鹳形目12种鸟类核c_mos基因_省略_NA基因序列分析及其系统发生研究_张国萍

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核基因在鸟类分子系统发育学研究中的应用

核基因在鸟类分子系统发育学研究中的应用张淑霞;杨晓君;杨岚;杨君兴;夏峰【期刊名称】《动物分类学报》【年(卷),期】2008(033)001【摘要】核基因作为一种新的遗传标记,近年来被广泛应用于鸟类分子系统发育研究中.核基因与线粒体基因位于不同的遗传载体上,因此被引入到系统发育学研究中为物种树的重建提供独立的证据.常用的外显子标记为重组激活基因1(RAG-1),重组激活基因2(RAG-2),癌基因c-myc,原癌基因c-mos,它们由于缓慢的进化速率而被用于鸟类高级分类阶元的系统学研究中.常用的内含子标记是β纤维蛋白原基因内含子7(β-fibrinogen intron7,β-fibint7),肌红蛋白基因内含子Ⅱ(myoglobin intionⅡ).内含子标记通常与线粒体序列联合使用,形成具有互补系统发育信号的数据集,应用于各种分类阶元的系统学研究中.【总页数】8页(P107-114)【作者】张淑霞;杨晓君;杨岚;杨君兴;夏峰【作者单位】中国科学院昆明动物研究所昆明 650223;云南省环境科学研究院昆明 650034;中国科学院昆明动物研究所昆明 650223;中国科学院昆明动物研究所昆明 650223;中国科学院昆明动物研究所昆明 650223;云南省环境科学研究院昆明 650034【正文语种】中文【中图分类】Q951【相关文献】1.基于核基因的无柄目分子系统发育研究 [J], 李咏琪;蔡月凤;沈思瑜;宋隽;阎斌伦;程汉良;申欣2.DNA在鸟类分子系统发育研究中的应用 [J], 马玉堃;牛黎明;国会艳3.基于核蛋白激酶基因内含子5序列研究雀形目18种鸟类分子系统发育关系 [J], 国会艳; 于慧鑫; 白素英; 马玉堃4.单拷贝核基因在昆虫分子系统学中的应用 [J], 马兰;黄原5.基于核蛋白激酶基因内含子5序列研究雀形目18种鸟类分子系统发育关系(英文) [J], 国会艳;于慧鑫;白素英;马玉堃因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

不同物种ＧＡＴＡ－２基因编码区生物信息学分析

不同物种ＧＡＴＡ－２基因编码区生物信息学分析作者：张天，李祥龙，周荣艳，等（来源：《湖北农业科学》 2013年第24期张天，李祥龙，周荣艳，李兰会（河北农业大学动物科技学院，河北保定０７１００１）摘要：利用生物信息学方法分析了小家鼠（Ｍｕｓｍｕｓｃｕｌｕｓ）、褐家鼠（Ｒａｔｔｕｓｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ）、人（Ｈｏｍｏｓａｐｉｅｎｓ）、黑猩猩（Ｐａｎｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ）、大猩猩（Gｏｒｉｌｌａ）、倭黑猩猩（Ｐａｎｐａｎｉｓｃｕｓ）、猿（Ｎｏｍａｓｃｕｓｌｅｕｃｏｇｅｎｙｓ）、狨（Ｃａｌｌｉｔｈｒｉｘｊａｃｃｈｕｓ）、亚马逊松鼠猴（Ｓａｉｍｉｒｉｂｏｌｉｖｉｅｎｓｉｓ）、家马（Ｅｑｕｕｓｃａｂａｌｌｕｓ）、小耳大婴猴（Ｏｔｏｌｅｍｕｒｇａｒｎｅｔｔｉｉ）、家猫（Ｆｅｌｉｓｃａｔｕｓ）、东非狒狒（ＰａｐｉｏＡｎｕｂｉｓ）、猕猴（Ｍａｃａｃａｍｕｌａｔｔａ）、犬（Ｃａｉｎｓｌａｐｕｓ）、野猪（Ｓｕｓｓｃｒｏｆａ）、大熊猫（Ａｉｌｕｒｏｐｏｄａｍｅｌａｎｏｌｅｕｃａ）等１７个物种ＧＡＴＡ－２基因编码序列（Ｃｏｄｉｎｇｓｅｑｕｅｎｃｅ，ＣＤＳ），并对该基因的遗传多样性、信号肽、导肽、跨膜结构域、疏水性／亲水性、蛋白质二级结构、氨基酸序列进行了分析和预测。

结果表明，在１７个物种５２条基因序列中共检测到３４４个多态位点，有２５种单倍型，ＧＡＴＡ－２基因序列编码区的种内、种间存在丰富的遗传多样性。

ＧＡＴＡ－２蛋白Ｎ端无信号肽，不具有导肽，没有跨膜结构域，表现为亲水性，蛋白质二级结构主要结构元件是无规卷曲和α－螺旋，理论等电点为９．４３，ＧＡＴＡ－２蛋白呈碱性。

