06---原核生物基因表达调控
第六章 原核生物表达调控
第一节概述围绕基因表达过程中发生的各种各样的调节方式都通称为基因表达调控(gene regulation或gene control)。
几个基本概念1、顺式作用元件和反式作用因子:基因活性的调控主要通过反式作用因子(通常是蛋白质)与顺式作用元件(通常在DNA 上)相互作用而实现。
顺式作用元件是指对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其自身同处在一个DNA分子上的基因;同时,这种DNA序列通常不编码蛋白质,多位于基因旁侧或内含子中,如启动子和终止子,都是典型的顺式作用元件。
反式作用因子是能调节与它们接触的基因的表达的各种扩散分子(通常是蛋白质),如RNA聚合酶、转录因子。
2、结构基因和调节基因:结构基因(structural gene)是编码蛋白质或RNA的基因。
细菌的结构基因一般成簇排列,多个结构基因受单一启动子共同控制,使整套基因或都表达或都不表达。
调节基因(regulator gene)是编码合成那些参与其他基因表达调控的RNA或蛋白质的特异DNA 序列。
调节基因编码的调节物质通过与DNA上的特定位点结合控制转录是调控的关键。
比如:它能使结构基因在需要某种酶时就合成某种酶,不需要时,则停止合成,它对不同染色体上的结构基因有调节作用。
调节物与DNA特定位点的相互作用能以正调控的方式(启动或增强基因表达活性)调节靶基因,也能以负调控的方式(关闭或降低基因表达活性)调节靶基因。
DNA位点通常位于受调节基因的上游,但也有例外.3、操纵基因和阻遏蛋白操纵基因(operator)是操纵子中的控制基因,在操纵子上一般与启动子相邻,通常处于开放状态,使RNA聚合酶能够通过并作用于启动子启动转录。
但当它与调节基因所编码的阻遏蛋白结合时,就从开放状态逐渐转变为关闭状态,使转录过程不能发生。
阻遏蛋白(aporepressor)是负调控系统中由调节基因编码的调节蛋白,它本身或与辅阻遏物(corepressor)一起结合于操纵基因,阻遏操纵子结构基因的转录。
第十章原核基因表达调控
DNA序列(除调节基因以外的所有基因)。
• 特点: (1)含有2个以上的基因 (2)各结构基因串连排列,组成结构基因群
PlacI
lacI
Plac Olac
lacZ lacY lacA
(3)多个结构基因的DNA被转录成多顺反子mRNA
(4)每个结构基因是一个连续的开放读框
(5)至少在第一个开放读框5’侧具有核糖体结合位点, 核糖体识别并结合RBS ,起始翻译。
沉默子(silencer):可降低基因启动子转录活性的一段DNA 顺式元件。与增强子作用相反。
反式作用因子(trans-acting factor)又称为分子间作用因
子,指一些与基因表达调控有关的蛋白质因子。
反式作用因子与顺式作用元件之间的共同作用,才能够达 到对特定基因进行调控的目的。
原核生物中的反式作用因子主要分为特异因子、激活蛋白
发现:
1961年
Jacob and Monod ---乳糖操纵子模型
细菌转录调控的最初概念
操纵子(operon)的基本组成 结构基因、调节基因、操纵元件
PlacI
lacI
Plac Olac
lacZ lacY lacA
Control element Structural genes
• 结构基因:可编码非调控RNA或蛋白质的一段
基因的表达严格按特定的时间顺序发生,称之为基因表达
的时间特异性。
多细胞生物基因表达的时间特异性又称阶段特异性(stage specificity)。
空间特异性(spatial specificity)是指多细胞生物个体在某一 特定生长发育阶段,同一基因的表达在不同的细胞或组织 器官中,从而导致特异性的蛋白质分布于不同的细胞或组
第十章原核生物基因表达的调控
表 16-4 E.coliσ 因子识别不同保守序列的启动子 基因 分子量 70KD 32KD 24KD 54KD 28KD 功能 普遍 热休克 热休克 氮饥饿 产生鞭毛 -35 序列 TTGACA CCCTTGAA ? CTGGNA CTAAA 间隔(bp) 16~18 13~15 ? 6 15 -10 序列 TATAAT CCCGATNT ? TTGCA GCCGATAA
基本概念
1.操纵子(operon)
很多功能上相关的结构基因在染色体上串连排列,由 一个共同的控制区来操纵这些基因的转录。包含这些结构 基因和控制区的整个核苷酸序列就称为操纵子(operon)。
一个完整的操纵子主要包括启动子、操纵基因、结构 基因和终止子。
2. 阻遏物和激活物(reperssor and activator)
2. 基因表达的极性效应
•在正常情况下原核基因表达时,其转录出来的mRNA随 即进行翻译,这时整个mRNA都覆盖着核糖体, ρ因子 无法接近mRNA,而RNA聚合酶早已越过前面的基因的 依赖ρ因子的终止子,所以转录实际上并不停止,而是继 续转录后续基因。如果在某一基因的依赖于ρ的终止子之 前发生无义突变,核糖体便从无义密码子上解离下来,翻 译停止,于是ρ就可以自由进入RNA并移动,直到赶上停 留在终止子上的RNA聚合酶,结果使RNA聚合酶释放, 不能再转录下游基因。
