生物信息学课程论文
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湖南农业大学课程论文
学院：生物科学技术学院班级：xx班
姓名：xx 学号：xx
课程论文题目：巨大芽孢杆菌AP25内切葡聚糖酶基因序列信息分析课程名称：生物信息学
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巨大芽孢杆菌AP25内切葡聚糖酶基因序列信息分析
生物科学技术学院xx班 xx 学号：xx
从土壤中分离到产纤维素酶的巨大芽孢杆菌AP25，经羧甲基纤维素平板检测，巨大芽孢杆菌AP25可产生葡聚糖内切酶。葡聚糖酶是将葡聚糖降解为葡萄糖的一类水解酶。葡聚糖酶可以作为探针来分析酵母细胞壁的结构及为酵母原生质作准备。葡聚糖酶和几丁质酶同时作用于真菌细胞壁，可以完全消解病原菌细胞壁，抑制病原菌生长，达到防菌目的，在真菌害病的生物防治中具有重要的商业价值。下面对巨大芽孢杆菌AP25内切葡聚糖酶基因序列进行分析。
一．先从GenBank中查找到巨大芽孢杆菌AP25内切葡聚糖酶基因的序列
结果如下：
ORIGIN
1 ATGAAACGGT CAATCTCTAT TTTTATTACG TGTTTATTGA TTACGGTATT GACAATGGGC
61 GGCTTGCAGG CTTCGCCGGC ATCTGCATCA GGGACAAAAA CGCCAGCAGC CAAGAATGGA
121 CAGCTTAGCA TAAAAGGAAC ACAGCTCGTA AACCGGGACG GCAAAGCGGT ACAATTGAAA
181 GGGATCAGTT CACATGGAGT GCGGTGGTAT GGCGATTTTG TCAATAAAGA CAGCTTAAAA
241 TGGCTGAGAG ACGATTGGGG CATAACCGTT TTCCGCGCGG CGATGTATAC CGCAGATGGC
301 GGTTATATTG ACAACCCTTC CGTGAAAAAT AAAGTAAAAG AAGCGGTTGA AGCGGCAAAA
361 GAACTTGGGA TATATGTCAT CATTGACTGG CATATCTTAA ATGACGGCTA CCCAAACCAA
421 CATAAAGAGA AGGCAAAAGA ATTTTTTAAG GAAATGTCAA GTCTTTGCGG AAACACGCCA
481 AACGTCATTT ATGAAATTGC AAACGAACCA AACGGTGATG TGAACTGGAA GCGGGATATT
541 AAACCGTATG CGGAAGAAGT GATTTCCGTT ATCCGCAAAA ATGATCCAGA CAACATCATC
601 ATTGTCGGAA CCGGTACATG GAGCCAAGAT GTGAATGATG CAGCCGATGA TCAGCTAAAA
661 GATGCAAACG TCATGTACGC GCTTCATTTT TATGCCGGCA CACACGGCCA ATCTTTACGG
721 GATAAAGCAA ACTATGCACT CAGTAAAGGA GCGCCTATTT TCGTGACGGA ATGGGGAACA
781 AGCGACGCGT CTGGAAATGG CGGTGTATTC CTTGACCAGT CGCGGGAATG GCTGAATTAT
841 CTCGACAGCA AGAACATCAG CTGGGTGAAC TGGAATCTTT CTGATAAGCA GGAAACATCC
901 TCAGCGTTAA AGCCGGGAGC ATCTAAAACA GGCGGCTGGC CGCTTACAGA TTTAACTGCT
961 TCAGGAACAT TCGTAAGAGA AAACATTCTC GGCAACAAAG ATTCAACGAA AGAACGCCCT
1021 GAAACGCCAG CACAAGATAA CCCCGCACAG GAAAACGGCA TTTCTGTACA ATACAAAGCA
1081 GGGGATGGGG GTGTGAACAG CAACCAAATC CGCCCGCAGC TTCACATAAA AAATAACGGC
1141 AATGCGACGG TTGATTTAAA AGATGTCACT GCCCGTTACT GGTATAACGC GAAAAACAAG
1201 GGCCAAAACT TTGACTGTGA CTACGCGCAG ATTGGATGCG GCAATCTGAC CCACAAATTT
1261 GTGACGCTGC ATAAACCTAA GCAAGGTGCA GATACCTATC TGGAACTGGG TTTTAAAACA
1321 GGAACGCTGT CACCGGGAGC AAGCACAGGG AATATTCAGC TTCGTCTTCA CAATGATGAC
1381 TGGAGTAATT ATGCACAAAG CGACGATTAT TCCTTTTTCC AATCAAATAC GTTTAAAACA
1441 ACGAAAAAAA TCACATTATA TCATCAAGGA AAACTGATTT GGGGAACAGA ACCAAATTAG
二．然后利用DNAstar软件分析此序列的组分和翻译此序列
（一）DNA序列的基本信息统计结果：
Total number of bases is 1500
% A = 33.40 [501]
% G = 23.93 [359]
% T = 21.80 [327]
% C = 20.87 [313]
% Ambiguous = 0.00 [0]
% A+T = 55.20 [828]
% C+G = 44.80 [672]
BASE COUNT 501 A 313 C 359 G 327 T
Davis,Botstein,Roth Melting Temp C. 82.93
Wallace Temp C 4970.00
（二）翻译DNA序列结果：MKRSISIFITCLLITVLTMGGLQASPASASGTKTPAAKNGQLSIKGTQLVNRDGKAVQLKGI SSHGVRWYGDFVNKDSLK WLRDDWGITVFRAAMYTADGGYIDNPSVKNKVKEAVEAAKELGIYVIIDWHILNDGYPN QHKEKAKEFFKEMSSLCGNTP
NVIYEIANEPNGDVNWKRDIKPY AEEVISVIRKNDPDNIIIVGTGTWSQDVNDAADDQLKD ANVMY ALHFYAGTHGQSLR DKANYALSKGAPIFVTEWGTSDASGNGGVFLDQSREWLNYLDSKNISWVNWNLSDKQE TSSALKPGASKTGGWPLTDLTA SGTFVRENILGNKDSTKERPETPAQDNPAQENGISVQYKAGDGGVNSNQIRPQLHIKNNG NA TVDLKDVTARYWYNAKNK GQNFDCDYAQIGCGNLTHKFVTLHKPKQGADTYLELGFKTGTLSPGASTGNIQLRLHNDD WSNY AQSDDYSFFQSNTFKT
TKKITL YHQGKLIWGTEPN.
Translate DNA Sequence Untitled Seq #1(1,1500)
With Standard Genetic Code
Molecular Weight 55156.55 Daltons