任毅发表论文目录 - 陕西师范大学生命科学学院 School Of …

合集下载

_1_抗胰蛋白酶的研究进展

_1_抗胰蛋白酶的研究进展
- AT产生缓慢的酶解 ,α1 - AT构象由 S型向 R 型转换 ,封 闭了蛋 白 酶 的 反 应 中 心 从 而 达 到 抑 制 蛋 白 酶 活 性 的 作
用 [2, 4 ] 。
1 α1 - 抗胰蛋白酶的理化性质及作用机制
2 α1 - 抗胰蛋白酶的遗传特征和基因多态 性
α1 - AT为单链糖蛋白 ,肽链由 394个氨基酸残基组成 , 肽链 中 含 有 43 个 A sn /A sp 残 基 , 但 仅 在 A sn46、A sn83、 A sn247上连接有寡糖链 ,其中一个糖链为三叉寡糖链 ,另外 2个为双叉寡糖链 ,糖含量为 12% ~14%。α1 - AT的分子 量为 45~56KDa,等电点为 p I4. 7~5. 0,正常人血浆中 α1 AT的含量为 (2. 90 ±0. 45) g /L ,在体内的半衰期为 3 ~5 d, 然而 α1 - AT的含量随蛋白酶抑制剂表型不同而不同 。α1
第 5期 α1 - 抗胰蛋白酶的研究进展
15
或多或少 的 都 将 表 现 出 遗 传 性 血 浆 α1 - AT 水 平 低 下 。 PiZZ个体中血浆的 α1 - AT水平仅为 PiMM 的 15% , PiSS为 60% , PiZS为 35% ,其中 PiZ变体是 α1 - AT缺乏最常见的 原因 。与正常 PiMM 型相比 ,肝细胞 PiZZ型 α1 - AT的侧糖 链缺乏半乳糖和唾液酸 ,而甘露糖明显高于 PiMM 型 。有缺 陷的糖基化影响了 PiZZ型 α1 - AT由粗糙内质网向光滑内 质网的迁移 ,最终导致 PiZZ型 α1 - AT形成聚合体在肝细 胞内质网上的沉积 ,同时变异导致了 α1 - AT合成过程中的 糖基化异常 ,使 α1 - AT的 分 泌 减 少 、在血 浆 中 的 含 量 降 低 。 [ 1, 5 ]

PARP-1基因多态性与临夏回族自治州回族人群胃癌易感性的关联研究

PARP-1基因多态性与临夏回族自治州回族人群胃癌易感性的关联研究

ti c n e OR: . 2 9 % C : . 1 r a cr( c 4 1 5,5 I 2 1 7—8 0 8, =0. 0 .3 P 0 0); lAl Va/ a+ Al Al e oy e areswi aigpc l e ea lsh d a/ a g n tp scrir t et ikev g tbe a h n 3 8 4 fl n ra e ikfrd vlpn at cc n e o ae t l Va g n tp sc rir wi o —e t gpc l v g tbe ( . 1 od icesd r o eeo igg s i a c rc mp rdwi Va/ l e oy e ar s t n t ai ike eea ls OR: s r h e h n 3 8 4,5 C : 1 0—6. 6 P=0 0 0) . 1 9 % I2.5 7 6, . 0 .Va/ a+ Al/ ag n tp scrir wi oi v p lr ifcin h d4. 8 odi— lAl a Al e oy e ares t p st eH. yoi ne t a 0 5 fl n h i o ce sd r kfrd v lpn ati c n e o ae t lVa e oy e ar r t eaieH. yoiifcin( R:. 8 9 % C : rae i e eo igg sr a c rc mp rdwi Va/ l n tp sc ri swi n g t p lr ne t s o c h g e h v o O 4 0 5,5 I
交互效应 。
关 键 词 胃癌 聚 腺 苷 二 磷 酸核 糖 聚 合 酶 一1 基 因多 态 性
Co r l to t e h c e td l mo p im so r e a i n Be we n t e Nu lo i e Po y r h s fPARP 一1 a d t u c p i ii fGa t i nc r i n he S s e tb lt o sr c Ca e n Hu hn c Gr u fLi i i y iEt i o p o nx a Hu

硕士研究生课程体系改革与专业核心

硕士研究生课程体系改革与专业核心

[收稿时间]2021-03-02[基金项目]陕西师范大学研究生教育教学改革研究项目(GERP-18-10)。

[作者简介]朱志红(1963—),男,陕西人,博士,教授,研究方向:群落生态学。

University Education[摘要]该研究基于硕士研究生课程体系构建的基本指导思想和原则,构建了符合陕西师范大学生态学专业硕士研究生培养目标和学科发展需要的新课程体系,并通过更新教学内容、加强教材建设、采用团队授课与互动式研究性教学模式等综合建设措施,显著提高了生态学专业核心课程教学质量,用实践证明了实施课程满意度的动态监测是客观评价课程教学质量与课程建设成效的有效办法。

[关键词]生态学专业;课程体系;专业核心课程;课程满意度[中图分类号]G643.2[文献标识码]A [文章编号]2095-3437(2022)10-0171-032018年6月,国务院学位委员会生态学科评议组发布了新的二级学科名单,建立了新的学科体系。

该体系突破了传统的学科框架,是顺应学科发展和中国实际发展需要的产物。

随着我国经济社会的快速发展,生态环境保护已成为我国高质量和转型发展的刚性要求。

在此背景下构建新的研究生课程体系,培养适应社会发展需要的专业人才,不断提高研究生培养质量,是当前生态学高等教育面临的紧迫任务。

本文回顾了陕西师范大学(简称“我校”)在生态学专业硕士研究生课程体系改革和专业核心课程建设中的工作并总结其经验,为进一步探索提高生态学专业硕士研究生培养质量提供参考。

一、课程体系改革(一)存在的相关问题陕西师范大学生态学学科于2000年获得二级学科硕士学位授予权后,按照生物学一级学科下的二级学科来设置课程,构建了首个生态学专业硕士研究生课程体系[1-2]。

