一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA提取方法_刘少华

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一种快速提取和纯化植物病组织中病原菌DNA的方法[发明专利]

一种快速提取和纯化植物病组织中病原菌DNA的方法[发明专利]

专利名称:一种快速提取和纯化植物病组织中病原菌DNA的方法
专利类型:发明专利
发明人:严蕾艳,马忠华,尹燕妮
申请号:CN200810121328.3
申请日:20080925
公开号:CN101367858A
公开日:
20090218
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种快速提取和纯化植物病组织中病原菌DNA的方法,将植物不同发病部位的组织加入提取液,用尖头玻棒研磨后,上清液加入无水乙醇沉淀DNA,再用70%乙醇洗涤干燥,最后通过过柱纯化得到植物组织中病原物的基因组DNA。

提取液的组分以提取液总体积计:PVP:1-2g/100ml,Tris-HCl:200mM,EDTA:50mM,NaCl:20mM,SDS:1g/100ml,余量为ddHO,pH8.0。

本发明的方法具有简单、污染小、快速、经济、高效等优点,能够实现多个样品短时间内提取DNA,给病害分子检测提供了便捷、快速的途径。

申请人:浙江大学
地址:310027 浙江省杭州市西湖区浙大路38号
国籍:CN
代理机构:杭州天勤知识产权代理有限公司
代理人:胡红娟
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一种快速有效提取植物和真菌DNA和RNA的简易方法

一种快速有效提取植物和真菌DNA和RNA的简易方法

基因组学与应用生物学,2009年,第28卷,第6期,第1183-1188页Genomics and Applied Biology,2009,Vol.28,No.6,1183-1188实验技术与方法Techniques and Methodology一种快速有效提取植物和真菌DNA 和RNA 的简易方法王学仁1,2张改娜1何涛1郝建国1贾敬芬1*1西北大学生命科学学院,陕西省生物技术重点实验室,西安,710069;2西安文理学院生命科学系,西安,710065*通讯作者,jiajf38@摘要本文利用一种真菌核酸的快速提取方法提取了3种真菌的DNA 和RNA ,并将该法略作改进用于烟草DNA 和RNA 的提取。

同时,通过低温保藏试验评价核酸提取液和提取产物的稳定性和有效性;利用凝胶电泳、PCR 和RT-PCR 等方法比较分析核酸质量;并将提取效果与传统方法或试剂盒的提取效果进行比较,以分析其有效性。

结果表明,改进后的提取方法是一种简单、方便和有效的实验方法,不仅可用于真菌也可用于植物DNA 和RNA 提取,用这种方法提取得到的DNA 和RNA 在低温保存条件下比较稳定,能较长时间保持其原有活性。

关键词真菌,烟草,核酸快速提取A Simple,Rapi d and Effective Method for Extraction of DNA and RNA from Fungi and PlantsWang Xueren 1,2Zhang Gaina 1He Tao 1Hao Jianguo 1Jia Jingfen 1*1The Provincial Key Laboratory of Biotechnology,School of Life Science,Northwest University,Xi'an,710069;2Department of Life Science,Xi'an University of Arts and Science,Xi'an,710065*Corresponding author,jiajf38@ DOI:10.3969/gab.028.0001183Abstract A method for rapid extraction of nucleic acid from fungi was used to extract DNA and RNA from three fungi and an improve method based on it was used to extract DNA and RNA from tobacco.Meanwhile,the stability and effectiveness of extracting solution and extracting product were appraised by examining the state of them after low-temperature preservation.The quality of isolated nucleic acids were analyzed by using agarose gel elec-trophoresis,PCR and RT-PCR amplification.The effectiveness of this method was analyzed and compared with that of kit methodology.The results indicated that the improve method for extraction of DNA and RNA in this pa-per was simple,convenient and effective,it could be used to extract DNA and RNA not only from fungi,but also from plants,the DNA and RNA extracted using this method were stable and their activities were kept for a rela-tively long time during cryopreservation.Keywords Fungus,Tobacco,Rapid extraction of nucleic acids/doi/10.3969/gab.028.0001183基金项目:本研究由国家自然科学基金(30671087)、西安市科技创新支撑计划(YF07109)和陕西省教育厅科学研究计划项目(06JK201)共同资助分子生物学的进展已经使其成为真菌学家进行真菌系统分类、对其分子进化、群落遗传以及植物与真菌相互作用研究的重要工具。

一种简便实用的植物总DNA提取方法

一种简便实用的植物总DNA提取方法

(自然科学版)23(3):271~272,2000α山西大学学报Journal of Shanxi U niversity(N at.Sci.Ed.) 文章编号:025322395(2000)032027122一种简便实用的植物总DNA提取方法王景雪1,孙 毅1,高武军2(11山西省农业生物技术研究中心,山西太原030031;21山西农业大学农业生物工程中心,山西太谷030801)摘 要:对近年来发展起来的植物基因组DNA提取方法进行了改良,提出一种简便、实用的DNA提取方法,所得DNA的产量和纯度能够满足基因工程操作的要求。

