生物化学——第九章 核酸的生物合成
生物化学核酸知识点总结
生物化学核酸知识点总结
核酸是由核苷酸组成的，核苷酸是核酸的基本组成单位。
核苷酸由碱基-核糖-磷酸基团组成。
核酸可分为核糖核酸（RNA）和脱氧核糖核酸（DNA）。
碱基可分为5大类，即腺嘌呤（A）、鸟嘌呤（G）、胞嘧啶（C）、尿嘧啶（U）和胸腺嘧啶（T）。
DNA分子中出现的碱基有A、T、C和G；RNA分子中所含的碱基是A、U、C和G。
核酸中含量相对恒定的元素是磷。
DNA分子由2条脱氧核糖核苷酸链组成，绝大部分RNA由1条核糖核苷酸链组成。
DNA碱基组成有一定的规律，即DNA分子中A的摩尔数与T相等，C与G相等。
碱基与碱基之间的连接中，（A）和（T）之间靠2个氢键连接，（C）和（G）之间靠3个氢键连接。
生物化学试题库及其答案——核酸的生物合成
一、选择题1．如果一个完全具有放射性的双链DNA分子在无放射性标记溶液中经过两轮复制，产生的四个DNA分子的放射性情况是：A、其中一半没有放射性B、都有放射性C、半数分子的两条链都有放射性D、一个分子的两条链都有放射性E、四个分子都不含放射性2．关于DNA指导下的RNA合成的下列论述除了项外都是正确的。
A、只有存在DNA时，RNA聚合酶才催化磷酸二酯键的生成B、在转录过程中RNA聚合酶需要一个引物C、链延长方向是5′→3′D、在多数情况下，只有一条DNA链作为模板E、合成的RNA链不是环形3．下列关于核不均一RNA（hnRNA）论述哪个是不正确的？A、它们的寿命比大多数RNA短B、在其3′端有一个多聚腺苷酸尾巴C、在其5′端有一个特殊帽子结构D、存在于细胞质中4．hnRNA是下列那种RNA的前体？A、tRNAB、rRNAC、mRNAD、SnRNA5．DNA复制时不需要下列那种酶：A、DNA指导的DNA聚合酶B、RNA引物酶C、DNA连接酶D、RNA指导的DNA聚合酶6．参与识别转录起点的是：A、ρ因子B、核心酶C、引物酶D、σ因子7．DNA半保留复制的实验根据是：A、放射性同位素14C示踪的密度梯度离心B、同位素15N标记的密度梯度离心C、同位素32P标记的密度梯度离心D、放射性同位素3H示踪的纸层析技术8．以下对大肠杆菌DNA连接酶的论述哪个是正确的？A、催化DNA双螺旋结构中的DNA片段间形成磷酸二酯键B、催化两条游离的单链DNA连接起来C、以NADP+作为能量来源D、以GTP作为能源9．下面关于单链结合蛋白（SSB）的描述哪个是不正确的？A、与单链DNA结合，防止碱基重新配对B、在复制中保护单链DNA不被核酸酶降解C、与单链区结合增加双链DNA的稳定性D、SSB与DNA解离后可重复利用10．有关转录的错误叙述是：A、RNA链按3′→5′方向延伸B、只有一条DNA链可作为模板C、以NTP为底物D、遵从碱基互补原则11．关于σ因子的描述那个是正确的？A、不属于RNA聚合酶B、可单独识别启动子部位而无需核心酶的存在C、转录始终需要σ亚基D、决定转录起始的专一性12．真核生物RNA聚合酶III的产物是：A、mRNAB、hnRNAC、rRNAD、srRNA和tRNA13．合成后无需进行转录后加工修饰就具有生物活性的RNA是：A、tRNAB、rRNAC、原核细胞mRNAD、真核细胞mRNA14．DNA聚合酶III的主要功能是：A、填补缺口B、连接冈崎片段C、聚合作用D、损伤修复15．DNA复制的底物是：A、dNTPB、NTPC、dNDPD、NMP16．下来哪一项不属于逆转录酶的功能：A、以RNA为模板合成DNAB、以DNA为模板合成DNAC、水解RNA－DNA杂交分子中的RNA链D、指导合成RNA二、填空题1．中心法则是于年提出的，其内容可概括为。
生物化学：名词解释大全
【生物化学：名词解释大全】第一章 蛋 白 质1．两性离子（dipolarion）2．必需氨基酸（essential amino acid）3．等电点(isoelectric point,pI)4．稀有氨基酸(rare amino acid)5．非蛋白质氨基酸(nonprotein amino acid)6．构型(configuration)7．蛋白质的一级结构(protein primary structure) 8．构象(conformation)9．蛋白质的二级结构(protein secondary structure) 10．结构域(domain)11．蛋白质的三级结构(protein tertiary structure) 12．氢键(hydrogen bond)13．蛋白质的四级结构(protein quaternary structure) 14．离子键(ionic bond)15．超二级结构(super-secondary structure)16．疏水键(hydrophobic bond)17．范德华力( van der Waals force)18．盐析(salting out)19．盐溶(salting in)20．蛋白质的变性(denaturation)21．蛋白质的复性(renaturation)22．蛋白质的沉淀作用(precipitation)23．凝胶电泳（gel electrophoresis）24．层析（chromatography）第二章 核 酸1．单核苷酸(mononucleotide)2．磷酸二酯键（phosphodiester bonds）3．不对称比率（dissymmetry ratio）4．碱基互补规律(complementary base pairing) 5．反密码子（anticodon）6．顺反子（cistron）7．核酸的变性与复性（denaturation、renaturation）8．退火（annealing）9．增色效应（hyper chromic effect）10．减色效应（hypo chromic effect）11．噬菌体（phage）12．发夹结构（hairpin structure）13．