RNAi技术在植物基因功能研究中的应用
描述RNA干扰技术在生物科学中的应用
描述RNA干扰技术在生物科学中的应用RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是一种生物学技术,用于沉默或抑制目标基因的表达。
RNAi技术是由特定RNA分子介导的,这些RNA分子可以选择性地靶向特定基因的mRNA,从而阻止目标基因的转录或翻译,最终影响与该基因相关的蛋白质的合成。
RNAi 技术在生物科学中的应用非常广泛,包括基础研究、功能基因组学、疾病治疗和农业等方面。
以下是RNA干扰技术在生物科学中的主要应用:1. 基因功能研究:RNAi技术可以用来研究基因的功能。
通过设计特异性的小干扰RNA(siRNA)或小 hairpin RNA(shRNA),科学家可以选择性地沉默特定的基因,然后观察对应的表型变化。
这有助于了解基因在生物体内的功能和调控机制。
2. 基因治疗:RNAi技术被用于治疗一些遗传性疾病或病毒感染。
通过设计siRNA来靶向病因基因或病毒RNA,可以抑制相关的基因表达,从而减缓疾病进展或抑制病毒复制。
3. 药物开发:RNAi技术在药物开发中被用来筛选和验证候选药物目标。
通过沉默特定基因,可以评估对细胞生存和增殖的影响,从而识别可能的药物靶点。
4. 农业生物技术:RNAi技术在农业领域中用于改良作物。
通过设计siRNA来沉默特定的基因,可以改变植物的性状,如抗虫性、抗病性和改善产量。
1/ 25. 病毒研究:RNAi技术被用于研究病毒的生命周期和传播机制。
通过沉默与病毒相关的基因,科学家可以了解病毒与宿主细胞相互作用的细节。
RNAi技术的广泛应用使其成为生物科学研究中的有力工具,为理解基因功能、治疗疾病和改良生物体提供了重要的手段。
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RNAi技术及其在植物中的应用
RNAi技术及其在植物中的应用什么是RNAi?RNA干扰(RNAi)是由双链RNA(dsRNA)诱导的转录后基因沉默(PTGS),是真核生物中一种进化上高度保守的生物学机制。
在RNAi途径中,dsRNA或发夹结构RNA(hpRNA)被Dicer 酶加工成一个21-23 nt的小RNA双链体(siRNA)。
siRNA的一条链被纳入RNA诱导的沉默复合物(RISC)中,另一条链保留并引导RISC切割与之序列互补的mRNA(图1)。
图1.真核生物中RNAi介导的基因沉默(Majumdar R., 2017)植物中RNAi途径的意义植物中RNAi技术因具有高特异性、高效性、高成功率、高稳定性等特点,被认为是功能基因组学中很有前途的一种基因调控方式,可在不影响其它基因的情况下,以精确的方式下调靶基因的表达。
植物中RNAi在维持基因组完整性和生长发育方面具有重要意义,能对影响作物经济性状的缺陷基因及不良基因进行RNA干扰,实现作物品种改良,还能抵抗引起重大经济损失的病原体、害虫、线虫和病毒的入侵。
研究小RNA在调控基因表达中的作用有助于研究人员探索小RNA在非生物和生物应激反应中的潜力,通过培育抗病、环境胁迫耐受以及高产的优良品种,为作物改良开辟了新的途径。
植物RNAi的技术流程1. siRNA的设计siRNA设计原则:(1)从靶基因起始密码子ATG下游50~100个核苷酸开始设计siRNA序列,越靠近3’端,基因沉默效果越好。
(2)siRNA序列最好为AA(Nn)UU,NA(Nn)UU和NA(Nn)NN也可以,N代表任意碱基,n为碱基数目,大约在19~29 nt之间。
(3)G/C含量在30%~52%之间其基因沉默效果较好。
(4)siRNA序列中避免连续的单一碱基及反向重复序列。
(5)将设计好的siRNA序列在数据库中进行比对,保证siRNA的序列特异性。
2. siRNA的合成和验证siRNA的合成方法主要包括化学合成法、体外转录法、酶消化法、体内转录法。
RNAi技术在植物改良中的应用
M a .2 2 r 01
热 带 农 业 科 学
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第3 2卷 第 3期
Vo . ,No. 132 3
R A 技术在植物改 良中的应用① Ni
喻 时周② 秦 信 蓉 韩 宏仕 杜 才 富⑧
RN A n e fr n e tc noo y h so y a d b sc m e h n s o itre e c e h lg it r n a i c a im f RN A itre e c ,a d atr t n ofp a t n e fr n e n leai ln o
介 绍 了 RA N i技 术 的 研 究 简 史 及 作 用 机 制 . 以 及 R A 技 术在 改 良植 物 的体 系结 构 、培育 不 育系 、调 Ni 控植 物 的颜 色 和香 味 、 长 果实 的货架 期 和在 无 核 延
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K e wor s RN A n e fr n e ;co m p o e e t; p iains y d itre e c r p i r v m n a pl to c
RNA干扰技术在植物基因工程中的应用
RNA干扰技术在植物基因工程中的应用RNA干扰技术(RNA interference,简称RNAi)是一种通过抑制基因表达的方法,在植物基因工程中具有广泛的应用。
这一技术利用双链RNA分子的结构和功能,能够选择性地沉默靶基因,从而实现对植物基因的精确调控。
本文将重点探讨RNA干扰技术在植物基因工程中的应用,并探讨其优势和潜在的挑战。
一、RNA干扰技术的基本原理RNA干扰技术的基本原理是利用双链RNA(dsRNA)的结构和功能,介导靶基因的沉默。
当外源的双链RNA(如siRNA或shRNA)引入植物细胞后,它们被核酸酶Dicer酶切割成长度约为21-25个核苷酸的小分子片段。
这些小片段将与靶基因的mRNA互补结合,通过RNA 诱导的基因静默(RNA induced gene silencing,简称RIGS)途径,导致靶基因的mRNA降解或翻译抑制,从而达到沉默靶基因的目的。
二、1. 基因功能研究通过RNA干扰技术,可以选择性地沉默靶基因,从而研究其功能和作用机制。
通过合成靶基因的siRNA或shRNA,并将其导入植物细胞,可以观察到由于基因静默引起的表型变化,从而揭示基因的生物学功能。
2. 产量提高RNA干扰技术可以用于提高植物的产量和质量。
