最新电子克隆学习.PPT课件
合集下载
生物ppt课件克隆
克隆技术的实现需要深入理解 细胞分裂、胚胎发育和核质互 作等生物学过程，以及掌握相 关的实验技术。
03
CHAPTER
克隆技术的生物学意义
对生物多样性的影响
生物多样性是地球上生命经过亿万年进化的结果，包含了物 种内、物种间以及生态系统的多样性。克隆技术可能会导致 生物多样性的减少，因为它可能导致物种的基因库单一化， 降低物种的遗传多样性。
克隆技术可以用于保护和恢复濒危物种，通过克隆技术可以 保存和繁殖具有重要价值的基因库，从而保护生物多样性。
对生物进化的影响
生物进化是物种在适应环境变化的过程中不断演变的过程 ，而克隆技术可能会对生物进化产生影响。由于克隆技术 可以快速繁殖具有优良性状的个体，这可能会导致某些物 种的进化速度减缓甚至停滞。
克隆植物
快速繁殖
通过克隆技术，可以快速繁殖出 大量植物，用于园艺、林业和农 业等领域，提高植物资源的利用
效率。
遗传改良
克隆植物可用于遗传改良，通过 基因编辑等技术，培育出具有优
良性状的植物新品种。
生态恢复
克隆技术可用于生态恢复工程， 快速繁殖出濒危植物和受损生态 系统所需的植物种类，促进生态
系统的恢复和重建。
育成为成熟的个体。
克隆动物的出生通常需要采用胚 胎移植技术，将人工胚胎转移到 代孕母体中，使其完成妊娠过程
。
克隆技术的科学原理
克隆技术的科学原理基于细胞 的全能性，即一个细胞具有发 育成完整个体的全部遗传信息 。
通过将供体细胞的细胞核移植 到受体细胞中，科学家可以重 新编程受体细胞，使其发育成 一个全新的个体。
克隆技术的潜在风险与挑战
伦理道德问题
克隆技术涉及到人类生命 的起源和尊严，引发了伦 理道德方面的争议和挑战 。
电子克隆的操作方法
电子克隆的操作方法
电子克隆是指复制一个电子设备或电子产品的过程。
一般来说，电子克隆的操作方法包括以下几个步骤：
1. 取得原始电子产品：电子克隆需要一个原始的电子产品，这个产品将作为复制对象。
要么是购买一个现成的产品，要么是自己制造一个原型。
2. 制作电路图：通过分析原始电子产品，制作该电子产品的电路图。
电路图是该产品的蓝图，它告诉你产品中的每个部件的类型、位置和连接。
3. 组装克隆电子产品：根据电路图，组装克隆电子产品。
这个步骤需要一些电子器件，比如电阻、电容、晶体管等等。
也需要一些工具，比如焊接工具、万用表、示波器等等。
4. 测试克隆电子产品：在组装完成后，测试克隆电子产品，确保它工作正常。
可以使用万用表、示波器等电子测试设备来测试克隆产品的电流、电压、频率等等参数。
5. 优化电子产品：如果测试结果不理想，可以对电路图和组件进行优化。
再次测试，直到克隆产品达到预期效果。
需要注意的是，电子克隆有时是非法的，因为它可能涉及到知识产权等法律问题。
在进行电子克隆之前，需要认真考虑和评估相关的法律风险。
选修三 第二章 第一节 什么是克隆 课件ppt（15张）
克隆
克隆（clone）为音译，实际就是无性繁殖。
无性繁殖：不经过两性生殖细胞，直接由母体形成个体。
繁殖速度： 快 特点
遗传性状： 与母本保持一致
任务2：构建克隆猴诞生的流程图
资料：
获得克隆猴的理论途径：选取3只母猴，将一只母猴的 卵细胞的细胞核去除；取第二只母猴的体细胞的核与去核 的卵细胞融合，形成重组细胞，并促使其分裂发育成早期 胚胎。胚胎发育到一定程度时再将它植入到第三只母猴的 子宫中，由它孕育并产生克隆羊。
分裂
抗体
未激活的
激活的
B淋巴细胞 B淋巴细胞
（效应B淋巴细胞）
杂交 瘤细胞
克隆
只要不通过两个分子、两个细胞或两个个体的结 合，只由一个模板分子、母细胞或母体直接形成新一 代分子、细胞或个体，就是无性繁殖，即克隆。
继“中中”和“华华”之后， 中国科学家又获得了几 只基因敲除的克隆猴。 它们是研究人类昼夜节 律现象的理想模型！
移植
母猴C 胚胎发育
克隆猴
个体水平上的克隆
不经过生殖细胞的结合（受精）而直接由体细胞
获得新个体。ຫໍສະໝຸດ 思考：若想从水母中获得荧光蛋白基因，并利用该 基因获得“绿色转基因克隆猴”，应该如何操作？