经过实践,我们发现该课程体系存在诸多问题,主要体现在以下4个方面。

其一,毕业要求的最低总学分过高,要求达到35~36学分,学生课业负担过重。

其二,专业课(专业必修课与研究方向选修课)的学分占比高达68.6%~75%,课程结构不完整、不平衡以及课程类别单一的问题比较突出。

应用型高校生物科学专业师范生“专创融合”培养模式的研究与实践

应用型高校生物科学专业师范生“专创融合”培养模式的研究与实践

第8期2024年4月江苏科技信息JiangsuScienceandTechnologyInformationNo 8Aprilꎬ2024基金项目:陕西省教改项目ꎻ项目名称:新师范背景下生物科学专业师范生教育实践能力培养与评价研究ꎻ项目编号:23BY168ꎮ陕西学前师范学院教改项目ꎻ项目名称:新师范背景下生物科学专业师范生双创教育与专业教育 11533 融合模式的研究与实践ꎻ项目编号:22JG008Zꎮ陕西学前师范学院教改项目ꎻ项目名称:省级生物科学一流专业建设点培育实践探索研究ꎻ项目编号:21JG04ZBꎮ作者简介:韩立敏(1981 )ꎬ女ꎬ副教授ꎬ博士ꎻ研究方向:植物生物技术ꎮ应用型高校生物科学专业师范生 专创融合培养模式的研究与实践韩立敏ꎬ王立志ꎬ化文平(陕西学前师范学院ꎬ陕西西安710100)摘要:高校创新创业教育是推进高等教育综合改革的重要举措ꎬ是高校助推国家创新驱动发展战略的重要抓手ꎬ也是新时代教育强国战略的题中之义ꎮ文章构建了生物科学专业师范生 11533 专创融合培养模式ꎬ进行了实践ꎬ取得了一定成效ꎬ为应用型本科高校师范生的 双创能力 提升培养提供了借鉴ꎬ该人才培养模式的推广可助力教师教育高质量发展ꎬ为基础教育输送卓越师资力量ꎮ关键词:生物科学ꎻ师范生ꎻ创新创业教育ꎻ专业教育ꎻ人才培养模式中图分类号:G65㊀㊀文献标志码:A0㊀引言㊀㊀科技是第一生产力ꎬ人才是第一资源ꎬ创新是第一动力ꎮ高等院校担负着培养新时代富有创新精神㊁创业意识与能力的创新创业人才的使命ꎬ创新创业人才培养是高校提升人才培养质量ꎬ驱动国家创新战略的重要组成部分ꎮ2010年ꎬ«教育部关于大力推进高等学校创新创业教育和大学生自主创业工作的意见»指出ꎬ在高等学校开展创新创业教育ꎬ积极鼓励高校学生自主创业ꎮ2015年ꎬ国务院颁布了«关于深化高等学校创新创业教育改革的实施意见»ꎬ进一步指出深化高等学校创新创业教育改革ꎬ是国家实施创新驱动发展战略㊁促进经济提质增效升级的迫切需要ꎬ是推进高等教育综合改革㊁促进高校毕业生更高质量创业就业的重要举措ꎮ2021年ꎬ«关于进一步支持大学生创新创业的指导意见»进一步要求ꎬ高校要聚焦创新创业教育改革关键环节和领域ꎬ推动高校将创新创业教育贯穿人才培养全过程ꎬ建立以创新创业为导向的新型人才培养模式ꎬ切实提升大学生的创新精神㊁创业意识和创新创业能力ꎮ为全面贯彻党的教育方针政策ꎬ国内多所高校相继开展了创新创业教育的改革ꎬ以提升创新创业人才培养的质量ꎮ如长安大学的 五链 协同人才培养模式㊁中国石油大学(华东) 四位一体 推进创新创业人才培养ꎬ北京工业大学构建的教学㊁研究㊁辅导㊁实训和孵化 五位一体 的创新创业生态培养模式ꎮ创新创业教育的核心内涵是培养大学生的创新精神㊁创新意识和创业能力ꎬ引导高等学校教师不断更新教育观念ꎬ改革人才培养模式㊁教育内容和教学方式ꎬ将人才培养㊁科学研究㊁社会服务紧密结合ꎬ实现从注重知识传授向更加重视创新意识和创新能力㊁专业素质培养的转变ꎬ提高人才培养质量ꎮ各高校聚焦立德树人根本任务ꎬ坚持把创新创业教育作为提高人才培养质量㊁提升学生就业能力㊁更好服务经济社会发展的重要途径ꎬ全面提升学生创新精神和创业能力ꎮ应用型本科院校更是把与学生职业素养和就业竞争力相关的创新创业教育作为提高人才培养质量的重要途径ꎮ高校创新创业教育的开展并非独立㊁自成体系的ꎬ唯有以专业教育为依托ꎬ以课程建设为基点ꎬ将学生创新精神㊁创业意识和创新创业能力的培养真正有机融入专业教育发展中ꎬ同时贯穿于人才培养的全过程ꎬ才能彰显本质与魅力[1]ꎮ进一步推进创新创业教育与专业教育的深度有机结合ꎬ建立创新创业教育与专业实践深度融合的教学模式具有重要意义[2-3]ꎮ本研究对应用型本科高校生物科学师范生的 专创融合 模式进行了探索与实践ꎮ1㊀生物科学专业人才培养目标㊀㊀地方高校生物科学(师范)专业人才培养目标的确定ꎬ需要符合中学教育专业师范生教师职业能力标准和师范类专业认证及学校的办学定位要求ꎬ体现先进的教学理念ꎬ突出专业特色ꎮ陕西学前师范学院(以下简称 该校 )生物科学专业以OBE(OutcomeBasedEducation)理念指导ꎬ全面贯彻党的教育方针ꎬ根据新时代教师教育高质量发展要求和中学生物教育课程改革理念ꎬ立足陕西ꎬ面向西部ꎬ服务区域基础教育发展ꎬ旨在培养德智体美劳全面发展ꎬ掌握生物科学基本知识㊁生物学实验技能㊁中学教育教学理论与方法ꎬ具备高尚师德㊁爱国情怀㊁奉献精神㊁创新精神ꎬ具有生物教育教学及研究能力的中学生物教师ꎮ2㊀生物科学专业师范生创新创业教育中存在的问题㊀㊀该校生物科学专业学生近年来在大学生创新创业训练㊁创新创业竞赛等方面取得了一定成绩ꎬ学生的创新创业意识有所提高ꎬ但是其创新创业思维不够活跃㊁创新创业能力相对不足ꎮ生物科学专业建设过程中存在创新创业教育与专业教育的融合度有待提高㊁ 专创融合 特色课程的研发与建设工作缺乏㊁创新创业教育共同体建设与协同机制不够完善等问题ꎮ如何将创新创业教育有机融入专业教育ꎬ激发㊁培养㊁提高学生的创新创业动力㊁精神㊁思维与能力ꎬ怎样使学生的创新创业活动更具有鲜明的特色ꎬ更具有生命力和发展持久性ꎬ成为创新创业教育亟须解决的问题ꎮ3㊀生物科学专业师范生专创融合培养模式的研究与实践㊀㊀聚焦立德树人根本任务ꎬ探求创新创业教育与专业教育的融合路径ꎬ构建创新创业教育与专业教育深度融合的培养模式ꎬ促进教育教学改革的深化ꎬ提升生物科学专业师范生的创新精神㊁创业意识与能力ꎬ提升人才培养质量ꎬ适应新时代对未来教师的需求ꎬ同时促进创业型就业ꎮ3 1㊀将创新创业教育与课程教学深度有机融合 课创融合㊀㊀课程是人才培养的核心要素ꎮ开展基于创新创业能力与素养培养的课程教学改革ꎬ将创新创业教育与专业理论课㊁实践课的教学结合ꎬ建设 专创融合 特色课程ꎮ在专业理论课中ꎬ通过探索项目式教学㊁案例教学㊁翻转课堂+混合式教学ꎬ将学科前沿㊁行业焦点热点问题融入教学等驱动学生创新创业思维与能力的培养[4-7]ꎮ在实验实训教学中注重设计性㊁综合性㊁创新性实验的自主研发与大型综合性㊁设计性实验的引入ꎬ引导学生关注学科实验服务行业[8]ꎮ在野外实习㊁课程见习㊁教育实习㊁毕业设计等教学中着力提升学生的实践创新创业能力ꎮ经过3年建设ꎬ现已形成 专创融合 特色课程两门ꎬ分别是 植物组织培养 中学生物学教学论 ꎬ基于 植物组织培养 专创融合课程孵育了多项 互联网+ 大赛参赛项目㊁大创项目及调研报告ꎬ如 番茄小镇 ㊁ 机机菜 云菜园㊁ 植无忧 科技等(见表1)ꎻ基于 中学生物教学论 专创融合课程形成了多份富有创意的优质微课作品ꎬ如«拥抱蓝天的你 鸟»㊁«基因的自由组合定律»㊁«遗传物质的探索之路»㊁«生命的基石 蛋白质»㊁ 匠心师创教育科技有限公司 创业企划书等(见表1)ꎮ通过专创教育的深度融合ꎬ在提高学生创新创业能力素养的同时使学生深刻体会所学学科的魅力ꎬ提升其利用专业特长服务社会的责任感和使命感ꎮ表1㊀专创融合特色课程孵育成果课程名称成果类型成果名称植物组织培养互联网+ 大赛项目大学生创新创业训练项目调研报告培培乐 科普App 植物足迹 科普App番茄小镇植无忧 科技 机机菜 云菜园黄芩毛状根体系建立与优化研究茉莉酸甲酯对黄芩有效成分合成与积累的影响研究外源褪黑素对干旱胁迫下丹参幼苗生理特性的影响研究黄姜内生菌的分离与鉴定研究黄姜内生菌产皂苷的分子机制研究«陕西植物组织培养服务市场现状及未来发展趋势»中学生物教学论微课作品企划书«拥抱蓝天的你 鸟»«基因的自由组合定律»«遗传物质的探索之路»«生命的基石 蛋白质»«细胞通过分裂产生新细胞»«输送血液的泵 心脏»«先天性行为和学习行为»«发生在肺内的气体交换»«生态系统及其组成成分»匠心师创教育科技有限公司言研焱教育咨询3 2㊀将创新创业教育与科研活动深度有机融合 科创融合㊀㊀科研在学生创新创业能力的培养方面具有重要作用ꎬ通过创新创业教育与科研活动的深度结合ꎬ实现以科研育人促双创育人[9]ꎮ以本科生导师制为依托ꎬ通过引导学生参与导师科研课题㊁积极申报大学生创新训练项目㊁主动自由探索课题等培养学生科学研究的思维㊁能力与素养[10]ꎮ搭建专家学术讲座㊁青年教师学术沙龙㊁学生科技角等科研交流平台ꎬ以 师心师梦 微信公众平台为学生拓宽科技视野ꎬ合力助推学生创新创业能力的培养ꎮ近3年ꎬ生物科学专业学生获大学生创新创业训练项目17项ꎬ其中国家级3项㊁省级9项㊁校级5项ꎮ学生申报项目的积极性提高ꎬ立项覆盖率逐年上升ꎬ成果质量不断提高ꎬ学生参与发表论文20余篇ꎬ其中SCI2篇㊁CSCD13篇ꎮ3 3㊀将创新创业教育与专业赛事深度有机融合 赛创融合㊀㊀以国家级赛事为龙头ꎬ校级竞赛为依托ꎬ将学生创新能力的培养与全国大学生生命科学竞赛㊁全国 互联网+ 创新创业大赛㊁全国 挑战杯 科技大赛㊁全国师范生微课大赛㊁ 田家炳杯 全国师范院校师范生教学技能竞赛㊁陕西省高校师范生教育教学能力大赛㊁校级理工类专业实验技能竞赛㊁趣味实验创新设计大赛㊁师范生技能大赛等各类各级专业相关赛事相融合ꎬ以赛促学㊁以赛促教ꎬ促进学生创新精神与能力的形成[11-12]ꎮ作为生物科学专业师范生ꎬ学生对教学类比赛的热情高涨ꎬ参赛积极性高ꎬ重视程度不断提高ꎮ如在全国师范生微课大赛这项赛事中ꎬ学生由最初教师劝导参赛到现在的主动积极参赛ꎬ近3年参赛率不断升高ꎬ由2021年度的10 81%持续提高到2023年度的17 52%ꎮ获奖数量和质量均在提升(见表2)ꎬ在第四届全国师范生微课大赛中学生更是取得特等奖1项㊁二等奖2项的优异成绩ꎮ这反映了在此人才培养模式下学生的创新能力不断提高ꎮ2023年度ꎬ本专业选派的1名学生获得了陕西省高校师范生教育教学能力大赛一等奖ꎬ首次选派的2名学生分别获 田家炳杯 三等奖和优胜奖ꎮ另外ꎬ近3年内本专业学生在全国生命科学大赛中获三等奖2项ꎬ在全国首届大学生职业规划大赛陕西赛区总决赛获铜奖1项ꎮ表2㊀近3年全国师范生微课大赛参赛及获奖情况年度参赛年级学生总人数/人院赛人数/人参赛率/%校赛人数/人校赛获奖情况国赛人数/人国赛获奖情况获奖率/%20212019级74810 814二等奖3项㊁优秀奖1项3一等奖1项㊁三等奖2项10020222019级2020级2021级2302912 616特等奖3项㊁一等奖3项3特等奖1项㊁二等奖2项10020232020级2021级2022级2344117 524待定待定待定待定3 4㊀将创新创业教育与社团活动深度有机融合 社创融合㊀㊀高校学生社团作为校园文化的重要载体ꎬ是学生培养兴趣爱好㊁扩大求知领域㊁陶冶思想情操㊁展示才华智慧的舞台ꎬ是实现 三全育人 ㊁促进学生德智体美劳全面发展的有力抓手[13-14]ꎬ需要精心组织㊁持续建设ꎬ树立品牌意识ꎬ打造品牌专业社团ꎬ组织品牌活动[15-16]ꎬ切实发挥学生社团的育人功能ꎬ促进人才培养质量的提升ꎮ组织创建 匠心青创 学生社团ꎬ为想创㊁敢闯㊁会创的学生提供优质的创新创业训练平台ꎮ通过科创沙龙㊁神禾 创梦杯 竞赛㊁创意森林㊁神禾 Bio就创训练营 ㊁企业参观等丰富多彩的社团活动为学生营造浓厚的创新创业氛围ꎬ提供优质的服务ꎬ提高学生的综合素质和创新创业能力ꎮ生物科学专业学生基于社团活动组建的 后浪朵朵ꎬ共卫生态 实践队㊁ 乡村食育促振兴ꎬ产教融合谱新篇 实践队在大学生暑期社会实践中表现出色ꎬ被评为省级优秀团队ꎮ2个社团的实践活动分别被«人民日报»㊁陕视新闻官微㊁中青网教育频道官微㊁陕西教育厅官微㊁«中国食品报»㊁«华商报»等多家媒体关注报道ꎮ通过 创梦杯 竞赛活动的开展ꎬ培育了多项 互联网+ 创新创业大赛参赛项目ꎮ3 5㊀将创新创业教育与成果转化有机融合 产创融合㊀㊀构建 校-地-企 校-地-校 人才协同培养模式ꎬ坚持协同发展ꎬ精准对接行业需求ꎬ有效推进深度合作ꎬ将学生创新创业能力的培养与产业需求相融合[17]ꎮ贯通 产㊁学㊁研㊁赛㊁创 ꎬ以产业发展前沿为导向ꎬ以企业研发项目为载体ꎬ在项目实践中培养学生的创新创业能力ꎮ与企业共建研发中心或协同创新中心ꎬ建设神禾科创小镇ꎬ完善成果转化机制ꎬ做好学生创新创业项目知识产权保护等工作ꎮ与教育科技类相关企业合作ꎬ共建共享中学生物教学资源库ꎬ将研发的习题库和教学比赛的优质教学设计㊁教案㊁微课视频㊁教具等教学资源进行成果转化ꎮ与中学共建实习基地ꎬ通过校内指导教师㊁校外实践导师共同指导培养的 双导师制 的实施致力于学生师范技能和创新能力的培养ꎮ与陕西天承生物科技股份有限公司㊁西安丹若尔石榴酒业有限责任公司等企业密切合作ꎬ共建陕西药食同源生物资源开发产业学院ꎮ4㊀结语㊀㊀在人才培养过程中ꎬ构建了以立德树人为根本任务ꎬ以学生为中心ꎬ以课程教学㊁科研活动㊁学生赛事㊁社团活动㊁成果转化为依托ꎬ面向全体学生㊁全体教师㊁人才培养全程ꎬ实现理论与实践相结合㊁课内与课外相结合㊁校内与校外相结合的生物科学专业师范生 11533 专创融合培养模式ꎬ即 一个根本任务㊁一个中心㊁五个依托㊁三个面向㊁三个结合 (见图1)ꎮ图1㊀生物科学专业师范生 11533 专创融合培养模式㊀㊀在该人才培养模式实施的过程中ꎬ有力组织㊁精准实施㊁制度管理㊁经费保障非常重要ꎮ专创深度融合培养模式对教师创新创业能力的要求不断提高ꎬ专兼有机结合的双创师资队伍建设是有效提升学生创新创业能力培养效果的重要措施ꎮ本科生大学4年全学业周期创新创业教育方案的宏观设计是保证培养质量的重要前提ꎬ同时ꎬ不同年级的学生专业积累㊁专业视野有差异ꎬ制定针对性强㊁切合学生实际的进阶性培养目标㊁策略和内容ꎬ实施更为科学合理ꎮ评价是人才培养中的重要反馈环节ꎬ有助于了解教育目标的达成情况ꎬ及时㊁有效㊁科学㊁公正的形成性评价与终结性评价相结合的评价方式可有力促进人才培养质量的提升ꎮ经过实践ꎬ取得了一定成效ꎬ促进了人才培养质量的提升ꎬ表现在学生升学和就业2个出口ꎮ近3年ꎬ学生考研率逐年提高ꎬ 985 211 高校考研录取率以每年6%以上的增幅提升(见图2)ꎮ毕业生平均就业率超过90%ꎬ70%以上从事教育及其相关行业ꎬ其综合素质得到用人单位好评ꎬ毕业生在就业岗位的适应度㊁创新意识和能力等方面满意率90%以上ꎮ因此ꎬ该人才培养模式的推广可助力教师教育高质量发展ꎬ为基础教育输送卓越未来教师ꎬ对加强基础教育师资队伍建设ꎬ优化教育资源ꎬ促进基础教育优质均衡发展具有重要意义ꎮ图2㊀生物科学专业学生近3年考研情况统计结果参考文献[1]张杨ꎬ管伟康.高校创新创业教育高质量发展研究[J].创新与创业教育ꎬ2023(6):8-17.[2]纪晓娜ꎬ郭瑞ꎬ田曦ꎬ等.以专创融合促地方应用型大学创新创业教育发展[J].长春工程学院学报ꎬ2023(4):80-85.[3]侯秋飞ꎬ范红红ꎬ张怡ꎬ等.专业认证背景下化工专业教育与创新创业教育融合研究[J].云南化工ꎬ2023(11):169-171.[4]吴青聪ꎬ陈柏ꎬ吴洪涛. 课程+项目+竞赛 三位一体的 专创融合 课程教学改革与实践:以机器人工程学综合课程设计课程为例[J].创新创业理论研究与实践ꎬ2023(20):136-138.[5]肖海ꎬ温生娟ꎬ赖运平ꎬ等.高校 专创融合 课程教学设计与实践研究:以成都农业科技职业学院作物生产技术课程为例[J].创新创业理论研究与实践ꎬ2023(20):37-39.[6]崔娜ꎬ肖春玲ꎬ徐建国ꎬ等.新工科背景下专创融合课程改革与设计:以«粮油食品工艺»为例[J].包装工程ꎬ2022(增刊2):171-176.[7]赵丹ꎬ谭琳ꎬ陈娜丽ꎬ等.高校 专创融合 课程教学设计与实践研究:以兰州理工大学«能源与环境材料创新设计»课程为例[J].创新创业理论研究与实践ꎬ2022(17):22-24.[8]林友谅ꎬ周金城ꎬ陈滔.基于OBE理念的 专创融合 课程改革研究:以 会计实训 课程为例[J].黑龙江教育(理论与实践)ꎬ2022(11):79-81.[9]胡娅琪ꎬ秦蓓ꎬ张博. 科研育人 背景下药学生创新创业能力的培养[J].广州化工ꎬ2020(22):186-188.[10]张笑ꎬ杨欢ꎬ杨建远ꎬ等.基于导师科研课题的本科生创新创业能力培养的探索[J].食品工业ꎬ2022(12):203-206.[11]单瑞霞ꎬ贾森ꎬ张丽华.基于 以赛促教㊁以赛促学 的应用型人才培养模式探索[J].装备制造技术ꎬ2023(4):296-298.[12]何振芳ꎬ肖燕ꎬ马雪梅ꎬ等.基于 团队+竞赛+导师 项目化学习模式的大学生创新创业素养培育研究与实践[J].高教学刊ꎬ2023(31):80-84.[13]杨润ꎬ胡志霞ꎬ张杰.高校学生社团对学生学业及就业的影响研究:以山西农业大学资源环境学院为例[J].创新创业理论研究与实践ꎬ2023(20):86-89. [14]张雯欣ꎬ熊贤.高校学生社团建设的五个着力点[J].新生代ꎬ2023(6):49-52.[15]祁焱华.基于学科专业的高校学生专业社团建设与运行研究[J].知识文库ꎬ2023(20):123-126. [16]印珺雯.探月精神融入高校科技创新类学生社团建设研究[J].中国教育技术装备ꎬ2023(21):55-58. [17]吴劲松ꎬ南睿铭ꎬ邓海茵ꎬ等.基于产 创 教融合的康复医学综合人才培养模式[J].创新创业理论研究与实践ꎬ2022(21):131-133.(编辑㊀何琳)ResearchandpracticeontheintegratedmodeofprofessionaleducationandinnovativeandentrepreneurialeducationfornormalstudentsmajoringinbiologicalscienceinlocaluniversitiesHanLimin WangLizhi HuaWenpingShaanxiXueqianNormalUniversity Xi an710100 ChinaAbstract Innovationandentrepreneurshipeducationinuniversitiesisanimportantmeasuretopromotethecomprehensivereformofhighereducation animportantleverforuniversitiestopromotethenationalinnovationdrivendevelopmentstrategy andalsotheessenceofthestrategyofbuildingastrongeducationcountryinthenewera.Thearticleconstructsthe 11533 specializedandinnovativeintegratedtrainingmodelforbiologicalsciencemajornormalstudents andhasachievedcertainresultsthroughpractice.Itprovidesreferenceforimprovingthe doubleinnovationability ofappliedundergraduatenormalstudents.Thepromotionofthistalenttrainingmodelcanhelphigh-qualitydevelopmentofteachereducationandprovideexcellentteachingstaffforbasiceducation.Keywords biologicalscience normalstudent innovativeandentrepreneurialeducation professionaleducation talenttrainingmode。

陕西师范大学生命科学学院科学研究...

陕西师范大学生命科学学院科学研究...