例如,通过沉默与种子发育相关的基因,可以提高作物的籽粒产量;通过抑制抗性基因的表达,可以增加作物对病害的抗性,提高植物的产量。
3. 抗病虫害RNA干扰技术可以用于植物的抗病虫害育种。
通过静默与病害相关的基因,可以使植物表现出抗病虫的特性。
这种方法比传统的农药使用更环保,对农业生产也具有很大的潜在价值。
4. 脱毒育种RNA干扰技术可以用于植物的脱毒育种。
通过沉默与毒素合成相关的基因,可以降低植物体内毒素水平,使植物更加健康。
这对于一些受毒素污染严重的地区,具有很大的经济和社会效益。
三、RNA干扰技术的优势和挑战1. 优势RNA干扰技术具有高度的特异性和灵活性。
RNAi在植物中的应用
RNAi在植物中的应用RNA沉默是广泛存在于生物中的一种古老现象,是生物抵抗异常DNA的一种保护机制,同时在生物生长发育过程中扮演着基因表达调控的角色。
文章对RNA沉默研究中的几个热点问题进行了介绍,按RNA沉默持续时间的不同对其在植物中应用的方法进行了分析,并重点论述了RNA沉默在植物功能基因组研究、作物品质改良以及抗病毒植物培育等方面的应用及其发展前景。
RNA沉默(RNAsilencing)是一种结合和降解特异mRNA序列的形式,其发现可追溯到1990年,Napoli等]向矮牵牛中导入更多拷贝与粉红色色素合成有关的基因以产生颜色更深的紫色矮牵牛花,结果许多花朵的颜色不但没有加深,反而变成白色或花白色。
因为导入的基因和其同源的内源基因同时都被抑制,所以被称为共抑制(co-suppression)现象。
另外,这种共抑制现象被确认是发生在转录后水平,所以又被称为转录后基因沉默(post-transcrip-tionalgenesilencing,PTGS)。
随后发现在真菌中的消除(quelling)现象以及动物的RNA干扰(RNAinterference,RNAi)现象都属于RNA沉默。
另外,Makarova等在最近的研究发现,在原核生物中同样存在着类似真核生物的RNA沉默机制。
RNA沉默自发现以来,迅速的成为生物学研究的热点。
不论对其机制的研究还是作为一种基因表达抑制技术的应用,RNA沉默都取得了巨大的成功。
本文简要介绍了RNA沉默的产生机制及植物RNA沉默的特异性、RNA沉默的技术特点及其与RNA介导的DNA甲基化的关系等研究热点,并系统论述了RNA沉默技术在植物中的应用。
本文还对RNA沉默技术的操作技术和应用领域进行了阐述,并对RNA沉默的在植物中的应用前景进行了展望。
1 RNA沉默研究中的几个热点问题1.1 RNA沉默的产生及其基本机制RNA沉默是存在于生物中的一种古老现象,是生物抵抗异常DNA(病毒、转座因子和某些高重复的基因组序列)的保护机制,同时在生物发育过程中扮演着基因表达调控的角色,它可以通过降解RNA、抑制翻译或修饰染色体等方式发挥作用。
RNAI原理及应用
RNAI原理及应用RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种基因调控机制,其通过抑制特定基因的转录或翻译过程,实现对基因表达的调控。
RNAi机制首先通过特定的酶将特定基因的mRNA分解为小片段,然后这些小片段与RNA-诱导沉默复合物(RISC)结合,最终导致该基因的特异性沉默。
RNAi技术已经被广泛应用于生物学研究以及治疗疾病的实践中。
以下是RNAi原理和应用的详细解释:RNAi原理:1.RNAi的起源:RNAi最早是在植物系统中被发现的一种基因沉默调控机制,随后发现其在真核生物中也存在。
2. RNA干扰的具体机制:首先,特定的酶(Dicer)将外源双链RNA (dsRNA)或内源的小干扰RNA(siRNA)切割为21-23个核苷酸的小分子(miRNA);然后,这些小分子与RISC结合,形成siRNA-RISC复合物;最后,这个复合物会识别并结合到目标mRNA上,以一种亚完美匹配的方式,引发mRNA的降解或抑制其翻译,从而达到对基因表达的调控。
RNAi应用:1.功能基因组学研究:RNAi可以帮助研究人和动物的基因功能,通过抑制目标基因的表达,可以观察基因敲除后生物体产生的表型改变。
这有助于揭示基因在生物体内的功能和作用机制。
2. 疾病治疗:RNAi技术在药物研发中有着广泛的应用潜力。
通过设计和合成siRNA,可以在细胞内选择性地抑制特定基因的表达,从而治疗一系列遗传病和感染病。
例如,在癌症治疗领域,可使用RNAi技术抑制癌细胞特定的致癌基因,达到治疗癌症的效果。
3.植物基因改良:RNAi技术可用于改良植物的抗感染性、抗虫性、耐盐碱性等性状。
通过抑制特定基因的表达,可以增加植物对胁迫的抵抗能力,提高作物的产量和质量。
4. 遗传治疗:通过将siRNA导入体内,可以干扰基因表达和调节细胞功能。
这种方法被广泛应用于基因治疗、基因靶向和克隆动物等领域。
总结:RNA干扰技术作为一种重要的基因调控方法,已经在生物学研究和治疗疾病的实践中得到广泛应用。
vigs基因沉默原理和rnai沉默
vigs基因沉默原理和rnai沉默VIGS基因沉默原理和RNAi沉默是两种常用的分子生物学技术,被广泛应用于研究植物基因功能。
它们有些相似之处,同时也存在一些差异。
本文将对这两种技术的原理、应用和优缺点进行详细探讨。
1. VIGS基因沉默原理VIGS(Virus-induced gene silencing)是通过病毒侵染植物细胞,诱导宿主植物基因的沉默。
该技术利用了病毒的复制和传播机制,将目标基因序列整合到病毒基因组中,并且在感染的植物细胞中产生可复制的RNA介导的沉默效应。
具体步骤包括:(1)构建VIGS载体:将目标基因的部分序列插入病毒载体,形成VIGS载体。
(2)VIGS载体侵染植物细胞:将构建好的VIGS载体导入病毒感受性植物中,让病毒基因组中的目标基因RNA与宿主植物基因的mRNA互补杂交,导致宿主基因沉默。
(3)基因沉默效应:病毒RNA会在植物细胞中被RNA依赖性RNA 聚合酶复制成多个复制体,随后通过系统性运输到植物全身,触发整个植物的基因沉默效应。
2. RNAi基因沉默原理RNA干扰(RNA interference)是一种保守的基因沉默机制,通过切割目标mRNA分子而将其降解,从而实现对基因表达的调控。
RNAi主要通过siRNA和miRNA两条途径实现。
具体步骤包括:(1)siRNA的产生:长双链RNA被核酸酶Dicer切割成短双链siRNA。
(2)siRNA的介导:siRNA将RISC(RNA诱导的沉默复合体)导入到靶基因mRNA上,使其降解。
(3)miRNA的产生:由miRNA基因转录出的pri-miRNA在细胞核中被核酸酶Drosha切割为pre-miRNA,经过转运到细胞质后被Dicer 进一步切割成短miRNA。
