关于流式细胞术的学习

1、MFI和GFI的意义？

Geo Mean，叫做几何均数（geometric mean），常用于等级资料和对数正态分布资料，和常用的算数均数（mean）的计算方法不同。“ %total或者%gate的结果”代表的是百分率，即细胞占总体细胞或者是门内细胞的百分比；用百分比作为统计指标，适用于荧光表达较强的指标。我看到你的流式图上，检测样本的荧光强度不是很强，属于弱表达的指标，若用百分率统计，就是会失去一部分弱阳性的数据。我建议可以用平均荧光强度（也就是 mean值）作为统计指标，比较荧光强度的变化。

2、FCM检测表达结果到底是用百分比还是MFI？我作出是单峰，原本我觉得用MFI表示较好。但我做的2个蛋白很奇怪，一个表达率高，但MFI值低；另一个表达率低，但MFI值高。我又作了SYBR GREEN 定量PCR，发现mRNA 的表达基本与百分比相符，而与MFI值不太一致。

个人认为如果有明显阴性细胞群和阳性细胞群，应计算百分比；无明显分群，仅荧光强度发生变化的应该用MFI。如果是整体峰移（或者叫单峰），那么根本不存在MFI之外的任何合理的指标，不管MFI跟其它指标吻合度如何，这就是客观数据、客观事实。

3、请问下表中流式细胞仪给出的平均值是什么意思，是怎样得到的，有些文献中提到“fluorescence per cell"，是下面的mean值吗，还是要用mean值除以第1栏的细胞数events，才能得到fluorescence per cell ？

mean 值就是每个细胞的平均荧光强度，不用再除细胞数。这只是个相对值，如果求绝对值，应用已知荧光剂浓度值对应仪器给出的mean值，做标准曲线。以后你得到的mean值，就可以根据这条标准曲线查出真正的荧光浓度值。