关键词：ＧＡＴＡ－２基因；物种；生物信息学分析；遗传多样性中图分类号：Ｑ７８６文献标识码：Ａ文章编号：0439－８114（２０13）24－6182-05ＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓＡｎａｌｙｓｉｓｏｆＣｏｄｉｎｇＲｅｇｉｏｎｓｏｆＧＡＴＡ－２ＧｅｎｅａｍｏｎｇDifferentＳｐｅｃｉｅｓＺＨＡＮＧＴｉａｎ，ＬＩＸｉａｎｇ－ｌｏｎｇ，ＺＨＯＵＲｏｎｇ－ｙａｎ，ＬＩＬａｎ－ｈｕｉ（ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＨｅｂｅｉ，Ｂａｏｄｉｎｇ０７１００１，Ｈｅｂｅｉ，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＴｈｅｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｃｏｄｉｎｇｒｅｇｉｏｎｓｏｆＧＡＴＡ－２ｇｅｎｅａｍｏｎｇ１７ｓｐｅｃｉｅｓｉｎｃｌｕｄｉｎｇＭｕｓｍｕｓｃｕｌｕｓ，Ｒａｔｔｕｓｎｏｒｖｅｇｉｃｕｓ，Ｈｏｍｏｓａｐｉｅｎｓ，Ｐａｎｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ，Gｏｒｉｌｌａ，Ｐａｎｐａｎｉｓｃｕｓ，Ｎｏｍａｓｃｕｓｌｅｕｃｏｇｅｎｙｓ，Ｃａｌｌｉｔｈｒｉｘｊａｃｃｈｕｓ，Ｓａｉｍｉｒｉｂｏｌｉｖｉｅｎｓｉｓ，Ｅｑｕｕｓｃａｂａｌｌｕｓ，Ｏｔｏｌｅｍｕｒｇａｒｎｅｔｔｉｉ，Ｆｅｌｉｓｃａｔｕｓ，ＰａｐｉｏＡｎｕｂｉｓ，Ｍａｃａｃａｍｕｌａｔｔａ，Ｃａｉｎｓｌａｐｕｓ，ＳｕｓｓｃｒｏｆａａｎｄＡｉｌｕｒｏｐｏｄａｍｅｌａｎｏｌｅｕｃａｗereａｎａｌｙｚｅｄwithｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．Ｔｈｅｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙ，ａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓ，ｓｉｇｎａｌｐｅｐｔｉｄｅ，ｌｅａｄｅｒｐｅｐｔｉｄｅｓ，ｔｒａｎｓ－ｍｅｍｂｒａｎｅｔｏｐｏｌｏｇｉｃａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，ｈｙｄｒｏｈｏｂｉｃｉｔｙｏｒｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃｉｔｙ，ｐｒｏｔｅｉｎｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｎｄｔｈｅｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｏｆｎｕｃｌｅｉｃａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｓｗｅｒｅａｎａｌｙｚｅｄａｌｓｏ．Ｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｓｈｏｗｅｄｔｈａｔａｔｏｔａｌｏｆ３４４ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃｓｉｔｅｓｗｅｒｅfoundｆｒｏｍ５２ｓｅｑｕｅｎｃｅｓｏｆ１７ｓｐｅｃｉｅｓ，ｆｒｏｍｗｈｉｃｈ２５ｈａｐｏｌｏｔｙｐｅｓｗｅｒｅｓｏｒｔｅｄ.TｈｅｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆｔｈｅＧＡＴＡ－２ｇｅｎｅＣＤＳｗａｓabundantｗｉｔｈｉｎａｎｄａｍｏｎｇｓｐｅｃｉｅｓ．ＧＡＴＡ－２ｗａｓｎｏtｔｒａｎｓ－ｍｅｍｂｒａｎｅｐｒｏｔｅｉｎｗｉｔｈｏｕｔｓｉｇｎａｌｐｅｐｔｉｄｅａｎｄｌｅａｄｅｒｐｅｐｔｉｄｅｓｉｎＮ－ｔｅｒｍｉｎａｌ.Tｈｅｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅｃｈａｉｎwasｈｙｄｒｏｐｈｉｌｉｃ.TｈｅｍａｉｎｍｏｔｉｆｓｏｆｐｒｅｄｉｃｔｅｄｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆＧＡＴＡ－２ｇｅｎｅｗｅｒｅｒａｎｄｏｍｃｏｉｌａｎｄａｌ－ｐｈａｈｅｌｉｘwithＩｓｏｅｌｅｃｔｒｉｃof９．４３.ＧＡＴＡ－２ｐｒｏｔｅｉｎｗａｓａｌｋａｌｉｎｅ．Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ＧＡＴＡ－２ｇｅｎｅ；ｓｐｅｃｉｅｓ；ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓanalysis；ｇｅｎｅｔｉｃｄｉｖｅｒｓｉｔｙＧＡＴＡ家族是一类能识别ＧＡＴＡ基序（ｍｏｔｉｆ），并能与之结合的转录调节因子，在动物、真菌、植物等生物中存在比较广泛。

9种鸭科鸟类的线粒体基因组序列分析与雁形目系统发生研究的开题报告

9种鸭科鸟类的线粒体基因组序列分析与雁形目系统发生研究的开题报告一、研究背景雁形目是由一大类形态相似的水鸟组成的，其中包括雅尔鹅科、鸭科、雁科、鸥科等多个种类。

在这些中，鸭科是最大的一个科，包括130多个物种，分布在全球各地。

鸟类线粒体基因组广泛运用于鸟类分类学研究，可以为鸟类分类提供更加精确的系统发生信息。

因此，对于雁形目及其中的鸭科，鸟类线粒体基因组的研究具有非常重要的意义。

二、研究目的与内容本研究的目的是对9种鸭科鸟类的线粒体基因组进行基因序列分析，以及对鸭科进行系统发生研究。

具体内容包括：1.分析样本DNA提取和质量检测情况，对基因组测序进行准备。

2.对9种不同鸭科鸟类的线粒体基因组进行测序、处理和比对分析。

3.利用分子进化分析方法，比较不同种系间的遗传差异，建立鱼鹌鹑族、鸭亚科、鸭族、绿头鸭亚科、渔鸭亚科等鸭科分类单元的系统发生关系，并构建最优的系统发生树以评估不同分类单元之间的关系。

三、研究意义鸟类线粒体基因组序列的研究已经成为鸟类系统分类学中的重要分支，并且逐步被广泛应用于各种鸟类分类单元的系统发生学和地质历史等方面的研究。

本研究的意义在于：1.通过对9种不同鸭科鸟类的线粒体基因组序列的分析，可以更加深入地了解各种鸟类的基因组特征和演化历程，进一步加深对鸟类遗传多样性的认知。

2.通过分析研究所得到的鸟类线粒体基因组序列信息，可以为鸟类的进化和系统演化研究提供重要的数据和信息。

3.对鸭科的系统发生学研究，可以为未来更深入的生物学领域的研究提供支持和帮助，进一步推进生物学研究的进展。

四、研究方法1.样本采集：在鸭科鸟类的生态环境下放置网捕装置，进行各种目标物种的捕捉。

2.实验室处理：挑选9种鸭科鸟类分别进行标本的采集，对样本进行DNA提取、PCR扩增和测序。

同时，对测序数据进行加工处理和比对分析。

3.系统发生分析：利用分子进化分析方法，比较不同种系间的遗传差异，建立鱼鹌鹑族、鸭亚科、鸭族、绿头鸭亚科、渔鸭亚科等鸭科分类单元的系统发生关系，并构建最优的系统发生树以评估不同分类单元之间的关系。

鸟纲分类

2008© 生命科学与工程学院动物学
性腺发育甲状腺分泌
黄冈师范学院
（四）迁徙的定向
特点：迁徙路线固定（繁殖区与越冬区），但迁徙距离远近因种而异。
1、训练和记忆（遗传所决定的方向感）
幼鸟随亲鸟迁徙过程中，对观察到的地形（海岸线、大的河川或山脉）有很强的记忆。
（种的特异性起着生物学的隔离机制作用）。
（1）方式：鸣叫、显势、跳舞、（2）意义：（a）雌雄互相吸引，为育雏过程的通力合作打下基础（b）激发雌雄体内激素水平，使交配、受精过程同步化。（c）保证同种繁殖、防止种间杂交，保证生殖隔离。
2008© 生命科学与工程学院动物学
黄冈师范学院
2008© 生命科学与工程学院
动物学
黄冈师范学院
针尾鸭
绿头鸭
花面鸭
赤麻鸭
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动物学
黄冈师范学院
豆雁
鸿雁大天鹅
2008© 生命科学与工程学院动物学
黄冈师范学院
5、隼形目Falcomiformes
2008© 生命科学与工程学院
动物学
黄冈师范学院
苍
鹰凤头苍鹰
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林夜鹰
普通夜鹰
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黄冈师范学院
14、雨燕目Apodiformes
楼燕（Apus apus）
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动物学
黄冈师范学院
白腰雨燕
小白腰雨燕
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黄冈师范学院
凤头树燕
2008© 生命科学与工程学院
2008© 生命科学与工程学院动物学

