不同地域和寄主来源的核盘菌遗传多样性分析_韩广振
不同地区桃树根际土壤微生物群落结构及多样性分析
第44卷,第1期2024年1月栽培生理Cultivation Physiology中国果菜China Fruit &Vegetable不同地区桃树根际土壤微生物群落结构及多样性分析徐海忠2，薛彦华2，丁洪发2，戚恒瑞1，李天昊1，毛伟健1*，程凡升1*（1.青岛农业大学食品科学与工程学院，山东青岛266109；2.山东天同食品有限公司，山东临沂276000）摘要:植物根际土壤微生物群落能够加速根际营养元素的循环，调节土壤肥力。
分析桃树根际土壤微生态结构，可以为桃树种植土壤改良提供依据。
利用高通量测序技术对临沂市李官、汤头、沂水3个地区桃园根际土壤微生物多样性和群落组成进行分析。
经筛选和去除嵌合体后，得到了425267条优质序列，这些序列的长度主要集中在400～450bp 。
在3个地区的样品中共鉴定出4175个操作性分类单元（OTU ）。
物种分类结果显示，细菌包括25个门、54个纲、145个目、272个科、497个属和577个物种。
在临沂不同地区的桃树根际土壤样品中，细菌群落组成和结构存在一定差异，细菌丰富度和多样性的顺序为汤头＞沂水＞李官。
细菌群落中，线菌门和变形菌门的丰度之和达到50.37%～66.07%，属于绝对优势菌门。
根据COG 功能分类统计，土壤细菌的功能基因主要集中在新陈代谢、遗传信息和细胞信号传导等方面。
总体而言，桃根际土壤的细菌多样性和群落组成在不同地区之间存在差异。
关键词:桃树；土壤；根际微生物；16S rRNA 测序中图分类号：TS201.3文献标志码：A文章编号：1008-1038(2024)01-0072-08DOI：10.19590/ki.1008-1038.2024.01.015Microbial Community Structure and Diversity of Peach RhizosphereSoil in Different RegionsXU Haizhong 2,XUE Yanhua 2,DING Hongfa 2,QI Hengrui 1,LI Tianhao 1,MAO Weijian 1*,CHENG Fansheng 1*(1.College of Food Science and Technology,Qingdao Agricultural University,Qingdao 266109,China;2.Shandong Tiantong Food Co.,Ltd.,Linyi 276000,China)Abstract:Plant rhizosphere soil microbial community can accelerate the circulation of rhizosphere nutrients andregulate soil fertility.The analysis of rhizosphere soil microecological structure of peach trees can effectively improve the planting soil of peach trees.The rhizosphere soil microbial diversity and community composition of收稿日期:2023-06-11基金项目:山东省重点研发计划-乡村振兴科技创新提振行动计划（2022TZXD0012）；青岛特种食品研究院揭榜挂帅项目（6602422201）第一作者简介:徐海忠（1983—），男，工程师，本科，主要从事果蔬深加工方面的研究工作*通信作者简介:毛伟健（2000—），男，硕士，主要从事食品生物技术方面的研究工作程凡升（1983—），男，教授，博士，主要从事食品生物技术方面的教学与研究工作人类活动引起的全球变化包括大气二氧化碳浓度升高、气候变暖、降水变化、干旱和大气氮沉降增加，是全球范围内生物多样性丧失的主要因素[1]。
核盘菌引起的菌核病生物防治研究进展
引文格式：李恩琛, 郗征, 朱娜, 等. 核盘菌引起的菌核病生物防治研究进展[J]. 云南农业大学学报(自然科学), 2023, 38(4):714−724. DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).202211047核盘菌引起的菌核病生物防治研究进展*李恩琛， 郗 征， 朱 娜， 刘 佳， 徐秉良 **， 张树武 **(甘肃农业大学 植物保护学院，甘肃省农作物病虫害生物防治工程实验室 ，甘肃 兰州 730070)摘要: 菌核病是由核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum )侵染引起的广谱性植物病害，在世界范围内造成巨大经济损失。
随着生防技术的日益提高，生物防治成为植物病害综合治理的重要措施。
本研究综述了目前菌核病的防治现状，重点围绕菌核病生物防治的研究进展，对不同拮抗真菌、细菌、真菌病毒、植物源杀菌剂和有机土壤改良剂在菌核病防治中的作用机制和防治效果进行系统阐述；讨论了生物防治研究与应用过程存在的问题，对生防微生物和天然植物资源未来的发展方向以及应用前景进行展望，以期为菌核病的安全、高效防治提供参考。
关键词: 核盘菌；菌核病；生物防治；拮抗微生物中图分类号: S476.1 文献标志码: A 文章编号: 1004–390X (2023) 04−0714−11Research Advances on Biocontrol of Sclerotinia Rot caused bySclerotinia sclerotiorumLI Enchen ，XI Zheng ，ZHU Na ，LIU Jia ，XU Bingliang ，ZHANG Shuwu(College of Plant Protection, Gansu Agricultural University, Biocontrol Engineering Laboratory ofCrop Diseases and Pests of Gansu Province, Lanzhou 730070, China)Abstract: Sclerotinia rot, caused by the fungus Sclerotinia sclerotiorum , is a broad spectrum plant disease that causes enormous economic losses worldwide. Biocontrol has become an important strategy for integrated management of plant diseases, as the development of biocontrol technology.This review provides an overview of the current status of sclerotinia rot management, focusing on the research progress of biocontrol of sclerotinia rot, and presents a systematic elucidation of the mechan-isms and effectiveness of different antagonistic fungi, bacteria, mycovirus, botanical fungicides and organic soil amendments in the control of sclerotinia rot. The problems in biocontrol research and ap-plication processes are discussed, and foreground for the future development direction and applica-tion of biocontrol microorganisms and natural plant resources are prospected, in order to provide ref-erences for the safe and effective control measures against sclerotinia rot in the future.Keywords: Sclerotinia sclerotiorum ; sclerotinia rot; biocontrol; antagonistic microorganisms云南农业大学学报（自然科学），2023，38(4)：714−724Journal of Yunnan Agricultural University (Natural Science)E-mail: ********************收稿日期：2022-11-22 修回日期：2023-08-25 网络首发日期：2023-09-08*基金项目：甘肃农业大学“伏羲杰出人才培育计划”项目 (Gaufx-03J03)；甘肃农业大学人才专项经费(2017RCZX-07)。
不同茬口土壤和大豆品种对根瘤菌遗传多样性的影响_王浩赵双进王绍东陈文新
Table 1
前茬作物 Fore-rotating crop 冬小麦 Winter wheat 玉米 Maize 全氮 Total nitrogen (g·kg−1) 0.945±0.021a 0.670±0.013b
哈尔滨
王绍东 1**
石家庄
陈文新 2
北京 100094; 050031)
(1. 东北农业大学国家大豆工程技术研究中心
150028; 2. 中国农业大学生物学院
3. 河北省农林科学院粮油作物研究所
摘
要
土壤和大豆品种是影响根瘤菌遗传多样性的主要因素。本研究通过土壤捕捉试验 , 分别从冬小麦茬
口和玉米茬口土壤中种植的 4 个大豆品种根瘤中分离得到 149 株快生根瘤菌和 49 株慢生根瘤菌。 对这些菌株 进行 16S rDNA 限制性酶切分析 (ARDRA)、16S-23S 基因间隔 (IGS)以及共生基因 (nod C)的限制性片段长度多 态性分析 (RFLP), 考察土壤茬口和大豆品种对大豆根瘤菌遗传多样性的影响。ARDRA 分析结果表明 , 快生根 瘤菌全部属于中华根瘤菌属 (Sinorhizobium), 慢生根瘤菌全部属于慢生根瘤菌属 (Bradyrhizobium)。IGS 酶切分 型将所有菌株分为 3 种图谱类型 , 其中型Ⅰ与辽宁慢生根瘤菌 (B. liaoningense)的模式菌株酶切图谱类型完全 一致 , 型Ⅱ和型Ⅲ与费氏中华根瘤菌 (S. fredii)的模式菌株酶切图谱类型完全一致。 综合以上结果 , 本研究分离 到的菌株分属于以上 2 个种。在两种茬口土壤中快生根瘤菌费氏中华根瘤菌均为优势种群 , 在冬小麦茬口土 壤中的比例 (平均 95.18%)远高于玉米茬口土壤 (平均 53.78%)。 ‘冀豆 12’大豆品种的费氏中华根瘤菌在两种茬 口土壤中所占比重均高于其他品种。对菌株的 IGS 基因型与宿主大豆品种的相关性分析表明 , 大豆品种与根 瘤菌 IGS 基因型之间具有一定相关性。nod C-RFLP 酶切分型结果表明 , 土壤茬口和大豆品种对菌株的共生基 因无明显影响。本研究表明根瘤菌、土壤茬口和大豆品种间存在一定的相关性。土壤茬口对根瘤菌的种群结 构影响较大 , 大豆品种对根瘤菌的基因型具有一定的选择性。 关键词 前茬作物 土壤 大豆品种 根瘤菌 遗传多样性 中图分类号 : Q938 文献标识码 : A 文章编号 : 1671-3990(2014)06-0648-07
用SSR分子标记分析香菇原生质体单核体的遗传多样性
