第十六章DNA的生物合成 Microsoft PowerPoint 演示文稿

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DNA、RNA和蛋白质的生物合成-PPT资料38页

DNA、RNA和蛋白质的生物合成-PPT资料38页

反转录酶是一种多功 能酶: RNA指导的DNA聚 合酶活力;
核糖核酸酶H的 活力:
DNA指导的DNA 聚合酶活力
R 模 板 NA DNA-杂 R化 N 双 A 链 单 链 DN 双 链 DNA
反转录的生物学意义
补充丰富了中心法则
解释了致癌病毒引起 癌细胞产生的机制
RNA的生物合成
需要延长因子(EF): 原核:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)、EF-G 真核:EF-1、EF-2
(一)进位
氨基酰-tRNA根据遗传密码的指引, 在GTP和EF-T的协助下,进入核蛋白体 的A位。
AUG 5'?
3'
fM 2
(二)成肽
转肽酶催化肽键的形成。
55'?'?
AA UU G
33''
fOMH 2 fM
蛋白质生物合成方向:由多肽链的氨基端开始, 向羧基端方向逐步延伸。
合成过程分为:
氨基酸的活化与转移——准备阶段 肽链合成的起始 肽链的延长 肽链的终止
1.氨基酸的活化与转移
氨酰-tRNA合成酶
tRNA携带并转运氨基酸,氨基
酸的结合位点是tRNA3’-末端的CCA-OH。氨基酸和tRNA在氨酰tRNA合成酶的催化下合成氨基酰tRNA。
DNA、RNA和 蛋白质的生物合成
吴菲菲 2019.11.29
转录
复制 DN A 反转录
1958年Crick将生物 遗传信息的这种传递 方式称为中心法则
RN A 复制
翻译
蛋白质
复制—以原来的DNA分子为模板,合成出相同分 子的过程。
转录—在DNA分子上合成出与其核苷酸顺序相对 应的RNA的过程。

DNA的生物合成

DNA的生物合成
DNA聚合酶只能催化DNA链从5'端至3'方向合成,故子链沿着模板复制时,DNA复制的酶学与拓扑学 参与DNA复制的物质 底物(substrate): dATP, dGTP, dCTP, dTTP; 聚合酶(polymerase): 依赖DNA的DNA聚合酶,简写为 DNA-pol; 模板(template): 解开成单链的DNA母链; 引物(primer): 提供3'-OH末端使dNTP可以依次聚合; 其他的酶和蛋白质因子。 生成磷酸二酯键是复制的基本化学反应 (dNMP)n + dNTP → (dNMP)n+1 + PPi DNA 新链生成需引物和模板; 新链的延长只可沿5'→ 3'方向进行 DNA聚合酶(依赖DNA的DNA聚合酶)催化核苷酸之间聚合 活性 5'-3' 的聚合活性 核酸外切酶活性 3'-5'外切酶活性 能辨认错配的碱基对,并将其水解 5'-3'外切酶活性 能切除突变的 DNA片段 原核生物的DNA聚合酶分为三型
双向复制 (bidirectional replication) 定义 原核生物复制时,DNA从起始点(origin)向两个方向解链,形成两个延伸方向相反的复 制叉,称为双向复制 原核生物
A. 环状双链DNA及复制起始点(一个复制点) B. 复制中的两个复制叉 C. 复制接近终止点 真核生物
多个复制起点,多起点双复制特征 从一个DNA复制起点起始的DNA复制区域称为复制子 半不连续复制 (semi-discontinuous replication)
拓扑异构分类 拓扑异构酶Ⅰ 切断DNA双链中一股链,使DNA解链旋转不致打结;适当时候封闭切口, DNA变为松弛状态。 反应不需ATP。 拓扑异构酶Ⅱ

