PRDM16基因启动子区甲基化与超重肥胖发生风险的关联研究(新)
组蛋白甲基化与脂肪生成
组蛋白甲基化与脂肪形成摘要最近的研究表明，在脂肪形成过程中，很多基因的表达受到表观遗传的调控。
组蛋白甲基化是一种重要的表观遗传学修饰，人们对其已经进行了深入的研究。
组蛋白甲基化可以通过调控脂肪细胞分化过程中转录因子及脂肪组织特异性基因的表达，从而调控脂肪组织的形成。
该文综述了脂肪形成过程中组蛋白甲基化及去甲基化表观调控的最新进展，探讨了脂肪组织组蛋白甲基化的研究趋势和未来发展方向。
关键词组蛋白甲基化；脂肪形成；基因表达；组蛋白甲基转移酶；组蛋白去甲基化酶随着经济的不断发展，肥胖已经成为全球性的公共健康问题，Ⅱ型糖尿病的发生占所有糖尿病的90%-95%，肥胖是Ⅱ型糖尿病的首要危险因素；肥胖还能增加某些类型癌症的发病风险，包括乳腺癌、肾癌、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、肝癌、大肠癌、黑色素瘤等(1)；最近有研究表明肥胖可加速人类肝脏的衰老(2)。
研究脂肪形成的分子机制将为治疗与糖尿病密切相关的肥胖和脂代谢障碍疾病等提供重要理论依据。
组蛋白甲基化可以通过调控脂肪细胞分化过程中转录因子及脂肪组织特异性基因的表达，从而在脂肪形成过程中发挥着重要作用。
1 组蛋白甲基化组蛋白甲基化作为一种重要的表观遗传学修饰方式，与基因转录调控、异染色质的形成、X染色体失活，基因组印记等密切相关。
(3)组蛋白甲基化的异常与多种人类疾病如肿瘤的发生等相关(4)。
与乙酰化不同，组蛋白甲基化对基因表达调控的作用可以完全相反，有时促进基因表达，有时却抑制基因表达，调控作用取决于甲基化的位点和甲基化的程度。
如H3K4甲基化与基因激活有关，而H3K9和H3K27甲基化与基因沉默相关(3, 5)。
组蛋白的甲基化修饰是由一类含有SET结构域、被称为组蛋白甲基转移酶（HMTs）的蛋白质来催化的。
SET结构域由最早发现表达这三个结构域的3个基因来命名，分别为Su(var)3−9, Enhancer of zeste (E(z))和trithorax (trx)(6)。
PRDM家族蛋白结构与功能研究进展
PRDM家族蛋白结构与功能研究进展赵生军;张勇;阎萍;郭宪【摘要】PRDM家族蛋白是具有一个PR结构域和数量不等锌指结构(除了PRDM11),广泛存在于灵长类、啮齿动物、鸟类和两栖动物中能够调控表观遗传的蛋白.部分PRDM蛋白家族成员的PR结构域具有组蛋白赖氨酸转移酶活性(HMT),影响表观遗传,PRDM蛋白锌指结构具有DNA、RNA、蛋白识别结合能力;另一部分PRDM家族成员虽然具有PR结构域,但不具有HMT活性,在癌症发生、原始生殖细胞特化、神经系统发育、造血、血管发展、胚胎发育中发挥重要作用.PRDM 家族蛋白通过甲基转移或募集染色体结构重塑复合物,调控基因表达和修改染色体结构,在细胞特化和疾病调控中起到重要作用.论文综述了PRDM家族蛋白结构与功能最新研究进展.【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2016(043)005【总页数】6页(P1188-1193)【关键词】PRDM家族蛋白;表观遗传;PR结构域;锌指结构;组蛋白赖氨酸转移酶活性【作者】赵生军;张勇;阎萍;郭宪【作者单位】中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州730050;甘肃农业大学动物医学院,兰州730070;甘肃农业大学动物医学院,兰州730070;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州730050;中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育工程重点实验室,兰州730050【正文语种】中文【中图分类】Q51PRDM家族蛋白其肽链N末端有一个保守的PR结构域(PR domain)，以及有重复数量不等的C2H2型锌指蛋白结构(zinc finger)，但PRDM11无锌指结构[1]。
Fumasoni等[2]检测到PRDM家族在灵长类中有17个成员，在啮齿动物、鸟类和两栖动物中有16个成员，在真菌与植物中没有检测到PRDM。
17个成员具有异同点[3]，可以通过不同剪接或启动形成不同的分子结构。
肠道微生物群落结构与慢性代谢性疾病风险关联性分析
肠道微生物群落结构与慢性代谢性疾病风险关联性分析引言肠道微生物群落结构是指人体肠道内寄生的各类微生物的类型、数量和相互关系。
近年来，越来越多的研究表明，肠道微生物群落结构与慢性代谢性疾病之间存在密切的关联。
本文旨在分析肠道微生物群落结构与多种常见的慢性代谢性疾病之间的关联，探讨其潜在的机制。
肠道微生物群落结构与肥胖相关性肥胖是当今社会普遍存在的一个问题，与许多慢性代谢性疾病密切相关。
研究发现，肥胖个体与非肥胖个体的肠道微生物群落结构有明显差异。
相比非肥胖人群，肥胖人群的肠道微生物群落中富含某些菌种，如 Firmicutes 和 Actinobacteria，而另一些菌种，如 Bacteroidetes 和Verrucomicrobia，则相对减少。
此外，肠道微生物的丰度与肥胖程度呈正相关关系。
这些研究结果提示肠道微生物群落结构与肥胖之间存在密切关联。
径向菌群与2型糖尿病关系研究2型糖尿病是一种严重的慢性代谢性疾病，与肠道微生物群落结构也有关联。
研究表明，肠道中的某些细菌群，如增殖型径向菌群（Eubacterium rectale 和 Roseburia），能够产生丙酸。
丙酸在体内具有调节血糖和能量代谢的作用。
据统计，患有2型糖尿病的个体肠道中径向菌群的数量较少。
这一研究结果表明，径向菌群与2型糖尿病之间可能存在一定的关系。
肠道微生物与非酒精性脂肪肝的关联性非酒精性脂肪肝是一种常见的慢性代谢性疾病，其与肠道微生物群落结构之间的关联也越来越受到关注。
研究发现，肠道中的某些细菌菌株，如克雷伯氏菌（Klebsiella），能够转化胆汁酸并增加肝脏脂肪沉积。
此外，一些菌种如肠球菌（Fusobacterium）和链球菌（Streptococcus）的过度生长会导致机体内炎症反应并加重脂肪肝的发展。
这些研究结果表明，肠道微生物群落结构与非酒精性脂肪肝之间存在一定的关联性。
肠道微生物与肠易激综合征关系探究肠易激综合征是一种常见的肠道疾病，其病因复杂，与肠道微生物群落结构的关系也备受关注。
PRNs 基因家族研究进展
生物技术进展2022年第12卷第3期325~331Current BiotechnologyISSN 2095‑2341进展评述ReviewsPRNs 基因家族研究进展樊锦瑞，王磊，邹俊杰*中国农业科学院生物技术研究所，北京100081摘要：Pirins （简称PRNs 、PIRs ）是含有Cupin 结构域的基因家族，属于功能各异的Cupin 超家族成员之一。
PRN 蛋白的N 端结构域含有金属离子结合位点，在原核和真核生物中高度保守。
