基因表达的调控
普通遗传学第十四章 基因表达的调控
第一节 原核生物的基因调控
一、转录水平的调控
→原核生物基因表达的调控主要发生在 转录水平。
→当需要某一特定基因产物时,合成这 种mRNA。当不需要这种产物时, mRNA转录受到抑制。
1、乳糖操纵元模型
大肠杆菌的乳糖降解代谢途径: Monod等发现,当大肠杆菌生长在含有乳 糖的培养基上时,乳糖代谢酶浓度急剧增 加;当培养基中没有乳糖时,乳糖代谢酶 基因不表达,乳糖代谢酶合成停止。 为此,Jacob和Monod(1961)提出了乳糖 操纵元模型,用来阐述乳糖代谢中基因表 达的调控机制
转录效率更高
→在有葡萄糖存在时,不能形成cAmp, 也就没有操纵元的正调控因子cAmp-CAP 复合物,因此基因不表达。
乳糖操纵元的正调控
2、色氨酸操纵元
大肠杆菌色氨酸操纵元是合成代谢途径中 基因调控的典型例子。
◆trp操纵元由5个结构基因trpE、trpD、trpC、
trpB和trpA组成一个多顺反子的基因簇。 5′端是启动子、操纵子、前导顺序(trpL)和 衰减子(attenuator)。
❖ 负调控:存在细胞中的阻遏物阻止转录过程的 调控。
❖ 正调控:调节蛋白和DNA以及RNA聚合酶相 互作用来帮助起始。诱导物通常与另一蛋白质结 合形成一种激活子复合物,与基因启动子DNA序 列结合,激活基因起始转录。
原核生物中基因表达以负调控为主, 真核生物中 则主要是正调控机制。
图 14-1 正调控和负调控
2、反义RNA调控
反义RNA可与目的基因的5’UTR( untranslated region )互补配对,配对的区域 通常也包括启动子的SD序列,使mRNA不能与 核糖体有效结合,从而阻止蛋白质的合成。
反义RNA基因已被导入真核细胞,控制真核生 物基因表达。例如,将乙烯形成酶基因的反义 RNA导入蕃茄,大大延长了蕃茄常温贮藏期。
基因表达的调控机制
基因表达的调控机制基因是生物体内控制遗传信息传递和蛋白质合成的重要单位。
基因表达的调控机制是指在不同的细胞类型、生物阶段和环境条件下,如何控制基因的转录和翻译活动,使得特定的基因在特定的时间和地点进行表达。
这种调控机制对于维持生物体内稳态、适应环境变化以及发展、生长和繁殖等生命过程至关重要。
本文将从转录、RNA加工、转运和翻译四个方面介绍基因表达的调控机制。
一、转录的调控转录是基因表达的第一步,是指将DNA转录成RNA,从而实现基因信息的转换。
转录的调控涉及到启动子、转录因子和表观遗传修饰等多种因素。
启动子是位于基因上游的DNA区域,包含特定的顺式作用元件,如TATA盒和启动子序列。
通过与转录因子相互作用,启动子能够吸引RNA聚合酶,使其在该区域上的结合和启动转录过程。
转录因子是一类能够与DNA特异性结合的蛋白质,可以促进或抑制基因的转录。
转录因子与启动子之间的结合关系是基因表达调控的关键。
其中包括激活转录因子和抑制转录因子。
激活转录因子能够与RNA聚合酶形成复合物,从而促进转录的进行,而抑制转录因子则能够阻断RNA聚合酶与DNA之间的相互作用,从而抑制转录。
此外,表观遗传修饰也是基因表达调控的重要机制。
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白修饰和非编码RNA等。
DNA甲基化是通过在DNA的甲基化位点上结合甲基基团来调控基因的表达。
组蛋白修饰则是通过改变组蛋白的翻译后修饰状态,如酶解修饰和乙酰化修饰等,以改变染色质的结构和亲缘性。
非编码RNA则具有多种功能,能够干扰DNA的转录和翻译,从而调控基因的表达。
二、RNA加工的调控在转录完成后,RNA还需要经历一系列的加工步骤才能形成成熟的mRNA。
RNA加工包括剪接、剪切、聚合化和修饰等环节。
剪接是指将mRNA的内含子剪除,同时将外显子连接起来的过程。
剪接的方式多样,可以通过选择性剪接产生多个不同的mRNA转录本,从而增加基因的多样性和功能。
剪切是指在剪接之前,将RNA的两端以及内部进行剪切处理,从而形成可供剪接的RNA单链结构。
生物化学》ppt课件14.第十四章-基因表达调控
1.操纵子的结构与功能
一个操纵子=调节序列+启动序列+操纵序列+编码序列
⑴调节序列(inhibitor,I):编码一种阻遏蛋白(repressor) 。 ⑵启动序列(promoter,P):结合RNA聚合酶,启动转录。 ⑶操纵序列(operator,O):阻遏蛋白的结合位点。 ⑷编码序列(coding sequence):编码功能性蛋白,2~6个。
第一节 基因表达调控的 概念和原理
(Concept and principle: Regulation of Gene Expression)
一、基因表达调控的概念
(一)基因表达(gene expression) 是指基因经过
转录、翻译,产生具有特异生物学功能的蛋白 质分子的过程。
(二)基因表达的时间性及空间性
转录激活域
谷氨酰胺富含域 脯氨酸富含域
蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域)
1.同源结构域
2.锌指
3.碱C
H
C
Cys
H
His
其他氨基酸
(四)真核生物基因表达调控模式
1.真核生物基因表达调控较复杂,除转录起始阶段 受到调节外,在转录后水平、翻译水平及翻译后水平 等均受调控。
2.真核RNA聚合酶Ⅱ在转录因子帮助下,形成的 转录起始复合物。
白 因 子 , 决 定 三 种 RNA(mRNA 、 tRNA 及 rRNA)转录的类别。