第十章 原核生物基因 表达的调控
生物的遗传信息是以基因的形式储藏在细 胞内的DNA(或RNA)分子中的。随着个体 的发育,DNA有序地将遗传信息,通过转 录和翻译的过程转变成蛋白质,执行各种 生理生化功能,完成生命的全过程。从 DNA到蛋白质的过程,叫做基因表达 (gene expression),对这个过程的调节 就称为基因表达调控(gene regulation或 gene control)。
《原核生物基因表达调控》练习题及答案
《原核生物基因表达调控》练习题及答案一、名词解释1.基因表达调控答案:所有生物的信息,都是以基因的形式储存在细胞内的DNA(或RNA)分子中,随着个体的发育,DNA分子能有序地将其所承载的遗传信息,通过密码子-反密码子系统,转变成蛋白质或功能RNA分子,执行各种生理生物化学功能。
这个从DNA到蛋白质或功能RNA的过程被称之为基因表达,对这个过程的调节称之为基因表达调控。
2.组成性基因表达答案:是指在个体发育的任一阶段都能在大多数细胞中持续进行的基因表达。
其基因表达产物通常是对生命过程必须的或必不可少的,一般只受启动序列或启动子与RNA聚合酶相互作用的影响,且较少受环境因素的影响及其他机制调节,也称为基本的基因表达。
3.管家基因答案:某些基因产物对生命全过程都是必须的获必不可少的。
这类基因在一个生物个体的几乎所有细胞中均表达,被称为管家基因。
4.诱导表达答案:是指在特定环境因素刺激下,基因被激活,从而使基因的表达产物增加。
5.阻遏表达答案:是指在特定环境因素刺激下,基因被抑制,从而使基因的表达产物减少。
6.反式作用因子答案:又称为分子间作用因子,指一些与基因表达调控有关的蛋白质因子。
它们由某一基因表达后通过与特异的顺式作用元件相互作用,反式激活另一基因的转录。
7.操纵子答案:是指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元。
8.SD序列答案:存在于原核生物起始密码子AUG上游7~12个核苷酸处的一种4~7个核苷酸的保守片段,它与16S rRNA 3’端反向互补,所以可将mRNA的AUG起始密码子置于核糖体的适当位置以便起始翻译作用。
根据首次识别其功能意义的科学家命名。
9.阻遏蛋白答案:是一类在转录水平对基因表达产生负控作用的蛋白质,在一定条件下与DNA结合,一般具有诱导和阻遏两种类型。
在诱导类型中,信号分子(诱导物)使阻遏蛋白从DNA释放下来;在阻遏类型中,信号分子使阻遏蛋白结合DNA,不管是哪一种情况,只要阻遏蛋白与DNA结合,基因的转录均将被抑制。
第14章 原核生物基因表达调控
第14章原核生物基因的表达调控重点:操纵子的结构特点和功能;乳糖操纵子的正负调控;色氨酸操纵子的衰减作用。
难点:色氨酸操纵子的衰减作用。
第一节基因调控的基本定律一、基因调控水平二、基因和调控元件三、DNA结合蛋白一、基因调控水平基因表达的调控可以发生在DNA到蛋白质的任意节点上,如基因结构、转录、mRNA 加工、RNA的稳定性、翻译和翻译后修饰。
二、基因和调控元件基因:是指能转录成RNA的DNA序列。
结构基因:编码代谢、生物合成和细胞结构的蛋白质。
调节基因:产物是RNA或蛋白质,控制结构基因的表达。
其产物通常是DNA结合蛋白。
调控元件:不能转录但是能够调控基因表达的DNA序列。
三、DNA结合蛋白调控蛋白通常含有与DNA结合的结构域,一般由60-90个氨基酸组成。
在一个结构域中,只有少数氨基酸与DNA接触。
这些氨基酸(包括天冬氨酸、谷氨酸、甘氨酸、赖氨酸和精氨酸)常与碱基形成氢键,或者与磷酸核糖骨架结合。
根据DNA结合结构域内的模体,可以将DNA结合分成几种类型(图16.2)。
第二节大肠杆菌的乳糖操纵子一、操纵子结构二、正负调控三、乳糖操纵子四、lac突变五、正控制一、操纵子结构原核和真核生物基因调控的主要差异在于功能相关的基因的组成。
细菌的功能相关的基因常常排列在一起,并且由同一启动子控制。
一群一起转录的细菌的结构基因(包括其启动子和控制转录的额外序列)称为操纵子。
二、正负调控转录水平上的调控主要有两种类型:负调控:gene ON 阻遏蛋白 OFF正调控:gene OFF 激活蛋白 ON诱导:活性阻遏蛋白 失活诱导因子+非活性激活蛋白 活性阻遏:失活阻遏蛋白 活性共阻遏蛋白+活性激活蛋白 失活三、乳糖操纵子乳糖操纵子是诱导型操纵子,当诱导物不存在时,阻遏蛋白结合到操纵序列上并阻止转录;当诱导物存在时,阻遏蛋白与诱导物结合后失去活性,转录才得以进行。
四、lac突变为了鉴定乳糖操纵子各个成分的功能,Jacob和Monod做了细菌的接合实验,其中供体菌的F’因子上也带有乳糖操纵子。
原核生物基因表达调控
Repressor
cAMP
CAP
葡萄糖不存在,乳糖存在,阻遏蛋白失活,cAMP+CAP与CAP位点结合结合,促进基因转录
The Lac Operon: III. 葡萄糖和乳糖都存在
Repressor
RNA Pol.
