《合成生物学》PPT课件
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生物大家族中的新成员
不过现在,将会有一些新成员加入到这个生物 大家族。在过去这些年里,科学家一直在尝试从零 开始制造全新的生命形式——用化学物质造出合成 DNA(脱氧核糖核酸),由DNA合成基因,再 由基因形成基因组,最终在实验室造出全新生物体 的分子系统,而这种生物体在自然界从未出现过。
这些向“造物主”的垄断地位发起挑战的人包括工程师、计算机学家、物理学家和 化学家。他们以有别于传统生物学家的视角看待生命,并在2003年开创了一个全新的 研究领域——合成生物学。
异构化等的氨基酸,促进蛋白质结构与功能的研究。
应用示例
• Brenner 提出向细胞DNA中掺入天然不存在的碱基来发展人工遗传系统, 支持人工生命 形式。
• 合成生物学也将对生命起源,其他生命形式的研究作出贡献。
控制生命
• 目前,研究人员正在试图控制细胞的行为,研制 不同的基因线路———即特别设计的、相互影响 的基因。
• Wimmer从装配平均长度为69 bp的寡核苷酸入手,结合了化学合成与无细胞体系的从头 合成,用了3 年时间完成了这个划时代的工作。
Venter 实验室发展了合成基因组
• Φ X-174 噬菌体基因是单链环状 DNA,是历史上第一个被纯化 的DNA 分子,也是第一个被测序的DNA分子。
• Φ X- 174 噬菌体对动植物无害,是合适的合成研究对象。
• 维斯另一项大胆的计划是为成年干细胞编程
• 促进某些干细胞分裂成骨细胞、肌肉细胞或软骨细胞 等,让细胞去修补受损的心脏或生产出合成膝关节。
• 尽管该工作尚处初级阶段,但却是生物学调控领 域中重要的进展。
应用示例
• Schultz 实验室研究向大肠杆菌蛋白质生物合成装置中添入 新组份,使之能通过基因生成非天然的氨基酸,结果取得 了成功。但是要在真核细胞做到这一点还有难度。
《合成生物学》课件
02
合成生物学基本技术
基因编辑技术
基因编辑技术是指通过特定的手 段对生物体的基因组进行精确的 修改,以达到改变其性状的目的 。
基因编辑技术的发展对于人类疾 病治疗、农业生产、生物多样性 保护等方面具有重要意义。
目前最常用的基因编辑技术是 CRISPR-Cas9系统,它能够实现 对基因组的精准定位和高效编辑 。
基因合成技术的发展对于人类疾病治疗、生物制药、农业育种等方面具有重要意义 。
生物信息学技术
生物信息学技术是指利用计算机科学和 数学的方法对生物数据进行分析、处理 和挖掘的技术。
生物信息学技术是合成生物学中的重要技术 之一,它能够实现对生物数据的快速处理和 深度挖掘,为合成生物学的研究提供重要的 数据支持和理论指导。
人工合成噬菌体基因组
总结词
开创性、潜力巨大
详细描述
人工合成噬菌体基因组是一项开创性的工作,展示了合成生物学在解决全球性问题上的 巨大潜力。噬菌体是细菌的天敌,通过人工合成噬菌体基因组,有望为未来的抗菌治疗
提供新的策略和工具。
人工合成生物钟基因组
总结词
挑战性、应用前景广阔
详细描述
人工合成生物钟基因组是一项极具挑战性的 任务,其成功实现了对生物钟的精确调控。 这一成果不仅有助于深入了解生物钟的机制 ,还为未来的生物技术应用提供了广阔的前 景,如优化农作物产量、提高动物养殖效益 等。
特性
合成生物学具有跨学科性、创新性、 系统性和工程性等特性,它旨在通过 设计和构建人工生物系统来解决实际 问题,改善人类生活和环境。
研究领域与方向
研究领域
合成生物学的研究领域包括基因和细胞工程、代谢工程、生物信息学和系统生物学等。
研究方向
合成生物学与基因回路PPT课件
基因回路的设计与构建
总结词
基因回路的设计与构建需要遵循一定的原则和方法,包括元件选择、元件组装、回路测试等步骤。
详细描述
基因回路的设计与构建是合成生物学中的重要技术之一。设计时需要选择合适的元件,并考虑它们之 间的相互作用和调控机制。构建时需要将这些元件组装在一起,并测试回路的性能和功能。此外,还 需要对构建的基因回路进行优化和改进,以提高其稳定性和调控精度。