载体
获得 目的基因
荧光蛋白基因
导入
筛选 检测
重组DNA
猴体细胞
细胞核
荧光蛋白 转基因克隆猴
受体母猴
早期胚胎
重组细胞
去核卵细胞
【资料】日本科学家 将绿色荧光蛋白基因 导入卵细胞中，再让 其受精，最终生下来 的“绿光猴”。
分子水平上的克隆
在分子水平上，基因克隆是指某种目的基因的复 制、分离的过程。
体外 利用PCR技术扩增目的基因
克隆技术课件
克隆技术的发展
克隆技术的概念： 从众多的基因或细胞群体中通过无性繁殖和选择目的基因 或特定类型细胞的技术的操作。
1.微生物克隆：
由一个细菌分裂（复制）出多个和它完全一样的细菌而 形成的菌落。 2.遗传工程的克隆：
例如：DNA克隆或基因克隆 3.个体水平上的克隆：
不通过两性细胞结合，直接从单一的细胞繁殖出生物个 体
★在实践中，技术尚不成熟，得到的克隆动物具有极大的偶 然性和随机性。迄今为止，克隆试验的成功率始终很低。例 如在培育“多莉“的实验中，融合了277枚移植核的卵细胞， 仅获得了 “多莉”这一只成活羔羊，成功率只有0.36％， 同时进行的胎儿成纤维细胞和胚胎细胞的克隆实验的成功率 也分别只有1.7％和1.1％。目前，多莉羊的制备还不能重复， 更不能肯定克隆多莉羊的方法也适用于其它动物或其它不同 组织器官的细胞。
（2）能有调控细 胞核发育的细胞 质物质
（3）完成胚胎发 育的必要的环境条 件
资料1：克隆技术存在的问题
尽管克隆技术有着广泛的应用前景，但离产业化尚 有很大距离。因为作为一个新兴的研究领域，克隆技术 在理论和技术上都还很不成熟。
★在理论上，分化的体细胞克隆对遗传物质重编（细胞核 内所有或大部分基因关闭，细胞重新恢复全能性的过程） 的机理还不清楚；克隆动物是否会记住供体细胞的年龄， 克隆动物的连续后代是否会累积突变基因，以及在克隆过 程中细胞质线粒体所起的遗传作用等问题还没有解决。
微生物克隆
细菌的二分裂
大肠杆菌的分裂
大肠杆菌的菌落
个体水平上的克隆
胚胎细胞核移植 体细胞核移植
广东诞生首例体细胞五头“克隆 猪”
个体水平上的克隆
中国首例异体克隆动物--克隆北山羊
绵羊“多利”
关于克隆的PPT
Under standard clones:
inhuman to destroy them
Too much population:
causing chaos in society
Disadvantages: impacts on our life
Used on crops and animals:
the side-effect is seen after generations
Cloning babies:
psychological problems of the children
Some parents want to clone a child，either to provide transplants for a dying child or to replace that child.
Some adults want to clone themselves for a variety of reasons .
But……
Leaders in most countries already prohibit human cloning， began examining the moral implications of cloninme experts are concerned about the creation of a new land disrespected social class:“the clones”.
From the preceding description we can see that cloned animals can bring human beings many benefits , such as the production of food, medicines, organs, to save the endangered animals and so on.
