番茄斑萎病毒核衣壳蛋白基因的克隆与分析

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番茄斑萎病毒4种检测方法比较

番茄斑萎病毒4种检测方法比较

番茄斑萎病毒4种检测方法比较作者:赵巍巍等来源:《植物保护》2015年第02期摘要:本研究根据番茄斑萎病毒(TSWV)S RNA上的核衣壳蛋白(N)基因保守序列设计特异性引物,比较了4种检测方法的灵敏度。

结果表明,特异性引物可扩增出397 bp的片段,序列和已发表的TSWV核苷酸序列同源性高达99%,可用于常规PCR和荧光定量RTPCR (qRTPCR)检测。

qRTPCR的灵敏度比快速检测试纸条、双抗体夹心酶联免疫吸附法(DASELISA)和常规PCR分别高出15 625倍、3 125倍和125倍,且能够准确定量;常规PCR 灵敏度较高,但不能准确定量;DASELISA方法适用于批量定性测定,但检测时间较长;试纸条法检测速度最快,但灵敏度最低,使用时可根据症状程度和试验条件选择适宜的检测方法。

关键词:番茄斑萎病毒; DASELISA;常规PCR;快速检测试纸条; qRTPCR;灵敏度中图分类号: S 432.41文献标识码: A番茄斑萎病毒(Tomato spotted wilt virus,TSWV)是布尼亚病毒科(Bunyaviridae),番茄斑萎病毒属(Tospovirus)代表性成员[1],病毒粒子近似球形[2],寄主植物广泛,主要侵染番茄、烟草、花生、辣椒、莴苣、大豆等蔬菜作物和数以千计的观赏植物[35]。

目前在世界多个国家和地区广泛分布,在夏威夷,生菜、番茄和胡椒上由其造成的损失达60%~70%[67];在法国和西班牙等欧洲国家和地区,曾因该病毒大量扩散而引起番茄、辣椒等作物感病,造成毁灭性损失,重病地块损失达100%;20世纪90年代末期,TSWV 在日本的菊花上严重发生,因其广泛的寄主范围和造成的巨大经济损失已被列为世界危害最大的十种植物病毒之一[8]。

自然界中TSWV主要通过蓟马传播,并以一种持久性循环增殖的方式传播[9],其中西花蓟马是其最有效的传播载体。

国外的许多研究表明,TSWV总是伴随西花蓟马的暴发而发生。

侵染菊花的番茄不孕病毒的鉴定及其外壳蛋白基因的克隆

侵染菊花的番茄不孕病毒的鉴定及其外壳蛋白基因的克隆

摘要 :从菊花花叶病标样中诗离到一球形病毒分离物 , 直径 2 ~2 m. T V抗血 清反应呈 阳性 根据英 国报 5 9n 与 A
道 的番 茄 不 孕 病毒 ( A nC T V E ) P基 因序 列 . 计 合 成 一 对 引 物 , 该 病 毒 R 设 对 NA进 行 R C T P R扩 增 . 到 与 预 期 大 得
小相符的特异扩增带。将 其克隆到 p E T es G M— y中, a 经酶切和序 列诗析表明所克隆的是 T VC A P基 因. 与已知的 6
个 株 系相 应 序 列 同源 性 均 在 9 %以上 。 64 关 键词 :菊花 ; 茄 不 孕病 毒 ; A LS R —C C 番 D SE IA ̄ T P R; P
卉 的主 要生产 基地 之一 , 由于病 毒病 的危 害, 但 使菊
花 品质 、 量 下 降, 种 退 化严 重 。 番茄 不 孕 病 毒 产 品 ( o t ap r i s A 是危 害菊 花 的主要病 T mao semvv u,T V) r 毒 之 一… , 起 菊 花 叶 片 花 叶 、 色 、 朵 畸 形 等 , 引 杂 花 但 由于菊 花 上常发 生 隐症 、 合侵染等现 象 . 复 给病 害
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第l 7卷 2期
20 0 2年 5 月





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侵染 菊花 的番 茄不 孕病 毒 的鉴 定及其 外 壳蛋 白基 因 的克 隆
As e m y V i u n e tn p r r s I f c i g Chr s n h m u ya t e m

番茄斑萎病毒4种检测方法比较

番茄斑萎病毒4种检测方法比较

灵敏度最低 , 使 用 时 可根 据 症 状 程 度 和 试 验 条 件 选 择 适 宜 的 检 测 方 法 。
关键词 番茄斑萎病毒 ; D AS - E L I S A; 常规 P C R; 快速检测试纸条 ; q R T - P C R; 灵敏度
中图分类号 : S 4 3 2 . 4 1 文 献标 识 码 : A D OI : 1 0 . 3 9 6 9 / j . i s s n . 0 5 2 9— 1 5 4 2 . 2 0 1 5 . 0 2 . 0 1 9
Co mp a r i s o n o f f o u r me t h o d s f o r d e t e c t i n g T o ma t o s p o t t e d wi l t v i r u s
Z h a o We i w e i , Ya n g J i a q i a n g , Zh o u Xi a o ma o , Wu Qi n g j u n
q u e n c e s h o we d a h o mo l o g y o f 9 9 % wi t h t h e p u b l i s h e d TS W V n u c l e o t i d e s e q u e n c e .Th e d e s i g n e d p r i me r s c o u l d b e
u s e d f o r c o n v e n t i o n a l P CR a n d q u a n t i t a t i v e r e v e r s e t r a n s c r i p t i o n — P CR ( q RT— P CR) me t h o d s .Th e s e n s i t i v i t y o f

番茄抗青枯病基因的克隆及高通量分子标记的开发

番茄抗青枯病基因的克隆及高通量分子标记的开发
TRBW-Marker在番茄抗青枯病育种中的应用前景
基于TRBW-Marker的多态性分析结果,该标记有望应用于番茄抗青枯病育种中,提高育种效率 和准确性。
抗青枯病基因功能验证
TRBW基因过表达载体构建
构建TRBW基因过表达载体,并转化至感病番茄品种中,获得转基因植株。
TRBW基因过表达对番茄抗青枯病能力的影响
高通量分子标记技术应用
分子标记辅助育种
高通量分子标记技术可用于快速、准确 地检测抗病基因,提高育种效率。通过 分子标记辅助育种,可以将多个抗病基 因聚合到一个品种中,育成具有持久抗 性的番茄新品种。
VS
基因定位与克隆
高通量分子标记技术可用于抗病基因的定 位和克隆。通过构建高密度遗传图谱和关 联分析,可以精确地定位抗病基因,并克 隆其编码序列,为深入研究抗病机理和开 发新型抗病策略提供基础。
02
实验材料与方法
实验材料来源及准备
1 2
3
番茄品种选择
选用具有抗青枯病性状的番茄品种作为实验材料。
DNA提取
采集番茄叶片,利用CTAB法提取高质量DNA,用于后续实 验。
病原菌准备
从青枯病病区采集病原菌,进行分离、纯化和扩增,用于接 种实验。
基因克隆技术流程
目的基因筛选
利用生物信息学方法,从已知抗 病基因数据库中筛选候选目的基 因。
分布与危害
番茄青枯病广泛分布于世界各地番茄产区,尤其在温暖潮湿地区发病严重。该病害可导致番茄减产甚 至绝收,给农业生产造成巨大损失。
抗青枯病基因研究现状
抗病基因鉴定
目前,已有多个与番茄抗青枯病相关的基因被鉴定出来,如Pto、Prf等。这些 基因通过不同的机制赋予番茄对青枯病的抗性。