应用
合成生物学在许多领域都有广泛的应用,如药物研 发、生物能源、环境保护等。
合成生物学的研究领域
80%
基因回路
基因回路是合成生物学中的重要 组成部分,它涉及基因表达的调 控和信号转导等方面。
100%
人工细胞
人工细胞是合成生物学中的另一 个重要领域,它涉及细胞结构和 功能的重构和优化。
80%
系统生物学
特点
合成生物学具有跨学科性、工程化、模块化、可编程性和可预测 性等特点,它通过将生物系统分解为可预测的组件,实现人工生 物系统的设计和构建。
合成生物学的发展历程
起源
合成生物学起源于20世纪70年代,随着基因工程的 兴起和分子生物学的深入研究,人们开始尝试设计 和构建人工生物系统。
发展
随着计算机科学和工程学的进步,合成生物学逐渐 形成了自己的理论体系和实践方法,并在近年来得 到了快速的发展。
03
合成生物学在基因回路中的应用
基因回路的设计优化
总结词
通过优化基因回路的元件和连接方式,提高基因 表达的准确性和稳定性。
总结词
利用计算机模拟和实验验证相结合的方法,对基 因回路进行设计和优化。
详细描述
在合成生物学中,基因回路的设计是关键环节之 一。通过对基因回路的元件进行优化,如增强启 动子、优化转录因子等,可以提高基因表达的准 确性和稳定性,从而更好地实现基因回路的功能 。
合成生物学讲幻灯片
2
合成生物学是指人们将“基因”连接成网络,让细 胞来完成设计人员设想的各种任务。
TNT-生物传感器 该研究可用来探测地雷位置
3
由DNA重组技术到合成生物学
理念:为细胞编写“基因软件” 自然演化的有机体(即生物学家所谓的“生命1.0版本”)的基
因组图谱正在以前所未有的速度被绘制完成,而其中的遗传密码 也将被逐渐解开。合成生物学家认为,他们可以利用这些已知信 息来设计、打造新生命形式。
现在不仅通过合成生成病毒,而且已经可以合成细菌。
10
合成生物学开辟了设计生命的前景
一方面有可能合成模仿生命物质特点的人工 化学系统;
另一方面也可能重新设计微生物
– 如Keasling 实验室向大肠杆菌中导入青蒿与酵 母的基因,使大肠杆菌能在调节下合成青蒿素, 从而显示了有效而价廉的治疗疟疾的前景
– 合成生物学今后将能生成自然界不存在实验室研究向大肠杆菌蛋白质生物合成装置中添 入新组份,使之能通过基因生成非天然的氨基酸,结果取得 了成功。但是要在真核细胞做到这一点还有难度。
2003年,Schultz 实验室报道了一种向酵母加 入非天然氨 基酸密码子的方法,成功地向蛋白质中导入了5 种氨基酸。
目前,能掺入到蛋白质的非天然氨基酸已有80多种。 今后将可以直接向蛋白质导入顺磁标记、金属结合、光 敏异构化等的氨基酸,促进蛋白质结构与功能的研究。
8
φX174噬菌体合成步骤示意图
9
合成生物学国际会议
2004 年6 月在美国麻省理工学院举行了第一届 合成生物 学国际会议。
会上除讨论了科学与技术问 题外,还讨论了合成生物学 当前与将来的生物学风险,有关伦理学问题,以及知识产权 问题。
随着这个领域的发展,对于合成生物学的安全性的考虑 愈来愈多。
合成生物学是指人们将“基因”连接成网络,让细 胞来完成设计人员设想的各种任务。
TNT-生物传感器 该研究可用来探测地雷位置
3
由DNA重组技术到合成生物学
理念:为细胞编写“基因软件” 自然演化的有机体(即生物学家所谓的“生命1.0版本”)的基
因组图谱正在以前所未有的速度被绘制完成,而其中的遗传密码 也将被逐渐解开。合成生物学家认为,他们可以利用这些已知信 息来设计、打造新生命形式。
现在不仅通过合成生成病毒,而且已经可以合成细菌。
10
合成生物学开辟了设计生命的前景
一方面有可能合成模仿生命物质特点的人工 化学系统;
另一方面也可能重新设计微生物
– 如Keasling 实验室向大肠杆菌中导入青蒿与酵 母的基因,使大肠杆菌能在调节下合成青蒿素, 从而显示了有效而价廉的治疗疟疾的前景