人hPRN 可作为转录因子辅因子和氧化还原感受器参与癌症发生过程，是癌症治疗的潜在靶点。
植物PRNs 基因家族一般含有多个成员，其生物学功能尚未得到深入研究。
概述了PRNs 蛋白的基本结构及其生化特征，并综述了PRNs 在人、微生物和植物中的生物学功能，以期为进一步解析水稻等作物中PRNs 的功能提供一定线索，并为基因编辑等生物育种技术改良作物提供新的靶点。
关键词：PRNs 基因家族；金属离子；转录因子辅因子；氧化还原感受器；靶点DOI ：10.19586/j.2095⁃2341.2021.190中图分类号：Q501文献标志码：AResearch Progress on PRNs Gene FamilyFAN Jinrui ，WANG Lei ，ZOU Junjie *Biotechnology Research Institute ，Chinese Academy of Agricultural Sciences ，Beijing 100081，ChinaAbstract ：Pirins （PRNs ，PIRs ）are gene family containing cupin domain and belong to the functionally diversity cupin superfamily.The N -terminal domain of PRN contains a metal -ion binding site ，which is highly conserved in prokaryotes and eukaryotes.Human hPRN could participate in cancer development as transcriptional regulator and redox sensor ，suggesting that hPRN is a potential therapeutic target.In plants ，there are several members in PRNs gene family ，whereas their biological func‐tions remain largely unknown.This paper outlined the basic structure and biochemical characteristic of PRNs ，and reviewed the biological research progresses in human ，microorganism and plants ，in order to provide clues to clarify the PRNs molecular mechanism of crop such as rice ，and provide target genes for the genetic improvement of crops production or adapation by gene editing and other molecular breeding techniques.Key words ：PRNs gene family ；metal ions ；transcriptional regulator ；redox sensor ；targetPirin （PRN 、PIR ）蛋白在人类中最初是通过酵母双杂交筛选发现的，其与转录因子NFI/CTF1（nuclear factor I/CCAAT box transcription factor ）相互作用，发挥相关功能［1］。
宫颈癌p16基因甲基化及表达的研究_原继荣
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遗 传 HEREDITAS (Beij ing)2005 27 卷
期发现有癌变倾向的细胞 , 还可作为分子指标 , 预测 对化疗的反应和判定预后等[ 4] 。 p 16 基因的研究已 成为当前肿瘤分子生物学和分子遗传学研究的热点 之一 。
本研究表明 , p 16 的失活存在于多种人类恶性 肿瘤 , 然而探讨宫颈癌发生过程中 p 16 基因异常表 达及其 5′CpG岛的甲基化状态的研究较少 , 特别是 综合分析 p 16 基因异常表达与病理类型 、临床分期 关系的研究更少见 , 对这些变化过程及相互作用的 了解仍不完善 。
取 2 μg 模板 DNA 蒸馏水定容至 50 μL , 加入新 配置 2 mol/ L 的 NaOH 液 5 .5 μL(使终浓度为 0 .3 mol/ L), 置 于 37 ℃孵 育 20 min 。 加 入 30 μL 10 mmol/ L 氢醌(Sigma), 见溶液呈黄色 。 加入 520 μL 新配制的 3 mol/ L 亚硫酸氢钠(Sigma S-8890)。 充 分混匀 后 , 离心 , 上盖矿物油 。 50 ℃孵育 16 h 。 次 日 , 经修饰的 DNA 用 Wizard DNA Clean-Up System (Promega A7280)纯化 。 纯化后的 DNA 于 4 ℃或 20 ℃保 存 。 在每离心 管中加入 5 .5 μL 的 3 mol/ L NaOH, 室温孵育 15 min 。加入 10 mol/ L 醋酸氨 33 μL 中和后 , 加入 3 体积的乙醇沉淀 DNA(-20 ℃过 夜 , 摇匀 30 min), 用 70 %乙醇洗涤 , 干燥后 , 用 20
Abst ract :To detect hypermethylation and aberrant expression of the p16 gene in cervical carcinoma (CC), methylation-specific PCR(MSP)was used to determine the methylation status of 5′CpG islands of the p16 gene, loss or decrease of p 16 expression was analyzed by immunohistochemistry (IHC), and homozygous deletion of exon 1 (E1)and/ or exon 2 (E2)was determined by PCR in 60 cases of CC at different pathological grades and clinical stages.The results showed absence of methylation and presence of normal expression of the p 16 gene in the control and adjacent tissues of CC.Hypermethylation, loss or decrease of expression and deletion of the p 16 gene were detected in 21.67 % (13/ 60), 51.67 %(31/ 60)and 15 .00%(9/ 60)of the tumor tissues, respectively.The rate of p16 expression markedly reduced with the increase of clinical stages.Our data suggested that inactivation of the p 16 gene was a frequent event and positively correlated with pathological grades in CC, and that methylation of the p 16 gene was an important event in carcinogenesis of CC. Key words :cervical carcinoma ;p16 gene expression ;methylation