2.特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需,决定该基因的时
第十三章基因表达的调节基因表达调节的基本概念及原理原核
组成性基因表达也是相对的,而不是一成不变 的,其表达强弱也是受一定机制调控的。
(2)诱导和阻遏表达
适应性表达指环境的变化容易使其表达水 平变动的一类基因表达。
改变基因表达的情况以适应环境,例如与适宜 温度下生活相比较,在冷或热环境下适应生活的 动物,其肝脏合成的蛋白质图谱就有明显的不同 ;长期摄取不同的食物,体内合成代谢酶类的情 况也会有所不同。所以,基因表达调控是生物适
激活蛋白
启p动o序列 操纵序列 编码序列 l
真核基因的调节蛋白--反式作用因子(转录因子)
由某一基因表达产生的蛋白质因子,通过 与另一基因的特异的顺式作用元件相互作用, 调节其表达。这种调节作用称为反式作用。
DNA
a
mRNA
蛋白质A
A
反式调节
A
B
转录调节因子结构
DNA结合域
转录激活域
酸性激活域 谷氨酰胺富含域 脯氨酸富含域
四、基因表达调控的基本原理
1、基因表达的多级调控
基因 激活
转录水平的基因表达调控最重要
转录起始 转录后加工 mRNA降解
蛋白质翻译
翻译后加工修饰
蛋白质降解等
2、特异DNA序列对基因转录激活的调节
基因转录激活调节基本要素
基因表达的调节与基因的结构、性质, 生物个体或细胞所处的内、外环境,以及细 胞内所存在的转录调节蛋白有关。
4)有乳糖,无葡萄糖时:
RNA-pol
细胞内cAMP含量高, cAMP与CAP结合成复合
O
物,与DNA结合,并推动 RNA-pol向前移动,促进
mRNA
转录。
乳糖与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与
解释基因表达的调控机制。
解释基因表达的调控机制。
> 原题:解释基因表达的调控机制基因表达调控是指在细胞中控制基因转录和翻译的过程。
通过调控基因表达,细胞可以根据内外环境的需求来合成所需的蛋白质。
基因表达调控涉及多个环节和分子机制。
一、转录调控1. 转录因子:转录因子是一类可以与DNA结合的蛋白质,它们能够促进或抑制特定基因的转录。
转录因子的结合位点通常位于基因的启动子区域,它们可以通过调控转录复合物的形成来影响RNA聚合酶的结合和启动转录的过程。
2. 染色质修饰:染色质修饰是指对DNA及其相关的蛋白质进行化学修饰,从而改变染色质结构和可访问性。
例如,DNA甲基化可以抑制某些基因的转录,而组蛋白乙酰化则可以促进基因的转录。
二、转录后调控1. RNA剪接:RNA剪接是一种将RNA前体分子中的内含子去除,将外显子连结起来的过程。
通过不同的剪接方式,可以产生不同的mRNA亚型,从而影响蛋白质的翻译。
2. mRNA降解:mRNA降解是指将mRNA分解为较小的碎片,从而停止蛋白质的合成。
通过调控mRNA的稳定性,可以控制基因的表达水平。
三、翻译调控1. 转运调控:通过调控mRNA的转运过程,可以控制mRNA的定位和稳定性。
这种调控方式可以影响基因的表达水平。
2. 蛋白质修饰:蛋白质修饰是指在翻译后对蛋白质进行化学修饰的过程。
蛋白质修饰可以影响蛋白质的功能、稳定性和亚细胞定位。
综上所述,基因表达调控涉及转录调控、转录后调控和翻译调控等多个层面和分子机制。
这些调控机制相互作用,共同影响基因的表达水平和细胞的功能。
对这些调控机制的深入研究,有助于我们更好地理解生物体的发育、生长和适应环境的能力。
基因表达的调控机制
基因表达的调控机制基因表达是指基因通过转录和翻译过程将DNA信息转化为蛋白质的过程。
在细胞内,基因表达的调控机制起着至关重要的作用,决定了细胞的功能和特性。
本文将介绍基因表达的调控机制,包括转录调控、转录后调控和翻译调控。
一、转录调控转录调控是指通过调控基因的转录过程来控制基因表达水平。
转录调控主要包括启动子区域的结构和转录因子的结合。
1. 启动子区域的结构启动子是位于基因上游的DNA序列,包含转录起始位点和调控元件。
调控元件包括增强子和抑制子,它们可以与转录因子结合,促进或抑制转录的发生。
启动子区域的结构可以通过DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等方式进行调控。
2. 转录因子的结合转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质,它们通过与启动子区域的调控元件结合来调控基因的转录。
转录因子可以分为激活子和抑制子,激活子能够促进转录的发生,而抑制子则能够抑制转录的发生。
转录因子的结合与DNA序列的亲和性有关,不同的转录因子结合到不同的DNA序列上,从而实现对基因的调控。
二、转录后调控转录后调控是指在转录完成后,通过调控RNA的加工、修饰和稳定性来控制基因表达水平。
转录后调控主要包括RNA剪接、RNA修饰和RNA降解。
1. RNA剪接RNA剪接是指在转录过程中,将前体mRNA中的内含子剪接掉,将外显子连接起来形成成熟的mRNA。
通过剪接的方式,可以产生不同的mRNA亚型,从而调控基因的表达。
RNA剪接的调控主要依赖于剪接因子的结合和剪接位点的选择。
2. RNA修饰RNA修饰是指在转录后,通过添加化学修饰基团来改变RNA的结构和功能。
常见的RNA修饰包括甲基化、腺苷酸转换和伪尿苷酸转换等。
RNA修饰可以影响RNA的稳定性、转运和翻译效率,从而调控基因的表达。
3. RNA降解RNA降解是指通过核酸酶将RNA分解为小片段,从而降低基因的表达水平。