CAP Bindin
g
Promoter
Operator X
LacZ
Repressor负调节与正调节协调合作
• 阻遏蛋白封闭转录时,CAP不发挥作用 • 如没有CAP加强转录,即使阻遏蛋白从操作基因上解聚仍无转录活性
3)正调控和负调控
正调控(positive control)
在没有调节蛋白质存在时基因是关闭的,加入某种调节蛋白后基因活性就被开启,这样的调控为正转录 调控。
调节基因
操纵基因
结构基因
调节蛋白
mRNA 酶蛋白
负调控(negative control)
在没有调节蛋白质存在时基因是表达的,加入这种调节蛋白质后基因表达活性便被关闭,这样的调 控负转录调控。
2)结构基因和调节基因
➢ 组成基因/管家基因(constitutive gene, housekeeping gene)是指不大受环境变动而持 续表达的一类基因。如DNA聚合酶,RNA聚合酶等代谢过程中十分必需的酶或蛋白质的基因 。 ➢调节基因(regulated gene)指环境的变化容易使其表达水平变动的一类基因。如:不同生 长发育时期表达的一些基因。
• 别乳糖是lac操纵子转录的活性诱导物 • 异丙基硫代半乳糖苷(isopropyl thiogalactoside:IPTG)结构上类似于别乳糖,是乳糖操纵
子非常有效的诱导物。可诱导lac操纵子表达,但不能被β-半乳糖苷酶水解。 • 这种能诱导酶合成,但不能被酶分解的分子称为安慰诱导物(gratuitous inducer)。安慰诱导
原核生物的基因调控
原核生物的基因调控每个物种都有一套完整的遗传信息。
遗传信息存在于DNA分子中,每个细胞都有相同的DNA,也确实是讲,每个细胞中都带有完整的遗传信息。
在正常情形下,一个个体的各类细胞差不多上按照一定的规律和一定的时空顺序,关闭一些基因,开启另一些基因,并持续地进行严格的调控,以保证个体的发育得以顺利进行。
基因表达(gene expression)确实是指某一基因指导下的蛋白质合成,蛋白质是基因表达的产物,在生活中并非所有基因都一齐表达,而是有些基因进行表达,形成其基因表达的特异产物,以构成细胞结构或代谢所需要的蛋白质或酶类。
然而,有许多基因却被关闭,不进行表达,而要在适当的时候才进行表达。
基因作用的调控机理相当复杂,至今仍知之不多。
但那个领域是当前遗传学研究的热点,随着功能基因组学的飞速进展,研究的进展相当地快。
因此,研究成果多集中在原核生物,对高等生物基因表达的调控机制还了解不多。
尽管一种基因编码一种蛋白质,然而不同蛋白质在细胞中的相对数量差不专门大,随着它们的功能而不同,例如,在E.coli细胞中,从总蛋白的不足0.01%--2%,各种蛋白质变化不定。
细胞要使其蛋白质合成达到这种差异,能够有两条途径:第一条途径是细胞操纵从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一种最经济的方法,能够免去白费从mRNA合成蛋白质的各种元件和材料。
这大致是生物在长期进化过程中自然选择的结果。
这种操纵通常称之为转录水平(transcriptional level)的调控。
大多数基因表达都属于转录水平的调控。
第二条途径是在mRNA合成后,操纵从mRNA翻译成多肽链的速度,包含一些分子装置咨询题,如与核糖体的结合速度等。
这种蛋白质合成或基因表达的操纵称为翻译水平(translational level)的调控。
这种调控是较少的。
一、转录水平的调控单细胞的原核生物对环境条件具有高度的适应性,能够迅速调剂各种基因的表达水平,以适应持续变化的环境条件。
原核生物的基因表达与调控
非编码RN的作用
参与基因表达调 控:非编码RN 可以调控基因的 表达影响蛋白质 的合成
参与转录后调控: 非编码RN可以 参与转录后的调 控影响mRN的 稳定性和翻译效 率
参与翻译调控: 非编码RN可以 参与翻译调控影 响蛋白质的合成 和翻译后修饰
参与表观遗传调 控:非编码RN 可以参与表观遗 传调控影响基因 的表达和功能
别
翻译起始调控: 包括正调控和 负调控影响翻
译效率
正调控:包括 启动子、增强 子等促进翻译
起始
负调控:包括 沉默子、终止 子等抑制翻译
起始
翻译延伸的调控
核糖体:蛋白质合成的场 所
起始密码子:蛋白质合成 的起始点
终止密码子:蛋白质合成 的终止点
延伸因子:参与蛋白质合 成的延伸过程
释放因子:参与蛋白质合 成的释放过程
时序调控机制的研究进展
发现基因表达调控的时序性
研究基因表达调控的调控网络
研究基因表达调控的机制 发现基因表达调控的调控因子
研究基因表达调控的调控机制在原核生物 中的作用
研究基因表达调控的调控机制在原核生物 中的调控机制
07
原核生物基因表达调控的应用前景
基因工程与合成生物学中的应用
基因工程:通过基因重组 技术将外源基因导入原核 生物实现基因表达调控
合成生物学:通过设计、 构建和优化基因回路实现 原核生物的基因表达调控
生物制药:利用原核生物 基因表达调控技术生产药 物、疫苗等
生物能源:利用原核生物 基因表达调控技术生产生 物燃料如乙醇、生物柴油 等
环境保护:利用原核生物 基因表达调控技术降解污 染物实现环境修复
农业:利用原核生物基因 表达调控技术改良作物品 种提高作物抗病、抗虫、 抗逆能力