DNA甲基化_去甲基化与癌症
收稿日期：2012-10-04第一作者：周建生(1988-)，男，硕士生，E-mail: zhoujiansheng0902@ *通信作者：焦炳华(1962-)，男，博士，教授， E-mail: jiaobh@DNA 甲基化/去甲基化与癌症周建生，杨生生，缪明永，焦炳华*(第二军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室，上海 200433)摘要：DNA 甲基化是真核细胞基因组中常见的可遗传的表观遗传修饰，在调节细胞增殖、分化、个体发育等方面起重要作用，并且DNA 甲基化水平异常与肿瘤的发生发展密切相关。
DNA 甲基化及被动去甲基化主要是在DNA 甲基转移酶家族参与下完成的，而DNA 的主动去甲基化机制尚不是很明确。
在肿瘤细胞中DNA 的整体甲基化水平显著降低，但抑癌基因的启动子区域却出现高甲基化。
目前尽管有DNA 去甲基化药物用于癌症的临床治疗，但药物特异性较差，因而研究特定基因的主动去甲基化机制有助于研发特异性高的药物用于癌症的治疗。
关键词：DNA 甲基化；DNA 去甲基化；癌症；表观遗传治疗Relationship between DNA methylation/demethylation and cancerZHOU Jiansheng, YANG Shengsheng, MIAO Mingyong, JIAO Binghua *(Department of Biochemistry and Molecular Biology, College of Basic Medical Sciences, the Second Military Medical University,Shanghai 200433, China)Abstract: DNA methylation, the most common heritable epigenetic marker of eukaryote genome, plays acritical role in cell proliferation, differentiation, and development. Aberrant DNA methylation is correlated with the onset and progression of cancer. It is well accepted that DNA methylation and DNA passive demethylation are mainly catalyzed by the family of DNA methyltransferases. However, the mechanism of DNA active demethylation is unclear. In cancer cells, the global genomic levels of DNA methylation are lower, but the promoter methylation levels of tumor suppressor genes are higher than in normal tissues. Several demethylating agents have been applied for the clinical treatment of cancer, but these agents are lack of specificity for target genes. So studying the mechanism of active demethylation of specific genes avails the research and development of high-specificity agents for the treatment of cancer.Key words: DNA methylation; DNA demethylation; cancer; epigenetic therapy表观遗传的概念最初是由Conrad Hal Waddington 于1942年提出的，他认为基因型通过一些偶然的、不确定的机制决定了不同的表现型[1]；1987年Holliday 将这一表观遗传概念用于DNA 甲基化水平改变引起基因表达活性改变现象[2]；现代表观遗传是指在基因的DNA 序列不发生改变的情况下，基因的表达水平与功能发生改变，并产生可以遗传的表型。
胰腺癌组织中p16基因启动子区5‘CpG岛甲基化及其表达研究
胰腺癌组织中p16基因启动子区5‘CpG岛甲基化及其表达
研究
刘枫;李兆申;等
【期刊名称】《胃肠病学》
【年(卷),期】2002(7)B11
【总页数】2页(P31-32)
【作者】刘枫;李兆申;等
【作者单位】第二军医大学长海医院消化内科;第二军医大学胰腺疾病研究所200433
【正文语种】中文
【中图分类】R735.9
【相关文献】
1.胰腺癌组织RUNX3基因启动子区CpG岛甲基化研究 [J], 郭志刚;郭卫东;杨帆
2.子宫内膜癌组织中FHIT基因启动子区域CpG岛甲基化状况的研究 [J], 朱介之;王波;洪凡真
3.甲状腺乳头状癌组织中NIS和RASSF1A基因启动子区CpG岛甲基化状态的研究 [J], 唐建东;栗夏莲
4.胰液中p16基因启动子区5′CpG岛甲基化改变及其意义 [J], 刘枫;李兆申;许国铭;孙振兴;邹多武;满晓华;方琳
5.上皮性卵巢癌组织中WWOX基因启动子区域CpG岛的甲基化状态及临床意义[J], 闫洪超;孙洁芸;陆晓媛;韩秋峪;魏敏
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肠道菌群与糖尿病、肥胖ppt课件
3500+种
9个
1:1
100倍
人体细菌种类
细菌菌门
细菌数/人体细胞数 细菌基因数/人体基因数