– 合成生物学今后将能生成自然界不存在实验室研究向大肠杆菌蛋白质生物合成装置中添 入新组份,使之能通过基因生成非天然的氨基酸,结果取得 了成功。但是要在真核细胞做到这一点还有难度。
2003年,Schultz 实验室报道了一种向酵母加 入非天然氨 基酸密码子的方法,成功地向蛋白质中导入了5 种氨基酸。
目前,能掺入到蛋白质的非天然氨基酸已有80多种。 今后将可以直接向蛋白质导入顺磁标记、金属结合、光 敏异构化等的氨基酸,促进蛋白质结构与功能的研究。
8
φX174噬菌体合成步骤示意图
9
合成生物学国际会议
2004 年6 月在美国麻省理工学院举行了第一届 合成生物 学国际会议。
会上除讨论了科学与技术问 题外,还讨论了合成生物学 当前与将来的生物学风险,有关伦理学问题,以及知识产权 问题。
随着这个领域的发展,对于合成生物学的安全性的考虑 愈来愈多。
《合成生物学》课件
药物、治疗疾病。
3
生物制造
利用合成生物学技术生产生物材料、 药物和可再生能源等。
环境保护
利用合成生物学技术解决环境问题, 如生物降解、废水处理等。
合成生物学的未来展望
发展趋势
合成生物学将继续发展,拓展 应用领域,推动技术创新。
挑战和遇
合成生物学面临伦理、安全等 挑战,需要加强监管和法律支 持。
可能影响的领域
结论
合成生学是一门重要的交叉学科,它具有广泛的影响和应用前景,但也需要 注意其伦理和法律问题,促进其健康发展。
合成生物学有望对医疗、工业、 农业等领域产生重大影响。
合成生物学的伦理和法律问题
1 生命伦理问题
修改基因是否涉及道德 和伦理问题,需要慎重 对待。
2 安全问题
3 监管和法律问题
合成生物学技术的滥用 可能导致安全风险,需 要建立严格的安全措施。
应建立合成生物学的监 管和法律体系,保障科 研和商业活动的合法性 和安全性。
《合成生物学》PPT课件
合成生物学是研究如何设计和构建新的生物系统的学科,结合了生命科学、 工程学和计算机科学的知识与方法。
什么是合成生物学?
合成生物学是通过改造、设计和构建基因组、细胞和生物体来实现新功能的 交叉学科。它来源于人们对生命的理解和对技术的发展。
合成生物学建新的基因组和 生物系统。
CRISPR-Cas9系统
一种用于基因组编辑的工具,具有高效、简 单和精准的特点。
基因编辑技术
通过CRISPR/Cas9等工具对基因序列进行精 准编辑,实现基因组定点改造。
人工基因调控系统
设计和构建基因调控元件,实现精确控制基 因的表达。
合成生物学的应用
1
合成生物学 ppt课件
21
人工设计基因组原则
删除
逆转录转座子
换位
Elements
替换
将TAG替换为TAA
引入
不变
Gene order
端粒重复部分 内含子
tRNA基因 部分同义密码子替换 LoxP Sym sites
PCRTags
Noncoding regions
• 利用密码子简并性实现
基本理念: 优化基因组,减少不稳定和冗余结构
12
⑤在两个末端序列中间,有 一段填充序列(HIS3),以便 pYAC4在细菌细胞中稳定 扩增;
⑥Amp抗性及细菌质粒复制 原点;
⑦一个EcoRⅠ克隆位点,该 位点位于酵母菌Sup4 tRNA 基因内。
13
选择标记--Sup4
• Sup4基因编码赭色抑制Trp-tRNA,抑制赭色表型(成 为白色)。
筛选第一受体的克隆子,一般采用抗菌素抗性 选择标记;
筛选第二受体的克隆子,常用与受体互补的营 养缺陷型。
10
人工酵母染色体克隆载体的构建
YAC(酵母人工染色体)克隆载体是最早构建成功 的人工染色体克隆载体。
将酵母染色体DNA的端粒(TEL)、DNA复制起点 (ARS)和着丝粒(CEN)以及必要的选择标记(HISA4和 TRPl)基因序列克隆到大肠杆菌质粒pBR322中,构建 成YCA克隆载体。
Science Volume 355(6329):eaaf4704
March 10, 2017
18
Synthetic Yeast 2.0
• Building the world‘s first synthetic eukaryotic genome together!