陕西师范大学生命科学学院科学研究...】近年来,生命科学学院不断优化队伍结构、加强团队建设与合作,加大经费投入,丰富学术交流,营造良好的学术氛围,促进了高水平成果的产出。

今年以来,学院科学研究在多个领域均取得重要进展,贺军民、王筱冰、夏海滨、王国栋等课题组先后在国际顶级期刊发表一系列学术论文。

贺军民课题组在Plant Physiology发表关于丝分裂原活化蛋白激酶在气孔运动中的作用的研究论文贺军民教授植物细胞信号转导课题组科研成果“Mitogen-activatedprotein kinase phosphatases affect UV-B-induced stomatalclosure via controllingNO inGuard Cells”在植物学领域顶级期刊PlantPhysiology发表,这是该课题组继2013年和2015年分别在植物学领域顶级期刊Plant Physiology和PlantJournal上发表关于气孔运动信号转导机制之后的又一项创新性成果。

该文章首次报道了丝分裂原活化蛋白激酶磷酸酶MKP1及其靶蛋白MPK6分别作为负调节因子和正调节因子参与了UV-B辐射诱导拟南芥气孔关闭的信号转导过程,且它们在该信号转导过程中的作用是介导H2O2诱导NO 的形成。

课题组发表在Plant Science上的文章报道了MPK信号级联途径MEK1-MPK6参与暗刺激诱导气孔关闭的信号转导过程,且其作用也是位于H2O2和NO之间。

该团队发表在Plant Physiology上的论文以研究生李封辰和王静为共同第一作者;发表在PlantScience上的论文以研究生张腾月和李封辰为共同第一作者,贺军民为两篇论文的通信作者。

PlantPhysiology (ISSN: 0032-0889)由美国植物生物学家学会(AmericanSociety of Plant Biologists, ASPB)创刊于1926年,是世界上最古老、最权威的国际植物科学期刊之一,也是世界上最优秀的三大植物学原创研究刊物之一,JCR数据库最新统计数据显示2016年影响因子为6.58,在379种植物学领域期刊中排名第10。