DNA的生物合成

DNA的生物合成

13/16.DNA的生物合成 13.2 原核生物DNA的复制 13.2.1 参与原核DNA复制的酶和蛋白质
1.原核生物的DNA聚合酶 (1)DNA聚合酶Ⅰ:
Klenow片段,含DNA聚合 酶和3´→5´核酸外切酶活性
13/16.DNA的生物合成
13.2 原核生物DNA的复制
13.2.1 参与原核DNA复制的酶和蛋白质
• 基因组能独立进行复制的单位称为复制子,每个复制子都含有控制复制起始
的起点,可能还有终止复制的终点
• 大多数原核生物染色体DNA的复制是双向,形成复制眼,单向复制的特殊形
式,称为滚动环式
• 真核生物染色体DNA是线形双链分子,含有许多复制起点,因此是多复制子。
13/16.DNA的生物合成 13.1 DNA复制的概况 13.1.2 DNA复制的起点和方向
13/16.DNA的生物合成 13.2 原核生物DNA的复制 13.2.1 参与原核DNA复制的酶和蛋白质
1.原核生物的DNA聚合酶
β-滑动夹子 将正在复制的DNA固定在夹子中心,并能随DNA复制沿着模板DNA链滑动 使DNA聚合酶不易从模板脱离,有利于DNA的连续复制
13/16.DNA的生物合成 13.2 原核生物DNA的复制 13.2.1 参与原核DNA复制的酶和蛋白质
2.参与原核生物DNA复制的其他酶和蛋白质 (5)其它蛋白因子
单链结合蛋白(SSB-single-strand binding protein) 稳定已被解开的DNA单链,阻止复性和保护单链不被核酸酶降解。
引发前体 它由多种蛋白质dnaA、dnaB、dnaC、n、n´、n´´ 和i组成。引发前体再与引发
若双链DNA中一条链有切口,一端是3´-OH,另一端是5´-磷酸基,连接酶可 催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。

基因的遗传与表达—DNA的生物合成(生物化学课件)

基因的遗传与表达—DNA的生物合成(生物化学课件)
DNA在代谢上的稳定性并非指DNA是一种惰性物质。
项目一 DNA的生物合成
❖ (二)复制必须具备的基本条件
模板:母链DNA
原料:dNTP(包括dATP、dGTP、dCTP、dTTP) 酶和蛋白质因子: 引物:一小段RNA 能量(ATP)及某些无机离子
项目一 DNA的生物合成 参与DNA复制的酶类与蛋白质因子及其主要作用 1.拓扑异构酶(Topo)
6.DNA连接酶
项目一 DNA的生物合成
作用:在有模板指导的条件下,催化2个DNA片段(两片段间的距离 为1个3' ,5' -磷酸二酯键的键长)的连接。
原理:在一个DNA片段的3' -OH末端和另一个DNA片段的5'-P末端形 成3',5'-磷酸二酯键,从而实现连接。
特点:原核细胞:需辅助因子NAD+ 真核细胞:不需辅助因子NAD+,但需耗能(ATP)
解链酶
项目一 DNA的生物合成
3.单链DNA结合蛋白(DNA结合蛋白)(SSB)
作用:防止重新形成双 链和防止单链模板被核酸酶水解,维持 DNA单链状态和完整性
项目一 DNA的生物合成 4.引物酶 DNA不能从无→有合成,需在一小段RNA基础上合成DNA RNA的合成:需引物酶,它是一种特殊的RNA聚合酶。
项目一 DNA的生物合成 复制起始阶段的特点 真核细胞:具有多个
起始位点
原核细胞:仅有一个复制起始位点,但往往是双向复制
项目一 DNA的生物合成
项目一 DNA的生物合成 链的延长
引物合成后,由DNA polⅢ(真核细胞为DNA聚合酶或)催 化,在引物3'-OH末端逐一添加与模板链对应互补的脱氧核苷 磷酸,使新合成的链不断延长。

