乙型肝炎病毒基因分型与疾病病情的关系
乙型肝炎病毒基因分型及其临床意义
乙型肝炎病毒基因分型及其临床意义作者:蒲春文高庆伟宋利国王洪来源:《中外健康文摘·新医学学刊》2007年第07期【摘要】目的了解乙型肝炎病毒(HBV)基因型流行情况及其临床意义。
方法用套式PCR扩增检测的各型乙型肝炎患者和慢性无症状HBV携带者(ASC)共390份血清HBVDNA,进行基因分型。
结果大连HBV各种基因型分布比例:基因型C占80.3%,基因型B占7.2%,未分型基因型12.3%,BC混合型占0.3%。
HBV基因B较常见于轻型肝病(如慢性肝炎轻度组),尚无发展至肝硬化者。
而基因型C则常见于较重的肝病(如慢性肝炎中重度组),发展至肝硬化者占相当比例。
结论①主要流行的HBV主要为基因型C。
②基因型C与较严重的肝脏疾病的发生有关。
③发现大连的慢性肝炎存在少量的HBV基因型B+C的混合型。
【关键词】肝炎乙型肝炎病毒基因型Distribution of hepatitis B virus genotypes and its clinical significance【Abstract】 Objective To understand the distribution of hepatitis B virus genotype and its clinical significance.Methods Nested polymerase chain reaction was used for amplification of HBV DNA in sera of patients with different liver diseases and asymptom carrier.Specimens from 390 subjects were positive for HBVDNA and HBV genotype was determined.Results The prevalence of genotype C was 80.3%, genotype B was 7.2%, unspecified genotype was 12.3%, BC mixed genotype was 0.3%.The prevalence of genotype B showed an increasing trend in patients with tender damaged chronic hepatitis group, no liver cirrhosis patient was found;in contrast,the prevalence of genotype C showed an opposite trend,genotype C showed an increasing trend in patients with severe damaged chronic hepatitis group.There were definitely proportion of patients with liver cirrhosis.Conclusion ①The predominant HBV genotypes were genotypes C.②The genotype C associated with severe liver diseases.③ We discover a few mixed genotype B,C in Dalian.【Key words】 Hepatitis HBV Genotype.【中图分类号】R512.6+2【文献标识码】A【文章编号】1672-5085(2007)04-0379-02全世界60亿人口,当中20亿曾经感染HBV,占全球人口的三分之一,我国的肝炎患者正在呈现上升趋势,每年有近40万人死于肝脏疾病。
肝癌患者血清中乙型肝炎病毒基因分型及临床意义
・
2 69 ・
肝 癌 患者 血 清 中乙型 肝 炎病 毒 基 因分 型及 临床 意 义
徐 天敏 王永 忠 濮翔科 卫 峥
常州 第二 人 民 院肝病 研究所 ( _ 江苏 常州 ,2 3 0 ) I0 1
摘
要 目的:探讨 血清 中乙型肝 炎病毒 ( B H V)基 因型及 HB N V D A水平与肝细胞 癌的 关 系 方 法 :应 用巢式
Chi na
A src Obet e oepoeterltnhpb tenHB eoye n et B ) A lvl i hp l e u r b tat jci :T x l eaos i ew e V gnlpsad Sln¨ V I ee n ea cl l v r h i i N s o la
X inmi,W N ogzog UT — t a t A G Yn — n ,P in —e t 1T e “P+l’ opt C .gh u ( h n zo ins ,23 0 ) h UXagk ,e a. h e t H sid 3 qe  ̄ h nzo C aghuJ gu l0 1 a
肝 炎病毒携 带者进行 了检 测。结果 :16例 中 B基 因型 5 3 9倒 ( 34 ) 4 . % 、C基 因型 7 7例 ( 6 6 ,随 着病情加 重 , 5 . %)