Dr. Jef Boeke
人工设计基因组原则
删除
逆转录转座子
换位
Elements
替换
将TAG替换为TAA
引入
不变
Gene order
端粒重复部分 内含子
tRNA基因 部分同义密码子替换 LoxP Sym sites
PCRTags
Noncoding regions
• 利用密码子简并性实现
基本理念: 优化基因组,减少不稳定和冗余结构
12
⑤在两个末端序列中间,有 一段填充序列(HIS3),以便 pYAC4在细菌细胞中稳定 扩增;
⑥Amp抗性及细菌质粒复制 原点;
⑦一个EcoRⅠ克隆位点,该 位点位于酵母菌Sup4 tRNA 基因内。
13
选择标记--Sup4
• Sup4基因编码赭色抑制Trp-tRNA,抑制赭色表型(成 为白色)。
筛选第一受体的克隆子,一般采用抗菌素抗性 选择标记;
筛选第二受体的克隆子,常用与受体互补的营 养缺陷型。
10
人工酵母染色体克隆载体的构建
YAC(酵母人工染色体)克隆载体是最早构建成功 的人工染色体克隆载体。
将酵母染色体DNA的端粒(TEL)、DNA复制起点 (ARS)和着丝粒(CEN)以及必要的选择标记(HISA4和 TRPl)基因序列克隆到大肠杆菌质粒pBR322中,构建 成YCA克隆载体。
Science Volume 355(6329):eaaf4704
March 10, 2017
18
Synthetic Yeast 2.0
• Building the world‘s first synthetic eukaryotic genome together!
Dr. Jef Boeke
synthetic合成生物学极佳自制ppt课件
不过现在,将会有一些新成员加入到这个生 物大家族。在过去这些年里,科学家一直在尝试从
零开始制造全新的生命形式——用化学物质造出合
成DNA,由DNA合成基因,再由基因形成基因
组,最终在实验室造出全新生物体的分子系统,而
这种生物体在自然界从未出现过。
“生物晋级2003计划!”
这些向“造物主”的垄断地位发起挑战的人包括 工程师、计算机学家、物理学家和化学家。 他们以有别于传统生物学家的视角看待生命 2003年开创了一个全新的研究领域—合成生物学
化生物模块——生物积块(BioBri除了用标准化的功能模块作为承载功能的硬件外,还 需要标准化的系统量化平台和抽象的概念信号作为承载功
能的软件。为此,iGEM Registry提供了衡量和代表输入输
出信号的标准——PoPS(RNA polymerase per second)和 RIPS(ribosomal initiations per second)。
的遗传线路;同样,遗传线路又可连接成调控网络或生物系统。
理念:为细胞编写“基因软件”
自然演化的有机体(即生物学家所谓的“生命1.0版本”
)的基因组图谱正在以前所未有的速度被绘制完成,而其中 的遗传密码也将被逐渐解开。合成生物学家认为,他们可以 利用这些已知信息来设计、打造新生命形式。 合成生物学所要打造的生命种类是全新的——它不是任何
“工程化”是合成生物学的一个显著特点,
也是合成生物学区别现有生物学其它学科的主 要特征之一。合成生物学家力图通过工程化方 法,将复杂生物系统简化以探索自然生物现象 及其应用,并利用基因等元素设计和构建具有 崭新功能的合成生物系统。
如果说1953年DNA双螺旋分子结构的发现让分子生 物学家意识到,基因与细胞的关系就像计算机的软件和
合成生物学(共10张PPT)
合成生物学的基本研究思路
利用生物零件(parts),如启动子、核糖体结合位点、 核糖核酸(RNA)、酶编码基因等组装成装置 (devices),即代谢途径或调解环路,并将装置进一 步组建成生命系统(systems),包括根据人类的意愿 从头设计合成新的生命过程或生命体,以及对现有生 物体进行重新设计。
利用微生物自身已有的代谢途径的前提下引入外源模块;