DNA的生物合成

DNA的生物合成
第十二章
DNA的生物合成 (复制)
DNA Biosynthesis,Replication
什么是DNA的复制?
是指遗传物质的传代,以母链DNA为模板 合成子链DNA的过程。
复制
亲代DNA
子代DNA
生物的遗传现象,与遗传物质的复制有关, 多数生物的遗传物质为DNA 。
第一节:复制的基本规律
❖ 半保留(semi-conservative ) ❖ 双向复制 (bidirectional replication) ❖ 半不连续复制 (semi-discontinuous replication) ❖ 高保真性 (high fidelity)
(一)原核生物的DNA聚合酶
DNA-pol Ⅰ DNA-pol Ⅱ DNA-pol Ⅲ
(一)原核生物的DNA聚合酶
分子量(kD) 组成
分子数/细胞 5→3核酸外切酶活性 基因突变后的致死性
DNA-pol I 109
单肽链
400 有 可能
DNA-pol II DNA-pol III
120 ?
? 无 不可能
(二). *DNA复制的保真性
•严格地遵守碱基配对规律:A与T、G与C • DNA-pol III 的ε亚基在复制延长中对碱 基的选择功能 • 复制出错时DNA-pol I 有及时的校读功能
三、复制中的分子解链及DNA 分子 拓扑学变化
DNA分子的碱基埋 在双螺旋内部,只有把 DNA解成单链,它才能 起模板作用。
(一)解螺旋酶、引物酶和单链DNA结合蛋白
原核生物复制起始的相关蛋白质
蛋白质(基因)
通用名
DnaA (dnaA) DnaB (dnaB) DnaC (dnaC)
解螺旋酶

DNA合成原理及操作PPT课件

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第三步:偶合(Coupling):亚磷酰胺四唑中间体与CPG所连接的核苷酸的5′ 羟基发生缩合反应,缩合脱掉四唑,形 成延长一个碱基的核苷酸链。
第四步:盖帽(Capping):少量未反应 (2%)的载体上的核苷酸链的5′羟基会 在后续的循环中参加反应,生成少一个 碱基的核苷酸链,因此需要在反应后进 行封闭。常用乙酰化反应与5′羟基缩合 成酯键,一般用混合乙酸酐和N-甲基咪 唑等做乙酰化试剂。
脱盐纯化:12-15小时
合成2-3小时→ 氨解2小时→ 抽干2-3小时→ 脱 盐0.5小时→ 定量分装1小时→ 抽干2-3小时→ 抽
DNA合成中碱基缺失或错误原因分析
一般客户提出异议时,我们首先给客户重新合成,然后再分析原因。 从合成机理上分析就可以很清楚的表明:人为的因素不可能造成碱基
缺失或个别的碱基错误。如果说某一个碱基由于种种原因(如瓶中溶液 没有了,或管道堵塞),未加入到正在延伸的Oligo上,那么下一个反应 Capping将会把Oligo封死,使整个oligo合成立即中止 。造成的原因可 能是: 1、Taq酶的原因。因为在PCR扩增时引物也被扩增,就可能出现错误 , 2、化学原因 。在合成过程中,如果本公司提供的DNA合成报告单是正确的, 表示合成是成功的 。化学合成的DNA片段要比天然的DNA片段有更多的 碱基突变概率。但其真正的化学机理还不太清楚,但可以肯定的是要保 证100%不发生错误是不可能的。 解决的办法: 1、采用高保真的 Taq酶 2、重新挑克隆 3、重合引物
一定要合成效果很好才选用此方法。
4.4 HPLC纯化
HPLC吸附基质分反相柱和离子柱:
RP(反相柱)是根据疏水性的差别来分离 的:疏水性更强的长片段比短片段在柱内保留的时 间更长。

分子生物学原理--DNA的生物合成演示课件

分子生物学原理--DNA的生物合成演示课件
合酶的活性,称为Klenow片段。 • 真核生物中发现的DNA聚合酶有、、和。
09.10.2020
6
DNA聚合酶催化的反应
• 5’到3’的聚合活性 (dNMP)n+dNTP(d
NMP)n+1+Ppi
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7
DNA聚合酶催化的反应
• 5’到3’的聚合活性 (dNMP)n+dNTP(d
09.10.2020
4
第一节 参与DNA复制的酶
• 底物:脱氧三磷酸核苷 • 聚合酶:依赖DNA的DNA聚合酶 • 模板:解开成单链的DNA母链 • 引物:一段寡核苷酸 • 其它酶和蛋白质因子:起解链、理顺双螺
旋、稳定单链的作用。连接酶。
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5
一、DNA聚合酶
• 大肠杆菌中有DNA聚合酶I,II和III。 • Pol III被认为是原核生物细胞内真正起复制作用的酶。 • Pol I可以被蛋白酶分成大小片段,大片段有DNA聚
• 拓扑酶对DNA分子的作用都 是既能水解,又能连接磷酸 二酯键。
• 拓扑酶I:不需要ATP,切断 DNA双链中的一股,使DNA 解链旋转中不打结,适当的 时候又把切口封闭,使DNA 变成松驰状态。
• 拓扑酶II在无ATP时,切断 处于超螺旋的DNA分子,使 超螺旋松驰。在有ATP时, 松驰状态的DNA进入负超螺 旋状态,断口在同一酶催化 下再连接起来。
• 连接酶连接的都是碱基互补基础上的双链中的 单链缺口,它并没有连接单独存在的DNA单 链或RNA单链的作用。
09.10.2020
16
三种酶催化生成磷酸二酯键的比较
提供核糖 3’-OH 提供 5’-P
结果
DNA 聚合酶 连接酶