c基 因型比例逐渐增 高;不同基 因型 HB V感染的肝癌 患者间 HB ) A水平差异有 显著意 义,P< . 5 VI N 0 0 ;在慢性 乙型 肝 炎患者 中,H V D A水平差异无显著性 意 义 结 论 :本地 区乙型肝 炎病毒 以 B、c基 因型 为主 ,乙型肝 炎病毒 c B N 基 因型及 高水平 的 HB N V D A感 染与肝癌 的发 生相关
乙肝病毒基因分型
(1)HBV 基因型与病毒复制及变异的关系
HBV 基因型与病毒复制水平及病毒标志物的表达有一定的相关性。Watanabe等研究报道,基因C型的HBeAg阳性率高于B型和A型,而B型HBeAg阴性率高于C型,同时B型血清HBeAg清除率较C型显著常见且较早发现;基因C型血清HBV DNA水平显著高于B型;A型的HBV DNA 自然清除率高于D型和F型,同时A型的HBsAg 自然清除率也比D型高;以上均提示C型HBV复制较活跃,易形成持续病毒血症,不易发生e系统血清转换发生快,免疫清除HBV较C型早。
近年来,随着分子生物学技术的迅猛发民和对HBV认识的不断深入,国内外许多学者对HBV基因分型及其临床的相关性开展了大量的研究. HBV基因分型比血清亚型更能反映原型病毒株之间的自然异质性. HBV基因分型方法有多种,以全基因测序为HBV基因分型的金标准,基于全基因核甘酸序列比较, HBV可分为A、B、C、D、E、F、G、H8个基因型。HBV基因型呈地理区域性分布,且不则基因型致病性不同,HBV基因型与乙型肝炎病情的进展,临床表现、治疗、预后有密切的关系。
总之,HBV基因型与病毒复制与清除,病毒变异,临床表现,治疗应答和预后均有一定的关系,提示不同基因型具有不同的致病性。基因分型的研究为乙肝病毒变异的研究,发病机制的探讨,病情评估,治疗药物的选择和预后判定以及分子流行病学研究提供了有力工具
大量研究表明,我国HBV基因型南方以B型为主,北方以C型为主,D型仅见于西部及少数民簇地区,A,F型偶有发现,还未发现其它性别。也有学者研究表明D基因型在我国宁夏地区,广东地区和香港地区约占感染者15%,因而HBV基因型在我国的确切分布状况仍不十分清楚。
HBV基因型的临床意义
近年来HBV基因分布的研究成为国内外学者关注的研究热点。研究发现,HBV基因的分布具有一定的地域性,A型主要分布在西欧、北欧、北美洲及非洲地区, B型和C型是亚洲和大洋洲的特征性基因型,B型主要见于中国、日本、印度尼西亚、越南和巴西,D型分布最为广泛,主要分布在中东、北非和南欧,也是地中海地区HBV的主要基因型,还发现于亚洲少数地区;E型主要分布于非洲撒哈拉沙漠地带;F型主要分布于美国、南美洲和土著居民;G型在法国、美国、德国、英国和意大利被发现;H型已在尼加拉瓜、墨西哥及美国加利氟尼亚地区被发现。
HBV S基因变异与临床疾病的关系
XU
Z h e n g - j u . P A N X g — n a n . W E I Ka i - p e n g , Y A NG Hu a n — we n . L I S h u — q i n g , HU N A G Z h i - j i e . C l i n i c a l L i v e r
4 3 f 4  ̄ 慢性H B V感染者 中共检出基因B 型2 9 例 ( 2 9 / 4 3 ,6 7 . 4 4 %),C 型1 4 例 ( 1 4 / 4 3 ,3 2 . 5 6 %);血清学
分型a d w型 2 8 例 ( 2 8 / 4 3 ,6 5 . 1 2 % ) ,a d r 型1 4 例 ( 1 4 / 4 3 ,3 2 . 5 6 % ),a y w型 1 例 ( 1 / 4 3 ,0 . 0 2 % ) 。4 3 例
7 0
・
临床论著
H B V S 基 因变异 与临床疾病 的关系
许 正锯 潘兴南 魏 开鹏 杨 环文 李树 清 黄志杰
【 摘要 】 目的 探 讨泉州地 区乙型肝炎病毒 ( HB V)慢性感染者H B V s 基因变异与临床疾病 的关 系 。方法 采用P C R 产物直接测序技术对4 3 例慢性H B V感染者的H B V s 区进行序 列测 定及分析 。 结果
乙肝病毒基因分型与慢性乙型肝炎患者临床和病理的相关性研究
例 ,占6 .7 ;在年龄 、性 别、肝功 能及病情程度之 间 ,B、c基 因型差异均无显著性 意义 ( 0 0 ) 4 1% P> .5 ;c基 因型患 者的 H V D A水平、HB A B N e g阳性 率均 显著高于 B基因型 ( 0 0 ) P< .5 ,其肝组织炎症评分和纤 维化评分也均 明显高于 B基 因型 ( 0 0 ) P< .5 。结论 :本地 区 C B患者 H V基 因型以 c型为主 ,c型血清 H V D A水平及 H e g阳性率 高 H B B N BA 于 B型 ,c型 引起 的肝 组织病 变较 B型严重。H V基 因分 型对判 断肝脏病 变的严 重程度 和指导 临床抗 病毒 治疗具有 B
g n tp so V wee d t ce i l o e c n e q a t ai eP . l a o n —u d d l e i p ywa o e wi a tp n t r e o y e fHB r e e td w t f rs e c u n i t CR B u t s u d g i e i rb o s sd n t f s— u cu e h u t v r v h
