高通量测序在癌症患者精准诊疗中的临床应用
高通量测序在临床中的应用
高通量测序在临床中的应用引言:近年来,高通量测序技术的迅速发展和广泛应用,为临床医学带来了革命性的进展。
本文将探讨高通量测序在临床中的应用,包括基因组学、疾病诊断和个体化医疗等方面的应用,并介绍其在改善患者诊疗效果、加快疾病研究和推动精准医学发展方面的重要作用。
一、高通量测序在基因组学研究中的应用高通量测序技术的出现,使得对基因组的研究变得更加便捷高效。
通过分析和解读大量的DNA序列,研究人员可以深入了解人类基因组的构成和变异,进而揭示许多与疾病相关的基因突变。
1. 探索人类基因组的构成高通量测序技术使得人类基因组的测序变得更加迅速和准确。
通过对大样本群体的基因组测序,研究人员可以发现人类基因组中存在的常见变异和罕见遗传突变,进而深入研究其与疾病的关联。
2. 揭示疾病相关基因突变高通量测序技术在疾病研究中的应用日益广泛。
通过对患者和正常人群的基因组测序,并分析其差异,研究人员可以鉴定出与疾病发生发展密切相关的基因突变。
这些发现有助于加深对疾病发生机制的理解,并为疾病的早期预测和个体化治疗提供依据。
二、高通量测序在疾病诊断中的应用高通量测序技术不仅在基因组学研究中发挥重要作用,还在临床诊断中得到了广泛应用。
其高通量、高灵敏度和高精准性的特点,使得高通量测序成为一种非常有潜力的疾病诊断技术。
1. 基因突变的检测高通量测序技术可以快速、准确地检测出患者基因组中的突变。
通过与数据库中的正常人群基因组进行比对和分析,可以确定患者基因组中的突变是否与疾病的发生有关。
这对于一些罕见遗传性疾病的诊断和预测具有重要意义。
2. 肿瘤领域中的应用高通量测序技术在肿瘤诊断和治疗中也发挥着重要作用。
通过对肿瘤组织的基因组测序,可以发现肿瘤中存在的具体基因变异,揭示肿瘤发生发展的分子机制,为个体化的肿瘤治疗提供依据。
三、高通量测序在个体化医疗中的应用基于高通量测序数据的个体化医疗是推动精准医学发展的重要手段之一。
通过对患者基因组进行测序和分析,医生可以根据个体的基因信息,制定出更加针对性和精准的治疗方案。
高通量测序技术在各种疾病预防和诊断中的应用
高通量测序技术在各种疾病预防和诊断中的应用随着生命科学技术的不断发展,我们已经进入了新的基因组学时代,基因测序成为了研究生物学、医学和生物技术的重要手段。
高通量测序技术得到了广泛应用,它不仅提供了基因测序和基因变异的信息,而且还可以在对疾病的观察和理解中发挥重要作用。
下面我们将讨论高通量测序技术在各种疾病预防和诊断中的应用。
一、肿瘤学高通量测序技术可以用来检测癌症相关的遗传变异。
这些变异可以是质量变异(单核苷酸变异、插入或删除特定碱基),也可以是结构变异(染色体缺失、重复、反转或移位等)。
通过进行全基因组或外显子测序,可以发现癌细胞中的遗传突变等异常变化。
这些变异可以帮助医生确定肿瘤的类型、预测病情及病人的反应,并为患者制定个性化治疗方案。
二、遗传学高通量测序技术可以轻松处理复杂的人类外貌和疾病相关的遗传因素。
通过基因组测序或基因检测,可以识别已知的和未知的基因,确定遗传变异,并利用这些信息来诊断、治疗和预防疾病。
三、微生物学高通量测序技术可以用于识别和解决微生物学的相关问题,如病毒、细菌、真菌和寄生虫。
通过对微生物的基因组进行测序,可以预测疾病发生和传播的风险,并制定相应的控制和治疗措施。
高通量测序技术对于疫情的控制和防治也有重要意义。
四、药物研发高通量测序技术可以用于药物研发。
研究人员可以通过全基因组和外显子测序等技术,识别疾病的遗传变异,寻找致病基因和相关途径,并确定是否存在有效药物治疗方案。
这种方法可以减少药物研发的时间和成本,加快了治疗药物的开发进程。
总之,高通量测序技术不仅可以用于诊断和治疗疾病,还可以帮助发现新的病因和治疗方法,推动医学科学的进步。
由于该技术的重要性,未来该技术将会有更广泛的应用。
高通量基因测序技术在医疗中的应用
高通量基因测序技术在医疗中的应用随着基因科学的进步,基因测序技术也在迅速发展。
高通量基因测序技术是目前最先进的基因测序技术之一。
它通过大规模平行测序,可以高效地获取每个个体的全基因组序列信息。
高通量基因测序技术有着很广泛的应用,其中医学领域是最重要的应用之一。
在医疗上,高通量基因测序技术已经被广泛应用,可以帮助医生们更早地诊断疾病、制定更有效的治疗方案。
本文将会介绍高通量基因测序技术在医疗中的应用,并着重介绍其在个体化医疗中的应用。
一、高通量基因测序技术的基本原理高通量基因测序技术采用平行测序的方法,同时测定许多DNA分子。
这种技术的初衷是为了进行全面的基因组测序,从而帮助人们更好地了解基因组的构成和功能。
在高通量基因测序技术中,首先将DNA片段匀浆到一个平台上,然后再将DNA嵌合到特定的测序器上进行测序。
测序的结果是成千上万的小片段序列,这些片段可以拼凑成完整的DNA序列。
二、高通量基因测序技术在医疗上的应用高通量基因测序技术在医学领域中有着多种应用。
例如,通过高通量基因测序技术可以快速、精准地诊断疾病,对于某些罕见而严重的疾病进行基因筛查和诊断有着重要的作用。
同时,在药物研发、医学研究、群体基因组学等领域中也有着广泛的应用。
此外,由于高通量基因测序技术具有较高的准确性和高通量测序能力,它在个体化医疗中的应用也越来越多。
个体化医疗是目前医学中的一个热点领域,它可以通过基因组信息来确定疾病的发生和发展,制定针对性的治疗方案。
在个体化医疗中,高通量基因测序技术的应用非常广泛。
例如,医生可以使用高通量测序技术快速、准确地筛查基因突变、单核苷酸多态性等遗传变异,以了解病人的遗传风险,进而制定个性化的治疗方案。
此外,通过对跨物种模型的分析,还可以早期发现某些疾病的发生和发展,为疾病的预防提供了有效手段。
三、高通量基因测序技术在肿瘤学中的应用高通量基因测序技术在肿瘤学中的应用得到了广泛的关注。
肿瘤是一类由于细胞基因突变引起的疾病,因此,基因组学的研究在肿瘤学中具有很大潜力。
高通量测序技术在癌症研究中的应用