• 体内细菌/自身细胞比例约为1:1*， • 人体中微生物有1/3具有普遍性，而2/3具有特异性。
人与肠道菌群休戚与共的一生
“无菌 体”
顺产 剖宫产 母乳喂养 奶粉喂养
转换到固 体食物
微生物丰 度↑
性别特异 性的微生 物群落
革兰氏阴性严格厌氧菌 肠道菌群中占比约10%-48% 参与多糖代谢、胆汁酸和类固醇代
谢 其中多形拟杆菌、卵形拟杆菌可降
解人体不能降解的多糖，向宿主提 供其中10-15%的能量
变形菌门（Proteobacteria）
兼性厌氧菌 生理情况下肠道菌群中占比＜
1% 多数变形菌均属于致病菌，如常
中草药及功能食品的潜在益生作用
Frontiers in Microbiology.DOI: 10.3389/fmicb.2017.02146
槲皮素+白藜芦醇 调节大鼠肠道菌群
槲皮素与白藜芦 醇（CQR）调节 肠道菌群组成， 相比于HFD组， 显著减低毛螺菌 科等与肥胖相关 的菌科的丰度， 增加Akk菌等与缓 解肥胖相关的菌 科/菌属的丰度。
尼古丁对肠道菌群的影响
尼古丁干预的雄性小鼠中，细菌碳水化合物代谢途径的差异性改变与较低的体重增加一致； 氧化应激反应和DNA修复基因也在这些小鼠肠道菌群中特异性富集在雌性和雄性小鼠中，尼 古丁造成的肠道菌群组成变化存在差异
Chemical Research in Toxicology. DOI:10.1021/acs.chemrestox.7b00162
• 膳食纤维和不饱和脂肪酸 与高水平的有益菌相关
《CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰对胰腺癌细胞的作用研究》范文
《CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰对胰腺癌细胞的作用研究》篇一一、引言近年来，胰腺癌作为全球范围内的高致死性癌症之一，其发病机制和治疗手段一直是研究的热点。
随着分子生物学和表观遗传学研究的深入，DNA甲基化修饰作为基因表达调控的重要机制之一，其在胰腺癌发展过程中的作用日益凸显。
CDH1基因作为一种在多种癌症中发挥重要作用的基因，其启动子区的DNA甲基化修饰与胰腺癌细胞的生物学行为密切相关。
本研究旨在探讨CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰对胰腺癌细胞的作用，为胰腺癌的诊断和治疗提供新的思路和方向。
二、材料与方法1. 材料实验所使用的胰腺癌细胞株、正常胰腺细胞株、相关试剂等均经过严格筛选和验证，确保实验的准确性和可靠性。
2. 方法（1）采用PCR技术扩增CDH1基因启动子区序列；（2）利用亚硫酸氢盐测序PCR（BSP-PCR）技术检测CDH1基因启动子区DNA甲基化水平；（3）通过细胞培养、转染等技术，构建胰腺癌细胞模型；（4）采用实时荧光定量PCR、Western blot等方法检测基因表达水平；（5）利用统计学方法分析数据，探讨CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰与胰腺癌细胞生物学行为的关系。
三、结果1. CDH1基因启动子区DNA甲基化水平在胰腺癌细胞中显著高于正常胰腺细胞；2. CDH1基因表达水平与DNA甲基化水平呈负相关，即DNA甲基化程度越高，CDH1基因表达水平越低；3. 通过体外实验发现，降低CDH1基因启动子区DNA甲基化水平可以显著促进胰腺癌细胞的增殖、迁移和侵袭能力；4. 在动物实验中，通过干预CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰，可以影响胰腺癌的生长和转移；5. 统计分析显示，CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰与胰腺癌患者的预后密切相关。
四、讨论本研究表明，CDH1基因启动子区DNA甲基化修饰在胰腺癌的发生、发展过程中起着重要作用。
DNA甲基化程度的增加可以抑制CDH1基因的表达，进而影响胰腺癌细胞的生物学行为。
PR结构域蛋白16结构及功能的研究进展
PR结构域蛋白16结构及功能的研究进展
谌倩芸杨芝春
【期刊名称】《临床与病理杂志》
【年(卷),期】2017(037)004
【摘要】PR结构域蛋白16（PR domain-containing 16,PRDM16）（PRD1-BF-1-RIZ1结构域同源蛋白16）是PRDM基因家族成员之一,除了参与白血病发病过程,还与发育异常相关。
此外,PRDM16还参与多种干细胞（如神经干细胞、造血干细胞）的分化调控。
大量文献研究表明PRDM16是调控棕色脂肪（brown adipose tissue,BAT）形成的开关基因。
【总页数】8页(P841-848)
【作者】谌倩芸杨芝春
【作者单位】中南大学湘雅药学院药理学系,长沙410078
【正文语种】中文
【中图分类】R373.21
【相关文献】
1.PR结构域蛋白16结构及功能的研究进展 [J], 谌倩芸
2.三结构域蛋白（TRIM）家族结构及功能的研究进展 [J], 陈艳清;曹树辉;李传友;
3.含RIZ1 PR结构域融合蛋白的原核表达、提纯与功能分析 [J], 余卫平;方娟娟;DONG Wei-feng;Ron Geyer
4.胰岛素受体底物PH结构域相互作用蛋白结构和功能研究进展 [J], 张巍;杜丽;王
凤阳;祁超
5.癌基因DEPDC1B及其编码蛋白功能结构域DEP的研究进展 [J], 何雪铼
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肥胖研究新进展PPT课件
• 预计到2030年,美国42%的人口将存在肥胖 问题。将超出美国现在人口3000万。与此 相关的医疗成本增加将达近5500亿美元。 这也是世界面临的问题！尤其是儿童现象 越来越严重
一、肥胖现象
BMI是国际上衡量人体胖瘦程度以及是否健 康的一个常用指标，其计算方法是体重 （千克）除以身高（米）的平方。正常值 在20至25之间，超过25为超重，30以上则 属肥胖。 不过美国人发现这一方法不正确，他们发明 了一种新方法！
• 这一方法比较危险，理论上支持，目前还 没有在儿童身上做过实验
《细胞—代谢》：再生棕色脂肪 细胞可治疗肥胖
• 美国科学家近日发现能促使棕色脂肪细胞 （一种具高代谢率的脂肪细胞）产生的分 子开关，这一结果为人类肥胖症的治疗及 预防带来了希望
在成人体内，存在着两种不同的脂肪细胞，一种是白色脂肪 细胞，它构成了绝大多数的脂肪组织，并贮存着过剩的能 量。另外一种脂肪细胞——棕色脂肪细胞则相反，它并不 贮存能量，而是具有高代谢率并可将能量“燃烧”殆尽。 婴儿因为需要保持身体温暖，所以其身体的脂肪细胞大多 数都是棕色脂肪细胞，但是过了婴儿期之后，棕色脂肪细 胞基本上就全消失了。 该项研究的领导者、美国波士顿Dana-Farber肿瘤研究所的 Bruce Spiegelman教授的研究小组发现，小鼠体内的棕 色脂肪细胞内含有大量名为PRDM16的蛋白，该蛋白在白 色脂肪细胞及其它细胞内却很罕见。研究人员利用基因技 术令正在生长中的小鼠脂肪细胞表达PRDM16，结果发现， 这些细胞变成了棕色脂肪细胞。而当他们把表达PRDM16 所需基因从棕色脂肪细胞中移走后，棕色脂肪细胞则不再 具有高代谢率。