2024年江苏省苏州工业园区中考一模语文试题(原卷版)

2023～2024学年初三教学调研试卷语文2024.04注意事项：1.本试卷共21题，满分130分，考试用时150分钟。

2.答题前，考生务必将自己的学校、班级、姓名、考试号用0.5毫米黑色墨水签字笔填写在答题卷的相应位置上，并用2B铅笔认真填涂考试号。

3.答选择题须用2B铅笔把答题卷上对应题目的答案标号涂黑，如需改动，请用橡皮擦干净后，再选涂其他答案；答非选择题必须用0.5毫米黑色墨水签字笔写在答题卷上指定的位置上，不在答题区域内的答案一律无效，不得用其他笔答题。

4.考生答题必须答在答题卷上，答在试卷和草稿纸上无效。

第一部分（20分）1. 阅读下面短文，完成题目。

山塘雨，飘进了我的思绪，洒透了我的心灵。

雨，衬出我心境一片宁静，一片平和。

看雨中山塘，就好像看一部“由激越到安详，由 A到 B ”的黑白影片。

生活在屋檐下的都是些普普通通的平民，有的卷起了袖子táo（）米洗菜，有的在油漆脱落的门口与孩子白相，有的则在木格子窗前闲话家常，使人感到一种散淡安yì（）的人生情味。

听山塘的雨声，又好像听一首“一切色彩喧哗”都已“消隐”的江南丝竹，依依袅袅是母亲吟唱的充满温xīn（）之感的生命之歌。

余光中说，雨是潮潮润润的音乐；雨是一种回忆的音乐。

是啊，行在雨中，听在雨中，思在雨中，更激起我穿越岁月回忆历史的意趣，尽管盛唐气象烟消云散，明清fán（）华风光不再，但这条古街在起起伏伏中对古文明的执著坚守，古老的牌坊在风风雨雨里的幽叹低吟，鳞次栉比的古宅里许许多多的老故事，却始终没有在岁月的流逝中湮灭，时间定格成历史，彳亍其间，如同置身历史。

山塘雨，给人的也许不在游兴，而是回忆，是沉思，是品味。

（1）看拼音写汉字。

táo（）米安yì（）温xīn（）fán（）华（2）结合语境，给文中画线处填上合适的词语。

A______ B______2. 古诗文默写。

山水诗文古诗文名句作者及出处探究发现主题热爱自然几处早莺争暖树，谁家新燕啄春泥。

从c-mos和12S rRNA基因序列探讨现生鸟类早期历史和三趾鹑类的系统地位

从c-mos和12S rRNA基因序列探讨现生鸟类早期历史和三趾鹑类的系统地位朱立峰;常青;张保卫;金宏;周开亚【期刊名称】《动物分类学报》【年(卷),期】2004(029)002【摘要】通常认为古腭型鸟类处在现生鸟类系统进化树的基部,最近的分子水平研究则认为今腭型鸟类中雀形目种类构成了现生鸟类中一个最古老的支系.本研究通过对现生鸟类中21目39种核c-mos基因和线粒体12S rRNA基因部分序列的分析,从分子角度对现生鸟类的早期进化及三趾鹑鸟类的系统发生进行了探讨.研究结果表明,鸡雁类是现生鸟类最古老的一个支系,现生鸟类的祖先并不是经白垩纪到第三纪大灭绝后残留下来的一些过渡性水鸟(transitional shorebirds).在现生鸟类中,今腭型鸟类为并系发生,古腭型鸟类为单系发生.三趾鹑类在系统发生中晚于鸡雁类和古腭型鸟类,早于今腭型鸟类中非鸡雁类鸟类与鹤形目鸟类的亲缘关系较远.建议将现生鸟类分为初鸟下纲和新鸟下纲2个下纲,三趾鹑类属新鸟下纲的三趾鹑目(Turniciformes).【总页数】7页(P181-187)【作者】朱立峰;常青;张保卫;金宏;周开亚【作者单位】南京师范大学遗传资源研究所南京 210097;南京师范大学遗传资源研究所南京 210097;中国科学院动物研究所北京 100080;南京师范大学遗传资源研究所南京 210097;南京师范大学遗传资源研究所南京 210097【正文语种】中文【中图分类】Q951.3【相关文献】1.从12S rRNA基因序列探讨麝类动物(Moschus)在新反刍下目中的系统学地位[J], 刘学东;郑冬;马建章2.从12S rRNA基因序列推测鹭科13种鸟类的系统发生关系 [J], 常青;张保卫;金宏;朱立峰;周开亚3.基于12S rRNA和16S rRNA基因序列探讨中国蚤蝇科部分属间的系统发育关系 [J], 赵丹彤;刘广纯;王剑峰4.鹳形目12种鸟类核c-mos 基因和线粒体12S rRNA基因序列分析及其系统发生研究 [J], 张国萍;王蔚;朱世杰;申煜;常弘5.基于12S rRNA基因序列探讨凹耳蛙(无尾目,蛙科)的分类地位 [J], 唐鑫生;陈启龙;黄松因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

全面破解鸟类起源演化之谜

全面破解鸟类起源演化之谜中外科学家全面破解鸟类起源演化之谜林小春鸟类是如何起源的？为何有鲜艳的羽毛？怎么学会了鸣叫？历经4年努力中国科学家主导的一个国际团队于11日公布了迄今最可靠的鸟类“生命之树”全面还原了地球生物演化史上的一个重要篇章。

现代鸟类的演化历史和亲缘关系是困扰学界数世纪的未解之谜。

为回答这些问题由华大基因的张国捷和国外同行领导的国际鸟类基因组联盟对48个鸟类物种进行基因组测序、组装和全基因组比较分析这些鸟类物种包括乌鸦、鸭、隼、鹦鹉、企鹅、朱鹮、啄木鸟和鹰等囊括了现代鸟类的主要分支。