番茄斑萎病毒4种检测方法比较_赵巍巍

番茄斑萎病毒4种检测方法比较_赵巍巍
2015,41(2):108-113
Plant Protection
番茄* , 吴青君2*
(1. 湖 南 农 业 大 学 农 药 研 究 所 , 长 沙 410128;2. 中 国 农 业 科 学 院 蔬 菜 花 卉 研 究 所 , 北 京 100081)
摘要 本研究根据番茄斑萎病毒(TSWV)S RNA 上的核衣 壳 蛋 白(N)基 因 保 守 序 列 设 计 特 异 性 引 物 ,比 较 了 4 种 检测方法的灵敏度。结果表明,特异性引物可扩增出397bp的片段,序列和已发 表 的 TSWV 核 苷 酸 序 列 同 源 性 高 达99%,可用于常规 PCR 和荧光定量 RT-PCR(qRT-PCR)检测。qRT-PCR 的灵敏度比快速检测试纸条、双抗体夹 心酶联免疫吸附法(DAS-ELISA)和常 规 PCR 分 别 高 出 15 625 倍、3 125 倍 和 125 倍,且 能 够 准 确 定 量;常 规 PCR 灵敏度较高,但不能准确定量;DAS-ELISA 方法适用于批量定性测定,但检测时间较长;试纸条法检测速度 最 快,但 灵 敏 度 最 低 ,使 用 时 可 根 据 症 状 程 度 和 试 验 条 件 选 择 适 宜 的 检 测 方 法 。 关键词 番茄斑萎病毒; DAS-ELISA; 常规 PCR; 快速检测试纸条; qRT-PCR; 灵敏度 中 图 分 类 号 : S 432.41 文 献 标 识 码 : A DOI: 10.3969/j.issn.0529-1542.2015.02.019
Abstract Specific primers were designed according to the conserved sequence of the nucleocapsid protein (N) gene of Tomato spotted wilt virus (TSWV)S RNA,and the sensitivities of four methods for detecting TSWV were compared.The results showed that a 397 bp fragment was amplified with the specific primers,and the se- quence showed a homology of 99% with the published TSWV nucleotide sequence.The designed primers could be used for conventional PCR and quantitative reverse transcription-PCR (qRT-PCR)methods.The sensitivity of qRT-PCR for detecting TSWV was 15 625 fold,3 125 fold and125 fold higher than that of the rapid detection test strip (RDTT),double sandwich enzyme-linked immunosorbent assay (DAS-ELISA)and conventional PCR,re- spectively.Moreover,qRT-PCR method can be accurately quantified.Conventional PCR showed a higher sensi- tivity,but it cannot be accurately quantified.DAS-ELISA is suitable for batch qualitative detection but it needs a longer detection time.RDTT is the fastest method,but the sensitivity is the lowest.Suitable detection methods can be selected according to the symptom degree and the experimental conditions. Key words Tomato spotted wilt virus; DAS-ELISA; conventional PCR; rapid detection test strip; qRT- PCR; sensitivity

番茄斑萎病毒核衣壳蛋白基因的克隆与分析

番茄斑萎病毒核衣壳蛋白基因的克隆与分析
3 o g igBa c fGrd ae h o ,C nrl o t nvri ,C a gh 4 0 2 ,C ia; .L npn rn ho a u t S o l e t uh U iest c aS y h n sa 1 1 5 hn
4 n tueo eea l n lw r ,C iee cd myo Agi l rl cecs e ig 10 8 ,C ia .I s t t fV g tb s d Fo es hns a e f r ut a ine ,B in 0 0 1 hn ) i ea A c u S j
( .湖南农业大学生物安全科技 学院 ,长沙 1 3 .中南大学研究 生院隆平分院 ,长沙 摘要 402 ; 2 1 18 .湖南省植物保护研究所 ,长沙 402 ; 1 1 5 4 0 2 ;4 1 1 5 .中国农业科学院蔬菜花卉研究所 ,南表现褪 绿黄化症状 的番茄上 分 离到番茄斑 萎病毒 ( o t sot l vr s YN 1 系, 用 R - T mao p t d wi iu ) _ 株 e t 利 T
P R 方 法 克 隆 了该 株 系 的核 衣 壳蛋 白基 因 , 测 定 了该 基 因 的序 列 , 长 为 7 7b , 码 2 8个 氨 基 酸 。 对 该 基 因 C 并 全 7 p 编 5
的氨基酸序 列分析 结果表 明, N一 Y 1N基 因与韩 国 3个株 系的氨基 酸序 列相 似性均 高达 9 。 7 关键词 番 茄斑萎病毒 ; 核衣 壳蛋 白; 克隆 中图分类号 : S4 64 2 1 3 . 1 . 9 文献标 识码 : A D I i. 9 9ji n 0 2 —14 . 0 0 0 . 1 O : 0 3 6/. s. 5 9 5 2 2 1 . 5 0 4 s

新疆加工番茄条斑坏死病原黄瓜花叶病毒外壳蛋白基因的克隆和序列分析

新疆加工番茄条斑坏死病原黄瓜花叶病毒外壳蛋白基因的克隆和序列分析
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第2卷 4
第 4期
Jun石河子大学学报r自然科学版 c ne ora o h ei nv ( yN t a S c ) l f i z U i s ( a rl ) S h ei t u i e
V1 4 o4 o. N . 2
要 病原 。
田间大量 采集 的 样 品 冷藏 于 一7  ̄ 通 过 摩擦 0C, 接种 心 叶烟 , 多次单 斑 分 离 后 , 后 接种 心 叶 烟 , 最 保 存毒 源 。 1 12 载体 与菌株 .. PC- U mT载体 购 自上 海 sno agn公 司 , 肠 杆 菌 大
近 年来 , 加工 蕃 茄 条斑 坏 死病 毒 病 的 发生 日益
严重, 成为制约加工蕃茄生产的重要 因素。在新疆 的奎屯 、 河 子 、 拉 斯 等 地 普遍 大 面积 发 生 , 的 石 玛 有 地块 发病 率 高 达 10 , 成 产 量 下 降 , 至 绝 产 。 0% 造 甚
利 用生 物学 、 电镜 观察 、 血清 学 和部分基 因序列测 定 等 方法 , 从引 起 条斑 坏 死 的加 工 番茄 中 , 离出黄 瓜 分 花 叶病毒 , 其 进 行 了 初 步 研究 ,发现 黄 瓜 花 叶 病 对
摘要 : 从表现花叶 、 畸形以及坏 死症状 的加工 番茄病株 上获得黄瓜花 叶病毒分离物 , 1 C V C 用 对 M P基 因引物进行 R -C 扩增得到 了 76 p的特异性核苷 酸片段 。将 P R产物插入到克隆载体 P C - TP R. 7b C U mT中转 化大肠杆菌 D S 。经 HQ
限制 酶酶切鉴 定 , 重组 克隆 中含有与 f R产 物大小相 同的 76 p的插 入片段 。c N 2 7b D A全序列 分析 表明,重组克隆含