关键词:植物;DNA提取;方法中图分类号:Q946 文献标识码:A 利用基因工程手段对植物进行定向改造,已成为当今植物育种学发展的一个新领域。

植物基因工程操作离不开植物基因组总DNA的制备,传统的CTAB DNA提取法步骤多,较烦琐,DNA产率低,而且由于酚很难完全去除,容易影响以后的酶切等工作的效率。

因此,我们改良了SD S法,并且在玉米等植物的研究中得到了较好的结果。

1 实验方法111 溶液及试剂11111 溶液500mmo l L N aC l,50mmo l L T ris・C l pH810,50mmo l L ED TA。

11112 其它溶液10%SD S,5mo l L KA c,氯仿—异戊醇(24∶1;V V),3mmo l L N aC l,Β2巯基乙醇,异丙醇.T E缓冲液:10mmo l L T ris・C l,1mmo l L ED TA(pH810),70%乙醇,RN ase A10m g m l.11113 仪器试验所使用离心机为德国产H ERM L E E360K离心机。

112 步骤(1)植物鲜叶片或幼芽,于研钵中快速用液氮研成粉末。

幼芽最好先冷冻干燥数小时后,再研磨。

(2)称取011g粉末,转入离心管中,立即加入800Λl溶液 和16Λ1Β2巯基乙醇,置于室温数分钟至解冻。

植物基因组dna的提取实验报告

植物基因组dna的提取实验报告

植物基因组dna的提取实验报告植物基因组DNA的提取实验报告。

植物基因组DNA的提取是分子生物学研究中的重要步骤,本实验旨在通过提取植物细胞中的DNA,为后续的PCR扩增、基因克隆、基因组测序等实验打下基础。

本报告将详细介绍植物基因组DNA提取的实验步骤、方法和结果。

实验材料和仪器。

1. 实验材料,植物叶片样品、液氮、细胞裂解缓冲液、蛋白酶K、异丙醇、等离子体膜、异丙醇沉淀液、乙醇、夹板、离心管、PCR管等。

2. 实验仪器,搅拌器、冰箱、冷冻离心机、显微镜、紫外可见分光光度计等。

实验步骤。

1. 取少量植物叶片样品置于液氮中,研磨成细碎的粉末状。

2. 将研磨好的植物叶片样品加入细胞裂解缓冲液,混合均匀后浸泡于65°C水浴中。

3. 加入蛋白酶K,继续65°C水浴裂解。

4. 加入等体积的异丙醇,轻轻摇晃离心管,使溶液混合均匀后放置于室温。

5. 加入等体积的等离子体膜,轻轻摇晃离心管,使溶液混合均匀后放置于室温。

6. 加入等体积的异丙醇沉淀液,轻轻摇晃离心管,使溶液混合均匀后放置于室温。

7. 将混合液转移至PCR管中,加入等体积的乙醇,轻轻摇晃离心管,使溶液混合均匀后放置于室温。

8. 离心沉淀后,弃上清液,加入70%乙醇洗涤。

9. 将洗涤后的DNA溶解于TE缓冲液中,用紫外可见分光光度计检测DNA浓度和纯度。

实验结果。

通过上述步骤,成功提取了植物基因组DNA,并进行了浓度和纯度的检测。

实验结果显示,提取的DNA浓度为120 ng/μl,纯度(A260/A280)为1.8,符合后续实验的要求。

结论。

本实验通过简单、快速、高效的方法成功提取了植物基因组DNA,为后续的分子生物学实验提供了可靠的基础。

通过本实验,我们对植物基因组DNA的提取过程有了更深入的了解,为今后的科研工作积累了宝贵的经验。

总结。

植物基因组DNA的提取是分子生物学研究中的重要步骤,本实验通过简单、快速、高效的方法成功提取了植物基因组DNA,并进行了浓度和纯度的检测。

一种快速、简单的植物基因组DNA提取方法[发明专利]

一种快速、简单的植物基因组DNA提取方法[发明专利]

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201711274541.3(22)申请日 2017.12.06(71)申请人 宁夏农林科学院地址 750002 宁夏回族自治区银川市金凤区黄河东路590号(72)发明人 陈晓军 樊云芳 王敬东 李树华 宋海丽 (51)Int.Cl.C12N 15/10(2006.01)(54)发明名称一种快速、简单的植物基因组DNA提取方法(57)摘要一种提取植物基因组DNA方法,它涉及一种简便、环保、快速提取植物基因组DNA的方法。

它解决了目前植物基因组DNA提取方法需要离心机昂贵特殊设备、提取步骤繁锁、提取过程中刺激味大、提取时间长等问题。

提取方法:一、将新鲜的植物组织打碎,加入改良DNA裂解液,混匀;二、用干净脱脂棉签,将其浸入步骤一中的DNA的粗提液3s,将浸润的棉签迅速在DNA清洗液中轻轻漂洗3次;三、然后将棉签在100μL ddH 2O或TE溶解彻底洗脱3-5次,洗脱过的溶液即DNA溶液,可用于下游的分子生物学实验。

本发明方法是一种可以广泛使用的植物DNA提取方法,它不受设备、材料量的限制,在DNA提取过程中省去了氯仿等刺激性化学试剂,短时间内完成DNA提取的工作,可广泛应满足基于PCR反应的基因型鉴定和基因克隆、测序等需要。