me h d t o .Re uls: S v n y s v n c s swih HBV e oy a d 4 a e t BV e o y e B r ee td i he 1 0 pain s s t e e t e e a e t g n tpeC n 3 c s swih H g n t p we e d tc e n t te t 2 wi hr nc he aii , r s e tv l.No sg fc n ifr n e wa o d i g t c o i p ttsB h e p c iey ini a tdfe e c sfun n a e, s x, lv rf ci n bewe n H BV e oy i e i e un to t e g n tpe C
乙型肝炎病毒基因分型技术的研究综述
乙型肝炎病毒基因分型技术的研究综述乙型肝炎病毒(HBV)感染是全球公共卫生问题之一,而基因分型技术为HBV感染相关研究提供重要工具。
HBV基因分型主要通过分析病毒基因组上的遗传变异来确定病毒分型,目前已经出现了多种分型方法。
病毒基因组是一个非常复杂的结构,主要由四个基因区组成,包括表面抗原(S)、核心抗原(C)、多功能蛋白(P)及调控区(X)。
HBV的基因组具有相对稳定的序列,并且存在着一定的变异性,包括点突变及插入/缺失。
这些变异主要分布在基因区及非编码区中,并且与HBV的发病、传染性、感染模式等方面密切相关。
传统的HBV分型方法主要使用基于血清型、分子型或分化型的分型方法。
其中,基于血清学分型方法主要通过分析S基因上的a determinant区域的变异来确定;分子学分型方法则通过分析不同基因区的变异来确定病毒所属分型;而分化型则是根据HBV遗传变异对C基因产生的影响来进行分类。
这些方法已经被广泛运用,并取得了一定的研究效果,但是随着分子生物学技术的快速发展,一些新的方法也相继出现。
现代的HBV基因分型技术主要集中在DNA序列分析、PCR及其变种、实时荧光定量PCR、DNase消化法、限制酶片段长度多态性分析、基因芯片及Next Generation Sequencing等领域。
这些方法各有优势,但基本上都需要对病毒基因组中的变异情况进行深度解读,以确定病毒所属分型。
DNA序列分析是一种经典的HBV基因分型方法,通常将某一区域的HBV基因进行PCR扩增后测序,通过对序列变异的分析以确定病毒所属分型。
其中,S区域是被最广泛应用的区域之一,其序列变异主要分布于a-determinant区域。
这种方法具有分辨率高、可靠性强等优点,但是需要耗费大量时间和精力,并且数据量大。
PCR及其变种技术(如逆转录PCR、嵌套PCR等)是一种快速、可靠的HBV基因分型方法。
通过引入适当的引物和反向基因,可以从不同基因区扩增出HBV基因片段,然后进行序列变异分析。
乙型肝炎病毒基因型与YMDD变异关系的研究进展(文献综述)
YD M D变异 尤为突 出 , 得 H V感 染后 的临床表 现与临 并使 B
床过程呈现多样 化 、 复杂化 。由于 H V不 同分离 株 间核苷 B 酸序列有差异 。{ E前根据 t V核苷 酸全序列 异质 性分 为 8 t B 个基 因型 , 问的基因型与病毒复制、 不 变异 、 疾病 的预后及治 疗药物的选操均有一定 的关系。
上升趋势 J 。
突变。18 年 日 学者 O a o - 首先提 出了 乙型肝炎 病 98 本 km t 1 o
毒基因分型法 , 1 株不 同亚型的 H V基因序列两两 比较 对 8 B 后, 根据核苷 酸序列异 源性 ≥8 %将 l 8株不 同亚型 的 t V t B 基因序列分为 A C 个基 因型 , B D4 随后 N re 证实 了这 一 odr 结果 , 同时还发现 了两个新 的基 因型 E和 F 目前 , 。 人类 已 发现的 H V基因型共 8种 , 分型标准是全 基 因序 列 同源 B 其 性 I9 % , S基 因序 列 同源性 99 %, >2 或 6 以此 为标准 将 乙肝 病 毒分为 A~i 8个基 因型 , { 不同基因型对各种抗病 毒药物
同样 , 欧美 国家对 H V基 因型及其 与 Y D相关性 的 B MD 研究结果显 示存 在地 区差异 。Mokvt aoi z等 于 19 9 8年 ~
异 与基 因型无关 。
主 , 以 B型为 主, 南方 D型仅见于少数民族地 区, 西藏和新 如
疆 , 型偶 有 发 班 , E型 和 F型 。 A 无
2 IB MD 变 异及 产生 机制 - VY D I
H V基 因组 由 s C P X4个开放 阅读框组 成 , B B 、、 、 H V变
探讨慢性乙型肝炎临床表现形式与乙肝病毒基因型的关系
本 文采用B 超 和C T 技术对患者 进行肝功 能和 乙肝病 毒定量进行 检 测 ,分析实 验数据后可知 ] :H B V 基 因型在本 地区 的分布 主要为B 型 C 型 ,其 中B 型略低于C 型 ;B 基 因型乙肝患者血清 中H B V = D N A  ̄ I ' I 与