用SSR分子标记分析香菇原生质体单核体的遗传多样性吴锦荣;鲍大鹏【摘要】运用根据香菇全基因组设计的104对S S R引物,对香菇21株原生质体单核体进行了遗传多样性分析,有58对S S R引物表现出多态性,多态性引物比例为55.8%,获得了430条扩增条带,其中多态性条带占298条,多态性条带比例达69.3%.运用N T S Y S-pc21软件分析了供试菌株之间的遗传相似性,研究表明:栽培品种和野生菌株之间存在明显的遗传差异性,但具有很高的相似系数的栽培品种之间则存在很近的亲缘关系;同一双核体得到的两个原生质体单核体菌株之间存在非常近的遗传关系.【期刊名称】《发酵科技通讯》【年(卷),期】2017(046)004【总页数】5页(P233-237)【关键词】香菇;原生质体单核体;SSR标记;遗传多样性【作者】吴锦荣;鲍大鹏【作者单位】新疆大学科学技术学院 ,新疆阿克苏 843000;上海农业科学院食用菌研究所 ,农业部南方食用菌资源利用重点实验室 ,上海 201403;上海农业科学院食用菌研究所 ,农业部南方食用菌资源利用重点实验室 ,上海 201403【正文语种】中文【中图分类】S646中国是香菇栽培的发源地，距今已有近900 年的香菇栽培历史.香菇在我国食用菌产业链中占有举足轻重的地位.香菇是世界第二大人工栽培食用菌，其产量仅次于双孢蘑菇.香菇产业的发展对香菇育种工作提出许多新的要求，香菇菌株遗传多样性分析是育种工作中一项非常重要的基础性研究,目前已经有很多学者对我国香菇自然种质资源和栽培品种的遗传背景进行了研究[1-5]，我国香菇野生品种拥有丰富的多样性，但是栽培品种的亲缘关系很近，遗传背景单一，多样性不丰富.香菇属于四极性异宗结合担子菌，有性生活史中绝大部分是以双核体菌丝体形式存在.目前对香菇遗传多样性的研究都是以双核体为研究材料，因而所获得的遗传差异是两个可亲和的细胞核的共同表现.而在香菇的杂交育种中，杂交亲本通常是单核体菌株.原生质体单核体菌株在杂交育种中的优点表现为：单核体直接来源于营养菌丝体，无减数分裂过程，从而有利于保存和稳定表达亲本优良性状；直接从菌丝体中获得单核体，减少了育种工作量，也缩短了育种时间；拓宽了无法形成子实体的野生菌质的杂交亲本基因型.1995年，杨岱筠等[6]得到金针菇菌丝体单核体，并分析了其遗传特性；1993年，潘迎捷[7]在异宗结合食用菌原生质体制备的研究中发现，单核体是重要的遗传材料，为食用菌育种开辟新的道路；1999年，上海市农科院以香菇栽培菌种Le1和野生菌种0426单核体为亲本，杂交选育出了申香8号菌种，相比亲本增产24%～30%[8].2002年，焦海涛等[9]进行了香菇单核体杂交试验研究，研究显示:杂交双核菌丝生长速度明显快于其亲本单核体；2008年，宋春艳等进行单核体杂交试验时，以单核体香菇939和中19为亲本，考查杂交体和亲本菌种子实体性状，研究结果表明：10 个杂交体的子实体与亲本有明显差异，且杂交后代的性状与亲本的交配类型有一定的关联性[10].所以，对香菇单核体菌株的遗传多样性的研究不仅能够对品种资源有更加深入的了解，而且能够有助于选择杂交亲本，以及有助于了解品种的遗传背景，开展品种溯源研究.笔者选取了7 对栽培品种的原生质体单核体和7 个野生菌株的原生质体单核体作为供试材料，采用基于香菇全基因组中发掘的SSR分子标记对这些单核体的遗传多样性进行分析.研究表明：21株香菇原生质体单核体间存在遗传差异性，相互之间存在一定的遗传多样性.这是首次对香菇单核体之间的亲缘关系进行报道.供试香菇菌株共21 株(表1)，均为原生质体单核体，其中9 对菌株分别来源于同一香菇双核体菌株，Xd2-6-1，Xd2-3-1和Xd3-3-1菌株分别来源于3个不同亲本.根据香菇全基因组数据(http://172.17.21.49/)，运用Primer primer 5软件设计SSR引物，并由上海生工生物技术公司合成.采用改进的CTAB法[11]提取香菇单核菌丝体中的基因组DNA.10 μL PCR反应体系中含有：1 μL的基因组DNA(50～100 ng/μL)，1 μL10×PCR缓冲液，0.2 μL dNTP(10 nmol/L)，1 μL MgCl2(25 nmol/L)，0.1 μL Taq DNA聚合酶(5 U/μL，Takara公司)，引物(10 μmol/L)各0.75 μL，5.2 μL ddH2O.PCR反应程序为：94 ℃下5 min；然后在94 ℃下50 s，55 ℃下50 s，72 ℃下50 s，共30 个循环；最后72 ℃保持5 min.PCR扩增产物加入6 μL加样缓冲液，混合均匀后在95 ℃下变性5 min，然后置于冰水混合物中冷却3 min，取3 μL于6%变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳，电泳缓冲液为1×TBE，电泳条件为：电压1 000 V，电流200 mA，功率200 W，电泳时间为45 min.电泳结果银染显色后拍照，进行数据分析.根据电泳结果，有扩增条带记为1，无条带记为0，生成距阵，利用NTSYS-pc软件对数据进行ΜPGMA聚类分析[12].根据香菇全基因组序列设计了共显性、稳定性、多态性和易操作性高，具有扩增产物的104 对SSR引物，经对21 个单核体菌株的遗传多样性分析，其中有58 对引物表现出多态性，占总数的55.8%，如表2所示.在具有多态性的58 对SSR引物标记中，以遗传稳定、多态性高和可靠性强的重复单位二核苷酸和三核苷酸的类型最多，分别为18 个和22 个，分别占总数的31.0%和37.9%.即不采用单拷重复位点进行扩增，从而有效地提高原生质体单核体遗传多样性的鉴定成功率.上述58 对多态性SSR引物在21 个单核体菌株中共扩增出430 条条带，其中多态性条带为298 条，比例达69.3%.应用NTSYS-pc21软件对21 个供试香菇单核体菌株进行遗传聚类分析(图1)，以0.58相似性为切割点，供试菌株可以分为三大类群：类群一为4 株来自湖南张家界的野生菌株的单核体；类群二为3 株来自四川喜德县野生菌株的单核体；类群三为14 株来自栽培菌种的单核体.其中2 株单核体亲本为日本栽培菌株.试验发现在相似系数很高的点，约为0.78，有一个聚集类群，即来自于国内的7 个(表1中的菌株编号为1，2，3，4，5，6，7)栽培菌株的原生质体单核体，从而揭示出它们之间很相似的遗传背景.遗传背景最相似的是源自亲本L66、申18、241及9015菌株的单核体，它们之间存在着最高的相似系数，约为0.88.这一现象暗示了它们可能有比较近的共同祖先，也表明来自相同亲本的单核体间得到的亲本遗传物质较丰富且稳定.已经有很多学者对香菇栽培品种和野生菌株的遗传多样性进行了研究，对亲本的遗传多样性进行研究是育种工作的基础，成功选育优良性状的菌种，关键在于正确选择杂交亲本，在杂交过程中将亲本的优良性状保留并传递下去.迄今为止，所开展的香菇遗传多样性研究都是以双核体菌株为供试材料，导致发生遗传距离偏向于双核菌种中某一单核受体亲本的情况.而以单核体为供试材料的香菇遗传多样性研究则不会出现这种状况.本文的供试原生质体单核体与孢子单核体完全不同：一是依靠原生质体单核化技术得到；二是双核菌丝体未经减数分裂阶段.因最终获得的单核体未经基因重组阶段，因此供试菌株的杂交遗传背景被纯粹、完整和准确地反映出来.此次研究的21 株供试单核体的聚类分析结果表明：所试香菇的栽培与野生菌株之间具有较大的遗传距离，栽培菌株之间的亲缘关系非常相近，与之前对香菇双核体的遗传多样性的研究结果相一致[13-14].本研究首次对香菇单核体的遗传多样性进行了报道，为以后对香菇遗传多样性的研究开辟了一条新路径.笔者的研究方法助推了今后对香菇杂交亲本遗传背景的全面、细致地解剖与了解.在本研究的聚类分析中一个比较有趣的结果：来自同一亲本的两个原生质体单核体多数聚集在一个小类群中，具有相似性，表明它们之间具有很近的亲缘关系.这种现象不仅表现在栽培菌株中，如L66-1和L66-2，武香1号-1和武香1号-2，44-1和44-2，而且也表现在野生菌株中，如L321-1和L321-2，L391-1和L391-2.可以将这个结果称之为“亲本近缘”现象，虽然目前所获得的实验数据尚不足以充分证明“亲本近缘”这一结论，但这种自然现象的发现值得进一步开展研究，并从中揭示新的自然规律，有意识地引入外来类型和野生菌株等重要的种质资源，拓宽育种基础，为香菇杂交育种工作提供新的理论指导.【相关文献】[1] 宋莹,刘娜,肖千明,等.十五个香菇菌株遗传特异性研究[J].北方园艺,2014,22(18):163-166.[2] 宋莹,张忠伟,刘俊杰,等.香菇辽抚4号遗传差异性分析[J].育种驯化,2016,38(5):19-20.[3] 罗海凌,邹龙玉,方雪婷,等.香菇遗传多样性研究进展[J].北方园艺,2014,24(21):185-187.[4] 巫萍,章炉军,张丹,等.利用SSR标记鉴定香菇单核体及杂交后代[J].微生物学通报,2016,43(2):444-455.[5] 刘靖宇,宋秀高,叶夏,等.香菇菌株遗传多样性ISSR、RAPD和SRAP综合分析[J].食用菌学报,2011,18(3):1-8.[6] 杨岱筠,张丕奇,郑美媛,等.白色金针茹原生质体单核菌系的建立及其遗传特性分析[J].食用菌学报,1995,2(4):18-21.[7] 潘迎捷.异宗结合食用菌的原生质体单核化[J].上海农业学报,1993,9(2):1-5.[8] 谭埼,潘迎捷,等.用单核原生质体杂交育成香茹新菌株申香8号[J].食用菌学报,1999,6(2):3-6.[9] 焦海涛,杨先新,周伟,等.香茹原生质体单核体杂交方法试验[J].中国食菌,2002,21(6):8-10.[10] 宋春艳,尚晓冬,谭琦,等.香茹原生质体单核体杂交后代性状变异初探[J].食用菌学报,2008,15(3):1-6.[11] 张红,秦莲花,谭琦,等.用改进的CTAB法提取香菇基因组DNA[J].上海大学学报(自然科学版),2006,12(5):547-550.[12] JAIN N, JAIN S, SAINI N, et a1. SSR analysis of chromosome 8 regions associated with aroma and cooked kernel elongation in Basmati rice[J]. Euphytica, 2006,152(2):259-273.[13] 龚利娟,李玉,刘淑艳.香菇品种遗传多样性RAPD分子标记的研究[J].菌物研究,2005,3(1):17-21.[14] 刘春滟,李南羿,张玉琼.香菇EST-SSR标记的开发及应用[J].食用菌学报,2010,17(2):1-6.。
木豆种质资源AFLP标记遗传多样性分析
木豆种质资源AFLP标记遗传多样性分析闫龙;关建平;宗绪晓【期刊名称】《作物学报》【年(卷),期】2007(33)5【摘要】利用AFLP分子标记技术,以木豆野生种(Cajanus scarabaeiodes)为对照,对来自印度、中国、非洲和美洲的139份栽培木豆(Cajanus cajan)种质遗传多样性进行研究.17对引物共扩增出502条清晰可辨的带,其中多态性带494条.遗传相似性系数UPGMA聚类图,揭示木豆种内存在足够的遗传多样性,可用于种质资源的准确鉴别与分类.借助遗传距离的ME进化树又将参试种质分成8个组群.分析结果表明,印度地方资源遗传多样性广泛,育成品种遗传基础广阔;非洲、美洲资源遗传多样性较丰富,且与印度资源的亲缘关系较密切.中国地方资源遗传多样性独特,且与印度、非洲、美洲栽培木豆资源亲缘关系不明显.研究结果基本支持印度木豆起源和多样性中心、非洲次生多样性中心的观点,并提出中国次生起源中心和遗传多样性中心假说.研究还发现,木豆核质互作雄性不育系(A)和保持系(B)间存在独特的AFLP 谱带差异,可能有助于分子标记辅助的木豆杂种优势利用和杂交种培育.【总页数】9页(P790-798)【作者】闫龙;关建平;宗绪晓【作者单位】中国农业科学院作物科学研究所;中国农业科学院作物科学研究所;国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程,北京,100081;中国农业科学院作物科学研究所;国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程,北京,100081【正文语种】中文【中图分类】S5【相关文献】1.苦荞种质资源AFLP标记遗传多样性分析 [J], 侯雅君;张宗文;吴斌;李艳琴2.基于AFLP标记的黄河三角洲中国柽柳种质资源遗传多样性分析 [J], 李永涛;杨庆山;刘德玺;周健;王莉莉;王振猛;魏文千3.基于AFLP标记的贵州及其邻省薏苡种质资源遗传多样性分析 [J], 李秀诗; 周祥; 李志芳; 黎青; 杨成龙; 周明强; 付瑜华4.基于AFLP标记的贵州及其邻省薏苡种质资源遗传多样性分析 [J], 李秀诗; 周祥; 李志芳; 黎青; 杨成龙; 周明强; 付瑜华5.基于AFLP标记的河八王种质资源遗传多样性分析及分子身份证构建 [J], 刘昔辉;张荣华;张革民;周会;宋焕忠;方位宽;区惠平;杨丽涛;李杨瑞因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