(4)miRNA的介导:miRNA与RISC结合后能够通过完全或不完全互补靶序列的mRNA上结合,从而通过诱导转录后调控蛋白质的翻译或降解。
3. VIGS和RNAi的异同点(1)机制差异:VIGS是依赖于病毒的复制和传播来诱导植物基因沉默,而RNAi是通过siRNA和miRNA介导的沉默机制来调控基因表达。
rnai技术及其应用
rnai技术及其应用一、RNai技术简介RNA干扰(RNAi)是一种广泛存在于真核生物中的基因沉默机制。
通过特定的siRNA或miRNA靶向mRNA,使其降解或翻译受到抑制,从而达到基因沉默的效果。
这项技术具有高效、特异性强、操作简单等优点,近年来被广泛应用于生物学研究和临床治疗领域。
二、RNai技术在基础生物学研究中的应用1. 基因功能研究:通过靶向特定基因进行干扰,观察其对细胞或个体的影响,推断该基因在生物体内所扮演的角色。
2. 基因调控网络分析:利用RNAi技术对关键基因进行干扰,进而分析其对整个调控网络的影响,揭示调控网络中各个组成部分之间相互作用的规律。
3. 药物筛选:利用RNAi技术对大量候选药物进行筛选,鉴定出具有治疗潜力的药物,并为新药开发提供理论依据。
三、RNai技术在临床治疗中的应用1. 肿瘤治疗:RNAi技术可以靶向肿瘤细胞中的癌基因进行干扰,抑制其生长和扩散,从而达到治疗肿瘤的目的。
2. 病毒感染治疗:利用RNAi技术靶向病毒基因进行干扰,阻断其复制和传播,从而达到治疗感染性疾病的目的。
3. 遗传性疾病治疗:RNAi技术可以靶向患者体内异常表达或突变的基因进行干扰,纠正其表达水平或功能异常,从而达到治疗遗传性疾病的目的。
四、RNai技术在农业领域中的应用1. 作物抗逆性改良:利用RNAi技术对作物中与逆境响应相关的基因进行干扰,提高其抵抗逆境能力。
2. 生物防治:利用RNAi技术靶向害虫或致病微生物中关键基因进行干扰,实现对害虫或致病微生物的有效控制。
3. 品质改良:利用RNAi技术靶向作物中与品质相关的基因进行干扰,提高其营养价值和经济价值。
五、RNai技术的发展趋势1. 基于CRISPR-Cas9技术的RNAi:将RNAi技术与CRISPR-Cas9技术相结合,可以实现更精准、更高效的基因编辑和调控。
2. 微型RNA(miRNA)在RNAi中的应用:miRNA是一种短链非编码RNA,具有广泛的生物学功能。
RNAi技术在园林植物遗传育种中的应用前景
d・
科 技 论 坛
R A 技术在园林植物遗传育种 中的应用前景 Ni 伊 春 130 ) 5 0 0 摘 要 :N R A干 扰 技 术 ( N n r rne 简 称 R i 指 将 双 链 R A g( s N 导入 生物 或 细胞 内 , R A it f ec , ee NA ) 是 N l dR A) 7 引起 与 其 同 源 的 m N R A特 异 性降解, 因而抑制其相应基 因表达的过程 。 它具有 高效、 快捷、 特异性强等特点 。 本文从 R A 的发现、 用机 制、 Ni 作 作用特点和 R A 技术在 N i
园林植物遗传育种 中的应用前景等 方面进行 了综述 。 关键 词 : N i作 用机 制 ; R A; 园林 植 物 遗 传 育种 自 19 年 Fr 等首次在线虫 中发现并阐明以来 , N i 98 i e R A 已经在 直 接在 细胞 内引 人 双链 R A 分子 但 还 是 造 成 了基 因沉 默 。 N 3 RN i A 的作 用特 点 其它动物 、 物和真菌中被证实 。 N i 植 R A 所具有的特异性 、 稳定性 、 高 效、 快速 以及不改变基 因组的遗传组成等特性为人们研究未知功能 通过对植物 ( 拟南芥)动物( 、 线虫和果蝇) R A 现象的研究 , 等 N i N i 首先 , N i R A 具有高度 的特 的基因提供 了新的反向遗传学手段 。 在拟南芥和水稻等基因组测序 不难发现 R A 作用具有 以下重要 特点 : 完成后 , N i R A 这一新技术在植物功能基 因组学 研究及植物 的遗传 异性 , 只引起与 dR A同源的 mR A降解 。2 ~ 3 sN N 12 个核苷酸中只要 就可以使该 s N i A序列不对靶 向 mR A起作用。 R N 改 良等方面提供 了一个强有力 的手段 , 同时也为 园林植物遗传育种 改变一个核苷酸 , 其 次, N i R A 抑制基因表达具有很高的效 率 ,仅需少 量的 dR A就 sN 工作 开辟 了更 为 广 阔 的前 景 。 能有效抑制靶基 因表达 。 ema V r 研究 发现要达到相同的抑制连环蛋 1 N i 发 现 R A 的 早在 19 , a o 等把 已知色素基 因置于强启动子后 , 9 0年 N pl i 导人 白基因的 目的 , 反义寡 核苷酸技术 所需浓度 为 2 m l , s N oL 而 i A / R 紫色矮牵牛花中 , 图加深矮牵牛 花的颜色 , 试 结果却 发现花的颜色 则 仅需 要 2 n oL 0m l 。 / 全部或部分变白。这就提示 , 导入的基因和牵 牛花 内源 的着色基 因 此外 , N i R A 具有 系统性( 或可传播性)即 s N , i A可 以在 R A依 R N 都被抑制 , 相似的现象也在线虫 中发现。 9 5 , 乃尔大学的 G o 赖性 R A聚合酶 的作用下 进行 大量扩增 , 19 年 康 u N 并转运 出细胞 , R A 使 Ni 等曾经尝试用反义 R A去 阻断线虫 的 pr 1 因表达 ,结果发现 扩散到整个机体并可以传代 。 N a 基 一 反义 R A的确能 阻断 目的基 因的表 达 ,但作 为对照的正义 R A, N N 4 R A 的应 用 及 在 园 林植 物 育 种 中的 应 用前 景 N i R A干扰 现象在生物体 内普遍存 在 , N 且高度保守 , 被生物学家 虽 不 能 与 活 性 R A 结 合 ,也 照 样 能 引 发 抑 制 。 19 N 9 8年 ,i Fr e和 Tb r 首 次将 双链 R A注 入 线 虫 ,结 果 表 现 出 比单 独 注 入 单链 要 誉为生物体在基 因组水平 上的免疫系统。随着 R A 机制研究 的不 aaa N Ni 强 得 多 的 沉 默 , 且 导致 子一 代 同 源 基 因 的 沉 默 , 也 是 人 们 第 一 断深入 , N 并 这 R A干扰作 为一 种高效 的、 序列特异 的基 因沉 默 , 可在抗 次应用 R A 技术。