高通量测序技术在癌症研究中的应用随着科技的迅速发展,高通量测序技术应用广泛,特别是在癌症研究中。
癌症是一种与基因有关的疾病,而高通量测序技术能够帮助研究人员更深入地了解癌症的基因变异及其影响,从而提高对癌症的治疗和预防水平。
一、高通量测序技术介绍高通量测序技术,又称为下一代测序技术,是近年来一种新型的基因测序技术。
与传统的Sanger测序相比,高通量测序技术更加快速、准确、可靠。
它的主要特点是利用高通量并行测序技术,将待测DNA片段分离出来,通过高通量并行化比对技术,得出测序结果。
二、癌症基因检测高通量测序技术可以用于检测基因及突变,因此在癌症研究中应用得非常广泛。
在过去,通过基因学研究癌症主要是通过单一基因进行研究,但是高通量测序技术的出现使研究人员能够同时针对多个基因进行研究。
这样,研究人员可以从整个基因组层次上了解癌症的基因表达及其突变。
三、个体化癌症治疗通过高通量测序技术在癌症研究中所得到的信息,可以使得癌症治疗能够更加个体化。
针对癌症患者的基因突变情况,研究人员可以根据不同的情况来制定相应的治疗方案。
这样,患者将得到更好的治疗效果,并减少治疗过程中的副作用。
四、基因编辑技术基因编辑技术是近年来发展迅速,是将CRISPR/Cas9等基因修饰工具与高通量测序技术相结合的结果。
基因编辑技术本身可使科学家删除、插入或更改相关基因表达。
这些改变可以帮助我们了解癌症发生的机制,以及如何避免或治疗这种疾病。
五、未来方向未来,随着高通量测序技术的不断进步和发展,我们将能够更加深入地研究癌症。
这些新的发现将不仅有助于改进癌症的诊断和治疗方法,也将有助于将癌症治疗引向更加精准的方向。
总之,随着高通量测序技术的应用,我们能够更加深入地了解癌症的基因变异及其影响,从而针对癌症制定更加个性化和有效的治疗方案。
未来,高通量测序技术将继续在癌症研究中发挥积极的作用,推动癌症治疗技术向前发展。
高通量测序技术在肿瘤诊断中的应用
高通量测序技术在肿瘤诊断中的应用随着生物学和医学研究的深入,高通量测序技术在肿瘤诊断中的应用也越来越广泛。
该技术可以帮助医生更准确地诊断肿瘤,为个体化治疗提供有力的依据。
一、高通量测序技术的原理及应用领域高通量测序技术是一种能够同时测量大量DNA或RNA序列的技术,广泛应用于基因组学、转录组学、蛋白质组学和生物信息学等领域。
该技术的基本原理是将DNA或RNA分子进行片段化后,通过高通量的测序仪进行读取和分析,最终得出具体序列信息。
在肿瘤诊断中,高通量测序技术可以检测肿瘤细胞内的异常基因表达、基因突变和染色体异常等,从而确定肿瘤的分型、患者的转移风险和治疗方案等信息。
同时,高通量测序技术还可通过NGS技术对肿瘤标志物进行快速检测,能够比基因芯片更快速地进行检测。
二、高通量测序技术在肿瘤诊断中的实际应用高通量测序技术在肿瘤诊断中有着广泛应用。
例如,针对胃肠道肿瘤、肺癌、乳腺癌、前列腺癌和淋巴瘤等多种癌症,研究人员使用高通量测序技术对肿瘤组织和外周血进行检测,并鉴定其成分,结果显示总体准确度达90%以上。
此外,高通量测序技术还被用于评估肿瘤分子标志物、RNA表达、基因突变情况、表观遗传变化和人类药代谢基因等信息,为临床医生提供更加全面的诊断指导。
三、高通量测序技术在肿瘤治疗中的贡献尽管肿瘤诊断和治疗中有许多困难,但是近年来高通量测序技术的应用却为临床医生和患者提供了新的机遇。
除了能够帮助医生更加准确地诊断和鉴定肿瘤的类型之外,高通量测序技术还能够在肿瘤个体化治疗方面产生深远的影响。
准确鉴定肿瘤个体分子标志物,是精准医疗治疗策略的基础。
通过高通量测序技术鉴定肿瘤个体分子标志物,能够为个性化治疗提供更加精细的依据,如寻找分子靶点,研究抑制剂等。
此外,针对肿瘤亚型有针对性的临床试验能够更好地增加治疗成功概率。
四、高通量测序技术在肿瘤领域应用的前景未来几年,高通量测序技术在肿瘤领域的应用将不断扩大。
多项研究表明,只要保证组织样本来源可靠、实验操作规范,高通量测序技术能够稳定、快速、准确地在线分析体外或内的肿瘤标记物,从而实现非侵入性的快速诊断。
高通量测序技术在肿瘤精准医学中的应用
高通量测序技术在肿瘤精准医学中的应用近年来,随着生物技术的快速发展和大规模测序技术的成熟,高通量测序技术在肿瘤精准医学领域得到了广泛的应用。
高通量测序技术能够迅速、准确地获取基因组的信息,为肿瘤的个性化治疗提供了重要的依据。
一、肿瘤的基因组学研究高通量测序技术的应用使得肿瘤的基因组学研究成为可能。
通过对肿瘤的基因组进行测序,可以获得肿瘤细胞中存在的各种基因突变、基因重排、拷贝数变异等遗传变异的信息。
这些遗传变异可以为肿瘤的发生机制和进展提供重要线索,有助于我们对肿瘤的认识和治疗策略的制定。
二、靶向治疗的指导高通量测序技术能够为肿瘤的个性化治疗提供指导。
通过对肿瘤基因组的测序,可以分析出肿瘤细胞中存在的突变基因和激活的信号通路,从而为选择合适的靶向治疗药物提供依据。
例如,EGFR突变是肺癌中常见的突变之一,而EGFR-酪氨酸激酶抑制剂就可以对这类肺癌进行靶向治疗。
通过高通量测序技术的应用,可以帮助医生更准确地判断患者的突变情况,从而制定更精确的治疗方案。
三、肿瘤免疫治疗的研究肿瘤免疫治疗是肿瘤精准医学中的重要治疗策略之一。
高通量测序技术的应用使得肿瘤免疫治疗的研究更为深入。
通过测序分析,可以获得肿瘤细胞中存在的免疫逃逸机制和免疫抑制分子的表达情况。
这些信息有助于我们了解肿瘤细胞如何逃避免疫系统的攻击,并为开发新的免疫治疗策略提供依据。
四、肿瘤进展和治疗效果的监测通过高通量测序技术,可以在治疗过程中对肿瘤基因组进行多次测序,从而监测肿瘤的进展和治疗效果。
通过比较不同时间点的测序结果,可以观察到肿瘤在基因组水平上的变化,评估治疗效果的好坏,并根据实时的情况进行治疗调整。
这对于精准医学的实施和治疗效果的评估至关重要。
综上所述,高通量测序技术在肿瘤精准医学中起到了至关重要的作用。
它不仅帮助我们更好地了解肿瘤的基因组学特征,为靶向治疗和免疫治疗提供依据,还可以监测治疗效果和预测肿瘤的进展。