陕西秦巴山区中华蜜蜂线粒体DNA的遗传多样性
陕西秦巴山区中华蜜蜂线粒体DNA的遗传多样性王俊杰;李婉玫;邱立飞;马丽红;冯志豪;廉振民;魏朝明【期刊名称】《陕西师范大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2018(046)001【摘要】To analyze the genetic diversity of A pis cerana cerana from Qinling-Daba Mountain ar-eas in Shaanxi province ,200 populations in20sampling sites were sampled from Qinling-Daba Mountain areas in Shaanxi province and analyzed using the gene region between tRNA leu ～CO Ⅱof the mitochondrial DNA (mtDNA ) by sequenced .The results revealed that :the total length of these mtDNA fragments were 349bp ,consisting of a 90 bp non-coding region and a 259 bp partial CO Ⅱ coding region .The base composition of A + T was over 85％ ,which suggested a strong A + T bias .There were 25 variable sites and 29 haplotypes .The haplotype diversity was 0 .680 ± 0 .037 ,and the nucleotide diversity was 0 .00294 ± 0 .00025 .The results of cluster analysis showed that the A pis cerana cerana from Qinling-Daba Mountain areas in Shaanxi province had no significant difference and the genetic relationship of A pis cerana cerana was closer to those A-pis cerana samples from Beijing ,Jilin and Gansu ,while the genetic relationship was closer to those A pis cerana samples from Japan than those from India .%为研究陕西秦巴山区中华蜜蜂遗传多样性,对陕西秦巴山区20个地理种群的200群中华蜜蜂线粒体DNA tRNAleu～COⅡ基因片段进行测序分析.结果显示:线粒体DNA基因片段长度为349 bp,其中包括90 bp非编码区和259 bp的COⅡ部分序列,A+T含量大于85％,表现出A+T偏倚性;共检测到25个变异位点和29种单倍型,单倍型多样度为0.680±0.037,核苷酸多样度为0.00294±0.00025;聚类分析发现陕西秦巴山区中华蜜蜂各地理种群间未发生明显遗传分化,与北京、吉林、甘肃等地及日本东方蜜蜂亲缘关系也较近,而与印度东方蜜蜂亲缘关系较远.【总页数】7页(P84-90)【作者】王俊杰;李婉玫;邱立飞;马丽红;冯志豪;廉振民;魏朝明【作者单位】陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119;陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119;陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119;陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119;陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119;陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119;陕西师范大学生命科学学院 ,陕西西安 710119【正文语种】中文【中图分类】S891【相关文献】1.海南中华蜜蜂线粒体DNA的遗传多样性 [J], 周姝婧;徐新建;朱翔杰;高景林;周冰峰2.陕西秦巴山区野桑蚕线粒体COⅠ序列的遗传多样性与系统进化分析 [J], 孟刚;彭云武;王瑞娴;楚渠;梁嘉俊;凌君3.湖南龙山不同海拔中华蜜蜂种群遗传多样性的微卫星DNA分析 [J], 徐浩;陈孝梅;蔺哲广;吉挺4.浙江省金华市中华蜜蜂线粒体DNA遗传多样性研究 [J], 曹联飞;苏晓玲;陈道印;赵东绪;华启云5.昌宁县中华蜜蜂种群遗传结构调查——基于线粒体DNA COX1分子标记 [J], 邱勇;田虎兴;李贵安;曾冠;普绍忠;普光正因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
核桃实生居群遗传多样性ISSR分析
JournalofPlantGeneticResources
核桃实生居群遗传多样性 ISSR分析
李国田，艾呈祥，张力思，魏海蓉，刘庆忠
（山东省果树研究所/山东省果树生物技术育种重点实验室，泰安 271000）
摘要：利用 ISSR技术对新疆核桃元丰、云新核桃、泰山野核桃和陕西核桃 4 个核桃实生居群共 61 份种质进行了遗传多样 性分析。 结果表明：从 36 条 ISSR引物中筛选 9 条引物，共检测出 101 个位点，多态性位点 89 个，占检测位点总数的 88.12%， 有效等位基因数、Nei′s基因多样性指数和 Shannon 信息指数分别为 1.5207、0.3125 和 0.4759。 UPGMA聚类结果表明，61 份核 桃种质聚为 5 组，元丰核桃居群和陕西核桃首先聚在一起，然后与云新核桃聚在一起，最后与泰山野核桃相聚，其中陕西核桃 居群的遗传多样性最高，分为 2 组，其多态位点百分率、H值和 I值分别为 66.29%、0.2111 和 0.3239。 居群间遗传一致度在 0.6727 ～0.7970 之间，基因流为 0.4220，表明不同居群间基因交流程度很低，基因分化明显，在遗传组成上存在显著差异。
主要手段，国内外已对核桃属植物的遗传关系、品种 鉴别等方面进行了多方面的研究[2-5] ， 等 Bayazit [6] 利用 AFLP方法对土耳其低需冷量核桃的多样性进 行了分析，用于确定核桃在地中海地区分布的范围； 国内利用 等 RAPD、SSR 技术对核桃属不同种之间
收稿日期 修回日期 ：2010-05-20
关键词：核桃；实生居群；遗传分析；ISSR
ISSRAnalysisofGeneticDiversity among Seedling Walnut （ Juglansspp.） Populations
不同陕西生境核桃内生真菌多样性研究
不同陕西生境核桃内生真菌多样性研究惠建超;翟梅枝;李梦歌;刘泽星;阿依佳玛丽·依玛尔【期刊名称】《河南农业大学学报》【年(卷),期】2018(052)006【摘要】选取夏季不同陕西生境中核桃(Juglans regia L.)的不同组织部位为供试材料,采用组织分离法,进行内生真菌的分离鉴定和多样性研究.结果表明,从864个组织块中共分离得到643株内生真菌,经形态学和分子生物学鉴定,归为30属,其中交链孢霉属(Alternaria)为优势类群,占菌株总数的27.06％;茎叶核菌属(Ectostroma)和花核菌属(Anthina)为亚优势类群,分别占菌株总数的12.13％和8.09％.不同陕西生境中,分离得到的内生真菌数量:山阳(271株)>蓝田(193株)>宜君(179株);山阳核桃内生真菌的多样性最丰富,均匀度指数和多样性指数分别为0.50和1.43;山阳和宜君相似程度最高,相似性指数为0.649.不同组织中,2 a生茎(144株)>干茎(142株)>1 a生茎(135株)>叶(131株)>果(53株)>根(38株);2 a 生茎的均匀度指数和多样性指数最高,分别为0.31和0.82;2 a生茎与干茎的相似程度最高,相似性指数为0.600.【总页数】12页(P956-966,982)【作者】惠建超;翟梅枝;李梦歌;刘泽星;阿依佳玛丽·依玛尔【作者单位】西北农林科技大学林学院核桃研究中心,陕西杨凌712100;西北农林科技大学林学院核桃研究中心,陕西杨凌712100;西北农林科技大学林学院核桃研究中心,陕西杨凌712100;西北农林科技大学林学院核桃研究中心,陕西杨凌712100;沙依巴克区林业厅,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830000;西北农林科技大学林学院核桃研究中心,陕西杨凌712100;沙依巴克区林业厅,新疆维吾尔自治区乌鲁木齐830000【正文语种】中文【中图分类】S718.81【相关文献】1.不同生境春季核桃内生真菌分离及其多样性 [J], 阿依佳玛丽·依玛尔;刘泽星;毛光瑞;翟梅枝2.不同生境下野生铁皮石斛内生真菌多样性的初步研究 [J], 毛益婷;代晓宇;马荣3.陕西蓝田核桃内生真菌多样性与时空分布 [J], 刘泽星;阿依佳玛丽·依玛尔;毛光瑞;张婷婷;翟梅枝4.陕西宜君核桃内生真菌多样性研究 [J], 李梦歌;惠建超;阿依佳玛丽•依玛尔;刘泽星;翟梅枝5.2种不同生境甘草内生真菌的分离鉴定及多样性比较 [J], 孙一帆;任广喜;史启今;姜丹;刘春生因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
猴头菌的遗传多样性及生物分类学研究
猴头菌的遗传多样性及生物分类学研究猴头菌（Hericium erinaceus），又被称为猴头菇或猴头香，属于担子菌门真菌科。
它具有独特的外形，其菌体像一棵悬挂的糯米，故得名猴头菌。
猴头菌不仅被当作一种美味可口的食材，还被广泛应用于中药及保健品中，被誉为“山珍菌王”。
猴头菌的遗传多样性是生物分类学研究的重要内容之一。
遗传多样性是指种群或物种内个体之间或种间遗传变异的程度。
它反映了物种的进化历程和遗传结构，对于物种的保护、繁育与利用具有重要意义。
研究表明，猴头菌的遗传多样性较高，不同地域的猴头菌种群之间存在一定的遗传差异。
例如，中国南方地区的野生猴头菌种群与北方地区的种群在遗传结构上存在差异，这与地理隔离和生态环境的差异有关。
另外，栽培种和野生种的猴头菌之间也存在一定的遗传差异。
这些差异的存在对于种源选择、栽培方法改良和种质资源保护具有重要意义。
为了研究猴头菌的遗传多样性，科研人员采用了多种分子生物学技术和遗传学方法。
例如，DNA分子标记技术被广泛应用于猴头菌的种群遗传学研究中。
通过利用随机扩增多态性DNA（RAPD）和简单重复序列（SSR）等分子标记技术，研究人员可以有效地检测和分析猴头菌种群之间的遗传变异。
此外，利用基因测序技术和生物信息学分析方法，科研人员可以获得猴头菌的基因组信息，进而揭示其遗传演化的规律和机制。
通过对猴头菌的遗传多样性的研究，我们可以更好地了解猴头菌的种群动态和遗传特征，为保护和合理利用猴头菌资源提供科学依据。
例如，通过研究不同地区猴头菌的遗传多样性，科研人员可以进行种源选择，选育适应不同地理环境的优良品种，提高猴头菌的产量和质量。
此外，研究猴头菌的遗传多样性还可以为猴头菌种质资源的收集、保存和共享提供理论依据，促进国内外猴头菌种质资源的互通互济。
需要指出的是，猴头菌的遗传多样性研究还存在一些挑战和亟待解决的问题。
首先，鉴于猴头菌的生育方式是有性繁殖和无性繁殖交替进行，研究人员需要进一步探索不同繁殖方式对猴头菌遗传多样性的影响。
寄主转移对烟粉虱体内共生菌多样性的影响
３ ~ ５ 代饲养ꎬ构建烟粉虱的棉花种群ꎮ 饲养条件
均为温度(２６±１) ℃ ꎬ相对湿度(６０±１０) ％ꎬ光周期
１４ Ｌ ∶１０ Ｄꎮ
１.２ 两个烟粉虱种群体内共生菌多样性分析
１.２.１ ＤＮＡ 提取和 ＰＣＲ 扩增 按照昆虫 ＤＮＡ
提取试剂盒( ＯＭＥＧＡꎬ ＵＳＡ) 说明书提取烟粉虱
样品 ＤＮＡꎬ 并 根 据 ＭｏＢｉｏ ＰｏｗｅｒＳｏｉｌ ｋｉｔ 试 剂 盒