鸟类是6500万年前白垩纪物种大灭绝事件中的幸存者那次事件灭绝了地球上的恐龙只有部分鸟类的祖先存活了下来。

而基于基因组数据的新研究表明恐龙灭绝后1000万年至1500万年间鸟类经历了一次“超级物种大爆发”后来逐渐演化出了1万多种被称为新鸟纲的鸟类95%的现存鸟类来自这一新鸟纲鸟类。

研究还表明鸟类的祖先从爬行动物中分化出来后丢失了成百上千的基因这些基因在人类中都有很重要的功能比如在维持生殖系统骨骼生成和肺部系统等方面不可或缺。

“这是个非常有趣的发现因为人们通常认为生物演化出新特征依靠的是产生新的遗传物质而不是基因的丢失。

”张国捷说。

此外具有鸣唱学习能力的鸟类（包括鸣禽、鹦鹉和蜂鸟）它们大脑中与鸣唱学习相关的脑基因调控回跟人类大脑中语言相关的区域呈现出相似特征。

其中鹦鹉具有一套独特的鸣唱学习系统这也许是它们可以模仿人类语言的原因。

其他一些重要发现还包括：家鸡的基因组与鸟类共同祖先可能是一只长满羽毛的恐龙；鳄鱼是鸟类的“近亲”它们的共同祖先可追溯至2.4亿年前但鳄鱼的基因组演化速率较慢而鸟类基因组演化速率较快；鸟类的牙齿是在约1.16亿年前失去的因为鸟类共同祖先中5个牙齿相关的基因在那个时间被“关闭”；水生鸟类有3次独立的起源；主要的陆生鸟类如鹦鹉、啄木鸟、猫头鹰、鹰和隼等都来自同一祖先这种祖先鸟类是顶级的捕食者它同时也是一种在美洲已灭绝的巨型恐鸟的祖先；最早的企鹅出现在约6000万年前。

鸟类发育中的同源框基因（上）

鸟类发育中的同源框基因（上）
Fains.,A;李来记
【期刊名称】《国外畜牧科技》
【年(卷),期】1997(024)002
【摘要】鸟类发育中的同源框基因（上）ＡｂｒａｈａｍＦａｉｎｓｏｄ等著李来记摘译周虚校１引言胚胎发育调节相关基因的分离是近十几年来胚胎发育研究中的一个重大进展。

过去，对胚胎发生的大部分认识是基于对几种生物（例如果蝇和小鼠）的形态观察、胚胎操作和遗传分析。

这种长...
【总页数】4页(P31-34)
【作者】Fains.,A;李来记
【作者单位】不详;不详
【正文语种】中文
【中图分类】Q959.7
【相关文献】
1.鸟类发育缺陷增强因子基因的克隆及同源性比较 [J], 何露;吕立夏;杨翠香;徐磊
2.青岛文昌鱼LIM类同源框基因反义寡核苷酸对其胚胎发育的影响 [J], 王勇①;郎刚华;徐永立;张培军
3.鸟类发育中的同源框基因（下） [J], 李来记
4.青岛文昌鱼LIM类基因Bblim同源框区的cDNA克隆、序列分析及其在胚胎发育中的表达 [J], 王勇;马洪明;等
5.生物进化论——昆虫同源框基因（Hox）聚类的系统发育分析 [J],
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挑战杯

5.方茴说："那时候我们不说爱，爱是多么遥远、多么沉重的字眼啊。

我们只说喜欢，就算喜欢也是偷偷摸摸的。

"6.方茴说："我觉得之所以说相见不如怀念，是因为相见只能让人在现实面前无奈地哀悼伤痛，而怀念却可以把已经注定的谎言变成童话。

"7.在村头有一截巨大的雷击木，直径十几米，此时主干上唯一的柳条已经在朝霞中掩去了莹光，变得普普通通了。

“挑战杯”全国大学生课外学术科技作品竞赛简介参加“挑战杯”科技竞赛的作品一般分为三大类：自然科学类学术论文、社会科学类社会调查报告和学术论文、科技发明制作，凡在举办竞赛终审决赛的当年７月１日起前正式注册的全日制非成人教育的各类高等院校的在校中国籍本专科生和硕士研究生、博士研究生（均不含在职研究生）都可申报参赛。

每个学校选送参加竞赛的作品总数不得超过６件（每人只限报一件作品）、作品中研究生的作品不得超过３件，其中博士研究生作品不得超过１件。

各类作品先经过省级选拔或发起院校直接报送至组委会，再由全国评审委员会对其进行预审，并最终评选出８０％左右的参赛作品进入终审，终审的结果是，参赛的三类作品各有特等奖、一等奖、二等奖、三等奖、且分别约占该类作品总数的３％、８％、２４％和６５％。

竞赛的宗旨：崇尚科学、追求真知、勤奋学习、锐意创新、迎接挑战。

竞赛的目的：引导和激励高校学生实事求是、刻苦钻研、勇于创新、多出成果、提高素质，并在此基础上促进高校学生课外学术科技活动的蓬勃开展，发现和培养一批在学术科技上有作为、有潜力的优秀人才。

竞赛的方式：高等学校在校学生申报自然科学类学术论文、哲学社会科学类社会调查报告和学术论文、科技发明制作三类作品参赛；聘请专家评定出具有较高学术理论水平、实际应用价值和创新意义的优秀作品，给予奖励；组织学术交流和科技成果的展览、转让活动。

第五届“挑战杯”一等奖获奖名单清华大学浦志勇《十字路口看乡企》--中国农村乡镇企业转制问题调查报告清华大学白继红蛋白质去折叠与折叠机制的研究清华大学陈益钢基于界面设计的多层膜技术获得新型合金1."噢，居然有土龙肉，给我一块！"2.老人们都笑了，自巨石上起身。

(精选)鸟类分类

鸟纲是陆生脊椎动物中显现最晚，数量最多的一纲。

鸟纲现存快要9000种，比哺乳动物几乎多一倍，但不同鸟类之间的不同却远比哺乳动物等少，象蓝鲸、鼩鼱、袋鼠和鸭嘴兽那样大的不同在鸟类中是不存在的，有些不同科的鸟类之间的区别乃至比某些同科而不同属的哺乳动物之间的不同还要小。

鸟纲分古鸟亚纲和今鸟亚纲两个亚纲，现存的鸟纲都能够划入今鸟亚纲的三个总目：古颚总目、楔翼总目和今颚总目，我国现存的鸟类都属于今颚总目。

古鸟亚纲包括始祖鸟，今鸟亚纲除现存的三个总目外，还包括已经灭绝的齿颚总目，鸟类不易形成化石，因此史前鸟类的化石超级稀少宝贵。

不同的学者对鸟类的有必然的不同，单就鸟类的总数就可差上几百种之多，目和科的划分也是互有不同。

鸟类的依据鸟类分类所依据的特点与所有动物分类学研究一样，是以形态学为基础。

形态学和比较解剖学的研究已有数百年历史，所积存的资料关于鸟类类群的熟悉，专门是高级分类阶元的特点，有重大奉献。

随着生物科学和生物学技术的飞速进展，显微形态学、生理生态学、行为学、细胞遗传学和生物化学等领域的技术功效也应用于分类特点和亲缘关系、种系发生等方面的分析，这些功效大大深化了对系统分类学的研究。