RNA降解的速度受到RNA的稳定性和降解酶的活性的影响。
不同的RNA分子具有不同的稳定性,一些RNA分子具有较长的半衰期,而另一些RNA分子则具有较短的半衰期。
基因表达的调控
第十三章基因表达的调控一、基因表达调控基本概念与原理:1.基因表达的概念:基因表达(gene expression)就是指在一定调节因素的作用下,DNA分子上特定的基因被激活并转录生成特定的RNA,或由此引起特异性蛋白质合成的过程。
2.基因表达的时间性及空间性:⑴时间特异性:基因表达的时间特异性(temporal specificity)是指特定基因的表达严格按照特定的时间顺序发生,以适应细胞或个体特定分化、发育阶段的需要。
故又称为阶段特异性。
⑵空间特异性:基因表达的空间特异性(spatial specificity)是指多细胞生物个体在某一特定生长发育阶段,同一基因的表达在不同的细胞或组织器官不同,从而导致特异性的蛋白质分布于不同的细胞或组织器官。
故又称为细胞特异性或组织特异性。
3.基因表达的方式:⑴组成性表达:组成性基因表达(constitutive gene expression)是指在个体发育的任一阶段都能在大多数细胞中持续进行的基因表达。
其基因表达产物通常是对生命过程必需的或必不可少的,且较少受环境因素的影响。
这类基因通常被称为管家基因(housekeeping gene)。
⑵诱导和阻遏表达:诱导表达(induction)是指在特定环境因素刺激下,基因被激活,从而使基因的表达产物增加。
这类基因称为可诱导基因。
阻遏表达(repression)是指在特定环境因素刺激下,基因被抑制,从而使基因的表达产物减少。
这类基因称为可阻遏基因。
4.基因表达的生物学意义:①适应环境、维持生长和增殖。
②维持个体发育与分化。
5.基因表达调控的基本原理:⑴基因表达的多级调控:基因表达调控可见于从基因激活到蛋白质生物合成的各个阶段,因此基因表达的调控可分为转录水平(基因激活及转录起始),转录后水平(加工及转运),翻译水平及翻译后水平,但以转录水平的基因表达调控最重要。
⑵基因转录激活调节基本要素:①顺式作用元件:顺式作用元件(cis-acting element)又称分子内作用元件,指存在于DNA分子上的一些与基因转录调控有关的特殊顺序。
基因表达的调控
基因表达的调控基因表达的调控是生物体中基因活动的一个重要过程,通过调控基因的表达水平,维持细胞的功能和稳态。
基因表达调控涉及多个层次,包括转录水平、转译水平和后转录水平等。
下面将对这些层次的基因表达调控进行详细介绍。
一、转录水平调控转录水平调控指的是通过调节基因的转录过程来控制基因表达的水平。
主要的调控方式包括转录激活和转录抑制。
转录激活因子可以与DNA结合,促进转录因子的结合,从而增强转录过程,而转录抑制因子则能够与DNA或转录因子结合,阻碍转录的进行。
此外,染色质的结构也会对基因的转录起到重要的调控作用,如DNA甲基化、组蛋白修饰等都可以改变染色质的状态,进而影响基因的表达。
二、转译水平调控转译水平调控是指调控基因的转录产物(mRNA)的转译过程。
在细胞中,mRNA需要被翻译成蛋白质才能发挥作用。
转译的调控主要包括转录后修饰和mRNA降解两个方面。
在转录后修饰中,mRNA会经历剪接、剪接调控、RNA编辑等多个步骤,来改变它的结构和功能。
而mRNA降解则通过一系列核酸酶的作用,将mRNA降解成短的片段,从而控制基因的表达。
三、后转录水平调控后转录水平调控是指基因表达的调控发生在转录和转译之后的过程。
在这个阶段,蛋白质会经历一系列的修饰和定位过程,以实现其特定的功能。
这些修饰包括糖基化、磷酸化、乙酰化等,它们可以改变蛋白质的稳定性、定位和相互作用等性质。
此外,许多蛋白质需要通过蛋白酶的作用进行裂解,形成活性的多肽或蛋白质片段。
总结起来,基因表达的调控是一个复杂而精细的过程,涉及多个层次的调控机制。
通过转录水平的调控,可以控制基因的转录过程和染色质的结构状态;通过转译水平的调控,可以调节mRNA的转译和降解过程;而后转录水平的调控,则调节了蛋白质的修饰和定位等过程。
这些调控机制相互作用,共同维持了细胞内基因表达的平衡,保证了生物体的正常功能。
基因表达的调控不仅对细胞发育和生理功能具有重要的影响,还与疾病的发生和进展密切相关。
基因表达调控
第一节 基因表达调控的基本原理
目录
一、基因表达的基本方式
按对刺激的反应性,基因表达的方式分为:
1、组成性表达
某些基因在一个个体的几乎所有细胞中持 续表达,通常被称为 管家基因(housekeeping gene)。无论表达水平高低,管家基因较少受环 境因素影响,这类基因表达被视为组成性基因 表达。
(一)调控序列(顺式作用元件)
可影响自身基因转录活性的DNA序列。
调控序列
顺式作用元件 启动子
结构基因
RNA-pol等
反式作用因子
调节蛋白
目录
1. 启动子
真核基因启动子是RNA聚合酶结 合位点周围的一组转录控制组件,至 少包括一个转录起始点以及一些功能 组件。如TATA盒。
目录
2. 增强子(enhancer)
目录
目录
六、转录后加工水平的调控 七、翻译水平的调控
目录
小结
1. 基因表达和基因表达调控的概念 2. 基因表达调控的多级调控模式 3. 转录起始调节的要素
顺式作用元件与反式作用因子 4.操纵子概念及乳糖操纵子调控机理
目录
绝大多数调节蛋白质结合DNA前,需通 过蛋白质-蛋白质相互作用,形成二聚体 (dimer)或多聚体(polymer)。属于蛋白质蛋白 质相互作用.