原核生物基因表达调控概述
原核生物基因表达调控概述基因表达调控是生物体内基因表达调节控制机制,使细胞中基因表达的过程在时间,空间上处于有序状态,并对环境条件的变化做出适当的反应复杂过程。
1.基因表达调控意义在生命活动中并不是所有的基因都同时表达,代谢过程中所需各种酶和蛋白质基因以及构成细胞化学成分的各种编码基因,正常情况下是经常表达的,而与生物发育过程有关的基因则需在特定的时空才表达,还有许多基因被暂时的或永久的关闭而不来表达。
2.原核基因表达调控特点原核生物基因表达调控存在于转录和翻译的起始、延伸和终止的每一步骤中。
这种调控多以操纵子为单位进行,将功能相关的基因组织在一起,同时开启或关闭基因表达即经济又有效,保证其生命活动的需要。
调控主要发生在转录水平,有正、负调控两种机制在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构,RNA 聚合酶的功能、蛋白质因子及其他小分子配基的相互作用。
细菌的转录和翻译过程几乎在同一时间内相互偶联。
细胞要控制各种蛋白质在不同时期的表达水平,有两条途径:(1)细胞控制从其DNA模板上转录其特异的mRNA的速度,这是一条经济的途径,可减少从mRNA合成蛋白质的小分子物质消耗,这是生物长期进化过程中自然选择的结果,这种控制称为转录水平调控。
(2)在mRNA合成后,控制从mRNA翻译肽链速度,包括一些与翻译有关的酶及其复合体分子缔合的装配速度等过程。
这种蛋白质合成及其基因表达的控制称为翻译水平的调控。
二.原核生物表达调控的概念(1)细菌细胞对营养的适应细菌必须能够广泛适应变化的环境条件。
这些条件包括营养、水分、溶液浓度、温度,pH等。
而这些条件须通过细胞内的各种生化反应途径,为细胞生长的繁荣提供能量和构建细胞组分所需的小分子化合物。
(2)顺式作用元件和反式作用元件基因活性的调节主要通过反式作用因子与顺式作用元件的相互作用而实现。
反式作用因子的编码基因与其识别或结合的靶核苷酸序列在同一个DNA分子上。
RNA聚合酶是典型的反式作用因子。
原核生物基因表达调控的特点
原核生物基因表达调控的特点原核生物指的是没有真核细胞核的生物,包括细菌和古细菌。
在原核生物中,基因表达调控是一种重要的生物学过程,通过调控基因的转录、翻译和后转录调控来控制蛋白质的合成和功能,从而适应环境的变化。
原核生物基因表达调控具有以下特点:1. 调控元件简单:原核生物的基因组相对较小,基因数目较少,调控元件相对简单。
通常,原核生物的基因调控主要依赖于启动子、操作子以及结合蛋白等几个关键的调控元件。
2. 调控网络简化:原核生物的基因调控网络相对简化,通常以正式的反式调控为主。
正式调控是指调控蛋白质与调控元件结合后,促进或抑制基因的转录。
3. 转录和翻译的耦合:在原核生物中,转录和翻译是同时进行的,没有真核生物中的核内转录和胞质翻译的空间分隔。
这种耦合使得原核生物能够更加高效地调控基因表达。
4. 调控速度快:原核生物的基因表达调控速度相对较快。
由于转录和翻译的耦合以及调控元件的简单性,原核生物可以在短时间内快速响应环境的变化,调整基因表达水平。
5. 基因调控的灵活性:原核生物的基因调控具有较高的灵活性。
原核生物通过对调控蛋白质的合成和降解进行调控,可以实现对基因表达的快速调整。
此外,原核生物还可以通过突变、重组和水平基因转移等方式来调整基因表达。
6. 调控机制多样:原核生物的基因表达调控机制多样。
除了上述的正式调控外,原核生物还可以通过DNA甲基化、RNA干扰、RNA 修饰等多种方式对基因进行调控。
在原核生物中,基因表达调控具有重要的生物学意义。
通过调控基因表达,原核生物能够适应不同的环境条件,维持稳定的内部环境,并实现生存和繁殖的目标。
同时,原核生物的基因表达调控机制也为生物学研究提供了重要的模型系统。
通过研究原核生物的基因表达调控,可以深入理解基因调控的基本原理,并为生物技术和医学研究提供理论基础和实验依据。
原核生物和真核生物基因表达调控复制、转录、翻译特点的比较
原核生物和真核生物基因表达调控、复制、转录、翻译特点的比较1.相同点:转录起始是基因表达调控的关键环节①结构基因均有调控序列;②表达过程都具有复杂性,表现为多环节;③表达的时空性,表现为不同发育阶段和不同组织器官上的表达的复杂性;2.不同点:①原核基因的表达调控主要包括转录和翻译水平。
真核基因的表达调控主要包括染色质活化、转录、转录后加工、翻译、翻译后加工多个层次。
②原核基因表达调控主要为负调控,真核主要为正调控。
③原核转录不需要转录因子,RNA聚合酶直接结合启动子,由sita因子决定基因表的的特异性,真核基因转录起始需要基础特异两类转录因子,依赖DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用调控转录激活。
④原核基因表达调控主要采用操纵子模型,转录出多顺反子RNA,实现协调调节;真核基因转录产物为单顺反子RNA,功能相关蛋白的协调表达机制更为复杂。
⑤真核生物基因表达调控的环节主要在转录水平,其次是翻译水平。
原核生物基因以操纵子的形式存在。
转录水平调控涉及到启动子、sita因子与RNA聚合酶结合、阻遏蛋白、负调控、正调控蛋白、倒位蛋白、RNA聚合酶抑制物、衰减子等。