番茄环纹斑点病毒核衣壳蛋白N_的RT-LAMP_检测方法的建立

番茄环纹斑点病毒核衣壳蛋白N_的RT-LAMP_检测方法的建立

㊀山东农业科学㊀2023ꎬ55(11):176~180ShandongAgriculturalSciences㊀DOI:10.14083/j.issn.1001-4942.2023.11.026收稿日期:2023-05-28基金项目:福建省科技计划项目(2023J06040ꎬ2022R1024006)ꎻ福建省农业科学院科技项目(CXTD2021004-3ꎬXTCXGC2021011ꎬXTCXGC2021017)作者简介:罗海燕(1998 )ꎬ女ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为植物病理学ꎮE-mail:2679408148@qq.com通信作者:陈勇(1983 )ꎬ男ꎬ博士ꎬ副研究员ꎬ主要从事媒介昆虫与植物病毒互作研究ꎮE-mail:cheny0903@163.com郑雪(1980 )ꎬ女ꎬ博士ꎬ副研究员ꎬ主要从事媒介昆虫与植物病毒互作研究ꎮE-mail:Zhengxue05@163.com番茄环纹斑点病毒核衣壳蛋白N的RT-LAMP检测方法的建立罗海燕1ꎬ李恒1ꎬ陆承聪1ꎬ魏辉1ꎬ郑雪2ꎬ陈勇1(1.福建省农业科学院植物保护研究所/闽台作物有害生物生态防控国家重点实验室/农业农村部福州作物有害生物科学观测试验站ꎬ福建福州㊀350013ꎻ2.云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所ꎬ云南昆明㊀650205)㊀㊀摘要:番茄环纹斑点病毒(TomatozonatespotvirusꎬTZSV)属正番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)ꎬ严重影响番茄㊁辣椒等作物的产量及经济价值ꎮ本研究根据TZSV的核衣壳蛋白N的基因序列设计逆转录环介导等温扩增(reversetranscriptionloop ̄mediatedisothermalamplificationꎬRT-LAMP)反应引物ꎬ建立了TZSV的RT-LAMP检测方法ꎮ结果显示ꎬ该方法能够特异扩增TZSVꎬ与侵染辣椒的番茄斑萎病毒和烟草花叶病毒不发生反应ꎻRNA最低检测限为0.01pg/μLꎬ灵敏度为普通逆转录PCR(RT-PCR)的10倍ꎻ田间样品检测应用结果表明ꎬRT-LAMP扩增和可视化检测结果与RT-PCR一致ꎮ综上ꎬ本研究建立的RT-LAMP快速检测方法可有效应用于TZSV的田间检测ꎮ关键词:番茄环纹斑点病毒ꎻ核衣壳蛋白Nꎻ逆转录环介导等温扩增技术ꎻ检测中图分类号:S432.4+1㊀㊀文献标识号:A㊀㊀文章编号:1001-4942(2023)11-0176-05EstablishmentofaReverseTranscriptionLoop ̄MediatedIsothermalAmplification(RT ̄LAMP)MethodforDetectingNucleocapsidProteinNofTomatoZonateSpotVirusLuoHaiyan1ꎬLiHeng1ꎬLuChengcong1ꎬWeiHui1ꎬZhengXue2ꎬChenYong1(1.InstituteofPlantProtectionꎬFujianAcademyofAgriculturalSciences/StateKeyLaboratoryforEcologicalPestControlofFujianandTaiwanCrops/FuzhouScientificObservingandExperimentalStationofCropPestsꎬMinistryofAgricultureandRuralAffairsꎬFuzhou350013ꎬChinaꎻ2.InstituteofBiotechnologyandGermplasmResourcesꎬYunnanAcademyofAgriculturalSciencesꎬKunming650205ꎬChina)Abstract㊀Tomatozonatespotvirus(TZSV)isaphytopathogenofthegenusOrthotospovirusꎬwhichcau ̄sessevereeconomicvalueandyieldlossoftomatoꎬpepperandothercrops.Inthisstudyꎬthereversetran ̄scriptionloop ̄mediatedisothermalamplification(RT ̄LAMP)primersweredesignedoriginallyusingthegenesequenceofthenucleocapsidproteinNofTZSVꎬandthenaspecificmethodwasestablishedforthedetectionofTZSVbyusingRT ̄LAMPmethod.TheresultsshowedthatthismethodcouldamplifyTZSVspecificallyꎬandcouldnotreactwithtomatospottedwiltvirusandtobaccomosaicvirus.ThelowestdetectionlimitofRNAwas0.01pg/μLꎬandthesensitivitywas10timesofthatofordinaryreversetranscriptionPCR(RT ̄PCR).TheRT ̄LAMPmethodwasappliedtodetectTZSVinfieldsamplesꎬandtheresultsofRT ̄LAMPamplificationandvisualinspectionwereconsistentwiththoseofRT ̄PCR.InconclusionꎬtheRT ̄LAMPrapiddetectionmethodestablishedinthisstudycouldbeeffectivelyappliedtothefielddetectionofTZSV.Keywords㊀TomatozonatespotvirusꎻNucleocapsidproteinNꎻReversetranscriptionloop ̄mediatediso ̄thermalamplification(RT ̄LAMP)ꎻDetection㊀㊀植物病毒病素有 植物癌症 之称ꎬ是导致作物减产和品质下降的主要因素之一ꎬ全球每年因植物病毒病害造成的经济损失高达300亿美元[1]ꎮ在已报道的1484种植物病毒病害中ꎬ70%以上由媒介昆虫传播[2]ꎮ番茄环纹斑点病毒(TomatozonatespotvirusꎬTZSV)属正番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)ꎬ于2005年在我国云南省被首次发现并报道ꎬ自然状态下主要侵染番茄(So ̄lanumlycopersicum)㊁辣椒(Capsicumannuum)㊁烟草(Nicotianatabacum)和马铃薯(Solanumtuberos ̄um)等20多种作物及杂草[3-4]ꎬ主要由西花蓟马(Franiklinellaoccidentalis)㊁梳缺花蓟马(F.shcu ̄letzi)㊁棕榈蓟马(Thripspalmi)等蓟马类昆虫以持久增殖型方式传播ꎬ也可通过机械摩擦传播[4]ꎮ近年来ꎬ除云南外ꎬ在北京㊁贵州及广西的辣椒㊁番茄产区也检测到该病毒病发生ꎬ危害有蔓延至周边省份的趋势[5]ꎮ建立一种高效㊁特异㊁灵敏的检测方法对TZSV的预警及发病规律研究具有重要意义ꎮ逆转录环介导等温扩增技术(reversetran ̄scriptionloop ̄mediatedisothermalamplificationꎬRT-LAMP)是将环介导等温扩增与逆转录反应相结合直接检测RNA的方法ꎬ当被检RNA与反应混合物中的pH指示剂耦合时ꎬ可通过颜色变化获得检测结果[6]ꎮRT-LAMP技术已被广泛应用于粮食㊁果树㊁蔬菜等农作物病毒病的检测[6-9]ꎮ李战彪等[9]建立了基于TZSVRNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymeraseꎬRdRp)的RT-LAMP技术ꎮ但迄今国内外未见有利用该技术检测TZSV核衣壳蛋白N(nucleocapsidproteinN)的报道ꎮ本研究根据TZSV核衣壳蛋白N的基因序列设计RT-LAMP引物ꎬ建立快速高效㊁特异灵敏的TZSVRT ̄LAMP检测体系ꎬ以期为TZSV的鉴定及防控提供技术支持ꎮ1㊀材料与方法1.1㊀试验材料1.1.1㊀供试病叶及病毒㊀感染TZSV㊁番茄斑萎病毒(TomatospottedwiltvirusꎬTSWV)和烟草花叶病毒(TobaccomosaicvirusꎬTMV)的辣椒叶片均由云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所提供ꎬ经RT-PCR检测确定病毒种类后ꎬ-80ħ保存备用ꎮ携带TZSV-N基因的质粒pTOPO-TZSV-N由福建省农业科学院植物保护研究所生物安全实验室构建并保存ꎮ1.1.2㊀主要试剂㊀TransZolPlant多糖植物总RNA提取试剂盒㊁EasyScriptReverseTranscriptase反转录试剂盒㊁Trans2kPlusDNAMarker㊁dNTPs均购自北京全式金生物技术有限公司ꎻBstDNA聚合酶㊁10ˑBstReactionBuffer购自生工生物工程(上海)股份有限公司ꎻSYBRGreenⅠ和甜菜碱购自北京索莱宝科技有限公司ꎻBst聚合酶㊁Mg ̄SO4购自NewEnglandBiolabs(美国)ꎻ其他试剂均为常规分析纯试剂ꎮ1.1.3㊀主要仪器㊀Bio-radT100PCR仪㊁MINI-PRATEA电泳仪㊁BioRadSYSTEMGelDocXR+凝胶成像系统均购自美国Bio-rad公司ꎮ1.2㊀试验设计与方法1.2.1㊀引物设计㊀根据GenBank中TZSV-N基因序列(登录号:MG656995.1)ꎬ利用PrimerEx ̄plorerV4软件设计RT-LAMP扩增引物ꎬ其中F3和B3为外引物㊁FIP和BIP为内引物(表1)ꎬ由福州尚亚生物技术有限公司合成ꎮ1.2.2㊀总RNA提取及cDNA合成㊀按照TransZolPlant试剂盒操作说明提取病叶总RNA(终浓度1μg/μL)ꎬ-80ħ保存备用ꎮ以RNA为模板ꎬ利用EasyScriptReverseTranscriptase试剂盒合成cDNAꎬ-20ħ保存备用ꎮ1.2.3㊀RT-LAMP和RT-PCR反应体系㊀25μLRT-LAMP反应体系:8U/μLBst2.0DNA聚合酶1μL㊁2.5mmol/LdNTPs4μL㊁25mmol/LMgSO44μL㊁10ˑBstDNABuffer2.5μL㊁20μmol/LBIP2μL㊁甜菜碱3.5μL㊁20μmol/LFIP2μL㊁10μmol/LB30.5μL㊁10μmol/LF30.5μL㊁cDNA模板2μLꎬ最后用ddH2O补至25μLꎮ反应条件:60ħ1hꎬ80ħ5minꎮ反应结束后ꎬ加入2.0μLSYBR771㊀第11期㊀㊀㊀㊀㊀㊀罗海燕ꎬ等:番茄环纹斑点病毒核衣壳蛋白N的RT-LAMP检测方法的建立GreenⅠ核酸染料ꎬ观察颜色反应ꎻ或取5μL扩增产物1%琼脂糖凝胶电泳后凝胶成像仪观察㊁拍照ꎮ㊀㊀表1㊀RT-LAMP及RT-PCR引物信息引物组引物引物序列(5ᶄ-3ᶄ)RT-LAMP-ⅠF3GGAAATATGAGTTTTGTGGTCATB3CTGGTACATTCAAACCGTATGFIPTCTGATGAAAGCTTCAGTCCTTTTA-TTGCTAGTAGTGCTGATGTBIPACCAGACTTATCAGCATGGCC-GGTAGTTCCATTGCCTTGACRT-LAMP-ⅡF3TGCTACAGATGAAACCACAAB3GCCAAAGGAAAGCAAACTGFIPTGGTACATTCAAACCGTATGCAG-AAACAAATGTATGTCAAGGCAATBIPAATTCATCAGCCATTAGACTGATGC-TGCTAATCCAGGAACGCTRT-LAMP-ⅢF3TGTCTAACGTCCGGAGTTB3TTGCATGCAGCAAACACTFIPGCCCTGGGTTTGGTCATCTG-TAACACAACAAAAGATTCACGABIPTTCAGCTTTGCCTCTTTCTATGAG-TTTCAGAATATTTATGCCAGTGTRT-PCRFAAAGATTCAAGAACTATTGGCTRTCTCAGTGAACTCCACGCTA㊀㊀25μLRT-PCR反应体系:10ˑBstReactionbuffer2.5μL㊁8U/μLBst2.0DNA聚合酶1μL㊁2.5mmol/LdNTPs4μL㊁10μmol/LTZSV-Ⅰ-F3及TZSV-Ⅰ-B3各0.5μL㊁cDNA模板2μL㊁ddH2O14.5μLꎮ反应程序:94ħ2minꎻ94ħ30sꎬ55ħ30sꎬ72ħ30sꎬ35个循环ꎻ72ħ2minꎮ1%琼脂糖凝胶电泳检测ꎮ1.2.4㊀特异性及灵敏度检测㊀分别以感染TZSV㊁TSWV㊁TMV的辣椒叶片总RAN为模版ꎬ利用建立的反应体系进行RT-LAMP扩增和1%琼脂糖凝胶电泳检测ꎬ与RT-PCR扩增结果对比ꎬ明确该方法的特异性ꎮ将感染TZSV的总RNA用RNase-freeH2O10倍梯度稀释(1.0ˑ10-1~1.0ˑ10-9)ꎬ以稀释后的RNA为模板ꎬ分别进行RT-LAMP和RT-PCR扩增ꎬ1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物ꎬ比较两者的灵敏度ꎮ1.3㊀RT-LAMP方法的应用秋冬季从云南省采集疑似感染TZSV的辣椒叶片ꎬ提取总RNAꎬ利用本试验建立的RT-LAMP和普通RT-PCR体系扩增ꎬ1%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物ꎮRT-LAMP反应产物中加入2.0μLSYBRGreenⅠ核酸染料ꎬ阳性为绿色ꎬ阴性为橙色ꎮ2㊀结果与分析2.1㊀RT-LAMP引物筛选以质粒pTOPO-TZSV-N为模板ꎬ进行RT-LAMP反应ꎬ1%琼脂糖凝胶电泳检测表明ꎬ引物组Ⅰ产生典型的LAMP梯状条带ꎬ扩增效果最好ꎬ其余两组无明显的梯状条带(图1A)ꎻ终止反应后向反应液中加入SYBRGreenⅠꎬ可见引物组Ⅰ变为绿色ꎬ其余两组为橙色(图1B)ꎮ因此ꎬ选择第Ⅰ组引物进行特异性和灵敏度检测ꎮM:DNA分子质量标准(DL2000)ꎻ1㊁2㊁3:RT-LAMP引物组Ⅰ㊁Ⅱ㊁Ⅲꎮ图1㊀RT-LAMP检测辣椒叶片TZSV的琼脂糖凝胶电泳(A)和染色反应(B)2.2㊀RT-LAMP的特异性检测以TZSV阳性样本为阳性对照ꎬ健康植物样本为阴性对照ꎬ对TMV和TSWV阳性样本进行RT-LAMP检测ꎮ结果显示ꎬ只有TZSV阳性样品出现梯状条带ꎬ其它病毒和健康植物样本中未产生梯状条带ꎬ与RT-PCR检测结果相同(图2)ꎬ说明建立的TZSVRT-LAMP检测方法具有较强的特异性ꎮ871㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀山东农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀第55卷㊀M:DNA分子质量标准(DL2000)ꎻTMV:TMV阳性样本ꎻTSWV:TSWV阳性样本ꎻTZSV:TZSV阳性样本ꎻCK:健康植物样本ꎮ图2㊀TZSV的RT-LAMP(A)和RT-PCR(B)特异性检测2.3㊀RT-LAMP的灵敏度检测将1μg/μL的TZSV总RNA进行10倍梯度稀释ꎬ以不同浓度RNA为模板分别进行RT-LAMP和RT-PCR扩增ꎮ结果显示ꎬRNA浓度被稀释至0.01pg/μL(10-8)时ꎬRT-LAMP方法仍能检测出TZSV(图3A)ꎬ而RT-PCR只能检测到RNA浓度稀释至0.1pg/μL(10-7)的样品(图3B)ꎬ表明RT-LAMP检测方法的灵敏度是RT-PCR的10倍ꎮM:DNA分子质量标准(DL2000)ꎻCK:空白对照ꎻ10-1~10-9:梯度稀释总RNAꎮ图3㊀TZSV的RT-LAMP(A)和RT-PCR(B)灵敏度检测2.4㊀RT-LAMP技术的田间检测应用对采自云南省的疑似感染TZSV的辣椒叶片进行RT-LAMP和RT-PCR检测ꎮ结果显示ꎬ6份样品中利用RT-LAMP方法检测出4份TZSV阳性样品ꎬ与RT-PCR检测结果一致ꎮ向RT-LAMP反应产物中加入SYBRGreenⅠ核酸荧光染料ꎬ阳性样品迅速变为绿色ꎬ阴性样品为橙色ꎬ结果一致(图4)ꎮ综上ꎬ本研究建立的RT-LAMP检测法可用于田间辣椒TZSV快速检测ꎮM:DNAmarkerꎻ1~6:田间采集的辣椒叶片样品ꎻ7:阳性对照ꎻ8:阴性对照ꎮ图4㊀TZSV田间样品RT-PCR(A)㊁RT-LAMP(B)及可视化(C)检测3㊀讨论与结论关于TZSV的检测ꎬ目前已建立了血清学㊁电971㊀第11期㊀㊀㊀㊀㊀㊀罗海燕ꎬ等:番茄环纹斑点病毒核衣壳蛋白N的RT-LAMP检测方法的建立镜观察㊁分子生物学等技术[5]ꎮ与血清学㊁电镜观察等手段相比ꎬRT-PCR和RT-qPCR等分子生物学方法灵敏度较高㊁特异性较强ꎬ是TZSV检测最常用的方法[10]ꎬ但在日常病害诊断中耗时长㊁操作繁琐且受限于高精度的实验仪器ꎮ本研究根据TZSV的核衣壳蛋白N基因设计引物ꎬ建立了TZSV的RT-LAMP检测技术ꎬ具有操作简便㊁特异性和灵敏度高㊁反应时间短㊁无需贵重仪器等优点ꎬ扩增产物既可凝胶电泳检测ꎬ也可依据颜色变化可视化判定ꎬ为生产及科研单位快速诊断TZSV提供了技术支持ꎮ特异性是检测RT-LAMP技术最为重要的指标之一[11]ꎮTZSV是茄科作物上的重要病原菌ꎬ与正番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)代表种TSWV同为云南地区蔬菜上的优势病毒ꎬ常交替或同时发生[12]ꎮ李战彪等[9]报道了基于TZSV-RdRp的RT-LAMP检测方法ꎬ但未明确其是否能特异性区分TZSV与TSWVꎮ本研究以TZSV-N为靶标基因设计筛选了其RT-LAMP特异性引物ꎬ有效扩增到TZSVꎬ未扩增到TSWVꎬ表现出较高的特异性ꎮ通常ꎬRT-LAMP检测的灵敏度要高于普通RT-PCRꎮ本研究建立的TZSVRT-LAMP方法RNA浓度检测下限为0.01pg/μLꎬ是RT-PCR灵敏度的10倍ꎬ也略高于基于TZSV-RdRp的RT-LAMP方法[9]ꎮ此外ꎬ由于TZSV侵染引起的病症存在低温隐症现象ꎬ给病害的诊断造成一定困难ꎮ本研究对秋冬季采自云南的6份辣椒叶片疑似病样进行鉴定ꎬ检测结果与RT-PCR一致ꎬ表明建立的RT-LAMP检测技术对隐症或病毒含量较低的样品也可有效检测ꎮ综上ꎬ本研究建立的TZSV-N基因的RT-LAMP检测方法能够特异扩增TZSVꎬ灵敏度为RT-PCR的10倍ꎮ在RT-LAMP反应产物中加入SYBRGreenⅠ核酸荧光染料用肉眼观察即可判断样品是否感染TZSVꎬ该结论可为TZSV的鉴定及防控提供技术支持ꎮ参㊀考㊀文㊀献:[1]㊀NicaiseV.Cropimmunityagainstviruses:outcomesandfuturechallenges[J].FrontiersinPlantScienceꎬ2014ꎬ5:660. [2]㊀HeSꎬKrainerKMC.Pandemicsofpeopleandplants:whichisthegreaterthreattofoodsecurity?[J].MolecularPlantꎬ2020ꎬ13(7):933-934.[3]㊀DongJHꎬChengXFꎬYinYYꎬetal.Characterizationofto ̄matozonatespotvirusꎬanewtospovirusinChina[J].ArchivesofVirologyꎬ2008ꎬ153(5):855-864.[4]㊀ChenYꎬZhengXꎬWeiHꎬetal.Aplantvirusmediatesinter ̄specificcompetitionbetweenitsinsectvectorsinCapsicuuman ̄nuum[J].JournalofPestScienceꎬ2021ꎬ94(1):17-28. [5]㊀刘宇艳ꎬ张洁ꎬ陈勇ꎬ等.番茄环纹斑点病毒的研究进展[J].山东农业科学ꎬ2021ꎬ53(8):138-142. [6]㊀赵雪君ꎬ邓永杰ꎬ魏周玲ꎬ等.蔬菜中黄瓜花叶病毒的RT ̄LAMP快速检测[J].园艺学报ꎬ2016ꎬ43(6):1203-1210. [7]㊀姜珊珊ꎬ冯佳ꎬ张眉ꎬ等.甘薯羽状斑驳病毒RT-LAMP快速检测方法的建立[J].中国农业科学ꎬ2018ꎬ51(7):1294-1302.[8]㊀王永江ꎬ周彦ꎬ李中安ꎬ等.柑橘衰退病毒RT-LAMP快速检测方法的建立[J].中国农业科学ꎬ2013ꎬ46(3):517-524.[9]㊀李站彪ꎬ秦碧霞ꎬ蔡健和ꎬ等.番茄环纹斑点病毒RT ̄LAMP检测方法㊁引物组及其应用:ZL201310351007.3[P].2014-08-20.[10]徐弢ꎬ郑雪ꎬ张晓林ꎬ等.番茄环纹斑点病毒(TZSV)实时荧光定量PCR检测方法的建立[J].山东农业科学ꎬ2017ꎬ49(7):139-144.[11]戴婷婷ꎬ陆辰晨ꎬ郑小波.环介导等温扩增技术在病原物检测上的应用研究进展[J].南京农业大学学报ꎬ2015ꎬ38(5):695-703.[12]郑雪ꎬ陈永对ꎬ吴阔ꎬ等.2014年云南番茄㊁辣椒上番茄斑萎病毒属病毒与传毒蓟马的发生特点[J].南方农业学报ꎬ2015ꎬ46(3):428-432.081㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀山东农业科学㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀㊀第55卷㊀。