DNA 的熔解温度（melting temperature T m）14．分子杂交（molecular hybridization）15．环化核苷酸(cyclic nucleotide)第三章 酶与辅酶1．米氏常数（K m 值）2．底物专一性（substrate specificity）3．辅基（prosthetic group）4．单体酶（monomeric enzyme）5．寡聚酶（oligomeric enzyme）6．多酶体系（multienzyme system）7．激活剂（activator）8．抑制剂（inhibitor inhibiton）9．变构酶（allosteric enzyme）10．同工酶（isozyme）11．诱导酶（induced enzyme）12．酶原（zymogen）13．酶的比活力（enzymatic compare energy）14．活性中心（active center）第四章 生物氧化与氧化磷酸化1． 生物氧化（biological oxidation）2． 呼吸链（respiratory chain）3． 氧化磷酸化（oxidative phosphorylation）4． 磷氧比P/O（P/O）5． 底物水平磷酸化（substrate level phosphorylation）6． 能荷（energy charg第五章 糖 代 谢1．糖异生(glycogenolysis)2．Q 酶(Q-enzyme)3．乳酸循环(lactate cycle)4．发酵(fermentation)5．变构调节(allosteric regulation)6．糖酵解途径(glycolytic pathway)7．糖的有氧氧化(aerobic oxidation)8．肝糖原分解(glycogenolysis)9．磷酸戊糖途径(pentose phosphate pathway)10．D-酶（D-enzyme）11．糖核苷酸（sugar-nucleotide）第六章 脂类代谢1． 必需脂肪酸（essential fatty acid）2． 脂肪酸的α-氧化(α- oxidation)3． 脂肪酸的β-氧化(β- oxidation)4． 脂肪酸的ω-氧化(ω- oxidation)5． 乙醛酸循环（glyoxylate cycle）6． 柠檬酸穿梭(citriate shuttle)7． 乙酰CoA 羧化酶系（acetyl-CoA carnoxylase）8． 脂肪酸合成酶系统（fatty acid synthase system）第八章 含氮化合物代谢1．蛋白酶（Proteinase）2．肽酶（Peptidase）3．氮平衡（Nitrogen balance）4．生物固氮（Biological nitrogen fixation）5．硝酸还原作用（Nitrate reduction）6．氨的同化（Incorporation of ammonium ions into organic molecules）7．转氨作用（Transamination）8．尿素循环（Urea cycle）9．生糖氨基酸（Glucogenic amino acid）10．生酮氨基酸（Ketogenic amino acid）11．核酸酶（Nuclease）12．限制性核酸内切酶（Restriction endonuclease）13．氨基蝶呤（Aminopterin）14．一碳单位（One carbon unit）第九章 核酸的生物合成1．半保留复制（semiconservative replication）2．不对称转录（asymmetric trancription）3．逆转录（reverse transcription）4．冈崎片段（Okazaki fragment）5．复制叉（replication fork）6．领头链（leading strand）7．随后链（lagging strand）8．有意义链（sense strand）9．光复活（photoreactivation）10．重组修复（recombination repair）11．内含子（intron）12．外显子（exon）13．基因载体（genonic vector）14．质粒（plasmid）第十一章 代谢调节1．诱导酶（Inducible enzyme）2．标兵酶（Pacemaker enzyme）3．操纵子（Operon）4．衰减子（Attenuator）5．阻遏物（Repressor）6．辅阻遏物（Corepressor）7．降解物基因活化蛋白（Catabolic gene activator protein）8．腺苷酸环化酶（Adenylate cyclase）9．共价修饰（Covalent modification）10．级联系统（Cascade system）11．反馈抑制（Feedback inhibition）12．交叉调节（Cross regulation）13．前馈激活（Feedforward activation）14．钙调蛋白（Calmodulin）第十二章 蛋白质的生物合成1．密码子(codon)2．反义密码子(synonymous codon)3．反密码子(anticodon)4．变偶假说(wobble hypothesis)5．移码突变(frameshift mutant)6．氨基酸同功受体(isoacceptor)7．反义RNA(antisense RNA)8．信号肽(signal peptide)9．简并密码(degenerate code)10．核糖体(ribosome)11．多核糖体(poly some)12．氨酰基部位(aminoacyl site)13．肽酰基部位(peptidy site)14．肽基转移酶(peptidyl transferase)15．氨酰- tRNA 合成酶(amino acy-tRNA synthetase) 16．蛋白质折叠(protein folding)17．核蛋白体循环(polyribosome)18．锌指(zine finger)19．亮氨酸拉链(leucine zipper) 20．顺式作用元件(cis-acting element) 21．反式作用因子(trans-acting factor) 22．螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix)第一章 蛋白质1．两性离子：指在同一氨基酸分子上含有等量的正负两种电荷，又称兼性离子或偶极离子。
