高通量测序用于发现严重感染病原体研究进展
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[ J o u r n a l o f P a t h o g e n Bi o l o g y .2 0 1 6 S e p ;1 l ( 9 ) : i n s e r t 1 —3 . ]
Us e o f h i g h - t h r o u g hpu t s e qu e nc i ng t o d e t e c t pa t ho g e ns i n s e ps i s
附页 1
D O I : 1 0 . 1 3 3 5 0 / j . 4 P b . 1 6 0 9 2 4
・综 述 ・
任 翊 ¨ ,宋 营 改 。 ,张 湘 莉 兰 。 ,童 贻 刚。
高通 量 测序 用 于发 现严 重 感 染病 原 体 研 究进 展
( 1 . 首 都 医 科 大 学 附属 北 京 友 谊 医 院 , 北 京 热 带 医学 研 究 所 , 热 带 病 防治 研 究 北 京 市 重 点 实 验 室 , 北京 1 0 0 0 5 0 ; 2 . 北京大学第 一医院 , 北京 1 0 0 0 3 4 ; 3 . 中 国 人 民解 放 军 军 事 医学 科 学 院微 生 物 流 行 病 研 究 所 , 北京 1 0 0 0 7 1 )
ຫໍສະໝຸດ Baidu
【 摘 要 】 如 何 能 在 海 量 的高 通 量 测 序 数 据 中去 除 噪 音 、 发 现 致 病 微 生 物 是 一 个 重 要 的研 究 课 题 。 临床 信 息 指 导 下 的 高 通 量 测 序 能 减 少 对 于 高 通 量 测 序 海 量 数 据 的生 物信 息 学 分 析 工 作 量 , 高 通 量 测 序 指 导 下 的 病 原 体 致 病 性 判 断 又 减 少 了
临 床撒 网 式 筛 查 病 原 体 的工 作 量 。高 通 量 测 序 的 临 床应 用 可 能 使 得 严 重 感 染 的 临 床 治 疗 更 为 精 准 并 有 效 降低 死 亡率 。
【 关键词】 高通量测序 ; 严 重感染 ; 病 原 体 ;综 述 【 中 图分 类 号 】 R 3 7 【 文 献 标 识 码 】 A 【 文章编号】 1 6 7 3 — 5 2 3 4 ( 2 0 1 6 ) 0 9 一 附页 1 一 O 3
v e n t i o n a n d T r e a t me n t o f T r o p i c a l Di s e a s e , Be i j i n g ,1 0 0 0 5 0 , C h i n a ; 2 . P e k i n g U n i v e r s i t y F i r s t Ho s p i t a l ; 3 . B e i j i n g
t a n t f i e l d o f r e s e a r c h . Hi g h - t h r o u g h p u t s e q u e n c i n g d i r e c t e d b y c l i n i c a l i n f o r ma t i o n d e c r e a s e s t h e wo r kl o a d o f b i o i n f o r ma t — i c s .P a t h o g e n i d e n t i f i c a t i o n d i r e c t e d b y h i g h - t h r o u g h p u t s e q u e n c i n g d e c r e a s e s t h e wo r k l o a d o f b r o a d l y s c r e e n i n g f o r p a t h o — g e n s . Th e c l i n i c a l u s e o f h i g h - t h r o u g h p u t s e q u e n c i n g wo u l d ma k e t h e d i a g n o s i s a n d t r e a t me n t o f s e p s i s mo r e p r e c i s e a n d mo r e e f f i c i e n t a n d i t ma y d e c r e a s e t h e mo r t a l i t y f r o m s e p s i s .
中 国 病 原 生 物 学 杂 志 2 0 1 6年 9月 第 1 1卷 第 9 期 e p t e m b e r 2 0 1 6 , V o 1 . 1 1 , N o . 9 J o u r n a l o f P a t h o g e n B i o l o g y S
REN Yi ,S ONG Yi n g — g a i 。 ,ZHANG Xi a n g — l i l a n 。 , TONG Yi — g a n g 。 ( 1 . C a p i t a l Me d i c a l U n i v e r s i t , B e i —
j i n g Fr i e n ds h i p Ho s p i t a l , Be i j i n g Tr o pi c a l Me d i c i n e Re s e a r c h I n s t i t u t e ,Be i j i n g Ke y L a b o r a t o r y f o r Re s e a r c h o n Pr e —
I n s t i t u t e o f Mi c r o b i o l o g y a n d Epi d e mi o l o gy)
[ A b s t r a c t ] I d e n t i f i c a t i o n o f e t i o l o g i c a g e n t s f r o m t h e b i g d a t a o b t a i n e d t h r o u g h h i g h - t h r o u g h p u t s e q u e n c i n g i s a n i mp o r —
脐带结肠炎综合征cordcolitissyndromeccs是发生于脐带造血干细胞移植后311月的病因不明性疾病患者表现为非血性腹泻结肠黏膜活检显示慢性活动性结肠炎上皮样肉芽肿形成没有病原微生物感染的镜下表现菌体没有病毒感染的细胞学改变没有移植物抗宿主疾病graftversushostdiseasegvhd的特征性病理表现但患者抗菌素治疗甲硝唑或喹诺酮类药物有效部分患者停药后复发再次用药能够缓解