番茄黄化曲叶病毒郑州分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析

番茄黄化曲叶病毒郑州分离物外壳蛋白基因的克隆与序列分析
f e c t u r e s o f Zhe n gz ho u du r i ng t he p a s t s e v e r a l y e a r s . To i de nt i f y t h e s u s p e c t e d be go mov i r u s, a p a i r
中图分 类 号 :¥ 4 3 6 . 4 1 2 . 1 文献标 志 码 :A 文 章编 号 :1 0 0 4—3 2 6 8 ( 2 0 1 3 ) 0 9— 0 0 8 7— 0 4
Cl o n i n g a n d S e q u e n c e An a l y s i s o f Co a t Pr o t e i n Ge n e o f
核 苷 酸组 成 , 其核 苷 酸和编 码氨 基 酸 序 列 与番 茄 黄 化 曲 叶病 毒 其他 分 离物 同源性 均在 9 5 以上;
系统进 化 分析表 明 , 郑 州分 离物 与 北京 、 烟台、 上 海 和新 疆 分 离物 亲缘 关 系最 近 。根 据双 生病 毒 的
分 类标 准 , 判 断郑 州分 离物 应属 于番 茄 黄化 曲叶 病毒 的一 个分 离物 。 关 键词 :番茄 黄化 曲叶病 毒 ;外 壳蛋 白;基 因克 隆 ;序 列分析
为 了确 定疑 似 病毒 的 分类地 位 , 根 据 已知 的 番 茄 黄 化 曲 叶 病毒 ( T YL C V) 基 因组序 列设 计 特 异性
引物 T YL C V—C P F / T YL C—C P R, 通过 P C R扩 增其 外 壳蛋 白基 因 , 对 获得 的特异 性 片段 回收 、 克 隆、 测 序并 进行 同源性 比较 及 分子 系统 进化 分析 。结果显 示 , 郑 州分 离物的 外 壳蛋 白基 因由 7 7 7个