考研农学门类联考《415动物生理学与生物化学》生物化学-核酸的生物合成【圣才出品】
第9章核酸的生物合成一、单项选择题1．真核基因表达受下列哪个成分调控？（）A．操纵基因B．非组蛋白C．组蛋白D．阻遏蛋白【答案】B【解析】真核基因的表达调控没有操纵子结构，真核生物的调控序列是指DNA中与转录启动和调控有关的核苷酸序列，包括：启动子、增强子及沉默子，受基因调节蛋白的调控，基因调节蛋白属于非组蛋白。
因此答案选B。
2．DNA半保留复制时，如果亲代DNA完全被放射性同位素标记，在无放射性标记的溶液中经过两轮复制所得到的4个DNA分子为（）。
A．都带有放射性B．其中一半分子无放射性C．其中一半分子的每条链都有放射性D．都没有放射性【答案】B【解析】DNA复制为半保留复制，经两轮复制后，其中一半分子无放射性，有一半分子的一条链由放射性。
因此答案选B。
3．关于转录的叙述下列哪一项是正确的？（）A．mRNA是翻译的模板，转录只是指合成mRNA的过程B．转录需RNA聚合酶，是一种酶促的核苷酸聚合过程C．逆转录也需要RNA聚合酶D．DNA复制中合成RNA引物也是转录【答案】B【解析】A项，转录是指遗传信息由基因转移到RNA的过程，包括mRNA、tRNA、rRNA等；C项，参与逆转录的酶是逆转录酶，不需要RNA聚合酶；D项，DNA复制中合成RNA引物不是遗传信息的传递过程。
因此答案选B。
4．下列不是操纵子的组成部分的是（）。
A．结构基因B．启动子C．操纵基因D．阻遏物【答案】D【解析】ABC三项，操纵子包括在功能上彼此相关的结构基因和控制部位，控制部位是由启动子和操纵基因构成。
因此答案选D。
5．下列（）参与打开DNA双螺旋结构。
A．引物酶B．端粒酶C．拓扑异构酶D．解螺旋酶【答案】D【解析】A项，引物酶是用来合成引物的；B项，端粒酶是一种核糖核蛋白酶，它催化端粒中重复单元的合成，用以维持端粒长度及功能；C型，拓扑异构酶是在超螺旋解旋和形成过程中起作用。
因此答案选D。
6．下列（）导致的DNA损伤导致生物体死亡的可能性最大。
大学生物化学考试名词英文及解释大全
14．离子键：带相反电荷的基团之间的静电引力，也称为静电键或盐键。
15．超二级结构：指蛋白质分子中相邻的二级结构单位组合在一起所形成的有规则的、在空间上能辨认的二级结构组合体。
16．疏水键：非极性分子之间的一种弱的、非共价的相互作用。如蛋白质分子中的疏水侧链避开水相而相互聚集而形成的作用力。
14．活性中心（active center）
第四章 生物氧化与氧化磷酸化
1．生物氧化（biological oxidation）
2．呼吸链（respiratory chain）
3．氧化磷酸化（oxidative phosphorylation）
4．磷氧比P/O（P/O）
5．底物水平磷酸化（substrate level phosphorylation）
20．蛋白质的变性作用：蛋白质分子的天然构象遭到破坏导致其生物活性丧失的现象。蛋白质在受到光照、热、有机溶剂以及一些变性剂的作用时，次级键遭到破坏导致天然构象的破坏，但其一级结构不发生改变。
21．蛋白质的复性：指在一定条件下，变性的蛋白质分子恢复其原有的天然构象并恢复生物活性的现象。
22．蛋白质的沉淀作用：在外界因素影响下，蛋白质分子失去水化膜或被中和其所带电荷，导致溶解度降低从而使蛋白质变得不稳定而沉淀的现象称为蛋白质的沉淀作用。
11．核酸酶（Nuclease）
12．限制性核酸内切酶（Restriction endonuclease）
13．氨基蝶呤（Aminopterin）
14．一碳单位（One carbon unit）
第九章 核酸的生物合成
1．半保留复制（semiconservative replication）
生物化学_09 核酸降解和核苷酸的代谢
IMP转变为GMP和 转变为GMP （3）IMP转变为GMP和AMP
2、 补救途径
(利用已有的碱基和核苷合成核苷酸) (1) 磷酸核糖转移酶途径（重要途径）
核苷磷酸化酶
嘌呤核苷 + 磷酸 腺嘌呤 + 5-PRPP
次黄嘌呤(鸟嘌呤) 磷酸核糖转移酶
嘌呤碱 + 戊糖-1-磷酸 AMP + PPi
腺嘌呤磷酸核糖转移酶
基因组DNA 基因组 不被切割
限制—修饰的酶学假说 限制 修饰的酶学假说 1968年，Meselson 和Yuan发现了 型限制性核酸内切酶 年 发现了I型限制性核酸内切酶 发现了 1970年，Smith和Wilcox从流感嗜血杆菌中分离纯化了 年 和 从流感嗜血杆菌中分离纯化了 第一个II型限制性核酸内切酶 第一个 型限制性核酸内切酶Hind II 型限制性核酸内切酶
（2）尿嘧啶核苷酸的合成 ）
天冬氨酸转氨甲酰酶 二氢乳清酸酶
乳清苷酸焦磷酸化酶／Mg2+ 二氢乳清酸脱氢酶
乳清苷酸脱羧酶
（3） 胞嘧啶核苷酸的合成
尿嘧啶核苷三磷酸可直接与NH3（细菌）或Gln（动物） 细菌） 尿嘧啶核苷三磷酸可直接与 （动物） 反应，生成胞嘧啶核苷三磷酸。 反应，生成胞嘧啶核苷三磷酸。
二、脱氧核糖核酸酶