《克隆技术》课件PPT课件
克隆技术在濒危物种保护中的应用前景
THANKS FOR
感谢您的观看
WATCHING
胚胎细胞克隆
总结词：将供体细胞的细胞核移植到去核的卵母细胞中，经过培养和激活后形成胚胎并进行移植。 详细描述：核移植克隆是一种利用细胞核移植技术进行无性繁殖的方法。首先，从供体动物体内取出细胞核，然后将其移植到去核的卵母细胞中。经过培养和激活后，形成胚胎并进行移植，最终产生遗传上与原个体完全相同的新个体。 科学依据：核移植克隆技术基于细胞核的全能性和卵母细胞的去分化能力，通过精确的操作实现克隆过程。 技术应用：核移植克隆技术已被应用于多种动物克隆，如牛、羊、猪等。同时，该技术也被应用于人类胚胎干细胞的体外培养和生产。
04
克隆技术的未来发展
克隆技术的科研进展
科研进展
科学家们正在不断探索克隆技术的科研进展，包括对克隆技术的原理、技术手段和伦理问题等方面进行深入研究。
科研成果
随着科研的深入，克隆技术已经取得了一些重要的科研成果，例如成功克隆出人类胚胎干细胞、治疗性克隆技术的发展等。
科研挑战
尽管克隆技术取得了一些进展，但仍面临着许多挑战，例如技术难度大、伦理和法律问题等。
克隆技术在农业领域的应用前景
保护优势
克隆技术可以为濒危物种保护提供更为有效和可靠的方式，避免物种灭绝的风险。
保护挑战
然而，克隆技术在濒危物种保护中的应用仍面临着一些挑战，例如技术难度大、伦理和法律问题等。
濒危物种保护
克隆技术也可以应用于濒危物种的保护，例如通过克隆技术繁殖濒危动物，保护其种群数量。
核移植克隆
成年动物体细胞克隆
总结词：利用成年动物的体细胞进行核移植，形成胚胎并进行移植，产生遗传上与原个体完全相同的新个体。
电子克隆简介
以上各步骤由程序自动完成
如何做拼图游戏
以构建的重叠序列群为信息标签，进一 步检索比对，搜索其高度同源序列
如果发现了与之高度同源的未知序列，则重复上述步骤；若没 有新的发现，说明拼接组装得到的EST可能囊括了所以可能的 目的基因序列
根据以上步骤，得到了一个全长为1678 bp的EST序列
如何做拼图游戏
什么是电子克隆
表达序列标签（expressed sequence tags， EST）是对某个基因cDNA克隆测序所得的部 分序列片段，长度大约为200~600bp
由于基因表达调控作用不同，同一个基因的 mRNA剪接位点和方式不同，所以同一个基 因的全长cDNA可能包含多个EST
EST既代表了基因cDNA的某一区段，也表征 了成熟mRNA可能的剪接方式
传统的方法如同小规模地捕捞一条或几条鱼，电子克隆与之相 比就如同集约化地捕捞一群鱼
拼图游戏一样的原理
相近的物种在核酸序列上有相似性，相近物 种中的同源基因序列在一定程度上可以代表 目的基因的序列
可代表程度与两序列的相似度直接相关，加 之遗传密码的简并性，这种混同在理论上是 可行的 ，但需要作同源性检验以克服主观因 素的影响
日本国立遗传研究所（National Institute of Genetics，NIG），ddbj.nig.ac.jp/
北京大学生物信息学中心（Peking University Center of Bioinformatics，PKUCBI）， /
优点与缺点的讨论
与传统的基因克隆方法相比，电子克隆有以 下的优点：
常用软件及网络资源简介
EditSeq是输入并且修剪DNA或蛋白质序列的 工具。EditSeq能读取大部分的序列格式，也 可以通过使用键盘输入，或者从其他地方复 制、粘贴得到。序列被打开后，EditSeq能使 用标准或者指定的遗传密码进行翻译或反翻 译、寻找开放读框以及进行阅读校对
如何做拼图游戏
以构建的重叠序列群为信息标签，进一 步检索比对，搜索其高度同源序列
如果发现了与之高度同源的未知序列，则重复上述步骤；若没 有新的发现，说明拼接组装得到的EST可能囊括了所以可能的 目的基因序列
根据以上步骤，得到了一个全长为1678 bp的EST序列
如何做拼图游戏
什么是电子克隆
表达序列标签（expressed sequence tags， EST）是对某个基因cDNA克隆测序所得的部 分序列片段，长度大约为200~600bp