鸟类的分类学特点通常鸟类分类鉴按时要紧依托外部形态特点，例如喙的形态和长短，跗趾与趾的特点和所被覆的鳞片形态和树目，飞羽（专门是低级飞羽）的数量和形态特点，尾羽的数量和形态特点，体形，各部的量度和特点，各部的羽色和羽饰特点，裸皮的颜色等。

要区别雌、雄、幼体与亚成体和不同季节的羽色转变，找出其间的共性和不同。

生物学和生态学特点●生物学特点那个地址所说的生物学特点主若是指与生长发育、生命周期有关的特点和生活习性等。

例如巢与卵的特点、亲鸟在孵卵及育雏活动中的分工、雏鸟发育特点、换羽规律及顺序、鸣声的声谱分析、食性和迁移特性等，大量内容早已汇入对鸟类系统分类研究的功效当中。

●生态学和行为学特点在深切分析系统进化理论方面，生态学和行为学的重要性日趋引发注意。

基于CHD基因序列的隼形目12种鸟系统发育关系

基于CHD基因序列的隼形目12种鸟系统发育关系刘铸;杨春文;田恒久;金建丽;金志民;鞠永富【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2010(000)006【摘要】对12个隼形目物种CHD基因的一段内含子序列进行比较和分析.CHD-W和CHD-Z基因的多态性存在差异,CHD-W基因不适合系统发生学的研究.通过对CHD-Z基因扩增序列构建的NJ和MP树,结果显示隼科鸟类与鹰科和鹳科鸟类关系较远,与传统形态分类和和鸟类新的分类系统不一致.在白腹鹞的分类地位上与传统形态学分类不一致,将白腹鹞归入鹰属一支.NJ树显示鸢属(黑鸢)与鵟属(毛脚鵟)亲缘关系较近,MP树显示鵟鹰属(灰脸鵟鹰)与鵟属(毛脚鵟)亲缘关系较近.NJ和MP 树都显示雕属(金雕)和鹰雕属(鹰雕)与其他鹰科各属亲缘关系较远.【总页数】6页(P179-184)【作者】刘铸;杨春文;田恒久;金建丽;金志民;鞠永富【作者单位】牡丹江师范学院生物系,牡丹江,157012;东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨,150040;牡丹江师范学院生物系,牡丹江,157012;北京市野生动物救护中心,北京,100029;牡丹江师范学院生物系,牡丹江,157012;牡丹江师范学院生物系,牡丹江,157012;东北林业大学野生动物资源学院,哈尔滨,150040【正文语种】中文【相关文献】1.基于Cyt b基因序列变异探讨鲱形目系统发育关系 [J], 王丹生;程远志;徐田军;王日昕2.鸻形目15种鸟类线粒体ND6基因序列差异及其系统进化关系 [J], 陈晓芳;王翔;袁晓东;汤敏谦;李玉祥;郭玉梅;李庆伟3.鹳形目12种鸟类核c-mos 基因和线粒体12S rRNA基因序列分析及其系统发生研究 [J], 张国萍;王蔚;朱世杰;申煜;常弘4.基于线粒体细胞色素b基因序列的雀形目18种鸟系统发育关系 [J], 国会艳;李玲;马玉堃;白素英5.形目12种鸟类线粒体细胞色素b基因序列差异及其系统发育关系 [J], 陈晓芳;王翔;袁晓东;汤敏谦;李玉祥;郭玉梅;李庆伟因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基于线粒体DNA序列分析金虎尾目在蔷薇亚纲中的地位

基于线粒体DNA 序列分析金虎尾目在蔷薇亚纲中的地位卿华，覃佳佳，靳燕，马政，姚慧鹏*（四川农业大学生命科学学院，四川雅安625014）摘要:【目的】探讨金虎尾目在蔷薇亚纲中的植物学地位。

【方法】以金虎尾目，豆类以及锦葵类植物12条线粒体基因作为研究对象，利用最大似然法、最大简约法、近邻法分别构建系统发生树，对金虎尾目的植物学地位进行分析。

【结果】最大似然法结果表明12条线粒体基因中，有9条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类，支持率为29%~79%；有3条线粒体基因支持金虎尾目属于豆类，支持率为17%~52%。

最大简约法结果表明12条线粒体基因中，有8条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类，支持率为36%~85%；而支持金虎尾目属于豆类的仅有2条基因，支持率为25%和66%；其余的2条基因支持金虎尾目既不属于锦葵类也不属于豆类,支持率为77%和99%。

近邻法结果表明12条线粒体基因中，有8条线粒体基因支持金虎尾目属于锦葵类，支持率为14%~82%；而只有3条基因表明金虎尾目属于豆类，支持率为36%~66%；其余的1条基因表明金虎尾目属于豆类和锦葵类分支之外,支持率为44%。

【结论】上述3种模型分析结果表明，大多数基因的分类支持金虎尾目归属于锦葵类分支，同时具有高支持率。

这个结果可为金虎尾目不完全谱系分选提供一定的证据。

关键词:金虎尾目；线粒体同源基因；系统发生树；不完全谱系分选中图分类号:Q941+2文献标志码:Ａ文章编号:1000-2650（2020）06-0708-07The Botanical Status of the Malpighiales in RosidaeQING Hua ，QIN Jiajia ，JIN Yan ，MA Zheng ，YAO Huipeng *（College of Life Science ，Sichuan Agricultural University ，Ya 'an 625014，Sichuan ，China ）Abstract:【Objective 】To explore the status of Malpighiales in Rosidae.【Method 】12mitochondrial genes were performed on phylogenetic analysis by using maximum likelihood method(ML)，maximum parsimo -ny method (MP)and neighbor joining method (NJ)，for 27species including to 6Malpighiales ，12Mal -vales and 9Fabales.【Result 】The results of the maximum likelihood method showed that among the 12mitochondrial genes ，9mitochondrial genes indicate that Malpighiales belongs to Malvales with the sup -port rate of 29%to 79%；3mitochondrial genes indicate that Malpighiales belongs to Fabales with the support rate of 17%to 52%.According to the maximum parsimony method ，8mitochondrial genes indi -cate that Malpighiales belongs to Malvales with the support rate of 36%to 85%；2genes indicate that Malpighiales belongs to Fabales with the support rates of 25%and 66%.The remaining 2genes indicate that Malpighiales is neither Malvales nor Fabales with the support rate of 77%and 99%.From neighbor joining method ，it is shown that 8mitochondrial genes indicate Malpighiales belongs to Malvales with the support rate of 14%to 82%，while only 3genes indicate that Malpighiales belongs to Fabales withthe support rate of 36%to 66%.The remaining 1gene indicates that Malpighiales is neither Malvales nor Fabales with the support rate of 44%.【Conclusion 】Based on most genes ，it is found that Malpighialesbelongs to the Malvales branch ，and has high confidence by three different analysis models.?This result第38卷第6期2020年12月收稿日期:2020-07-11基金项目:四川农业大学双支计划（2021993090）。