相信随着测序技术的不断发展和成熟,高通量测序技术将在肿瘤精准医学中发挥更加重要的作用,为肿瘤患者带来更好的治疗效果和生存质量。
高通量测序技术在肺癌诊断中的应用
高通量测序技术在肺癌诊断中的应用肺癌是全球范围内导致死亡率最高的癌症之一。
根据统计数据,每年有数以百万计的人罹患肺癌,受其影响的还有无数的家庭。
肺癌的治疗难度很大,而早期诊断有助于提高治疗效果。
现代医学技术发展极快,高通量测序技术这一技术的应用也让肺癌诊断的效率有了飞跃式的发展。
高通量测序技术是一种新型的基因诊断技术,是指在分子水平上通过对DNA或RNA序列进行测定并比较,从而发现患者中与正常人不同的基因序列。
这项技术使得人类有了能力精准检测人体中的各种基因突变,并为诊断精确度的提升提供了重要的工具。
传统的肺癌诊断通常不能在早期发现癌症,这是因为癌细胞和正常细胞之间的差异不是很明显。
而高通量测序技术能够关注在基因序列的改变上,识别癌细胞中出现的突变,从而提高对肺癌的诊断准确度。
基于高通量测序技术的肺癌诊断方法有许多,其中最流行的方法是DNA测序,通过对肿瘤细胞和健康细胞中的DNA进行比较,确定哪些基因发生了突变。
除此之外,还可以使用RNA测序、转录组测序、表观转录组测序、微核酸测序等各种技术来识别患者肿瘤中的特定基因变异,从而更精确地诊断肺癌。
高通量测序技术在肺癌诊断中的应用无疑带来了巨大的进步。
目前,肺癌的早期诊断能够使用血液DNA搜寻癌细胞循环DNA (ctDNA)。
医生可以测定患者血液样本中的CTDNA,测定DNA中癌症突变的存在,从而提供肿瘤诊断的线索。
该技术的特点在于灵敏性高,能够及早检测到肿瘤的存在,从而有助于提高肺癌治疗的效果。
除了早期诊断之外,肺癌患者治疗的选择也可以受到高通量测序技术的指导。
肺癌的治疗方案往往是根据患者肿瘤组织切片标本的基因突变情况确定的,但是这种方法存在样本数量有限、切片破坏性等缺点,无法完整分析患者的肿瘤基因信息。
而使用基于高通量测序技术的方法,医生可以在样本准备阶段就对患者的基因进行更全面的测序分析,从而为治疗方案的制定打下了更好的基础。
总之,高通量测序技术在肺癌诊断和治疗方面发挥了重要作用。
2023高通量测序技术在肿瘤精准诊疗中的临床应用
2023高通量测序技术在肿瘤精准诊疗中的临床应用摘要高通量测序技术与传统的基因检测技术相比,实现了多样本、多位点、多变异类型的大规模平行检测,在提供临床诊疗信息的同时还能挖掘大量具有研究价值的信息,其在临床的应用范围日益广泛。
另一方面,基于基础研究的不断深入,医药产业的转化产出也逐渐加大,靶向治疗、免疫治疗等新型方式将肿瘤带入“个体化精准诊疗”时代,从病种管理逐渐发展到基因管理,以患者基因组大数据为核心,实现疾病的分类、诊断、治疗与预后方案的制定,因此基因检测在整个肿瘤的管理过程中占据了不可替代的重要作用。
目前,高通量测序在肿瘤临床应用中涉及了靶向治疗、辅助诊断、评估预后、复发或耐药监测等诸多方面,本文对以上各方面的临床实践现状和进展进行详细介绍。
近年来,肿瘤精准诊疗的概念不断“微观化”,同时伴随着生物信息学与测序技术的交叉融合,基因检测越来越广泛地应用于临床各个领域。
高通量测序技术,即二代测序(next generation sequencing,NGS)一次检测即可实现对大量DNA片段进行测序,极大地推动了精准诊疗概念在肿瘤全程管理中的建立[1 ]。
肿瘤的治疗方式经历了变化的轨迹:从手术治疗到放疗、化疗,再到靶向治疗、免疫治疗等新方法,肿瘤的发生发展机制复杂,但其本质是基于驱动基因变异导致的疾病,基因检测可获取相应变异信息。
因此,随着基因组学的不断深入发展,NGS技术在肿瘤临床应用中扮演的角色也越来越重要。
一、NGS相比传统分子技术的优势当NGS技术还未应用于临床肿瘤伴随诊断时,已有多个基于免疫组化技术、荧光定量聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术和荧光免疫杂交技术等传统分子检测技术的产品作为靶向治疗药物的伴随诊断试剂盒在国内外获得批准。
这些传统分子检测技术存在明显局限性:(1)检测通量低,单次检测只能测出有限的基因变异数目和类型;(2)无法检出未知的变异,可能会发生罕见变异的漏检,导致假阴性结果[2 ];(3)无法区分具体变异位点,如表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因19号外显子的缺失变异有多种核苷酸变异形式,PCR方法无法区分具位点[3 ];(4)近年来肿瘤突变负荷(tumor mutation burden,TMB)、微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)与免疫治疗效果的相关性研究,同源重组修复缺陷(homologous recombination deficiency,HRD)与聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(poly ADP-ribose polymerase,PARP)抑制剂治疗效果的研究越来越多,传统分子检测无法为这两种治疗方法提供有效的标志物信息[4 ]。
高通量测序技术在医学研究中的应用
高通量测序技术在医学研究中的应用一、引言高通量测序是指以高效率和速度进行基因组测序,它在生物学研究和医学实践中扮演着重要的角色。
自2005年Illumina公司开始商业化高通量测序技术以来,随着技术的进步和应用的拓展,高通量测序在医学研究中的应用范围越来越广泛。
本文将重点介绍高通量测序在医学研究中的应用,并探讨其优缺点。
二、高通量测序技术在研究基因型方面的应用高通量测序技术已经成为检测疾病基因型和基因突变的重要工具。
以人类基因组测序为例,目前已有超过6,000例完全人类基因组测序,这些测序数据成为了各种疾病基因研究的重要数据源。
高通量测序还为基因相似性比较和物种起源研究提供了新技术,可以检测出不同组织间极微小的差异,甚至前端生物学分支领域中极小的变化如SNP、Indel等都可以被发现。