• 治疗肥胖不要盲目的节食，因 为有研究表明长时间摄入低热 量视为会导致人机能受损，代 谢功能紊乱，严重损害身体健 康！ • 运动锻炼是最健康有效的方法！
原发性肝细胞癌中p16、p15基因启动子区甲基化状态检测
原发性肝细胞癌中p16、p15基因启动子区甲基化状态检测徐静;李旭;高人焘;徐修才;翟志敏;马金良;叶书来【期刊名称】《安徽医科大学学报》【年(卷),期】2006(41)4【摘要】目的研究原发性肝细胞癌中p16、p15基因启动子区甲基化状态及其与原发性肝细胞癌发生发展的关系.方法用特异性甲基化PCR(MSP)法检测30例原发性肝细胞癌肿瘤组织和5例正常肝脏组织中p16、p15基因启动子区甲基化状态,并进行统计分析.结果 30例原发性肝细胞癌肿瘤组织中p16和p15基因启动子区分别有53.3%(16/30,P＜0.05)和46.7%(14/30,P＞0.05)甲基化,5例正常组织中未发现甲基化.两基因甲基化与原发性肝细胞癌临床病理及HBsAg之间无明显相关性(P＞0.05),两者在原发性肝细胞癌发生中有协同性(相关性和一致性).结论 p16、p15基因启动子区异常甲基化在原发性肝细胞癌中发生频率很高,可能对肝细胞癌发生发展起重要作用.【总页数】4页(P365-368)【作者】徐静;李旭;高人焘;徐修才;翟志敏;马金良;叶书来【作者单位】安徽医科大学第一附属医院感染病科,合肥,230022;安徽医科大学附属省立医院感染病科,合肥,230001;安徽医科大学第一附属医院感染病科,合肥,230022;安徽医科大学附属省立医院感染病科,合肥,230001;安徽医科大学附属省立医院中心实验室,合肥,230001;安徽医科大学附属省立医院中心实验室,合肥,230001;安徽医科大学附属省立医院普外科,合肥,230001;安徽医科大学附属省立医院输血科,合肥,230001【正文语种】中文【中图分类】R735.7;R394.2【相关文献】1.原发胃癌中p15基因异常及启动子区甲基化状态 [J], 杨宇霞;孔祥东;张思仲2.大肠癌组织中p16、Rb及p27基因启动子区甲基化状态检测 [J], 原志庆;崔静;千新来;贺国洋;郑丽丽3.HPV16 E7蛋白阳性和阴性乳癌组织中P16蛋白与p16基因启动子区甲基化检测 [J], 李新娟;张洁;贺国洋;赵杰;常海敏;千新来;崔静;朱慧芳;韩芳毅;杨慧林;王霞;冶亚平;李新强;马帅4.食管鳞状细胞癌组织 P16基因启动子区CpG 单位甲基化状态检测及意义 [J], 刘芳;康雪;刘晓燕;张宁;齐翠花;黎永军;郑勇;陈卫刚5.多发性骨髓瘤p15、p16基因启动子区甲基化的研究 [J], 傅卫军;高勇;侯健;王东星;丁思奇;陈秋生因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
棕色脂肪产热相关基因
棕色脂肪产热相关基因棕色脂肪是一种能够产生热量的特殊脂肪组织，与体温调节和能量代谢密切相关。
近年来，科学家们发现了与棕色脂肪产热相关的一些基因，这些基因的发现为我们进一步了解棕色脂肪的功能和调控机制提供了重要线索。
一、UCP1基因UCP1 (uncoupling protein 1)基因是棕色脂肪燃烧热量的关键基因。
它编码的蛋白质UCP1是棕色脂肪细胞内的一种离子通道，能够将线粒体内的化学能转化为热能。
UCP1基因的表达水平高，能够促进棕色脂肪的产热功能，从而增加能量消耗。
二、PRDM16基因PRDM16 (PR domain containing 16)基因是另一个与棕色脂肪产热相关的基因。
研究发现，PRDM16基因的表达水平在棕色脂肪中高度表达。
PRDM16蛋白质能够调控棕色脂肪的发育和分化，并与UCP1基因协同作用，增加棕色脂肪的产热能力。
三、ZFP516基因ZFP516 (zinc finger protein 516)基因是近年来新发现的与棕色脂肪产热相关的基因。
研究表明，ZFP516基因在棕色脂肪细胞中高度表达，其缺失会导致棕色脂肪功能丧失。
ZFP516蛋白质能够与其他转录因子相互作用，调控棕色脂肪基因的表达，从而影响棕色脂肪的产热能力。
四、CREB-PGC1α信号通路CREB (cAMP response element-binding protein)和PGC1α (peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha)是两个重要的转录因子，参与调控棕色脂肪产热。
研究发现，CREB能够促进UCP1和PRDM16基因的表达，而PGC1α能够增强CREB的转录活性。
这个信号通路的活化能够促进棕色脂肪的产热功能。
五、其他基因除了上述几个基因外，还有许多其他与棕色脂肪产热相关的基因被科学家们发现。
例如，IRX3、IRX5和LHX8等基因的表达与棕色脂肪的发育和功能密切相关。
PRDM16——控制BAT和WAT发育的分子开关
指 的外侧 （ ３ａ ￣２ ５ａ ） 有一个 Ｐ ８ ａ １ ａ 含 Ｒ结构域 （ 因 该
和 棕 色 脂 肪 组 织 （ ｒｗｎ ａ ｉｏ ｅ ｔ ｓ ｅ Ｂ ｂ ｏ ｄｐ ｓ ｉ ｕ ， ＡＴ） ｓ 。
２ Ｐ Ｍ １ 对 棕 色 脂 肪 细 胞 分 化 的 作 用 及 ＲＤ ６ 其 分 子 机 制
２ １ 棕 色 脂 肪 组 织 和 白色 脂 肪 组 织 ．
主要对 Ｐ Ｍ１ ＲＤ ６的结构 、 能 以及 其 作用 的分 子机 功
制 等进 行 了概 括介 绍 。
哺乳 动 物 体 内 的 两 类 脂 肪 细 胞 存 在 很 大 的差 异 ， 色脂肪 细胞 内分 布着 很 多小脂 滴 ， 棕 呈现 “ 多室 ”
胞 较 白色脂 肪 细胞 含 有 更 多 的线 粒 体 ， 并且 位 于 线
粒体 内膜上 的解 偶联 蛋 白一 ｕ ｃ ｕ ｌ ｇｐｏｅ ， １（ ｎ ｏ ｐｉ ｒｔｉ ｌ ｎ ｎ
收 稿 日期 ： ０ ９ ０ — ｌ ２ ０ —３ ３
基 金 项 目： 家理 科 人 才培 养基 金 资助 （０ ３ ６ ９ 国 Ｊ７０４） 作者简介 ： 艳（ ９ ６ 。 ． 南南阳人 ， 士研 究生， 张 １８ 一） 女 河 硕 主要从事动物脂肪代谢分子机理研 究。 ＊通讯作者
脂 肪 细胞 分化 相 关 的核 因子 ， 中 Ｐ —ａ在 Ｂ 其 ＧＣ ｌ ＡＴ 中的 表达 量 较 ＷＡＴ 中高 很 多 ， Ｐ —ａ能 介 导 但 ＧＣ ｌ
提高Ｌ ， 明在 白色 脂肪 位点 中 ， ８表 ］ 生理水 平 或低 于 生 理 水 平的 Ｐ Ｄ １ Ｒ Ｍ ６可 以促 进 棕色 脂肪 细胞 的形成 。 此 外 ， 于棕 色 脂 肪 细 胞 和 白色 脂 肪 细 胞 的起 关 源问题 ， 乎所 有 先 前 的研 究 均 表 明两 者 共 同起 源 几 于一 种 脂 生 成 的 前 体 细 胞 ［ ¨ 。鉴 于 Ｐ ＤＭ１ １ Ｒ ６ 具 有启 动棕 色 脂 肪 细 胞 特 异 基 因 表 达 程 序 的能 力 ，