中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析

中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析

第52卷 第3期2024年3月西北农林科技大学学报(自然科学版)J o u r n a l o f N o r t h w e s t A&F U n i v e r s i t y(N a t .S c i .E d .)V o l .52N o .3M a r .2024网络出版时间:2023-09-04 14:29 D O I :10.13207/j .c n k i .jn w a f u .2024.03.001网络出版地址:h t t ps ://l i n k .c n k i .n e t /u r l i d /61.1390.S .20230831.1424.010中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析[收稿日期] 2022-12-14[基金项目] 国家自然科学基金面上项目(32172792);国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(C A R S -44-K X J 7);福建农林大学硕士生导师团队项目;福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)科研扶持项目;福建省省级大学生创新创业训练计划项目(202310389027,X 202310389084) [作者简介] 郭思佳(1998-),女,四川什邡人,在读硕士,主要从事蜜蜂分子生物学研究㊂E -m a i l :g u o s i j i a 1998@163.c o m [通信作者] 付中民(1972-),男,河北唐山人,副教授,主要从事蜜蜂科学研究㊂E -m a i l :z m f @f a f u .e d u .c n郭 睿(1987-),男,安徽六安人,副教授,主要从事昆虫-病原互作研究㊂E -m a i l :r u i gu o @f a f u .e d u .c n 郭思佳1,张凯遥1,荆 欣1,高旭泽1,冯佩林1,邹培缘1,张浩宇1,陈大福1,2,郭 睿1,2,付中民1,2(1福建农林大学动物科学学院(蜂学学院),福建福州350002;2福建省蜂疗研究所,福建福州350002)[摘 要] ʌ目的ɔ系统鉴定和分析中华蜜蜂(A pi s c e r a n a c e r a n a )吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本,为深入开展相关基因和剪接体的功能研究奠定基础㊂ʌ方法ɔ基于前期已获得的高质量中华蜜蜂纳米孔长读段测序数据,通过B l a s t 工具将全长转录本比对N r 数据库筛选出吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本㊂利用g f f c o m p a r e 软件将全长转录本与东方蜜蜂(A pi s c e r a n a )参考基因组上注释的转录本进行比较,鉴定未注释的新基因和新转录本㊂利用T A P I S p i p e l i n e 预测和分析吞噬与包囊作用相关基因的可变多聚腺苷酸化(a l t e r n a t i v e p o l y a d e n yl a t i o n ,A P A )位点,并通过T B t o o l s 软件鉴定A P A 位点上游的基序(m o t i f )㊂使用A s t a l a v i s t a 软件鉴定可变剪接(a l t e r n a t i v e s p l i c i n g ,A S )事件,并通过I G V 浏览器进行结构可视化㊂通过R T -P C R 验证A S 事件的真实性㊂ʌ结果ɔ共鉴定到中华蜜蜂吞噬与包囊作用相关的基因66个和全长转录本395条,发掘出东方蜜蜂参考基因组未注释的2个新基因和303条新转录本㊂对参考基因组已注释的34个基因进行了结构优化,分别延伸了18个基因的5'端和12个基因的3'端,同时延长了4个基因的5'端和3'端㊂共鉴定到含有1个及以上A P A 位点的吞噬与包囊作用相关基因47个,其中多于5个A P A 位点的基因最多,为32个㊂在A P A 位点上游鉴定到多个基序,一致性序列为:G R B G C N K S D A A C A A Y T R B -G C B M R N G G B Y A Y T A YW C N VWN G G ㊂共鉴定到吞噬与包囊作用相关基因的A S 事件296次,其中包括131次可变3'端剪接(a l t e r n a t i v e 3's pl i c e s i t e ,A 3S S )㊁85次内含子保留(i n t r o n r e t e n t i o n ,I R )㊁70次可变5'端剪接(a l t e r n a t i v e 5's p l i c e s i t e ,A 5S S )和10次外显子跳跃(e x o n s k i p p i n g,E S )㊂R T -P C R 结果显示,扩增的目的片段大小符合预期,证实了随机选择的2次A S 事件的真实性㊂ʌ结论ɔ系统鉴定了中华蜜蜂吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本以及A S 事件和A P A 位点,优化了东方蜜蜂参考基因组注释的吞噬与包囊作用相关基因的结构㊂[关键词] 中华蜜蜂;吞噬作用;包囊作用;全长转录本;纳米孔测序;可变剪接;可变多聚腺苷酸化[中图分类号] S 895.137[文献标志码] A[文章编号] 1671-9387(2024)03-0001-10I d e n t i f i c a t i o n a n d a n a l y s i s o f f u l l -l e n g t h t r a n s c r i p t s o f ge n e s r e l a t i v e t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A pi s c e r a n a c e r a n a G U O S i j i a 1,Z H A N G K a i y a o 1,J I N G X i n 1,G A O X u z e 1,F E N G P e i l i n 1,Z O U P e i yu a n 1,Z H A N G H a o y u 1,C H E N D a f u 1,2,G U O R u i 1,2,F U Z h o n gm i n 1,2(1C o l l e g e o f A n i m a l S c i e n c e s (C o l l e g e o f B e e S c i e n c e ),F u j i a n A g r i c u l t u r e a n d F o r e s t r y U n i v e r s i t y ,F u z h o u ,F u ji a n 350002,C h i n a ;2A p i t h e r a p y R e s e a r c h I n s t i t u t e o f F u j i a n P r o v i n c e ,F u z h o u ,F u ji a n 350002,C h i n a )A b s t r a c t :ʌO b j e c t i v e ɔS y s t e m a t i c i d e n t i f i c a t i o n a n d i n v e s t i g a t i o n o f g e n e s a n d f u l l -l e n g t h t r a n s c r i pt sa s s o c i a t e d w i t h p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A p i s c e r a n a c e r a n a w e r e c o n d u c t e d,a i m i n g t o p r o v i d eb a-s i s f o r f u r t h e r f u nc t i o n a l s t ud y o n re l a t e d g e n e s a n d i s of o r m s.ʌM e t h o dɔB a s e d o n p r e v i o u s l yg a i n e dhi g h-q u a l i t y N a n o p o r e l o n g r e a d s e q u e n c i n g d a t a f r o m A p i s c e r a n a c e r a n a,t h e m a p p i n g o f f u l l-l e n g t h t r a n-s c r i p t s t o N r d a t a b a s e w a s c o n d u c t e d b y B l a s t t o o l t o i d e n t i f y f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s r e l a t i v e t o p h a g o c y t o-s i s a n d c a p s u l a t i o n.T h e f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s w e r e c o m p a r e d w i t h t h o s e a n n o t a t e d o n r e f e r e n c e g e n o m e u s i n g t h e g f f c o m p a r e s o f t w a r e t o i d e n t i f y u n a n n o t a t e d n o v e l g e n e s a n d f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s.P r e d i c t i o n a n d a n a l y s i s o f a l t e r n a t i v e p o l y a d e n y l a t i o n(A P A)s i t e s w e r e c o n d u c t e d w i t h T A P I S p i p e l i n e,f o l l o w e d b y i d e n t i f i c a t i o n o f m o t i f s u p s t r e a m o f A P A s i t e s b y T B t o o l s s o f t w a r e.A s t a l a v i s t a s o f t w a r e w a s e m p l o y e d t o i d e n t i f y a l t e r n a t i v e s p l i c i n g(A S)e v e n t s f o l l o w e d b y s t r u c t u r a l v i s u a l i z a t i o n b y I G V b r o w s e r.R T-P C R w a s p e r f o r m e d t o v a l i d a t e t h e a u t h e n t i c i t y o f A S e v e n t s.ʌR e s u l tɔA t o t a l o f66g e n e s a n d395f u l l-l e n g t h t r a n-s c r i p t s r e l e v a n t t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A p i s c e r a n a c e r a n a w e r e d i s c o v e r e d,i n c l u d i n g2n e w g e n e s a n d303n e w t r a n s c r i p t s u n a n n o t a t e d o n t h e r e f e r e n c e g e n o m e o f A p i s c e r a n a.T h e s t r u c t u r e o f34 a n n o t a t e d g e n e s o f t h e r e f e r e n c e g e n o m e w a s o p t i m i z e d,a m o n g w h i c h5'e n d s o f18g e n e s a n d3'e n d s o f12 g e n e s w e r e e x t e n d e d,a n d5'e n d s a n d3'e n d s o f4g e n e s w e r e p r o l o n g e d.A d d i t i o n a l l y,47g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n w e r e i d e n t i f i e d t o c o n t a i n o n e o r m o r e A P A s i t e s.T h e n u m b e r o f g e n e s w i t h m o r e t h a n5A P A s i t e s w a s32.M u l t i p l e m o t i f s w e r e i d e n t i f i e d i n u p s t r e a m o f A P A s i t e s,a n d t h e c o n s i s t-e n t s e q u e n c e w a s G R B G C N K S D A A C A A Y T R B G C B MR N G G B Y A Y T A YW C N VWN G G.I n t o t a l,296A S e v e n t s w e r e i d e n t i f i e d,i n c l u d i n g131a l t e r n a t i v e s3's p l i c e s i t e s(A3S S),85i n t r o n r e t e n t i o n(I R),70a l t e r-n a t i v e5's p l i c e s i t e s(A5S S)a n d10e x o n s k i p p i n g(E S).R T-P C R s h o w e d t h a t t h e s i z e s o f a m p l i f i e d f r a g-m e n t s w e r e c o n s i s t e n t w i t h e x p e c t e d s i z e s,c o n f i r m i n g t h a t t h e a u t h e n t i c i t y o f t h e2r a n d o m l y s e l e c t e d A S e v e n t s.ʌC o n c l u s i o nɔG e n e s a n d f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s r e l a t i v e t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A p i s c e r-a n a c e r a n a a n d A S e v e n t s a s w e l l a s A P A s i t e s w e r e s y s t e m a t i c a l l y i d e n t i f i e d,a n d s t r u c t u r e s o f p h a g o c y t o-s i s a n d c a p s u l a t i o n-a s s o c i a t e d g e n e s w e r e o p t i m i z e d.K e y w o r d s:A p i s c e r a n a c e r a n a;p h a g o c y t o s i s;c a p s u l a t i o n;f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s;N a n o p o r e s e q u e n-c i n g;a l t e r n a t i v e s p l i c i n g;a l t e r n a t i v e p o l y a d e n y l a t i o n蜜蜂是自然界最重要的授粉昆虫,在生态平衡和粮食安全方面发挥举足轻重的作用㊂中华蜜蜂(A p i s c e r a n a c e r a n a),简称中蜂,是东方蜜蜂(A p i s c e r a n a)的指名亚种,也是我国养蜂生产中使用的主要蜂种之一,经过长期的适应性进化已高度适应我国地理环境,具有重要的生态和经济价值[1]㊂近年来,以牛津纳米孔(N a n o p o r e)长读段测序技术为代表的第三代测序技术不断革新㊁突飞猛进,在组装染色体级别基因组和揭示转录组复杂性等方面应用广泛㊂由于具有超长读长的显著优势,牛津纳米孔测序技术已成功应用于可变剪接体(i s o-f o r m)㊁可变剪切(a l t e r n a t i v e s p l i c i n g,A S)和可变多聚腺苷酸化(a l t e r n a t i v e p o l y a d e n y l a t i o n,A P A)位点等的精确鉴定和分析[2-3]㊂目前,基于牛津纳米孔测序技术的全长转录组研究已见诸于橄榄果蝇(B a c t r o c e r a o l e a e)[4]㊁亚洲飞蝗(L o c u s t a m i g r a t o-r i a)[5]和椰蛀犀金龟(O r y c t e s r h i n o c e r o s)[6]等昆虫中㊂东方蜜蜂的全长转录组研究报道迄今仅有2例,L i u等[7]对长白山东方蜜蜂越冬期抗寒性的全长转录本进行了分析,确定了5941个完整的O R F 序列;蔡宗兵等[8]在中华蜜蜂中肠中鉴定到265个与细胞色素P450相关的全长转录本㊂此前,本课题组利用牛津纳米孔测序技术对蜜蜂的2种真菌病原蜜蜂球囊菌(A s c o s p h a e r a a p i s)和东方蜜蜂微孢子虫(N o s e m a c e r a n a e)进行了较为系统的全长转录组研究[9-14],但中蜂的全长转录组研究总体上仍较为滞后㊂作为无脊椎动物,蜜蜂等昆虫缺乏获得性免疫,但拥有包括细胞免疫和体液免疫在内的天然免疫系统㊂当侵入昆虫血淋巴的病原体被宿主细胞识别后,宿主的细胞免疫随即被激活,进而合成与分泌抗菌肽,抵御病原侵染[15]㊂吞噬和包囊作用是昆虫的2种重要细胞免疫反应,吞噬能直接杀死真菌孢子和外源小分子,而包囊能抵御如寄生虫等无法被吞噬的入侵者[16]㊂W a n g等[17]研究发现,棉铃虫(H e l i c o v e r p a a r m i g e r a)20E-H a E c R-H a U S P复合物刺激血淋巴中H a C T L1基因的表达,进而提高2西北农林科技大学学报(自然科学版)第52卷H a C T L1蛋白的合成与分泌,并促进细胞吞噬和包囊作用,抵抗中华卵索线虫(O v o m e r m i s s i n e n s i s)的侵袭㊂在果蝇(D r o s o p h i l a)中,TM9S F4基因突变可引起吞噬与包囊作用缺失,导致果蝇对革兰氏阴性菌更加敏感[18]㊂P a r k等[19]利用二代测序技术组装和注释了东方蜜蜂的参考基因组,但由于二代测序产生的读段较短,故该版本参考基因组仅组装到重叠群(c o n t i g)水平,东方蜜蜂参考基因组仍需要进一步完善㊂目前,人们对中蜂吞噬与包囊作用的认识非常有限,对其相关基因和全长转录组缺乏深入的研究㊂前期研究中,本课题组已利用牛津纳米孔测序技术对中华蜜蜂工蜂幼虫肠道组织进行了测序,获得了高质量的长读段数据[8]㊂在此基础上,本研究对中华蜜蜂吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本进行了系统鉴定,对东方蜜蜂参考基因组已注释的吞噬与包囊作用相关基因进行结构优化,进而发掘和分析吞噬与包囊作用相关基因的A P A位点和A S事件,并对A S事件进行分子验证,以期丰富中华蜜蜂吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本的相关信息,为深入开展相关基因和剪接体的功能研究奠定基础㊂1材料与方法1.1细胞吞噬与包囊作用相关基因与全长转录本的筛选与分析本课题组前期已完成中蜂幼虫4,5和6日龄肠道样品(A c4组㊁A c5组和A c6组)制备㊁R N A提取㊁c D N A建库及牛津纳米孔测序㊂A c4㊁A c5和A c6组测序结果分别获得了7338627,7003419和7434233条原始读段,其N50分别为1276,1306和1404b p,平均读长分别为1126,1126和1166 b p,最大长度分别为16628,12808和14359b p,质量值均达到Q12[8]㊂高质量的长读段测序数据可用于本研究中中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本的鉴定及分析㊂使用B l a s t工具(参数为默认设置)将鉴定到的所有全长转录本序列比对到G O(h t t p://g e n e o n t o l o g y.o r g/)㊁K E G G(h t t p s:// w w w.k e g g.j p/)和N r(h t t p s://f t p.n c b i.n l m.n i h.g o v/b l a s t/d b/F A S T A/)数据库,再根据注释信息筛选细胞吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本㊂1.2东方蜜蜂参考基因组中已注释细胞吞噬与包囊作用相关基因的结构优化按照本课题组已建立的技术流程[12,20],利用g f f c o m p a r e软件(参数为默认设置)将本研究中鉴定到的细胞吞噬与包囊作用相关全长转录本与中蜂参考基因组(A C S N U-2.0)上已注释的转录本进行比较,以发现未注释的新基因和转录本,并对已注释基因进行结构优化㊂如果在原有基因边界之外的区域有比对读段(m a p p e d r e a d s)支持,则将基因的非翻译区向上㊁下游延伸,以修正基因的边界㊂1.3细胞吞噬与包囊作用相关基因的A P A位点鉴定与分析参照杜宇等[11]报道的方法,利用T A P I S p i p e-l i n e[21]鉴定细胞吞噬与包囊作用相关基因的A P A 位点,参数设置为:-n o r c㊁-m e m e-m i n w6㊁-m e m e-m a x w6㊁-s p a m o-s k i p㊁-f i m o-s k i p㊂通过T B t o o l s软件[22]对细胞吞噬与包囊作用相关基因A P A位点上游50b p的序列特征进行分析,以鉴定基序(m o-t i f)㊂1.4细胞吞噬与包囊作用相关基因的可变剪接分析参照陈华枝等[13]和杜宇等[11]报道的方法,使用A s t a l a v i s t a软件[23]鉴定中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S事件类型,其中包括互斥外显子(m u t u a l l y e x c l u s i v e e x o n,M E E)㊁内含子保留(i n-t r o n r e t e n t i o n,I R)㊁外显子跳跃(e x o n s k i p p i n g, E S)㊁可变3'端剪接(a l t e r n a t i v e3's p l i c e s i t e,A3S S)和可变5'端剪接(a l t e r n a t i v e5's p l i c e s i t e,A5S S)㊂参数为默认设置㊂根据预测结果统计以上可变剪接类型数量㊂1.5细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S事件验证中蜂幼虫取自福建农林大学动物科学学院(蜂学学院)蜜蜂保护课题组的实验蜂群㊂参照本课题组已建立的技术流程[24-26],从蜂群中提取巢脾,在实验室中将2日龄幼虫移至干净的48孔培养板,放入恒温恒湿箱,在温度为35ħ㊁相对湿度(R H)为90%的条件下饲养,分别剖取4,5和6日龄幼虫肠道组织,液氮速冻后迅速转移到-80ħ超低温冰箱保存,备用㊂为验证细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S事件准确性,以β-a c t i n为内参基因,随机选择2种A S 类型(A3S S㊁I R)的1个基因进行R T-P C R验证㊂根据上述基因的核酸序列设计跨剪接位点的特异性引物,交由生工生物(上海)公司合成(表1)㊂以肌动蛋白基因β-a c t i n(L O C107999330)作为内参基因,将上述制备的4,5和6日龄幼虫肠道的R N A等物3第3期郭思佳,等:中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析质的量混合后进行反转录,获得c D N A ㊂以得到的c D N A 作为模板进行P C R 扩增,反应体系和程序参照蔡宗兵等[8]的报道进行㊂P C R 产物经3%琼脂糖凝胶电泳后使用核酸凝胶成像仪进行检测和拍照㊂表1 本研究中使用的引物序列T a b l e 1 S e q u e n c e s o f p r i m e r s u s e d i n t h i s s t u d yA S 类型T y pe of A S 基因或基因I DG e n e o r g e n e I D预测的转录本号P r e d i c t e d t r a n s c r i pt n u m b e r 序列S e qu e n c e I RL O C 107999286O N T.6127.13(444b p ),O N T.6127.3(341b p)F :5'-C T C A C G G A A C T A C C A C G G -3'R :5'-G G G A T A T T C G C C A C A A C A -3'A 3S S L O C 107999764O N T.6364.6(362b p ),O N T.6364.2(425b p)F :5'-A G A A A G A G C A T T A G G A G A -3'R :5'-G G A G T A C G T T G A A T A G G A -3'-β-a c t i n -F :5'-T T A T A TG C C A A C A C T G T C C T T T -3'R :5'-A G A A T T G A T C C A C C A A T C C A -3'注:括号中的数据为片段长度㊂N o t e :D a t a i n t h e b r a c k e t s i s t h e l e n g t h o f t r a n s c r i pt .2 结果与分析2.1 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因和全长转录本的鉴定与分析试验共鉴定到吞噬相关的基因65个和全长转录本391条,包囊作用相关的基因1个和全长转录本4条,其中包括东方蜜蜂参考基因组上未注释的2个新基因和303条新转录本㊂对鉴定到的基因进行K E G G 和G O 注释,结果有62个基因注释到22条K E G G 通路(图1);有65个基因注释到53个G O 条目,其中P 值排序前20的条目见图2㊂图中数据为注释到的基因数及其占比㊂图2同D i g i t s i n d i c a t e n u m b e r s o f g e n e s a n n o t a t e d a n d i t s r a t i o .F i g.2i s t h e s a m e 图1 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的K E G G 注释F i g .1 K EG G a n n o t a t i o n s o f g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A pi s c e r a n a c e r a n a 4西北农林科技大学学报(自然科学版)第52卷图2 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的G O 注释F i g .2G O a n n o t a t i o n s o f g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l e i n A pi s c e r a n a c e r a n a 2.2 东方蜜蜂参考基因组已注释细胞吞噬与包囊作用相关基因的结构优化试验共对东方蜜蜂参考基因组上已注释的34个细胞吞噬与包囊作用相关基因的结构进行了优化,其中正链结构优化的基因为17个,负链结构优化的基因为17个;5'端延长的基因有18个,延长长度介于4~5512b p;3'端延长的基因有12个,延长长度介于1~3218b p;3'和5'端均延长的基因有4个,分别为L O C 107999172,L O C 107999330,L O C 108000752和L O C 108003556(表2)㊂表2 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因结构优化的详细信息T a b l e 2 D e t a i l e d i n f o r m a t i o n o f s t r u c t u r a l o p t i m i z a t i o n o f g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A pi s c e r a n a c e r a n a 基因I DG e n e I D参考序列R e f e r e n c e s e qu e n c e 优化前的起止位置S t a r t a n d e n d s i t e s b e f o r e o pt i m i z a t i o n 优化后的起止位置S t a r t a n d e n d s i t e s a f t e r o pt i m i z a t i o n 正负链P o s i t i v e o r n e ga t i v e s t r a n d 末端E n d L O C 107998143NW _016019219.11777187-17784171771675-1778417+5'L O C 108003298NW _016019863.197472-9977891999-99778-5'L O C 107995660NW _016017456.11776644-18069261774455-1806926+5'L O C 107999172NW _016019319.1419590-429628417412-429628+5'L O C 107997445NW _016019153.11089494-11037821087610-1103782-5'L O C 107999159NW _016019319.117703-2478016575-24780-5'L O C 107994640NW _016018544.15265-71014277-7101-5'L O C 107999790NW _016019364.180049-8323779245-83237-5'L O C 107994136NW _016018344.11816913-18226661816182-1822666-5'L O C 107999764NW _016019364.1946296-958611945624-958611-5'L O C 108000406NW _016019441.1709872-713105709245-713105-5'L O C 107997632NW _016019175.11062418-10727961061901-1072796-5'L