是目前世界上最优秀、最重要和最权 威的桌面化学办公应用软件,集强大的应用功能于一身,为化学工作者提供了优秀的化学辅助系统。
➢它既可以轻松的绘出分子结构图和化学反应方程式、实验室仪器装置和化学工艺流程图等,并应用到字 处理软件中; ➢而且可以将化合物名称直接转为结构图,省却绘图的麻烦; ➢也可以对已知结构的化合物命名,给出正确的化合 物名称。
ChemOffice软件操作及使用
第1篇 分子模拟设计及计算
化学编辑排版和分子模拟设计与计算
四川天一学院 --张 毅 副教授
第1篇 分子模拟设计及计算
四川天一学院 张 毅 副教授
化学办公软件
第二部分 ChemOffice 软件的使用 2. 1 简 介 2. 2 ChemDraw的使用 2. 3 Chem3D的使用 2. 4 ChemFinder的使用
ChemDraw是ChemOffice中使用最为频繁的组件
主
主工具栏
格式栏
菜单栏
界
结构工具栏
面
模板工具栏
状态栏
绘图区
套索 实键 双键 虚键 切割键 切割楔键 黑体键 黑体楔键 空心楔键 波浪键 表格 长链 环丙烷环 环戊烷环 环庚烷环 环己烷椅式 环戊二烯环
蓬罩 橡皮 文本 笔 箭头 轨道 绘图元素 基元 化学符号 弧形 原子反应 模板 环丁烷环 环己烷环 环辛烷环 环己烷椅式 苯环
2.2 ChemDraw的使用
2.2.1 概述 2.2.2 化学结构绘图 2.2.3 ChemNMR-核磁谱的计算 2.2.4 ChemProp-分子物理化学性质计算和标准命名 2.2.5 原子轨道和分子轨道图的制作
2.2.1 概述
ChemDraw奉行的理念是:化学家能 懂的,ChemDraw也应该能懂
包含三大模块
1. ChemDraw模块——化学结构绘图 是世界上最受欢迎的化学结构绘图软件,是国际上论文期刊指定的格式。 2. Chem3D模块——分子构型与仿真分析 具有完整的界面及功能,提供工作站级的3D分子轮廓图及分子轨道特性分析,并和数种量子化学
软件结合在一起。 3. ChemFinder模块——化学信息搜寻整合系统 智能型的快速化学搜索引擎。可以建立化学数据库、储存及搜索,也可以使用现成的化学数据库。
分子式和结构式是化学家的语言 目录
主要内容
第一部分:化学结构绘制软件ChemWin 1. ChemWin简介 2.键、环、箭头箭头工具 3.编辑工具、原子标记、轨道、组合工具、菜单命令等 第二部分:集成化学软件桌面系统ChemOffice 1. Chem Draw 2.Chem 3D 3.ChemFinder 第三部分:数学公式及长篇文章排版 1.Mathtype 2.长篇文章排版