②再将来自大肠杆菌、酵母、青蒿多种基因及其代谢途径组装与 精密调控;
2了0第21一年个5月具,有文人特造尔基成因功组地的来将活人自细工胞青合。蒿成的的支细原体胞基色因组素转入到除原基因组的山羊支原体细胞内,获得了具有自我复制和生存能力的新菌株,制造出
引入植物青蒿的amorphadiePne4合5成0酶氧(AD化S)还基因原,克酶隆青蒿类植物转化amorphadiene为青蒿酸的细胞色素P450氧化还原酶等
群模块合成、模块组装)以及人造细胞合成,它们能在从分子到细胞、从组织到机体的多个水平上参与包括遗传与进化在内的复杂生物学。
2000年Kool在美国化学学会年会上重新提出合成生物学概念;
来自青蒿
合成生物学的两个基本方向
1911年7月8日,在著名医学刊物《柳叶刀》发表的一篇书评中合成生物学一词首次出现“合成生物学”;
③最后执行所需功能的途径生产出青蒿酸;
其能够杀伤大肠杆菌以前及时转化为Amorphadiene,
2000年Kool在美国化学学会年会上重新提出合成生物学概念;
Keasling利用合成生物学的手段,
合成生物学是以生命科学理论为指导,以工程学原理进行遗传设计、基因组改造(重组染色体)和(或)合成(包括赋予各种复杂生物功能为单位的基因
例 :青蒿素的生产
来自青蒿
第九章 合成生物学
• ②生产能源物质氢 • Zhang 等人用13 个已知酶组成一个新的非天然的催化体
系,建立催化途径, 将淀粉和水在一般条件下产生氢, 并 通过燃料电池产生电能
• ③利用合成生物学技术生产生物柴油。 • 佛大学医学院教授Church发起成立了LS9 可再生石油公司,
试制生物柴油燃料, 并已取得了一些进展,且获得了美国 MIT《技术评论》2007 年度的TR35最高奖
◆ 不同人工模块转录调控 机制是否一致
固有基因 底盘生物
◆ 人工模块与底盘生物的 转录调控、密码子使用、 蛋白表达等是否一致
“系统优化”原则
科学问题3:功能模块之间及与底盘微生物的适配耦联机理
10
所选重要模式微生物具有重要应用价值
所选模式微生物在环境、能源和医学等领域有着重要的应用 价值,对解决国家重大需求具有深远的战略性意义。
各种模式微生物块
人工模块 人工模块 人工模块
◆ 从模式微生物中 如何选择功能模块
◆ 如何优化人工 模块的功能
◆ 如何优化人工 模块的插入
科学问题2:功能模块的设计、优化与重构原理
9
科学问题提炼: 如何实现功能模块和底盘的互配?
人工模块
◆ 不同人工模块通过表达的 蛋白、代谢物等是否相互影 响干扰
第九章 合成生物学
• 合成生物学中底盘生物的构建与功 能模块的集成表达
背景
人类基因组计划 1990年 模式生物基因组计划
两重意义: ( 1 ) 新的生物零件、组 件和系统的设计与构建 ( 2) 对现有的、天然存在 的生物系统的重新设计
合成生物学
衍生出
转蛋代 录白谢 组质组 学组学
学
产生了
交叉学科
生物信息学 系统生物学
系,建立催化途径, 将淀粉和水在一般条件下产生氢, 并 通过燃料电池产生电能
• ③利用合成生物学技术生产生物柴油。 • 佛大学医学院教授Church发起成立了LS9 可再生石油公司,
试制生物柴油燃料, 并已取得了一些进展,且获得了美国 MIT《技术评论》2007 年度的TR35最高奖
◆ 不同人工模块转录调控 机制是否一致
固有基因 底盘生物
◆ 人工模块与底盘生物的 转录调控、密码子使用、 蛋白表达等是否一致
“系统优化”原则
科学问题3:功能模块之间及与底盘微生物的适配耦联机理
10
所选重要模式微生物具有重要应用价值
所选模式微生物在环境、能源和医学等领域有着重要的应用 价值,对解决国家重大需求具有深远的战略性意义。
各种模式微生物块
人工模块 人工模块 人工模块
◆ 从模式微生物中 如何选择功能模块
◆ 如何优化人工 模块的功能
◆ 如何优化人工 模块的插入
科学问题2:功能模块的设计、优化与重构原理
9
科学问题提炼: 如何实现功能模块和底盘的互配?