由于基因表达调控作用不同，同一个基因的 mRNA剪接位点和方式不同，所以同一个基 因的全长cDNA可能包含多个EST
EST既代表了基因cDNA的某一区段，也表征 了成熟mRNA可能的剪接方式
传统的方法如同小规模地捕捞一条或几条鱼，电子克隆与之相 比就如同集约化地捕捞一群鱼
拼图游戏一样的原理
相近的物种在核酸序列上有相似性，相近物 种中的同源基因序列在一定程度上可以代表 目的基因的序列
可代表程度与两序列的相似度直接相关，加 之遗传密码的简并性，这种混同在理论上是 可行的 ，但需要作同源性检验以克服主观因 素的影响
日本国立遗传研究所（National Institute of Genetics，NIG），ddbj.nig.ac.jp/
北京大学生物信息学中心（Peking University Center of Bioinformatics，PKUCBI）， /
优点与缺点的讨论
与传统的基因克隆方法相比，电子克隆有以 下的优点：
常用软件及网络资源简介
EditSeq是输入并且修剪DNA或蛋白质序列的 工具。EditSeq能读取大部分的序列格式，也 可以通过使用键盘输入，或者从其他地方复 制、粘贴得到。序列被打开后，EditSeq能使 用标准或者指定的遗传密码进行翻译或反翻 译、寻找开放读框以及进行阅读校对
《电子克隆》PPT课件
步骤 2：找到并打开包含OsG6PDH基因的水稻基因组序列 注意OsG6PDH基因在水稻该基因组序列中的大概位置
14
步骤 3：选择拷贝合适大小的包含G6PDH基因的水稻基因组序列
15
步骤4：去除序列中的数字（可以粘贴进入bioxm中，再复 制出来)
16
步骤5：将复制的序列输入Softberry （）网站的FGENESH程序进行基 因结构（外显子大小和位置）的预测
步骤2：选择能够尽可能覆盖玉米序列的水稻EST序列进行拼22 接
Os6PGDH 的克隆：
步骤3：利用BioXM或者DNAssist程序进行EST序列拼接
23
Os6PGDH 的克隆：
步骤3：利用BioXM或者DNAssist程序进行EST序列拼接
选择部分第2条序列的头部序列搜索第1条序列
24
重要通知:
计算机
RT-PCR，克隆，测序
EST拼接
5
利用EST资料
人工
种子核苷酸序列 BLASTn
水稻EST数据库 序列拼接
计算机
直到无法继续延伸或已经具备 完整的ORF
RT-PCR，克隆，测序
6
OsG6PDH 的克隆
以小麦G6PDH蛋白（BAA97662 ）搜索水稻nr数据库结果7
OsG6PDH 的克隆
12
1.什么是传统机械按键设计？
传统的机械按键设计是需要手动按压按键触动PCBA上的 开关按键来实现功能的一种设计方式。
传统机械按键结构层图：
按
பைடு நூலகம்
PCBA
键
开关 键
传统机械按键设计要点： 1.合理的选择按键的类型， 尽量选择平头类的按键，以 防按键下陷。 2.开关按键和塑胶按键设计 间隙建议留0.05~0.1mm，以 防按键死键。 3.要考虑成型工艺，合理计 算累积公差，以防按键手感 不良。
相关主题
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性，平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益，请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间：9:00-18:30)。
信息科学技术特别是数据库技术在战后 飞速发展
.
3
什么是电子克隆
表达序列标签（expressed sequence tags， EST）是对某个基因cDNA克隆测序所得的部 分序列片段，长度大约为200~600bp
由于基因表达调控作用不同，同一个基因的 mRNA剪接位点和方式不同，所以同一个基 因的全长cDNA可能包含多个EST
.
16
如何做拼图游戏
对延伸出的cDNA其作人工的可靠性验证 提取水稻中总RNA，进行RT-PCR，电泳检
测结果 转录调控的研究
.