只能水解DNA磷酸二酯键的酶。 只能水解DNA磷酸二酯键的酶。 DNA磷酸二酯键的酶 牛胰脱氧核糖核酸酶（DNaseⅠ） 牛胰脱氧核糖核酸酶（DNaseⅠ）： 可切割双链和单链DNA 降解产物为3 DNA， 可切割双链和单链 DNA， 降解产物为 3’ - 磷酸 为末端的寡核苷酸。 为末端的寡核苷酸。 限制性核酸内切酶： 限制性核酸内切酶： 细菌产生的、能识别并特异切割外源DNA DNA特定 细菌产生的 、 能识别并特异切割外源 DNA 特定 中的磷酸二脂键( 序列中的磷酸二脂键 对碱基序列专一） 序列中的磷酸二脂键(对碱基序列专一）的核酸内 切酶。 切酶。
生物化学核酸的生物合成
13.1 DNA的生物合成
13.1.2 逆转录—由RNA指导合成DNA的过程 ➢ 逆转录酶：以RNA为模板，dNTP为底物，催化5端到3端
方向合成DNA的酶（RDDP）或反转录酶，是 1970年在劳氏肉瘤、鼠白血病病毒中发现的引 起生物致癌的酶。 ➢ 逆转录特点：（1）模板为单链RNA；
（2）逆转录酶（RnaseH）具有专一切除 RNA—DNA杂交分子中的RNA的功能。
u 解开DNA双螺旋结构
（4）拓扑异构酶 拓扑是物理学上的一个名称，空间异构的意思。
用于解开DNA超螺旋结构，TOPＩ——打开一条链；TOPⅡ从中间 剪开。
（5）单链结合蛋白（SSB） u 防止两条链再结合（复性）
（6）引发酶和引发体： u 催化引物的合成，多数是RNA聚合酶催化合成RNA引 物、也有
DNA复制——依赖于DNA的DNA合成，
合
是主要的合成方式。
成
逆转录 —— 依赖于RNA的DNA合成，
方
式
主要在病毒中，
是转录的逆过程。
DNA的损伤与修复—— DNA损伤后，
DNA片段的填补。
3
13.1 DNA的生物合成
13.1.1 DNA复制—由亲代DNA合成两个相同的 子代DNA的过程
u DNA复制的方式——半保留复制
u DNA复制的方式——半保留复制
Ø 6.DNA复制的过程——起始、延长和中止
复制的延伸：
是一个重复的过程。在RNA引物上，由DNA聚合酶Ⅲ（真核为α）催化， 以dNTP为底物，沿着5 / 3/滑动，按碱基配对原则在引物3/—OH 上接上相应的核苷酸，以添加dNMP顺序。不断滑动，不断添加，链就不 断延长。
②模板DNA高级结构的解除：拓扑异构酶Ⅱ（旋转酶）打开拓扑结构， 解旋酶打开双螺旋，DNA单链结合蛋白结合于已解开的链上，提供模板
生物化学名词解释(下)
第五章 糖 代 谢1．糖异生：非糖物质（如丙酮酸乳酸甘油生糖氨基酸等）转变为葡萄糖的过程。
2．Q 酶：Q 酶是参与支链淀粉合成的酶。
功能是在直链淀粉分子上催化合成（α-1，6）糖苷键，形成支链淀粉。
3．乳酸循环乳：酸循环是指肌肉缺氧时产生大量乳酸，大部分经血液运到肝脏，通过糖异生作用肝糖原或葡萄糖补充血糖，血糖可再被肌肉利用，这样形成的循环称乳酸循环。
4．发酵：厌氧有机体把糖酵解生成NADH 中的氢交给丙酮酸脱羧后的产物乙醛，使之生成乙醇的过程称之为酒精发酵。
如果将氢交给病酮酸丙生成乳酸则叫乳酸发酵。
5．变构调节：变构调节是指某些调节物能与酶的调节部位结合使酶分子的构象发生改变，从而改变酶的活性，称酶的变构调节。
6．糖酵解途径：糖酵解途径指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的阶段，是体内糖代谢最主要途径。
7．糖的有氧氧化：糖的有氧氧化指葡萄糖或糖原在有氧条件下氧化成水和二氧化碳的过程。
是糖氧化的主要方式。
8．肝糖原分解：肝糖原分解指肝糖原分解为葡萄糖的过程。
9．磷酸戊糖途径：磷酸戊糖途径指机体某些组织（如肝、脂肪组织等）以6-磷酸葡萄糖为起始物在6-磷酸葡萄糖脱氢酶催化下形成6-磷酸葡萄糖酸进而代谢生成磷酸戊糖为中间代谢物的过程，又称为磷酸已糖旁路。
10．D-酶：一种糖苷转移酶，作用于α-1，4 糖苷键，将一个麦芽多糖的片段转移到葡萄糖、麦芽糖或其它多糖上。
11．糖核苷酸：单糖与核苷酸通过磷酸酯键结合的化合物，是双糖和多糖合成中单糖的活化形式与供体。
第六章 脂类代谢1．必需脂肪酸：为人体生长所必需但有不能自身合成，必须从事物中摄取的脂肪酸。
在脂肪中有三种脂肪酸是人体所必需的，即亚油酸，亚麻酸，花生四烯酸。
2.α-氧化：α-氧化作用是以具有3-18碳原子的游离脂肪酸作为底物，有分子氧间接参与，经脂肪酸过氧化物酶催化作用，由α碳原子开始氧化，氧化产物是D-α-羟脂肪酸或少一个碳原子的脂肪酸。
3. 脂肪酸的β-氧化：脂肪酸的β-氧化作用是脂肪酸在一系列酶的作用下，在α碳原子和β碳原子之间断裂，β碳原子氧化成羧基生成含2个碳原子的乙酰CoA 和比原来少2 个碳原子的脂肪酸。
生物化学学习指导
生物化学学习指导及习题第一章蛋白质化学第二章核酸化学第三章酶学第四章维生素和辅酶第五章糖代谢第六章新陈代谢总论与生物氧化第七章脂类代谢第八章氨基酸代谢第九章核酸的生物合成第十章蛋白质的生物合成第十一章代谢的相互关系及调节控制二00九年三月第一章蛋白质化学I 主要内容一、蛋白质的生物学意义蛋白质是生物体内最为重要的有机化学物质之一，它几乎参与了生物体所有的生命活动，如生物体的构成、机体的运动、化学催化、机体的免疫保护、生物遗传信息的传递与表达等等，可以说蛋白质是一切生命活动的重要支柱，没有蛋白质就没有生命现象的存在，因此，蛋白质化学是生物化学中一个重要的研究方面。
二、蛋白质的元素组成蛋白质是由C、H、O、N、S等几种元素构成，其中C 50-55%、H 6-8%、O 20-30%、 N 15-17%、S 0-4%，且含量基本相同，因此通过测定蛋白质样品中元素含量就可以推测出样品中蛋白质的含量。
三、蛋白质的氨基酸组成（一）氨基酸的结构及特点一般的蛋白质都是由20种氨基酸构成，这些氨基酸都是在蛋白质的合成过程中直接加进去的，并有专门的遗传密码与其对应，这些构成蛋白质的基本氨基酸称为天然氨基酸(通用氨基酸)。
天然氨基酸具有如下特点：1. 20种天然氨基酸均有专门的遗传密码与其对应，它们在蛋白质的合成中是直接加上去的。
2. 除甘氨酸外，其它氨基酸至少含有一个手性碳原子。
3. 除脯氨酸外，其它氨基酸均为 -氨基酸。
4. 氨基酸虽有D、L–型之分，但存在于天然蛋白质中的氨基酸均为L-型氨基酸。