人工模块
◆ 不同人工模块通过表达的 蛋白、代谢物等是否相互影 响干扰
第九章 合成生物学
• 合成生物学中底盘生物的构建与功 能模块的集成表达
背景
人类基因组计划 1990年 模式生物基因组计划
两重意义: ( 1 ) 新的生物零件、组 件和系统的设计与构建 ( 2) 对现有的、天然存在 的生物系统的重新设计
合成生物学
衍生出
转蛋代 录白谢 组质组 学组学
学
产生了
交叉学科
生物信息学 系统生物学
《合成生物学》课件
发展
近年来,随着技术的不断进步和应用领域的不断拓展,合成生物学的发展非常迅 速。未来,合成生物学将在医药、能源、环境、农业等领域发挥越来越重要的作 用。
02
合成生物学基础知识
基因与DNA
基因
基因是生物体内携带遗传信息的 最小单位,负责编码蛋白质或 RNA分子。
DNA
DNA是生物体的主要遗传物质, 由四种不同的脱氧核糖核苷酸按 照特定序列组成。
伦理、法律与社会影响
伦理问题 合成生物学可能引发基因歧视和基因操纵问题。
合成生物学可能对生物多样性产生威胁。
伦理、法律与社会影响
• 合成生物学可能引发人类对自身 定义的挑战。
伦理、法律与社会影响
法律问题 需要明确合成生物学研究成果的产权归属和利益分配。
缺乏针对合成生物学的相关法律法规和监管机制。 需要制定针对合成生物学技术的安全评估和审查标准。
生物燃料的生产
总结词
合成生物学技术可以用于设计和构建 高效的生产菌株,以生产生物燃料, 如生物柴油、乙醇等。
详细描述
通过合成生物学技术,可以设计和构 建能够高效转化原料的微生物菌株, 以生产生物燃料。这些生物燃料具有 可再生、环保、高效等优点,可以替 代传统的化石燃料。
环境污染治理
总结词
合成生物学技术可以用于设计和构建能 够降解污染物、净化环境的微生物菌株 。
《合成生物学》课件
• 合成生物学简介 • 合成生物学基础知识 • 合成生物学的应用 • 合成生物学的挑战与前景 • 实验与实践
01
合成生物学简介
定义与特点
定义
合成生物学是一门跨学科的领域,它结合了生物学、工程学和计算机科学的知 识,通过设计和构建人工生物系统来进行研究和应用。
近年来,随着技术的不断进步和应用领域的不断拓展,合成生物学的发展非常迅 速。未来,合成生物学将在医药、能源、环境、农业等领域发挥越来越重要的作 用。
02
合成生物学基础知识
基因与DNA
基因
基因是生物体内携带遗传信息的 最小单位,负责编码蛋白质或 RNA分子。
DNA
DNA是生物体的主要遗传物质, 由四种不同的脱氧核糖核苷酸按 照特定序列组成。
伦理、法律与社会影响
伦理问题 合成生物学可能引发基因歧视和基因操纵问题。
合成生物学可能对生物多样性产生威胁。
伦理、法律与社会影响
• 合成生物学可能引发人类对自身 定义的挑战。
伦理、法律与社会影响
法律问题 需要明确合成生物学研究成果的产权归属和利益分配。
缺乏针对合成生物学的相关法律法规和监管机制。 需要制定针对合成生物学技术的安全评估和审查标准。
生物燃料的生产
总结词
合成生物学技术可以用于设计和构建 高效的生产菌株,以生产生物燃料, 如生物柴油、乙醇等。
详细描述
通过合成生物学技术,可以设计和构 建能够高效转化原料的微生物菌株, 以生产生物燃料。这些生物燃料具有 可再生、环保、高效等优点,可以替 代传统的化石燃料。
环境污染治理
总结词
合成生物学技术可以用于设计和构建能 够降解污染物、净化环境的微生物菌株 。
《合成生物学》课件
• 合成生物学简介 • 合成生物学基础知识 • 合成生物学的应用 • 合成生物学的挑战与前景 • 实验与实践
01
合成生物学简介
定义与特点
定义
合成生物学是一门跨学科的领域,它结合了生物学、工程学和计算机科学的知 识,通过设计和构建人工生物系统来进行研究和应用。
合成生物学优秀课件
2. 代谢途径的快速进化 基因突变
改造代谢途径
生产目标化合物
Church 对20种番茄红素合成有关的基因进行突变; 将突变的90个DNA片段,转入大肠杆菌; 3天内产生了150亿基因突变体; 从中筛选到使番茄红素产量提高5倍的基因。
3. 利用合成生物学生产新能源 Kaslling利用13个可逆的酶促反应组合起来创
1.人工构建合成生命体 2002年 Wimmer小组脊髓灰质炎病毒的合成 Venter 合成噬菌体基因组和生殖道支原体基因组
LO生物学的发展历史及概念 2. 研究方式和工具 3. 合成生物学的研究方向 4. 展 望
15.1 合成生物学的发展史及概念
(1)合成生物学的发展史 1978年 Skallka在对限制性内切核酸酶的评论中 第一次预言了合成生物学的诞生。
1980年 Hobom引入了合成生物学的的名词来描述 基因重组技术。
(2) 合成生物学 合成生物学学是生物科学在二十一世纪刚刚
出现的一个分支学科。