事实上 , Ni 即使每个 细胞 只注入几个分子的 dR 病毒侵染 、 s— 植物基 因功能分析 、 因组改 良、 基 限制基因组内转座 因子 N A也足以弓起抑制 。 I 随后 H m o d a m n 还发现 , 不仅在线虫中 , 在果蝇 的活 动 等方 面发 挥 重 要 作 用 。 中也存在 dR A诱导 的基 因沉默 ,而且在它们 的后代 中依然表 现 sN 在老鼠、 拟南芥 、 水稻和人 等的基 因组测序完成后 , 生物学研究 沉 默 , 将 这 种现 象 称 为 R A。 并 N i 进入后基因组 时代 。人们研究 的重点放 在基 因的功能注释 , 因的 基 2 RN i 作用 机 制 A的 表达调控及改造 以及基 因间的相互联系研究上。R A 为大规模高 N i 目前 所认 识 到 的 R A 的 分 子 机 制 主 要 是 通 过 对 植 物 、真 菌 、 效及复杂的功能基 因组学研究提供 了一个便捷的平台。利用 R A N i N i 动物等细胞 的研究得到的。其可能的作用机制是 :s N dR A被切割成 在水稻 、 芸薹属和油菜以及烟草上 已经进行了一些基因功能验证 的 2— 5核 苷 酸 的 短 干 扰 R A s N , 过 s N 介 导 的 D A 或 相 关 研 究 , 以说 这 些前 提 工 作 为分 子 生 物 学 更 好 的 应 用 在 园林 植 12 N (i A)通 R i A R N 可 组蛋 白甲基化 , 特异性降解 m N R A及微小 R A( R A) 断蛋 白 物遗传育种工作 中奠定 了基础。 N miN 阻 质 翻译 等 环节 , 而实 现 其 生 物 学 功 能 。这 些 反 应 主要 发 生 在 以 下 从 同时 , 随着生活水平 的提高 , 人们对品质的要求也 1益提高 。 3 例 几个水平上 : 转录基因沉默 、 转录后基因沉默、 翻译水平沉默。 如咖 啡 是 世 界 上 主要 的饮 料 之 一 , 所 含 的咖 啡 因对 于 某 些 过 敏人 它 R A 的作用机制可概括为三个 阶段 : N i 群来说容易使血压升高并诱发心脏病 , 因此全球对于低咖啡因含量 启动阶段 :s N dR A被 Dcr i 酶以一 种 A P依赖 的方式逐步切割 咖啡 的需求 E益增 多。 e T l 虽然说可以用物理或化学的方法来降低咖啡 成 s N 这种双链 s N i A; R i A包 括 约 2 R 0个 碱 基 对 , 每 条 链 的 3 末 中咖啡因的含量 , 这不仅会提高成本 , 且 。 但 而且会 使咖啡 的部分风 味 端都 悬 垂 着 2 未 配 对 碱 基 。 个 丧失 。咖啡因的前提物为可可碱 ,hnrO i 等利用 R A 的方法 Sii ga jo t Ni 效 应 阶段 : 先 s N 聚 集 到 一 种 包 含 着 核 酸 内切 酶 、 切 酶 对 可 可 碱 合 成 酶 进 行 抑 制 ,使 植 株 中 的 咖 啡 因 含 量 比原 来 减 少 了 首 i A R 外 和解旋酶 的复合物上 , 形成诱 导沉 默复合体 R S , IC 然后 s N i A经历 7 %。此外 B zv 等通过 R A 技术成功地对拟南芥和油菜的花器 R 0 yoa Ni 个 A P依赖的解双链的过程激 活 RS 。在 s N T IC i A反义链 的指导 官进行 了改造 , R 创造 出没有花瓣但其它功能完整 的花 。 由此证明 , 通 下 , IC与 目的 m N RS R A互 补 结 合 ,并 特异 性 切 割 mR A, R A断 过 R A 技术来 改变 园林植物的观赏性状是完全可以实现的。 N m N Ni 裂的部位大约在 s N i A互补结合 的中部 。 R 此后 mR A进一步降解 , N 目前就 R A干扰技术在一些粮食作物及经济作物育种工作上 N 导 致 不能 进 行 翻译 过 程 , 而 引 起 目的基 因沉 默 。 从 的 运 用 , 同理 这 一 新 的分 子 技 术 同样 也 可 以 应 用 在 园林 植 物 有 种 sN i A的 扩 增 阶段 : 目前 , 已发 现 有 以下 2种类 型 的 扩增 : R 由 中。 一些影 响重要观赏性状 的基 因可 以通过该技术和其 它育种技术 RS IC剪切产生的单链 s N s i A 的扩增和非正常 m N R R A的扩增 。 实验 相结合 , 鉴定 其功能 、 置等 , 位 有望用于数量性状 的定 位 、 隆以及 克 发 现 , 形 成 的 s N 中 , 一 部 分 并 不 是 直 接来 自于 dR A 的 作图等, 在新 i A R 有 sN 也可以对一些影响重要观赏性状 的缺 陷基 因或不 良基因进 裂解 , 而是通过一种 R A聚合酶的链式反应 。该反应 以 s N 中 行 R A干扰 , N i A R N 抑制其 表达等 。例如 , 我们 可以找到控制叶绿体代谢 的一条链 为引物 , 以靶 mR A为模 板 , R A依 赖的 R A聚合酶 的相关基 因,利用 R A干扰技 术改变质体代谢用 以培育彩色叶观 N 在 N N N ( d P 的作用下 , RR ) 扩增靶 mR A, N 产生新 的 s N i A亚群 ( 称二级 赏植 物。 R 也 同理可 以对花色素代谢途径进行 相关 R A干扰处理 , N 从而 s N , 单链 的具 有 明 显极 性 的反 义 R A, i A)为 R N 而这 些 二 级 s N i A又 产生更多花色品种的园林 花卉。也 可以利�
RNA干扰技术的应用
RNA干扰技术的应用近年来,RNA干扰技术(RNAi)被广泛应用于生物学和医学研究中。
它是利用小的干扰RNA(siRNA)切断或抑制靶向基因的转录和翻译,从而影响基因表达和功能的一种基因沉默技术。
RNAi不仅重要的是基础研究工具,也具有广泛的应用前景,可用于研究基因功能、治疗疾病、植物育种等领域。
在这篇文章中,我将讨论RNA干扰技术的一些应用和未来发展。
1. 基因功能研究RNAi可应用于对物种基因组篡改进行研究,因为它易于特异地沉默基因。
研究人员可使用siRNA或shRNA来沉默基因表达,并探索其功能。
此外,siRNA靶向序列可根据特定的基因序列设计,为研究不同基因家族和生物过程提供了便捷的工具。
因此,RNAi在植物学、昆虫学、神经科学和生长发育等领域的基础研究中广泛应用。
2. 疾病治疗RNAi对治疗疾病的作用越来越多地展现出来。
RNAi技术可用于治疗许多遗传性和获得性疾病,如癌症、肺炎、病毒感染、高胆固醇、遗传性失明等。
该技术可以通过制造专门定制的siRNA 来对特定的靶向基因进行沉默。
在靶向治疗中,研究人员可将siRNA送入人体或动物体内,治疗疾病中编码靶向基因的细胞。