目录
1. 调节蛋白分类
通用转录因子(general transcription factors) 是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋
白 因 子 , 决 定 三 种 RNA(mRNA 、 tRNA 及 rRNA)转录的类别。TFⅠ、Ⅱ、Ⅲ。
基因 激活
转录起始 转录后加工 mRNA降解
蛋白质翻译 翻译后加工修饰 蛋白质降解等
基因表达与调控
基因表达与调控基因是生物体内蛋白质合成的基本单位,而基因表达与调控则是指基因在不同细胞类型和生理状态下的活性水平调节。
通过基因表达与调控,细胞能够在不同环境中正确地产生所需的蛋白质,从而维持生命的正常功能。
本文将从基因表达、基因调控以及相关机制等方面进行论述。
一、基因表达基因表达是指基因通过转录和翻译过程转化为蛋白质的过程。
基因表达分为几个步骤,包括转录和翻译。
转录是指DNA分子通过酶的作用,在细胞核内转录成RNA分子的过程。
翻译是指RNA通过核糖体和tRNA的配合作用,在细胞质中合成蛋白质的过程。
基因表达的过程中,遵循了中心法则,即DNA→RNA→蛋白质。
二、基因调控基因调控是指通过调节基因的表达水平来控制细胞功能和生物体发育的过程。
基因调控的作用机制很多,包括转录水平的调控、RNA后转录调控以及转译后调控等。
转录调控是指通过控制转录过程中的启动子、转录因子和蛋白质复合体等因素的结合,来调节基因表达。
RNA后转录调控是指通过不同的RNA分子、非编码RNA以及miRNA 等调控因子,对RNA分子进行修饰和降解的过程。
转译后调控是指通过对已合成的蛋白质进行修饰、分解和定位等方式调节基因表达。
三、基因表达与调控的相关机制1. DNA甲基化DNA甲基化是指DNA分子中的一些Cytosine碱基通过甲基化酶的作用而被甲基基团修饰的过程。
DNA甲基化可以影响基因的表达,通常甲基化的基因会出现表达静默的现象,从而达到对基因的调控效果。
2. 转录因子转录因子是指能够与DNA特定区域结合,调控基因表达的蛋白质。
转录因子可以通过结合启动子区域,影响RNA聚合酶与DNA结合的能力,从而调控基因的转录过程。
转录因子的表达量和活性水平可以受到其他调控因素的影响,从而进一步调节基因的表达。
3. miRNAmiRNA(microRNA)是一种短链非编码RNA分子,具有调节基因表达的功能。
miRNA可以与靶基因的mRNA结合,通过抑制其翻译或降解来影响基因的表达水平。
教学课件第五章基因表达的调控Regulationandcontrolofgene
操纵子由结构基因B、A、D以及调控元件I1、 I2、O1、O2和启动子构成。araC基因编码调 节蛋白AraC。
23
AraC 对阿拉伯糖操纵子的调节图
不存在阿拉伯糖时,AraC二聚体与O1、O2及I1 结合,二聚体间相互作用使DNA弯曲成环结构。
由于I2不被占据,B、A、D基因不发生转录,但
例:色氨酸操纵子表达的调控有两种方式: a.通过阻遏蛋白的负调控 b.通过衰减子作用
31
(2)转录衰减的调控
调节区
trpR RNA聚P合酶O
RNA聚合酶
Trp 低时
Trp 高时 Trp
140个核苷酸
结构基因
mRNA 6700个核苷酸
色氨酸操纵子
32
调节区
trpR
PO
前导序列
前导mRNA
1
2
结构基因
(constitutive gene expression)
基因较少受环境因素影响,而是在个 体各个生长阶段的大多数或几乎全部组织 中持续表达,或变化很小。如管家基因。
5
(二)诱导和阻遏表达
诱导表达(induction expression)
在特定环境信号刺激下,有些基 因的表达表现为开放或增强。
阻遏表达(repression expression)
在特定环境信号刺激下,有些基因 的表达表现为关闭或下降。
6
协调表达(coordinance expression)
在一定机制下,功能相关的一组 基因,协调一致,共同表达。
7
四、基因表达的调控的概念
机体各种细胞中含有的相同遗传 信息(相同的结构基因),根据机体的 不同发育阶段、不同的组织细胞及不 同的功能状态,选择性、程序性地表 达特定数量的特定基因的过程。
第7章原核生物基因表达的调控
Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。
Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透过大肠杆
菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的乙酰基转到β-半乳糖苷
上,形成乙酰半乳糖。
gene
正调控
调控蛋白
负调控
结构基因表达
▪ 负调控:抑制基因表达的调控方式 ▪ 正调控:促进基因表达的调控方式
B、特殊代谢物的调控
诱导(induction)
阻遏(repression)
inducer
gene
repressor
gene
特殊代谢物
诱导 阻遏
结构基因表达
诱导物、可诱导基因 阻遏物、可阻遏基因