O C 108000577NW _016019442.1960650-965211960161-965211-5'5第3期郭思佳,等:中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析表2(续) T a b l e 2(c o n t i n u e d)基因I DG e n e I D参考序列R e f e r e n c e s e qu e n c e 优化前的起止位置S t a r t a n d e n d s i t e s b e f o r e o pt i m i z a t i o n 优化后的起止位置S t a r t a n d e n d s i t e s a f t e r o pt i m i z a t i o n 正负链P o s i t i v e o r n e ga t i v e s t r a n d 末端E n d L O C 107999330NW _016019330.11372267-13770341371781-1377034-5'L O C 108000587NW _016019442.1569024-569997568540-569997-5'L O C 108000752NW _016017512.1181972-183084181594-183084-5'L O C 107998213NW _016019219.12093759-21004742093552-2100474-5'L O C 107998677NW _016019275.1760522-765147760336-765147-5'L O C 107999232NW _016019330.1492630-495090492481-495090-5'L O C 108001305NW _016019552.1187553-189571187438-189571-5'L O C 107995080NW _016017456.1516106-518939516101-518939+5'L O C 108003556NW _016017567.12875991-28786182875987-2878618+5'L O C 107999330NW _016019330.11371781-13770331371781-1377034-3'L O C 107992565NW _016017856.1183783-185914183783-185924+3'L O C 108001195NW _016017512.1514991-517027514991-517058+3'L O C 108000752NW _016017512.1181594-182906181594-183084-3'L O C 107998372NW _016019231.11386200-13883801386200-1388790+3'L O C 107995099NW _016018567.1136406-140802136406-141304+3'L O C 107993924NW _016018256.1253448-258337253448-258848+3'L O C 107997332NW _016017457.1590209-593951590209-594488+3'L O C 108003264NW _016017556.1192600-196182192600-196785+3'L O C 107992702NW _016017899.1 211-1820211-2563+3'L O C 107999172NW _016019319.1417412-428815417412-429628+3'L O C 108000484NW _016019441.14376457-43802124376457-4381188+3'L O C 108003556NW _016017567.12875987-28772962875987-2878618+3'L O C 108002524NW _016017455.1845010-847931845010-849556+3'L O C 122719477NW _016017767.1310646-314815310646-318033+3'L O C 107995086NW _016018567.1848331-849310848331-849899+3'2.3 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的A P A位点鉴定与分析试验共鉴定到含有1个及以上A P A 位点的细胞吞噬与包囊作用相关基因47个(图3),其中多于5个A P A 位点的基因最多,为32个;含有1个A P A 位点的基因次之,为6个;含有2个和3个A P A 位点的基因均为4个;含有4个A P A 位点的基因为1个㊂此外,在细胞吞噬与包囊作用相关基因的A P A 位点上游鉴定到多个基序,一致性序列为:G R B G C N K S D A A C A A Y T R B G C B M R N G G B Y -A Y T A YW C N VWN G G (图4)㊂图3 不同数量A P A 位点中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的分布F i g.3 D i s t r i b u t i o n o f d i f f e r e n t n u m b e r s o f A P A s i t e s o f g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l e i n A pi s c e r a n a c e r a na 图4 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的一致性基序F i g .4 M o t i f s o f g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c y t o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A pi s c e r a n a c e r a n a 6西北农林科技大学学报(自然科学版)第52卷2.4 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S 事件鉴定与分析试验共鉴定到细胞吞噬与包囊作用相关基因的296次A S 事件,其中数量最多的类型是可变3'端剪接(A 3S S ,131次),其次为内含子保留(I R ,85次)和可变5'端剪接(A 5S S ,70次),数量最少的类型为外显子跳跃(E S ,10次)(图5)㊂部分细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S 事件详细信息见表3㊂表3 细胞吞噬与包囊作用相关基因的可变剪接事件(A S)详细信息(仅展示6个)T a b l e 3 D e t a i l i n f o r m a t i o n o f a l t e r n a t i v e s p l i c i n g e v e n t s o c c u r r e d i n p h a g o c yt o s i s a n d c a p s u l a t i o n r e l e v a n t g e n e s (s i x d i s p l a y e d o n l y)基因I DG e n e I D转录本I DT r a n s c r i pt I D A S 事件类型A S e v e n t t y pe 参考序列R e f e r e n c e s e q u e n c e 链属S t r a n d t y pe 区域R e gi o n L O C 107999286O N T.6127.13,O N T.6127.3I RNW _016019330.1C 3148146-3148035L O C 107999764O N T.6364.6,O N T.6364.2A 3S S NW _016019364.1C 949340-949306L O C 107999286O N T.6127.7,O N T.6127.2E SNW _016019330.1C3172740-3172667L O C 107995660O N T.309.1,O N T.309.2A 5S S NW _016017456.1W 1780668-1780704L O C 107995099O N T.3315.1,O N T.3315.3A 3S S NW _016018567.1W 137912-137926L O C 107992565O N T.1750.1,O N T.1750.2I R NW _016017856.1W183906-184992注:C 和W 分别代表负义链和正义链㊂N o t e :C a n d W r e p r e s e n t n o n s e n s e s t r a n d a n d s e n s e s t r a n d ,r e s p e c t i v e l y.图5 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S 事件类型F i g .5 T y p e s o f A S e v e n t s i n g e n e s r e l a t e d t o p h a g o c yt o s i s a n d c a p s u l a t i o n i n A pi s c e r a n a c e r a n a 2.5 中蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因的A S 事件验证随机选择2种A S 事件类型进行R T -P C R 验证,结果(图6)显示,L O C 107999764基因可检测到2条转录本,大小分别约为425和362b p ,与基于测序数据预测出的O N T.6364.2和O N T 6364.6的大小(表1)一致;L O C 107999286基因可检测到2条转录本,大小分别约为444和341b p,与基于测序数据预测出的O N T.6127.3和O N T.6127.13的大小(表1)一致㊂上述结果表明,本研究鉴定到的A S 事件真实可靠㊂A ,C .A 3S S 和I R 的可变剪接事件类型示意图,方框表示外显子,直线表示内含子,箭头表示转录方向;B ,D.L O C 107999764和L O C 107999286扩增产物的琼脂糖凝胶电泳A a n d C s h o w t y p e s o f a l t e r n a t i v e s p l i c i n g e v e n t s o c c u r r e d i n A 3S S a n d I R ,r e c t a n g l e s r e p r e s e n t e x o n s ,a n d b l a c k l i n e s r e pr e s e n t i n t r o n s ,a r r o w i n d i c a t e d i r e c t i o n o f t r a n s c r i p t i o n ;B a n d D s h o w a g a r o s e g e l e l e c t r o p h o r e s i s f o r a m pl i f i e d pr o d u c t s f r o m L O C 107999764a n d L O C 107999286图6 中蜂2个基因可变剪接事件的P C R 验证F i g .6 P C R v a l i d a t i o n o f a l t e r n a t i v e s p l i c i n g e v e n t s o c c u r r e d i n t w o g e n e s i n A pi s c e r a n a c e r a n a 7第3期郭思佳,等:中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析3讨论此前,P a r k等[19]利用二代测序技术组装和注释了东方蜜蜂的参考基因组(A C S N U-2.0),该版本的基因组大小约为238M b,共包含10651个编码基因,其中注释到吞噬作用的基因和转录本数目分别为95个和182条,注释到包囊作用的基因和转录本数目分别为1个和1条㊂基于已获得的高质量牛津纳米孔测序数据,本研究共鉴定到中蜂吞噬作用相关的基因65个和全长转录本391条,包囊作用相关的基因1个和全长转录本4条,其中包括参考基因组上未注释的新基因2个和新转录本303条㊂这为持续深入开展中蜂吞噬与包囊作用相关基因和i s o-f o r m的研究提供了宝贵的材料㊂U T R主要通过顺式调节元件和R N A结合蛋白(或小R N A反式作用因子)之间的动态相互作用来调节特定的m R N A的代谢和翻译[27]㊂3'U T R 参与m i R N A或以蛋白质为基础的m R N A的降解机制,而5'U T R影响m R N A的翻译效率[28]㊂本研究共对东方蜜蜂参考基因组上已注释的34个吞噬与包囊作用相关基因结构进行优化,延长了18个基因的5'U T R(延长长度介于4~5512b p)和12个基因的3'U T R(延长长度介于1~3218b p),同时延长了4个基因的5'U T R和3'U T R㊂这为进一步开展上述中蜂吞噬与包囊作用相关基因表达调控的深入研究提供了重要基础㊂A P A通过产生编码序列或3'U T R不同的异构体,从而调节目标R N A的功能㊁稳定性㊁定位和翻译效率,促进转录组的复杂性[29]㊂哺乳动物基因组中有50%~80%的基因发生A S和A P A,进而产生数量众多的剪接异构体[30];在人(H o m o s a p i e n s)中,至少有70%的基因含有A P A位点[31-32];在小鼠(M u s m u s c u l u s)中,32%的表达基因经历A P A[33];在水稻(O r y z a s a t i v a)中,约48%的基因含有A P A 位点[34];在小麦(T r i t i c u m a e s t i v u m)中,有31%的基因含有A P A位点[35];在拟南芥(A r a b i d o p s i s t h a l i a n a)中,超过60%的基因含有A P A位点[36]㊂本研究鉴定到中蜂吞噬与包囊作用相关的66个基因,其中有47(约71.2%)个基因含有1个及以上的A P A位点,表明中蜂吞噬与包囊作用相关的基因多数发生A P A㊂其中,多于5个A P A位点的基因最多,这与他人对热带爪蟾(X e n o p u s t r o p i c a l i s)[37]和蜜蜂球囊菌[11]等物种的研究报道一致㊂但在高粱[38]和草地贪夜蛾(S p o d o p t e r a f r u g i p e r d a)[39]等物种中,含2个A P A位点的基因最为丰富㊂上述结果表明,不同物种中,A P A位点数的分布规律存在差异㊂此外,在吞噬与包囊作用相关基因的A P A 位点上游鉴定到多个基序,一致性序列为:G RB G C-N K S D A AC A A Y T R B G C B M R N G G B Y A Y T A YW-C N VWN G G㊂人类基因的A P A位点上游存在1个经典m o t i f(A A U A A A),该基序同样存在于果蝇基因A P A位点上游[40]㊂M a等[35]在小麦基因的A P A位点上游鉴定到多个基序,其中出现频率最高的是A A U A A A㊁A U A U A U和U A U A U A㊂玉米(Z e a m a y s)基因的A P A位点上游出现频率前3位的基序为:A A U A A A㊁A U A U A U和U A U A U A[41]㊂本课题组在东方蜜蜂微孢子虫基因的A P A位点上游发现3个基序:A A U A A A㊁U G A U G C和G C G A C G[13],在蜜蜂球囊菌基因的A P A位点上游鉴定到4个基序:A U G A U A A㊁C A U G A A C㊁G U U C A A U和U C A U C A U[42]㊂以上结果表明,A P A上游基序具有一定的种属特异性㊂W a n g等[30]研究发现,哺乳动物基因进化过程中聚腺苷酸化位点(p o l y a d e n y l a t i o n s i t e s,P A S)选择对A P A施加进化压力的基因特征包括基因年龄㊁基因表达模式和基因功能㊂本研究鉴定到的基序与其他物种中A P A位点上游的基序均不相同,推测可能是由于高分化细胞一般倾向于使用远端P A S,导致具有较长3'U T R的转录本表达,而生长较快的细胞则倾向于使用近端P A S,产生较短的3'U T R,从而导致产生的转录本具有潜在的高表达水平[43]㊂A S 在基因的功能多样性中扮演着重要的角色,由A S 产生的蛋白质异构体在酶活性㊁定位或稳定性等方面存在差异,从而影响细胞的活动[44]㊂本研究共鉴定到吞噬与包囊作用相关基因的296次A S事件,说明中蜂吞噬与包囊作用相关基因广泛发生A S㊂其中,最丰富的A S事件类型是A3S S(131次),其次是I R(85次),数量最少的为E S(10次)㊂在硝酸盐胁迫条件下,大豆(G l y c i n e m a x L.)根系中R I 和A3S S是最常见的A S类型,其中A3S S产生的剪接异构体的相对表达量在不同硝酸盐条件差异显著[45]㊂L e v e s q u e等[46]报告了第一个关于癌症中A3S S使用的全基因组研究,强调了乳腺癌中数百个不同剪接的事件,表明A3S S在乳腺癌整体剪接网络中具有重要作用㊂I R和A3S S主要涉及调节前体m R N A产生不同的成熟剪接体,调节细胞中基因的表达,然后影响编码蛋白的功能[47]㊂本研究通过R T-P C R对随机选择2种A S事件类型进行验8西北农林科技大学学报(自然科学版)第52卷证,结果显示L O C107999764和L O C107999286均能扩增出2条转录本,大小与基于测序数据的预测结果一致,表明中蜂吞噬与包囊作用相关基因的A S 事件真实可靠㊂[参考文献][1]曾志将.养蜂学[M].北京:中国农业出版社,2017.Z e n g Z J.A p i c u l t u r e[M].B e i j i n g:C h i n a A g r i c u l t u r e P r e s s, 2017.[2] D e a m e r D,A k e s o n M,B r a n t o n D.T h r e e d e c a d e s o f n a n o p o r es e q u e n c i n g[J].N a t u r e B i o t e c h n o l o g y,2016,34(5):518-524.[3] W a n g Y,Z h a o Y,B o l l a s A,e t a l.N a n o p o r e s e q u e n c i n g t e c h n o-l o g y,b i o i n f o r m a t i c s a n d a p p l i c a t i o n s[J].N a t u r e B i o t e c h n o l o-g y,2021,39(11):1348-1365.[4] B a y e g a A,O i k o n o m o p o u l o s S,G r e g o r i o u M E,e t a l.N a n o p o r el o n g-r e a d R N A-s e q a n d a b s o l u t e q u a n t i f i c a t i o n d e l i n e a t e t r a n-s c r i p t i o n d y n a m i c s i n e a r l y e m b r y o d e v e l o p m e n t o f a n i n s e c t p e s t[J].S c i e n t i f i c R e p o r t s,2021,11(1):7878.[5] J i a n g F,Z h a n g J,L i u Q,e t a l.L o n g-r e a d d i r e c t R N A s e q u e n-c i n g b y5'-C a p c a p t u r i n g r e v e a l s t h e i m p a c t o f P i w i o n t h ew i d e s p r e a d e x o n i z a t i o n o f t r a n s p o s a b l e e l e m e n t s i n l o c u s t s [J].R N A B i o l o g y,2019,16(7):950-959.[6] F i l i p o v i c I,H e r e w a r d J P,R aši c G,e t a l.T h e c o m p l e t e m i t o-c h o nd r i a l ge n o m e s e q u e n c e of O r y c t e s r h i n o c e r o s(C o l e o p t e r a:S c a r a b a e i d a e)b a s e d o n l o n g-r e a d n a n o p o r e s e q u e n c i n g[J].P e e r J,2021,9:e10552.[7] L i u N N,R e n Z Y,R e n Q D,e t a l.F u l l l e n g t h t r a n s c r i p t o m e sa n a l y s i s o f c o l d-r e s i s t a n c e o f A p i s c e r a n a i n C h a n gb a i M o u n-t a i n d u r i n g o v e r w i n t e r i n g p e r i o d[J].G e n e,2022,830:146503.[8]蔡宗兵,王紫馨,吴鹰,等.中华蜜蜂细胞色素P450相关基因和全长转录本的鉴定及分析[J].昆虫学报,2023,66(1):11-18.C a i Z B,W a n g Z X,W u Y,e t a l.I d e n t i f i c a t i o n a n d a n a l y s i s o fg e n e s a n d f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s r e l a t e d t o c y t o c h r o m e P450i nA p i s c e r a n a c e r a n a[J].A c t a E n t o m o l o g i c a S i n i c a,2023,66(1):11-18.[9]隆琦,余岢骏,吴鹰,等.蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中毒力因子相关全长转录本的鉴定及分析[J].应用昆虫学报,2021,58(5):1073-1082.L o n g Q,Y u K J,W u Y,e t a l.I d e n t i f i c a t i o n a n d a n a l y s i s o f v i-r u l e n c e f a c t o r-r e l a t e d f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t s i n A s c o s p h a e r a a-p i s m y c e l i u m a n d s p o r e s[J].C h i n e s e J o u r n a l o f A p p l i e d E n t o-m o l o g y,2021,58(5):1073-1082.[10]杜宇,祝智威,王杰,等.利用第三代纳米孔长读段测序技术构建和注释蜜蜂球囊菌的全长转录组[J].中国农业科学, 2021,54(4):864-876.D u Y,Z h u Z W,W a n g J,e t a l.C o n s t r u c t i o n a n d a n n o t a t i o n o fA s c o s p h a e r a a p i s f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t o m e u t i l i z i n g n a n o p o r et h i r d-g e n e r a t i o n l o n g-r e a d s e q u e n c i n g t e c h n o l o g y[J].S c i e n t i aA g r i c u l t u r a S i n i c a,2021,54(4):864-876.[11]杜宇,王杰,蒋海宾,等.基于第三代长读段测序数据解析蜜蜂球囊菌基因的可变剪切与可变腺苷酸化[J].微生物学报,2021,61(3):667-682.D u Y,W a n g J,J i a n g H B,e t a l.A n a l y s i s o f a l t e r n a t i v e s p l i c i n ga n d p o l y a d e n y l a t i o n o f A s c o s p h a e r a a p i s g e n e sb a s e d o nt h i r d-g e n e r a t i o n l o n g-r e a d s e q u e n c i n g d a t a s e t[J].A c t a M i-c r o b i o l o g i c a S i n i c a,2021,61(3):667-682.[12]陈华枝,范元婵,蒋海宾,等.基于纳米孔全长转录组数据完善东方蜜蜂微孢子虫的基因组注释[J].中国农业科学,2021, 54(6):1288-1300.C h e n H Z,F a n Y C,J i a n g H B,e t a l.I m p r o v e m e n t o f N o s e m ac e r a n a e g e n o m e a n n o t a t i o n b a s ed o n n a n o p o ref u l l-l e ng t ht r a n s c r i p t o m e d a t a[J].S c i e n t i a A g r i c u l t u r a S i n i c a,2021,54(6):1288-1300.[13]陈华枝,范小雪,范元婵,等.东方蜜蜂微孢子虫基因的可变剪接及可变腺苷酸化解析[J].菌物学报,2021,40(1):161-173.C h e n H Z,F a n X X,F a n Y C,e t a l.A n a l y s i s o f a l t e r n a t i v es p l i c i n g a n d a l t e r n a t i v e p o l y a d e n y l a t i o n o f N o s e m a c e r a n a eg e n e s[J].M y c o s y s t e m a,2021,40(1):161-173.[14]陈华枝,杜宇,范小雪,等.基于第三代纳米孔测序技术的东方蜜蜂微孢子虫全长转录组构建及注释[J].昆虫学报, 2020,63(12):1461-1472.C h e n H Z,D u Y,F a n X X,e t a l.C o n s t r u c t i o n a n d a n n o t a t i o no f t h e f u l l-l e n g t h t r a n s c r i p t o m e o f N o s e m a c e r a n a e b a s e d o nt h e t h i r d-g e n e r a t i o n n a n o p o r e s e q u e n c i n g t e c h n o l o g y[J].A c-t a E n t o m o l o g i c a S i n i c a,2020,63(12):1461-1472. [15] S t r a n d M R.T h e i n s e c t c e l l u l a r i mm u n e r e s p o n s e[J].I n s e c tS c i e n c e,2008,15:1-14.[16]吴姗,凌尔军.昆虫细胞免疫反应中的吞噬㊁集结和包囊作用[J].昆虫学报,2009,52(7):791-798.W u S,L i n g E J.P h a g o c y t o s i s,n o d u l a t i o n a n d e n c a p s u l a t i o n i nc e l l u l a r i mm u n e r e s p o n s e s i n i n s e c t s[J].A c t a E n t o m o l o g i c aS i n i c a,2009,52(7):791-798.[17]W a n g G J,W a n g W W,L i u Y,e t a l.S t e r o i d h o r m o n e20-h y d r o x y e c d y s o n e p r o m o t e s C T L1-m e d i a t e d c e l l u l a r i mm u n i t yi n H e l i c o v e r p a a r m i g e r a[J].I n s e c t S c i e n c e,2021,28(5):1399-1413.[18] B e r g e r e t E,P e r r i n J,W i l l i a m s M,e t a l.T M9S F4i s r e q u i r e df o r D r o s o p h i l a c e l l u l a r i mm u n i t y v i a c e l l a d h e s i o n a n d p h a-g o c y t o s i s[J].J o u r n a l o f C e l l S c i e n c e,2008,121(P t20):3325-3334.[19] P a r k D,J u n g J W,C h o i B S,e t a l.U n c o v e r i n g t h e n o v e l c h a-r a c t e r i s t i c s o f A s i a n h o n e y b e e,A p i s c e r a n a,b y w h o l e g e-n o m e s e q u e n c i n g[J].B M C G e n o m i c s,2015,16(1):1. [20]杜宇,付中民,祝智威,等.基于蜜蜂球囊菌纳米孔测序数据的基因非翻译区延长㊁S S R位点发掘及未注释基因和转录本鉴定[J].昆虫学报,2020,63(11):1345-1357.D u Y,F u Z M,Z h u Z W,e t a l.E l o n g a t i o n o f g e n i c u n t r a n s-l a t e d r e g i o n s,e x p l o r a t i o n o f S S R l o c i a n d i d e n t i f i c a t i o n o fu n a n n o t a t e d g e n e s a n d t r a n s c r i p t s b a s e d o n t h e N a n o p o r e s e-q u e n c i n g d a t a s e t o f A s c o s p h a e r a a p i s[J].A c t a E n t o m o l o g i c aS i n i c a,2020,63(11):1345-1357.[21] A b d e l-G h a n y S E,H a m i l t o n M,J a c o b i J L,e t a l.A s u r v e y o f9第3期郭思佳,等:中华蜜蜂细胞吞噬与包囊作用相关基因全长转录本鉴定及分析。