三、高通量测序技术在研究药物代谢方面的应用在临床重要性方面,高通量测序技术可以在诊疗过程中帮助确定药物剂量,并提供实时监测和调整方案。
由于高通量测序技术能够对一个个体的整个基因组进行检测,因此它可以提供其他药物剂量调整方案所不能提供的深刻信息。
通过筛选出与药物代谢相关的基因,如CYP450等,高通量测序技术还可以在临床用药过程中帮助患者避免药物不良反应。
四、高通量测序技术在研究肿瘤方面的应用高通量测序技术在癌症诊断和治疗中的应用也十分重要。
利用高通量测序技术,可以对肿瘤相关基因进行突变检测、差异表达、表观遗传变异、基因编辑等多个方面的研究。
特别是淋巴瘤等血液系统肿瘤的测序研究相对容易受到技术的支持。
五、高通量测序技术在研究人类受精过程、胚胎发育过程方面的应用在研究人类受精过程和胚胎发育过程中,高通量测序技术也有着令人瞩目的应用前景。
一项最近的研究表明,通过结合高通量测序技术和其他诊断方法,可以检测出能够预测妊娠成功和特定欠发育疾病的胚胎基因组变异。
六、高通量测序技术的优缺点高通量测序技术的优点在于它提供了人类基因组、物种起源和疾病相关基因型的更全面认识;可以发现疾病发生的复杂机理及其可能的新突破口。
高通量测序技术在癌症诊断中的应用
高通量测序技术在癌症诊断中的应用癌症是目前人类面临的一大挑战,其中晚期癌症病人的疗效很差,其治愈率通常不超过30%。
因此,如何早期发现和诊断癌症,以实现早期干预和治疗,变得越来越重要,这也是医学领域的研究热点之一。
而高通量测序技术的出现,则为癌症早期诊断和个性化治疗提供了新的思路和方法。
高通量测序技术是一种能够在短时间内快速的监测DNA序列、RNA序列、蛋白质序列等生物大分子序列的技术。
这种技术在医学领域中特别应用于癌症的研究。
高通量测序技术可以快速检测基因的变异、表达水平等信息,从而准确判断癌症的类型以及患者的基因组信息。
例如,如果一个基因发生了突变,它可能成为肿瘤抑制基因或肿瘤促进基因,在不同的组织中可能会表现出不同的表达水平和不同的突变类型。
而高通量测序技术能够帮助研究人员快速筛选这些变异,从而准确地判断癌症类型并提供合理的治疗方法。
除此之外,高通量测序还能够提取出癌细胞塑形、信号传导、代谢、细胞凋亡等方面的信息。
例如,研究人员可以通过高通量测序技术检测癌症患者的血液样本,发现某些患者体内的血细胞发生突变,从而识别出这些患者。
可以使用基因检测技术来检测这些癌症的基础。
其中基因组测序在癌症研究方面表现出高度的可靠性和有用性。
通过基因组测序,人们能够快速分析几百个甚至几千个基因,从而了解基因的变异和基因的位置,进而进一步探索这些变异或基因的功能,帮助人们快速诊断癌症。
在基因组测序中,体细胞突变和肿瘤中去剪切突变的筛选,不仅可以用于癌症的早期诊断,还可以用于血液疾病的个性化治疗。
此外,研究人员可以通过分析肿瘤的DNA序列,探索出特定的癌症引发的突变和影响蛋白质调节的基因。
这些信息不仅可以加深对癌症的认识,还可以为开发新型的抗癌药物提供参考。
例如,利用高通量测序技术可以检测出癌症患者体内的一些先天性变异,在新药的设计中考虑到这些变异,可以有效提高药物疗效。
尚有一些临床研究表明,利用高通量测序技术识别癌症之前的标志物,为癌症的早期诊断和治疗提供了更可靠、全面的检测手段。
高通量测序技术在肿瘤诊疗中的应用
高通量测序技术在肿瘤诊疗中的应用肿瘤是一种常见的疾病,其危害性和复杂性使得传统的诊疗手段已经无法满足对肿瘤的准确诊断和治疗需求。
因此,在临床肿瘤诊疗中,高通量测序技术得到了广泛应用。
本文将结合实际案例,阐述高通量测序技术在肿瘤诊疗中的应用,并探讨其未来的发展方向。
一、肿瘤基因测序肿瘤基因测序是肿瘤诊疗中的重要手段之一。
它通过对肿瘤细胞DNA的全基因组或全外显子的测序,发现肿瘤细胞DNA中的突变,比较癌细胞和正常细胞DNA的差异性,同时为制定出个性化的治疗方案提供依据。
以某肝癌患者为例,其癌组织样本和相应癌旁组织样本均经过DNA提取和测序,最终得到该患者癌细胞DNA中的基因变异,其中包括 ACTA2、MUC4、TP53等多个基因的变异。
在利用基因测序技术诊断出不同肿瘤类型的基础上,根据患者的基因变异情况,确定了药物靶向治疗方案,使得患者的治疗效果得到了极大的提升。
二、肿瘤基因组学肿瘤基因组学是指肿瘤细胞DNA中突变和拷贝数改变等各种变异情况在基因组水平上的研究。
基因组水平的研究不仅可以进一步解决肿瘤治疗难题,还可以对肿瘤发生和发展的机制进行深入探讨。
如在肝癌研究中,整个肝癌基因组测序的结果表明该肝癌患者肝细胞染色体重排和突变情况较为特殊。
在此基础上,根据肝癌生长机制的差异,开展了肝癌的基因治疗和免疫治疗等领域的研究,极大地提升了肝癌临床诊疗水平。
三、肿瘤RNA测序肿瘤RNA测序是分析特定细胞的基因表达和组成的有力工具。
肿瘤细胞中存在着大量异常的基因表达,使用RNA测序技术可以检测肿瘤特异性差异表达的基因的存在,并对这些基因的方法和调控作用展开研究,从而为肿瘤的治疗和预后方面的研究提供实验基础。
在某宫颈癌方面的研究中,通过对宫颈鳞状细胞癌患者和正常人群进行RNA测序,发现宫颈鳞状细胞癌患者中的MT1G和MT1M两个基因在表达上存在显著下降,较好的预测了宫颈鳞状细胞癌患者的生存期。
因此,RNA测序在肿瘤预后方面也具有很大的应用前景。
高通量测序技术在医学诊断中的应用
高通量测序技术在医学诊断中的应用随着科技的不断发展和进步,医学诊断也取得了长足的进步。
近年来,高通量测序技术(High-throughput sequencing technology,又称第二代测序技术)在医学领域的应用涵盖了基因组学、转录组学、表观基因组学等领域,为科学家们研究疾病的发病机制、靶向治疗、预测疾病进展等方面提供了无限可能。
一、一代测序技术的缺陷在谈论高通量测序技术前,我们先来了解一下一代测序技术的缺陷。
一代测序技术主要采用Sanger测序技术,该技术需要进行反复的电泳与循环扩增,皆会导致高通量、长序列读取能力较弱,因此无法满足需要进行高通量、较快速的基因组DNA序列测序的需求。