第6章生物的进化——2023-2024学年高一生物学人教版(2019)必修二单元检测卷(A卷)

第6章生物的进化——2023-2024学年高一生物学人教版（2019）必修二单元检测卷（A卷）考试时间：90分钟满分：100分一、单项选择题：本题共13小题，每题3分，共39分。

在每小题给出的四个选项中，只有一项是符合题目要求的。

1.中国科学院古脊椎动物与古人类研究所在广西早泥盆世古鱼类特异埋藏生物群中，发现了首个完整保存尾鳍的盔甲鱼类一九尾狐甲鱼的化石。

九尾孤甲鱼长约10厘米，身体除了具有盔甲鱼类典型的下歪尾外，尾鳍还具有9个手指状的分叉，是原始的叉形尾，使其能够成为一个灵活的“游泳者”。

下列有关说法错误的是( )A.九尾狐甲鱼的灭绝是自然选择的结果B.九尾狐甲鱼羽状尾鳍的形成体现了生物对环境的适应C.九尾狐甲鱼进化过程中基因发生了定向突变D.化石能够确定生物的形态、结构、行为特征，是研究生物进化最直接、最重要的证据2.夏威夷群岛距离大陆最近的地方也有几千千米。

多种不同的蜜旋木雀生活在这些由火山喷发形成的小岛上，它们的生活习性不同，尤其是喙的形态和大小有很大区别。

DNA检测技术发现，这些蜜旋木雀最初属于同一物种。

下列关于蜜旋木雀的叙述，错误的是( )A.不同小岛上的现存蜜旋木雀仍可能朝着不同方向进化B.该群岛上所有蜜旋木雀所含有的全部基因组成基因库C.在这些蜜旋木雀形成的过程中，小岛起着关键性作用D.DNA检测技术可以为生物进化提供证据3.蔗蟾蜍曾被某国引入，用来控制甘蔗园中的害虫，但除控制害虫外，蔗蟾蜍还能捕食多种动物。

蔗蟾蜍本身有毒，在当地鲜有天敌，且繁殖速度快，变异率高，几十年来迅速扩散，已成为人侵物种，造成了生态灾难。

研究发现，它们的进化速度惊人，已经进化出长而有力的后腿，生存能力剧增。

对上述材料的分析，正确的是( )A.几十年来，蔗蟾蜍种群的基因频率发生了改变B.某国的环境条件直接对引入蔗蟾蜍的基因进行了选择C.蔗蟾蜍的变异主要来自基因突变D.引入地的环境诱导蔗蟾蜍发生了定向突变4.雄性孔雀的体表有橘黄色斑块，该橘黄色斑块有利于吸引异性，从而提高繁殖的成功率，但同时也容易吸引天敌，雄性孔雀可以通过改变橘黄色斑块的，数量来提高对环境的适应性。

新出炉的鸟类的新演化树

新出炉的鸟类的新演化树，有什么不同？南川木菠萝发表于 2014-12-20 09:38喜欢鸟类的同学们，我们现在有一个好消息一个坏消息。

好消息是：就在上周，基于全基因组测序的鸟类演化新系统树出来了；坏消息是：我们可能又得多记一套分类系统了。

鸟类分类系统的演进最经典的鸟类的分类是基于形态学特征的传统分类系统。

在这个系统里，现存的鸟类都属于鸟纲今鸟亚纲，其下分有三个总目：古颚总目/平胸总目，包括鸵鸟、美洲鸵、鹤鸵、几维鸟和䳍（有些系统中该字无法显示，写作[共鸟]）；楔翼总目/企鹅总目，由所有种类的企鹅组成；其余的鸟则被统统塞进今颚总目/凸胸总目，包括27个目：潜鸟鸊鷉鹱鹈鹳红鹳雁隼鸡麝雉鹤鸻沙鸡鸽鹦鹃鸮夜鹰雨燕蜂鸟鼠鸟咬鹃佛法僧戴胜犀鸟鴷雀——嗯，就这些。

多彩的鸟类世界。

图片：当然，形态学上的特征有的时候无法真正反应物种间的演化关系。

20世纪80年代，美国鸟类学家、分子生物学家查尔斯•西布利（Charles G. Sibley）利用DNA杂交技术对鸟类的系统演化和亲缘关系进行了研究，提出了DNA分类系统，这个分类系统把鸟纲分为古鸟亚纲和今鸟亚纲，现生鸟类全部归于今鸟亚纲，今鸟亚纲进一步分为三个下纲：始鸟下纲、三趾鹑下纲和新鸟下纲。

始鸟下纲包括两个小纲：平胸小纲，等于传统分类系统的平胸总目，包含的类群相同；鸡雁小纲，包括传统分类中的鸡形目和雁形目。

三趾鹑下纲比较特殊，只包括三趾鹑这一目一科，而它们以往是被归类在鹤形目中的。

新鸟下纲包含四个小纲：鴷小纲、佛法僧小纲、鼠鸟小纲和燕雀小纲。

鴷小纲基本等同传统分类的鴷形目；佛法僧小纲囊括了传统分类中的佛法僧目、戴胜目、犀鸟目和咬鹃目；鼠鸟小纲等于传统分类的鼠鸟目。

燕雀小纲则庞大无匹，传统分类法中剩下的目都包含其中，分为鹃形总目、鹦形总目、雨燕总目、鸮形总目、燕雀总目。

鹃形总目相当于传统分类中的鹃形目；鹦形总目约等于鹦形目；雨燕总目包括雨燕目和蜂鸟目；鸮形总目则复杂一些，不仅包括以前的鸮形目，而且把蕉鹃和夜鹰也收了进来。

GDF11_通过AKT_通路抑制骨骼肌细胞分化

2023 ，43（2） : 092J.SHANXI AGRIC, UNIV . （ N atural Science Edition ）学报（自然科学版）04185GDF11通过AKT 通路抑制骨骼肌细胞分化张鹏翔，吴佳豪，冀云燕，薛霖莉，董亚洁，宫泽恩，郝晓静，曹校瑞，赫晓燕*（山西农业大学动物医学学院，山西晋中 030801）摘要：［目的］探究骨骼肌GDF11（生长分化因子11，Growth and differentiation factor 11）在生长发育过程中的表达情况及其作用，明确GDF11在骨骼肌细胞中激活的非SMAD 调控通路，为抵抗骨骼肌衰老、促进骨骼肌损伤修复，探究肌肉发育调控的相关机制提供理论参考。