陕西师范大学第十届挑战杯大学生课外学术科技作品竞赛

陕西师范大学第十届挑战杯大学生课外学术科技作品竞赛
韩笑(研究生)
政治经济学院
53.
《历史学专业课程与教学改革刍议——以陕西师范大学历史系为例》
江学嘉(本科)
历史文化学院
54.
《陕西历史博物馆临时展厅对观众疲劳度调节及其相关作用》
孔艺冰(本科)
历史文化学院
55.
《神圣与世俗:转型期阿訇社会角色变迁的实证研究—以宁夏海原县为例》
闫宇晓(研究生)
政治经济学院
生命科学学院
41.
《燃煤电厂粉煤灰及底灰的天然放射性水平》
李丽(本科)
旅游与环境学院
42.
《PM2.5扩散模型及长期预测——以西安市为例》
彭发(本科)
数学与信息科学学院
43.
《对西安市雾霾治理方案的探究》
张莹(本科)
数学与信息科学学院
44.
《校园植物管理信息系统建设——以陕西师范大学雁塔校区为例》
许春燕(本科)
刘欢(本科)
数学与信息科学学院
49.
《农村小学中华优秀传统文化教育的现状与对策》
王孟飞(本科)
历史文化学院
50.
《陕西面食的文化营销推广——以岐山面为例的调查》
董雅娜(本科)
历史文化学院
51.
《西魏北周时期同州地位的变迁》
李兆宇(本科)
历史文化学院
52.
《陕西省廉政文化建设实践活动群众宣传的反馈调查》
贺彤(本科)
物理学与信息技术学院
71.
《高校教材循环方案探究》
李程(本科)
数学与信息科学学院
72.
《大学生基本生存能力调查研究——以西安市部分高校为例》
赵卫利(本科)
数学与信息科学学院
73.
《关于大学生参与科研创新活动的调研分析——以陕西师范大学为例》

用叶圆片法测算红薯叶的光饱和点和光补偿点

用叶圆片法测算红薯叶的光饱和点和光补偿点

中学生物学Middle School Biology第36卷第10期2020 年Vol.36 No.102020文件编号:1003 - 7586(2020 )10 - 0038 - 03用叶圆片法测算红薯叶的光饱和点和光补偿点易任远'曾峰?(1•湖南师范大学附属中学 湖南长沙 410006)(2.湖南省教育科学研究院湖南长沙410005)摘要本研究定量分析红薯叶圆片在不同光照强度下的浮起时长,绘制光照强度一浮起时长倒数的 曲线,再对光饱和点前的数据进行线性拟合,测算红薯叶的光补偿点。

通过与光合作用测量系统测得结果进行比较分析,引导学生建构重要概念,发展科学思维。

关键词红薯叶叶圆片法光饱和点光补偿点高中生物学实验中图分类号G633. 91 文献标志码B1 前言“探究环境因素对光合作用强度的影响”是《普通 高中生物学课程标准(2017年版)》要求开展的实验,也是人教社2019年版生物学《必修1 •分子与细胞》中第五章第四节的内容。

教材中的方案将装有叶圆片 的烧杯放在强、中、弱3种光照下,比较同一时间段内 各烧杯中叶圆片浮起的数量。

在实际操作过程中,强 光照下的两组叶圆片尽管所在的烧杯有一定的距离,本文是人民教育出版社课程教材研究所''十三五”课题“核心素养视域下高中生物实验教学现状分析与对策研究”(课题编号为KC2019-041)和湖南师范大学附属中学2019年度教育科学规划课题“2019年人民教 育出版社高中生物新教材实验指导微课的校本化开发”(课题编号为FZJK19B18)的研究成果。

浮起的时间段也会非常集中,而中、弱光照下,离光源越远的叶圆片浮起的越晚。

这个现象引起了笔者的 注意,于是和学生一起用量化分析、数学建模的方法,进行了以下实验,对这一现象进行了深度探究。

2材料与方法2.1材料和试剂菜市场购买的红薯叶、质量分数为2%的碳酸氢 钠溶液。

2.2 仪器100 W 白炽台灯、数字照度计、Li- 6400便携式光合作用测量系统、计时器、打孔器、20 mL 注射器、50 mL烧杯。

受体型酪氨酸激酶trkb参和前列...

受体型酪氨酸激酶trkb参和前列...

受体型酪氨酸激酶TrkB参与前列腺肿瘤发生的机制研究及Sur-D71A显性负突变体诱导肿瘤细胞凋亡的分子机制博士研究生:李建华导师:王禾教授第四军医大学西京医院泌尿外科,西安 710032中文摘要前列腺癌为老年男性常见疾病。

全球范围居男性癌症发病率第3位,病死率第6位,在美国则分别居男性癌症发病率第1位,病死率第2位。

我国前列腺癌发病率虽远低于欧美国家,但近年随着前列腺癌检出率的提高、人口老龄化及生活习惯的改变,发病率呈明显增加趋势,目前已经成为泌尿系统除膀胱癌和肾癌以外的第3大恶性肿瘤,并有逐渐接近膀胱癌和肾癌的趋势。

有关前列腺癌诊断和治疗的研究已经成为泌尿外科的重要研究课题。

目前普遍的观点认为从正常前列腺组织发展到前列腺癌经历了前列腺上皮细胞内瘤、局部前列腺癌、侵袭性前列腺癌和转移性前列腺癌等几个阶段。

对于晚期的前列腺癌一般采用内分泌治疗,大多数患者起初都对内分泌治疗有效,但经过中位时间14~30个月后,几乎所有患者病变都将逐渐发展为雄激素非依赖性前列腺癌。

目前,临床上尚无有效的方法来治疗,病死率高。

只有从肿瘤的发生发展的分子机制方面来治疗恶性肿瘤,才是彻底根治的唯一途径。

因此基因治疗目前成为前列腺癌治疗的选择之一。

本论文以针-3-对前列腺癌的基因治疗方法和前列腺癌发生、发展以及预后评价相关新分子的研究为切入点,对两方面的内容进行了较为深入的实验研究。

第一部分是关于受体型酪氨酸激酶 TrkB参与前列腺癌发生与发展进程分子机制的研究;第二部分是关于我课题组前期发现的一个凋亡诱导分子—Survivin显性负突变分子Sur-D71A诱导前列腺癌细胞凋亡分子机制的研究。

TrkB是一种受体型酪氨酸激酶,属于Trk神经营养因子受体家族,其基因表达产物通过与其配体脑衍生营养因子(BDNF)相互作用诱导神经系统细胞的持续性增殖、活化及抵抗外源凋亡刺激因素引起的细胞死亡。

近年来发现TrkB及其配体BDNF在多种肿瘤中的表达存在异常,其过量表达高度提示与肿瘤细胞的增殖和转移密切相关,但在前列腺癌方面的研究却为数不多。

生命科学学院开设研究生扫描电镜课程的探索

生命科学学院开设研究生扫描电镜课程的探索

学法教法研究高等教育课程教育研究生命科学学院开设研究生扫描电镜课程的探索谢丽李海燕(兰州大学生命科学学院研究实验中心甘肃兰州730000)【摘要】作为对超微结构进行研究的一种重要手段,扫描电子显微镜在生命科学领域的应用受到高度重视。

作者以“突出应用,简化原理、立足平台仪器”为原则,从课程目标、课程内容、课程完成的情况等方面,探索为生命科学学院研究生开设扫描电镜课程的创新方法。

【关键词】扫描电子显微镜生命科学研究生课程创新方法【基金项目】由“中央高校基本科研业务费专项资金”重点研究基地团队建设项目资助的,项目编号:lzujbky-2014-bt05。

【中图分类号】G64【文献标识码】A 【文章编号】2095-3089(2016)06-0016-02生命科学的理论和应用归根到底来自实验,并由实验检验。

近30年来,生命科学的发展极其迅速,取得了一系列令人瞩目的成就。

其中,大型精密仪器的作用功不可没。

大型仪器为研究生命物质的作用和功能提供了定位、定性、定量,甚至实时的数据和图片,为生命科学的重大发现提供着强有力的实验证据,决定性地引导着相关研究领域的发展方向。

扫描电子显微镜是一种用电子束扫描样品表面,通过电子束与样品的相互作用产生多种效应,从而获取样品表面放大的形貌像。

这个像是在样品被扫描时按时序建立起来的,其放大倍率从几倍到几十万倍连续可调,景深大,分辨率高,保真度好。

在立体、清晰、多观察角度等方面均较普通光学显微镜有不可比拟的优越性。

作为对超微结构进行研究的一种重要手段,在生命科学研究领域的应用受到高度重视。

因此,为研究生设置扫描电镜课的重要意义不言而喻。

1.课程内容的设置本门课程是以兰州大学研究型生命科学大型仪器共享平台为依托,授课所使用的Hitachi 3400N 型扫描电镜隶属于该平台,授课团队的各成员均来自于该平台,且具有较丰富的生命科学的教育和科研背景,授课的对象也是生命科学各专业的研究生。

211099477_Sigma-1受体在神经病理性疼痛大鼠内质网应激中的作用

211099477_Sigma-1受体在神经病理性疼痛大鼠内质网应激中的作用

Tianjin Med J,April 2023,Vol.51No.4Sigma-1受体在神经病理性疼痛大鼠内质网应激中的作用莫少娥,刘可鹏,傅文,谢酬勤,郁冬玲,陈实,蓝雨雁△摘要:目的探讨sigma-1受体(sig-1R )对神经病理性疼痛(NP )大鼠内质网应激的作用。

方法将鞘内置管成功的SPF 级雄性SD 大鼠24只按随机数字表法分为假手术组(S 组)、NP 模型组(C 组)、sig-1R 抑制剂BD1047干预组(B 组),每组8只。

C 组和B 组采用坐骨神经慢性挤压性损伤法建立NP 模型。

术后第4、5、6天,S 组和C 组鞘内注射生理盐水20µL ,B 组鞘内注射BD1047(120µmol/L )20µL ,1次/d 。

于术前1d 及术后第1、3、5、7天检测术侧足机械缩足反应阈(MWT )。

采用Westen blot 和免疫荧光染色法检测背根神经元(DRG )sig-1R 、免疫球蛋白重链结合蛋白(BIP )、转录活化因子4(ATF4)、C/EBP 同源蛋白(CHOP )的表达情况;采用HE 染色法观察DRG 形态大小及病理改变;采用透射电镜观察DRG 内质网改变。

结果与S 组比较,C 组大鼠术后各时间点术侧足MWT 明显下降,DRG 病理损伤和内质网破坏明显加重,sig-1R 、BIP 、ATF4、CHOP 表达均上调(P <0.05);与C 组比较,B 组大鼠术后第5、7天MWT 升高,DRG 病理损伤和内质网破坏减轻,sig-1R 、BIP 、ATF4、CHOP 表达均下调(P <0.05)。

结论sig-1R 参与了大鼠神经病理性疼痛的过程,其机制可能与抑制DRG 内质网应激有关。

关键词:神经痛;内质网应激;免疫球蛋白重链;sigma-1受体;背根神经元中图分类号:R614,R745文献标志码:A DOI :10.11958/20221491The role of sigma-1receptor in endoplasmic reticulum stress in neuropathic pain ratsMO Shaoe,LIU Kepeng,FU Wen,XIE Chouqin,YU Dongling,CHEN Shi,LAN Yuyan △Department of Anesthesiology,the First Affiliated Hospital of Guangxi Medical University,Nanning 530021,China△Corresponding Author E-mail:Abstract:Objective To investigate the role of sigma-1receptor (sig-1R)in endoplasmic reticulum stress in neuropathic pain (NP)rats.Methods Twenty-four SPF male SD rats with successful sheath tube were divided into the sham operation group (group S),the neuropathic pain model group (group C)and the BD1047intervention group (group B)according to random number table,with 8rats in each group.Chronic crush injury of sciatic nerve was used to establish NP model.On the 4th,5th and 6th day after operation,normal saline 20µL was injected intrathecally in the group S and the group C,and BD1047(120µmol/L)20µL was injected intrathecally in the group B once a day.The mechanical foot withdrawal response threshold (MWT)of the surgical side foot was measured on the first day before operation and on the first,3rd,5th and 7th day after operation.Western blot assay and immunofluorescence staining were used to detect the expression levels of sig-1R,glucose-regulated protein (BIP),activating transcription factor 4(ATF4)and C/EBP-homologous protein (CHOP)in dorsal root neurons (DRG).HE staining was used to observe the morphological size and pathological changes of DRG.Changes of endoplasmic reticulum in DRG were observed by scanning electron microscopy.Results Compared with the group S,intraoperative parapodum MWT was significantly decreased (P <0.05),and pathological injury and endoplasmic reticulum destruction of DRG were significantly aggravated.Expressions of sig-1R,BIP,ATF4and CHOP were up-regulated in the group C after CCI (P <0.05).Compared with the group C,the MWT was increased on the 5th and 7th day after CCI in the group B (P <0.05),and the expressions of sig-1R,BIP,ATF4and CHOP were down-regulated (P <0.05).The pathological injury of DRG was improved.Conclusion sig-1R are involved in the neuropathic pain in rats,and the mechanism may be related to the inhibition of endoplasmic reticulum stress in dorsal root neurons.Key words:neuralgia;endoplasmic reticulum stress;immunoglobulin heavy chains;sigma-1receptor;dorsal root neurons基金项目:广西自然科学基金(2018GXNSFAA281101);广西研究生教育创新计划项目(YCSW2021120);广西医疗卫生适宜技术开发与推广应用项目(S2019109)作者单位:广西医科大学第一附属医院麻醉科(邮编530021)作者简介:莫少娥(1995),女,硕士在读,主要从事神经病理性疼痛机制方面研究。

