NGS用于指导晚期恶性肿瘤治疗的 ppt课件
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NGS用于指导晚期恶性肿瘤治疗 2016 ASCO新进展
----精准检测，精准治疗
Insight on Novel Mechanisms and Precision Care
方勇
浙江大学医学院附属邵逸夫医院肿瘤内科
基因检测一览
同病异治 异病同治
遗传性肿瘤 重叠表型
Presented By Claudine Isaacs at 2016 ASCO Annual Meeting
简介
• 在进展期黑色素瘤患者 中Intro，duction抗PD-1治疗有30-45% 的有效率；
• 反应可能持续存在； • 较难辨别有效人群； • 因此需要有效预测标记
物。
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
抗PD-1/PD-L1的候选标记物
特定突变
Specific mutations
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
特定突变
Specific mutations
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
Presented By David Hayes at 2016 ASCO Annual Meeting
以杂交捕获法为基础的二代基因测序法可作为预 测抗PD-1/PD-L1治疗黑色素瘤疗效的标记物
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷比较
Mutation load comparisons
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
在未选择患者中的突变负荷及生存率
在未选择患者中 突变负荷与生存 Mutation load and survival in unselected patients 率无关
码区序列 Aims —突变负荷和特殊突变与临床结果的相关性 —与全外显子测序所得突变负荷相比较
• T细胞受体测序与结果的相关性
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
方法：
Methods
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
600
518 500
425
400
382
300 299 307 278 303 314
200
100
0 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
内容：
NGS指导下的肿瘤免疫治疗 cfDNA检测与肿瘤治疗 NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用
癌症是一种……的疾病?
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
结论
• 二代杂交捕获法为基础的NGS检测突变负荷与抗PD-1/PD-L1疗 效相关
Conclusions
• 236-315个基因突变负荷的检测结果与全外显子测序结果一致
• 通过此法检测突变负荷可能有助于临床的治疗决策和预测疗 效。
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
TCR克隆
TCR clonality
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
潜在临床价值及意义
Potential implications
测序的优势
• 价格更低wk.baidu.com • 品质更高 • 适用范围更广
—机器 Sequencing is … —试剂盒 —软件 • 组织灵活性更高 —石蜡标本 —无需细胞 —甚至RNA！
Presented By David Hayes at 2016 ASCO Annual Meeting
近8年，ASCO年会上与NGS相关的摘要数目投稿
突变负荷和反应
Mutation load and response
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷和反应
Mutation load and response
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷和反应
Mutation load and response
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷和生存率
Mutation load and survival
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
内容：
NGS指导下的肿瘤免疫治疗 cfDNA检测与肿瘤治疗 NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用
背景：
ctDNA PPV vs. tissue biopsy (NSCLC, CRC, Breast, Others)
Candidate biomarkers for anti-PD-1/PD-L1
克隆性增殖，突变或新的抗原
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
目标：
• 假设：小片段基因能精确地代替基因突变负荷 • 以杂交捕获法为基础的二代基因测序法检测236-315个基因编
DNA
• 胚系 —家族性肿瘤综合征
Cancer is a disease of …
—药物基因组学 • 体系
—单核苷酸变异（突变） —短序列插入/缺失 —长序列缺失/扩增 —结构的变异（易位）
免疫系统
• B细胞受体—克隆和多样性 （DNA或RNA）
• T细胞受体—克隆和多样性 （DNA或RNA）
• 突变负荷（RNA或DNA） • 肿瘤亚克隆 • RNA特征
----精准检测，精准治疗
Insight on Novel Mechanisms and Precision Care
方勇
浙江大学医学院附属邵逸夫医院肿瘤内科
基因检测一览
同病异治 异病同治
遗传性肿瘤 重叠表型
Presented By Claudine Isaacs at 2016 ASCO Annual Meeting
简介
• 在进展期黑色素瘤患者 中Intro，duction抗PD-1治疗有30-45% 的有效率；
• 反应可能持续存在； • 较难辨别有效人群； • 因此需要有效预测标记
物。
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
抗PD-1/PD-L1的候选标记物
特定突变
Specific mutations
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
特定突变
Specific mutations
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
Presented By David Hayes at 2016 ASCO Annual Meeting
以杂交捕获法为基础的二代基因测序法可作为预 测抗PD-1/PD-L1治疗黑色素瘤疗效的标记物
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷比较
Mutation load comparisons
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
在未选择患者中的突变负荷及生存率
在未选择患者中 突变负荷与生存 Mutation load and survival in unselected patients 率无关
码区序列 Aims —突变负荷和特殊突变与临床结果的相关性 —与全外显子测序所得突变负荷相比较
• T细胞受体测序与结果的相关性
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
方法：
Methods
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
600
518 500
425
400
382
300 299 307 278 303 314
200
100
0 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
内容：
NGS指导下的肿瘤免疫治疗 cfDNA检测与肿瘤治疗 NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用
癌症是一种……的疾病?
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
结论
• 二代杂交捕获法为基础的NGS检测突变负荷与抗PD-1/PD-L1疗 效相关
Conclusions
• 236-315个基因突变负荷的检测结果与全外显子测序结果一致
• 通过此法检测突变负荷可能有助于临床的治疗决策和预测疗 效。
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
TCR克隆
TCR clonality
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
潜在临床价值及意义
Potential implications
测序的优势
• 价格更低wk.baidu.com • 品质更高 • 适用范围更广
—机器 Sequencing is … —试剂盒 —软件 • 组织灵活性更高 —石蜡标本 —无需细胞 —甚至RNA！
Presented By David Hayes at 2016 ASCO Annual Meeting
近8年，ASCO年会上与NGS相关的摘要数目投稿
突变负荷和反应
Mutation load and response
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷和反应
Mutation load and response
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷和反应
Mutation load and response
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
突变负荷和生存率
Mutation load and survival
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
内容：
NGS指导下的肿瘤免疫治疗 cfDNA检测与肿瘤治疗 NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用
背景：
ctDNA PPV vs. tissue biopsy (NSCLC, CRC, Breast, Others)
Candidate biomarkers for anti-PD-1/PD-L1
克隆性增殖，突变或新的抗原
Presented By Douglas Johnson at 2016 ASCO Annual Meeting
目标：
• 假设：小片段基因能精确地代替基因突变负荷 • 以杂交捕获法为基础的二代基因测序法检测236-315个基因编
DNA
• 胚系 —家族性肿瘤综合征
Cancer is a disease of …
—药物基因组学 • 体系
—单核苷酸变异（突变） —短序列插入/缺失 —长序列缺失/扩增 —结构的变异（易位）
免疫系统
• B细胞受体—克隆和多样性 （DNA或RNA）
• T细胞受体—克隆和多样性 （DNA或RNA）
• 突变负荷（RNA或DNA） • 肿瘤亚克隆 • RNA特征