胃癌p16基因启动子CpG岛甲基化研究的开题报告
胃癌p16基因启动子CpG岛甲基化研究的开题报告
开题报告：胃癌p16基因启动子CpG岛甲基化研究
背景和研究意义：胃癌是发病率和死亡率较高的一种恶性肿瘤，其
发病机制尚不完全清楚。
研究表明，肿瘤发生和发展与遗传和环境因素
的相互作用有关。
甲基化作为一种重要的表观遗传修饰方式，与肿瘤发
生和发展密切相关。
p16基因是一个重要的抑癌基因，当其启动子区域的CpG岛甲基化程度增加时，会导致p16基因的表达下调，从而促进肿瘤
的形成。
因此，研究胃癌p16基因启动子CpG岛甲基化状况对于了解胃
癌发生机制，寻找预防和治疗策略具有重要意义。
研究内容和方法：本研究将采用病例对照的方法，收集胃癌患者和
健康人群的组织样本，通过甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）、双重甲基化特异性聚合酶链反应（MSSCP）和双下标免疫组织化学方法检测胃
癌p16基因启动子CpG岛的甲基化水平，同时对样本的临床病理资料进
行统计分析。
预期结果：本研究预计能够明确胃癌p16基因启动子CpG岛的甲基化状况和其与胃癌的关系，为阐明胃癌的发病机制提供新思路和新证据。
同时，本研究的结果可能对于胃癌的预防和治疗策略的制定具有指导意义。
研究意义和贡献：本研究通过对胃癌p16基因启动子CpG岛甲基化状况与胃癌的关系进行深入研究，有望为胃癌的预防和治疗提供新思路
和新方向，具有一定的临床应用价值和社会贡献。
【高中生物】北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制
【高中生物】北京基因组所揭示RNA甲基化调控基因剪接机制ythdc1调控mrna选择性剪接中国科学院北京基因组研究所精准基因组医学重点实验室及遗传与发育协同创新中心杨运桂课题组在研究m6a甲基化修饰调节mrna选择性剪接规律过程中，发现了读码器ythdc1通过招募前体mrna剪接因子srsf3同时抑制剪接因子srsf10与rna的结合，促进外显子被保留的分子机制。
该研究结果于2月在molecularcell杂志在线发表。
研究团队通过串联和亲和结晶的方法甄选ythdc1的互并作蛋白，辨认出与其相互作用的两个mrna剪辑因子srsf3（srp20）和srsf10（spp30c），融合mRNA组和光交联-rna测序及生物信息技术，证明ythdc1和srsf3女性主义于推动外显子留存，但srsf10则女性主义于推动外显子的剪辑。
ythdc1通过推动srsf3，同时遏制srsf10的核小斑定位及它们融合rna的能力去调控mrna选择性剪辑，而且只有野生型的ythdc1能止跌因敲低ythdc1引发的srsf3和srsf10核小斑定位、rna融合能力和靶基因mrna选择性剪辑变化。
结合研究团队前期参与发现的rna甲基化修饰酶（jiaetal.naturechemicalbiologyzhengetal.molecularcellpingetal.cellresearch）及其甲基化位点选择性机制(chenetal.cellstemcell)和m6a修饰外显子被保留现象(zhaoetal.cellresearch)，m6a读码器ythdc1调控mrna剪接分子机制的阐明，为进一步研究m6a的生物功能和rna表观遗传提供依据，为研究与正常生理（如干细胞干性维持和分化）或异常病理生命活动（如恶性肿瘤等）关联的分子机理提供新的表观调控研究方向。
该项研究获得科技部、国家自然科学基金和中科院先导专项等项目的积极支持。
PGC-1α启动子甲基化介导在热大鼠预适应延缓运动疲劳中的机制研究
PGC-1α启动子甲基化介导在热大鼠预适应延缓运动疲劳中的机制研究赵海涛;曹庆雷;邓中原【期刊名称】《中国康复医学杂志》【年(卷),期】2022(37)10【摘要】目的:探讨热预适应通过调节过氧化物酶体增殖物活化受体γ协同刺激因子-1α(peroxisome proliferator-activated receptor-γcoactivator-1α,PGC-1α)基因的启动子甲基化修饰从而延缓运动疲劳发生的机制。
方法:选取12只8周龄雄性SD大鼠随机分成热预适应组(n=6)与正常对照组(n=6),热预适应组经过42℃热应激处理15min,每天间隔处理3次,连续处理7d,结束后每组取3只SD大鼠采集肌肉组织进行启动子甲基化检测,随后利用生物信息学软件预测SD大鼠肌肉组织中PGC-1α基因的CpG岛,针对CpG岛设计检测引物,采用重亚硫酸盐的测序法分析肌肉组织内PGC-1α基因启动子区CpG岛的甲基化程度,同时采用Western Blot法检测PGC-1α蛋白表达情况。
将每组的另3只大鼠进行跑台一次性力竭运动,记录力竭时间。
结果:热预适应处理显著延缓了运动疲劳的发生。
同时,与对照组PGC-1α基因启动子区域CpG岛高度甲基化(50.20%±3.13%或48.78%±3.38%)相比,热预适应处理显著降低了PGC-1α基因的甲基化(18.57%±2.12%或19.80%±1.99%),但热预适应组PGC-1α基因的蛋白表达量却显著高于对照组。
因此,SD大鼠在1w的热预适应过程中PGC-1α基因启动子区CpG岛的甲基化模式发生了显著变化,即随着热预适应处理时间的增加,PGC-1α基因启动子区甲基化程度逐渐降低,但PGC-1α基因的表达量显著升高。
结论:对大鼠进行热预适应处理可以通过降低PGC-1α启动子的甲基化水平增加PGC-1α基因的表达量,这可能是热预适应通过PGC-1α基因启动子甲基化水平的改变延缓运动疲劳发生的机制之一。
神经母细胞瘤p16基因甲基化研究
神经母细胞瘤p16基因甲基化研究杨立业;李心元;高红【期刊名称】《苏州大学学报（医学版）》【年(卷),期】2001(021)001【摘要】目的明确在神经母细胞瘤中p16基因是否发生甲基化及其频率，阐明p16基因在神经母细胞瘤中的作用机制。
方法应用PCR技术结合限制性内切酶FnuDⅡ、SacⅡ、HpaⅡ为工具，对14例神经母细胞瘤患者的14个原发灶及其中5例肿瘤周围正常组织p16基因第1外显子CpG岛进行了甲基化修饰的研究。
结果5例正常组织的p16基因第1外显子CpG岛未发生甲基化，而4例原发灶在Ⅱ(1例)、Ⅲ(2例)、Ⅳ(1例)期有甲基化发生。
结论神经母细胞瘤瘤组织DNA中不存在p16基因的纯合性缺失，p16基因甲基化可能为其失活的一种形式，Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期均有发生，可能是肿瘤发生的早期事件。
同一患者的原发灶和转移灶，可有不同的甲基化模式，反映了肿瘤的异质性。