无葡萄糖、 有乳糖-----cAMP水平高 (2)cAMP与CRP结合形成有活性的
CRP- cAMP 复合物 (3)CRP-cAMP 与Plac结合 (4)增强了RNA聚合酶与启动子的结合
(5)lacZ, lacY 、 lacA高表达
105
40
105
41
乳糖、G存在与否及与操纵子正、负控因素、 基因开放与关闭情况如下:
CRP
Binding
RNA
Promoter
Operator
CRP
Pol. Repressor
cAMP
LacZ
LacY
LacA
Repressor mRNA
STOP
Right there
CRP
Polymerase
cAMP
Repressor
cAMP
CRP
基因表达的调控
基因表达调控(gene regulation或gene control):对 基因表达调控 或 : 基因表达过程的调节。 基因表达过程的调节。 基因表达的组织特异性(tissue specificity): 基因表达的组织特异性(tissue specificity):不同组 织细胞中不仅表达的基因数量不相同,而且基因 织细胞中不仅表达的基因数量不相同, 表达的强度和种类也各不相同。 表达的强度和种类也各不相同。 基因表达的阶段特异性(stage specificity): 基因表达的阶段特异性(stage specificity):细胞分 化发育的不同时期,基因表达的情况是不相同的。 化发育的不同时期,基因表达的情况是不相同的。
魔斑的主要作用: 魔斑的主要作用: (1) ppGpp—四磷酸鸟苷(魔斑I magic spot I) ppGpp—四磷酸鸟苷(魔斑I 调控一些反应的效应物,主要功能是: 调控一些反应的效应物,主要功能是: 抑制rRNA基因的启动子与RNA聚合酶与结合的专一性 基因的启动子与RNA聚合酶与结合的专一性; ① 抑制rRNA基因的启动子与RNA聚合酶与结合的专一性; 抑制多数或大多数基因转录的延伸。 ② 抑制多数或大多数基因转录的延伸。 (2) pppGpp—五磷酸鸟苷(魔斑II magic spot II) pppGpp—五磷酸鸟苷(魔斑II 当细胞缺乏氨基酸时产生ppGpp, 当细胞缺乏氨基酸时产生ppGpp,可在很大范围内做出应急 反应,如抑制核糖体和其他大分子的合成, 反应,如抑制核糖体和其他大分子的合成,活化某些氨基酸操 纵子的转录表达,抑制与氨基酸运转无关的转运系统, 纵子的转录表达,抑制与氨基酸运转无关的转运系统,活化蛋 白水解酶等。 白水解酶等。 空转反应( reaction) 空载tRNA 空转反应(idling reaction)-空载tRNA 松驰型突变(relaxed(rel)mutants) 松驰型突变(relaxed(rel)mutants) 应急因子( factor) 应急因子(stringent factor):RelA
基因表达与调控
❖基因表达(gene expression)是指将来自基因的遗传信息合成功能性基因产物的过程。
基因表达产物通常是蛋白质,但是非蛋白质编码基因如转移RNA(tRNA)或小核RNA(snRNA)基因的表达产物是功能性RNA。
基因表达可以通过对其中的几个步骤,包括转录,RNA剪接,翻译和翻译后修饰,进行调控来实现对基因表达的调控。
基因调控赋予细胞对结构和功能的控制,基因调控是细胞分化、形态发生以及任何生物的多功能性和适应性的基础。
基因调控也可以作为进化改变的底物,因为控制基因表达的时间、位置和量可以对基因在细胞或多细胞生物中的功能(作用)产生深远的影响。
➢转录原核生物的转录是通过单一类型的RNA聚合酶进行的,需要一个称为Pribnow盒的DNA序列以及sigma因子(σ因子)以开始转录。
原核蛋白编码基因的转录产生的是可以翻译成蛋白质的信使RNA(mRNA)真核生物的转录由三种类型的RNA聚合酶进行,每种RNA聚合酶需要一种称为启动子的特殊DNA序列和一组DNA结合蛋白(转录因子)来启动该过程。
RNA聚合酶I负责核糖体RNA(rRNA)基因的转录。
RNA聚合酶II(Pol II)转录所有蛋白质编码基因以及一些非编码RNA加工:RNA(例如snRNA,snoRNA 或长非编码RNA)。
RNA聚合酶III转录5S rRNA,转移RNA(tRNA)基因和一些小的非编码RNA(例如7SK)。
当聚合酶遇到称为终止子的序列时,转录结束。
真核基因的转录会产生RNA的初级转录本(pre-mRNA),必须经过一系列加工才能成为成熟RNA(mRNA)。
RNA的加工包括5端加帽、3端多腺苷酸化和RNA剪接。
RNA加工可能是真核生物细胞核带来的进化优势。
➢RNA的成熟多数生物体中的非编码基因(ncRNA)被转录为需要进一步加工的前体。
核糖体RNA(rRNA)通常被转录为含有一个或多个rRNA的前体rRNA,前体rRNA后来在特定位点被大约150种不同的snoRNA切割和修饰。
基因表达的调控机制
基因表达的调控机制基因表达是指基因信息转录成RNA,再翻译成蛋白质的过程。
在细胞内,基因表达需要受到严格的调控,以确保细胞在不同环境下能够适应并正常运作。