翻译水平的调控涉及SD序列、mRNA的稳定性不稳定(5’端和3’端的发夹结构可保护不被酶水解mRNA的5’端与核糖体结合可明显提高稳定性)、翻译产物及小分子RNA的调控作用。
真核生物基因表达的调控环节较多:在DNA水平上可以通过染色体丢失、基因扩增、基因重排、DNA甲基化、染色体结构改变影响基因表达。
在转录水平主要通过反式作用因子调控转录因子与TA TA盒的结合、RNA聚合酶与转录因子-DNA复合物的结合及转录起始复合物的形成。
在转录后水平主要通过RNA修饰、剪接及mRNA运输的控制来影响基因表达。
在翻译水平有影响起始翻译的阻遏蛋白、5’AUG、5’端非编码区长度、mRNA的稳定性调节及小分子RNA。
真核基因调控中最重要的环节是基因转录,真核生物基因表达需要转录因子、启动子、沉默子和增强子。
原核基因表达调控特点
原核基因表达调控特点原核生物是指没有真核细胞核的生物,包括细菌和古细菌。
原核生物的基因表达调控具有以下特点:1. 基因结构简单:原核生物的基因通常由一个连续的DNA片段组成,没有内含子和外显子的区别。
这种简单的基因结构使得原核生物的基因表达调控更为直接和高效。
2. 没有转录因子:转录因子是对基因表达起调控作用的蛋白质,通过结合到DNA上的特定序列来激活或抑制转录过程。
然而,在原核生物中,没有类似的转录因子存在。
原核生物的基因表达调控主要通过DNA序列上的启动子和终止子来实现。
3. 启动子和终止子:在原核生物的基因中,启动子是位于转录起始位点上游的DNA序列,终止子是位于转录终止位点下游的DNA序列。
启动子和终止子的序列特点会直接影响基因的转录活性。
例如,启动子上的TATA盒序列通常是原核生物中的转录起始位点,终止子上的rho独立终止序列可以使转录过程自动终止。
这些序列的存在和特点决定了基因的表达水平和调控方式。
4. 负反馈调控:原核生物的基因表达调控中普遍存在负反馈调控机制。
负反馈调控是指基因产物通过结合到自己的启动子或调控区域上,从而抑制自身的转录活性。
这种调控机制可以使得基因的表达水平保持在一定的稳态,并且对外界环境的变化具有一定的适应性。
5. 调控网络简单:与真核生物相比,原核生物的基因调控网络更为简单。
原核生物中的基因调控主要是单个基因与单个调控元件的相互作用,这种简单的调控网络可以使得基因表达的调控更为精确和高效。
6. 高度节约:原核生物的基因表达调控过程非常节约能量和资源。
由于原核生物基因的结构简单,基因表达调控的过程也相对简单,不需要大量的转录因子和调控蛋白的参与,节约了细胞的能量和物质消耗。
原核生物的基因表达调控具有基因结构简单、没有转录因子、启动子和终止子的作用、负反馈调控、调控网络简单和高度节约等特点。
这些特点使得原核生物能够在复杂的环境中快速适应和响应,保证基因表达的高效和精确。
第7章原核生物基因表达的调控
Z编码β-半乳糖苷酶:将乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。
Y编码β-半乳糖苷透过酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透过大肠杆
菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶:乙酰辅酶A上的乙酰基转到β-半乳糖苷
上,形成乙酰半乳糖。
gene
正调控
调控蛋白
负调控
结构基因表达
▪ 负调控:抑制基因表达的调控方式 ▪ 正调控:促进基因表达的调控方式
B、特殊代谢物的调控
诱导(induction)
阻遏(repression)
inducer
gene
repressor
gene
特殊代谢物
诱导 阻遏
结构基因表达
诱导物、可诱导基因 阻遏物、可阻遏基因
无葡萄糖、 有乳糖-----cAMP水平高 (2)cAMP与CRP结合形成有活性的
CRP- cAMP 复合物 (3)CRP-cAMP 与Plac结合 (4)增强了RNA聚合酶与启动子的结合
(5)lacZ, lacY 、 lacA高表达
105
40
105
41
乳糖、G存在与否及与操纵子正、负控因素、 基因开放与关闭情况如下:
CRP
Binding
RNA
Promoter
Operator
CRP
Pol. Repressor
cAMP
LacZ
LacY
LacA
Repressor mRNA
STOP
Right there
CRP
Polymerase
cAMP
Repressor
cAMP
CRP
原核生物的基因表达调控
经常需要激活蛋白
经常受到阻遏
鼠伤寒沙门氏菌相变的分子机制
在转录水平的调控
转录起始阶段的调控 (1)不同σ因子的选择性使用 (2)操纵子调控模型 (3)几种重要的操纵子
转录终止阶段的调控 (1)抗终止作用 (2)弱化
不同σ因子的选择性使用
原核生物识别启动子序列的是σ因子。不同的σ 因子可识别不同的启动子序列,E. coli主要使 用σ70。在特殊的条件下,其它类型的σ因子被 表达或被激活。这些新的σ因子识别的是其它 类型的启动子,其一致序列不同于σ70所识别的 启动子,从而指导RNA pol启动一些新基因的 表达。这样的调控系统使有机体能够对在特定 条件下需要表达的多个基因进行统一的调控。
大肠杆菌半乳糖操纵子模型