ｍａｉｎ ｆｏｒｍ. Ｔｈｅ ｃｏ￣ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｒｉｃｈｎｅｓｓ ｏｆ ｓｙｍｂｉｏｔｉｃ ｂａｃｔｅｒｉａ ｉｎｃｒｅａｓｅｄ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｗｈｅｎ Ｂ. ｔａｂａｃｉ ｗｅｒｅ ｔｒａｎｓ￣
收稿日期:２０２３－０７－０４
基金项目:山东省烟草产业技术体系项目( ＳＤＡＩＴ－２５－０３) ꎻ山东省农业科学院农业科技创新工程项目( ＣＸＧＣ２０２３Ａ４７) ꎻ山东省农业重大
象ꎬ但寄主转移前后烟粉虱体内共生菌的多样性
虱属ꎬ别名棉粉虱或甘薯粉虱
９００ 种
[３]
[１－２]
ꎬ是一种典型的
ꎮ 其为害方式多样ꎬ主要通过直接取食
植物韧皮部的汁液ꎬ导致植物营养不良ꎬ严重时可
使植株长势衰弱
[４]
ꎻ且烟粉虱取食后分泌大量蜜
露ꎬ蜜露与真菌结合在一起可诱导植物发生煤污
病等真菌病害ꎬ降低植株光合作用和呼吸作用的
ｏｂｖｉｏｕｓｌｙ ｗｈｅｎ Ｂ. ｔａｂａｃｉ ｗｅｒｅ ｔｒａｎｓｆｅｒｒｅｄ ｔｏ ｃｏｔｔｏｎ ｆｒｏｍ ｔｏｍａｔｏꎬ ａｎｄ ｔｈｅ ｄｏｍｉｎａｎｔ ｓｙｍｂｉｏｔｉｃ ｂａｃｔｅｒｉａ ｉｎｃｒｅａｓｅｄ
ｔｏ ｆｏｕｒ ｇｅｎｕｓ ａｓ Ｐｏｒｔｉｅｒａꎬ Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａꎬ Ｈａｍｉｌｔｏｎｅｌｌａ ａｎｄ Ｃａｒｄｉｎｉｕｍ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｖｅ ａｂｕｎｄａｎｃｅ ｃｈａｎｇｉｎｇ ｓｉｇｎｉｆｉ￣
玉米种子真菌区系和种带优势镰孢菌遗传多样性及其致病机理研究
玉米种子真菌区系和种带优势镰孢菌遗传多样性及其致病机理研究玉米种子真菌区系和种带优势镰孢菌遗传多样性及其致病机理研究摘要：玉米是全球重要的粮食作物之一，然而，玉米种子真菌感染是导致玉米产量损失的主要原因之一。
这些真菌中，镰孢菌是最为常见且具有潜在病原性的种类之一。
本文旨在探讨玉米种子真菌区系中镰孢菌的遗传多样性以及其对玉米的致病机理。
引言：玉米是世界上重要的农作物之一，在全球范围内广泛种植。
然而，在玉米种植过程中，种子真菌感染是造成玉米产量损失的主要原因之一。
镰孢菌属是玉米种子真菌中最常见的一类，且具有潜在致病性。
因此，研究玉米种子真菌区系和镰孢菌的遗传多样性及其致病机理对于玉米产量的提高和病害防控具有重要意义。
方法：本研究从不同地理区域采集玉米种子样本，进行玉米种子真菌区系的分离纯化。
通过形态学和分子生物学方法，鉴定镰孢菌的物种并分析其遗传多样性。
同时，将不同物种的镰孢菌进行致病性评估，研究其致病机理。
结果：在玉米种子真菌区系中，镰孢菌是最为常见的一类真菌。
通过形态学和分子生物学的鉴定，发现玉米种子真菌区系中镰孢菌主要包括镰刀镰孢菌、柄锈菌和黑斑镰孢菌等。
通过分析其遗传多样性，发现不同物种和不同地理区域的镰孢菌存在一定的遗传差异。
通过致病性评估发现，镰孢菌在玉米种子发芽过程中会引起种子发芽受阻、幼苗生长缓慢等症状，严重影响玉米的生长和发育。
讨论：玉米种子真菌区系中的镰孢菌对玉米的产量和质量具有严重影响。
不同物种和不同地理区域的镰孢菌存在遗传多样性，这表明镰孢菌的分布与地理环境有关。
研究镰孢菌的致病机理有助于我们更好地理解镰孢菌与玉米的互作关系，为病害防控提供理论基础。
进一步研究如何利用细胞遗传学和分子生物学技术阻断镰孢菌致病的途径也具有重要意义。
结论：玉米种子真菌区系中镰孢菌的遗传多样性和致病机理的研究对于玉米产量的提高和病害防控具有重要意义。
在进一步研究中，可以结合细胞遗传学和分子生物学技术，探索针对镰孢菌的防控策略，为提高玉米产量和质量提供科学依据镰孢菌是玉米种子真菌区系中最常见的一类真菌。
不同居群北柴胡ISSR_遗传多样性分析
生物技术进展 2023 年 第 13 卷 第 6 期 919 ~ 924Current Biotechnology ISSN 2095‑2341研究论文Articles不同居群北柴胡ISSR 遗传多样性分析闫晓睿 ， 薛帼珍 ， 杨晓霞 ， 王宇 ， 杜晨晖 ， 张朔生 ， 刘计权 *山西中医药大学中药与食品工程学院，山西 晋中 030619摘要：利用简单重复间序列（inter -simple sequence repeat, ISSR)分子标记技术对10个不同居群的北柴胡样品进行遗传多样性分析，为进一步开展北柴胡优良种质的选育提供依据。
以不同居群的北柴胡新鲜叶片为材料，用植物组织DNA 提取试剂盒提取北柴胡样品DNA 。
利用单因素梯度实验研究最佳ISSR -PCR 反应体系，将不同居群的DNA 扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳，利用NTSYS -pc 软件分析不同居群北柴胡的遗传多样性。
结果发现，10个居群的北柴胡遗传相似系数介于0.142 8~1.000 0。
经聚类分析，10个不同居群的北柴胡分为3大类，第1类为甘肃北柴胡；第2类包括5个北柴胡样品，分别为陵川、河南、闻喜、平陆、襄汾北柴胡，均属于山西省晋南居群；第3类包括4个北柴胡样品，分别为内蒙古、临汾、浑源、广灵北柴胡，类属于山西省北部居群及内蒙古居群；10个居群的北柴胡存在比较丰富的遗传多样性，且与其地理环境有一定的关联性。
研究结果可为北柴胡种质资源保护及优良种质选育提供理论依据。
关键词：北柴胡；ISSR ；PCR 扩增；聚类分析；遗传多样性DOI ：10.19586/j.20952341.2023.0084 中图分类号：Q37，R932 文献标志码：AISSR Genetic Diversity Analysis of Bupleurum chinense from Different PopulationsYAN Xiaorui ， XUE Guozhen ， YANG Xiaoxia ， WANG Yu ， DU Chenhui ， ZHANG Shuosheng ，LIU Jiquan *College of Chinese Medicine and Food Engineering ， Shanxi University of Chinese Medicine ， Shanxi Jinzhong 030619， ChinaAbstract ：The genetic diversity of 10 different populations of Bupleurum chinense was studied by inter -simple sequence repeat （ISSR ） molecular marker technique ， in order to provide basis for further breeding of B. chinense . The DNA of Bupleurum chi⁃nense samples from fresh leaves of different populations was extracted by the plant tissue DNA extraction kit. The single factor gradient experiment was used to study the optimal ISSR -PCR reaction system. The DNA amplification products of different populations were subjected to agarose gel electrophoresis ， and the genetic diversity of different populations of B. chinense was analyzed byNTSYS -pc software. The results showed that the genetic similarity coefficient of 10 populations ranged from 0.142 8 to 1.000 0. 10 different populations were divided into three categories by cluster analysis ， with the first category being Gansu. The second category included five samples of B. chinense ， Lingchuan ， Henan ， Wenxi ， Pinglu ， and Xiangfen ， all belonging to the Jinnan population in Shanxi Province. The third category included four samples ， namely Inner Mongolia ， Linfen ， Hunyuan ， and Guangling ， belonging to the northern population of Shanxi Province and Inner Mongolia. The 10 populations of B. chinense have relatively abundant genetic diversity and are related to their geographical environment. The results could provide theoretical basis for germplasm resources protection and elite germplasm breeding of B. chinense.Key words ：Bupleurum chinense ； ISSR ； PCR amplification ； cluster analysis ； genetic diversity收稿日期：20230615； 接受日期：20231016基金项目：山西省自然基金面上项目（20210302123233；20230602324694）；山西道地药材品质形成机制创新团队项目（2022TD2009）；山西中医药大学中药资源学科建设项目（2023XKJS -24）；山西中药材产业技术体系项目（CZ2023018）； 山西中医药大学太行本草专项（2022PY -TH -30）。
新疆小麦白粉病菌群体遗传多样性分析
麦类作物学报 2023,43(9):1135-1141J o u r n a l ofT r i t i c e a eC r o p s d o i :10.7606/j.i s s n .1009-1041.2023.09.06网络出版时间:2023-07-13网络出版地址:h t t ps ://k n s .c n k i .n e t /k c m s 2/d e t a i l /61.1359.s .20230712.1503.004.h t m l 新疆小麦白粉病菌群体遗传多样性分析收稿日期:2022-11-17 修回日期:2022-12-24基金项目:新疆农业科学院青年科技骨干创新能力培养项目(x j n k q-2020024);新疆维吾尔自治区区域协同创新专项(2020E 0215);新疆自治区重点研发专项(2021B 02002-1);农业科技创新稳定支持项目(x j n k yw d z c -2022004);现代农业产业技术体系专项(C A R S -03-88)第一作者E -m a i l :930062867@q q.c o m 通讯作者:高海峰(E -m a i l :g h f 20044666@163.c o m );崔燕华(E -m a i l :1319693372@q q.c o m )来汉林1,沈煜洋2,李月1,陈利2,李广阔2,崔燕华3,高海峰2(1.新疆农业大学生命科学学院,新疆乌鲁木齐830052;2.新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室/农业部库尔勒作物有害生物科学观测实验站,新疆乌鲁木齐830091;3.