已有很多研究表明RNAi可用于抑制癌症的转移和侵袭,并已开发出临床应用前景广的RNAi疗法。
但是,RNAi仍然面临许多挑战,例如递送难以克服,RNAi非特异性靶向靶标,以及宿主免疫反应等等。
3. 植物育种RNAi技术也在植物育种中发挥了重要作用。
它可用于基因沉默,改变花卉、果实及蔬菜的颜色和外观。
在转基因植物育种领域中,RNAi尤为有用。
组织特异性且RNA干扰剂高度专一的性质也适用于农业生产,如促进作物抗性和产量增加。
最近的一项研究表明,靶向抑制油菜花内皮细胞EXPANSIN基因,可以在根部形成大量侧根,从而提高即将到来的作物产量以及对营养和水分的利用率。
4. 稍微未来的展望RNAi仍需要在许多方面进行改进。
在临床应用中,RNAi限制因素的最大是如何递送siRNA和shRNA。
RNAi技术的原理及应用
RNAi技术的原理及应用原理RNAi(RNA interference)技术是一种通过靶向RNA的降解来抑制基因表达的方法。
这种技术基于细胞内的一个自然免疫系统,该系统可以识别和降解异质RNA分子。
RNAi技术可以用于研究基因功能,发现新的药物靶标,并为基因治疗提供了一种有力工具。
RNAi技术的原理可以概括为以下几个步骤:1.siRNA合成:RNAi技术使用小干扰RNA(siRNA)来诱导RNA降解,siRNA在细胞内的一种酶切后生成双链RNA。
2.RISC复合物的形成:双链RNA结合到RNA诱导沉默复合物(RISC)蛋白上,形成siRNA-RISC复合物。
3.靶向RNA的降解:siRNA-RISC复合物通过辨识靶向RNA的互补序列,导致靶向RNA的降解。
应用RNAi技术在许多领域都有广泛的应用。
下面列举了一些主要的应用领域:功能基因组学研究RNAi技术为功能基因组学研究提供了一种有效的方法。
通过利用RNAi技术沉默特定基因的表达,研究人员可以了解该基因对细胞功能和生物过程的影响。
这种方法可以帮助我们理解基因调控网络以及各个基因在细胞和生物体中的作用。
药物研发RNAi技术为药物研发提供了新的途径。
通过使用siRNA来沉默特定基因的表达,研究人员可以发现新的药物靶标,并研发相应的药物。
这种方法具有高度的特异性和选择性,可以减少非特异性的药物作用,提高疗效。
基因治疗RNAi技术在基因治疗中也有潜在的应用。
通过利用siRNA来抑制异常基因的表达,可以治疗某些遗传疾病。
例如,通过沉默表达异常的突变基因,可以减少与遗传性疾病相关的症状,并提高患者的生活质量。
农业改良RNAi技术在农业领域也有重要应用。
通过利用RNAi技术来靶向沉默特定害虫的基因,可以开发出新型的农药和抗虫作物。
这种方法可以减少农药的使用,降低对环境的污染,提高农作物的产量和质量。
病毒治疗RNAi技术还可以被应用于病毒治疗。
通过利用siRNA来沉默病毒基因的表达,可以抑制病毒的复制和传播。
浅谈RNAi干扰及其在植物转基因研究中的应用
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浅 谈 R A 干 扰 及 其 N i 在 植 物 转 基 因研 究 中 的应 用
◆ 邓祖丽颖
( 郑州幼儿师范 校)
【 摘要】本文综述了 R A干扰技术( N i 中 s N R A ) i A和 m co N R irR A介 导的干扰作用机制和植物 R A 表达载体 的构建 R A 现 象有着复 N i Ni
R A 翻译 , 年 来 也 被 列 为 R A 机 制 的一 部 分 。 N 近 Ni 二 、 基 因 植 物 中 的 RN 转 A沉 默研 究
在 起 始 过 程 阶 段 , 源 长 链 的 双 链 R A( s N 可 以通 过 多 种 方 式 导 外 N dR A) 入 细 胞 。 长 链 的 dR A 被 Dcr酶 切 割 后 , 成 2 —2 n sN i e 变 2 3 t的 短 的 双 链
2 mR A 介 导 的 R i . iN NA m R A是 具 有 5’ 磷 酸 基 团 以及 3’ 羟 基 基 团 的 2 一 单 链 R A, iN 端 端 2 I N 与 病毒感 染、 转座子沉默机 制 中也 会发 生 R A干扰现 象。 目前 在基 因功能 s N N i A的长度相 同, R 但二者 结构不 同 , i N m R A序 列位于 茎环结 构的 茎干部 的研究 中, 该技术成为研究某个基因沉默表达 的有效 工具。R A干扰过程 分 , 这 些 茎 环 结 构 通 常 是 含 有 一 些 突 起 和 内 环 的 不 完 全 发 夹 结 构 。 最 N 而
是一个 由 dR s NA诱导的多 因素 参与 的过程 , 中 s al N 指 s N 其 m lR A( i A和 近 , R 数以百计的 miNA 在人 、 R s 线虫等物种 中被发现 。 目前认 为在 生物体 内 mR iNA) 发挥着核心作 用。本文从 R A干扰机制方面 , N 探讨 了其在 转基 因 miN s 先 由不 确 定 的 聚 合酶 在细 胞 核 内转 录 m R A 基 因 , 生 初 级 转 RA首 iN s 产 植物 中的应用 , 旨在为该技术在转基因中的应 用提供借鉴。
rnai技术的原理和应用
RNAi技术的原理和应用一、RNAi技术的原理RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是一种在生物体内通过特异性降解靶标RNA来抑制基因表达的机制。
RNAi技术利用这种机制,成为研究基因功能、疾病治疗和农作物改良等领域的重要工具。
1. siRNA与miRNARNAi技术主要包含两种类型的RNA:小干扰RNA (small interfering RNA, siRNA) 和微小RNA (microRNA, miRNA)。
siRNA由外源RNA合成,与目标基因的mRNA序列互补,引导RNA诱导的RNA降解复合体(RISC)将目标mRNA降解。
miRNA则是内源性产生的RNA分子,通过RISC复合体靶向调控某些基因的表达。
2. RNA干扰的机制RNA干扰的关键步骤包括:转录、加工和效应。
在转录过程中,DNA被转录成为RNA前体(pre-mRNA),其中含有外显子和内含子。
RNA加工过程中,RNA干扰的主要分子Dicer将pre-mRNA切割成为短的双链RNA分子(siRNA和miRNA)。
在效应阶段,双链RNA分子导入RISC复合体,其中一个链被剪切并去除,另一个链则被完整保留,它将与目标mRNA互补,导致目标mRNA的降解或抑制翻译。