［方法］以不同发育阶段小鼠和C2C12细胞为材料，取不同发育阶段小鼠腓肠肌、使用分化培养基诱导细胞分化、使用D⁃半乳糖诱导C2C12细胞衰老，分别探究GDF11在个体层面和细胞层面骨骼肌生长发育和衰老中的表现和作用；通过构建GDF11的过表达载体和siRNA 载体，观察GDF11对C2C12细胞成肌分化的影响，并检测了在这一过程中细胞内相关基因的变化，探究GDF11在骨骼肌细胞发育中影响；通过对AKT 信号通路的抑制，明确GDF11在骨骼肌细胞分化过程中激活的非SMAD 调控通路。

［结果］（1）在小鼠腓肠肌中，GDF11蛋白表达量随着年龄的增长呈现出先下降后上升的趋势。

（2）在细胞分化前期GDF11表达量逐渐升高，并在3 d 时细胞开始分化时达到最高，随后逐渐降低，7 d 时恢复到与初始相似的水平。

（3）随着D⁃半乳糖浓度的增加，细胞衰老程度逐渐增加，同时细胞GDF11表达量逐渐增加。

（4）过表达GDF11使细胞分化进程推迟，但抑制GDF11的表达对细胞分化进程并没有影响。

过表达GDF11上调了AKT 的磷酸化水平。

（5）过表达GDF11的C2C12细胞中阻断AKT 通路能够逆转GDF11造成的分化抑制。

生物信息学上机指南3

《生物信息学》上机指南（三）实验三、分子系统发育分析 2学时教学要求：1、了解系统发育分析原理、步骤、方法。

2、掌握phylip、Mega等软件的下载与使用。

3、学习进化树结果分析。

重点掌握phylip、Mega的使用。

实验步骤：1.基于细胞色素c氨基酸序列的真核生物系统发育分析细胞色素c（cytochrome c）是一种含血红素的电子转运蛋白，它存在于所有真核生物的线粒体中，参加呼吸作用。

细胞色素c的氨基酸顺序分析资料已经用来核对各个物种之间的分类学关系，以及绘制进化树。

本实验利用Mega软件，采用邻位相接法，构建43种真核生物细胞色素c系统进化树。

类群中文名称拉丁学名蛋白质登录号哺乳类人Homo sapiens P99999黑猩猩Pan troglodytes P99998恒河猴Macaca mulatta P00002大袋鼠Macropus giganteus P00014家兔Oryctolagus cuniculus P00008小家鼠Mus musculus CAA25899 马Equus caballus P00004绵羊Ovis aries P62896牛Bos taurus P62894野猪Sus scrofa P62895狗Canis familiaris P00011南象海豹Mirounga leonina P00012长翼蝠Miniopterus schreibersii P00013河马Hippopotamus amphibius P00007鸟类鸸鹋Dromaius novaehollandiae P00018 鸵鸟Struthio camelus P00019 原鸡Gallus gallus P67881 火鸡Meleagris gallopavo P67882企鹅Aptenodytes patagonicus P00017 家鸽Columba livia P00021绿头鸭Anas platyrhynchosP00020爬行类拟鳄龟Chelydra serpentina P00022 两栖类牛蛙Rana catesbeiana P00024硬骨鱼类长鳍金枪鱼Thunnus alalunga P81459 太平洋鲣鱼Katsuwonus pelamis P00025 斑马鱼Danio rerio Q6IQM2软骨鱼类角鲨Squalus sucklii P00027 圆口类七鳃鳗Entosphenus tridentatus P00028 棘皮动物红海星Asterias rubens P00029 环节动物赤子爱胜蚓Eisenia fetida P00030昆虫沙漠蝗Schistocerca gregaria P00040 烟草天蛾Manduca sexta P00039 眉纹天蚕蛾Samia cynthia P00037 铜绿蝇Lucilia cuppina P00036植物小麦Triticum aestivum P00068水稻Oryza sativa BAA02159 向日葵Helianthus annuus P00070菠菜Spinacia oleracea P00073银杏Ginkgo biloba P00074芝麻Sesamum indicum P00054真菌毕赤酵母Pichia anomala P00042 白色念珠菌Candida albicans P53698 粗糙脉胞菌Neurospora crassa P000481.1.序列获取（1）用记事本将蛋白质登录号粘进去，每个登录号占一行，存为Sequence_ID.txt。

鸱鸮科27种鸟类COⅠ序列变异及系统发育分析

野生动物学报ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＷｉｌｄｌｉｆｅ２０１６，３７（４）：３５１— ３５６
固
康
稿件运行过程收稿Ｅｌ期：２０１６—０５—１９修回日期：２０１６— ０６— ２１发表日期：２０１６—１１—１０关键词：鸱鹗科；四川林鹗；
鸱鸨科鸟类的种属分类仍存在一些争议。例如：渔鹗属和雪鹗属是否应并入雕鹗
属，四川Ｉ林鹗是一独立种还是长尾林鹗的一个亚种？线粒体ＤＮＡ中细胞色素Ｃ氧化酶亚基Ｉ（ＣＯＩ）基因是ＤＮＡ条形编码的主要基因，被广泛应用于鸟类的物种鉴定和系统发育研究。通过测定中国产红角鹗、雕鹗和长尾林鹗ＣＯＩ基因的序列，并结合ＧｅｎＢａｎｋ
Ａｍｏｎｇ２７ＳｐｅｃｉｅｓｏｆＳｔｒｉｇｉｄａｅＢｉｒｄｓ
ＫａｎｇＨｕｉ ’ ＤｉｎｇＰｅｎｇ ’ ＬｉＢｏ ’ ，
（１．ＮｏｒｔｈｅａｓｔＦｏｒｅｓｔｒｙＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｈａｒｂｉｎ，１５００４０，Ｃｈｉｎａ；２．ＳｔａｔｅＦｏｒｅｓｔｒｙ
ＡｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎＤｅｃｔｅｃｔｉｎｇＣｅｎｔｅｒｏｆＷｉｌｄｌｉｆｅ，Ｈａｒｂｉｎ，１５０ＩｎｔｈｅｔａｘｏｎｏｍｙｏｆｔｈｅａｖｉａｎｆａｍｉｌｙＳｔｒｉｇｉｄａｅ，ｔｈｅｒｅｒｅｍａｉｎｓｅｖｅｒａｌｃｏｎｔｒｏｖｅｒｓｉａｌｉｓｓｕｅｓ．