新疆农业科学院综合试验场,新疆乌鲁木齐830012)摘 要:为了解新疆小麦白粉病菌群体多样性及其间关系,利用I S S R 分子标记对2020年喀什㊁阿克苏㊁和田㊁昌吉㊁塔城共5个地区13个县市小麦白粉病菌群体进行遗传多样性研究㊂结果表明,喀什㊁阿克苏㊁和田㊁昌吉㊁塔城小麦白粉病菌群体的遗传距离为0.0317~0.0945,塔城与阿克苏群体的遗传距离最近,和田与喀什的遗传距离最远;总体N e i s 遗传多样性指数为0.2571,群体N e i s 内遗传多样性指数为0.2175,群体内的遗传变异占总体变异的84.60%,表明遗传变异主要来源于群体内㊂群体间基因流N m 值为2.7490,表明新疆不同区域群体存在一定的基因交流㊂N o r m a l i z e d M a n t e l S t a t i s t i c 分析表明,小麦白粉病菌群体间遗传距离与地理距离相关性不大㊂关键词:新疆;小麦;白粉病菌;遗传多样性中图分类号:S 512.1;S 330 文献标识码:A 文章编号:1009-1041(2023)09-1135-07A n a l y s i s o fG e n e t i cD i v e r s i t y o fB l u m e r i a g r a m i n i s f .s p.t r i t i c i P o p u l a t i o n i nX i n j i a n g Pr o v i n c e L A IH a n l i n 1,S H E NY u y a n g 2,L IY u e 1,C H E NL i 2,L IG u a n g k u o 2,C U IY a n h u a 3,G A O H a i f e n g2(1.C o l l e g e o fL i f eS c i e n c e s ,X i n j i a n g A g r i c u l t u r a lU n i v e r s i t y ,U r u m q i X i n j i a n g 830052,C h i n a ;2.I n s t i t u t e o f P l a n t P r o t e c t i o n ,X i n j i a n g A c a d e m y o fA g r i c u l t u r a l S c i e n c e s /K e y L a b o r a t o r y o f I n t e g r a t e dP e s tM a n a g e m e n t o nC r o p i nN o r t h w e s t e r nO a s i s ,M i n i s t r yo fC h i n a /S c i e n t i f i cO b s e r v i n g a n dE x p e r i m e n t a l S t a t i o no fK o r l a ,M i n i s t r y o fA g r i c u l t u r e ,U r u m q i X i n j i a n g 830091,C h i n a ;3.X i n j i a n g A c a d e m y o fA g r i c u l t u r a l S c i e n c e sC o m p r e h e n s i v eT e s t i n g G r o u n d ,U r u m q iX i n j i a n g 830012,C h i n a )A b s t r a c t :I no r d e r t o c l a r i f y p o p u l a t i o n g e n e t i c d i v e r s i t y o f t h ew h e a t p o w d e r y m i l d e w p a t h o ge n i nX i n -j i a n g ,s i m p l e r e p e a t s e q u e n c e i n t e r v a l s (I S S R )m o l e c u l a rm a r k e r sw e r eu s e d t o a n a l y z e p o p u l a t i o n g e -n e t i c d i v e r s i t y of t h ew h e a t p o w d e r y m i l d e w p a t h og e n i s o l a t e s f r o m13c o u n t i e s i n f i v e r e gi o n s ,i n c l u -d i n g K a s h g a r ,A k s u ,H o t a n ,C h a n g j i ,a n dT a c h e n g i n 2020.T h e r e s u l t s s h o w e d t h a t ge n e t i c d i s t a n c e of f i v e p o p u l a t i o n s o fK a s hg a r ,A k s u ,H o t a n ,Ch a n g ji ,a n dT a c h e n g r a n g e d f r o m0.0317t o 0.0945,a m o n g w h i c h g e n e t i cd i s t a n c eb e t w e e n T a c h e n g a n d A k s u p o p u l a t i o n sw a s m i n i m u m ,a n dt h a tb e -t w e e nH o t a na n dK a s h g a rw a sm a x i m u m.G e n e t i c d i v e r s i t y i n d e xo f o v e r a l l p o p u l a t i o nw a s 0.2571,a n d t h a tw i t h i n p o p u l a t i o nw a s 0.2175.G e n e t i c v a r i a t i o nw i t h i n p o pu l a t i o n a c c o u n t e d f o r 84.60%o f t h e t o t a l v a r i a t i o n s ,i n d i c a t i n g t h a t t h e g e n e t i c v a r i a t i o nm a i n l y o r i g i n a t e dw i t h i n t h e p o p u l a t i o n .T h e v a l u e o f g e n e f l o w (N m )b e t w e e n p o p u l a t i o n sw a s2.7490,i n d i c a t i n g th a t t h e r ew a sac e r t a i n g e n e e x c h a n g e a m o n gp o p u l a t i o n s i nd i f f e r e n tr e g i o n so fX i n j i a n g .N o r m a l i z e d M a n t e lS t a t i s t i ca n a l ys i s s h o w e d t h a t t h e r ew a sn o tas t r o n g c o r r e l a t i o no f g e n e t i cd i s t a n c ea n d g e o g r a ph i cd i s t a n c eb e t w e e n Copyright ©博看网. All Rights Reserved.p o p u l a t i o n s o f t h ew h e a t p o w d e r y m i l d e w p a t h o g e n.K e y w o r d s:X i n j i a n g;W h e a t;B l u m e r i a g r a m i n i s f.s p.T r i t i c i;G e n e t i c d i v e r s i t y由专性寄生菌B l u m e r i a g r a m i n i s f.s p.t r i t i c i 引起的小麦白粉病是一种典型的气传病害,是我国小麦生产上危害最为严重的病害之一,严重影响小麦的产量和品质[1-2]㊂20世纪70年代以来,由于矮秆品种㊁密植技术的推广和氮肥使用量的增加,导致小麦白粉病的危害呈现逐年加重的趋势[3]㊂近年来,受菌源变异㊁气候变化㊁种植条件改变及部分主栽品种抗病性丧失等多种因素的影响,新疆地区小麦白粉病严重发生[4]㊂培育和选用抗病品种是防治该病最经济㊁有效的措施[5],研究小麦白粉菌群体遗传多样性对选育抗病品种和病害防治具有重要意义㊂随着分子生物学的发展,D N A分子标记在小麦白粉病菌群体遗传结构的研究中发挥着重要作用[6]㊂用于白粉病菌研究的D N A分子标记技术有限制性片段长度多态性(r e s t r i c t i o nf r a g m e n t l e n g t h p o l y m o r p h i s m,R F L P)㊁随机扩增多态性(r a n d o m a m p l i f i e d o f p o l y m o r p h i c D N A, R A P D)㊁简单重复序列(s i m p l e s e q u e n c e r e p e a t s, S S R)㊁简单重复序列区间(s i m p l er e p e a ts e-q u e n c e i n t e r v a l s,I S S R)㊁扩增片段长度多态分析(a m p l i f i e d f r a g m e n t l e n g t h p o l y m o r p h i s m, A F L P)和单核苷酸多态性(s i n g l en u c l e o t i d e p o l-y m o r p h i s m,S N P)分析等[7-8]㊂雷雨等[9]在2013年利用R A P D分子标记对四川西南部小麦白粉病菌群体遗传多样性进行了研究,发现该地区的遗传多态性丰富,毒性多样性与遗传多样性不存在线性关系㊂曹志强等[10]利用A F L P技术对2009 2015年安徽省各地区小麦白粉病菌群体遗传结构进行研究,发现不同年份的白粉病菌群体遗传多样性水平存在一定的遗传变异㊂马原里等[11]用S N P结合S S R分子标记对小麦抗白粉病基因进行了定位㊂I S S R技术具有操作简单㊁重复性高㊁无需同位素㊁精准度高㊁能高程度揭示D N A 多态性等优点,被广泛应用于分子检测中[12]㊂贾少锋等[13]构建了小麦白粉病菌I S S R-P C R体系,并首次将其应用到小麦白粉病菌遗传多样性分析中㊂刘娜等[14]采用I S S R和S R A P分子标记对四川省小麦白粉病菌野生群体遗传多样性进行了比较分析,发现这两种标记均可用于研究小麦白粉病菌的遗传多样性㊂李莹等[15]和李强等[16]用I S S R技术分析了陕西省不同年份小麦群体的遗传多样性㊂有关新疆小麦此方面的研究未见报道㊂为此,本研究利用I S S R分子标记技术对2020年喀什㊁阿克苏㊁和田㊁昌吉㊁塔城小麦白粉病菌群体进行遗传多样性研究,以期为新疆小麦白粉病流行监测㊁抗病育种及病害的防治提供依据㊂1材料与方法1.1材料菌株:2020年5月初至6月中旬小麦白粉病发病高峰期,分别从新疆5个地区13个县市采集小麦白粉病菌样品,地点为:和田地区的墨玉县(1)和洛浦县(2),喀什地区的泽普县(2)和叶城县(2),阿克苏地区的温宿县(7)㊁拜城县(2)和阿瓦提县(3),塔城地区的额敏县(6)㊁塔城市(5)和托里县(6),昌吉州的阜康市(8)㊁木垒县(5)和奇台县(5),经分离纯化,共获得54株白粉病菌菌株(表1)㊂扩繁小麦品种:感病品种新春6号,由新疆农业科学院粮食作物研究所提供㊂1.2方法1.2.1菌株D N A提取将获得的54株菌株用新春6号扩繁,收集叶片上小麦白粉病菌分生孢子,称取10~15m g,用天根微生物基因组D N A提取试剂盒D P302(中国)提取基因组D N A,用N a n oD r o p610检测D N A浓度, O D260/O D280为1.65~1.85之间,4ʎC保存待用㊂1.2.2I S S R-P C R检测对小麦白粉病菌利用I S S R标记进行P C R 检测,预试验从P1~P18[15]中筛选出8条扩增条带明显且多态性稳定的引物P3㊁P5㊁P7㊁P9㊁P15㊁P16㊁P17和P18(表2),引物由上海生工合成,目标片段在100~2000b p之间㊂P C R反应体系25μL:2ˑP C R M i x12.5μL,菌株D N A模板1μL,上下游引物各0.25μL,d d H2O11μL㊂反应条件:94ħ预变性5m i n;94ħ变性30s,50~54ħ退火35s,72ħ延伸40s,35个循环;72ħ延伸3m i n,4ħ保存㊂扩增结果用1.5%琼脂糖凝胶电泳检测㊂1.2.3遗传多样性分析根据54个小麦白粉病菌菌株的扩增条带结㊃6311㊃麦类作物学报第43卷Copyright©博看网. All Rights Reserved.