目的在于设计和创造新的生物组件和体系, 对现有的生物体系进行重新设计。从基本的生物 组件构建复杂的人工生命体系,对整个生命过程 进行重新设计、改造、构建。
合成生物包含的内容
基因合成 构建人工生命体
基于现有的 天然生物组件, 设计构建有新功 能的生物体系。
用途:调节基因表达和蛋白质功能。
基因线路
1) 基因拨动开关 e.g. E. coli
诱导物B
阻遏物 B 启动子A
报告基因
启动子B 阻遏物A
诱导物A
❖ 通过加入不同的诱导物实现开关在两个稳定态之 间的转换。
❖ 状态转换具有滞后性,具有记忆功能。
2)基因振荡器
FT1激活它本身和FT2; FT2过量,会抑制FT1
合成生物学研究与进展38页PPT
▪
26、要使整个人生都过得舒适、愉快,这是不可能的,因为人类必须具备一种能应付逆境的态度。——卢梭
▪
27、只有把抱怨环境的心情,化为上进的力量,才是成功的保证。——罗曼·罗兰
▪
28、知之者不如好之者,好之者不如乐之者。——孔子
▪
Байду номын сангаас29、勇猛、大胆和坚定的决心能够抵得上武器的精良。——达·芬奇
▪
30、意志是一个强壮的盲人,倚靠在明眼的跛子肩上。——叔本华
谢谢!
38
合成生物学研究与进展
11、获得的成功越大,就越令人高兴 。野心 是使人 勤奋的 原因, 节制使 人枯萎 。 12、不问收获,只问耕耘。如同种树 ,先有 根茎, 再有枝 叶,尔 后花实 ,好好 劳动, 不要想 太多, 那样只 会使人 胆孝懒 惰,因 为不实 践,甚 至不接 触社会 ,难道 你是野 人。(名 言网) 13、不怕,不悔(虽然只有四个字,但 常看常 新。 14、我在心里默默地为每一个人祝福 。我爱 自己, 我用清 洁与节 制来珍 惜我的 身体, 我用智 慧和知 识充实 我的头 脑。 15、这世上的一切都借希望而完成。 农夫不 会播下 一粒玉 米,如 果他不 曾希望 它长成 种籽; 单身汉 不会娶 妻,如 果他不 曾希望 有小孩 ;商人 或手艺 人不会 工作, 如果他 不曾希 望因此 而有收 益。-- 马钉路 德。
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ppt课件
14
控制生命
目前,研究人员正在试图控制细胞的行为,研 制不同的基因线路———即特别设计的、相互 影响的基因。
波士顿大学生物医学工程师科林斯已研制出一 种“套环开关”,所选择的细胞功能可随意开 关。
加州大学生物学和物理学教授埃罗维茨等人研 究出另外一种线路:
– 当某种特殊蛋白质含量发生变化时,细胞能在发光
②1960,我国科学家首次合成 了具有生物活性的蛋白质-胰岛 素。
③当人类进入基因组和后基因 组的二十一世纪的今天,科学 家正在为人工合成生命而努力。 有活性的X174噬菌体(5386个 bp)和脊髓灰质炎(7500个bp)已 被科学家先后合成。
④ Mycoplasma laboratorium
⑤人工生命(以人工设计为主导)
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Wimmer从装配平均长度为69 bp的寡核苷 酸入手,结合了化学合成与无细胞体系 的从头合成,用了3 年时间完成了这个划 时代的工作。
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Venter 实验室发展了合成基因组
Φ X-174 噬菌体基因是单链环状 DNA,是历史上第一个被纯 化的DNA 分子,也是第一个被测序的DNA分子。
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转基因生物
物种生物学 一亿种:140万种
(占1.4% ) 物种资源 基因资源
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人工合成脊髓灰白质炎病毒cDNA
美国纽约大学Wimmer 实验室于2002年报 道了化学合成 脊髓灰白质炎病毒cDNA, 并用RNA聚合酶将它转 成有感染活力的 病毒RNA。
– 开辟了利用已知基因组序列,不需要天然模 板,从化合物单体合成感染性病毒的先河。
合成生物学
Synthetic biology
(概念、原理、应用)
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生命1.0版本
36亿年前,一个微小的生命细胞在地球的荒野
中诞生,它自我复制,它的后代们继续复制自我,就
这样,随着遗传基因一代代变异,延续数十亿代。今
天,每个生物体——每个人、植物、动物和微生物—
—都能从第一个细胞找到自己的起源。迄今为止,地
现在不仅通过合成生成病毒,而且已经可以合成细菌。