%Objective To investigate whether the hypermethylation of p16 gene is present or not.Method The methylation pattern at 5′ CpG island of p16 gene was analyzed by PCR combined with methylation sensitive restriction endonuclease enzymes Hpa Ⅱ、Sac Ⅱ and FnuDⅡ in the normal tissue in 5 cases and 14 primary tumors and in 2 of which metastatic tumors were available.Results 5′ CpG island methylation occured in 4/14 primary tumors and 1/2 metastatic tumors.no methylation occured in the normal tissue in 5 cases,no homozygous deletions occured in neuroblastomas since all tumor DNA undigested displayed specific bands after PCR amplification.Methylationscattered from stage Ⅱ to stage Ⅳ,both the primary and me tastatic DNA display methylation in one Ⅳ stage patient.This indicated that methylation occured prior to metastasis and methylation of CpG island was early event of this tumorigenesis.Conclusions De novo 5′ CpG island methylation of p16 gene is an important and common mode of inactivation for this negative regulator of cell cycle in neuroblastomas.【总页数】4页(P28-31)【作者】杨立业;李心元;高红【作者单位】广东省潮州市中心医院神经外科,;中国医科大学附属第二医院小儿外科,;中国医科大学附属第二医院小儿外科,【正文语种】中文【中图分类】R730.264【相关文献】1.内蒙古地区RASSF 1A、P16、DAPK、RUNX3基因甲基化在非小细胞肺癌中的研究 [J], 王培培;张翠英;2.非小细胞肺癌(NSCLC)p16基因甲基化改变及p16蛋白表达研究 [J], 张文;孙玉鹗;蔡庆;王桂洪;卢光明3.p16基因甲基化及P16、Cyclin D1、pRb与皮肤鳞状细胞癌相关性研究 [J], 魏志平;刘彦群;张昕博4.P16基因甲基化与垂体腺瘤及其临床特征相关性的研究 [J], 顾强; 程玉; 张宇; 崔国栋; 孙晓阳; 巴一旭; 杨光; 陶宇; 郑宏山; 王宁5.消痞颗粒对胃癌前病变大鼠p16基因甲基化的干预研究 [J], 安静;杨晋翔;魏玥;陈泽慧;戈学凤因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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中华内分泌代谢杂志 2016 年 5 月第 32 卷第 5 期 Chin J Endocrinol Metab, May 2016, Vol. 32, No. 5
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WHO 最新报告指出:目前全球超重人口已超过 19 亿,肥胖患者达 6 亿,是导致早死、致残、影响生命 质量和增加各国财政负担的全球性重要公共卫生问 题。 中国的肥胖人数已经位居世界第二,肥胖作为复 杂疾病,其发生是环境、基因共同作用的结果,多个研
一、 对象
氢盐修饰,并将 10 μl M-Elution Buffer 洗脱修饰后的
1. 对象:选取河南省某 市 级 医 院 腹 部 手 术 患 者 DNA 保存于-20℃ 备用。
116 例,其中成年男性 25 例, 成年 女 性 91 例。 由 于
4. 质谱法检测启动子区域甲基化:采用 Sequenom
【 Key words】 Obesity; PRDM16; Methylation ( Chin J Endocrinol Metab, 2016, 32: 370-375)
DOI:10. 3760 / cma. j. issn. 1000-6699. 2016. 05. 004 基金项目:国家自然科学基金(81001280,81202277,81373096) 作者单位:450001 郑州大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室( 孙盼盼、戚敏杰、付晓丽、平智广) ;450001 郑 州大学基础医学院组织学与胚胎学系( 刘莉) ;300011 天津市健康教育所( 詹芳芳) ;454150 焦作市人民医院护理部( 卢 明) ;450001 郑州大学基础医学院( 陈远思、陈嘉欣) Email: zhiyin1907@ 126. com 通信作者:平智广,Email: ping zhg@ 163. com
进棕色脂肪细胞形成,是棕色脂肪形成的特异性转录 调控因子[4] 。 棕色脂肪细胞富含线粒体加快人体新
二、 方法 1. 血样的采集:由专业化验员统一采集研究对象
陈代谢,分解脂肪产生热量和减少脂肪堆积,具有潜在 空腹静脉血 2 ml( 手术前晨起空腹) ,置于 EDTA-K2 抗
的抵抗肥胖和预防肥胖综合征的作用。
【 Abstract】 Objective To explore the association between the CpG methylation level of positive regulatory domain containing 16 ( PRDM16) gene promoter and obesity or body mass index( BMI) . Methods A total of 116 patients(91 female adults and 25 male adults) with abdominal operation in a municipal hospital of Henan province were enrolled in this study and they were divided into two groups: normal weight group( n = 50) , overweight or obesity group ( n = 66 ) . Fasting plasma glucose, total cholesterol, triglyceride, high density lipoprotein and low density lipoprotein were measured in peripheral blood. DNA was extracted from white blood cells in peripheral blood and modified by bisulphite. Then the CpG methylation level of PRDM16 gene promoter was detected by mass spectrometry. Finally, all data were analyzed by IBM SPSS Statistics 21. 