表1 采样位置信息T a b l e 1 I s o l a t e s l o c a t i o n i n f o r m a t i o n县(市)C o u n t y (c i t y )样品数N o .o f s a m pl e s 菌株数N o .o f i s o l a t e s海拔E l e v a t i o n /m 地理位置L o c a t i o n东经E a s t l o n gi t u d e 北纬N o r t h l a t i t u d e墨玉县K a r a k a xC o u n t y 51124579ʎ37'26ᵡ37ʎ13'43ᵡ洛浦县L o p C o u n t y32134479ʎ59'44ᵡ37ʎ5'44ᵡ132580ʎ1'3ᵡ37ʎ5'54ᵡ泽普县P o s k a m C o u n t y42119877ʎ17'29ᵡ38ʎ13'0ᵡ120977ʎ21'0ᵡ38ʎ11'10ᵡ叶城县Y e c h e n g C o u n t y82141277ʎ17'11ᵡ37ʎ51'10ᵡ140077ʎ21'18ᵡ37ʎ49'32ᵡ温宿县W e n s uC o u n t y87108380ʎ9'42ᵡ41ʎ17'40ᵡ114180ʎ4'21ᵡ41ʎ22'39ᵡ117780ʎ1'27ᵡ41ʎ24'45ᵡ119879ʎ56'23ᵡ41ʎ25'44ᵡ123079ʎ54'27ᵡ41ʎ27'53ᵡ118979ʎ59'5ᵡ41ʎ24'13ᵡ114080ʎ3'54ᵡ41ʎ23'7ᵡ拜城县B a i c h e n g C o u n t y 72125481ʎ34'5ᵡ41ʎ41'14ᵡ115981ʎ53'25ᵡ41ʎ41'44ᵡ阿瓦提县A w a tC o u n t y5397580ʎ22'46ᵡ40ʎ33'28ᵡ98280ʎ22'30ᵡ40ʎ33'43ᵡ100680ʎ20'37ᵡ40ʎ46'4ᵡ额敏县E m i nC o u n t y8665684ʎ2'37ᵡ46ʎ37'40ᵡ61783ʎ59'40ᵡ46ʎ37'46ᵡ63784ʎ0'18ᵡ46ʎ37'7ᵡ66784ʎ5'10ᵡ46ʎ41'6ᵡ73184ʎ9'43ᵡ46ʎ42'14ᵡ78984ʎ9'47ᵡ46ʎ39'44ᵡ塔城市T a c h e n g C i t y9559083ʎ23'21ᵡ46ʎ40'41ᵡ75583ʎ24'59ᵡ46ʎ46'28ᵡ74083ʎ23'4ᵡ46ʎ46'58ᵡ70783ʎ19'9ᵡ46ʎ47'45ᵡ60783ʎ2'41ᵡ46ʎ49'5ᵡ托里县T o l i C o u n t y86136583ʎ21'59ᵡ45ʎ51'10ᵡ138883ʎ19'54ᵡ45ʎ49'58ᵡ139683ʎ19'24ᵡ45ʎ49'52ᵡ142583ʎ20'30ᵡ45ʎ47'56ᵡ84083ʎ48'40ᵡ46ʎ5'5ᵡ79383ʎ46'40ᵡ46ʎ5'4ᵡ阜康市F u k a n g C i t y8853988ʎ14'3ᵡ44ʎ9'7ᵡ53788ʎ16'18ᵡ44ʎ9'56ᵡ51588ʎ17'28ᵡ44ʎ11'46ᵡ53288ʎ18'52ᵡ44ʎ11'4ᵡ54088ʎ20'20ᵡ44ʎ10'47ᵡ53588ʎ30'14ᵡ44ʎ11'22ᵡ53588ʎ29'7ᵡ44ʎ11'56ᵡ53088ʎ23'59ᵡ44ʎ11'9ᵡ木垒M u l e i h a s a k eC o u n t y75104190ʎ6'32ᵡ43ʎ49'20ᵡ114490ʎ9'15ᵡ43ʎ47'27ᵡ103690ʎ5'51ᵡ43ʎ49'11ᵡ109590ʎ5'7ᵡ43ʎ49'46ᵡ103990ʎ3'13ᵡ43ʎ49'4ᵡ奇台县Q i t a i C o u n t y7562889ʎ31'22ᵡ44ʎ5'47ᵡ62689ʎ29'37ᵡ44ʎ4'34ᵡ78889ʎ50'58ᵡ43ʎ58'19ᵡ78989ʎ51'48ᵡ43ʎ58'18ᵡ60887ʎ28'48ᵡ43ʎ56'52ᵡ㊃7311㊃第9期来汉林等:新疆小麦白粉病菌群体遗传多样性分析Copyright ©博看网. All Rights Reserved.果,有条带的记为1,无条带的记为0,表示等位基因的有或无㊂将转换的0/1数据矩阵用N T S Y Spc (2.10e ,W I B ,C A S )统计软件进行遗传相似性分析,通过N o r m a l i z e dM a n t e l S t a t i s t i c 进行遗传距离和地理距离相关性分析㊂采用非加权类平均法(u n w e i g h t p a i r g r o u p m e t h o du s i n g ar i t h m e t i c a v e r a ge s ,U P GMA )构建小麦白粉病菌遗传多态性聚类分析树状图㊂用p o p ge n e (1.32,U A ,C I F O R )软件对菌株群体进行等位基因数㊁有效等位基因数㊁N e i s 遗传多样性指数㊁香农指数㊁多态性位点数㊁遗传距离㊁遗传一致度和基因流N m 群体遗传分化系数的计算㊂2 结果分析2.1 I S S R 扩增结果分析供试菌株I S S R -P C R 扩增的琼脂糖凝胶电泳结果(图1,表2)显示,引物P 3扩增出了22条清晰条带,数目最多;引物P 5扩增出3条清晰带,数目最少;引物P 7㊁P 9㊁P 15㊁P 16㊁P 17和P 18扩增条带数分别为10㊁12㊁9㊁9㊁7和5条㊂共扩增出条带77条,其中多态条带68条,多态性比率为88.31%㊂M :D L 2000;1~54:菌株㊂M :D L 2000;1-54:I s o l a t e s .图1 小麦白粉病菌I S S R -P C R 扩增结果F i g .1 I S S R -P C Ra m p l i f i c a t i o n r e s u l t s o f B l u m e r i a g r a m i n i s f .s p.t r i t i c i i s o l a t e s 表2 I S S R 引物序列T a b l e 2 S e qu e n c e o f I S S R p r i m e r s 引物P r i m e r 序列S e qu e n c e (5'-3')退火温度T m /ħ扩增总条带数N o .o f b a n d s多态性条带数P o l y m o r ph i c b a n d s 多态位点频率P e r c e n t a ge of p o l y m o r ph i c l o c i /%P 3C A C A C A C A C A C A C A C A T 50222195.45P 5A C A C A C A C A C A C A C A C T533266.67P 7A G A G A G A G A G A G A G A G Y C 5310770.00P 9G A G A G A G A G A G A G A G A Y C 531212100P 15B D B C A C A C A C A C A C A C A 539777.78P 16D B D A C A C A C A C A C A C A C539888.89P 17V H V G T G T G T G T G T G T G T5277100P 18H V H T G T G T G T G T G T G T G535480.00㊃8311㊃麦 类 作 物 学 报 第43卷Copyright ©博看网. All Rights Reserved.2.2 群体间分子遗传多样性分析由表3可知,新疆不同区域小麦白粉病菌群体遗传多样性存在差异㊂5个群体的N e i s 遗传多样性指数介于0.1461~0.2609之间,塔城群体最高,其次是阿克苏群体(0.2467),二者显著高于和田群体,与昌吉群体和喀什群体之间无显著性差异;昌吉群体和喀什群体分别为0.2234和0.2107,均高于和田群体,但差异不显著;和田群体遗传多样性最低㊂塔城群体的等位基因数为1.8052,多态位点数和多态位点百分比为62和80.52%,均高于其他4个群体㊂表明塔城群体的遗传多样性水平最高,其次是昌吉群体,和田群体最低㊂当N m <1时,表明不同群体间基因交流水平低,仅具有遗传分化的潜力;当基因流1ɤN m ɤ4时,表明不同群体间存在一定的基因交流,并且遗传分化较小[17]㊂本研究的基因流N m 为2.7490,表明新疆不同地区小麦白粉病菌群体存在一定的基因交流㊂表3 新疆5个小麦白粉病菌群体遗传多样性T a b l e 3 G e n e t i c d i v e r s i t y o f f i v e B l u m e r i a g r a m i n i s f .s p .t r i t i c i p o p u l a t i o n s i nX i n j i a n g群体P o p u l a t i o n 样本量N o .o f i s o l a t e s等位基因N u m -b e r o f a l l e l e s 有效等位基因E f f e c t i v e n u m b e r o f a l l e l e s N e i s 多样性指数N e i s d i v e r s i t y i n d e x 香农指数S h a n n o n s i n d e x 多态性位点数N u m b e r o f p o l -y m o r p h i c l o c i 多态性位点百分比P e r c e n t a ge of p o l -y m o r ph i c l o c i /%和田H o t a n 31.38961.24860.1461b0.21763038.96喀什K a s h g a r 41.57141.36880.2107a b 0.31314457.14阿克苏A k s u 121.74031.40600.2467a 0.37435774.03塔城T a c h e n g 171.80521.42840.2609a 0.39786280.52昌吉C h a n g ji 181.79221.35350.2234a b0.35026179.22同列数据后不同小写字母表示差异显著(P <0.05)㊂D i f f e r e n t l o w e r c a s e l e t t e r s f o l l o w i n g d a t a i n s a m e c o l u m n i n d i c a t e s i gn i f i c a n t d i f f e r e n c e s (P <0.05).2.3 群体间的遗传距离和一致度分析昌吉㊁塔城㊁阿克苏㊁喀什和和田群体间的遗传距离和一致度分析结果(表4)表明,其遗传距离介于0.0317~0.0945之间,遗传一致度介于0.9098~0.9688之间,其中,塔城与阿克苏群体的遗传距离最近,和田与喀什的遗传距离最大;遗传一致性则与对应的遗传距离相反㊂说明塔城与阿克苏群体亲缘关系更近㊂表4 新疆5个小麦白粉病菌群体遗传距离与遗传一致度T a b l e 4 G e n e t i c d i s t a n c e a n d g e n e t i c c o n s i s t e n c y o f f i v e B l u m e r i a g r a m i n i s f .s p .t r i t i c i p o p u l a t i o n s i nX i n j i a n g群体P o p u l a t i o n 和田H e t i a n喀什K a s h i 阿克苏A k e s u 塔城T a c h e n g 昌吉C h a n g j i 和田H o t a n 0.90980.93730.93500.9142喀什K a s h g a r 0.09450.94460.93090.9167阿克苏A k s u 0.06470.05700.96880.9629塔城T a c h e n g 0.06720.07160.03170.9600昌吉C h a n g ji 0.08970.08690.03780.0408对角线左下区域显示为遗传距离,对角线右上显示为遗传一致度㊂G e n e t i c d i s t a n c e i s i n d i c a t e d i n l o w e r l e f t r e g i o n i nm i d d l e d i a g o n a l ,a n d g e n e t i c i d e n t i t y i s i n d i c a t e d i nu p p e r r i g h t r e gi o n i nm i d d l e d i -a go n a l .