二、高通量测序技术的应用1.体液检测高通量测序技术为体液检测提供了便利。
例如,DNA在血液中的检测对于血液病的筛查和疾病的诊断具有重要意义。
同时,高通量测序技术也可用于液体活检样品的分析。
2.疾病表型的研究常常有人认为疾病的发生和基因有着密不可分的关系,高通量测序技术提供了探索这种关系的可能性。
致病基因突变的发现对于对疾病的概念和分类有着深远的影响。
高通量测序技术的应用,可以加速疾病与基因之间的关联研究,提高疾病表型的研究质量,从而有助于疾病的预测及精准治疗。
3.个性化治疗高通量测序技术可以根据患者的DNA信息,为患者个体开发相应的治疗方案,使治疗取得更好的效果。
基因组学的技术进展,使得人们可以更好地描绘事物的真实面貌,这些技术的发展和应用能够为个性化药物治疗(i.e. precision medicine)提供有力的支持。
例如,一项研究表明,基于高通量测序技术的细胞自由DNA分析可以帮助化疗药物的选择和用量调整,提高疗效,降低不良反应的发生率。
4.研究癌症发展的机理癌症是一个复杂的疾病,其发展的机制到目前为止仍未被完全理解。
高通量测序技术可用于确定不同阶段肿瘤的基因变异,分析癌细胞中的基因组印迹,挖掘出新的治疗靶标,进而为癌症治疗提供有力的解决方案。
高通量基因测序技术在疾病诊断和治疗中的应用
高通量基因测序技术在疾病诊断和治疗中的应用随着科技的不断进步,高通量基因测序技术成为了现代医学领域中的重要工具。
基因测序技术的快速发展并且价格越来越便宜,为研究人员和医生们提供了一种更加有效的手段来诊断和治疗各种疾病。
高通量基因测序技术能够突破传统疾病诊断和治疗方法的限制,其应用前景十分广泛。
高通量基因测序技术是一种将DNA样本分离然后测序后获得的基因信息的技术。
自从第一个人类基因组计划开始以来,人们的基因测序技术就在不断的提高。
高通量基因测序技术之所以在医学领域中受到追捧,是因为它可以快速地获取大量的DNA序列数据,这些数据则为疾病的诊断和治疗带来了新的方法。
对病因的研究是以非变异基因的“正常性”比较为标准。
如果发现了某种基因的异常,那么就可以根据这一发现,来为病人定制基因检测和治疗方案。
例如,现在的癌症诊断和治疗,也借助了高通量基因测序的技术。
在癌症治疗中,医生需要通过测序分析得到精确且可靠的基因数据,以便作出正确的判断和治疗方案。
现在许多的癌症疾病是由于基因突变导致的,基于这个情况研究人员发现,高通量基因测序可以为抗癌剂的筛选和定制提供基础。
如果医生可以非常准确地了解病人的个体基因信息,那么就可以为他们制定更加个性化的治疗方案,外加基因治疗,从而提高治疗的效果和降低不良反应。
此外,近年来高通量基因测序技术也在一些先天性疾病和其他罕见病的诊断中得到了应用。
传统的基因测序技术需要根据,常规基因检测结果来推断,这只能得到疾病的一些信息。
与之相较,应用高通量基因测序技术就可以获得更加全面的基因信息和更为准确的诊断结果,提升了综合的诊断能力。
尤其是对于眼科和神经学的疾病,高通量基因测序技术可以更好地解析这些疾病的基因影响,为正确的治疗提供了理论依据。
可见,随着高通量基因测序技术的日益成熟和完善,它在全球各地医疗机构的应用范围也在不断地扩大。
这一技术的应用旨在为疾病的诊断和治疗提供更为准确的基因数据和更加个性化的治疗方案。
高通量测序技术在精准医学中的应用及挑战
高通量测序技术在精准医学中的应用及挑战随着科学技术的不断进步,高通量测序技术在精准医学领域的应用越来越广泛。
高通量测序技术是一种能够迅速、准确地分析DNA或RNA序列的方法,能够为生物医学研究提供大量的基因组数据,从而为精准医学的发展提供了重要的支持。
本文将介绍高通量测序技术在精准医学中的应用以及所面临的挑战。
一、高通量测序技术在精准医学中的应用1. 个体化药物治疗高通量测序技术可以对个体基因组进行全面的扫描,帮助医生了解患者的遗传变异情况。
基于这些信息,医生可以根据个体的基因组特征来调整药物剂量和选择最适合的药物。
这种个体化药物治疗可以有效避免患者遭受不必要的药物副作用,提高治疗效果。
例如,在癌症治疗中,高通量测序技术可以帮助识别癌症相关基因的突变,并预测不同基因突变型对不同药物的敏感性。
基于这些信息,医生可以为患者制定个体化的化疗方案,提高治疗效果。
2. 疾病诊断和预防高通量测序技术可以对患者的基因组进行全面的扫描,帮助医生诊断一些罕见遗传病和遗传性疾病。
通过了解患者的基因组信息,医生可以提前进行预防和干预,减少疾病的发生。
同时,高通量测序技术还可以帮助鉴定一些潜在的疾病风险因素,为患者提供个体化的健康管理建议。
3. 临床研究和新药开发高通量测序技术可以帮助科学家深入了解疾病的发生机制,寻找新的治疗靶点和药物。
通过对大样本基因组数据的分析,科学家可以发现一些与疾病发生相关的基因变异,并探索潜在的治疗方法。
此外,高通量测序技术还可以帮助科学家评估药物的安全性和有效性,加速新药的开发进程。
二、高通量测序技术在精准医学中面临的挑战1. 数据的分析和解读高通量测序技术产生的数据量庞大,需要专业的生物信息学分析和解读。
如何准确地分析和解读这些数据,成为了精准医学研究中的重要挑战。
目前,一些专门的生物信息学工具已经被开发出来,帮助科学家进行数据分析和解读,但仍然需要不断改进和完善。
2. 隐私和伦理问题高通量测序技术涉及患者个体基因组的测序和分析,因此涉及患者个人隐私的问题。
高通量基因组学技术在癌症诊断中的应用
高通量基因组学技术在癌症诊断中的应用引言随着生物技术和计算机技术的飞速发展,高通量基因组学技术在医疗诊断中的地位日益重要。
尤其是在癌症诊断中,高通量基因测序技术已经被广泛应用,成功地帮助医生实现早期发现、早期干预,并提高治疗效果和患者生存率。
本文将探讨高通量基因组学技术在癌症诊断中的应用,从测序技术、分析方法、临床应用等方面进行介绍和分析。
测序技术高通量基因测序技术是指能够在较短时间内同时测定大量DNA分子或RNA分子序列的技术。