番茄斑萎病毒外壳蛋白原核表达及Dot-blotELISA检测方法的建立

番茄斑萎病毒外壳蛋白原核表达及Dot-blotELISA检测方法的建立
浙 江 大 学 学报 ( 农业与生命科学版) 3() 57 0, 08 46: 9~61 20
J un lo ein ie s y( rc o r a fZhja gUn vri Ag i.&. f c. t Li S i ) e
文 章 编 号 : 0 8 9 0 ( 0 8 0 — 5 70 10 —2 92 0 )60 9—5
Ab t a t sr c :T he ul oa p o e n f l c t r t i ge o To a o po td w it i us (TSW V ) wa s bco d n o ne f m t s te l v r s u lne i t a pr a y tc e pr s in c o pET一 2 ok r o i x e so ve t r 3 a. R e uls r s rc i e z m e i s in nd s t of e t iton n y dge to a DN A s q ncng e ue i s ow ha t i e ton die to a d e e e w e e c r e t nd h t t he ns ri r ci n n s qu nc r o r c a no r m e hit ut ton e s e fa s f m a i xit d. T hi s r c m bi ntpr ka yo i xpr s i n ve t ( eo na o r tc e e so cor pET一 2aT SW V— 3 CP) wa u e o t a f m E. c l BL2l s s d t r nsor oi
文 献标 识码 : A
中图 分 类 号 :Q 8 4 2 4 7 ;¥ 3 . 1

番茄黑环病毒外壳蛋白基因的克隆与原核表达

番茄黑环病毒外壳蛋白基因的克隆与原核表达

E x i t I n s p e c t i o n a n d Q u a r a n t i n e B u r e a u , Q i n g d a o 2 6 6 0 0 , C h i n a ; 3 . C h i n a C e r t i f i c a t i o n& I n s p e c t i o n( G r o u p )
p r o k a r y o t i c e x p r e s s i o n v e c t o r pET3 0a — TBRV CP wa s c o ns t r uc t e d. a n d t r a ns f o r me d i n t o E. c o l i BL 一21 . Af t e r
1 . 0 m mo l / L I P T G、 4 h条 件 下 表 达量 最 高 。
关键词 : 番茄 黑环病毒 ; 外壳蛋 白基 因; 克隆 ; 原核表达 中图分类号 : ¥ 4 3 2 . 4 1 文献标志码 : A 文章编号 : 1 0 0 0— 2 2 , 8 6 ( 2 0 1 3 ) 0 4— 0 7 2 7—0 5
C o . , L t d . , B e i j i n g 1 0 0 0 2 8 , C h i n a ) A b s t r a c t : T h e c o a t p r o t e i n( C P )g e n e o f t o ma t o b a l c k r i n g v i r u s( T B R V)w a s a m p l i i f e d b y R T— P C R.
Th e a mp l i f i e d f r a g me n t wa s c l o n e d a n d c o n ir f me d b y s e q u e n c e a n a l y s i s wh i c h c o n s i s t e d o f 1 3 9 9 b p. TBRV CP g e n e wa s c l o n e d i n t o p MD1 9一T s i mp l e v e c t o r . S e q u e n c e a n a l y s i s s ho we d t h a t t h e n u c l e o t i d e wa s 99 % a li g n e d wi t h TBRV CP g e n e i n Ge n Ba n k. TBRV CP g e n e wa s i n s e r t e d i n t o p E3 30a d i g e s t e d b y Hi n d l U /Ba mH , t h e

应用DPO技术检测番茄斑萎病毒方法的建立

应用DPO技术检测番茄斑萎病毒方法的建立
D N A聚 合酶 ( 5 U / L ) O . 2 L , 上、 下游 D P O 引物 ( 2 0 t x mo l / L ) 各 1 . 0 p . L , 以 去 离 子 水 补 充 至
2 5 L 。利 用该检 测 方法 , 在4 9 . 8~ 7 0 . 0℃ 的退 火温 度 范 围 内, 均 可 实现 目标 基 因片段 的 高 效扩
异性 强 。所建 立的 D P O—P C R检 测方 法能 够准确 、 高效地检 测 T S wv, 可用 于进 出境 种苗检 疫 筛查
及 田 间 病 害诊 断 。
DP O —P C R :检 测 关 键词 :番茄斑 萎病 毒 ; 双 启动 寡核 苷酸 引物 ; 中图分 类号 : ¥ 4 3 2 . 4 1 文献 标 志码 : A 文章编 号 : 1 0 0 4—3 2 6 8 ( 2 0 1 7 ) 1 1— 0 0 9 3— 0 5
应用 D P O 技 术 检 测 番 茄 斑 萎 病 毒 方 法 的建 立
刘 忠梅 , 罗 佳。 , 潘 仲 乐 , 刘 洪 义 , 李 丹 丹 , 韩 政 坤 , 魏 冬 旭 , 马 微
( 1 . 黑 龙 江 出人 境 检 验 检 疫 局 检验 检疫 技术 中 心 , 黑龙江 哈尔滨 1 5 0 0 0 1 ; 2 . 辽 宁 出人 境 检 验 检 疫 局 , 辽 宁 大连 1 1 6 0 0 1 ; 3 . 海 南 出入 境 检 验 检 疫 局 检 验 检 疫 技 术 中心 , 海南 海 口 5 7 0 1 2 5 ; 4 . 东 宁 出入 境 检 验 检 疫 局 , 黑龙江 东宁 1 5 7 2 9 9 )
HAN Zh e n g k u n , W EI Do n g x u , MA We i

番茄SlNBRP1基因的克隆及抗病性研究

番茄SlNBRP1基因的克隆及抗病性研究

番茄SlNBRP1基因的克隆及抗病性研究作物病害是限制农业生产的主要原因之一。

通常植物通过两种途径来抵御病害,分别是基础抗性(PTI)和基因对基因抗性(ETI),其中在ETI途径中发挥主要作用的就是抗性基因(R基因),它可以编码产生ETI系统中的免疫受体。

利用R基因培育抗性品种是防治作物病害最为直接、环保、有效的手段。

大多数的R基因都可以编码含有卷曲螺旋结构、核苷酸结合位点和富含亮氨基酸重复序列(CC-NBS-LRR)结构域的蛋白质。

番茄是全世界种植最为广泛的一种经济作物,在果蔬供应中占有至关重要的地位。

细菌性斑点病对番茄的生产构成了严重的威胁,深入研究细菌性斑点病的致病机理不仅为改良番茄育种提供了新的线索而且对提高番茄品质起到了重要的指导作用。

番茄中的DDB1作为CRL4泛素连结酶复合体的核心成分,通过靶向修饰不同底物蛋白的丰度和活性参与调控多种生物学功能,包括叶绿体发育、果实大小和抗病应答等。

前期的研究发现,番茄的DDB1功能缺失突变体hp1表现出对病原菌高敏感性。

为了进一步研究DDB1在番茄中的抗病功能,我们以DDB1为诱饵通过酵母双杂交筛选得到了一个番茄的抗性基因SlNBRP1。

通过基因表达模式分析和亚细胞定位实验我们得知SlNBRP1在番茄的根、茎、叶、花和果中均有表达,并且定位于细胞质中。

通过对SlNBRP1进行生物信息学分析得知它含有抗性蛋白高度保守的CC-NBS结构域。

通过免疫共沉淀和酵母双杂交实验进一步证实SlNBRP1与DDB1存在相互作用。

通过SlNBRP1的原生质体转化实验我们得知SlNBRP1是受CUL4-DDB1复合体的泛素化调控而降解的。

我们推测SlNBRP1可以与DDB1共同参与调控番茄的抗病免疫应答。

为了验证抗性蛋白SlNBRP1的功能,我们利用植物基因工程技术,构建植物表达载体pBI121-35S::SlNBRP1,通过农杆菌介导法,将SlNBRP1基因导入野生型番茄基因组中,得到转基因植株。