㊃9311㊃第9期来汉林等:新疆小麦白粉病菌群体遗传多样性分析Copyright ©博看网. All Rights Reserved.2.4 群体遗传变异分析新疆5个区域小麦白粉病菌群体总N e i s 多样性指数为0.2571,群体内N e i s 多样性指数为0.2175,群体遗传分化系数为0.1539,群体内的遗传变异占总体变异的84.60%㊂由此表明,遗传变异主要来源于群体内,群体间存在较大的分化㊂2.5 群体遗传聚类分析U P GMA 聚类分析结果(图2)表明,当遗传距离为0.932时,可将5个群体分为三大分支,第一大分支包含昌吉㊁塔城㊁阿克苏共3个亚群,其中塔城和阿克苏群体归为一小分支;第二大分支是喀什;第三大分支是和田群体㊂建立群体间的遗传距离和地理位置距离矩阵,通过N o r m a l i z e dM a n t e lS t a t i s t i c 检验分析,相关系数为r =0.1700,表明新疆5个小麦白粉病菌群体的遗传距离与地理距离相关性不显著㊂图2 基于非加权组平均法的新疆5个小麦白粉病菌群体聚类分析F i g .2 C l u s t e r a n a l y s i s o f f i v e B l u m e r i a g r a m i n i s f .s p .t r i t i c i p o p u l a t i o n s f r o m X i n j i a n g ba s e d o nu n w e i g h t e d p a i r -g r o u p me t h o dw i t ha r i t h m e t i cm e a n s 3 讨论前人对新疆地区小麦白粉病的研究主要集中在药效评价㊁抗病品种鉴定㊁毒性监测和田间发生流行规律研究方面㊂赵海燕等[18]和李广阔等[19]研究发现,核桃小麦套种有利于白粉病的发生㊂高海峰等[20]筛选出新紫1号和14/8329两个品种(系)对小麦白粉病具有明显抗性㊂王振花等[21]对新疆小麦白粉病菌群体毒性进行了鉴定,发现大部分基因乃存在抗性㊂高海峰等[22]发现新冬60号和新冬57号田间发生危害程度显著低于新冬20号㊂本研究利用I S S R 分子标记对新疆不同区域5个群体54株小麦白粉病菌进行遗传多样性分析,结果表明,不同地区白粉病菌群体之间遗传多样性存在差异,遗传变异主要来源于群体内部,且不同群体之间存在一定的基因交流㊂这与李莹等[15]㊁李强等[16]㊁赵紫慧等[23]和石琳等[24]对陕西㊁山东㊁河北㊁四川㊁甘肃等地区的研究结果相似㊂本研究发现,新疆小麦白粉病菌群体遗传距离与地理距离的相关不显著,这与李莹等[15]对2016年陕西省小麦白粉病菌遗传多样性研究的结果相似,而李强等[16]和Z e n g 等[25]研究发现,小麦白粉病菌群体遗传距离与地理距离显著相关,结果不同可能是由于不同区域之间因地形特征引起的环境不同㊂北疆地区的昌吉和塔城之间白粉病菌群体遗传一致度较高,这可能是由于塔城和昌吉位于准噶尔盆地两缘,中间无山脉阻碍,白粉病菌在高空气流作用下便于基因交流㊂南疆地区的喀什与和田白粉病菌群体遗传一致度最低,这可能是由于喀什与和田位于塔克拉玛干沙漠边缘,白粉病菌很难通过沙漠在两地之间进行基因交流㊂整体分析表明,北疆和南疆小麦白粉病菌群体遗传一致度较低,原因可能是天山山脉把昌吉㊁塔城与阿克苏㊁喀什㊁和田分开,且南疆有我国最大的塔克拉玛干沙漠,阻碍了南㊁北疆小麦白粉病菌基因交流㊂新疆面积大,南㊁北疆小麦主产区相距较远,种植制度不同,且有高山㊁沙漠阻隔,易造成小麦白粉病菌群体遗传差异大,因此,在下一步研究中应扩大样本采集区域和数量,进一步明确南㊁北疆小麦白粉病菌群体遗传特征,为新疆小麦白粉病的科学防控提供依据㊂㊃0411㊃麦 类 作 物 学 报 第43卷Copyright ©博看网. All Rights Reserved.参考文献:[1]王鑫,宋鹏博,王笑笑,等.305份国内外小麦种质条锈病与白粉病抗性鉴定与评价[J].麦类作物学报,2021,41(6):690. WA N G X,S O N GPB,WA N GXX,e t a l.I d e n t i f i c a t i o n a n d e-v a l u a t i o no f r e s i s t a n c e t os t r i p er u s ta n d p o w d e r y m i l d e w o f 305d o m e s t i c a n d f o r e i g nw h e a t g e r m p l a s m s[J].J o u r n a l o f T r i t i c e a eC r o p s,2021,41(6):690.[2]武英鹏,原宗英,刘敏捷,等.小麦抗感品种间作和混种对白粉病的控制效果[J].麦类作物学报,2021,41(5):647.WU YP,Y U A NZY,L I U MJ,e t a l.C o n t r o l e f f e c t o f i n t e r-c r o p p i n g a n d m i x e d-c r o p p i n g o f r e s i s t a n t a n d s u s c e p t i b l e w h e a t c u l t i v a r sa g a i n s tw h e a t p o w d e r y m i l d e w[J].J o u r n a l o f T r i t i c e a eC r o p s,2021,41(5):647.[3]B E N N E T TFG A.R e s i s t a n c e t o p o w d e r y m i l d e w i nw h e a t:A r e v i e wo f i t s u s e i n a g r i c u l t u r e a n db r e e d i n gp r o g r a mm e s[J]. 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J o u r n a l o f I n t e g r a t i v eA g r i c u l t u r e,2014,13(11):2430.㊃1411㊃第9期来汉林等:新疆小麦白粉病菌群体遗传多样性分析Copyright©博看网. All Rights Reserved.。
天津和唐山小豆地方品种遗传多样性分析
，
。 E-mail：Chengxz@
680
植物遗传资源学报
卷 12
及其遗传育种具有重要的意义[3]。 我国小豆遗传 多样性研究相对薄弱，分子标记常用 AFLP、RAPD 等通用型标记，但是 稳 RAPD 定性较差， 耗 AFLP 费高、操作复杂[4]，在遗传多样性分析中逐渐被 SSR标记所取代，尤其是近 5 年来 标 SSR 记已广 泛应用于豆类作物遗传多样性的研究中[5-9]。 前 人对小豆遗传多样性的研究大多集中在个体，或 是先运用 NTSYS 软件，依据遗传相似系数进行聚 类分析，然后根据树型图分组讨论。 由于在不同 的区域在生产实际中存在着相互引种的现象，根 据遗传相似系数划分出的组群，可能与实际有所 不同。 本试验利用 分 SSR 子标记技术，对不同来 源的红小豆地方品种群体遗传多样性水平和遗传 结构进行分析，旨在揭示唐山红小豆和天津红小 豆不同群体的差异及其相互关系，进而为该区域 红小豆种质资源的保存、评价及其杂交亲本的选 择提供理论依据。
信息指数 PPB=85.39%，I（
）
=0.567]
，其次为玉田和迁安的品种资源，而在
天津红小豆资源中，除静海县（排位第 5）外，遗传多样性水平相对较小，其中宁河的遗传多样性水平最低（PPB=22.47%，I=
0.1575）。 聚类分析表明，96 个品种可分为三个组群，唐山红小豆组群中包含了天津静海小豆；天津红小豆中的大港品种资源
（1 Tangshan AcademyofAgriculturalSciences，HebeiProvinces，Tangshan 063001； 2 InstituteofGropSciences，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，Beijing 100081）
河南和河北冬小麦区假禾谷镰孢的遗传多样性
河南和河北冬小麦区假禾谷镰孢的遗传多样性贺小伦;周海峰;袁虹霞;施艳;孙炳剑;李洪连【期刊名称】《中国农业科学》【年(卷),期】2016(000)002【摘要】【目的】运用ISSR-PCR技术揭示中国河南和河北省冬小麦区6个地理群体小麦茎基腐病优势病原菌假禾谷镰孢（Fusarium pseudograminearum）的遗传多样性。
【方法】利用筛选的17个ISSR引物对从河南和河北冬小麦区收集的166株假禾谷镰孢菌株进行扩增。
根据群体扩增的结果，用POPGENE version l.32软件计算各项遗传多样性参数。
根据不同地理群体的遗传相似系数，用NTSYSpc version 2.11软件进行群体聚类分析。
【结果】从97个ISSR引物中筛选出了17个多态性较好的引物，用这17个引物对河南和河北冬小麦区的166株假禾谷镰孢菌株进行扩增，共扩增出234个DNA片段，其中多态性位点为218个，占总扩增片段的93.16%。
平均每个引物可以扩增出13.76个条带，扩增产物大小在150—2500 bp。
POPGENE分析表明，6个地理群体的多态位点数在58—208，平均为124；多态位点百分率在24.79%—88.89%，平均为52.92%；有效等位基因数在1.1548—1.3293，平均为1.2584。
遗传多样性分析表明，在地理种群水平上，Nei’s 基因多样性指数在0.0897—0.2069，平均为0.1548；Shannon’s信息指数在0.1337—0.3257，平均为0.2368，这表明不同地理群体间存在一定的遗传变异。
河南北部地区的Shannon’s 信息指数和Nei’s 基因多样性指数最高，表明该地区假禾谷镰孢菌株之间的遗传多样性最丰富。
河南南部地区的Shannon’s 信息指数和Nei’s 基因多样性指数最低，表明该地区假禾谷镰孢菌株之间的遗传多样性最低。
遗传相似性分析证明，河南北部地区假禾谷镰孢种群和河南东部地区种群最近，河南南部地区假禾谷镰孢种群和河南东部地区种群最远。
生物遗传多样性研究方法及其保护措施
生物遗传多样性研究方法及其保护措施
尚占环;姚爱兴
【期刊名称】《农业科学研究》
【年(卷),期】2002(023)001
【摘要】本文综述了生物遗传多样性的研究方法.对等位酶分析(Allozyme analysis)、聚合酶链式反应(PCR)法、限制性内切酶片段长度多型性(Restriction Fragment Length Polymorphism简称RFLP)分析和随机扩增的多态性
DNA(Random Amplified Polymorphic DNA简称RAPD)分析等四种方法在遗传多样性研究中的应用进行了讨论.另外,概述了遗传多样性的保护问题,提出分子生物学在遗传多样性及生物多样性的保护中将起重要作用.