包括Sanger测序、Roche/454、Illumina/Solexa、ABI/SOLiD等,其中Illumina/Solexa测序技术是目前应用最广泛的一种。
与传统的Sanger测序方法相比,高通量基因测序技术具有以下优点:1. 高通量:一次实验可同时测序大量的DNA/RNA分子序列,可检测样本中所有基因的“表达谱”;2. 高精度:对于同一序列区域的多次测序结果具有良好的重复性和一致性,能够准确捕捉低频基因突变;3. 高灵敏度:能够检测极低浓度的DNA/RNA,有助于早期诊断和精准治疗。
分析方法高通量基因测序技术的应用离不开相应的分析软件和算法。
主要分析方法包括:1. 基因差异表达分析:通过比较样本和对照组基因的表达水平,筛选出差异显著的基因,以此作为癌症诊断和治疗的标志物;2. 基因突变检测:利用测序技术检测样本DNA序列中的基因突变信息,包括点突变、插入缺失、染色体重排等,确定癌症的致病基因和突变驱动通路;3. 基因组装和注释:将测序的DNA/RNA序列进行组装和注释,包括基因定位、基因结构、基因功能等信息的提取和分析,为癌症诊断和治疗提供依据。
临床应用高通量基因测序技术在癌症诊断和治疗中具有广泛的应用前景。
下面介绍其主要应用场景:1. 早期癌症检测:利用高通量基因测序技术对肿瘤标志物基因进行检测,发现早期肿瘤并进行精准治疗,提高患者的生存率和治疗效果;2. 癌症分型和分级:通过对不同癌症类型和不同分级的样本进行测序和分析,确定癌症的类型、分级和预后,为治疗方案的制定提供依据;3. 靶向治疗和个体化治疗:基于癌症基因组分析结果,制定个性化的治疗方案,提高治疗效果和患者生存率。
高通量测序技术在临床检测中的应用
高通量测序技术在临床检测中的应用随着生物技术的不断发展,高通量测序技术已经成为了目前最常用的基因测序技术之一。
尤其是在临床检测领域,高通量测序技术的应用越来越广泛。
本文将从高通量测序技术的基本原理、优势以及在临床检测中的应用等方面进行探讨。
一、高通量测序技术的基本原理高通量测序技术是指在相同时间内,同时进行大量DNA序列的测量。
其基本原理是利用高测量速率的测序平台及对应的测序化学试剂将DNA序列反复扩增,并通过DNA序列分析软件将测序结果分析出来。
通常,高通量测序技术包括以下几个步骤:首先需要将DNA 拆分为一定长度的片段,接着将这些DNA片段进行扩增,再通过测序仪进行读取,最后通过计算机软件进行序列分析。
二、高通量测序技术的优势相比于传统的基因测序技术,高通量测序技术具有以下几个优势:1.快速和节省成本高通量测序技术的测序器速度快,可以在几天内完成大量基因测序,并且由于扩增和测序过程自动化,并且需要的测序化学试剂量小,可以有效地节省时间和成本。
2.高准确率和可靠性高通量测序技术的准确率相对传统测序技术更高,能够提高检测结果的可靠性。
3.多样性评估高通量测序技术不仅能够对单个基因进行测序,还能够在同一时间内对多个基因进行测序,从而对多样性进行评估。
4.数据量大高通量测序技术测序的数据量很大,这也就意味着可以更广泛地检测基因。
三、高通量测序技术在临床检测中的应用非常广泛,下面就列举几个例子:1.个体化治疗通过高通量测序技术,可以获取患者的全基因组信息,从而实现个体化的治疗方案。
基于患者的基因信息,可以预测患者对药物的反应性,制定相应的治疗方案,从而最大程度地提高治疗效果。
2.癌症筛查和诊断高通量测序技术可以帮助医生进行癌症筛查和诊断。
通过测序技术,可以检测到许多潜在的癌症标记物,从而更加准确地进行癌症的诊断和预测。
3.遗传病的检测高通量测序技术可以帮助医生进行遗传病的检测,通过基因测序可以确定患者是否有遗传病的风险,并进行相应的预防和治疗。
高通量测序技术在肿瘤诊断中的应用
高通量测序技术在肿瘤诊断中的应用随着基因测序技术不断的发展,尤其是高通量测序技术的应用,肿瘤诊断越来越具有智能化和精准化,高通量测序技术已成为目前肿瘤诊断中应用最为广泛的技术之一。
一、高通量测序技术的优势高通量测序技术是一种高效的基因测序技术,它采用了大量的并行测序方法和基于DNA合成的“二代”测序技术,将有机体的基因组序列快速准确地测序出来。
相较于传统的测序方法,高通量测序技术具有更快的测序速度,更高的测序精度和更低的误识别率等优点。
其次,高通量测序技术可以同时测序多个DNA样品,大大提高了数据的获取效率。
这使得在肿瘤诊断和治疗方面呈现出了巨大的潜力。
例如,在肿瘤样品中,由于存在许多不同的肿瘤细胞亚群,标准的靶向测序可能会错过若干关键变异。
而高通量测序技术可以在不同亚向之间进行区分,从而能够更加准确和全面地评估基因组的变异。
二、高通量测序技术在肿瘤诊断中的应用在肿瘤诊断中,高通量测序技术已被广泛应用于各个层面,包括肿瘤基因诊断,预后分析,药物治疗等。
下面来具体阐述一下:1. 肿瘤基因诊断高通量测序技术可以快速准确地检测肿瘤中的基因变异和突变。
这项技术能够发现那些早期的基因突变并在治疗最为有效的时期进行启动治疗。
在肺癌中,使用高通量测序技术可以分析各种基因突变、表观遗传学和非编码RNA,这些厚重的信息将有助于提供定制化的治疗方案。
2. 预后分析高通量测序还可以用于肿瘤病人的预后分析,预后分析涉及到肿瘤细胞凋亡过程、自噬等生理和代谢因素。
这项技术对于乳腺癌、肺癌、肝癌等不同种类的肿瘤有着不同的意义,可以帮助医生更好地评估病情。
3. 药物治疗高通量测序技术还可以为肿瘤病人制定个性化的药物治疗方案。
以肺癌为例,药物敏感度测试提供了快速确定患者个性化药物治疗方案的机会。
在公司检测的患者中,肺癌药物执行率达到了73%。
与标准基因研究相比,高通量测序技术具有更高的精度和指导性。
三、高通量测序技术面临的挑战高通量测序技术在肿瘤诊断中应用广泛,但也面临着许多挑战。
高通量全基因组测序技术在疾病诊断和治疗中的应用
高通量全基因组测序技术在疾病诊断和治疗中的应用随着基因测序的技术越来越成熟,全基因组测序技术也逐渐走进人们的视野。
全基因组测序技术能够同时测定一个个体的所有基因,从而得到完整的基因组信息。