权利要求书1页 说明书3页 附图2页CN 108795924 A 2018.11.13C N 108795924A1.一种改良DNA裂解缓冲液,每1000ml所述DNA提取缓冲液中,含有十二烷基硫酸钠钠(SDS)0.6g。

2.根据权利要求1所述的DNA提取缓冲液,其特征在于,每1000ml所述DNA提取缓冲液中还含有Tris-HCl 200mmol、NaCl 250mmol、EDTA 25mmol。

3.一种改良DNA清洗液,每1000ml所述DNA清洗液中,含有吐温-20 15g。

一种提取真菌基因组DNA的新方法

一种提取真菌基因组DNA的新方法

一种提取真菌基因组DNA的新方法真菌为低等真核生物,种类庞大而多样,在最近的几年里,随着测序技术的不断提高和大片段测序价钱的降低,大量真菌被测序,真菌基因组学研究快速发展。

特别是真菌比较基因组学的分析已成为生物进化、系统发生学、药物靶基因、基因发现以及基因功能等方面的研究[2-3]。

而真菌基因组DNA的浓度和纯度直接关系到真菌基因组的测序和组装,从而进一步影响后续的基因注释及分析。

高质量和大片段(30 kb)的真菌基因组DNA可以用于10 kb文库构建和高通量测序。

有些真菌由于色素、多糖含量较高,使得传统CTAB方法提取不能获得高纯度、大量的基因组DNA,给后续测序工作带来很大难度。

例如,产黄青霉(Penicillium chrysogenum),该菌产生色素很多,用传统方法很难完全去除色素;对于一些含糖量多的真菌,如冬虫夏草菌(Ophiocordyceps sinensis)中至少含有20种多糖,约占虫草总干质量的 3 %~8 % ,这一类真菌传统方法提取的基因组DNA是达不到高通量测序的要求的。

试验采用月桂酸钠法、CTAB法和酶解法分别提取了相同的4株真菌基因组总DNA。

这4株真菌都属于Ophiocordyceps sinensis菌株,多糖和色素含量较多。

1 材料和方法1.1 材料1.1.1 供试菌株Ophiocordyceps sinensis菌株4株,由中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室刘杏忠研究员课题组提供。

真菌在铺有玻璃纸的PDA培养基上培养,25 ℃,7~20 d。

1.1.2 仪器恒温电热水槽,电子分析天平,低温离心机,移液器,NanoDrop 1000,电泳槽,电泳仪,凝胶成像系统1.1.3 主要试剂液氮、1 %月桂酸钠、100 mM NaCl、Tris饱和酚、氯仿-异戊醇(24+1)、异丙醇、70 %乙醇(v/v)、无菌ddH2O、RNase A(Sigma,100 mg/mL)、RNase T1(Fermentas,1000 U/μl,用TE稀释至1000 U/mL)。

英山黄花菜叶枯病的病原鉴定及室内药效研究

英山黄花菜叶枯病的病原鉴定及室内药效研究

《英山黄花菜叶枯病的病原鉴定及室内药效研究》报告如下。

1 材料与方法1.1 供试菌株利用组织分离法[2]从湖北省英山县雷家店镇友谊村黄花菜种植基地黄花菜叶片上分离、纯化、保存病菌。

1.2 病原菌形态观察和离体回接鉴定将病菌菌块先置于马铃薯葡萄糖培养基(Potato dextrose agar,PDA)[2]平板中央,28 ℃黑暗培养3 d,观察菌落颜色和形态;并用无菌水洗下培养菌落中的分生孢子,在显微镜(XDS-500倒置显微镜)下观察其形态。

在湖北省农业科学院经济作物研究所蔬菜基地选取健康的黄花菜叶片,用自来水冲洗干净,用75%乙醇棉球轻擦表面。

在无菌操作台上用镊子轻刮叶片表面,使其形成微创伤,然后用无菌打孔器打取5 mm菌饼置于创伤处,以接培养基的黄花菜叶片为对照。

用无菌水打湿无菌纸后放入无菌瓷盘中,将处理好的叶片放在无菌纸上,用保鲜膜包裹瓷盘28 ℃培养。

3次重复,每天观察并记录是否发病。

1.3 菌丝生长的致死温度和最适pH取直径为0.9 cm菌块于1.5 mL离心管中,在不同温度梯度(30、35、40、45、50、55、60、65 ℃)下水浴10 min后接种于PDA平板。

28 ℃培养,3 d后观察菌丝生长情况,3次重复。

取直径为0.9 cm菌块移到pH 4~11共9个梯度的PDA培养基平板上,平板置于28 ℃条件下培养3 d,测量菌落直径,3次重复。

1.4 不同碳源和氮源对菌丝生长的影响基础培养基采用査彼(Czapek)培养基,硝酸钠2.00 g、氯化钾0.50 g、硫酸亚铁0.01 g、磷酸氢二钾1.00 g、硫酸镁0.50 g、蔗糖30.00 g、琼脂17.00 g。