基因表达的调控机制涉及到多个层面,包括转录水平、转录后调控、翻译水平和蛋白后修饰等。
本文将从这些方面介绍基因表达的调控机制。
1. 转录水平的调控转录是基因表达的第一步,也是调控基因表达的关键环节。
在转录水平,基因的表达可以通过启动子区域的甲基化、转录因子的结合、染色质重塑等方式进行调控。
启动子区域的甲基化可以影响转录因子的结合,从而影响基因的转录活性。
转录因子是一类能够结合到DNA上特定序列的蛋白质,它们可以促进或抑制基因的转录。
染色质重塑是指通过改变染色质的结构来影响基因的可及性,从而调控基因的表达水平。
2. 转录后调控转录后调控是指转录后RNA的修饰和稳定性调控。
在细胞核内,RNA经过剪接、剪切、聚腺苷酸化等修饰过程,形成成熟的mRNA。
这些修饰过程可以影响mRNA的稳定性和翻译效率。
另外,miRNA和siRNA等小RNA也可以通过靶向特定mRNA分解或抑制翻译来调控基因表达。
3. 翻译水平的调控翻译是指mRNA上的密码子被翻译成氨基酸序列的过程。
在翻译水平,基因的表达可以通过启动子区域的结构、mRNA的稳定性、翻译因子的结合等方式进行调控。
启动子区域的结构可以影响翻译因子的结合,从而影响翻译的进行。
翻译因子是一类能够结合到mRNA上特定序列的蛋白质,它们可以促进或抑制翻译的进行。
4. 蛋白后修饰蛋白后修饰是指蛋白质合成后,蛋白质经过翻译后修饰的过程。
在细胞内,蛋白质可以通过磷酸化、甲基化、乙酰化等方式进行修饰,从而影响蛋白质的功能和稳定性。
这些修饰过程可以调控蛋白质的活性、亚细胞定位和相互作用等。
综上所述,基因表达的调控机制涉及到转录水平、转录后调控、翻译水平和蛋白后修饰等多个层面。
这些调控机制相互作用,共同调节基因的表达水平,以适应细胞在不同环境下的需要。
生物化学 第39章 基因的表达与调控
调节基因
操纵基因
结构基因
激活蛋白 阻遏蛋白
正转录调控 负转录调控
正转录调控
如果在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入这种调节 蛋白质后基因活性就被开启,这样的调控正转录调控。
调节基因
操纵基因
结构基因
激活蛋白 阻遏蛋白
正转录调控 负转录调控
负转录调控
在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这种调节蛋白 质后基因表达活性便被关闭,这样的调控负转录调控。
可诱导调节
• 指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下, 由原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物 质的诱导下使基因活化。 例:大肠杆菌的乳糖操纵子
酶合成的诱导操纵子模型
cAMP与代谢物激活蛋白
• 代谢物激活蛋白(CAP)/环腺甘酸受体蛋白(CRP)
调控区
结构基因
DNA
P OZ YA
操纵序列
Z: β-半乳糖苷酶 Y: 透酶
启动序列
A:乙酰基转移酶
CAP结合位点 cAMP—CAP复合物
CAP的正调控
ATP
cAMP(环腺甘酸)
腺甘酸环化酶
+ + + + 转录
DNA
基因表达的规律 ——时间性和空间性
• 时间特异性(temporal specificity) 按功能需要,某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序 发生,称之为基因表达的时间特异性。 多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段特异性(stage specificity)。
• 空间特异性(spatial specificity) 在个体生长全过程,某种基因产物在个体按不同组织空间 顺序出现,称之为基因表达的空间特异性。
基因表达调控名词解释
基因表达调控名词解释基因表达调控名词解释,又称为基因调控,是一种过程,它通过影响基因表达水平而调节生物体的特性。
调节这一过程包括对基因在何时,何处,以及如何表达的调节,以及影响基因表达水平的遗传因子的调节。
它是由外部刺激(环境信号)和内部机制(遗传因素)共同作用产生的。
基因表达调控包括以下几个方面:1.转录调控:转录调控是指控制基因转录成mRNA(信使核酸)的过程,也就是控制DNA上的信息被转换成mRNA 的过程。
转录调控可以通过调节转录因子(TF)的活性或改变DNA序列来实现。
2.加工调控:加工调控是指在mRNA被转录之后,mRNA 被进一步加工,以减少它的长度或改变它的结构的过程。
加工调控包括剪切、编码和标记等加工过程。
3.翻译调控:翻译调控是指调节翻译过程的过程,这一过程是将mRNA转换成蛋白质的过程。
翻译调控可以通过调节转录因子的活性或改变mRNA序列来实现。
4.蛋白质表达调控:蛋白质表达调控是指在蛋白质被合成之后,它们的表达水平进一步调节的过程。
蛋白质表达调控可以通过调节转录因子的活性或改变蛋白质序列来实现。
5.基因组学调控:基因组学调控是指改变基因组结构和功能的过程,包括基因组编辑、基因重新排列和基因组组装等过程。