（二）天然氨基酸的分类1.根据氨基酸分子中氨基和羧基的相对数量进行分类2.根据氨基酸分子结构分类3.根据氨基酸侧链基团极性分类氨基酸根据其侧链基团在近中性的pH条件下是否带电荷以及带电荷的种类分成四类：非极性氨基酸、极性不带电荷氨基酸、极性带正电荷氨基酸、极性带负电荷氨基酸。
（三）稀有蛋白质氨基酸这部分主要是指虽然在蛋白质中有所存在，含量却较少的一类氨基酸。
生物化学——精选推荐
第一章蛋白质化学1、简述二级结构的主要内容。
α-螺旋(α-helix)，β-折叠(β-sheet)，β-转角(β-turn)，无规卷曲2、蛋白质变性及变性后结构与功能的变化。
蛋白质变性：物理因素：紫外照射、x射线、超声波、高压、震荡等；化学因素：强酸、强碱、重金属、有机溶剂等；结构上：主要是高级结构的破坏（主要指二级以上）；功能上：生物学功能的改变。
3、维持蛋白质的力有哪些？一级结构：主要是共价键(肽键、二硫键等)二级结构：主要是氢键等三级结构：主要是疏水键等四级结构：主要是次级键（盐键、范德华力等）4、举例说明蛋白质结构与功能的关系。
一级结构定义：一级结构与功能的关系：高级结构定义：高级结构与功能的关系：5、举例说明分离蛋白质的常规方法及其原理。
(1)根据溶解度不同：盐析法、等电点沉淀法和有机溶剂沉淀法(2)根据分子大小不同：透析法、超滤法和凝胶过滤法(3)根据带电性质不同：电泳法、离子交换层析法(4)根据配体特异性：亲和层析法6、说明谷胱甘肽的结构特点及其生理作用。
(1)结构特点：谷胱甘肽(GSH)是存在于动植物和微生物细胞中的一种重要三肽，由谷氨酸、半胱氨酸和甘氨酸组成，它的分子中有一个由谷氨酸的γ-羧基与半胱氨酸的α-氨基缩合而成的γ-肽键。
(2)生理作用：由于GSH含有一个活泼的巯基，可作为重要的还原剂，保护体内蛋白质或酶分子中的巯基免遭氧化，使酶或蛋白质处在活性状态下；GSH的巯基还具有嗜核特征，能与外源的嗜电子物质如致癌剂或药物等结合，从而阻断这些化合物与DNA、RNA或蛋白质结合，保护机体免遭损害。
7、简述凝胶层析法的基本原理及应用。
(1)基本原理：凝胶层析过程中直径大于孔径的分子不能进入凝胶内部，直接沿凝胶颗粒的间隙流出，所以向下移动速度较快；小分子物质除了可以在凝胶颗粒间隙中扩散外，还可以进入凝胶颗粒的微孔中，即进入凝胶相中，因此在向下移动的过程中，必须等它们从凝胶颗粒内扩散至颗粒间隙后再进入另一凝胶颗粒，造成在柱内保留时间长，小分子物质下移速度必然落后于大分子物质从而使混合样品中分子大小不同的物质随洗脱液按顺序地流出柱外而得到分离。
生物化学基础靳利娥第9章 核酸代谢
谷氨酸 + 氨基甲酰磷酸
氨基甲酰磷酸合成酶（CPS）的区别
尿嘧啶核苷酸从头合成 1. 经转酰、环化、脱水、脱氢等合成嘧啶环 2. 催化反应的酶为多功能酶 3. 共六步反应
第五步 获得磷酸核糖
第二步 限速步骤
第四步 嘧啶环生成 反应部位：线粒体
第三步 环化
第六步 产生生成
2 胞嘧啶核苷酸的合成
核苷酸激酶
尿嘧啶 + PRPP
磷酸嘧啶核苷 + PPi
尿嘧啶核苷 + ATP 尿苷激酶
UMP +ADP
胞嘧啶可被尿苷激酶催化生成胞嘧啶核苷酸。
ATP作用生成5-磷酸核糖焦磷酸(PRPP)，然后用 于单核苷酸的合成。
二、嘌呤核苷酸的合成代谢
一、从头合成途径 (de novo synthesis pathway) 定义：利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二
氧化碳等原料，经一系列酶促反应合成嘌呤核苷 酸的途径。主要部位:：肝、小肠和胸腺（脑和骨 髓不进行） 二、补救合成途径(salvage synthesis pathway)
断核苷酸的生成，是抗癌作用的节点所在
嘌 呤 合 成 调 节 机 制
嘌呤抗代谢物分子结构
嘌呤类似物
叶酸类似物
氨基酸类似物
三、嘧啶核苷酸的合成代谢
从头合成途径(de novo synthesis pathway) 补救合成途径(salvage synthesis pathway)
（一）嘧啶核苷酸的从头合成
(hypoxanthine- guanine phosphoribosyl transferase, HGPRT) • 胞苷激酶 (kinase)
3 补救合成过程
生物化学基础(靳利娥)第9章 核酸代谢
鸟嘌呤＋ 鸟嘌呤＋H2O
鸟嘌呤脱氨酶
黄嘌呤＋ 黄嘌呤＋NH3
尿酸的生成
尿酸 尿酸氧化酶
尿囊素
尿囊素酶
尿囊酸
尿囊酸酶
尿素 尿素酶
尿酸的排泄方式
尿酸 人，灵长类，短毛狗，鸟类、爬虫类、软 灵长类，短毛狗，鸟类、爬虫类、 体动物、海鞘类、 体动物、海鞘类、昆虫 哺乳动物（灵长类除外）、腹足类 哺乳动物（灵长类除外）、腹足类 ）、 硬骨鱼 大多数鱼类、两栖类、 大多数鱼类、两栖类、淡水瓣鳃类
单核苷（DNA 与RNA特异） 单核苷酸
特异DNA 顺序
限制性内切酶
• 定义：特定核苷酸序列处切开核苷酸之间3’,5’-磷酸二酯 定义：特定核苷酸序列处切开核苷酸之间 磷酸二酯 断裂或产生缺口。 键，使DNA断裂或产生缺口。 断裂或产生缺口 • 如果识别序列的碱基经过修饰，限制性内切酶就不作用。 如果识别序列的碱基经过修饰，限制性内切酶就不作用。 通常寄主DNA在特定核苷酸序列处被甲基化而得到保护 在特定核苷酸序列处被甲基化而得到保护 通常寄主 则被分解。 ，但外源DNA则被分解。 但外源 则被分解 • Ⅰ型限制性内切酶既能催化宿主DNA的甲基化，又催化 的甲基化， 型限制性内切酶既能催化宿主 的甲基化 非甲基化的DNA的水解； 的水解； 非甲基化的 的水解 • Ⅱ型限制性内切酶只催化非甲基化的 的水解。 型限制性内切酶只催化非甲基化的DNA的水解。 只催化非甲基化的 的水解
IMP合成四至六步 合成四至六步 合成