H B e A g 阳性率要 比C 基 因型 乙肝患者 低 ,这 也在 一定程度 上说 明 ,B
国喱蚕弱瞄珂
2 0 1 3 年4月第 1 1 卷 第1 0 期
・临床研究 ・ 5 o 5
探讨慢性 乙型肝炎 临床表现形式与 乙肝病毒基 因型 的关 系
钟 勇玲
( 广东 省五 华县 人民医院 ,广 东 五华 5 1 4 4 0 0 )
【 摘要 】 目的 对慢 性 乙型 肝 炎, 临床 表现 类型和 乙肝病 毒基 因型 的 关 系进 行探 讨 。方法 采用 B超 和 C T技 术对 1 6例重度 慢 性 乙肝 患者 ,1 9 例 中度 慢 性 乙肝 患者和 1 0例轻度 慢性 乙肝 患者的血 清进 行 肝功 能及 乙肝 病毒 定量 的检 测 ,并取 葛 兰素 史克公 司生 产 的拉 米夫 定 ( 贺 普丁 )
3讨
论 本 文 经 过 血 清HBV 基 因分 型 检 测 ” ] ,在 4 5 例 慢 性 乙肝 病 患
为1 0 例 ,患 者平均 年龄为 3 6 岁 。标本选 择为H B s A g 阳性 ,血清H B V - D N A>1 X 1 0 I U / m l ,同时对 其他类型肝炎 ( 甲、丙 、丁、戊 、庚 )所 致的肝损伤病症予 以排 除。
m 1 )在检 测为C 基 因型 的2 7 例 患者 中,H B e A g 检 测呈 阳性 的患者 为 l 1 例 ,占总 人数 的4 0 . 7 4 %,H B V o D N A的平均值 为9 . 3 7 X i 0 I U / m l ,具体 统计数据见 下表2 。在血清H B e A g 阳性 率和H B V - D N A 平均水 平方 面 ,
乙型肝炎病毒的异质性及临床意义
THANKS
感谢观看
体,为临床诊断提供重要依据。
03
基因测序
基因测序技术能够检测病毒基因序列的变异,有助于深入了解病毒的变
异和演化。
诊断准确性评估
诊断准确性标准
诊断准确性评估需要建立统一的 标准,如灵敏度、特异度、阳性 预测值和阴性预测值等,以客观 评价诊断方法的准确性。
交叉验证
通过将同一种诊断方法在不同时 间或不同实验室进行重复验证, 以评估其稳定性和可靠性。
监测与评估
建立有效的监测和评估 体系,及时了解疫苗接 种情况和免疫效果,为 优化疫苗接种策略提供 科学依据。
05
乙型肝炎病毒异质性与临床诊断
诊断技术发展
01
核酸检测
随着核酸检测技术的发展,通过检测病毒核酸来诊断乙型肝炎的方法越
来越准确和灵敏。
02
免疫学检测
免疫学检测方法如酶联免疫法、化学发光法等,能够检测病毒抗原和抗
03
乙型肝炎病毒异质性与治疗策略
个体化治疗
根据患者病情和基因型制定个性化治疗方案
针对不同基因型和病情的乙型肝炎患者,制定个性化的治疗方案,以提高治疗效果和减少 副作用。
考虑患者年龄、性别和遗传因素
患者的年龄、性别和遗传因素可能影响治疗反应和预后,个体化治疗需综合考虑这些因素 。
监测病毒变异和耐药性
乙型肝炎病毒的异质性及 临床意义
• 乙型肝炎病毒的异质性 • 乙型肝炎病毒异质性与疾病进展 • 乙型肝炎病毒异质性与治疗策略 • 乙型肝炎病毒异质性与疫苗研制 • 乙型肝炎病毒异质性与临床诊断
01
乙型肝炎病毒的异质性
病毒基因型
基因型分类
根据病毒基因序列的差异,乙型肝炎病毒可 分为A、B、C、D、E、F、G和H等基因型 。
乙肝病毒基因分型对慢性乙肝患者凝血功能的影响
参 考文 献
[ ] 梁新宇 , 1 徐杰 , 段正 军 , 血清 H V R A荧光 定量检测 的临 等. C N 床意义 [] 放射免疫学杂志 , 1 ,3 1 :4 J. 2 02 ()8. 0
[ ] Iz 2 j 8 B,A m dW,JvdV ,e a. sc tn o brtr a h a ae F t 1Asoii fl o oyp — ao aa rle l i i l atr i a etwt eaisC[] Vml , 0 1 a t ̄wt vr co pt ns i hp ti J . i 2 1 , ne h af sn i h t J 831 :6 . (0 20 — 2 1-31 2收稿 )
在丙型肝炎的诊断 中, 型肝炎病毒抗体检测并不能用来 丙 进行确诊 , 只有通过 H VR A的定量分析 , C N 才能对丙型肝 炎病
毒感染进行直接诊断, C N H V R A的检 出是丙型肝炎病毒感染 的
最直接证据… , 是反映病毒复制和传染 陛的重要指标, 这对区分 急慢性与 已恢复的感染和规范抗病毒治疗都有重要 的意义 。本
1 资料和 方法
1 1 一般资料 . 15例( 9 , 6 ) B 5 男 4 女 1 H V感染患者血清采 自
本院 21 一 0 1 00年 2 1 年门诊和住院患者 , 所有病例均未用溶栓及 2 结果 抗凝药物 , 诊断标准符合 21 年第十次全国传染病 与寄生虫学 2 1 I V基因型检测结果 对 1 例 乙肝病毒感染患者进行 01 . t B 5
H V R A高水平组患者平均年龄也比阴性组大, C N 虽然并未显示 出显著的差异 , 但提示我们 , 丙型肝炎病毒 的消除能力可能存在
慢性乙型肝炎患者血清HBV基因分型
S r BV e o y i f Chr n c H e tts B te t e aH G n t p ng o o i pa ii Pa i n s