在医学领域,全基因组测序技术可以帮助诊断疾病、预测风险、制定个性化治疗方案,成为了现代医学领域的重要工具之一。
一、全基因组测序技术在疾病诊断中的应用全基因组测序技术在疾病诊断中的应用可以帮助患者及时了解自身的病因,制定有效的治疗方案。
全基因组测序技术可以检测到所有基因序列中的各种变异,包括单核苷酸多态性、插入和缺失等,因此有望帮助解决多种疾病的诊断难题。
比如,在对于罕见病的诊断中,全基因组测序技术可以帮助医生发现患者基因组中存在的罕见变异,从而指导医生完成诊断。
此外,全基因组测序技术还可以帮助人们了解自身的基因组模式,预测一些常见疾病的发生风险。
比如,全基因组测序技术可以通过比较个人基因组序列和普通人类基因组序列,来对某些特定基因进行分析,从而预测个人患上某些遗传疾病的风险。
二、全基因组测序技术在疾病治疗中的应用全基因组测序技术在疾病治疗方面的应用主要体现在个性化治疗方面。
个性化治疗是以个体的基因信息为基础的精准治疗,可以针对每个人的疾病信息和遗传组成选择最适合的治疗方法。
比如,在肿瘤治疗中,全基因组测序技术可以提供肿瘤患者的基因变异信息,从而寻找针对性更强、更有效的靶向治疗方法。
全基因组测序技术可以为治疗肿瘤患者提供更准确、更有效的疗法,从而达到更好的治疗效果。
此外,全基因组测序技术还可以为患者制定预防、干预和治疗方案提供依据,促进临床医学的进步和发展。
三、全基因组测序技术的未来发展前景随着全基因组测序技术的广泛应用,不断有新的应用领域被探究并取得了不少进展。
未来,该技术的应用前景将变得更加广阔。
首先,全基因组测序技术将逐渐成为临床疾病诊断的标准技术。
全基因组测序技术被认为是一种全面、迅速、具有预测性的诊断技术,具有预测疾病风险和预防疾病的潜力。
高通量基因测序技术在癌症诊断中的应用
高通量基因测序技术在癌症诊断中的应用近年来,癌症的发病率不断上升,已成为全球公认的重大健康挑战之一。
随着基因科技的快速发展,高通量基因测序技术被广泛应用于癌症的基因检测和诊断中,使得癌症的准确诊断和个性化治疗成为可能。
什么是高通量基因测序技术?高通量基因测序技术是一种利用计算机、化学、物理等多个领域的交叉技术,通过对DNA或RNA进行扫描、分析、处理后得到其完整序列信息的技术。
它的出现,革命性地改变了基因测序的速度和精准度。
在基因测序的过程中,利用高通量基因测序技术可以快速获取患者的基因信息,包括基因表达、突变和变异等等。
这种技术的应用,为癌症的早期诊断、治疗、监测和预测提供了更加精准、快速和全面的数据信息。
高通量基因测序技术与癌症诊断的关系癌症是一种严重的疾病,传统的癌症诊断方法往往依赖于临床症状、体检、组织病理检查和影像学检查等手段。
然而,这些方法的敏感度和特异度较低,可能会导致漏诊或误诊的情况发生。
高通量基因测序技术的出现,为癌症的精准诊断带来了新的可能。
它能够通过分析患者肿瘤DNA或RNA的序列信息,快速发现与癌症相关的基因变异和突变,同时利用人工智能算法对大量的数据进行集成分析,提高了癌症诊断的准确性和可靠性。
例如,利用高通量基因测序技术,可以检测到HER2基因的扩增,从而指导HER2阳性乳腺癌患者的治疗选择。
同时,高通量基因测序技术还被广泛应用于肺癌、结直肠癌、血液系统肿瘤等多种癌症的诊断和治疗中。
高通量基因测序技术的局限性尽管高通量基因测序技术已经取得了显著的进展,但仍然存在一些局限性。
首先,高通量基因测序技术的应用需要大量的数据信息,包括样本数量、深度和覆盖面积等,同时还需要专业的数据分析技术,这对数据的存储和处理产生了巨大的挑战。
其次,在应用高通量基因测序技术进行癌症诊断的过程中,研究人员需要考虑到准确性和可重复性的问题。
例如,在肿瘤组织和健康组织中,可能存在不同的细胞类型和混杂度,这对基因测序的结果产生了很大的影响。
高通量单细胞技术在癌症诊治中的应用
高通量单细胞技术在癌症诊治中的应用随着科技的发展,医学领域中各种新技术和新方法的出现,为诊治癌症带来了新的希望。
高通量单细胞技术就是其中之一,具有极高的敏感度和准确性,正在逐渐在癌症诊治中得到广泛应用。
一、高通量单细胞技术的基本原理高通量单细胞技术是指将单个细胞从组织中分离出来,采用一系列高通量技术对其进行检测和分析的一种方法。
其基本原理是通过微流控技术或显微操作等手段将单个细胞分离出来,并将细胞中包含的RNA、DNA、蛋白质等生物信息进行测序、分析,得到单个细胞的全局基因表达、信号转导和代谢状态等信息。
二、高通量单细胞技术在癌症诊断中的应用1. 微小残留病灶的检测高通量单细胞技术可以在手术前或手术后检测癌细胞微小残留病灶。
在癌症手术后,通过对血液样本中单个细胞的检测,可以确定病人是否已经完全切除肿瘤,从而更好地评估病人的预后和治疗效果。
2. 个体化治疗高通量单细胞技术可以用于癌症患者的个体化治疗。
通过对单个癌细胞进行基因表达分析,可以确定癌细胞的分子特征,为制定个体化的治疗方案提供有力的支持。
例如,对于HER2(人表皮生长因子受体2)阳性的乳腺癌患者,可以根据个体化的基因特征,选择更加精准的治疗手段,例如富马酸替卡泊单抗(Trastuzumab)等。
3. 罕见癌症的诊断高通量单细胞技术可用于诊断罕见的癌症。
由于罕见癌症样本的数量有限,传统的组织学方法难以对其进行准确的分析。
而高通量单细胞技术可以单个细胞进行分析,避免了取样量的局限性,从而更加准确地诊断罕见的癌症。
三、高通量单细胞技术在癌症治疗中的应用1. 新药的筛选高通量单细胞技术可用于新药的筛选。
通过对单个癌细胞的试验,可以快速、高效地筛选出具有靶向性的新药,从而进一步优化治疗方案。
2. 治疗效果监测高通量单细胞技术可用于监测治疗效果。
通过对单个癌细胞的分析,可以评估治疗效果的好坏,并采取相应的治疗措施。
3. 克服耐药性高通量单细胞技术可用于克服癌细胞耐药性。
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肺癌靶向治疗成果参加16th WCLC交流