4. 甲酰甘氨酰胺核苷酸与谷氨酰胺反应为 甲酰甘氨咪唑核苷酸 酶： 甲酰甘氨咪唑核苷酸合成酶 5.甲酰甘氨咪唑核苷酸脱水环化为5-氨基 5.甲酰甘氨咪唑核苷酸脱水环化为5 甲酰甘氨咪唑核苷酸脱水环化为 咪唑核苷酸（ 生成嘌呤完整五元环） 咪唑核苷酸（ 生成嘌呤完整五元环） 5-氨基咪唑核苷酸与羧化生成5 6. 5-氨基咪唑核苷酸与羧化生成5-氨基咪 唑-4-羧酸核苷酸 酶： 氨基咪唑核苷酸羧化酶
生物化学核酸的合成总结
生物化学核酸的合成总结
生物化学核酸的合成是一个复杂的过程，它涉及到原料的选择、反应的条件和方法等多方面的因素。
以下是一些重要的总结和建议：
原料的选择
- 氮碱基和磷酸需要选择高纯度的化学试剂。
- 脱氧核糖需要通过专业的方法和设备进行合成。
- 有机溶剂需要使用高纯度的溶剂。
反应的条件
- 酶法合成核酸是迄今为止最具可行性的方法，但需要特定的
反应条件。
- 化学法合成核酸需要控制好反应的温度、pH、浓度和时间等
因素。
- 合成核酸的反应过程中，需要对反应物进行保护，例如，甲
基化保护和二甲基氨基保护。
合成的方法
- 固相合成是一种常用的方法，能够高效地合成寡核苷酸。
- 液相合成是另一种常用的方法，能够合成较长的核酸序列。
- 化学法和酶法的结合可以实现更精确的合成，但需要更多的操作和经验支持。
总的来说，生物化学核酸的合成需要仔细的技术操作和合理的方法设计。
当这些因素得到合理的控制和平衡时，生物化学核酸的合成可以实现高效、准确和规模化的要求。
沈同《生物化学》精要
沈同《生物化学》（第三版）精要速览第一章绪论第二章蛋白质的结构与功能第三章核酸的结构与功能第四章酶第五章糖代谢第七章生物氧化第八章氨基酸代谢第九章核苷酸代谢第十章DNA的生物合成第十一章RNA的生物合成第十二章蛋白质的生物合成第十三章基因表达调控第十四章基因重组和基因工程第一章绪论一、生物化学的的概念：生物化学（biochemistry)是利用化学的原理与方法去探讨生命的一门科学，它是介于化学、生物学及物理学之间的一门边缘学科。
二、生物化学的发展：1．叙述生物化学阶段：是生物化学发展的萌芽阶段，其主要的工作是分析和研究生物体的组成成分以及生物体的分泌物和排泄物。
2．动态生物化学阶段：是生物化学蓬勃发展的时期。
就在这一时期，人们基本上弄清了生物体内各种主要化学物质的代谢途径。
3．分子生物学阶段：这一阶段的主要研究工作就是探讨各种生物大分子的结构与其功能之间的关系。
三、生物化学研究的主要方面：1．生物体的物质组成：高等生物体主要由蛋白质、核酸、糖类、脂类以及水、无机盐等组成，此外还含有一些低分子物质。
2．物质代谢：物质代谢的基本过程主要包括三大步骤：消化、吸收→中间代谢→排泄。
其中，中间代谢过程是在细胞内进行的，最为复杂的化学变化过程，它包括合成代谢，分解代谢，物质互变，代谢调控，能量代谢几方面的内容。
3．细胞信号转导：细胞内存在多条信号转导途径，而这些途径之间通过一定的方式方式相互交织在一起，从而构成了非常复杂的信号转导网络，调控细胞的代谢、生理活动及生长分化。
4．生物分子的结构与功能：通过对生物大分子结构的理解，揭示结构与功能之间的关系。
5．遗传与繁殖：对生物体遗传与繁殖的分子机制的研究，也是现代生物化学与分子生物学研究的一个重要内容。
第二章蛋白质的结构与功能一、氨基酸：1．结构特点：氨基酸(amino acid)是蛋白质分子的基本组成单位。
构成天然蛋白质分子的氨基酸约有20种，除脯氨酸为α-亚氨基酸、甘氨酸不含手性碳原子外，其余氨基酸均为L-α-氨基酸。
生物化学——名词解释题库
【生物化学——名词解说大全】第一章蛋白质1．两性离子（dipolarion ）2．必要氨基酸（essential amino acid）3．等电点 (isoelectric point,pI)4．罕有氨基酸(rare amino acid)5．非蛋白质氨基酸(nonprotein amino acid) 6．构型 (configuration)7．蛋白质的一级构造(protein primary structure)8．构象 (conformation)9．蛋白质的二级构造(protein secondary structure)10．构造域 (domain)11．蛋白质的三级构造(protein tertiary structure)12．氢键 (hydrogen bond)13．蛋白质的四级构造(protein quaternary structure)14．离子键 (ionic bond)15．超二级构造(super-secondary structure) 16．疏水键 (hydrophobic bond)17．范德华力 ( van der Waals force) 18．盐析 (salting out)19．盐溶 (salting in)20．蛋白质的变性(denaturation)21．蛋白质的复性(renaturation)22．蛋白质的积淀作用(precipitation) 23．凝胶电泳（gel electrophoresis）24．层析（ chromatography ）第二章核酸1．单核苷酸 (mononucleotide)2．磷酸二酯键（phosphodiester bonds）3．不对称比率（dissymmetry ratio ）4．碱基互补规律(complementary base pairing)5．反密码子（anticodon）6．顺反子（ cistron ）7．核酸的变性与复性（ denaturation 、renaturation ）8．退火（ annealing）9．添色效应（hyper chromic effect ）10．减色效应（hypo chromic effect ）11．噬菌体（ phage）12．发夹构造（ hairpin structure ）13． DNA 的溶化温度（ melting temperature Tm）14．分子杂交（molecular hybridization ）15．