F ENG a g we ,M ENG a — i ’ Xin . i F n png
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WA G Y n WA G F n C E i.a N ag, N e g , H N Quyn
a d1 1 5 )w r n n w e oy e n 0( 4. % eeu k o ng n tp .HB D n ep st ert f e f e oy eC p t nsaehg - V— NA a dt oiv aeo Ago n tp ai t r ih h i HB g e
冯相 伟 ,孟 繁 平 h ,汪 杨 ,王 峰 ,陈秋 艳
( .延 边 大 学 基 础 医学 院免 疫 学 与 病 原 生 物 学 教 研 部 , 林 延 吉 吉
2 .吉 林 大 学 第 一 医 院感 染 科 , 林 长 春 吉 I0 2 ) 30 1
1 30 300;
摘
要 为了解 长春 市慢性 乙型肝 炎患者血 清中的 乙型肝 炎病毒 ( V) 因型情 况及 其与临床 特点 的相 关 HB 基
维普资讯
微 生物 学 杂 志 20 年5 第2 卷3 JU N L F IR B L G a 20 V1 7 o 0 7 月 7 期 O R A C O I O YMy 07 o2 N. OM O . 3
2 7
慢 性 乙型 肝 炎 患 者 血 清 HB V基 因分 型
e ta h s e o p a e t H V D A: r h ntoei g n t eB p t ns( B ・ N P< . 1 B A : = . 8 P< . 5 T n B L o g n ・ n y i 0 O ;H e g x 3 9 , 0 0 )A L a d T I f e o
不同临床类型慢性乙肝患者乙肝病毒基因型检测
( . p r n fP d arc meThr f l td Hop tlo u a—e iest, a g o g 1De at to e itis, idAf i e s i fS n Y tsn Un v ri Gu n d n 、Gu n z o me i a a y agh u
分子诊断与治疗杂志
21  ̄ 1 0 0 月第 2 卷第 1 期
JMo an T e aur 0 0V 12 N . lDi hr n a 2 1. o. o 1 g ,J y基因型检测
牟一坤 顾琳 。 曾淑珍 【 摘
法
要】
目的
探讨本院慢性乙型肝炎患者 乙肝病毒基 因型分布特征及 与临床类 型的关 系。 方
gn tp fH V wa e ome ytel epo easy( iA) R s l A ttlo 2 p tnswee e o eo B sp r r db h i rb sa LP . e ut y f n s oa f5 a et i r
icu e 3 lsa d 1 e ls n erme ina ewa 6y as(a g 2 7 e r ) Ofte5 ain s n ld d( 9mae 3fmae )a dt i da g s3 e r rn e 1 - 6y as . n h h 2p te t,
Gu n d n , a g h u5 0 8 , ia a g o g Gu n z o 1 0 0 Chn )
【B T A T A S R C 】
Obe t e T td eds iuino ea t i s( B jci os yt ir t f p tiB v u H V)gn tp s npt ns v u h tb o h is r e o e a et y i i
乙肝病毒基因分型及其临床意义
其它型 多见 , n e等 【 对 4 Mag 一 3位 美 国 患 者 检 测 后
发现 nl86 A也只 在 C型 、 t 9 G D型 中出现 , 原因 其 可能是 前 C 区形 成 了 一 个 对 组 装 病 毒 前 基 因 组 R A 很重要 的发 夹结构 。A型前 C区第 1 N 5位密 码
C A nl8 8位 子 为 c 2, 非 A 型 为 CU 型第 t 5 为 o 而 ,
_
C, 在前 基 因组 R A 中与 nl8 6位 G 形成稳 定 的 N t 9
碱基 对 , 非 A型 nl96 — 将 原不 稳 定的前 c 而 t 8 区第 l 密 码 子 a: 的第 3位 的 u 与前 c区第 5位 u 2 密码子 UG 的第 2位 的 G配对 的 u —G碱基 8位 G
【 中图分类号 l526 2 R 1. 【 文献标识码 【 文章编 ̄ ] 0 55 ( 】 )1 00 0 -1 1 2620 0 09 2 0 (2