基因组学调控可以通过调节转录因子的活性或改变基因序列来实现。
6.转录因子调控:转录因子调控是指调节转录因子在基因表达过程中所起的作用。
转录因子可以激活或抑制基因表达,调节基因启动子,从而调节基因表达水平。
7.基因突变调控:基因突变调控是指改变基因序列的过程,该过程可以改变基因的结构和功能,从而影响基因表达水平。
基因突变可以在遗传过程中发生,也可以由外界刺激引起。
基因表达调控是生物体发育和遗传的基本原理,它可以帮助我们了解基因如何调节和控制特定的生物过程,从而更好地为人类提供服务。
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• (3)重复序列。即许多重复出现的核苷酸顺序。某些 重复序列出现在调控区,如转录终止区、衰减区及某些 酶或蛋白质结合位点,可能对DNA的复制、转录调控等 有重要意义。
• 多拷贝序列,近1/3的基因是多拷贝的。
• (4)断裂结构。大多数基因都是由外显子和内含子组 成,外显子之间被内含子隔开,形成相间排列的断裂方 式。
• 空间特异性(spatial specificity)在个体生长全
过程,某基因产物在不同组织空间顺序出现。
3. 正调控和负调控
• 正调控(positive control)有调节蛋白(诱导物,inducer)时,基因表达活性被开启。没 有调节蛋白存在时基因是“关闭”的。
• 调节蛋白——诱导物(inducer)
碱性α-螺旋
螺旋—环—螺旋
Zinc Finger Motif
Helix-Turn-Helix Motif
Leucine Zipper
H-Bonding in a Protein-DNA Interaction
2. 转录活性结构域——与其它调控蛋白相互作用, 发挥转录活化功能。 直接与RNA聚合酶作用提高其活性,或与 其它转录因子作用后再作用于RNA聚合酶
6. 基因重排 • 指某些基因片断改变原来存在的顺序而重新排
列组合。
抗体——多样性(抗原特异性),机制之一是B细胞免疫 球蛋白基因重排。
方式: 同源重组 移动基因(转位基因、跳跃基因),如癌基因的转座 基因转化,如病毒基因的整合
二、 转录水平的调控
• 三种因素的相互作用
(1)RNA聚合酶(polII) RNA聚合酶识别DNA序列,形成转录起始复合物 (2)DNA上的调控元件( 顺式作用元件)
(2)尽管有正负调控元件,但正调控机制占主要地位—— RNA聚合酶需要调控蛋白参与才能起始转录
• (3)真核基因的转录和翻译分别在细胞核和细胞质中进行, 这种时空差别使真核基因的调控更复杂、有序。
C. 多级调控
真核细胞基因表达的调控是一个多层 次、多水平的复杂过程
• 转录前调控(DNA水平调控) • 转录调控 • 转录后调控 • 翻译调控 • 翻译后调控
• 负调控(negative control)调节蛋白存在时基因表达活性被“关闭”。没有调节蛋白存在 时基因是表达的。
• 调节蛋白——阻遏物(repressor)
第二节 原核生物的基因表达调控
• 1. 转 录 水 平 的 调 控 —— 操 纵 子 (operon)
• 是原核生物基因表达调控的基本方式
DNA分子上与转录有关的调控序列,包括启动子,增强子 和终止子 (3)转录因子(反式作用因子)
蛋白质因子,包含两个结构域
反式作用因子:蛋白质因子
两种结构域: DNA结合结构域 转录活性结构域
1. DNA结合结构域,与特定DNA序列结合——DNA 结合蛋白
改变DNA的构象,影响基因转录——转录因子
锌指结构域 亮氨酸拉链
• 迅速合成自身需要的蛋白质(酶)、核酸和其 他生物大分子;或迅速停止合成不再需要的成分。
• 真核生物: • 基因表达具有阶段特异性和组织特异性 • 人类基因组大约有3万个基因
受精卵细胞 → 胚胎→ 组织器官 细胞的形态功能不同 细胞内基因表达不同 2%~15%基因表达—— 选择性、程序性地表达特定基因
基因转录后在加工修饰形成成熟的mRNA时,内含 子转录产物被切除。对于同一初级转录本,不同的剪接 方式产生不同mRNA,可翻译出不同的多肽。
• B.真核基因与原核基因有一些相同的表达调控机制, 但在以下几点与原核基因不同:
• (1) DNA与蛋白质形成复杂而有序的染色质结构,转录的 激活与被转录区的染色质结构有关;
• GAPDH或G3PDH,甘油醛-3-磷酸脱氢酶 • β-actin,β-肌动蛋白
• 其表达效率主要由启动子和RNA聚合酶决定,受环境因 素影响较小
2. 适应性表达:大多数基因的表达水平与内外环境的变 化相适应。
• 诱导表达(induction expression) 在特定环境信号刺激
下,基因的表达开放或增强。
• 有些是细胞固有转录因子,与细胞周期、发育等密切相 关。
• 有些能介导激素、生长因子、致癌物等外来刺激所诱导 的转录起始作用。
• 据功能分类: • 1) 基本转录因子——RNA聚合酶与启动子结合所必需
F
H
A
D
B
E
TATA
RNA polⅡ
DNA
TFⅡD TFⅡA TFⅡB polⅡ/ TFⅡF TFⅡE 转录起始前复合物