SERPINE1在胃癌中的免疫浸润和ceRNA网络的综合分析

SERPINE1在胃癌中的免疫浸润和ceRNA网络的综合分析

doi:10.3969/j.issn.1000-484X.2023.11.015·论著/肿瘤免疫学·SERPINE1在胃癌中的免疫浸润和ceRNA网络的综合分析①时谨代德柱宋旭东郭霞梅封紫玉陶国全(南京医科大学附属淮安第一医院胃肠外科,淮安 223300)中图分类号R735.2 文献标志码 A 文章编号1000-484X(2023)11-2326-09[摘要]目的:探讨纤溶酶原激活物抑制剂1型(SERPINE1)在胃癌中的生物学作用,进一步阐明胃癌发病机制,为今后实施个体化预防及早期诊治提供参考。

方法:通过多个数据库分析SERPINE1在泛癌和胃癌中的表达并进行临床病理学分析。

使用R和STRING对SERPINE1共表达基因进行GO/KEGG功能富集和PPI分析。

通过TIMER数据库和CIBERSORT分析胃癌组织SERPINE1表达与免疫浸润的联系。

多个在线网站构建符合ceRNA假说的调控网络。

结果:SERPINE1在包括胃癌在内的多种肿瘤中高表达,与临床病理特征密切相关。

GO/KEGG功能富集分析提示SERPINE1与胰腺分泌、表皮生长、表皮细胞分化及角质形成细胞分化通路密切相关。

STRING数据库分析表明SERPINE1及相关蛋白(PLAT)在胃癌中存在差异表达;PLAT低表达的胃癌患者总生存期较高。

PPI显示SERPINE1与PLAT密切相关,在胃癌发展中可能发挥重要作用。

TIMER数据库及CIBERSORT分析显示SERPINE1表达与多种免疫细胞浸润相关。

通过网站相关分析构建了胃癌中9个可能的ceRNA网络。

结论:SERPINE1可作为胃癌患者诊断及预后的生物标志物,可能与肿瘤免疫浸润和ceRNA网络有关。

[关键词]SERPINE1;胃癌;生物信息学;免疫浸润;ceRNAComprehensive analysis of immune infiltration and ceRNA network of SERPINE1 in gastric cancerSHI Jin,DAI Dezhu,SONG Xudong,GUO Xiamei,FENG Ziyu,TAO Guoquan. Department of Gastrointestinal Surgery,the Affiliated Huai'an No.1 People's Hospital of Nanjing Medical University, Huai'an 223300, China [Abstract]Objective:To investigate biological role of SERPINE1 (plasminogen activator inhibitor type 1) in gastric cancer,in order to further clarify pathogenesis of gastric cancer and provide important reference for individualized prevention and early diagno‐sis and treatment in future. Methods:SERPINE1 expression in generalized and gastric cancer was analyzed from multiple databases and clinicopathological analysis. GO/KEGG function enrichment and PPI analysis of SERPINE1 co-expressed genes were performed using R and STRING. Association between SERPINE1 expression and immune infiltration in gastric cancer tissues was analyzed by TIMER database and CIBERSORT. Several online websites constructed regulatory networks conforming to ceRNA hypothesis. Results:SERPINE1 was highly expressed in a variety of tumors, including gastric cancer, and closely associated with clinicopathological fea‐tures. GO/KEGG functional enrichment analysis suggested that SERPINE1 was closely related to pancreatic secretion,epidermal growth,epidermal cell differentiation and keratinocyte differentiation pathways. STRING database analysis showed that SERPINE1 and related protein (PLAT) were differentially expressed in gastric cancer. Gastric cancer patients with low PLAT expression had higher overall survival. PPI showed that SERPINE1 was closely associated with PLAT, which might play an important role in development of gastric cancer. TIMER database and CIBERSORT analysis showed that SERPINE1 expression was associated with infiltration of various immune cells. Nine possible ceRNA networks in gastric cancer were constructed through website correlation analysis. Conclusion:SERPINE1 can be used as a biomarker for diagnosis and treatment of gastric cancer patients, which may associate with tumor immune infiltration and ceRNA network.[Key words]SERPINE1;Gastric cancer;Bioinformatics;Immune infiltration;ceRNA①本文为国家自然科学基金项目(81773538)。

生物体内有四类大分子

生物体内有四类大分子

博士□兽医硕士专业学位□硕士√农业推广硕士专业学位□同等学力在职申请学位□中职教师攻读硕士学位□工程硕士专业学位□高校教师攻读硕士学位□风景园林硕士专业学位□西北农林科技大学研究生课程考试试卷(课程名称:生物有机化学)学位课□选修课√补修课□研究生年级、姓名 08级王博所在学院及专业理学院应用化学任课教师姓名周乐考试日期考试成绩评卷教师签字处生物有机化学与新药研发生物学和有机化学是相辅相成,互相影响,互相推动的两门学科。

生命科学中的许多重要发现和突破,都包含了大量与有机化学有关的研究工作。

有机化学在几百年前就已经达到了分子水平,而生命科学则是在沃森和克里克发明DNA双螺旋结构之后才真正意义上的进入到了分子生物学水平并有了突飞猛进的发展。

生命过程中各种生物大分子复杂的变化及其调控作用的分子机制和化学本质等许多根本性的问题,已经摆在化学家们的面前。

这既是一种挑战,同时又是一个重要的机遇,使生命科学和有机化学能在更深的层次上密切结合,相互促进,共同发展。

从这个意义上讲,生物有机化学的产生和发展,既是现代有机化学和生命科学发展的必然结果,也是学科进一步发展的需要。

我认为生命科学和有机化学的发展有两个最重要目的,首先是满足人类探索自身,探索生命奥秘的求知欲。

生物体内的各种大分子已经逐渐揭开其神秘的面纱,生物体内有四类大分子:糖类、脂质、蛋白质、核酸。

糖类广泛的存在于生物界,糖类物质占植物干重的85%-90%,是生命活动的能量来源。

糖类是地球上数量最多的一类有机化合物,地球上糖类物质的根本来源是绿色细胞进行的光合作用。

脂质是脂肪酸和醇说形成的酯类及其衍生物。

生物膜骨架就是由磷脂类构成的双分子层。

蛋白质是生物体内最重要的一类生物大分子,是生命体的组成成分。

蛋白质由氨基酸组成,蛋白质具有催化、调节代谢、转运、储存物质、防御病原菌入侵等生理功能。

而目前世界上生命科学领域研究最为活跃的部分就是核酸。

核酸自从发现之日起就被科学家认为可能在细胞发育中发挥极为重要的作用。

自然科学课程思政元素的提取与运用

自然科学课程思政元素的提取与运用

2016年12月,习近平总书记在全国高校思想政治工作会议上指出:“要用好课堂教学这个主渠道,思想政治理论课要坚持在改进中加强,提升思想政治教育亲和力和针对性,满足学生成长发展需求和期待,其他各门课都要守好一段渠、种好责任田,使各类课程与思想政治理论课同向同行,形成协同效应。

”[1]习近平总书记的讲话给目前的学校教育提出了明确的要求,立德树人成为“为谁培养人”“如何培养人”“培养什么样的人”的核心要素。

但是,由于认识、方法、队伍、措施、效果等方面的问题[2],在实际实施中课程思政远没有达到预期的效果,尤其是讲授自然科学的教师,感觉无从入手,无法灵活地穿插思想政治教育内容,讲起来很生硬,出现“为了思政而思政”的尴尬局面。

更多的教师在怕讲错的思想指导下,采取回避的态度,尽量不去涉及。

教师们不知道从哪里提取思想政治元素,不会灵活开展思想政治教育,认为课程思政是人文学科的范畴,讲授自然科学无法开展思想政治教育。

事实上,自然科学因其独特的自然属性而具有较强的思想政治教育功能,有些思想政治教育功能更是专门的思想政治课程替代不了的。

2020年5月,教育部印发了《高等学校课程思政建设指导纲要》,明确了课程思政的战略地位、目标要求和内容重点,并详细规划了各类专业课程进行课程思政建设的方法和指导意见[3]。

那么,如何更好地贯彻教育部的精神,充分发挥自然科学课程思政的功能呢?多年的教学经验告诉我们,可以从以下几个方面开展工作。

一、自然科学课程思政元素的提取原则课程思政不能为了思政而思政,要在教授知识时顺其自然地达到育人的目的,解决好专业教育和思想政治教育“两张皮”的问题[3]。

1.内容和形式的统一。

教师要“守好一段渠、种好责任田”,就要了解责任田,明确思想政治的主要内容。

教书育人是教师的天职,利用自然科学的内容教书育人,实现内容和形式的统一。

其中,内容是教书育人,形式是课程思政。

思想政治元素提取时必须严格依据课程内容,从具体的科学知识出发,结合生活实际教书育人[3]。

任毅发表论文目录-陕西师范大学生命科学学院SchoolOf…

任毅发表论文目录-陕西师范大学生命科学学院SchoolOf…

任毅发表论文目录-陕西师范大学生命科学学院SchoolOf…任毅十年来的成果一、社会兼职1. 国家林业局保护司“大熊猫保护管理咨询专家委员会”成员(自2003年至今);2. 国家林业局“全国第四次大熊猫调查专家委员会”成员;3. 《Journal of Systematics and Evolution》(原《植物分类学报》)副主编;4. 《植物学报》编委;5. WWF西安办公室“秦岭大熊猫保护项目专家顾问委员会”委员;6. DIWPA(Biodiversity in Western Pacific and Asia, 西太平洋和亚洲地区生物多样性组织)通讯委员(自2000年至今)。

二、发表论文(*为通讯作者)共发表论文45篇:其中第一作者或通讯作者SCI 23篇(其中作为共同通讯作者在PNAS上发表的论文具有很大的影响力),权威、SCIE、核心22篇。

Ren Y., Li Z.-J., Lei Y.-J. 2003. Achene and seed abortion contribute to the rarity of Kingdonia uniflora. Israel Journ. of Plant Sciences 51(1):39-44. (SCI源期刊)Ren Y., 2003, Establishment of a primary monitoring and assessment system in giant panda’s habitat in Changqing National Nature Reserve of China. Proceedings, International Symposium of the Kanazawa University 21st Century COE Program.1:443-446Ren Y., Li Z.-J., Hu Z.-H. 2003. Approaches to the systematic position of Circaeaster based on the morphological data. 西北植物学报23(7):1091-1097.Ren Y., Li Y., Dang G.-D.. 2003. A new species of Bashania(Poaceae: Bambusoideae) from Mt. Qinling, Shaanxi, China. Novon 13(4):473-476.Ren Y., Li Z.-J., Chang H.-L., Lei Y.-J., Lu A.-M. 2004. Floral Development of Kingdonia (Ranunculaceae s. l., Ranunculales). Plant Sys. Evol.247(3-4):145-153.(SCI)田先华,任毅*,杜喜春,冯鲁田. 2004.《秦岭植物志》种子植物补遗。

《秦岭植物志》种子植物补遗——被子植物门的双子叶植物

《秦岭植物志》种子植物补遗——被子植物门的双子叶植物

《秦岭植物志》种子植物补遗——被子植物门的双子叶植物李海宁;田先华;任毅
【期刊名称】《西北植物学报》
【年(卷),期】2006(26)12
【摘要】报道了<秦岭植物志>遗漏的5种、2变种植物,它们分属于6科、7属,分别为:菊科的同花母菊、石竹科的须弥孩儿参和无毛漆姑草、禾本科的蒙古穗三毛(变种)、十字花科的毛葶苈、蓼科的狭叶圆穗蓼(变种)和败酱科的小花缬草.【总页数】3页(P2580-2582)
【作者】李海宁;田先华;任毅
【作者单位】陕西师范大学,生命科学学院,教育部药用植物资源与天然药物化学重点实验室,西安,710062;陕西师范大学,生命科学学院,教育部药用植物资源与天然药物化学重点实验室,西安,710062;陕西师范大学,生命科学学院,教育部药用植物资源与天然药物化学重点实验室,西安,710062
【正文语种】中文
【中图分类】Q949.4
【相关文献】
1.《秦岭植物志》种子植物补遗——被子植物门的双子叶植物 [J], 赵亮;刘虎祥;田先华;任毅
2.《秦岭植物志》种子植物补遗--被子植物门的双子叶植物(1) [J], 田先华;任毅;杜喜春;冯鲁田
3.秦岭种子植物补遗--裸子植物门和被子植物门的单子叶植物 [J], 任毅
4.江苏沿海地区原色种子植物志——裸子植物和双子叶植物离瓣花类(精装,全彩)[J],
5.《河南植物志》双子叶植物增补(一) [J], 杨相甫;李发启;师学珍;王太霞
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。

融入安全教育的研究生仪器应用课程改革实践——以陕西师范大学生物学专业为例

融入安全教育的研究生仪器应用课程改革实践——以陕西师范大学生物学专业为例

[收稿时间]2020-11-18[基金项目]陕西师范大学研究生教育教学改革研究项目“生物实验室安全及大型仪器应用优质课程项目”(GERP-18-09)。

[作者简介]孙燕(1975—),女,河南人,博士,副教授,陕西师范大学生命科学学院副院长,陕西省毒理学会副理事长,陕西省微生物学学会常务理事,研究方向:实验室管理、实验室安全教育、大型仪器共享平台管理等。

2022年7University Education[摘要]高校研究生教育质量是近年高校在深化教育改革方面的关注点。

然而,生物学等实验学科的部分改革重视学生科研素质、科研能力的提升但不够重视学生在实验室安全方面的教育,近年高校频发的实验室安全事故与此不无关系。

基于此,陕西师范大学生物学专业在生物实验室安全及大型仪器应用研究生优质课程建设项目实施过程中,构建模块化、专题式教学体系,探索与教学内容相符的课堂教学及实践教学新模式,实现以课程为载体促使学生牢固树立安全意识、严格规范安全行为的教学目标。

这个面向研究生的提升生物实验室安全意识的课程建设与教学实践,为安全、有序、高效地开展实验室科研工作提供了有力支撑。

[关键词]安全意识;实验室安全;研究生教育;生物学;课程改革[中图分类号]G643[文献标识码]A [文章编号]2095-3437(2022)07-0244-03党的十九大报告提出“加快一流大学和一流学科建设,实现高等教育内涵式发展”,研究生教育处于我国教育体系的顶端,与本科生相比,研究生具有深度参与科研活动的显著特点,特别是生物学这样的实验学科,因此生物学一流学科建设与其研究生教育质量有着密切关系[1]。