乳糖操纵子三个阻遏蛋白结合位点的结构特征及其作用
乳糖操纵子的正调控
葡萄糖效应——在有葡萄糖存在时,细菌优先利用环 境中的葡萄糖,即使有诱导物乳糖的存在,乳糖操纵 子也处于被抑制的状态,直到葡萄糖被消耗完后才能 解除抑制,这时细菌才开始利用乳糖进行生长。这说 明乳糖的存在仅仅是乳糖操纵子开放的必要条件,但 还不是充要条件。
乳糖苷酶,催化很少一部分乳糖异构化为别乳糖,绝 大多数乳糖水解为半乳糖和葡萄糖;lacY基因编码半 乳糖透过酶,其功能是使环境中的β-半乳糖苷能透过 细胞壁和细胞膜进入细胞内;lacA基因编码转乙酰基 酶右。,转按录lac时Z→,lRacNYA→聚la合cA酶方首向先进与行P转lac录结,合每,次通转过录lac出O来向 的一条mRNA上都带有这3个基因。
乳糖操纵子的负调控 乳糖操纵子的正调控
β-半乳糖苷酶催化的水解和异构化反应
葡萄糖效应和乳糖诱导
乳糖对乳糖代谢酶的诱导
如果供大肠杆菌生长的培养基中没有乳糖,那么细胞 内参与乳糖分解代谢的三种酶,即β-半乳糖苷酶、乳 糖透过酶和巯基半乳糖苷转乙酰酶很少,如每个细胞 的β-半乳糖苷酶的平均含量只有0.5个~5个。可是一旦 在培养基中加入乳糖或某些乳糖的类似物,则在几分 钟内,每个细胞中的β-半乳糖苷酶分子数量骤增,可 高达5 000个,有时甚至可占细菌可溶性蛋白的 5%~ 10%。与此同时,其它两种酶的分子数也迅速提高。 由此可见,新合成的β-半乳糖苷酶、透过酶和乙酰化 酶由底物乳糖或其类似物直接诱导产生,乳糖及其相 关类似物被称为诱导物。
第11章 原核生物基因表达的调控
Ø 葡萄糖代谢导致cAMP浓度下降; Ø cAMP可以活化乳糖操纵子的激活蛋白:
CRP: cAMP receptor protein(cAMP受体蛋白) CAP: catabolite gene activator protein
(代谢降解物活化蛋白)
Ø cAMP-CRP/CAP
乳糖操纵子的正调控
Ø 每个阻遏蛋白四聚体与两个 operator 结合; Ø 阻遏蛋白与Operator结合导 致DNA弯折,干扰mRNA的 合成。
p.286 图11-7
乳糖操纵子的正调控
当细菌在含有葡萄糖和乳 糖的培养基中生长时,通常 总是优先利用葡萄糖,而不 利用乳糖;只有当葡萄糖耗 尽后,细菌经过一段停滞期, 才能在乳糖的诱导下,合成 β-半乳糖苷酶等分解利用 乳糖的酶类,细菌才能利用 乳糖。
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OOPPtrptrEpE trptDrpDtrpCtrpCtrpBtrpBtrpAtrpA
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色氨酸操纵子的衰减作用
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OP trpL trpE trpD trpC trpB trpA
5’
(1) 新合成的正链 RNA可以翻译A蛋白;
3’ (-) A
5’(+)
5’
但是很快形成二级结构,阻止A蛋白 的继续合成;
所以 A蛋白与C蛋白的量为1:180
Ø Rep的合成依赖于C蛋白的表达, 证据:C基因的codon6发生无义突 变:核糖体停留在该处,导致rep基 因RBS附近的二级结构无法打开, 则rep基因无法表达。
AraC既是阻遏蛋白, 又是激活蛋白;
分子生物学:原核基因表达调控模式
添加葡萄糖后,细菌所需要的能量便可从葡萄糖得到 满足,葡萄糖是最方便的能源,细菌无需开动一些不 常用的基因去利用这些稀有的糖类。
葡萄糖的存在会抑制细菌的腺苷酸环化酶活性,减少
环腺苷酸(cAMP)的合成,与它相结合的蛋白质,
即 环 腺 苷 酸 受 体 蛋 白 CRP 又 称 分 解 代 谢 物 激 活 蛋 白 CAP,因找不到配体而不能形成复合物。
负控诱导 阻遏蛋白不与效应物(诱导物)结合时,结 构基因不转录;与之结合则转录。
负控阻遏 阻遏蛋白与效应物结合时,结构基因不转录。 阻遏蛋白作用的部位是操纵区。
在正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋 白(activator)。
正控诱导系统 效应物分子(诱导物)的存在使激活蛋白 处于活性状态;
葡萄糖 cAMP Lac操纵子被抑制
DNA
+ + + + 转录
CAP P O Z Y A
CAP CAP CAP CAP 无葡萄糖,cAMP浓度高时
CAP
有葡萄糖,cAMP浓度低时
协调调节
负性调节与正性调节协调合作
阻遏蛋白封闭转录时,CAP不发挥作用 如没有CAP加强转录,即使阻遏蛋白从P上解聚仍无转录活性
23
• 乳糖操纵子的控制模型,其主要内容如下:
① Z、Y、A基因的产物由同一条多顺反子的mRNA分子所编码。 ② 这个mRNA分子的启动子紧接着O区,而位于I与O之间的启动子区(P), 不能单独起动合成β-半乳糖苷酶和透过酶的生理过程。 ③ 操纵基因是DNA上的一小段序列(仅为26bp),是阻遏物的结合位点。 ④当阻遏物与操纵基因结合时,lac mRNA的转录起始受到抑制。 ⑤诱导物通过与阻遏物结合,改变它的三维构象,使之不能与操纵基因结 合,从而激发lac mRNA的合成。当有诱导物存在时,操纵基因区没有被阻 遏物占据,所以启动子能够顺利起始mRNA的合成。