DNA的生物合成课件

DNA的生物合成课件

(五) 复制的过程 3.复制叉的推进-复制叉推进的过程
一.DNA的复制
② 随后链的合成
冈崎片段的连结:DNA聚合酶 Ⅰ一面以其DNA聚合活 性在上游冈崎片段的3'-OH末端添加 脱氧核苷酸,一面以其5'→3'核酸外 切活性切除引物,直至将引物全部切 除。 DNA连接酶将最后的缺口补好。
(五) 复制的过程 3.复制叉的推进-复制叉推进的过程
第一节 DNA的生物合成
一. DNA的复制
复制部位:
真核生物: 细胞核 原核生物: 细胞质的核质区
(一) 复制的反应
一. DNA的复制
n1d
2TdP 3TdP 4TdPTTP
DNA聚合酶 DNA+ (
DNA模板
n1+n2+n3+n4)PPi
PPi随即被焦磷酸酶水解,从 而推动聚合反应的进行。
(二) 复制的方式 半保留复制
原核生物的DNA 上一般只有一个复制原点,但 在迅速生长时期,第一轮复制尚未完成,就在起 点处启动第二轮复制;
真核生物则有多个复制原点,可以同时启动 复制过程。
(五) 复制的过程
1. 复制的启动
一.DNA的复制
复制过程的调控主要取决于复制启动的频率, 而DNA延长的速度大体上是恒定的。由于真核生物 在多位点上启动复制,所以尽管其DNA比原核生物 DNA大得多,但复制的总速度反而比原核生物快。
(四)参与复制的酶和蛋白质
4. 使DNA双螺旋解开的酶和蛋白质
一.DNA的复制
单链结合蛋白(SSBP): 与解链后的DNA单链结合,阻止其再次形成双
螺旋。大肠杆菌SSB为177 aa 多肽,以四聚体形式 存在,与 32 个 bp DNA 区相结合,结合后的 DN 分子僵硬,不易 弯曲,有利于单链DNA分子的稳 定,避免核酸酶进攻;同时降低了Tm值,进一步 促进DNA的解链。

高中生物 DNA的生物合成课件

高中生物 DNA的生物合成课件

含有解螺旋酶、DnaC蛋白、引物酶和DNA 复制起始区域的复合结构称为引发体。
3
5 3
引物
5
引物是由引物酶催化合成的短链RNA分子。
(二)复制的延长
复制的延长指在 DNA-pol 催化下, dNTP 以 dNMP的方式逐个加入引物或延长中的子链上, 其化学本质是磷酸二酯键的不断生成。
3' 5'

?