碳源用葡萄糖、D-果糖、乳糖、甘露醇、麦芽糖和可溶性淀粉替代基础培养基中的碳源;氮源用甘氨酸、酵母浸出液、硫酸铵、硝酸钾、蛋白胨、磷酸二氢铵、硝酸铵和L-谷氨酸钠替代基础培养基中的氮源。

每个处理设置3次重复,28 ℃条件下接菌培养3 d后测量菌落直径。

一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA提取方法_刘少华

一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA提取方法_刘少华

植物病理学报A CTA PHY TO PA THO LOG ICA SI N ICA 35(4):362-365(2005)收稿日期:2004-10-22;修回日期:2004-12-28基金项目:上海市科技兴农重点攻关资助项目(沪农科攻字2003第3-4号)通讯作者:戴富明,副研究员,主要从事经济作物病害的分子诊断和综合防治研究;E-m ai:l fum i ngda@i 163.co m 。

研究简报一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA 提取方法刘少华1,2,陆金萍2,朱瑞良1,戴富明2*(1华东师范大学生命科学学院,上海200062;2上海市农业科学院植物保护研究所上海市设施园艺重点实验室,上海201106)摘要:尿素提取法是最新报道的一种植物拟南芥基因组DNA 的提取方法,但是还没有应用于植物病原真菌DN A 的提取。

本研究采用改进的4种不同的方法(尿素提取法、CTAB 提取法、氯化苄提取法以及S D S -CTA B 提取法),分别对5种分类地位不同的植物病原真菌(草莓疫霉病菌、西瓜蔓枯病菌、草莓炭疽病菌、西瓜枯萎病菌和水稻纹枯病菌)的基因组DN A 进行提取和比较。

结果表明,尿素提取法和SD S -CTAB 法均能提取到所有5种真菌的基因组DNA,而尿素提取法提取D NA 的效率更高、质量更好,操作步骤更为快速简单。

关键词:植物病原真菌;基因组DNA;尿素提取法A rap i d and s m i p le ex tra ct i o n m e tho d fo r p lan t pa tho g en ic fu ng i LI U Shao -hua 1,2,LUJi n -p i n g 2,ZHU Ru-i liang 1,DA I Fu -m i n g 2(1D epart m en t o f B i o l o g ica l Sc i ences ,t he East C hi na N o r m a l U n i v ersity ,Shanghai 200062,C hi na ;2Institute o f P lan t P ro t ec tion ,Shanghai A cade m y o f A gr i cu lt ura l Sc i ences ,Shanghai K ey L ab o f Pro -tected H or ticultura l T echno l o gy,Shang ha i 201106,Ch i na)Ab stra ct :U rea ex traction ha s been recently reported as a m ethod on ly fo r ex traction o fA rabidopsis g enom ic DNA,w hich has no t applied i n ex traction o f plant patho gen ic funga lDNA.I n this paper ,four k i n ds o f ex trac -ti o n m e t h ods (m odifi e d urea ,CTAB ,benzy l chlor i d e and SD S-CTAB )w ere app li e d to ex tract the g enom ic DNA of fi v e d ifferen t plan t pa t h ogen ic fung i (Phytophtho ra fraga riae,D i d y m ella bryoniae,C o lleto trichum fra-ga riae,Fusa ri u m o xysporum f .sp .cucum eriru m ,Rhizo cton ia so lani)and they are assessed on si m p licity ,rapid -ity and efficacy .Resu lts show ed tha t the urea m e t h od had better efficacy ,si m pler ,m ore conven ient pro cedure and broader applicability .Key w o rd s:p lant patho gen ic fung ;i genom ic DNA;urea ex traction m ethod文章编号:0412-0914(2005)04-0362-04国内外用于真核生物基因组DNA 提取的方法很多,植物病原真菌基因组DNA 提取主要借鉴植物基因组DNA 的提取方法,然而,有些方法试剂昂贵或者步骤繁琐。