0 at the 5% level. The essential features and biochemical indexes of research objects between two groups were compared by two independent sample t-test, except chi-square test for gender. The correlation between CpG methylation level of PRDM16 gene and BMI was analyzed by multiple linear regression. Results There were no significant differences ( P > 0. 05 ) in the methylation levels of PRDM16 gene＇s effective CpG sites( including CpG5. 6, CpG8, CpG9, CpG12, CpG13. 14. 15, CpG26. 27, CpG28 and CpG29) between two groups. The methylation level of CpG26. 27 had positive linear relation with BMI in overweight or obesity group with the standardized coefficients of 46. 928 ( P = 0. 015 ) , which means the higher the methylation level is, the higher the BMI would be. Conclusion The CpG26. 27 methylation level of PRDM16 gene promoter region may have relationship with the risk of obesity.
因 DNA 甲基化与肥胖的相关性,为肥胖发病机制的进 莱枫公司( 中国) 提供的 DNA 提取试剂盒说明进行血
一步研究提供基础。
浆 DNA 抽 提, 并 将 其 保 存 于 - 20℃ 备 用。 按 照 EZ
对象和方法
DNA Methylation-Kit 试剂盒 ( Zymo Research,美国) 说 明书步骤,取 14 μl DNA 样本对血浆 DNA 进行亚硫酸
凝管中,经 3 000 r / min 离心 10 min 后分离白细胞后置
DNA 甲基化是目前研究最为深入的一种表观遗 于 2 ml EP 管中,保存于-80℃ 冰箱备用。
传修饰方法,近年来的研究发现基因甲基化与肥胖发
2. 生化指标测定:采用葡萄糖氧化酶法检测空腹
生存在关联,如过氧化物酶体增殖体激活受体基因及 5-羟色胺载体基因启动子高甲基化可增加肥胖发生风 险[5] ;FTO 基因甲基化也可增加肥胖发生风险[6] 。 目
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中华内分泌代谢杂志 2016 年 5 月第 32 卷第 5 期 Chin J Endocrinol Metab, May 2016, Vol. 32, No. 5
●临床研究●
PRDM16 基因启动子区甲基化与超重肥胖 发生风险的关联研究
孙盼盼 刘莉 詹芳芳 戚敏杰 卢明 陈远思 陈嘉欣 付晓丽 平智广
数( BMI) <18. 5 kg / m2 为体重过低,18. 5 kg / m2 ≤BMI< 24 kg / m2 为正常体重,BMI≥24 kg / m2 为超重,BMI≥28 kg / m2 为肥胖。 由此根据,本研究将 66 例 BMI≥24. 0 kg / m2 研究对象列为超重肥胖组( 超重 45 例,肥胖 21 例) ,50 例 18. 5 kg / m2 ≤BMI<24 kg / m2 研究对象列为
究表 明 PRDM16 ( positive r) 基因与肥胖的发生密切相关[1-3] 。 PRDM16 基因位
正常体重组。 4. 医学伦理:研究方案获郑州大学伦理委员会审
于人体第一条染色体上,能抑制白色脂肪细胞形成,促 批,并与研究对象签署知情同意书。
血糖( fasting plasma glucose,FPG) 水平;采用全自动生 化分析仪检测总胆固醇( total cholesterol,TC) 、三酰甘 油( triglyceride, TG ) 、 高 密 度 脂 蛋 白 胆 固 醇 ( high-
前,针对 PRDM16 基 因 甲 基 化 与 肥 胖 关 系 的 研 究 甚 density lipoprotein-cholesterol, HDL-C) 、 低 密 度 脂 蛋 白
【 摘要】 目的 探讨 PRDM16( positive regulatory domain containing 16) 基因启动子区 CpG 位点的甲基 化水平与肥胖的相关性。 方法 选取河南省某医院腹部手术患者 116 例,分为正常体重组 50 例、超重肥胖 组 66 例,其中成年男性 25 例、成年女性 91 例。 应用外周血测定空腹血糖、总胆固醇、三酰甘油、高密度脂 蛋白和低密度脂蛋白水平;然后提取 DNA 和亚硫酸氢盐修饰并使用质谱法对 PRDM16 基因启动子区 CpG 位点甲基化水平进行检测。 最后应用 IBM SPSS Statistics 21. 0 软件进行统计学分析:研究对象基本特征和 生化指标资料的组间比较采用两独立样本 t 检验;性别资料采用 χ2 检验;多个 CpG 位点甲基化与体重指数 ( BMI) 间关系采用多重线性回归;检验水准 α = 0. 05。 结果 PRDM16 基因启动子区全部有效检测位点 CpG5. 6、CpG8、CpG9、CpG12、CpG13. 14. 15、CpG26. 27、CpG28 和 CpG29 甲基化水平在正常体重组和超重肥 胖组之间无区别( P>0. 05) ;经分层分析,超重肥胖组 CpG26. 27 位点与 BMI 有线性关系,且甲基化程度越 高,BMI 越大,标准化偏回归系数为 46. 928( P = 0. 015) 。 结论 PRDM16 基因启动子区 CpG26. 27 位点甲 基化水平可能与肥胖相关。