T C G AA G T C C T A G C G A C
• 3 5外切酶活性 能辨认错配的碱基对,并将其水解。 • 5 3外切酶活性 能切除突变的 DNA片段。
目录
(一)原核生物的DNA聚合酶
DNA-pol Ⅰ
DNA-pol Ⅱ
DNA-pol Ⅲ
(一)原核生物的DNA聚合酶
拓扑异 构酶Ⅱ
切断DNA分子两股链,断端通过 切口旋转使超螺旋松弛。 利用ATP供能,连接断端, DNA 分子进入负超螺旋状态。
目录
五、DNA连接酶
• DNA连接酶(DNA ligase)作用方式
连接 DNA 链 3-OH 末端和相邻 DNA 链 5-P 末端,使二者生成磷酸二酯键,从而把两段相 邻的DNA链连接成一条完整的链。
DNA-pol I DNA-pol II 分子量(kD) 组成 分子数/细胞 5→3核酸外切酶活性 基因突变后的致死性 109 单肽链 400 有 可能 120 ? ? 无 不可能 DNA-pol III 250 多亚基不对称 二聚体 20 无 可能
DNA-pol Ⅰ
(109kD)
功能:对复制中的错误进行校读,对复制和 修复中出现的空隙进行填补。
• 解螺旋酶(helicase) ——利用ATP供能,作用于氢键,使DNA双链 解开成为两条单链 • 引物酶(primase) ——复制起始时催化生成RNA引物的酶 • 单链DNA结合蛋白(single stranded DNA binding protein, SSB) ——在复制中维持模板处于单链状态并保护单 链的完整

DNA合成原理ppt课件

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O CPG
DM TO
Base 2
O
I2
O
NCH2CH2COP O O
Base 1 O
O CPG
核苷酸的纯化方法
在所有合成循环结束后,就得到一个目标DNA片段粗品, 首先需经过氨解步骤,然后再通过各种方式进行纯化。
氨解
❖切
割:将合成好的寡聚核苷酸从固体载体(CPG)上化学切割下来。 常用新鲜的浓氨水来裂解CPG 上连接化合物与初始核苷间的 酯键。
核酸
磷酸
核苷酸
核苷
戊糖:核糖 碱基:A 、G 、C 、U
脱氧核苷酸
磷酸 脱氧核 苷
戊糖:脱氧核糖 碱基:A 、G 、C 、T
A (腺嘌呤)、G (鸟嘌呤)、C (胞嘧啶)、 U (尿嘧啶)、T (胸腺嘧啶)
HO
O
Base HO
O
Base
O O P OH
OH
O
OH
O P OH
OH
脱氧核苷酸 Base=A, G, C, T
➢ 优点:自动化程度高,省人力,纯化效果好,纯度可达 99%以上,特别是在标记引物和特殊修饰探针纯 化中效果好。
➢ 缺点:纯化量小,不能纯化长片段,设备昂贵。
❖ 各纯化方法的比较
纯化方法
优点和缺点
C18柱脱盐 省时省力,但只能去除盐分,不能去除比目的片段短的小片段。
OPC PAGE HPLC
省时省力,纯化效果略好于C18柱,但对于小片段的去除效果 不太好,并且吸附量低,对于长于25bp的片段纯化效果不好。
➢ 优点:所有纯化方法中最简单的一种。
➢ 缺点:不能有效去除比目的片段短的小片段,前提是合成 效果很好时才能选用此法。
❖ OPC 纯化

DNA的生物合成生物化学课件

DNA的生物合成生物化学课件

SSB曾被称为螺旋反稳定蛋白
(HDP)。在大肠杆菌,它是由177个氨
基酸残基组成的同四聚体,结合单链DNA
的跨度约32个核苷酸单位。
SSB与解开的DNA单链紧密结合,防

重新形成双链,并免受核酸酶降解。在复
制中维持模板处于单链状态。
43
3. DNA拓扑异构酶 (topoisomerase) :
拓扑:是指物体或图像作弹性移位而又保 持物体不变的性质。 拓扑异构酶:是一类可改变DNA拓扑性质 的酶。对DNA分子的作用是既能水解、又
27
28
第二、3′→5′的外切作用(3′→5′exonuclease action)
大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ除具有5′→3′的聚合
作用外,也能催化从3′-末端水解DNA链,而产
生游离的单核苷酸,称为3′→5′的外切作用。
其3′→5′的外切作用对DNA的聚合具有校正功
能。错位接上去的碱基C会被DNA聚合酶Ⅰ的
23
24
三、参与DNA复制的一些酶类和蛋白质
DNA链合成基本条件: dNTP Mg++ 3’-OH引物 DNA模板 酶和蛋白质因子
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(一)DNA聚合酶 DNA聚合酶(DNA polymerase)在有 DNA模板存在时,可催化合成DNA,因此, 又 称 为 DNA 指 导 的 DNA 聚 合 酶 ( DNAdirected DNA polymerase , DDDP )。 1.大肠杆菌DNA聚合酶(原核生物) 1956 年, Kornberg 等人首次从大肠杆 菌的提取液中发现了一种能催化合成 DNA 的酶,称为DNA聚合酶Ⅰ。
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(一)原核生物DNA复制过程 1.复制的起始
6