17
常用软件及网络资源简介
DNAStar是一款电子克隆中常用的软件包， 它以功能全面和强大而著称，它主要包括以 下几个应用程序：EditSeq、GeneMan、 GeneQuest、MapDraw、MegAlign、 PrimerSelect、Protean、和SeqMan II
电子克隆简介
南京农业大学生命科学学院 沈文飙
.
1
什么是电子克隆 拼图游戏一样的原理 应用 如何做拼图游戏 常用软件及网络资源简介 优点与缺点的讨论 现状与展望
.
2
什么是电子克隆
Watson & Crick 成功解析了DNA分子 二级结构，开创了分子生物学时代
Karry Mullis 发明了PCR反应，体外大 规模、有目的和快速地克隆目标基因成 为可能
.
12
如何做拼图游戏
将检索得到的同源序列保存到PC机上，运行 DNAStar软件包，将上述序列输入，由于基 因测序是借助质粒载体完成的，序列中难免 混有载体序列，因此需要运行程序查找载体 序列，对序列进行末段修剪去掉冗余部分
.
13
如何做拼图游戏
程序根据外显子和内含子的编码规则和排布 方式搜索和定位开放阅读框，开放阅读框是 电子克隆的重点研究对象；接着，程序对各 段序列的重复序列和差异序列进行逐一检索 和比对，并对重叠区域进行拼接和组装，构 建重叠序列群
EST既代表了基因cDNA的某一区段，也表征 了成熟mRNA可能的剪接方式
.
4
什么是电子克隆
电子克隆技术是生物学数据库中EST数据库、 核酸序列数据库、基因组数据库，采用同源 性序列比对和归类分析、重叠区域组装和拼 接等方法延长EST序列，直至没有与之同源 的序列可供拼接为止，所得到的序列可以认 为是相对应基因的全长cDNA，根据所得的 cDNA序列设计囊括开放阅读框两端的引物， 进行RT-PCR克隆出相应基因的方法
.
5
什么骤繁琐、成 本高、得率低；运用电子克隆的方法延伸得 到的cDNA几乎囊括了所有疑似为目的基因的 cDNA序列，无论表达转录如何调控，都能通 过PCR扩增出表达的那一段基因
.
18
常用软件及网络资源简介
EditSeq是输入并且修剪DNA或蛋白质序列的 工具。EditSeq能读取大部分的序列格式，也 可以通过使用键盘输入，或者从其他地方复 制、粘贴得到。序列被打开后，EditSeq能使 用标准或者指定的遗传密码进行翻译或反翻 译、寻找开放读框以及进行阅读校对
.
19
常用软件及网络资源简介
以上各步骤由程序自动完成
.
14
如何做拼图游戏
以构建的重叠序列群为信息标签，进一 步检索比对，搜索其高度同源序列
如果发现了与之高度同源的未知序列，则重复上述步骤；若没 有新的发现，说明拼接组装得到的EST可能囊括了所以可能的 目的基因序列
根据以上步骤，得到了一个全长为1678 bp的EST序列
分析和定位开放阅读框 虚拟翻译并对多肽链序列检索比对 可靠性检查 分析与之相关的调控序列
.
11
如何做拼图游戏
以电子克隆新的水稻过氧化氢酶（catalase， CAT）基因为例，简介延伸cDNA的流程：
以登录号为CA759712的EST在对其在核酸序 列数据库中进行BLAST检索比对时，发现登 录号为CB652681的序列推测为水稻CAT基因 的部分序列，与信息标签 EST具有比较高的 同源性，该EST序列将作为种子序列
.
7
拼图游戏一样的原理
借助计算机找到具有相同或相似图案的图块， 拼成完整的图案，我们需要做的是进行局部 的微调。
剩下的工作就是对拼接出的cDNA进行可能的 开放阅读框的分析，设计囊括开放阅读框两 端的引物，RT-PCR扩增侯选基因
.
8
应用
电子克隆主要应用于两个方面： 一个是利用EST序列检索同源性序列，并由
.