枸骨内生真菌IFB-GLP-4的鉴定

枸骨内生真菌IFB-GLP-4的鉴定

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枸 骨 内生 真 菌 IB GL 一 的鉴 定 F — P4
郭也等
该 菌 由本 组 2 0 年 采 自南 京 紫 金 山, 为 一野 生 型菌 08
株 ,对 其 遗 传 背 景 等 亟待 研 究 。本 组 已有 结 果证 实
P A) 0 g S "2 0 马铃 薯 去皮 切 丁 ,加水 煮 沸3 mi,滤 去 0 n
残 渣 ,滤 液 加 水 补 足 至 1 0 mL,再  ̄ /2 g 糖 , 00 Jk 0 蔗 I. J
l~ 0 琼 脂 , 1 1 5 2g 2 ℃灭菌 3 mi、p 0 n H自然 。
新 骨架 化 合 物g inroe 幽 门螺 旋杆 菌 有 较 强 ug ad ns A对
的拮抗 作 用( 阳 性药 青 霉 素相 当) 与 ,为 了研 究新 骨架 化 合 物 可 能 的 生物 合 成 途 径 ,推 测 其 生源 基 础 , 为 其 工 业 化 研 究提 供 理 论 依 据 有 必 要 对 产 生 菌 进 行 分 类 鉴 定 。 因 此 本研 究通 过 形 态 学 和 分 子 生 物 学 方法 对 菌 株I B GL 一进 行 了 鉴定 ,为该 菌株 的深入 研 究 F — P4 提 供 参考 依 据 。
麦 芽培 养基 ( lE t c A a,ME ) 0 麦 Ma xr t gr t a A :2 g
芽 , 加 水 煮 沸 3 mi ,滤 去 残 渣 ,滤 液 加 水 补 足 至 0 n l 0 mL,再 ̄ l. g O0 X2 蔗糖 和 1 蛋 白胨 , 1~ 0 琼脂 , 0 g 52g
摘要 :从药 用植物枸骨 中分离到一株具有抗芽孢 杆菌活性且 能产 生新骨架化合物 的内生真菌,该菌命名 为IB GL .,综 F . P4 合运用形态学和 分子生物学方法对 该菌进行分类鉴定 ,确 定其为子囊菌亚 f( cmy oia,腔 菌纲( 0uoso cts,座 囊 Aso ct ) n L clacmy ee) 菌 目( tiels,球座菌属( u n ri) Dohd a ) e G i ad ,芒果球座 菌( u n ri m n i re。 g a G i ada a g ea ) g f 关键词 :枸骨 ;内生真菌IB G P4 F — L .;形态 学特 点;分子鉴定 中图分类号 :Q9 95 3. 文献标 识码 :A

“安地静”通过农业部科技成果鉴定

“安地静”通过农业部科技成果鉴定

从 山东 全省 二 点 委 夜 蛾 调查 发 现 , 在 6月 底 到
3 6 5 .
8月下 旬 , 也就 是 夏 玉米 生长 期 间 , 二点 委 夜 蛾栖 息 在夏 玉米 、 大豆 田间或地 头 的麦秸 或者 杂 草 里 , 栖 息
地 发生量 相对 较 大 ; 而 秸 秆 未 还 田的 玉 米 田块 里 则 相对 较少 ; 一 般情 况 下 , 有 秸 秆 的玉 米 田 、 大 豆 田均 能 发现 二点 委夜蛾 幼 虫 。可 见 , 只要 温度 条 件适 宜 , 有 小麦秸 秆 还 田的地 区就 有 可 能发 生 二点 委 夜 蛾 ,
1 3 2—1 3 4 .
[ 5 ] 姜京宇 ,李秀琴 , 刘丽, 等.河北省玉米 田二 点委夜蛾发生危 害初报口] .植 物保护 , 2 0 1 1 ,3 7 ( 5 ) :2 1 3—2 1 4 .
也 预示着 这种 害虫 具有 较强 的扩 散性 。因 此要 加 强 预 测预 报 , 防止该 虫在 新 的地 区大暴 发 。
而 发生量最少 的地 区集 中在 E l 照、 滨州、 威海、 青 岛和
枣 庄等地 , 地域 分 布 没有 明显 的特 征 。相 比 2 0 1 1 年
参 考文献
[ 1 ] 姜京宇 , 李 秀芹 ,许佑辉 ,等.二点委夜蛾研究初报l _ J ] .植物
保 护 ,2 0 0 8 ,3 4 ( 3 ) :1 2 3 —1 2 6 .
报, 介 绍 了安 地静 前 期 的研 发 、 试验 、 规 模 化 生 产 及 推 广 应 用等 。该 项 成 果 解 决 了 固体 农 药 的微 囊化 , 创 制 了 两种 不 同 作 用 机 理 药剂 复 配 的种 子 处理 微 囊 悬 浮 剂 , 已获 得 国 家发 明 专 利 ( 专利 号 Z L 2 0 I 1 1 0 3 5 8 1 0 0 . 8 ) , 经过 科 学 试 验 效 果 显 著 优 于 常 规 药 剂, 残 留低 、 对 花 生 出 苗安 全 。2 0 1 3 年 安 地 静 示 范推 广 面 积 达 到 2 . 7万 h m2 , 安 地 静 效 果 得 到 了农 民 、 经销 商 、 零 售 商 和 基 层 植 保 服 务 人 员 的 高度 认 可 。

CTAB植物DNA的提取方法

CTAB植物DNA的提取方法

CTAB法提植物DNA
2010-11-26 09:14:27| 分类:DNA提取
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CTAB法是一种快速简便的提取植物总DNA的方法,
其原理是:采用机械破碎植物细胞,然后加入CTAB分离缓冲液将DNA溶解出来,再经氯仿-异戊醇抽提除去蛋白质,最后得到DNA。