Poster1: Xiaochun Zhang, et al. Clinical Effects of Icotinib for Brain Metastasis in Chinese Non-Small Cell Lung Cancer Patients Harboring an EGFR Mutation. Journal of Thoracic Oncology 2015; 10(9): suppl 2 S644. Poster2: Xiaochun Zhang, et al. Efficacy and Tolerability Analysis of Icotinib in EGFR Mutation Positive and Unknown Advanced NSCLC Patients from Eastern Coastal China. Journal of Thoracic Oncology 2015; 10(9): suppl 2 S524.
8.6%
114例患者肿瘤类型构成
NGS检出常规驱动基因以外其它治疗靶点
Xiaochun Zhang, et al. J Clin Oncol 2015; 33 (15): suppl e22066.
肿瘤组织NGS检测
其它治疗靶点
PTEN EGFR PIK3CA HER2 BRCA1/2 FBXW7 others(n≤3)
诊断 右肺腺癌 cT1N3M1 Ⅳ期
肿瘤活检组织基因检测(ARMS PCR/qPCR)
检测项目 EGFR Kras ALK Ros1 HER2 c-MET VEGFR1 VEGFR2 VEGFR3
检测内容 18、19、20、21外显子 2、3外显子 基因融合 基因融合 扩增 扩增 mRNA表达 mRNA表达 mRNA表达
高通量测序在癌症患者精准诊疗中的临床应用
青岛大学附属医院 2016-10-28
张晓春
目录
1
肿瘤驱动基因检测技术
2
典型病例分享
3
结论与展望
驱动基因检测-个体化精确治疗的前提
驱动基因 靶向药物
EGFR mutaions (K-ras WT)
TKIs
ALK rearrangements
Crizotinib
目录
1
肿瘤驱动基因检测技术
2
典型病例分享
3
结论与展望
典型病例分享一
牟XX
病史
女,32岁 2014.06 咳嗽、胸闷、胸痛2月余 初次就诊(尚在哺乳期)
辅助检查
CT: 右肺癌并癌性淋巴管炎
、双肺多发转移 ECT:
第三肋骨成骨转移
病理
右颈部淋巴结活检病理: 肺低分化腺癌转移 胸腔及心包积液: 查见恶性瘤细胞
NGS ctDNA 检测
非小细胞肺癌 EGFR ALK、RET Others (mTOR pathway, HER2, et al.) Total 其它癌症 乳腺癌 胃癌 结直肠癌
(n=65) 8/65 2/65 9/65 21/65 (n=82) 15/39 3/23 6/20
Xiaochun Zhang, et al. J Clin Oncol 2015; 33 (15): suppl e22078
46.5%(53/114)常规驱动基因检测阴性的患者检出了额外的其它治疗靶点
Xiaochun Zhang, et al. J Clin Oncol 2015; 33 (15): suppl e22066.
NGS测序成果入选ASCO会议交流
• Xiaochun Zhang, et al. J Clin Oncol 2015; 33 (15): suppl e22066 • Xiaochun Zhang, et al. J Clin Oncol 2015; 33 (15): suppl e12500 • Xiaochun Zhang, et al. J Clin Oncol 2015; 33 (15): suppl e22078
Ros1 gene fusions Crizotinib
MET amplification
Crizotinib
HER2 mutations trastuzumab
BRAF
vemurafenib
RET gene fusions cabozantinib
EGFR
EGFR T790M
Targetable genes
ARMS PCR 少数基因
已知特定突变 成本高
肺癌基因突变检测标本
标本来源 肿瘤组织
恶性积液 支气管灌洗液 外周血 痰液
检测标本类型选择
具体类型
灵敏度与适用性
新鲜标本
+++
石蜡标本
++
离心浓缩(查瘤细胞) 上清 离心浓缩(查瘤细胞)
++ +/++ ++
CTC 血浆(ctDNA)
(查瘤细胞)
?
+/++(难以获取组织或 无法二次活检) ?
ratio 12.3% 3.1% 13.8% 29.2%
ratio 38.5% 13.0% 30.0%
类型
非小细胞肺癌 乳腺癌/胃癌 结直肠癌
肿瘤组织NGS检测
常规驱动基因
EGFR、ALK、K-ras no mutation HER2(-) RAS、RAF(-)
治疗提示
TKIs Trastuzumab C225,other?
Resistance Mechanisms
基因突变检测技术
NGS Vs. Sanger or ARMS
Next generation sequencing 灵敏度高(1-5%)
Next generation sequencing 高通量 已知及未知突变 成本低
Sanger sequencing 灵敏度低(10%以上)
结果 野生型 野生型 无 无 无 无 高表达 中偏高表达 中偏高表达
基因 SETD2 IRS2 ERG MYCN TGFBR2 KLF4 APCDD1
比例
治疗提示
7.0%(8/114) 6.1%(7/114) 5.3%(6/114) 4.4%(5/114) 3.5%(4/114) 3.5%(4/114) 16.7%(19/114)
mTOR inhibitor TKIs mTOR inhibitor HER2 inhibitor PARP inhibitor mTOR inhibitor Corresponding drugs