环化核苷酸(cyclic nucleotide)第三章酶与辅酶1．米氏常数（K m值）2．底物专一性（substrate specificity ）3．辅基（ prosthetic group ）4．单体酶（ monomeric enzyme ）5．寡聚酶（ oligomeric enzyme ）6．多酶系统（multienzyme system ）7．激活剂（ activator ）8．克制剂（ inhibitor inhibiton）9．变构酶（ allosteric enzyme ）10．同工酶（ isozyme）11．引诱酶（ induced enzyme）12．酶原（ zymogen）13．酶的比活力（ enzymatic compare energy ）14．活性中心（ active center）第四章生物氧化与氧化磷酸化1．生物氧化（ biological oxidation ）2．呼吸链（ respiratory chain ）3．氧化磷酸化（ oxidative phosphorylation ）4．磷氧比 P/O（ P/O）5．底物水平磷酸化（ substrate level phosphorylation ）6．能荷（ energy charg第五章糖代谢1．糖异生 (glycogenolysis)2． Q 酶 (Q-enzyme)3．乳酸循环 (lactate cycle)4．发酵 (fermentation)5．变构调理 (allosteric regulation)6．糖酵解门路(glycolytic pathway)7．糖的有氧氧化(aerobic oxidation)8．肝糖原分解(glycogenolysis)9．磷酸戊糖门路 (pentose phosphate pathway) 10． D- 酶（ D-enzyme ）11．糖核苷酸（sugar-nucleotide）第六章脂类代谢1．必要脂肪酸（essential fatty acid ）2．脂肪酸的α -氧化 (α - oxidation)3．脂肪酸的β -氧化 (β - oxidation)4．脂肪酸的ω -氧化 (ω - oxidation)5．乙醛酸循环（glyoxylate cycle ）6．柠檬酸穿越 (citriate shuttle)7．乙酰 CoA 羧化酶系（ acetyl-CoA carnoxylase）8．脂肪酸合成酶系统（ fatty acid synthase system）第八章含氮化合物代谢1．蛋白酶（ Proteinase）2．肽酶（ Peptidase）3．氮均衡（ Nitrogen balance ）4．生物固氮（Biological nitrogen fixation）5．硝酸复原作用（Nitrate reduction ）6．氨的同化（ Incorporation of ammonium ions into organic molecules ）7．转氨作用（Transamination ）8．尿素循环（Urea cycle ）9．生糖氨基酸（Glucogenic amino acid ）10．生酮氨基酸（Ketogenic amino acid ）11．核酸酶（ Nuclease）12．限制性核酸内切酶（ Restriction endonuclease）13．氨基蝶呤（Aminopterin ）14．一碳单位（One carbon unit ）第九章核酸的生物合成1．半保存复制（ semiconservative replication ）2．不对称转录（asymmetric trancription ）3．逆转录（ reverse transcription ）4．冈崎片段（Okazaki fragment ）5．复制叉（ replication fork ）6．领头链（ leading strand）7．随后链（ lagging strand ）8．存心义链（sense strand）9．收复生（ photoreactivation ）10．重组修复（recombination repair ）11．内含子（ intron ）12．外显子（ exon）13．基因载体（genonic vector ）14．质粒（ plasmid ）第十一章代谢调理1．引诱酶（ Inducible enzyme ）2．标兵酶（ Pacemaker enzyme）3．操控子（ Operon）4．衰减子（ Attenuator ）5．隔绝物（ Repressor）6．辅隔绝物（ Corepressor）7．降解物基因活化蛋白（Catabolic gene activator protein ）8．腺苷酸环化酶（Adenylate cyclase ）9．共价修饰（ Covalent modification ）10．级联系统（ Cascade system）11．反应克制（Feedback inhibition ）12．交错调理（ Cross regulation ）13．前馈激活（Feedforward activation ）14．钙调蛋白（ Calmodulin ）第十二章蛋白质的生物合成1．密码子 (codon)2．反义密码子(synonymous codon)3．反密码子 (anticodon)4．变偶假说 (wobble hypothesis)5．移码突变 (frameshift mutant)6．氨基酸同功受体(isoacceptor)7．反义 RNA(antisense RNA)8．信号肽 (signal peptide)9．简并密码 (degenerate code)10．核糖体 (ribosome)11．多核糖体 (poly some)12．氨酰基部位(aminoacyl site)13．肽酰基部位(peptidy site)14．肽基转移酶(peptidyl transferase) 15．氨酰 - tRNA 合成酶 (amino acy-tRNA synthetase)16．蛋白质折叠(protein folding)17．核蛋白体循环(polyribosome)18．锌指 (zine finger)19．亮氨酸拉链(leucine zipper)20．顺式作用元件(cis-acting element) 21．反式作用因子(trans-acting factor) 22．螺旋 - 环 - 螺旋 (helix-loop-helix)第一章蛋白质1．两性离子：指在同一氨基酸分子上含有等量的正负两种电荷，又称兼性离子或偶极离子。