CTAB法的版本有很多,不过大同小异。

以下是我使用的方法:
1.将植物组织洗净,用75%的酒精表面消毒4-5min,用去离子水冲洗3次;
2. 将样品放在灭过菌的研钵中,加入液氮捣碎,迅速转入1.5ml离心管中,加入600mlCTAB (或同时加入石英砂和CTAB研磨,然后转入1.5ml离心管中);
3. 65℃水浴1h(每20min反转摇匀一次);
4. 加等体积的氯仿-异戊醇(体积比24:1),或加入苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),颠倒混匀;
5. 6500rpm离心30min,取上清于新管中;
6. 重复4,5步骤;
7. 向上清中加入2倍体积的无水乙醇(或2/3体积的异丙醇)沉淀DNA,-20℃放置20min 或更长时间,或过夜;
9. 加75%的乙醇清洗DNA,每次12000rpm 2min,去上清;
10. 风干后加入40ul的TE缓冲液溶解DNA;
11. 取2ul溶液电泳检测。

植物基因组DNA快速提取与扩增体系优化的方法[发明专利]

植物基因组DNA快速提取与扩增体系优化的方法[发明专利]

(19)中华人民共和国国家知识产权局(12)发明专利申请(10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请号 201810891038.0(22)申请日 2018.08.07(71)申请人 深圳大学地址 518000 广东省深圳市南山区南海大道3688号(72)发明人 刘琳 罗淋淋 李琳 杨晓玉 (74)专利代理机构 广州市南锋专利事务所有限公司 44228代理人 郑学伟 叶利军(51)Int.Cl.C12N 15/10(2006.01)C12Q 1/686(2018.01)(54)发明名称植物基因组DNA快速提取与扩增体系优化的方法(57)摘要本发明公开了一种植物基因组DNA快速提取与扩增体系优化的方法,包括如下步骤:取长3-5mm,宽2-3mm的植物组织样品置于微孔板中;在所述微孔板中加入氧化锆珠;在所述微孔板中加入DNA提取液;将所述微孔板密封后放置在组织研磨仪器上进行研磨形成样本组织液。

将所述样本组织液作为PCR反应的模板,进行PCR扩增。

本发明可应用于多种植物基因组的DNA的快速提取,满足植物分子生物学和遗传学的研究及转基因农作物的快速鉴定。

权利要求书2页 说明书5页 附图2页CN 109055355 A 2018.12.21C N 109055355A1.一种植物基因组DNA快速提取与扩增体系优化的方法,其特征在于,包括如下步骤:取长3-5mm,宽2-3mm的植物组织样品置于微孔板中;在所述微孔板中加入氧化锆珠;在所述微孔板中加入DNA提取液;将所述微孔板密封后放置在组织研磨仪器上进行研磨形成样本组织液。

将所述样本组织液作为PCR反应的模板,进行PCR扩增,所述PCR扩增中的PCR反应体系如下:。

2.根据权利要求1所述的植物基因组DNA快速提取与扩增体系优化的方法,其特征在于,所述DNA提取液制备如下:按照以下组分配置10X缓冲母液:-100mM三(羟甲基)氨基甲烷盐酸盐;-5mM乙二胺四乙酸;-1M氯化钾;-5mM氯化钠;将10X缓冲母液用去离子水稀释后形成所述DNA提取液。

一种简单有效提取植物病原真菌基因组DNA的试剂和方法[发明专利]

一种简单有效提取植物病原真菌基因组DNA的试剂和方法[发明专利]

专利名称:一种简单有效提取植物病原真菌基因组DNA的试剂和方法
专利类型:发明专利
发明人:赵爱春,张帅,朱攀攀,寇敏,刘长英,郑莎
申请号:CN201910648326.8
申请日:20190718
公开号:CN110205319A
公开日:
20190906
专利内容由知识产权出版社提供
摘要:本发明公开了一种简单有效提取植物病原真菌基因组DNA的试剂和方法,提取试剂包括溶液A和溶液B提取,其中溶液A各组分的浓度如下:200mM Tris‑HCl(pH8.0),250mM
NaCl,25mM EDTA,0.5wt%SDS,1wt%β‑巯基乙醇,RNA酶8μL;溶液B为浓度5M醋酸钾;使用该试剂提取能够快速、有效地提取到纯度高、稳定性好的基因组并且可直接用于基因克隆以及基因组测序,为病原真菌分子生物学研究提供了一种高效可行的分子检测途径。

申请人:西南大学
地址:400715 重庆市北碚区天生路2号
国籍:CN
代理机构:重庆航图知识产权代理事务所(普通合伙)
代理人:王贵君
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真菌dna提取方法

真菌dna提取方法

真菌dna提取方法嘿,咱今儿就来唠唠真菌 DNA 提取这档子事儿!你可别小瞧这真菌,它们虽然小小的,可里面藏着的秘密那可多了去啦!要想把它们的 DNA 给弄出来,那可得有点小窍门。

首先呢,咱得准备好各种家伙什儿。

就好比要去打仗,你不得把刀枪棍棒都准备齐了呀!什么离心管啦、各种试剂啦,一个都不能少。

然后呢,把真菌给弄碎咯!这就好比是要打开一个宝库的大门,得先把那锁给撬开。

可以用一些特殊的方法,让真菌乖乖地把它们的秘密给吐出来。

接着,就是一系列复杂又有趣的操作啦。

就好像是在玩一个解谜游戏,每一步都得小心翼翼,又得充满好奇。

加这个试剂,摇一摇;加那个试剂,再晃一晃。

看着那些液体在管子里翻滚变化,心里还真有点小激动呢!提取的过程中,可千万不能马虎。

就跟做饭似的,盐放多了菜就咸了,火候不对菜就糊了。

咱这提取 DNA 也是一个道理,稍有不慎,可能就前功尽弃啦!你想想,那小小的真菌里,藏着多少关于生命的密码呀!咱要是能成功地把它们的 DNA 提取出来,不就像是拿到了打开生命奥秘大门的钥匙嘛!这多有意思,多有成就感呀!有时候,可能一次两次都不成功,但咱可不能灰心丧气呀!就跟学走路似的,哪有一开始就走得稳稳当当的呀。