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合成生物学开辟了设计生命的前 景
一方面有可能合成模仿生命物质特点的 人工化学系统;另一方面也可能重新设 计微生物
– 如Keasling 实验室向大肠杆菌中导入青蒿与 酵母的基因,使大肠杆菌能在调节下合成青 蒿素,从而显示了有效而价廉的治疗疟疾的 前景
Φ X- 174 噬菌体对动植物无害,是合适的合成研究对象。
美国Venter 实验室发展了合成基因组的工作, 该实验室只用 两周就合成了Φ X-174 噬菌体基因 (5,386bp) 。
Venter实验室的技术改进主要有:
– (1)用凝胶来提纯寡核苷酸以减少污染;
– (2) 严格控制退火连接温度来防止与不正确的序列发生连 接;
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这些向“造物主”的垄断地位发起挑 战的人包括工程师、计算机学家、物理学 家和化学家。他们以有别于传统生物学家 的视角看待生命,并在2003年开创了一个 全新的研究领域——合成生物学。
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由DNA重组技术到合成生物学
理念:为细胞编写“基因软件” 自然演化的有机体(即生物学家所谓的“生命1.0版本”)
– 合成生物学今后将能生成自然界不存在的新 的微生物。
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应用示例
Schultz 实验室研究向大肠杆菌蛋白质生物合成装置中 添入新组份,使之能通过基因生成非天然的氨基酸, 结果取得了成功。但是要在真核细胞做到这一点还有 难度。
2003年,Schultz 实验室报道了一种向酵母加 入非天然 氨基酸密码子的方法,成功地向蛋白质中导入了5 种氨 基酸。
的基因组图谱正在以前所未有的速度被绘制完成,而其中的 遗传密码也将被逐渐解开。合成生物学家认为,他们可以利 用这些已知信息来设计、打造新生命形式。
在过去,遗传工程一直拘囿于对已有的遗传密码进行简单 修补改造,比如从一种细菌中提取一个基因,然后植入玉米 或猪的染色体。而合成生物学所要打造的生命种类是全新 的——它不是任何一个原始母细胞的后裔,也没有哪个物种 是它的祖先。其实pp在t课件本质上,这是一个逆自然的过程。 5
目前,能掺入到蛋白质的非天然氨基酸已有80多种。 今后将可以直接向蛋白质导入顺磁标记、金属结合、
光敏异构化等的p氨pt课基件 酸,促进蛋白质结构与功能的研 13
应用示例
Brenner 提出向细胞DNA中掺入天然不存 在的碱基来发展人工遗传系统, 支持人 工生命形式。
合成生物学也将对生命起源,其他生命 形式的研究作出贡献。
– (3)采用聚合酶循环装置来装配连结产物。
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合成生物学国际会议
2004 年6 月在美国麻省理工学院举行了第一届 合成生 物学国际会议。
会上除讨论了科学与技术问 题外,还讨论了合成生物 学当前与将来的生物学风险,有关伦理学问题,以及 知识产权问题。
随着这个领域的发展,对于合成生物学的安全性的考 虑愈来愈多。
状态和非发光状态之间转换,起到有机振荡器的作
用,打开了利pp用t课件生物分子进行计算的大门。
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维斯和加州理工学院化学工程师阿诺尔 一起,采用“定向进化”的方法,精细 调整研制线路,将基因网络插入细胞内 ,有选择性地促进细胞生长。
合成生物学
如果说1953年DNA双螺旋分子结构的 发现让分子生物学家意识到,基因与细 胞的关系就像计算机的软件和硬件,那 么合成生物学正在做的就是设计新“软 件”、开发新“硬件”。
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合成生物学
生物资源研究的三个层次
DNA重组技术
①1828年,德国化学家Wohler 人工合成了存在于生物体内的 一种有机物质-尿素,从而打破 了“生命”与“非生命”之间 的物质壁垒。
球的生物大家族是我们在宇宙发现的唯一存在的源自种生命。ppt课件
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生物大家族中的新成员
不过现在,将会有一些新成员加入到这个生物 大家族。在过去这些年里,科学家一直在尝试从零 开始制造全新的生命形式——用化学物质造出合成 DNA(脱氧核糖核酸),由DNA合成基因,再 由基因形成基因组,最终在实验室造出全新生物体 的分子系统,而这种生物体在自然界从未出现过。