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原核生物的基因表达调控
3. 弱化子对基因活性的影响
• 在这种调节方式中,起信号作用的是有特殊负载的氨酰-tRNA的
浓度,在色氨酸操纵子中就是色氨酰-tRNA的浓度。当操纵子被 阻遏,RNA合成被终止时,起终止转录信号作用的那一段DNA序
列被称为弱化子。
• 属于这种调节方式的有:大肠杆菌中的色氨酸操纵子、苯丙氨
乳糖操纵子模型
2.4. 葡萄糖对lac操纵子影响 β-半乳糖苷酶在乳糖代谢中 的作用是把前者分解成葡萄 糖及半乳糖。如果将葡萄糖 和乳糖同时加入培养基中, 大肠杆菌在耗尽外源葡萄糖 之前不会诱发lac操纵子。
某大肠杆菌突变体,它不能将葡萄糖-6-磷酸转化为下一步代谢中间物, 该细菌的lac基因能在葡萄糖存在时被诱导合成。所以,不是葡萄糖而 是它的某些降解产物抑制lac mRNA的合成,科学上把葡萄糖的这种效 应称之为代谢物阻遏效应。
1. 原核基因调控分类
• 原核生物的基因调控主要发生在转录水平上,根据调控机制的
不同可分为负转录调控和正转录调控。 – 在负转录调控系统中,调节基因的产物是阻遏蛋白 (repressor)。根据其作用特征又可分为负控诱导系统和负 控阻遏系统二大类。 – 在正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋白 (activator)。也可根据激活蛋白的作用性质分为正控诱导 系统和正控阻遏系统。
转录酶结合部位
阻遏物结合部位 启动子 (操纵基因)
操纵子的调控序列
操纵子的转录单位
(由ABC编码基因构成的1个转录单位)
1个操纵子
乳糖操纵子模型
• 大肠杆菌能利用乳糖作为碳源,而利用乳糖作为碳源的酶只有
当乳糖成为惟一的碳源时才会被合成。
• 大肠杆菌乳糖操纵子(lactose operon)包括3个结构基因:Z、
原核生物 的基因表达调控
原核生物的基因表达调控
自然选择倾向于保留高效率的生命过程。
原核生物和单细胞真核生物直接暴露在变幻莫
测的环境中,食物供应无保障,只有根据环境条件 的改变合成各种不同的蛋白质,使代谢过程适应环 境的变化,才能维持自身的生存和繁衍。因此,原
核细胞都有一套准确地调节基因表达和蛋白质合成
谢酶等。
诱导型表达(Inducible expression) - 基因的表达水平受调节物的诱导而增加。 如:参与DNA修复的酶类; 某些代谢酶等。
原核生物的基因表达调控
• 1961年,Jacob和Monod提出了操纵子模型,这是与
特殊代谢途径有关的基因转录的协同调控模型。
• 操纵子是基因表达和调控的单元,典型的操纵子包括:
乳糖操纵子模型
1. 酶的诱导——lac体系受调控的证据
• 实验室常用两种乳糖类似物——异丙基巯基半乳糖苷(IPTG)
和巯甲基半乳糖苷(TMG),在酶活性分析中常用发色底物O硝基半乳糖苷(ONPG)。因为它们都不是半乳糖苷酶的底物,
所以又称为安慰性诱导物。
乳糖操纵子模型
2.1. lac操纵子的本底水平表达
2.3. 阻遏物lacI基因产物及功能 • lac操纵子阻遏物mRNA是由弱 启动子控制下永久型合成的, 该阻遏蛋白有4个相同的亚基, 每个亚基均含有347个氨基酸 残基,并能与1分子IPTG结合, 每个细胞中有5~10个阻遏物 分子。 • Lac I 基因由弱启动子变为强 启动子,细胞内将不可能产生 足够的诱导物来克服阻遏状态, 整个lac操纵子在这些突变体 中将不可诱导。
原核生物的基因表达调控
基因表达调控主要表现在以下二方面: – 转录水平上的调控 – 转录后水平上的调控: • mRNA加工成熟水平调控 • 翻译水平调控
• 不同的生物使用不同的信号来指挥基因调控。
– 原核生物中,营养状况和环境因素对基因表达起 着举足轻重的影响。 – 在真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平和 发育阶段是基因表达调控的最主要手段,营养和 环境因素的影响力下降。
阻遏蛋白 转录激活 负控诱导 激活蛋白 正控诱导
转录抑制ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱ
负控阻遏
正控阻遏
原核生物的基因表达调控
2. 原核基因调控的主要特点:
• 原核生物通过特殊代谢物调节的基因活性主要分为可
诱导和可阻遏两大类:
– 可诱导调节。是指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用 下,由原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物质的诱 导下使基因活化。这类基因中最突出的例子是大肠杆菌的乳 糖操纵子。 – 可阻遏调节。这类基因平时都是开启的,处在产生蛋白质或 酶的工作过程中,由于一些特殊代谢物或化合物的积累而将 其关闭,阻遏了基因的表达。比如大肠杆菌中的色氨酸操纵 子。
• 两个矛盾:
– 诱导物需要穿过细胞膜才能与阻遏物结合,而转运诱导物需 要转运酶,转运酶的合成有需要诱导。 – 人们发现乳糖并不与阻遏物相结合,真正诱导物是异构乳糖, 而后者是在β-半乳糖苷酶的催化下由乳糖形成的。