得不断地尝试,不断地改进方法,总有一次能成功的。

而且,这提取真菌 DNA 可不只是在实验室里玩玩哦!它对很多领域都有着重要的意义呢。

比如说医学,了解了真菌的 DNA,就能更好地对付那些让人生病的真菌啦;还有农业,能让庄稼长得更好,少受那些坏真菌的侵害。

哎呀呀,说了这么多,总之就是,真菌 DNA 提取虽然有点难,但只要咱用心去做,肯定能成功的!别害怕失败,别嫌麻烦,大胆地去尝试吧!让我们一起揭开真菌背后的神秘面纱,探索生命的奇妙之处!你说好不好呀?。

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植物病理学报A CTA PHY TO PA THO LOG ICA SI N ICA 35(4):362-365(2005)收稿日期:2004-10-22;修回日期:2004-12-28基金项目:上海市科技兴农重点攻关资助项目(沪农科攻字2003第3-4号)通讯作者:戴富明,副研究员,主要从事经济作物病害的分子诊断和综合防治研究;E-m ai:l fum i ngda@i 163.co m 。

研究简报一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA 提取方法刘少华1,2,陆金萍2,朱瑞良1,戴富明2*(1华东师范大学生命科学学院,上海200062;2上海市农业科学院植物保护研究所上海市设施园艺重点实验室,上海201106)摘要:尿素提取法是最新报道的一种植物拟南芥基因组DNA 的提取方法,但是还没有应用于植物病原真菌DN A 的提取。

本研究采用改进的4种不同的方法(尿素提取法、CTAB 提取法、氯化苄提取法以及S D S -CTA B 提取法),分别对5种分类地位不同的植物病原真菌(草莓疫霉病菌、西瓜蔓枯病菌、草莓炭疽病菌、西瓜枯萎病菌和水稻纹枯病菌)的基因组DN A 进行提取和比较。

结果表明,尿素提取法和SD S -CTAB 法均能提取到所有5种真菌的基因组DNA,而尿素提取法提取D NA 的效率更高、质量更好,操作步骤更为快速简单。

关键词:植物病原真菌;基因组DNA;尿素提取法A rap i d and s m i p le ex tra ct i o n m e tho d fo r p lan t pa tho g en ic fu ng i LI U Shao -hua 1,2,LUJi n -p i n g 2,ZHU Ru-i liang 1,DA I Fu -m i n g 2(1D epart m en t o f B i o l o g ica l Sc i ences ,t he East C hi na N o r m a l U n i v ersity ,Shanghai 200062,C hi na ;2Institute o f P lan t P ro t ec tion ,Shanghai A cade m y o f A gr i cu lt ura l Sc i ences ,Shanghai K ey L ab o f Pro -tected H or ticultura l T echno l o gy,Shang ha i 201106,Ch i na)Ab stra ct :U rea ex traction ha s been recently reported as a m ethod on ly fo r ex traction o fA rabidopsis g enom ic DNA,w hich has no t applied i n ex traction o f plant patho gen ic funga lDNA.I n this paper ,four k i n ds o f ex trac -ti o n m e t h ods (m odifi e d urea ,CTAB ,benzy l chlor i d e and SD S-CTAB )w ere app li e d to ex tract the g enom ic DNA of fi v e d ifferen t plan t pa t h ogen ic fung i (Phytophtho ra fraga riae,D i d y m ella bryoniae,C o lleto trichum fra-ga riae,Fusa ri u m o xysporum f .sp .cucum eriru m ,Rhizo cton ia so lani)and they are assessed on si m p licity ,rapid -ity and efficacy .Resu lts show ed tha t the urea m e t h od had better efficacy ,si m pler ,m ore conven ient pro cedure and broader applicability .Key w o rd s:p lant patho gen ic fung ;i genom ic DNA;urea ex traction m ethod文章编号:0412-0914(2005)04-0362-04国内外用于真核生物基因组DNA 提取的方法很多,植物病原真菌基因组DNA 提取主要借鉴植物基因组DNA 的提取方法,然而,有些方法试剂昂贵或者步骤繁琐。

本文以5种分类地位差异明显的植物病原真菌为材料,对4种不同的基因组DNA 提取方法在DNA 得率和耗时等方面进行评价,以得到快速便捷、适应性广的植物病原真菌DNA 提取方法。