• 1983年,发现了反义RNA对基因表达的调控; • 1984年,提出用反义RNA来治疗病毒性疾病
第三节 真核生物的基因表达调控
• A.真核生物基因/基因组有如下特点:
• (1)单顺反子。其mRNA只为一条多肽链编码,而真 核细胞蛋白多由几条多肽链组成,因而存在多个基因协 调表达的问题
• (2)基因家族。许多结构相似,功能相关的真核基因 组成一个集合称为基因家族(gene family)。家族中的 成员可以紧密地排在一起,成为一个基因簇;也可分散 在同一染色体的不同部位;也可位于不同染色体上。
• 正负调控之间存在着一种协调:阻遏蛋白的退
离和CAP的结合是lac操纵子表达的必要条件
• 当阻遏蛋白结合于O区而阻碍转录时,CAP结合对转录没有影响; 但如果没有CAP蛋白与CAP位点结合,即便阻遏蛋白退离O区也 不能启动转录。
Four States of the Lac Operon
LacI
Lactose Glucose
• 阻遏表达(repression expression)在特定环境信号刺激
下,基因的表达关闭或减弱。
3. 协同/协调表达 coordinate expression
• 为确保机体代谢有条不紊地进行,需要多基因产物的共同作用。 • 功能相关的一组基因的表达需协调一致,共同表达,这种表达方
式称为协同表达、共表达
与形成
• 小结: • 顺式作用元件是反式作用因子的结合位点 • 转录水平的调控主要是通过顺式作用元件和反式作用因子的相互作用实现的。
• 2. 基因转录的翻译调控——衰减子
• 转录和翻译是紧密偶联的,RNA聚合酶刚转录 出前导肽的部分密码子,核糖体就开始翻译。
• 衰减子调控的实质是以翻译手段调控基因的转 录
Trp衰减子机制 :
Байду номын сангаас高色氨酸水平 形成终止子结构
低色氨酸水平
不形成终止子结构
3. 翻译水平的调控
(1)mRNA稳定性的调控 (2)翻译起始的调控
核糖体结合蛋白 大亚基50S
(3)反义RNA(anti-sense RNA) • 能与特异mRNA互补结合,而调控蛋白质合成的小
分子RNA
• 抑制mRNA的翻译功能 • 结合位点通常是mRNA上的S-D序列、起始密码子AUG和部分N端
的密码子 • 与S-D序列上游集合,改变mRNA二级结构,抑制与核糖体的结合 • 结合DNA,影响复制和转录
• 又称协调调节(coordinated regulation)
2020/6/3
tangbinghua_bucm@
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二、基因表达调控的基本规律
1. 多级调控
2. 具有时间和空间特异性
• 时间特异性(temporal specificity)在多细胞生
物,从受精卵到组织、器官形成的各个发育阶 段,相应的基因严格按照一定的时间顺序开启 或关闭。
• Jacob和Monod于1961年提出大肠杆菌的lac 操
纵子(乳糖操纵子)模型 • 操纵子是由数个相关的结构基因及其调控区组
成。
几个功能相关的结构基因排列在一起受上游同一个调控序列控制,呈现协同表达
结构基因:LacI 编码阻遏蛋白,lacZ 编码β-半乳糖苷酶,lacY 编码通透酶,lacA 编码硫代半乳糖苷转乙酰酶 调 控 区 : 操 纵 基 因 / 序 列 ( operator ) 、 启 动 基 因 / 序 列 ( promoter ) 及 其 它 有 调 控 功 能 的 部 位 组 成
5. 基因扩增 ——细胞内某些特定基因的拷贝数专一性地大量增 加的现象 • 是细胞在短期内为满足某种需要而产生足够的基因
产物的一种调控手段。
• 如:非洲爪蟾卵母细胞中rRNA基因在分裂期扩增了 约4 000倍,使细胞内迅速积蓄起1012个核糖体。
• 一些药物能诱导抗药性基因的扩增,如: 氨甲蝶呤——二氢叶酸还原酶基因 镉汞等重金属——金属硫蛋白I基因 铜离子——铜结合蛋白
组蛋白与DNA的结合与解离,特定DNA序列的暴露
3. DNA的甲基化
• 主要是胞密啶(C)在5位上被甲基化,生成mCG
• 与控制基因表达有关,与疾病有关。
• 低甲基化或未甲基化的基因——转录活跃
• 高度甲基化的基因——不转录、不表达
• 如珠蛋白基因——在红细胞中是低甲基化的,而在不表达珠蛋白的细胞 中则高度甲基化。
诱导物 IPTG
基因“关闭”
复合物
O基因“开启”,结构基因开始表达
• 多顺反子mRNA是为两条或更多条多肽链编码的mRNA,在原核生 物中普遍存在。
• 正调控作用 :
• CAP (分解代谢基因活化蛋白)结合位点:启动子上游( RNA 聚合酶结合部位的上游)
• 只有当CAP与cAMP结合成复合物,才结合到DNA上。结合后有 推动RNA聚合酶前移作用。
-
+
-
-
+
-
CAP-cAMP
+
+
• 所谓基因“关闭”不是绝对的, 只是说基因表达水平 很低,存在基础表达速率。
• 通常,可诱导基因只具有较低的基础表达速率,在受到 诱导物的正调控时,其基因表达增加。如乳糖操纵子。