二、RNAi技术的应用RNAi技术在基因功能研究、药物开发和农作物改良等领域具有广泛应用。
1. 基因功能研究通过使用RNAi技术,可以靶向抑制特定基因的表达,从而研究该基因在生物体内的功能。
通过观察目标基因沉默后的表型变化,可以了解该基因在生物体内的作用。
2. 疾病治疗RNAi技术在疾病治疗方面具有潜力。
通过靶向特定的疾病相关基因,可以抑制目标基因的表达,进而抑制疾病的发展。
例如,将siRNA引入乳腺癌细胞中,可以有效降低乳腺癌相关基因的表达,抑制癌细胞的生长。
3. 药物开发RNAi技术在药物开发中可以用于筛选和验证药物靶点。
通过使用siRNA库,可以快速筛选出对特定疾病相关基因表达具有抑制作用的siRNA序列,从而为药物研发提供候选目标。
RNA干扰技术在生物领域中的应用
RNA干扰技术在生物领域中的应用近年来,随着科技的不断升级,越来越多的新技术被应用于生物学研究中,其中RNA干扰技术就是其中一种非常重要的技术。
那么,什么是RNA干扰技术呢?它又有哪些应用呢?本文将简单介绍一下RNA干扰技术及其在生物领域中的应用。
一、RNA干扰技术简介RNA干扰技术又称RNAi技术,是一种革命性的基因沉默技术。
它利用RNA分子的特定序列来识别和逐步降解特定基因的mRNA分子,从而抑制这些基因的表达。
RNA干扰技术最初是在简单生物体中发现的,但目前已经广泛应用于大多数生物体的基因功能研究。
二、RNA干扰技术的原理RNA干扰技术的实现需要借助siRNA和miRNA这两种RNA分子。
siRNA是双链RNA分子,可以通过RNA依赖性RNA酶(cleavage-specific ribonuclease)的作用切割自由的mRNA,从而防止mRNA被转录成蛋白质。
miRNA是较短的小分子RNA,与特定mRNA的3'非翻译区域结合,从而防止mRNA进一步被转录成蛋白质,从而实现基因表达的抑制。
三、RNA干扰技术的应用RNA干扰技术可以在不同层面上影响基因表达,因此可以用于许多生物学实验中。
以下是RNA干扰技术在生物领域中的几个应用:1.重点基因的沉默RNA干扰技术可以针对特定基因进行沉默,从而研究这些基因在生理过程中扮演的角色。
例如,破坏某些基因可使显眼的突变发生,这有助于揭示该基因在发育和其他生物过程中的作用。
2.病理物质的抑制RNA干扰技术可以用于识别并抑制某些病理物质。
根据预测,RNAi技术在基于RNA的疗法方面有非常重要的应用前景。
例如,RNA干扰技术可以在肝炎、病毒感染、癌症和糖尿病等疾病的治疗中发挥作用。
3.药物筛选RNA干扰技术可以用于筛选潜在的治疗物质。
比如,在研究基因和药物之间的相互作用时,可以先沉默某个基因,然后观察药物对该基因表达的影响。
4.转基因作物的研究RNA干扰技术也有可能用于转基因作物的研究。
RNAi技术在转基因农作物中的应用
RNAi技术在转基因农作物中的应用随着全球人口的增长和环境的变化,食物安全和农业可持续性成为全球关注的话题。
转基因技术带来了新的机遇和挑战,其中RNA干涉技术(RNAi)成为了转基因农作物研究的热点之一。
RNAi技术是通过RNA分子靶向破坏基因表达而实现基因沉默的一种技术。
在植物中,RNAi技术可以用于产生抗虫、抗病、提高产量、改善品质等方面的转基因农作物。
一、抗虫转基因农作物许多昆虫会通过进食植物来获取营养,然而一些昆虫会摄入植物中的毒素而死亡。
转基因技术可以利用RNAi技术来生产这些毒素,从而让植物本身具备抗虫能力。
例如,棉花一直是重要的经济作物之一,但由于棉铃虫的侵袭而导致了巨大的损失。
科学家通过RNAi技术把棉铃虫的RNA适配体(RNAi的关键组件之一)合成到了棉花中,从而通过RNA 干扰的效应来杀死棉铃虫。
二、抗病转基因农作物RNAi技术也可以用来产生抗病转基因农作物。
例如,在早熟禾中,许多病毒的基因组是由RNA分子组成的。
科学家通过RNAi技术来干扰病毒RNA分子的复制和转录,从而让早熟禾对某些病毒具有抵抗力。
同样地,水稻条斑病是导致水稻减产和品质降低的一个主要病害。
科学家通过RNAi技术来抑制病原菌在水稻中的生长和繁殖,从而让水稻对条斑病具有抵抗力。
三、提高产量、改善品质的转基因农作物除了利用RNAi技术产生抗病、抗虫转基因农作物,RNAi技术也可以提高产量、改善品质。
例如,水稻是全球最重要的粮食作物之一,但其稻谷中含有过量的淀粉和过少的这一丝质质量很低。
科学家通过RNAi技术来抑制淀粉合成的关键基因,从而让水稻籽粒拥有更多的这一丝质和更少的淀粉,从而提高了水稻的营养价值。
同样的,苹果、巧克力等作物也可以通过RNAi技术创造有更好的口感和更高的营养价值。
总的来说,RNAi技术在转基因农作物的研究中具有巨大的潜力。
在保证食品安全的前提下,RNAi技术可以用于生产更加健康,更加高产的农作物,以满足不断增长的人口需求和环境挑战。
RNAi技术在植物基因功能研究中的应用
工作 研 究
《 现代 农业 科技 } 07年第 1 期 20 8
R A 技术在植物基 因功能研究 中的应用 N i
黄 丹莹 1 , 2
(揭 阳职 业 技 术 学 院 . 东 揭 阳 5 20 华 南农 业 大 学 生 命 科 学 学 院 ) ’ 广 20 0;
基 因序 列标 签 ( T)] GS [ 4 。 31 植 物体 中 的 l Ai 导方 法 . 诱
对 模 式 生 物 的 研 究 发 现 [, 物 体 内 外 源 或 内 源 的 2生 1 dRNA经酶切 . s 可形 成具 有 5 末端 磷酸 基 、 ’ ’ 3 末端 羟基 和 2 个突 出 的单 链核 苷酸 的信 号 分子 s i RNA, 诱发 RNA 机 制 。 i 最近 研究 中还发现 , 植物 中除 了转 录后水 平 沉默 ( TG ) 在 P S, RN 也能在 基 因 的转录水 平 ( S 上发 挥作 用 。 TG )
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R i 术 是将人 工合 成或 载体 表达 的小 的双 链 R NA 技 NA
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植物RNA干扰技术的研究进展及应用前景
·44·工 作 研 究农业开发与装备 2017年第5期摘要:RNA干扰(RNA interference,RNAi)是一种重要的基因沉默现象,已经被应用于植物的育种研究中。
主要综述了植物RNAi 技术的研究进展及在植物中的应用和展望。
关键词:RNA干扰;植物;前景RNA干扰是植物在长期进化过程中形成的一种重要防御机制,RNA干扰技术在植物遗传改良、育种等方面有着广阔的应用前景,该技术在农业各领域将发挥越来越大的作用。