• 解释:在没有诱导物的情况下,转运酶和β-半乳糖苷
酶仍有本地水平的表达。阻遏物的结合并非绝对紧密, 偶尔会掉下,使得转录可以进行。表达量足以使诱导
乳糖操纵子模型
2.3. 阻遏物lacI基因产物及功能 • lac操纵子阻遏物mRNA是由弱 启动子控制下永久型合成的, 该阻遏蛋白有4个相同的亚基, 每个亚基均含有347个氨基酸 残基,并能与1分子IPTG结合, 每个细胞中有5~10个阻遏物 分子。 • Lac I 基因由弱启动子变为强 启动子,细胞内将不可能产生 足够的诱导物来克服阻遏状态, 整个lac操纵子在这些突变体 中将不可诱导。
来,这种现象称为葡萄糖效应或称为降解物抑制作用。
• 降解物抑制作用是通过提高转录强度来调节基因表达
的,是一种积极的调节方式。
原核生物的基因表达调控
5.细菌的应急反应
• 细菌有时会碰到紧急状况,比如氨基酸饥饿——氨基酸的全面
匮乏。细菌会产生一个应急反应——停止包括生产各种RNA、糖、 和蛋白质的几乎全部生物化学反应过程。
原核生物的基因表达调控
研究原核生物的基因表达调控模式可以为探索更复杂的真核细胞基因表达 调控机制提供重要的线索,对基因工程也有重要的指导意义。 组成型表达(Constitutive expression): - 这类基因又称看家基因(housekeeping genes),该基因的表达是持 续性的,不受调控的。如:组成机体的结构蛋白;三羧酸循环中的代
酸操纵子、苏氨酸操纵子、异亮氨酸操纵子和缬氨酸操纵子以 及沙门氏菌的组氨酸操纵子和亮氨酸操纵子、嘧啶合成操纵子 等等。
原核生物的基因表达调控
4. 降解物对基因活性的调节
• 有葡萄糖存在的情况下,即使在细菌培养基中加入乳
糖、半乳糖、阿拉伯糖或麦芽糖等诱导物,与其相对
应的操纵子也不会启动,不会产生出代谢这些糖的酶
Y和A,以及启动子、控制子和阻遏子等。转录的调控是在启动 区和操纵区进行的。
乳糖操纵子模型
• P为启动子,O为操纵区,lac I 编码阻遏子 • 3个结构基因各决定一种酶:Z编码β-半乳糖苷酶;Y编码β-半乳
糖苷透过酶;A编码β-半乳糖苷乙酰基转移酶。 – β-半乳糖苷酶是一种β-半乳糖苷键的专一性酶,除能将乳糖 水解成葡萄糖和半乳糖外,还能水解其他β-半乳糖苷(如苯 基半乳糖苷)。 – β-半乳糖苷透过酶的作用是使外界的β-半乳糖苷透过大肠杆 菌细胞壁和原生质膜进入细胞内。
• 在无葡萄糖有乳糖的培养基中,lac+细菌中将同时合成
β-半乳糖苷酶和透过酶。
乳糖操纵子模型
1.
酶的诱导——lac体系受调控的证据 中 加 入 乳 糖 1 ~ 2 分 钟 后 , 编 码 β- 半 乳 糖 苷 酶 和 透 过 酶 的 lac mRNA量就迅速增加,去掉乳糖后,量立即下降。
• 用32P标记的mRNA与模板DNA进行定量分子杂交,表明培养基
– β-半乳糖苷乙酰基转移酶的作用是把乙酰辅酶A上的乙酰基 转移到-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。
乳糖操纵子模型
1. 酶的诱导——lac 体系受调控的证据
• 一般情况下,lac+基因型大肠杆菌细胞内β-半乳糖苷酶
和透过酶的浓度很低,每个细胞只有1~2个酶分子。但 是,在乳糖培养基上酶的浓度很快达到细胞总蛋白量的 6%或7%,超过105个酶分子lac mRNA/细胞。
原核生物的基因表达调控
• 在转录水平上对基因表达的调控决定于DNA的结构、
RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互
作用。
• 转录与翻译的特点:
– 细菌的转录与翻译过程几乎发生在同一时间间隔内, 转录与翻译相耦联。
– 真核生物中,转录产物只有从核内运转到核外,才
能被核糖体翻译成蛋白质。
原核生物的基因表达调控
原核生物的基因表达调控
内容:
原核基因表达调控总论 乳糖操纵子与负控诱导系统 色氨酸操纵子与负控阻遏系统 其他操纵子 转录水平上其它调控 转录后调控
原核生物的基因表达调控
随着生物个体的发育,DNA分子能有序地将其所
承载的遗传信息,通过密码子-反密码子系统转变成 蛋白质,执行各种生理生化功能。 科学家把从DNA到蛋白质的过程称为基因表达 (gene expression) ,对这个过程的调节就称为 基因表达调控(gene regulation,gene control)。 基因调控是现阶段分子生物学研究的中心课题。
– 结构基因(除调节基因以外的所有基因),编码 那些在某一特定的生物合成途径中起作用的、其表 达被协同调控的酶。 – 调控元件,如操纵序列,是调节结构基因转录的 一段DNA序列。 – 调节基因,其产物能够识别调控元件,例如阻抑 物,可以结合并调控操纵基因序列。
操纵子=调控序列+转录单位
除个别基因外,原核生物绝大多数基因按功能相关性成簇地串联、密集于染色 体上,共同组成一个转录单位-操纵子(operon)。 一个操纵子只含有一个启动序列(启动子)及数个可转录的编码基因。通常编 码基因为2~6个,有的多达20个以上,在同一启动序列控制下,可转录产生多 顺反子。 原核基因的协调表达就是通过调控单个启动序列的活性来完成的。