番茄脆皮突变体的基因克隆与功能研究

番茄脆皮突变体的基因克隆与功能研究

番茄脆皮突变体的基因克隆与功能研究
番茄是一种重要的蔬菜作物,富含多种营养物质,如维生素C、胡萝卜素等。

然而,在番茄的生产过程中,硬度不足容易导致损失,影响着番茄的品质和口感。

为了解决这个问题,研究人员在番茄品种中发现了脆皮突变体,这一突变体具有较高的硬度和耐储存能力,因此备受关注。

为了深入研究脆皮突变体的特性,研究人员开始探索其基因机制。

最新的研究表明,这一突变体的基因突变位于染色体7上,导致了一个新的基因,称为SlBGAMT1(soluble beta-galactosidase mitochondrial 1)。

通过对这一基因的克隆和功能研究,研究人员发现,SlBGAMT1参与了番茄果实的细胞壁代谢过程。

具体来说,它参与了果实细胞壁构建的过程,并影响了果实细胞壁中的多糖物质的合成和解聚。

这种调控作用最终导致了独特的果实硬度和贮存性能。

此外,研究人员还发现,SlBGAMT1对番茄植株的根系发育和吸收水分等方面也有一定的影响。

这些发现不仅为进一步改良番茄品种提供了新的思路,同时也对于理解番茄果实的生长发育及其细胞壁合成机制具有一定的意义。

对于进一步研究SlBGAMT1所参与的细胞壁代谢过程,研究人员正在尝试利用基因编辑技术对其进行删除或逆转录,以期验证其作用机制,并找到更好的方法来应对相关的问题。

总之,番茄脆皮突变体的基因克隆与功能研究为我们提供了新的思路和方法,有望为改良蔬菜品种、优化农业生产等方面带来实际的应用价值。

一种番茄斑萎病毒属病毒基因及其应用[发明专利]

一种番茄斑萎病毒属病毒基因及其应用[发明专利]

专利名称:一种番茄斑萎病毒属病毒基因及其应用专利类型:发明专利
发明人:董家红,郑宽瑜,张仲凯,吴阔,张丽珍
申请号:CN201710251104.3
申请日:20170418
公开号:CN106929520A
公开日:
20170707
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种番茄斑萎病毒属病毒即辣椒黄花环斑病毒基因序列(包括RNA或DNA分子)及其应用。

所述的病毒基因序列的碱基序列如SEQ ID NO:1所示,能够编码病毒的核壳体蛋白(N)及非结构蛋白(NSs);或所述的病毒基因序列的碱基序列如SEQ ID NO:2所示,能够编码病毒的运动蛋白(NSm)和糖蛋白(Gn或Gc);或所述的病毒基因序列的碱基序列如SEQ ID NO:3所示,能够编码病毒的复制酶(RdRp)。

应用为所述的病毒基因序列在制备检测辣椒黄花环斑病毒的检测试剂盒中的应用和所述的病毒基因序列在制备预防和/或治疗由辣椒黄花斑病毒引起的病害药物或试剂中的应用。

申请人:云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所
地址:650223 云南省昆明市学云路9号
国籍:CN
代理机构:昆明知道专利事务所(特殊普通合伙企业)
更多信息请下载全文后查看。

西红柿斑点枯萎病毒[发明专利]

西红柿斑点枯萎病毒[发明专利]

专利名称:西红柿斑点枯萎病毒专利类型:发明专利
发明人:D·贡萨维斯,S-Z·彭
申请号:CN94191418.6
申请日:19940127
公开号:CN1118983A
公开日:
19960320
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明描述了西红柿斑点枯萎病毒(TSWV)核蛋白壳的核苷酸序列,和含有TSMV分离株的核蛋白壳核苷酸序列的转基因植物表现出对不同血清型的Tospoviruses具有抗性。

另外,生产出含有源自莴苣的TSWV分离株核蛋白壳核苷酸序列的转基因植物,该植物(产生少量的核蛋白壳蛋白)表现出对同源和亲缘关系密切的病毒分离株的抗性;而当植物产生大量核蛋白壳蛋白时,该植物对同源分离株和亲缘关系远的无耐性坏死性斑点病毒(INSV)分离株具有适当水平的保护能力。

申请人:康乃尔研究基金会有限公司
地址:美国纽约州
国籍:US
代理机构:中国专利代理(香港)有限公司
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新疆加工番茄上南方番茄病毒外壳蛋白基因的克隆与原核表达

新疆加工番茄上南方番茄病毒外壳蛋白基因的克隆与原核表达

新疆加工番茄上南方番茄病毒外壳蛋白基因的克隆与原核表达张强;崔百明;郑银英;向本春【摘要】[目的]克隆南方番茄病毒(STV)的外壳蛋白(CP)基因,构建其原核表达载体并进行诱导表达,为制备检测该病毒的高效价血清提供参考.[方法]利用一步法RT-PCR从新疆加工番茄上克隆STV CP基因,将其连接到原核表达载体pET-28a(+)上,获得重组质粒pET-28a-STV CP.将重组质粒转化大肠杆菌BL21后用IPTG进行诱导表达.[结果]成功克隆了STV CP基因,其长度为1 134 bp.构建了原核重组表达质粒pET-28a-STV CP,其在1 mmol/L IPTG诱导下,成功表达出分子质量约47 ku 的蛋白.[结论]成功克隆了STV CP基因,并诱导了pET-28a-STV CP重组蛋白的原核表达.【期刊名称】《西北农林科技大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2015(043)004【总页数】5页(P118-122)【关键词】南方番茄病毒;外壳蛋白基因;原核表达【作者】张强;崔百明;郑银英;向本春【作者单位】石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室,新疆石河子832003;石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室,新疆石河子832003;石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室,新疆石河子832003;石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室,新疆石河子832003【正文语种】中文【中图分类】S432.41加工番茄属于普通番茄的一种类型,在新疆有“红色产业”之称。