15
如何做拼图游戏
以此EST序列为cDNA序列，对其设计囊括整 个开放阅读框的特异性引物，设计得到的上 游引物为：5’-CTA-GCC-CAC-TAC-CATGGA-TCC-TTG-3’，下游引物为：5’-CAGAAT-TTC-TGT-AGC-CTT-GCT-GAT-3’，
引物的具体合成可交由经营分子生物学相关产业的公司商业化 合成
GeneQuest可以发现注释DNA序列中的基因， 并提供相关的参数，包括ORF、拼接位点、 转录因子结合位点、重复序列、限制性内切 酶酶切位点等。通过应用“methods”命令， 序列的各项相关信息和参数可以以图形的形 式展示出来。
.
20
常用软件及网络资源简介
MapDraw可以制作简单的线性图到有注释的 环形图，在展示限制性酶切位点的同时，还 可以同时展示序列的feature、开放阅读框及 其翻译结果。MapDraw工具主要应用与规划 酶切位点和克隆实验，产生详细和充分的结 果概括
此拼接cDNA序列以期挖掘新基因 另一方面是在全基因组已经测序的物种中，
研究整个基因组序列以推测其中可能尚未发 现的基因 目前应用比较广泛的是第一方面
.
9
应用
数据库查询 数据库比对 文件下载 序列分析 序列装配 分子模型 结构分析 功能分析
.
10
应用
在全基因组已经测序的物种中推测新基因的 步骤如下：
传统的方法如同小规模地捕捞一条或几条鱼，电子克隆与之相 比就如同集约化地捕捞一群鱼
.
6
拼图游戏一样的原理
相近的物种在核酸序列上有相似性，相近物 种中的同源基因序列在一定程度上可以代表 目的基因的序列
可代表程度与两序列的相似度直接相关，加 之遗传密码的简并性，这种混同在理论上是 可行的 ，但需要作同源性检验以克服主观因 素的影响
.
3
什么是电子克隆
表达序列标签（expressed sequence tags， EST）是对某个基因cDNA克隆测序所得的部 分序列片段，长度大约为200~600bp
由于基因表达调控作用不同，同一个基因的 mRNA剪接位点和方式不同，所以同一个基 因的全长cDNA可能包含多个EST
.
16
如何做拼图游戏
对延伸出的cDNA其作人工的可靠性验证 提取水稻中总RNA，进行RT-PCR，电泳检
测结果 转录调控的研究
.
17
常用软件及网络资源简介
DNAStar是一款电子克隆中常用的软件包， 它以功能全面和强大而著称，它主要包括以 下几个应用程序：EditSeq、GeneMan、 GeneQuest、MapDraw、MegAlign、 PrimerSelect、Protean、和SeqMan II
电子克隆简介
南京农业大学生命科学学院 沈文飙
.
1
什么是电子克隆 拼图游戏一样的原理 应用 如何做拼图游戏 常用软件及网络资源简介 优点与缺点的讨论 现状与展望
.
2
什么是电子克隆
Watson & Crick 成功解析了DNA分子 二级结构，开创了分子生物学时代
Karry Mullis 发明了PCR反应，体外大 规模、有目的和快速地克隆目标基因成 为可能
.
12
如何做拼图游戏
将检索得到的同源序列保存到PC机上，运行 DNAStar软件包，将上述序列输入，由于基 因测序是借助质粒载体完成的，序列中难免 混有载体序列，因此需要运行程序查找载体 序列，对序列进行末段修剪去掉冗余部分
.
13
如何做拼图游戏
程序根据外显子和内含子的编码规则和排布 方式搜索和定位开放阅读框，开放阅读框是 电子克隆的重点研究对象；接着，程序对各 段序列的重复序列和差异序列进行逐一检索 和比对，并对重叠区域进行拼接和组装，构 建重叠序列群
EST既代表了基因cDNA的某一区段，也表征 了成熟mRNA可能的剪接方式
.
4
什么是电子克隆
电子克隆技术是生物学数据库中EST数据库、 核酸序列数据库、基因组数据库，采用同源 性序列比对和归类分析、重叠区域组装和拼 接等方法延长EST序列，直至没有与之同源 的序列可供拼接为止，所得到的序列可以认 为是相对应基因的全长cDNA，根据所得的 cDNA序列设计囊括开放阅读框两端的引物， 进行RT-PCR克隆出相应基因的方法
.