乙型肝 炎 病 毒 ( B 是 嗜 肝 DN 病 毒 , B H V) A H V 基 因组 又称 HB D V NA, 32 0碱基 对组 成 近 年 由 0 来 . 内外学 者 对 HB 基 因分 型 开 展 了 多 方 面 的 国 V 研究, 本文对 近年来 的研究 进展 作一 概述 。 1 H v基 因型 的建立 B }BA 玎s g共有 1 O个 亚 型 , 主为 a ra w、y 、y d 、d ar aw 等 4个 亚型 , 血 清学 并 不 能真 正反 映 基 因型 的改 但 变 O a t 在 1 9 k moo等 9 8年 由无 症 状携 带者 ( S A C) 的血 清 中克 隆 3株 ar亚 型 的 H V D d B NA 序 列 , 与 l 5株 H V D A 序列进 行两 两 比较 , B N 根据 核苷 酸 序 列 异质性≥8 将 此 1 %, 8株 H V D A 序列 分为 A、 B N B C D 4种基 因型 , 步 建立 了 H V D 、、 初 B NA基 因型
人体基因组变异与疾病风险的关系分析
人体基因组变异与疾病风险的关系分析人类基因组是指人体内所有基因所组成的基因库,是人体的遗传密码。
基因组变异是指人体基因组序列中的变化。
它可以起到增强、缺陷或不确定的作用,也可以导致个体发生疾病。
因此,对于人体基因组的变异,特别是与疾病风险相关的变异,进行深入的探讨和分析,对于人类健康生活和疾病预防将具有重要的意义。
一、基因组变异的分类人类基因组的变异可以分为两种类型,一种是常见变异,另一种则是罕见变异。
常见变异是指频率大于1%的基因变异,而罕见变异则是指频率小于等于1%的基因变异。
常见变异是指具有较高频率的突变,比如常见的基因突变有血红蛋白病、修复能力错误相关的癌症等。
此类疾病主要是由基因影响机制的变异所致。
单基因遗传病在人群中的发病率较低,预后差,病情也难控制。
罕见变异是指基因突变的频率较小,常见于个别人群或家族,如囊性纤维化、遗传性失明等。
此外,基因突变还可分为:控制基因变异,功能突变和结构突变。
其中控制基因突变可以影响基因的转录水平,并对疾病的发生发展产生影响。
功能突变是指基因本身的结构或活动发生变化,例如突变后使导致失调的酶不能正常发挥作用,让代谢产品积聚体内,导致特定的遗传病。
而结构变异则是指基因的整体发生变化,如染色体结构异常等,会导致严重的疾病和生殖问题。
二、基因组变异与疾病风险的关系在探讨基因组变异与疾病风险的关系时,我们首先需要了解疾病的发病机制。
大多数的疾病是由多种因素共同作用导致的,包括基因和环境两个方面。
而其中基因方面的因素,就是基因的变异状态。
因此,我们在疾病的预防和治疗中,不仅需要考虑环境因素,更要考虑基因的变异情况。
基因组变异会影响基因的功能和活动,从而影响疾病的发生和发展。
例如,胰岛素基因的变异会造成糖尿病的发生,而细胞分裂相关的基因变异则会导致DNA的错误复制和修复,从而导致癌症的发生。
此外,基因组变异还可能影响药物的代谢和吸收,从而影响药物治疗的效果。
例如,乙型肝炎病毒感染的治疗通常采用拉米夫定和替米非定的联合治疗。
乙型肝炎病毒基因亚型与肝细胞癌临床病理的关系
乙型肝 炎病 毒基 因亚型与肝细 胞癌临床病理的关 系
陈 翔 一 , ,陈 涛 , 建平 ,罗兴 喜 ,訾 刘 力 ,张大 伟
(. 山大 学 附属 第 二 医 院 肝 胆 外 科 , 东 广 州 5 0 2 ;. 远 市 人 民 医 院 肝 胆 外 科 , 东 清 远 5 10 ) 1中 广 1 10 2 清 广 150
2D pr et f ea bl r ugr. epeSH sil f i y a ,Qny a 150 hn ) .ea m n o pt iayS re P ol opt n u n i un5 10 ,C i t H o i y aoQ g g a
A s at bet e oivsgt teasc tn btenh pti B v u H V)sb eoyead c n o a o g a bt c :I jc v 】T n et a h s i i ew e eais i s( B r O i i e o ao t r u gnt n l i p t l il p ic h o c caat iiso h pt e ua ac o hrc r t f ea cl l cri ma( C ) 【 tos h V sb eo p f 9p s oea v C pt nswt B e sc o l r n H C . Me d】T eHB u gnt eo ot prt eHC a et i H V h y 8 — i i h
if ci n we e d tr n d b l p e C s a n e t r ee mi e y mu t lx P R a s y, t e h l ia n ah l gc lf au e f df r n u g n tp a in s o i h n t e ci c l a d p t oo ia e t r s o i e e t s b e oy e p t t n f e
乙肝病毒基因变异和基因型(亚型)与肝细胞癌的关系
维普资讯
实刚 医学杂志 2 0 年第 2 卷第 2 期 07 3 1
乙肝 病 毒基 因变 异 和基 因型 ( 型 ) 亚 与 肝 细胞 癌 的关 系
张 勇扬 王 爱平
摘
唐 勤
要 目的 : 步探 讨 乙肝病毒基 因变异 、 因型及 亚型与肝 细胞癌( C 发 病的相关性。方法 : 初 基 H C) 特异探针
并检测了部分肝癌患者 的乙肝病毒( B / C ) H V H C 的基
因亚 型
1 资料 与方 法
11 一般 资料 .