近些年,随着种植面积的逐年加大,加工番茄已成为新疆经济的支柱性产业之一,也是新疆经济增长速度最快的产业之一[1-2]。

加工番茄由于枝繁叶茂、种植密度大、品种抗病能力不一、栽培时间长、连作和重茬地增多等因素,导致其病毒病日趋严重。

对加工番茄的病毒病进行调查发现,加工番茄病毒病类型主要有花叶型、蕨叶型、条斑型、巨芽型、卷叶型和黄顶型等。

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。据报道 , 该
[ 3 4]
病曾在美国花生上造成接 近 95% 的损失
[ 5]
, 在夏
。 1984 年, 在 我国南 方花 生病 害
, 而在 法国 和
调查时 发 现 由 番茄 斑 萎 病 毒 ( T SWV ) 引 起 新 病 害 [ 15] , 随后陆续在番 茄 ( 四川 ) 及甜菜 ( 内蒙古 ) 上
[ 19]
。由于其危害性严重 , 经济损失日益加大 ,
已被作为检疫性病害。近年来 , 随着西花蓟马在我 国部分地 区的 传播 扩散 [ 20 23] , 番茄 斑萎 病 毒的 发 生情况也备受人们关注。 2009 年作者从云南昆明 半开放型大棚 内的番 茄上采集了样本 , 且在采样棚内发现传毒介体 症状 , 本文对其 N 基因进行了克隆分析。 西 花蓟马, 该样品温室接种三生烟后表现典型的环斑
通过比较 GenBank 中 T SWV 核衣壳蛋白基因 序列, 用 DNAM AN ( V6. 0. 3. 40) 设计 T SWV 核衣 壳蛋白基因 ( N 基因 ) 全长序列引物 , 其引物序列为: 上 游 5 AT GT YT AAGGT T AAGCT CACT AAG 3 ; 下游 5 T T AAGCAAGYY CT GYGA GT T T T GCC 3 ( Y= C 或 T ) 。 1 . 2. 3 . 2 cDNA 合成 mo l/ L ) , 置 于 PCR 仪 中 95 缓 冲 液, 2 保温 取 9 L 提取的番茄斑萎病毒 RNA 加 1 L 上 游引 物 ( 20 5 m in, 然 后 迅 速放 到 冰 上, 1 ~ 2 m in, 加 混 合 物 ( 5 L 反转录酶 5 dNT Ps, 0. 2 25 L , 置于 42 L 2 m mol/ L 的 L 反 转 录 酶 ) , 加 灭 菌 ddH 2 O 至 下 45~ 60 min, 以此 为模板进行
Cloning and sequence analysis of the nucleoprotein genes of Tomato spotted wilt virus isolates from Yunnan
T ang Qianjun 1 , Sun Shue2, 3 , L iu Y o ng2, 3 , T an X inqiu2 , X ia o Q im ing1 , X ie Bing ya n4 , Z hang De yo ng 2, 3 410128, China ; ( 1. Co llege o f Bio sa fety Science and Techno lo gy , Huna n A gricultur al Univer sity , Cha ngsha 2. I nstitute o f Plant Pr otection , Huna n Aca demy o f Agricultura l Sciences, Cha ngsha 3. Lo ngping Branch of G r aduate Scho ol , Centr al South University , Changsha 4. I nstitute of Vegetables and Flo wers , Chinese Academ y of Agr icultura l Sciences, Beijing Abstract
[ 24]
萎病毒
。 2000 年 , 张仲凯等在研 究云南烟草 病
毒病原中发现 T SWV 在 云南烟区 广泛分布 , 主 要 引起斑块 状褪 绿、 黄化、 坏死 及灼 烧状 等症 状, 在 局部地区 可造 成 60% 以上 的 严重 损 失
[ 1 8]
。 2004
年, 丁铭在昆明地区栽培的马铃薯病株上分离鉴定 出含有番茄斑萎 病毒属番茄斑 萎病毒和花生环 斑 病毒
收稿日期 : 基金项目 : * 通信作者
[ 2]
,随
, 但番
茄斑萎病毒最早由 Samuel, Bald 和 P it tm an 于 1930 年首次正式 报道 [ 10] 。至 今 , 番茄 斑萎 病毒 病已 广 泛分布于世界各 地, 欧洲、 亚洲、 非洲、 美洲及大 洋 洲均有分 布
[ 1 1 14]
66 发现
[ 16]
2010 。1992 年 , 姚革在四川烟叶 上发现番茄 斑
[ 17]
用缓冲液接种植株作对照。 1 . 2. 1 . 2 番茄斑萎病毒的纯化 将带毒叶片用接种缓冲液研磨后采用摩擦汁液 接种的方法接种于鉴别寄主矮牵牛 ( P et unia hy bri da ) , 接种 2~ 4 d 后便出现局部褐色斑, 将单个的褐 色斑点剪下 , 用接种缓冲液研磨接种于三生烟 , 出现 系统症状后 , 再接种于矮牵牛, 经 3 次单斑纯化后接 种于三生烟上保存。 1 . 2. 2 植物总 RN A 的提取
[ 9] [ 8]
番茄
斑萎病毒 ( T omato sp otted w il t virus , T SWV) 命名 。T SWV 是 T osp ovi rus 属 中最重 要的一 种 病毒 , 侵染 82 科 900 多种单、 双子叶植 物, 广泛 分 布于世界各地 的温带、 亚热带及热带地 区, 对许 多 经济作物及庭院植物造成严重损失 威夷造成 50% ~ 90% 的 莴苣死 亡
410125, China ; 100081, China )
410125, China ;
Tom ato spotted wilt virus ( T SW V ) wa s detected via R T PCR fr om to mato w ith mo ttle sympto m co l
番茄斑萎病毒 ( T osp ov irus) 属于布尼亚病毒科 ( Bunuyaviridae) , 是 Bunyaviridae 中 唯 一一 个 侵 染 植物的属 , 属名由该属内银莲花产生毁灭性危害[ 6] 。 T SWV 以其广泛的寄主范围和造 成的巨大经济 损 失已被列为世界危害最大的十种植物病毒之一[ 7] 。 早在 1919 年 , 在澳大利亚首次发现了斑萎病 后 , 发现了斑萎 病的传毒 介体 西花 蓟马
1
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材料与方法
材料与试剂 材料采自云南省昆明, 在湖南省植物保护研究
所分子生物学实验室温室种植的三生烟上繁殖, 实 验所用 T aq 酶、 反转录 酶均购自 F erm ent as 公 司, pGEM T Vect or 购自 P romega 公司 , PCR 纯 化回 收试剂盒为上海生工公司产品, P CR 引物由上海生 工公司合成。抗生素 ( 氨苄青霉素) 购自上海生工公 司, 其他化学试剂均为国产分析纯试剂。大肠杆菌 ( E. col i) NM 522 菌株由湖南省植物保护研究所分 子生物学实验室保存。 1. 2 方法 番茄斑萎病毒的接种 1. 2. 1 番茄斑萎病毒的接种与纯化 1. 2. 1. 1 取样品病叶少许 , 放于研钵中。加入适量接种 缓冲液[ 0. 1 mo l/ L NaH 2 PO 4 / Na 2 H P O4 pH 7. 0; 质 量浓 度 2% Poly viny lpy rolidon; 质 量 浓 度 0. 2% Na2 SO 3 ] , 用 研 棒充 分 研 磨。用 喷 粉 器将 金 刚 砂 ( 200~ 400 筛目) 撒至待接种的叶表面 ( 也可直接将 金刚砂加在研磨液中 ) , 用铅笔在接种叶上打点做标 记, 并在瓦钵内插上标签 , 注明时间及处理。用手指 或棉球、 纱布和研棒蘸取少许汁液, 在待接种植株的 叶面上从叶基到叶尖方向轻轻地、 均匀地涂擦 , 涂擦 前用肥皂洗净手指, 涂擦时用另一只手托住叶片, 涂 擦后用清水冲洗接种过的叶片 , 将植株于温室 ( 22~ 25 ) , 光照周期 L D= 16 h 8 h 条件下 培养。
取叶片组织每 0. 3 g 加 3 mL GB 溶液研磨, 取 500 L 研磨液加入 100 L 10% 的月桂酰醇 ( NL S) , 置于 70 , 10 min( 不时摇动 ) , 冰浴 5 min, 室温下 13 000 g 离心 10 min, 取 300 L 上清, 加 150 L 无水 乙醇, 300 L NaI 溶液, 25 L 硅溶液( 2 mol/ L SiO2 , pH2. 0) , 混匀( 硅溶液要充分混溶后再加) , 置于室温 10 min, 不停摇动, 室温下 6 000 g 离心1 min, 弃上清, 加 WB 溶液洗涤 2 次, 室温下 6 000 g 离心 1 min, 弃 上清, 沉淀加 150 L 灭菌 ddH 2 O, 置于 70 温下 13 000 g 离心10 min, 取上清 , - 20 1 . 2. 3 1 . 2. 3 . 1 RT PCR 的引物设计 反转录 聚合酶链式反应( RT P CR) 4 min, 室 保存备用。
lecte d f ro m Y unnan. T he N g ene, encoding nucleo pr o tein, w as cloned a nd sequenced. Sequence and analysis re sults indicated that the N g ene wa s 777 bp in length and encoded 258 a mino acids. Se quence analyse s sho wed N gene share d 99% and 97% nucleo tide identities w ith the isolates fr o m South K or ea and T aiw an, re spectiv ely. In amino a cid le vels, the sequence ide ntity was 99% and 98% , re spe ctiv ely. Ke y words T oma to spot ted wilt vir us ; nucleo pr o tein; clo ne
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