1 植物RNAi技术的研究进展RNAi现象最初是在植物中发现的,当时被称为“共抑制”。
1990年,Napoli等人尝试在紫色矮牵牛中引入查尔酮合酶基因提高查尔酮合成酶过量表达,从而达到加深花瓣的颜色的目的,但结果却出人意料,花瓣颜色不但未加深,而且还出现了紫白相间、灰白、全白的花瓣,当时他们称之为基因的共抑制(co-suppression),指被引入的外源基因和同源内源基因表达同时减弱的现象。
直到1998年,Waterhouse等发现,植物在被病毒感染后,能同时产生与病毒基因组同源的正义和反义RNA的植物比那些只能产生正义或反义RNA的植物能更有效地抵御病毒的入侵,结果表明在植物中双链RNA分子能诱导PTGS的现象发生。
同年,Fire等在研究RNAi所需的结构和传递条件的试验中发现,把dsRNA正义链和反义链的混合物注入线虫体内,比注入单独的任意一个正义链或反义链的效果均要好。
通过反义RNA与正链RNA形成双链RNA 特异性地抑制内源目的基因的现象叫做RNA干扰,它通过人为地引入与内源目的基因具有相同序列的双链RNA,从而诱导内源目的基因的mRNA降解,达到阻止基因表达的目的。
RNAi主要有三个步骤:第一个是启始阶段,即内源或外源dsRNA经核酸酶切割产生21~23bp的siRNA;第二个是效应阶段,即siRNA与RNA诱导沉默复合物RISC(RNA-induced silencing complex)结合共同降解靶mRNA。
RNA干扰在植物保护和生产上的应用
RNA干扰在植物保护和生产上的应用RNA干扰(RNA interference,简称RNAi)是一种基因调控机制,能够通过特定的RNA分子干扰位于靶基因上的mRNA从而抑制基因的表达。
这种技术被广泛应用于植物保护和生产领域,已经成为植物科学研究和生产应用的重要工具。
一、 RNA干扰的基本原理和机制RNA干扰主要由两种RNA分子产生,即小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)和微小RNA(microRNA,miRNA)。
这两种RNA分子都是由长链RNA(long RNA)分解而来,具有一定序列特异性,可以在靶基因的mRNA上结合并引发剪切作用或翻译抑制。
其中siRNA是由外源基因体系合成的双链RNA,在细胞内切割成20-25个核苷酸左右的小片段,具有强烈的靶向特异性;而miRNA主要来自内源基因体系的一些片段,在细胞内成熟后与Dicer、Argonaute等核酸酶结合成miRNA-RISC复合物,介导靶基因的翻译抑制。
RNA干扰的机制基于RNA分子的序列互补性。
当siRNA或miRNA与mRNA的互补序列匹配时,这些RNA分子就能与mRNA形成二级结构。
对于siRNA,主要与RNA诱导沉默复合物(RISC)结合后,介导靶mRNA的核糖核酸水解降解或翻译抑制;而对于miRNA,主要与miRNA-RISC复合物结合后介导靶mRNA 的翻译抑制。
这些过程都基于精确的靶向识别和序列匹配。
二、 RNA干扰在植物保护领域的应用RNA干扰技术在植物保护领域的应用有很多,其中包括基因沉默和基因免疫两方面。
基因沉默是指通过RNA干扰抑制目标基因的表达,从而影响其功能,如在植物中控制瘟疫病、白粉病等病害的基因沉默研究;而基因免疫则是指利用RNA干扰技术提高植物抵御病害的能力,如在植物中引入外源siRNA和miRNA靶向病毒、细菌等病原体的研究。
例如,基于RNA干扰技术研究的棉铃虫宿主植物基因GhPDS,能够减少布氏杆菌及其内毒素致病的危害。
RNAi的分子机制及其在基因靶向治疗中的应用
RNAi的分子机制及其在基因靶向治疗中的应用RNA干扰技术(RNAi)是一种重要的基因调控手段,通过诱导RNA分子与靶标mRNA一级互补配对,引发靶标mRNA的降解或翻译抑制,从而实现靶向基因调控和基因治疗。
RNAi技术已经被广泛应用于植物、动物和人类等领域,具有广泛的应用前景和良好的开发前景。
一、RNA干扰的分子机制RNAi的分子机制主要包括siRNA和miRNA两种,它们在细胞内作用的途径微不相同。
研究表明,RNAi的实现至少包括三个关键步骤:启动、放大和执行。
启动阶段,外源或内源均可以产生一个长条形的双链RNA分子,称为干扰RNA(dsRNA)。
在先天免疫反应中,干扰RNA可以被通过Toll样受体的免疫检测效应分子(TRIF)或联合酶分泌1α(RIG-1)识别并结合,然后TRIF引起IFN-γ的激活,进而出现自体免疫反应。
但是,当干扰RNA的长度不足20个核苷酸时,它就不能启动RNAi反应。
放大阶段,干扰RNA链被核酸酶III酶切并处理成长度约为21-23个核苷酸的短干扰RNA(siRNA),这些siRNA成为扩大干扰信号的基础。
siRNA的一端将与AGO蛋白结合,AGO蛋白是核酸水平上的一种蛋白,具有RNA解旋酶活性,可在靶mRNA上识别并结合siRNA与AGO蛋白复合物。
执行阶段,siRNA与AGO蛋白形成的复合体(RISC)可识别靶标mRNA并切割它。
复合物中的siRNA链将氢键与靶mRNA上的互补RNA链结合,将AGO蛋白降解靶mRNA链,从而通过RNAi调控基因表达。
二、 RNAi在基因靶向治疗中的应用RNAi技术具有较高的特异性、灵敏性和基因选择性,能够在治疗中实现高效的基因选择性治疗。
它在基因靶向治疗和临床转化研究中发挥着重要的作用。
(一)抗癌治疗RNAi技术可以通过siRNA的设计和构建实现靶向抑制多种癌症细胞的生存和增殖。
例如,在肺癌治疗中,siRNA可针对EZH2和BCL2L12等靶标基因进行干扰治疗,实现癌细胞的快速消亡,从而实现肺癌的治疗。
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RNAi技术在植物基因功能研究中的应用
摘要RNAi技术是研究基因功能的重要工具。
其原理是对某个已知基因,设计诱导其沉默的dsRNA,通过合适手段导入细胞或机体使产生干涉效应的信号分子siRNA,导致基因表达水平下降或完全沉默。
通过基因表型变化,鉴定该基因功能。
从RNAi的研究背景和作用机制出发,对近年来利用RNAi技术研究植物基因功能的概况、诱导方法和载体作一综述。
关键词基因沉默;RNAi技术;植物基因功能
1RANi的研究背景
1998年,Fire等[1]发现,过去利用正反义RNA阻断基因表达都是因体外制备的单链RNA中污染极少量双链RNA(dsRNA)所引起的,并发现在线虫中导入dsRNA,mRNA明显减少,推论存在某种机制特异地破坏降解内源mRNA,导致某个基因沉默,即转录后基因沉默(PTGS)。