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DNA复制时,亲代DNA双螺旋解开成为两 条单链,各自作为模板,按照碱基配对规 律合成一条与模板相互补的新链,形成两 个子代DNA分子。每一个子代DNA分子中 都保留有一条来自亲代的链。这种DNA复 制的方式称为半保留复制。
6
DNA半保留复制的实验证明
含15N-DNA的细菌
培养于普 通培养基
第一代细菌 继续培养于 普通培养基
Mechanism of DNA replication
3’
5’
P
P
C
G
P
P
G
C
P
P
A
T
P
3’
P
OH
P
T
A
P
A
T
P
T
5’ 23
template Primer and the direction of new strand
Mechanism of DNA replication
3’
5’
P
P
C
G
P
P
G
复制叉的解链方向
随从链
冈崎片段
5’
3’ 5’
31
四、复制的保真性
新链的延伸过程严格遵守碱基配对的规律,即 A=T,G ≡ C 。
DNA聚合酶对碱基的选择能力,能选择与亲代模 板链正确配对的碱基进入子链相应的位置。
校读修正错配碱基,通过DNA聚合酶的3′→5′外 切酶活性,在碱基发生错配时,及时切除并更换 上正确碱基。
46
三、引物酶和引发体(primase, primosome )
引物酶,即Dna G蛋白,催化引物的生成
引发体,由ori C,Dna A、Dna B、Dna C 及Dna G组成 引物为一段短的RNA片段 为什么需要引物?
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• 半保留复制的实验证据:1958年Meselson和 半保留复制的实验证据:1958年Meselson和 Stahl用同位素 标记大肠杆菌DNA, DNA,首先证明 Stahl用同位素15N标记大肠杆菌DNA,首先证明 DNA的半保留复制 的半保留复制。 了DNA的半保留复制。
15N-DNA的密度大于14N-DNA的密度 DNA的密度大于 DNA的密度
但是它不能将两条游离的DNA单链连接起来。 但是它不能将两条游离的DNA单链连接起来。 DNA单链连接起来
大肠杆菌和其它细菌的DNA连接酶要求NAD 提供能量, 大肠杆菌和其它细菌的DNA连接酶要求NAD+提供能量,在高等生 和其它细菌的DNA连接酶要求 物和噬菌体中,则要求ATP提供能量。T4噬菌体的DNA连接酶不 和噬菌体中,则要求ATP提供能量。T4噬菌体的DNA连接酶不 ATP提供能量 噬菌体的DNA连接酶 仅能在模板链上连接DNA和DNA链之间的切口, 仅能在模板链上连接DNA和DNA链之间的切口,而且能连接无单 DNA 链之间的切口 链粘性末端的平头双链DNA。 链粘性末端的平头双链DNA。 DNA
解螺旋酶 ATP
dnaA、B、C… 、 、
DnaA、B、C… 、 、
2.
单链DNA结合蛋白(SSB) 单链DNA结合蛋白(SSB) DNA结合蛋白
作用:防止单链DNA重 作用:防止单链DNA重 DNA 新形成双链,防止单 新形成双链, DNA被核酸酶水解 链DNA被核酸酶水解
SSB
3. 拓扑异构酶
ATP
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
DNA聚合酶 DNA-pol) 聚合酶( (三) DNA聚合酶(DNA-pol) 即依赖于DNA的DNA聚合酶(DDDP) 即依赖于DNA的DNA聚合酶(DDDP) DNA 聚合酶
原核生物有3 原核生物有3种:
DNA-polⅠ、 Ⅱ、 Ⅲ DNA-polⅠ
真核生物有多种: 真核生物有多种:
DNA聚合酶 聚合酶Ⅲ 是原核生物DNA DNA复制的主要聚合 ⑶ DNA聚合酶Ⅲ:是原核生物DNA复制的主要聚合 酶,该酶由10种亚基组成,其中α、ε、θ形成全酶 该酶由10种亚基组成,其中α 10种亚基组成 的核心酶。具有5 的核心酶。具有5’→3’DNA聚合酶活性( α亚基, DNA聚合酶活性( 亚基, 聚合酶活性 速率高); 具有3 外切酶( 亚基) 速率高); 具有3’ → 5’外切酶(ε亚基)的校 对功能,提高DNA复制的保真性;还具有5’ → 3’ 对功能,提高DNA复制的保真性;还具有5 DNA复制的保真性 外切酶活性(单链有效,其意义未知)。 外切酶活性(单链有效,其意义未知)。 DNA聚合酶IV和 聚合酶IV 1999年发现 年发现, DNA严重 (4) DNA聚合酶IV和V:1999年发现,当DNA严重 损伤时,诱导产生。 损伤时,诱导产生。
DNA聚合酶Ⅰ DNA聚合酶Ⅰ 聚合酶 亚基数目 5’ 3’聚合活性 聚合活性 3’ 5’外切活性 外切活性
保护DNA DNA复制的 (保护DNA复制的 忠实性fidelity fidelity) 忠实性fidelity)
DNA聚合酶Ⅱ DNA聚合酶Ⅱ 聚合酶 >1(多亚基酶 ) + 很低 +
DNA聚合酶Ⅲ DNA聚合酶Ⅲ 聚合酶 >1(多亚基酶) 多亚基酶) + 很高 +
(一)复制的化学反应
N1OH +dN TP +dN2 DNA pol
生成磷酸二酯键 5`
N1N2-OH
5`
3`
+PPi 3`
TAGAAGACCTATTGGCC——5’ 3’——TAGAAGACCTATTGGCC TAGAAGACCTATTGGCC 5 ATCTTCTGGATAACCGG 5’——ATCTTCTGGATAACCGG ATCTTCTGGATAACCGG——3’ 3
第十六章 DNA的生物合成
DNA是生物遗传的主要物质基础, DNA是生物遗传的主要物质基础,生物机体的 是生物遗传的主要物质基础 遗传信息以密码的形式编码在DNA分子上, DNA分子上 遗传信息以密码的形式编码在DNA分子上,表现为 特定的核苷酸排列顺序,并通过DNA DNA的复制由亲代 特定的核苷酸排列顺序,并通过DNA的复制由亲代 传递给子代。在后代的生长发育过程中, 传递给子代。在后代的生长发育过程中,遗传信 息自DNA转录给RNA,然后翻译成特异的蛋白质, DNA转录给RNA,然后翻译成特异的蛋白质 息自DNA转录给RNA,然后翻译成特异的蛋白质,以 执行各种生命功能, 执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的 遗传性状。 遗传性状。
三、
DNA复制的酶学 DNA复制的酶学
模板:解开成单链的DNA DNA母链 1. 模板:解开成单链的DNA母链 底物dNTP dATP,dGTP,dCTP, 2. 底物dNTP :dATP,dGTP,dCTP,dTTP DNA聚合酶 DNA聚合酶, 3. DNA聚合酶,DNA-pol 引物(primer):RNA引物 ):RNA 4. 引物(primer):RNA引物 5. 其他酶和蛋白质因子
1(单体酶) 单体酶) + 中 +
5’ 3’外切活性 外切活性
+
-
DNA 复制的主要 聚合酶, 聚合酶,还具有 3’-5‘ 外切酶 的校对功能, 的校对功能,提 DNA复制的保真 高DNA复制的保真 性
主要是对DNA损伤的 主要是对DNA损伤的 DNA 修复;以及在DNA DNA复 修复;以及在DNA复 制时切除RNA RNA引物并 制时切除RNA引物并 填补其留下的空隙。 填补其留下的空隙。
-
-
+
+
+
功能
引物 合成
修复 线粒体DNA 作用 的复制
核DNA 的复制
修复 作用
DNA连接酶 1967年发现 连接酶( 年发现) (四) DNA连接酶(1967年发现)
若双链DNA中一条链有切口,一端是3 若双链DNA中一条链有切口,一端是3’-OH,另一端是5 ’ DNA中一条链有切口 OH,另一端是5 -磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。 磷酸基,连接酶可催化这两端形成磷酸二酯键,而使切口连接。 3‘ 5‘ OH P 5‘ 3‘