20 0 5年 4 l 间 , 京鼓 楼 院 门诊 一 0月 南
和住 院 部 中 .选 择 HB D A 阳性 的 HB V.N V慢 性 感 染 病 人共 9 ( 7 , 2 ) , 中 HC 9男 4女 5例 其 C患 者 ( C组 ) HC 2 7例 , 其他 非 H C病例 ( H C组 , C NC 包括无症状携带
hbv 分型检测内容
hbv 分型检测内容
HBV分型检测是基因扩增检测实验室(PCR实验室)进行的一项检查,通过取自患者血液及其他体液、细胞中提取的HBV DNA进行检测的技术。
具体检测内容如下:
1. 全面型别分析:提取出来的HBVDNA经过扩增基因信息后,通过特定设备对乙肝患者细胞中的HBVDNA分字进行分子信息检测,分析它所含有各种基因型的情况。
2. 分型针对性治疗:为乙肝患者诊断、抗病毒用药治疗、预后提供了重要的指导依据。
HBV分型检测可以诊断识别常见的A-H乙肝HBV基因具体分型。
其中,A型易于转为慢性乙型肝炎,B型通常病程轻微,C型易发重症肝病,D型则表现为急性自限型乙型肝炎。
如果需要进行HBV分型检测,请在专业医师指导下进行,切勿自行诊断。
乙型肝炎病毒基因型及其与肝功能的关系
采用荧光 P C R法检测 , 检测步骤及质量控制结果 均严 格参 照试剂盒说 明书上进 行。 并采用全 自 动生化分析仪测量该组患者 的丙氨酸氨基转移酶 、 天冬氨 酸氨基转移酶 、 总 胆红索 、 直接胆红素、 总蛋 白及清蛋 白等 。 1 . 3 统计学 指标 采用 S P S S 1 8 . 0统计 软件对本次研究 所取得 的数据进 行分析 , 计数 资料采用 x 2检 验, 计量资料采取 t 检验 , 以均数 ± 标准差(x- 4 - s ) 的形式对数据进行表示 , 以 P< 0 . 0 5 代表有 统计学意 义。
必须根据患者实 际进行 , 以确保患者的安全。
参 考 文献
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INNO_LiPA乙型肝炎病毒基因分型方法的评价
基金项目:国家“973”高技术计划项目(G1999054106)作者单位:100044北京大学人民医院北京大学肝病研究所(房继莲、魏来、李若冰、丛旭、许军、王宇);Hepatitis Diagnostics Program, Innogenetics N1V1,Ghent,Belgium(Erwin Sablon)通信作者:魏来weelai@ ・基础实验诊断研究・INNO2LiPA乙型肝炎病毒基因分型方法的评价房继莲 魏来 李若冰 丛旭 许军 Erwin Sablon 王宇 【摘要】 目的 评价INNO2LiPA乙型肝炎病毒基因分型的方法,并探讨了基因型与临床疾病的关系。
方法 随机选取113例慢性HBV感染者外周血采用INNO2LiPA和S基因序列分析两种方法测定HBV基因型。
结果 11INNO2LiPA基因分型法与S基因序列分析法测定的基因型结果比较,符合率8213%(93/113),误判率315%(4/113),B/C型混合感染检出率513%(6/113)。
21LC组和HCC组C基因型比率高于AsC组,差异有显著性(分别为9219%比5218%,X2=7103,P<0101和8819%比5218%,X2=3191,P<0105);LC组C基因型比率高于CHB组,差异有显著性(9219%比6111%,X2=5112,P<0105)。
结论 11INNO2LiPA法是一种较灵敏的快速检测HBV基因型的实验方法,尤其检测混合基因型感染灵敏度高。
21C基因型HBV感染与较重肝病有关。
【关键词】 肝炎病毒,乙型; 基因型; 核酸杂交; 序列分析; 肝疾病Evalu ation of the INN O2LiPA HBV genotyping assay for determination of hepatitis B virus genotype FA N G Ji2lian3,W EI L ai,L I R uo2bing,CON G X u,XU J un,Erw in S ablon,W A N G Y u13 Institute of liver diseases and people’s hospital,Peking U niversity,Beijing100044,China Corresponding author:W EI L ai Em ail:weelai@【Abstract】 Objective To evaluate the INNO2LiPA HBV genotyping assay for determination of hepatitis B virus genotype and to investigate clinical significance of hepatitis B virus genotype1Methods Sera from113patients chronically infected with HBV were detected1HBV genotype was determined by INNO2LiPA and S gene sequencing1R esults 11Complete concordance between INNO2LiPA and sequence analysis was observed for93s pecimens(8213%)1INNO2LiPA was able to detect6(513%)B/C mixed genotype infections not detected by amplicon sequencing1Four specimens(315%)had discrepant results between the two methods121The rate of genotype C infection was higher in patients of LC and HCC than that in AsC(9219%vs5218%,X2=7103,P<0101and8819%vs5218%,X2=3191,P< 0105);and there was significant difference in the distribution of genotype C between LC patients and CHB patients(9219%vs6111%,X2=5112,P<0105)1Conclusions 11The INNO2LiPA HBV G enotyping assay appears to be useful for the rapid genotyping of HBV,particularly for the sensitive detection of mixed genotype infections121G enotype C HBV may induce more severe the liver inflammation than genotype B may do1【K ey w ord】 Hepatitis B virus; G enotype; Nucleic acid hybridization; Sequence analysis; Liver disease 迄今为止,全世界共鉴定了A2H8种乙型肝炎病毒(HBV)基因型[1]。