5
什么骤繁琐、成 本高、得率低；运用电子克隆的方法延伸得 到的cDNA几乎囊括了所有疑似为目的基因的 cDNA序列，无论表达转录如何调控，都能通 过PCR扩增出表达的那一段基因
.
18
常用软件及网络资源简介
EditSeq是输入并且修剪DNA或蛋白质序列的 工具。EditSeq能读取大部分的序列格式，也 可以通过使用键盘输入，或者从其他地方复 制、粘贴得到。序列被打开后，EditSeq能使 用标准或者指定的遗传密码进行翻译或反翻 译、寻找开放读框以及进行阅读校对
.
19
常用软件及网络资源简介
以上各步骤由程序自动完成
.
14
如何做拼图游戏
以构建的重叠序列群为信息标签，进一 步检索比对，搜索其高度同源序列
如果发现了与之高度同源的未知序列，则重复上述步骤；若没 有新的发现，说明拼接组装得到的EST可能囊括了所以可能的 目的基因序列
根据以上步骤，得到了一个全长为1678 bp的EST序列
分析和定位开放阅读框 虚拟翻译并对多肽链序列检索比对 可靠性检查 分析与之相关的调控序列
.
11
如何做拼图游戏
以电子克隆新的水稻过氧化氢酶（catalase， CAT）基因为例，简介延伸cDNA的流程：
以登录号为CA759712的EST在对其在核酸序 列数据库中进行BLAST检索比对时，发现登 录号为CB652681的序列推测为水稻CAT基因 的部分序列，与信息标签 EST具有比较高的 同源性，该EST序列将作为种子序列
.
7
拼图游戏一样的原理
借助计算机找到具有相同或相似图案的图块， 拼成完整的图案，我们需要做的是进行局部 的微调。
剩下的工作就是对拼接出的cDNA进行可能的 开放阅读框的分析，设计囊括开放阅读框两 端的引物，RT-PCR扩增侯选基因
.
8
应用
电子克隆主要应用于两个方面： 一个是利用EST序列检索同源性序列，并由
.
15
如何做拼图游戏
以此EST序列为cDNA序列，对其设计囊括整 个开放阅读框的特异性引物，设计得到的上 游引物为：5’-CTA-GCC-CAC-TAC-CATGGA-TCC-TTG-3’，下游引物为：5’-CAGAAT-TTC-TGT-AGC-CTT-GCT-GAT-3’，
引物的具体合成可交由经营分子生物学相关产业的公司商业化 合成
GeneQuest可以发现注释DNA序列中的基因， 并提供相关的参数，包括ORF、拼接位点、 转录因子结合位点、重复序列、限制性内切 酶酶切位点等。通过应用“methods”命令， 序列的各项相关信息和参数可以以图形的形 式展示出来。
.
20
常用软件及网络资源简介
MapDraw可以制作简单的线性图到有注释的 环形图，在展示限制性酶切位点的同时，还 可以同时展示序列的feature、开放阅读框及 其翻译结果。MapDraw工具主要应用与规划 酶切位点和克隆实验，产生详细和充分的结 果概括
此拼接cDNA序列以期挖掘新基因 另一方面是在全基因组已经测序的物种中，
研究整个基因组序列以推测其中可能尚未发 现的基因 目前应用比较广泛的是第一方面
.
9
应用
数据库查询 数据库比对 文件下载 序列分析 序列装配 分子模型 结构分析 功能分析
.
10
应用
在全基因组已经测序的物种中推测新基因的 步骤如下：
传统的方法如同小规模地捕捞一条或几条鱼，电子克隆与之相 比就如同集约化地捕捞一群鱼
.
6
拼图游戏一样的原理
相近的物种在核酸序列上有相似性，相近物 种中的同源基因序列在一定程度上可以代表 目的基因的序列
可代表程度与两序列的相似度直接相关，加 之遗传密码的简并性，这种混同在理论上是 可行的 ，但需要作同源性检验以克服主观因 素的影响