Topo酶 切割DNA链 Topo酶:切割DNA链,使其松弛后再连接 DNA TopoⅡ(DNA Gyrase) Ⅱ )
Helicase
Supercoiled DNA
TOPOⅡ Ⅱ
Helicase
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
TOPOⅡ Ⅱ
DNA的半保留复制的生物学意义: DNA的半保留复制的生物学意义: 的半保留复制的生物学意义 • DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳 DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳 的半保留复制表明DNA 定性, 定性,保证亲代的遗传信息稳定地传递 给后代。 给后代。
DNA在代谢上的稳定性并非指DNA是一种惰性物 DNA在代谢上的稳定性并非指DNA是一种惰性物 在代谢上的稳定性并非指DNA 质。
催化DNA的拓扑连环数发生变化的酶, DNA重组修复和其他 催化DNA的拓扑连环数发生变化的酶,在DNA重组修复和其他 DNA的拓扑连环数发生变化的酶 转变方面起重要作用。 转变方面起重要作用。 除连环数不同外其它性质均相同的DNA分子称为拓扑异构体, 除连环数不同外其它性质均相同的DNA分子称为拓扑异构体, DNA分子称为拓扑异构体 引起拓扑异构体反应的酶称为拓扑异构酶 引起拓扑异构体反应的酶称为拓扑异构酶 拓扑异构酶І: DNA一条链发生断裂和再连接。 拓扑异构酶 :使DNA一条链发生断裂和再连接。作用是松 一条链发生断裂和再连接 解负超螺旋,反应不需要能量。主要集中在活性转录区, 解负超螺旋,反应不需要能量。主要集中在活性转录区, 同转录有关。 同转录有关。 拓扑异构酶Π 拓扑异构酶Π:使DNA两条链发生断裂和再连接。当引 DNA两条链发生断裂和再连接。 两条链发生断裂和再连接 入负超螺旋时需要由ATP提供能量,同复制有关。 ATP提供能量 入负超螺旋时需要由ATP提供能量,同复制有关。 二者共同控制DNA的拓扑结构。 二者共同控制DNA的拓扑结构。 DNA的拓扑结构
5’
3’
二、DNA的半不连续复制 的半不连续复制
拓扑异构酶 单链结合蛋白 解链酶 引物酶及引发体 DNA聚合酶 DNA聚合酶 DNA连接酶 DNA连接酶 引物 领头链 3′ 5′ 冈崎片段
随从链
3′
5′
几个重要概念 1.半不连续性:DNA复制过程中, 1.半不连续性:DNA复制过程中,一条链是连续 半不连续性 复制过程中 复制, 复制,另一条链是不连续复制的现象 2.领头链:链的延长方向(5’→ ) (5 2.领头链:链的延长方向(5 → 3’)与解链方向 领头链 相同, 相同, 为连续复制 随从链: 链的延长方向(5 (5’→ ) 3. 随从链: 链的延长方向(5 →3’)与解链方 向相反, 向相反,为不连续复制 4. 冈崎片段(Okazaki fragment): 冈崎片段( fragment): 不连续复制的片段
(二) 解链相关酶类 解旋酶(helicase) 1. 解旋酶(helicase) 2. 拓扑异构酶(topoisomerase I、II) 拓扑异构酶( I、II) 单链DNA结合蛋白(SSB) DNA结合蛋白 3. 单链DNA结合蛋白(SSB)
1.解旋酶 (helicase) 1.解旋酶
作用:断裂互补碱基间的氢键, DNA成单链 作用:断裂互补碱基间的氢键,使DNA成单链
修复紫外光引起 DNA损伤 的DNA损伤
在真核细胞内有五种DNA聚合酶 与细菌DNA DNA聚合酶的性质基本 在真核细胞内有五种DNA聚合酶 (与细菌DNA聚合酶的性质基本 DNA 相同:底物、模板、引物、方向) 相同:底物、模板、引物、方向) α β γ δ ε 定位 细胞核 细胞核 线粒体 细胞核 细胞核 3’- 5’ 外切 酶活性
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