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l g c o p i e s / m 1 ) 和H B e A g阳性率 ( 6 8 . 5 %) 均 明显高于 B型( 6 . 1 ±
1 . O l g c o p i e s / ml 和 4 5 . 4 %. P < 0 . 0 5 o
染途径 和疾病发生 、 发展等过程有一定的相关性。有较多研 究结果显示 , B基因型与较轻的病变有 关 ,而 c基 型则与 较重的病变有关 。本组肝衰竭患者 H B V C型感染率明
【 关键词 】 乙型肝炎 ; H B V基因型 ; 微板核酸杂交 ; 聚合酶链反应 d o i : 1 ( ) 3 9 6 9  ̄i s s n . 1 6 7 2 — 5 { ) 6 9 . 2 ( ) 1 3 . 0 1 0 2 2
乙型肝炎 病毒( h e p a t i t i s B v i r u s , H B V) 存在 多种不 同的 基因型, 而这些 基因型与病毒 变异 和慢性肝病患者 的病情严
表 1 H B V感染者 HB V基 因分型( %) 情况
二 、H B V基 因分型与 HB V D N A定量 和 H B e A g阳性率
的关 系 HB V C型 感 染 者 H B V D N A定 量 ( 7 . 0±1 . 1
讨 论
不 同基 因型 H B V可能具 有不同的毒力 , 且与 HB V的感
如下 。
D N A检测线性范 围为 1 0 ~ 1 0 拷贝 / 毫升 ; 采用 C MI A法检测 H B e A g 滴度( 美国A b b o t t 公司 ) , 根据试剂盒提供 的标 准判断
结果 。
、
统计学方法
采用 S P S S 1 3 . 0软件进行统计分析 , 采
理 ,然后 再 酶标 记 各 型 探 针 来检 测 HB V的 所 属 亚 型 ; H B V
分型检测多采用 基因测序方法 , 但有 耗时长 、 检测成本 高和
操作复杂等缺点 , 而 聚合 酶链 式反应( P o l y me r a s e C h a i n R e —
a c t i o n , P C R)微板核酸杂交酶联免疫法 ( E n z y m e — l i n k e d i m— m u n o s o r b a n t a s s a y s , E L I S A) 能迅速且简便地检测 乙型肝炎病 毒基 因型 。本研究采用 P C R微板核酸杂交 E L I S A技术检测 了乙型肝炎病毒感染者乙型肝炎病毒基因分型情况 , 现报道
重 程 度 有 着 十分 紧密 的关 联 … 。近 年 来 , 已有 较 多关 于 H B V 基 因 分 型 与肝 脏 病 变 严 重 程 度方 面 的研 究 报 道 1 。目前 基 因
例。 患者 HB V D N A阳性 。 除外合并其他嗜肝病毒重叠感 染 、 药物性肝炎 、 自身免疫性肝炎和酒精性肝病等患者。 二 、检测方法 采用 P C R微板 核酸杂交 E L [ S A技术检 测 H B V D N A基因分型 ( 上海浩源生物科技有 限公 司 ) , 通过 在微孔 中包被 型通 用序列探针与待测 P C R产物予 以杂交处
・
66 ・
实用肝脏病杂志2 0 1 3年 2月第 l 6卷第 1 期
J C l i n
o f ! e } J .
・
. .
.
短篇论著 ・
乙型肝炎病毒基 因分型与疾病病情 的关 系
孙 文锦 肖作汉 赵 丽芹 王立志
【 摘要 】 目的 探讨乙型肝炎病 毒基因分型与疾病病情的关系。 方法 采用 P C R微板核酸杂交 E L I S A技 术检测 2 9 9 例慢性
多于 B型 , 而在其他 临床类 型患者则没有这种差异 。关于 C 基 因型引起 的肝脏病变多较重于 B基因型的原 因 , 一般认为
可 能与 C基 因型 更易 出现 T 1 7 6 2变异 及 基本 核心 启动 子 ( B C P) 的变异等有关I S , 。
结 果
资 料 与方 法
一
用t 检验和卡方检验 , 以P < 0 . 0 5 表示差异有统计学意义。
H B V基 因 分 型 情 况 在 本 组 2 9 9例 患 者 中 , H B V
、
病 例来源
2 0 0 9年 2月 一 2 0 1 2年 2月我科 门诊 及
一
住 院治疗 的 2 9 9例慢性 乙型肝 炎患者 , 男2 1 2例 , 女 8 7例 ,
平 均年 龄 为 3 8 . 2 ±8 . 5岁 。 符合 2 0 1 0年修 订 的诊 断 标 准 , 其
、
基 因分型情况见表 1 ,其 中肝衰竭患 者 H B V C基 因型显著
高 于 B基 因 型 ( P < 0 . 0 5 ) 。
巾慢性 肝炎轻度 7 4例 , 中度 7 8例 , 重度 7 2例 和肝衰竭 7 5
乙型肝炎患者 HB V基冈 ,并 分析其 H B V DN A定量和 HB e A g阳性率 的关 系。结果 本组 患者 H B V基 因分 型结果以 c型 1 4 3例最 多 , B型 1 1 9例次 之 , 其他类 型少 见 ; 肝衰 竭患者 HB V C基 因型 ( 5 3 . 3 %) 显著 高于 B基因型 ( 3 4 . 7 %, P < 0 . 0 5 ) ; C型患者 HB V D N A定量 ( 7 . 0±1 . 1 1 g c o p i e s / m 1 ) 和 HB e A g阳性率 ( 6 8 . 5 %) 均明显高于 B型( 6 . 1 ±1 . 0 1 g c o l i f e s / m l 和4 5 . 4 %, P < O . 0 5) 。结论 组 乙型肝炎病毒基冈分型以 c型和 B型居多, 在肝衰竭患者 HB V C型感染者多于 B型。 本