然而,目前不少高校的生物学科研究生教育,重视科研素质、科研能力培养,却不够重视实验室安全意识的培养和大型仪器安全操作规范的培训,导致发生了不少安全事故,比如2018年北京交通大学、2017年复旦大学和2015年清华大学的实验室都发生过爆炸事故。

秦岭大熊猫主食竹一新纪录——神农箭竹

秦岭大熊猫主食竹一新纪录——神农箭竹

秦岭大熊猫主食竹一新纪录——神农箭竹张雨曲;任毅【摘要】报道了秦岭大熊猫主食竹新纪录一种:神农箭竹(Fargesia murielae (Gamble) Yi),该竹种已有的分布记录仅见于湖北神农架地区.本研究发现该竹种还广泛分布于秦岭中段陕西平河梁国家级自然保护区、长安光头山及柞水牛背梁自然保护区等地.特别是平河梁保护区地处秦岭大熊猫栖息地的最东部,是秦岭大熊猫平河梁区域种群的分布核心地带,而神农箭竹为该区域较高海拔分布的唯一竹种,可以确定其为该区域大熊猫主食竹.【期刊名称】《陕西师范大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2016(044)001【总页数】3页(P78-80)【关键词】大熊猫主食竹;神农箭竹;新纪录;秦岭山区【作者】张雨曲;任毅【作者单位】陕西师范大学生命科学学院,陕西西安710119;陕西师范大学生命科学学院,陕西西安710119【正文语种】中文【中图分类】O62.25大熊猫是我国的国宝,也是地球上最为濒危的物种之一,加上它不可取代的观赏价值,受到了全世界人民的喜爱。

秦岭地区是大熊猫的主要分布地区之一,更是大熊猫秦岭亚种的唯一分布区[1-5]。

大熊猫以竹子为食,因此其主食竹的研究,是大熊猫保护工作的重要组成部分。

根据现有资料[6-10],秦岭大熊猫的主食竹主要为巴山木竹属(Bashania Keng f. et Yi)和箭竹属(Fargesia Franch.)竹种,巴山木竹属竹种分布于较低海拔区域,而箭竹属竹种分布于较高海拔区域,箭竹属大熊猫主食竹有毛龙头竹(F. decurvata J. L. Lu)、华西箭竹(F. nitida (Mitford) Keng f. et Yi)和秦岭箭竹(F. qinlingensis Yi et J.X. Shao)。

作者在调查中发现,秦岭大熊猫主食竹还有神农箭竹(F. murielae(Gamble) Yi)。

该竹种广泛分布于陕西平河梁国家级自然保护区,是保护区较高海拔分布的唯一竹种。

内科管理人员岗位竞聘演讲汇报报告PPT

内科管理人员岗位竞聘演讲汇报报告PPT

团队协作能力强
单击此处添加简短说明,添加简短文字, 具体文字添加此处。
操作方式科学
单击此处添加简短说明,添加简短文字, 具体文字添加此处。
目标清晰明确
单击此处添加简短说明,添加简短文字, 具体文字添加此处。
02
解决问题的能力
SOLVING ISSUES
1
2
3 4
案例一
点击输入简要文字内容,文字内容需概括精炼,不用 多余的文字修饰,言简意赅的说明该项内容。
远见力
决策力
创新力 执行力
感召力
1.执行公司的各项制度和流程
2.全面负责公司日常管理工作
3.团队建设与人才的培养
点击输入简要文字内容,文字内容需概括精炼, 不用多余的文字修饰,言简意赅的说明分项内容。 点击输入简要文字内容,文字内容需概括精炼,不 用多余的文字修饰,言简意赅的说明分项内容……
点击输入简要文字内容,文字内容需概括精炼, 不用多余的文字修饰,言简意赅的说明分项内容……
能正常交流,此处添加详细文本描述,建议 与标题相关并符合整体语言风格。
岗位认知
POSTCOMNTVE
02
岗位认知
POST COGNITION
主要任务
单击此处添加简短说明,添加简短文字, 具体文字添加此处。
时间进度
单击此处添加简短说明,添加简短文字, 具体文字添加此处。
效益预测
单击此处添加简短说明,添加简短文字, 具体文字添加此处。
01
教育经历
Education experience
教育经历
毕业于 (北京清华大学) 在此录入上述图表的描述说明,在此录入上述图表的描述说明。
毕业于 (美国加州理工)在此录入上述图表的描述说明,在此 录入上述图表的描述说明。
  1. 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
  2. 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
  3. 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。

任毅十年来的成果一、社会兼职1. 国家林业局保护司“大熊猫保护管理咨询专家委员会”成员(自2003年至今);2. 国家林业局“全国第四次大熊猫调查专家委员会”成员;3. 《Journal of Systematics and Evolution》(原《植物分类学报》)副主编;4. 《植物学报》编委;5. WWF西安办公室“秦岭大熊猫保护项目专家顾问委员会”委员;6. DIWPA(Biodiversity in Western Pacific and Asia, 西太平洋和亚洲地区生物多样性组织)通讯委员(自2000年至今)。

二、发表论文(*为通讯作者)共发表论文45篇:其中第一作者或通讯作者SCI 23篇(其中作为共同通讯作者在PNAS上发表的论文具有很大的影响力),权威、SCIE、核心22篇。

Ren Y., Li Z.-J., Lei Y.-J. 2003. Achene and seed abortion contribute to the rarity of Kingdonia uniflora. Israel Journ. of Plant Sciences 51(1):39-44. (SCI源期刊)Ren Y., 2003, Establishment of a primary monitoring and assessment system in giant panda’s habitat in Changqing National Nature Reserve of China. Proceedings, International Symposium of the Kanazawa University 21st Century COE Program.1:443-446Ren Y., Li Z.-J., Hu Z.-H. 2003. Approaches to the systematic position of Circaeaster based on the morphological data. 西北植物学报23(7):1091-1097.Ren Y., Li Y., Dang G.-D.. 2003. A new species of Bashania (Poaceae: Bambusoideae) from Mt. Qinling, Shaanxi, China. Novon 13(4):473-476.Ren Y., Li Z.-J., Chang H.-L., Lei Y.-J., Lu A.-M. 2004. Floral Development of Kingdonia (Ranunculaceae s. l., Ranunculales). Plant Sys. Evol.247(3-4):145-153.(SCI)田先华,任毅*,杜喜春,冯鲁田. 2004.《秦岭植物志》种子植物补遗。

西北植物学报24(4):678-682.Ren Y., Liu Xi., Ge S. 2005. Low genetic diversity among populations of the rare Chinese endemic Kingdonia uniflora revealed by RAPD-analysis. Israel Journ. of Plant Sciences 53(1):65-73.(SCI源期刊)Chang H.-L., Ren* Y., Lu A.-M. 2005. Floral Morphogenesis of Anemone rivularis Buch.-Ham. ex DC. var. flore-minore Maxim. (Ranunculaceae) with Special Emphasis on Androecium Development Sequence. Journ. Integ. Plant Biol. (植物学报) 47(1):257-263.(权威期刊)田先华,李红芳,庞承义,任毅*. 2005. 领春木(领春木科)导管穿孔板中纹孔膜残余的观察. 西北植物学报25(7):1345-1349.Du X.-C., Ren* Y.2005. A new species of Hypericum(Glusiaceae) from Shaanxi province, China. Novon 15(2):274-276. (SCIE)张阿娟, 任毅*, 田先华, 张小卉. 2005. 类叶升麻(毛茛科)次生木质部管状分子的研究. 西北植物学报25(6) :2363-2370.宋春慧, 任毅*, 田先华, 张小卉. 2005. 黄三七属(毛茛科)次生木质部导管穿孔板的研究. 云南植物研究.Zhang X.-H., Ren* Y., Tian X.-H., Pan L.-Z. 2005. Anatomical studies on Sinofranchetia chinensis (Lardizabalaceae) and their systematic significance.Botanical Journal of the Linnean Society149:271–281. (SCI源期刊)Tian X.-H., Zhang L., Ren Y. 2006. Morphogenesis of flowers and inflorescences of Circaeaster (Circaeasteraceae, Ranunculales). Plant Syst. Evol.256: 89–96.(SCI 源期刊)贺海霞,张小玲,任毅*. 2006. 独叶草的不育雄蕊、花被片和可育雄蕊对传粉昆虫和传粉的影响. 云南植物研究28(4):371-377.刘萍,宋磊, 任毅*,田先华,张小卉. 2006. 铁筷子(毛茛科)营养器官的结构及其系统学意义. 西北植物学报26(11):2208-2213.赵亮, 田先华, 任毅*. 2006. 秦岭毛茛属植物(毛茛科)的分类学研究. 西北植物学报26(11): 2360-2366.李海宁,田先华,任毅*. 2006. 《秦岭植物志》种子植物补遗——被子植物门的双子叶植物. 西北植物学报26(12):2580-2582.辜天琪,任毅*. 2007. 黄连属Coptis(毛茛科)花的形态发生研究. 植物学通报24(1):80-86.王自芬, 任毅*. 2007. 被子植物胚珠研究进展. 植物学通报24 (1):49-59.Chen L., Ren* Y., Endress P. K., Tian X.-H., Zhang X.-H. 2007. Floral organogenesis in Tetracentron sinense (Trochodendraceae) and its systematic significance. Plant Systematics and Evolution 264: 183-193. (SCI源期刊)Ren Y., Li H.-F., Zhao L., Endress P. K. 2007. Floral morphogenesis in Euptelea (Eupteleaceae, Ranunculales). Annals of Botany 100(2):185-193. (SCI源期刊)Tian X.-H., Zhao L., Ren Y., Zhang X.-H. 2007. Number of floral organs in Circaeaster agrestis (Circaeasteraceae) and possible homeosis among floral organs.Plant Systematics and Evolution 265: 259-265.Yan X.-L., Ren* Y., Tian X.-H., Zhang X.-H. 2007. Morphogenesis of pistillate flowers of Cercidiphyllum japonicum (Cercidiphylleceae). Journ. Integ. Plant Biol.49: (9): 1400–1408.(权威)Ren Y., Cheng L., Tian X.-H., Zhang X.-H., Lu A.-M. 2007. Discovery of vessels in Tetracentron (Trochodendraceae) and its systematic significance. Plant Systematics and Evolution 267: 155-161. (SCI源期刊)宋萍, 田先华, 任毅*. 2007. 驴蹄草属和金莲花属(毛茛科)花器官的形态发生及系统学意义. 植物分类学报45(6):769-782.(SCIE)赵亮, 刘虎祥, 田先华, 任毅*. 2007. 《秦岭植物志》种子植物补遗—被子植物门的双子叶植物. 西北植物学报 27(4): 0824-0826.Wang Z.-F., Ren* Y. 2008. Ovule Morphogenesis in Ranunculaceae and its Systematic Significance. Annals of Botany 101(3):447-462. (SCI源期刊)Li J., Ren* Y. 2008. Floral morphogenesis of Aristolochia L. (Aristolochiaceae). 西北植物学报28(2): 267-271.Zhang X.-H., Ren* Y. 2008. Floral morphology and development in Sargentodoxa (Lardizabalaceae). Int. J. Plant Sci. 169(9):1148–1158. (SCI源期刊)Ren Y., Chang H.-L., Tian X.-H., Song P., Endress P. K. 2009. Floral development in Adonideae (Ranunculaceae). Flora 204:506–517.Wang W., Lu A.-M., Ren Y., Endress M. E., Chen Z.-D. 2009. Phylogeny and classification of Ranunculales: Evidence from four molecular loci andmorphological data. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics 11:81–110. (SCI源期刊)Zhang X.-H., Ren* Y., Tian X.-H. 2009. Floral morphogenesis in Sinofranchetia (Lardizabalaceae) and its systematic significance. Botanical Journal of the Linnean Society 160: 82–92. (SCI源期刊)Ren Y., Chang H.-L., Endress P. K. 2010. Floral development in Anemoneae (Ranunculaceae). Botanical Journal of the Linnean Society 162: 77–100. (SCI源期刊)Du X.-C.,Ren Y*. 2010.A new species of Hydrocotyle (Hydrocotyleceae) from Shaanxi, China. Ann. Bot. Fennici 47: 403-407. (SCI源期刊)Ren Y., Gu T.-Q.,Chang H.-L. 2011. Floral development of Dichocarpum, Thalictrum, and Aquilegia (Thalictroideae, Ranunculaceae). Plant Syst. Evol. 292: 203–213.(SCI源期刊)Li H.-F., Ren* Y. 2011. The effect of SEM preparation on pit membrane remnants in vessel element end-walls of primitive angiosperms. Flora 206: 310–315. (SCI源期刊)Li H.-F., Chaw S.-M., Du C.-M., Ren* Y.2011. Vessel elements present in the secondary xylem of Trochodendron and Tetracentron (Trochodendraceae). Flora 206: 595-600. (SCI源期刊)Du X.-C., Ren* Y., Dang G.-D., Jeremy L. 2011. Distribution and plant community associations of the understory bamboo Fargesia qinlingensis in the Foping National Nature Reserve, China. Annals of Forest Sciences 68: 1197–1206. (SCI源期刊)Zhang* X.-H., Ren Y. 2011. Comparative floral development in Lardizabalaceae (Ranunculales). Botanical Journal of the Linnean Society 166: 171–184. (SCI源期刊)Zhao L., Liu P., Che X.-F., Wang W, Ren* Y. 2011. Floral organogenesis of Helleborus thibetanus and Nigella damascena (Ranunculaceae) and its systematic significance. Botanical Journal of the Linnean Society 166: 431–443. (SCI源期刊)Zhao L., Wang W., Ren* Y., Bachelier J. B. 2012. Floral development in Asteropyrum (Ranunculaceae): implication for its systematic position. Annales Botanici Fennici 49: 31-42.(SCI源期刊)Wang X.-M., Zhang P., Du Q.-G., He H.-X., Zhao L., Ren* Y., Endress P. K. 2012.Heterodichogamy in Kingdonia(Circaeasteraceae, Ranunculales). Annals of Botany 109: 1125-1132.(SCI源期刊)Zhao L., Bachelier J. B., Chang H.-L., Tian X.-H., Ren* Y. 2012. Inflorescence and floral development in Ranunculus and three allied genera in Ranunculeae (Ranunculoideae, Ranunculaceae). Plant Systematics and Evolution 298:1057–1071.(SCI源期刊)Zhang R., Guo C.-C., Zhang W.-G., Wang P.-P., Li L., Duan X.-S., Du Q.-G., Zhao L., Shan H.-Y., Hodges S. A., Kramer E. M., Ren* Y., Kong* H.-Z. 2013. Disruption of the petal identity gene APETALA3-3 is highly correlated with loss of petalswithin the buttercup family (Ranunculaceae). Proceedings of the National Academy of Sciences 110(13): 5074-5079.(SCI源期刊,通讯作者之一,IF=9.737)二、承担项目主持项目23项:其中国家自然科学基金4项、横向18项,参加国家自然科学基金重点项目1项、主持十一五科技支撑项目子课题1项,到校经费702.7万元。

相关文档
最新文档