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❖ 中心法则揭示的意义：
总结了生物体内遗传信息的流动规律，揭示遗传 的分子基础，不仅使人们对细胞的生长、发育、 遗传、变异等生命现象有了更深刻的认识，而且 以这方面的理论和技术为基础发展了基因工程， 给人类的生产和生活带来了深刻的革命。
RNA聚合酶催化的反应
3´
5´
U
A
GC
CG
A
3´
模板DNA
U
5´
新合成RNA
RNA链的延伸图解
模板链（反义链）
有义链
复链
解链
新生RNA 3´
3´
RNA-DNA杂交螺旋
聚合酶的移动方向
延长部位
大肠杆菌RNA聚合酶的结构示意图
起始因子
核心酶(α2ββ)
全酶(α2ββ )
β——和模板DNA结合
β——起始和催化聚合反应
（一）复制原点与方向
• DNA 复制必须在特定位置开始，该位置称为复制原点。 • 真核生物染色体具有许多复制原点
一、复制原点
DnaB
SSB
(解螺旋酶)
DnaA
大肠杆菌DNA复制起点在起始阶段的结构模型
DNA复制的方向
未复制DNA
起始点
单向复制
起始点
起始点 复制叉的推进
双向复制
起始点
复制叉
复制叉
复制叉
环状 DNA复制时 所形成的θ结构
真核生物的复制都是双向的，且没有固定的复制终点。
5´
3´
（
解旋酶
二
）
SSB
半
解链酶
引物酶和引 发体
不 连
RNA引物
续
DNA聚合
的
酶III
复
DNA聚合
制
酶I
机
制
3´ 5´ RNA引 物
3´ 5´
（三）原核生物DNA聚合反应有关的酶 类
（1）DNA聚合酶: (DNA polymetases)
第一节 DNA的合成
一、DNA的半保留复制
DNA在复制时，两条链解开 分别作为模板，在DNA聚合酶 的催化下按碱基互补的原则合 成两条与模板链互补的新链， 以组成新的DNA分子。这样新 形成的两个DNA分子与亲代 DNA分子的碱基顺序完全一样。 由于子代DNA分子中一条链来 自亲代，另一条链是新合成的， 这种复制方式称为半保留复制。
• 扩充了中心法则
3、病毒逆转录过程 • 有助于对病毒致癌机制的了解 4、逆转录的生物学意义• 与真核细胞分裂和胚胎发育有关
• 逆转录酶是分子生物学重要工具酶
逆转录过程中cDNA的合成
整合入宿主细胞染色体DNA
cDNA
逆转录
转录
RNA
被膜 衣壳
RNA
转译
RNA
衣壳蛋白 丢失衣壳
进入细胞 丢失被膜
被膜蛋白 逆转录酶
逆转 录酶
逆逆转录病毒的生活周期
第二节 RNA的合成
一、转录的概念
转录（transcripion)是在 DNA的指导下的RNA聚合酶 的催化下，按照碱基配对的原则，以四种核苷酸为原 料合成一条与模板DNA互补的RNA 的过程。RNA的转 录从DNA模板的特定位点开始，并在一定的位点终止。 此转录区域为一个转录单位。
生物化学——第九章 核酸的生物合成
概述
复制
DNA
转录 逆转录
RNA 复制
翻译
蛋白质
遗传信息传递的中心法则
子代细胞的生长发育过程中，这些遗传信息通过 转录传递给RNA，再由RNA通过翻译转变成相应 的蛋白质多肽链上的氨基酸排列顺序，由蛋白质 执行各种各样的生物学功能，使后代表现出与亲 代相似的遗传特征。
（6）DNA连接酶（DNA ligase）
大肠杆菌三种DNA聚合酶比较
比较项目
DNA DNA DNA聚合酶Ⅲ 聚合酶Ⅰ 聚合酶Ⅱ （复合物）
分子量
109，000 120，000
每个细胞的分子统计数 400
100
5´-3 ´聚合酶作用
+
+
3´-5 ´核酸外切酶作用 +
+
5´-3 ´核酸外切酶作用 +
α——？
RNA合成过程
启动子 （promoter)
RNA聚合酶
起始
双链DNA
局部解开
终止子 (terminator)
磷酸二酯
键形成
55
离开
延长阶段
5 解链区到达
基因终点 5
终止阶段
5
3 3 3
5 RNA
3
非信息区
转录的产物
体内的RNA，包括mRNA、tRNA、rRNA和SnRNA， 均是以DNA为模板，在RNA聚合酶催化下合成的。
• 编码链 5′…GCATGGAATC…3′
• 模板链 3′…CGTACCTTAG…5′
转录
mRNA 5′…GCAUGGAAUC…3′
二、 RNA聚合酶
RNA聚合酶（依赖DNA的RNA聚合酶），在有Mg2+、4种 核苷三磷酸(dNTP)和DNA模板存在时，它能从新催化核苷 酸聚合成与模板DNA互补的RNA长链。
-
转化率（相对活性）
1
0 .05
400，000 10-20 + + + 50
DNA聚合酶的3-5外切酶水解位点
错配碱基
3´
5´
5´
3´
3´- 5´核酸外切 酶水解位点
二、逆转录作用
1、概念 2、逆转录酶
以RNA为模板合成DNA， 这与通常转录过程中遗 传信息从DNA到RNA的方 向相反，故称为逆转录 作用。
（2）引物酶(peimase)和引发体(primosome)
启动RNA引物链的合成。
（3） DNA解链酶 (DNA helicase)
（4）单链结合蛋白(single-strand binding protein)
SSB: 结合在解开的DNA单链上，防止重新形成双
螺旋。
（5）拓扑异构酶(topoisomerase):兼具内切酶和连接 酶活力，能迅速将DNA超螺旋或双螺旋紧张状态变 成松驰状态，便于解链。