1 材料与方法111 菌种草莓疫霉病菌(Phytoph t h o ra fra ga ria e )、西瓜蔓枯病菌(D idy m e lla bryonia e)、草莓炭疽病菌(C o lleto trichum fraga ria e)和西瓜枯萎病菌(Fu-sa ri u m o xyspo r um f.sp.cucu m erirum)为上海市农业科学院植物保护研究所植物病理组分离并保存的菌种。

水稻纹枯病菌(Rhizo ctonia so lan i)菌种由中科院上海植物生理生态研究所何祖华教授惠赠。

112病原菌培养将植物病原真菌移至PDA平板上,25e黑暗条件下培养48~72h,然后将菌落边缘的菌丝切成2~3mm的菌落小块,把4~5个菌丝块移至C za-pek或者PD S培养液中,26e、120r/m in条件下振荡培养3~4d。

113病菌菌丝预处理液体培养好的菌丝,在双层尼龙网上抽滤,用水洗涤2次,以除去菌丝内的培养液,收集菌丝,吸干水分,用液氮研磨成粉末,备用。

114DNA提取方法11411尿素提取法根据Sun等[1]方法改进。

015g研磨好的菌丝样品加入10mL尿素提取液(7m o l/L U rea、50mm o l/L T ris-HC l pH810、6215 mm o l/L NaC l、1%SD S),摇匀,12000r/m i n离心5 m i n,吸取上清液,上清液12000r/m i n再次离心5 m i n;将上清液移入另一新管中,加入等体积的苯酚B氯仿B异戊醇(25B24B1)溶液,用力振荡数次混匀,12000r/m in离心5m in;取上清到一新管中加入等体积的异丙醇和1/10体积的3m o l/L N a A c (p H512),-20e放置20m in,12000r/m in离心5m in;弃上清液,倒置使管壁液体流尽,70%无水乙醇洗沉淀,室温放置干燥5~10m i n,溶于200 L L双蒸水中,加入RN ase A(10L g/L L)2L L, 37e水浴30m i n,-20e保存备用。

11412CTAB提取法根据Sagha i等[2]和易润华等[3]CTAB法,略有改进。

015g研磨好的菌丝样品加入10mL CTAB提取液(011m o l/L T ris-HC l p H715、1%CTAB、017m o l/L N a C l、10mm o l/L EDTA、1%2-巯基乙醇),65e水浴30m in,每隔5m i n振荡混匀1次,冷却至室温,加入等体积的氯仿B异戊醇(24B1),摇动数次,混匀,12000r/m i n 离心10m in;移取上清液到一个新管中,再次用氯仿B异戊醇(24B1)抽提1次,然后加入等体积的异丙醇,-20e放置20m i n,12000r/m i n离心10m i n;弃上清液,70%无水乙醇洗沉淀,后面步骤同11411。

11413氯化苄提取法根据章初龙等[4]的氯化苄法,略有改进。

015g研磨好的菌丝样品加入10 m L提取液(100mm o l/L T ris-HC l p H715、40 mm o l/L E DTA pH810),振荡混匀,加入2m L 10%SD S,6m L氯化苄,剧烈振荡,使管内混合物呈乳状,50e保温1h,每隔几分钟振荡混匀1次,冷却至室温,加入6m L预冷的3m o l/L N a A c(pH 512)溶液,混匀,然后冰浴15m i n,11000r/m i n离心15m i n;取上清液,上清液再离心5m i n;取上清,加入等体积异丙醇,-20e放置1h,11000r/m i n 离心15m in;弃上清液,后面步骤同11411。

11414SD S-CTAB提取法根据何月秋[5]SD S-CTAB法,略有改进。

015g研磨好的菌丝样品加入10m L提取液(50mm o l/L T ris-HC l、150mm o l/ L NaC l、100mm o l/L EDTA),振荡混匀,再加入1 m L20%SD S混匀,然后将离心管置于摇床内37e 缓慢摇动1h,每管加入5m o l/L N a C l溶液115 m L,缓慢混匀,加入113m L CTAB/N aC l溶液(10%CTAB、017m o l/L NaC l),混匀,65e水浴20 m i n,每隔几分钟摇动1次,冷却置室温,加入等体积氯仿B异戊醇,在摇床内剧烈摇动5m i n,10000 r/m i n离心12m i n,上清12000r/m i n离心5m i n;上清液移入新管中,加入016倍体积预冷的异丙醇,-20e放置过夜,10000r/m i n离心12m i n;弃上清液,后面步骤同11411。

115DNA的电泳分析及含量测定应用紫外分光光度计,将提取的植物病原真菌DNA样品做适当稀释后,测定A260和A260/A280,并计算DNA含量;提取的植物病原真菌DNA稀释适当倍数,观察电泳条带。

2结果与分析2114种方法提取步骤比较4种植物病原真菌基因组DNA提取方法主要差别在于提取液成分及样本与提取液混匀后的处理这二个方面。

提取液差别主要在于细胞裂解的试剂不同,而样本与提取液混匀后处理方法的差异主要是处理的温度和时间不同。

尿素法非常简便,常温混匀后马上可以离心,而其余3种方法均需要50e以上的温度处理,还需要长时间的振荡,其中SD S-CTAB法则最为复杂,需要37和65e二种不3634期刘少华,等:一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA提取方法同的温度处理。

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