不同食性雁形目鸟类线粒体基因组的适应性进化分析

生物技术进展 2023 年第 13 卷第 5 期 748 ~ 754Current Biotechnology ISSN 2095‑2341研究论文Articles不同食性雁形目鸟类线粒体基因组的适应性进化分析张卫平1，2 ，邱冰滢1，2 ，张东升1，2 *1.上海海洋大学水产与生命学院，水产科学国家级实验教学示范中心，上海 201306；2.上海海洋大学水产与生命学院，环境DNA 技术与水生态健康评估工程中心，上海 201306摘要：以往的研究表明，动物的食性与能量代谢及生存适应密切相关。

能量代谢主要发生在线粒体中，线粒体编码的13个蛋白质亚基是氧化磷酸化复合体的重要组成部分。

雁形目鸟类的食性主要包括肉食性、杂食性和植食性3种类型。

为了分析食性对鸟类基因组进化的影响，研究选取了20种雁形目鸟类，并根据食性分成3组，下载其线粒体基因组，通过适应性进化分析、放松性选择分析、多态性氨基酸位点检测以及3D 结构预测分析，研究这3组鸟类的线粒体蛋白编码基因在进化上的表现。

结果发现，食肉组鸟类线粒体基因组的进化速率高于食草组和杂食组鸟类，并且只有食肉组鸟类线粒体蛋白编码基因受到了放松性的选择压力作用。

此外，多态性氨基酸位点检测表明，食肉组线粒体基因组编码的蛋白质中，多态性位点和有害位点数量远高于食草组和杂食组。

而杂食组鸟类线粒体蛋白编码基因进化速率较低，大部分基因受到强化性选择作用，蛋白质序列中的多态性位点也较少。

研究结果表明，不同食性的雁形目鸟类，其线粒体基因组编码的蛋白质受到了不同的选择压力，这为食性差异影响鸟类线粒体基因组适应性进化提供了分子依据。

关键词：雁形目；食性；线粒体；适应性进化DOI ：10.19586/j.2095‑2341.2023.0054 中图分类号：Q951 文献标志码：AAdaptive Evolution Analysis of Mitochondrial Genomes in Anseriform Birds with Various Feeding HabitsZHANG Weiping 1，2 ， QIU Bingying 1，2 ， ZHANG Dongsheng 1，2 *1.National Demonstration Center for Experimental Fisheries Science Education ， College of Fisheries and Life Science ， Shanghai Ocean University ， Shanghai 201306， China ；2.Environmental DNA Technology and Water Ecological Health Assessment Engineering Center ， College of Fisheries and Life Science ， Shanghai Ocean University ， Shanghai 201306， ChinaAbstract ：Previous studies showed that ， animals' feeding habits are related to their energy metabolism and adaptation. Energy metabolism takes place in mitochondria ， and 13 subunits of the oxidative phosphorylation complexes were encoded by mitochondrial genome. According to feeding habits ， birds of Anteriformes could be divided into three groups ， including carnivorous ， herbivorous and omnivorous. To study the evolutionary effects of feeding habit on mitogenomes ， we selected 20 anteriformes species and divided them into three groups. We downloaded their mitogenomes ， and did adaptive analysis ， relax analysis ， polymorphism analysis and 3D structure prediction. Our results showed that ， the carnivorous group had higher evolutionary rates than the other two groups ， and only the carnivorous group had multiple genes under relaxed selection. Meanwhile ， the carnivorous group had more polymorphism sites and deterious sites among their proteins sequences than the other two groups. The genes from the omnivorous group showed decreased evolutionary rates ， and most of the genes were under intensification selection ， furthermore ， less polymorphic sites were detected in this group. The results indicated that the proteins encoded by mitochondrial genomes of anteriformes birds with different feeding habits are subject to different selective pressures. This study provides a molecular basis for theinfluence of dietary differences on the adaptive evolution of avian mitochondrial genomes.Key words ：anteriformes ； diets ； mitochondria ； adaptive evolution收稿日期：20230417；接受日期：20230517基金项目：国家重点研发计划项目（2022YFC2601301）。

鸻形目27种鸟类c-mos基因序列分析及其系统发育研究的开题报告

鸻形目27种鸟类c-mos基因序列分析及其系统发育研究的开题报告一、选题背景及意义鸻形目（Charadriiformes）是一类食虫性水鸟，包括鸻科、鸻形科、鸬鹚科等27个科、400多个物种。

这些鸟类广泛分布于全球各地的沿海和内陆水源。

随着分子生物学技术的发展，c-mos基因已成为研究鸟类系统发育的一种重要工具。

近年来，针对鸟类c-mos基因的分析已获得了在系统发育、生物地理学和进化生物学等方面的重要进展。

本研究旨在利用c-mos基因序列分析方法，探究不同鸻形目鸟类之间的系统发育关系，揭示其进化历史，为鸟类分类和进化研究提供重要的参考依据。

二、研究目标和内容本研究的主要目标是对鸻形目27种鸟类c-mos基因序列进行分析，并构建其系统发育树。

具体内容如下：1. 采取PCR扩增、测序等分子生物学技术，获得鸻形目27种鸟类c-mos基因序列。

2. 对所得序列进行生物信息学分析，包括序列比对、构建系统发育树等，并使用适当的统计方法对进化关系进行验证。

3. 结合文献资料，对所得结果进行解释和讨论，探究鸟类的起源和演化过程。

三、预期成果通过本研究，预期获得以下成果：1. 获得27种鸻形目鸟类c-mos基因序列，并对其进行生物信息学分析。

2. 构建包括鸤鹚属、鴴属、鸻科、鸻形科、鸬鹚科等鸟类的系统发育树，并明确其亲缘关系。

3. 在已有文献的基础上，更深入地探究鸟类的进化历史和多样性，丰富鸟类分类和进化研究的基础知识。

四、研究方法和步骤1. 材料收集：收集27种鸻形目鸟类的标本或组织样本（如血液、羽毛、肌肉等），提取总RNA并利用RT-PCR合成cDNA。

2. PCR扩增与测序：利用特异引物对c-mos基因进行PCR扩增，扩增产物经纯化后送测序公司进行测序。

3. 数据处理：对所得序列进行比对和编辑，确定同源区域。

确保序列质量后，使用分子进化学软件对鸻形目鸟类的c-mos基因序列进行分析。

4. 构建进化树：利用PARALLEL-MPI软件构建进化树，并使用适当的统计方法（Bootstrap法、Maximum likelihood法等）对进化关系进行验证。