AutoDockVina与MGLTools的安装

AutoDock Vina (简称Vina)是一款免费开源的分子对接软件，由美国斯克利普斯研究所(The Scripps Research Institute )Oleg Trott 博士开发。Vina 在AutoDock 4 的基础上做了极大的改进，主要是算法上的改进，促使它在结合模式预测的平均准确率和计算速度方面都远超

A u t o D o c k 4 。更多介绍请访问：

Vina 有Windows 、Linux、MacOSX 等不同系统版本以及源代码。可从这里免费：

Vina 只负责对接计算，它并不提供蛋白大分子和配体小分子的准备功能。该部分功能则由MGLTools 来完成。因此，通常也需要安装MGLTools 下面简单讲解Vina 和MGLTools 的安装。

Windows 系统中安装Vina

1、双击点击二进制文件autodock_vina_1_1_2_win32.msi ，按提示点击安装即可。

2、由于Vina 没有用户图形界面 ( GUI ) ，因此，不会在开始菜单栏出现。默认安装在

C:\Program Files\The Scripps Research Institute\Vina ，或者C:\Program Files (x86)\The Scripps Research Institute\Vina 下面。

3、为Vina 设置环境变量，方便以后使用。请参考博文：《如何设置环境变量》

Linux 系统中安装Vina

1、敲以下命令，解压文件autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz ：

tar xzf autodock_vina_1_1_2_linux_x86.tgz

2、解压后在bin 文件夹中找到vina 和vina_split ，前者即为对接程序Vina。

3、敲以下命令，赋予vina 和vina_split 执行权限：

chmod +x vina

chmod +x vina_split 或者一行命令：chmod +x vina*

4、设置环境变量，请参考博文：《如何设置环境变量》Windows 系统中安装MGLTools

双击点击二进制文件

Linux 系统中安装MGLTools

1、据实际情况，选择32 位或者64 位的MGLTools

2、敲以下命令，进入该目录：

cd /home/software

3、敲以下

chmod

4、敲以下命令，执行安装：

5、会弹出与Windows 下一样的安装界面，按提示点击安装即可。