在此情况下,启动子是活跃的但不能正常积累mRNA。
这种现象被称为RNA干涉(RNAi)。
研究表明RNAi 现象广泛存在大多数真核生物中,起到自行监控细胞中异常的mRNA、封闭该基因表达、抵御病毒感染及阻断转座子的作用。
RNAi技术是将人工合成或载体表达的小的双链RNA(siRNA)导入真核细胞,促使内源RNA降解,高效特异阻断体内特定基因的表达,诱使细胞表现出特定基因缺失表型,获得功能丧失或降低的突变体。
RNAi技术具有高度的特异性和高效的干扰活力,是研究基因功能的强有力的工具而被广泛应用。
2RNAi的作用机制
对模式生物的研究发现[2],生物体内外源或内源的dsRNA经酶切,可形成具有5’末端磷酸基、3’末端羟基和2个突出的单链核苷酸的信号分子siRNA,诱发RNAi机制。
最近研究中还发现,在植物中除了转录后水平沉默(PTGS),RNAi也能在基因的转录水平(TGS)上发挥作用。
2.1酶的作用
参与RNAi发生的Dicer酶特异识别dsRNA,该酶依赖ATP,能将转基因和
病毒感染等引入的dsRNA,逐步切割成含21-23个核苷酸siRNA,启动细胞内RNAi反应。
RNAi过程的另一种重要的酶是RNA指导的RNA聚合酶(RdRP)。
RdRP的作用,使进入细胞内的dsRNA数量呈指数级扩增,RNAi效应得以放大。
故少量dsRNA可使大量靶mRNA大幅度下调。
2.2RNAi过程
dsRNA进入细胞后,在Dicer酶作用下被裂解成siRNA,双链解开为单链,并和某些蛋白质相结合形成RNA诱导的沉默复合体(RISC)。
在ATP的作用下,活化解链siRNA指导活化的RISC分裂靶mRNA。
另外,在RdRP作用下,以siRNA为模板合成mRNA互补链,结果mRNA变成dsRNA,在Dicer酶的作用下被切成siRNA,重复进行分裂靶mRNA。
3RNAi技术在植物基因功能方面的研究
RNAi被生物学家称为生物体在基因组水平上的免疫系统,也为植物基因功能的研究提供了新的思路和技术平台,即利用RNAi技术进行逆向基因分析。
针对某个已知的基因,设计可诱导其沉默的双链RNA,通过合适的手段导入细胞或机体,使该基因表达水平下降或完全沉默。
观察基因表型的变化,鉴定基因在基因组中的功能。
这仅仅是使表达暂时降低或抑制,基因的信息仍是完整的。
最初在植物中研究RNAi的实验是使水稻中报告基因GUS沉默,来比较正义链、反义链及dsRNA诱导RNAi效率的高低。
近年来利用RNAi技术在水稻、拟南芥、芸薹属、油菜、烟草及棉花上,已经进行了一些基因功能验证的相关研究[3]。
其中研究最深入的是应用RNAi技术进行大规模拟南芥功能基因组的分析,以获得拟南芥全基因组高质量的基因序列标签(GST)[4]。
3.1植物体中的RNAi诱导方法
研究表明,在植物体中,信号分子siRNA可通过植物的维管系统运输。
通过韧皮部进行长距离运输或通过胞间连丝进行细胞与细胞之间的转运。
将目标基因特异性序列以正向和反方分别插入标记基因或内含子的5’端和3’端,再在一端连接一个启动子,用转基因技术将反式重复的外源基因导入生物体,诱导表达发夹结构的转录产物RNA(iphRNA),能产生稳定遗传的RNAi现象[5],其诱导目的基因沉默效率高,适用性广,应用潜力大。
dsRNA或iphRNA能通过以下几种方法呈递到植物体内。
3.1.1微弹轰击法。
将dsRNA或含内含子的发夹结构RNA(iphRNA)表达载体显微注射入植物体内。
3.1.2农杆菌介导法。
将带有能转录成ihpRNA的反式重复的外源基因的T-DNA质粒,通过农杆菌介导整合到植物基因组上。
3.1.3病毒诱导基因沉默(VIGS)。
目标序列整合入病毒基因序列,通过农杆菌介导转化ihpRNA表达。
3.2相关的干涉载体
Helliwell及其同事利用Invitrogen公司的Gateway重组克隆技术,构建高通量基因沉默的载体系列pHELLSGATE,
包括全部拟南芥基因组的ihpRNA转基因系[7]。
澳大利亚的CSIRO公司也构建出多种适用于禾本科植物的RNAi载体——pHannibal和pKannibal质粒载体系列[7]。
还有用于高通量植物功能基因组构建的载体系列,包括适合组成型表达、诱导型异常表达的GUS或GFP融合蛋白双元载体,和以烟草花叶病毒为基础构建的高通量VICS载体系列。
新载体的开发加快了植物功能基因组的研究。
3.3RNAi为注释和认识同源基因及功能提供了快速、高效的鉴定方法
比较接近的物种,可通过比较基因组加快研究进度。
利用传统基因敲除或反义RNA的方法使基因沉默来研究基因家族的功能,往往难以达到理想效果,但应用RNi技术能更好地研究同源基因。
Frankish[4]使用RNAi的方法,证实通过合理设计双链RNA,可有效地同时沉默1个基因家族,为多倍体物种的功能基因组学研究指明了方向。
4RNAi技术在植物功能基因组研究中的应用展望及挑战
RNAi现象在植物体内能以孟德尔方式遗传,高度的特异性高效干扰活力,使得RNAi技术在植物学各个研究领域得到广泛应用。
但RNAi技术应用于高通量的植物功能基因组学的研究也有一定的限制。
首先,目的基因序列必须是已知,随着基因组和EST测序计划的增加,受序列方面的限制将会减少;其次,dsRNA 限制了高通量方法的应用,目前只有少数植物能被成功转化,稳定表达ihpRNA。
因此,必须改进植物基因干涉载体的转化方法,加快新载体的开发;第三,并非所有基因都可被沉默,表达水平低的基因RNAi现象不明显。
对多因一效基因或同源性较高的基因家族,干涉会同时作用这些基因,沉默表型难以鉴定;另外,基因被沉默的表型与转基因时所引起的插入突变表型,有时难以区别。
RNAi作为后基因组时代基因功能验证和表达调控分析的新技术,有着不可估量的应用价值。
可以预见,随着RNAi技术的不断完善,植物基因功能的研究和应用将取得更大成果。
5参考文献
[1] FIRE A,XU S,MONTGOMERY M,KOSTAS S,et al.Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans[J].Nature,1998,391:806-811.
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[3] NANCY A E.RNA goesmobile[J].Plant Cell,2002(14):1433-1436.
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