【总页数】4页(P66-69)
【作者】尚占环;姚爱兴
【作者单位】宁夏农学院草业科学研究所,银川,750105;宁夏农学院草业科学研究所,银川,750105
【正文语种】中文
【中图分类】Q943
【相关文献】
1.DGGE分析微型真核浮游生物遗传多样性及其与环境因子的相关性 [J], 李强;赵越;李玉华;魏自民
2.城市景观格局变化对生物遗传多样性影响的模拟研究——以沈阳市为例 [J], 宋
有涛;尹相彬;李博文;李小谦;孙子程;刘利;朱京海
3.深海热液口大型底栖生物遗传多样性的研究进展 [J], 杨梅;李新正
4.微生物遗传多样性的挖掘和代谢工程应用 [J], 赵心清;陈洪奇;许建韧
5.青藏高原景观多样性和生物遗传多样性 [J], 杨博辉;郎侠
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黑平菇及白色变异平菇单核菌株的遗传多样性分析
黑平菇及白色变异平菇单核菌株的遗传多样性分析夏会楠;李东晓;周金看;王春霞;郭金英;郑素月【期刊名称】《江苏农业科学》【年(卷),期】2024(52)7【摘要】以筛选平菇杂交过程中优良菌株为目标,分析黑平菇以及白色变异平菇单核菌株遗传多样性。
用24个白色变异平菇原生质体单核菌株以及37个黑平菇原生质体单核菌株为试验材料,采用酯酶同工酶技术以及ISSR分子标记技术对其单核菌株进行遗传多样性分析。
结果表明,酯酶同工酶白色变异原生质体单核菌株菌株共检测出7条迁移率不同的酶带,黑平菇单核菌株共检测出8条迁移率不同的酶带,多态性条带分别占65.8%、75%;ISSR分子标记技术将平菇白色变异单核菌株以及黑平菇单核菌株的原生质体单核菌株从5个ISSR引物中分别扩增出68、74条清晰的DNA多态片段,多态性位点分别占78.5%、63%。
两类聚类分析结果表明,当GS为0.75时,将24个平菇白色变异菌株单核菌株分为两大类;当GS为0.79左右时,将37个黑平菇单核菌株分为两大类。
说明酯酶同工酶技术以及ISSR分子标记技术可以用于单核菌株遗传多样性分析,为平菇杂交育种过程中优良亲本单核体的选择提供理论依据。
【总页数】7页(P41-47)【作者】夏会楠;李东晓;周金看;王春霞;郭金英;郑素月【作者单位】河北工程大学园林与生态工程学院【正文语种】中文【中图分类】S646.140.32【相关文献】1.平菇原生质体再生菌株的ISSR-PCR遗传多样性分析2.山东省35个黑灰色平菇菌株的酯酶同工酶分析3.平菇原生质体单核化菌株的制备及其培养特征分析4.野生平菇菌株的培养特征及遗传多样性分析5.基于酯酶和ISSR技术的平菇单核菌株遗传多样性分析因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
核桃炭疽病菌中GH互作蛋白找寻及遗传关系分析
核桃炭疽病菌中GH互作蛋白找寻及遗传关系分析张凯强;韩长志【期刊名称】《福建农林大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2024(53)2【摘要】【目的】植物病原真菌中的糖苷水解酶(GH)是参与破坏植物细胞壁的重要酶类,在真菌致病过程中发挥着重要作用。
了解核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作蛋白及其遗传关系,可为深入研究该病菌中GH家族蛋白的协同作用机制提供参考。
【方法】基于前期所获得的胶孢炭疽菌Cg1中20个GH蛋白,通过STRING网络在线分析与其相似性较高的两个炭疽菌种——胶孢炭疽菌Cg-14和果生炭疽菌Nara gc5相关蛋白的互作关系;同时,利用生物信息学分析工具对这些蛋白进行了分子对接、亚细胞定位及遗传关系分析。
【结果】两个炭疽菌菌株GH蛋白的互作情况极为相似。
其中:GH5的互作蛋白数量最多,且GH5、GH6、GH7、GH11之间均存在明显互作关系;GH28亚家族中两个蛋白之间互作但不与其他GH亚家族蛋白互作;与单独GH蛋白存在互作关系的其他类蛋白多参与多糖催化、碳水化合物代谢等过程。
不同蛋白之间均存在多个相互作用的氨基酸位点;仅GH72亚家族中的3个蛋白定位于质膜,其余蛋白均定位于细胞外;胶孢炭疽菌Cg1、Cg-14以及果生炭疽菌Nara gc5中GH蛋白明显分为四大类。
其中:GH43亚家族中的3个蛋白分属于不同分支,亲缘关系较远;GH5中的3个蛋白有两个属于同一分支,另一个单独在一个分支;而GH7、GH11、GH28亚家族内部的蛋白均属于同一分支。
【结论】核桃炭疽病菌中GH蛋白的互作关系主要有3种,即不同GH蛋白之间的互作、同一GH亚家族中不同蛋白之间的互作以及单独的GH蛋白。
其中,大部分GH蛋白定位于细胞外,且大多数GH亚家族中不同蛋白之间的亲缘关系较近,仅有小部分亲缘关系较远。
【总页数】7页(P199-205)【作者】张凯强;韩长志【作者单位】西南林业大学生物多样性保护学院;云南省森林灾害预警与控制重点实验室【正文语种】中文【中图分类】S435.6【相关文献】1.苹果炭疽叶枯病菌与寄主互作分子致病机理研究进展2.氮胁迫条件下稻瘟病菌分泌蛋白与水稻悬浮细胞互作中“活性氧”变化分析3.禾谷炭疽菌中候选G蛋白偶联受体蛋白理化性质及遗传关系分析4.稻瘟病菌中小G蛋白Rho3的假定互作蛋白MoKin1的功能分析5.稻瘟病菌中一个假定Rho GTP酶激活蛋白与Rho族蛋白的互作关系因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
核盘菌对油菜、向日葵和大豆的侵染及其致病性分化研究
核盘菌对油菜、向日葵和大豆的侵染及其致病性分化研究李永红;王灏;李建厂;王道杰;李殿荣【期刊名称】《植物病理学报》【年(卷),期】2005(35)6【摘要】通过对从陕西大荔采集的油菜及其后茬向日葵上的核盘菌和从新疆阿勒泰的向日葵上采集的核盘菌样品进行单菌核分离、培养和纯化,比较其菌丝生长速度、菌丝干重、菌落形态、致病力强弱及菌株的草酸累积等,将两地的核盘菌分成A、B、C三种类型,其中A类来源于陕西大荔的油菜和向日葵,B、C类来源于新疆阿勒泰的向日葵。
不同类型核盘菌对于不同寄主的致病力存在着分化现象,A、B类菌株生长正常、菌落均匀旺盛,B类对油菜、向日葵和大豆的致病力较强,草酸产量较高;而A类仅对油菜和向日葵的致病力较强对大豆的致病力很弱,但草酸产量最高。
C类菌株生长异常,菌落稀疏不均匀,对3种作物的致病力均弱,草酸产量较低。
2001年田问调查亦表明:A类菌株可导致油菜、向日葵菌核病的发生, 但未见其使大豆致病,由此提出油菜茬后,不宜种植向日葵,二者应与小麦、玉米等实行较长周期的轮作。
本文也同时对各菌株进行了RAPD分析和菌丝体亲和性研究,结果表明,菌株间的遗传多样性表现丰富但未发现与其致病性分化相关。
【总页数】7页(P486-492)【关键词】核盘菌;侵染;致病性分化;亲和性【作者】李永红;王灏;李建厂;王道杰;李殿荣【作者单位】陕西省杂交油菜研究中心【正文语种】中文【中图分类】S435.65【相关文献】1.向日葵核盘菌菌株致病性研究及其温度效应 [J], 李建厂;李永红;陈文杰;李殿荣2.核盘菌菌丝体在向日葵和油菜病茎中的生活力研究 [J], Huang,HC;辛爱梅3.黑龙江地区向日葵核盘菌致病性分化研究 [J], 刘佳;张匀华;孟庆林;石凤梅;马立功;李易初;刘春来;左豫虎4.核盘菌子囊孢子对向日葵叶部的侵染 [J], Sedu.,FS;汪景宽5.核盘菌侵入油菜超微结构及侵染机制的研究 [J], 杨谦因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
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中国油料作物学报Chinese Journal of Oil Crop Sciences 2014，36(2):244－249doi :10．7505/j．issn．1007－9084．2014．02．016不同地域和寄主来源的核盘菌遗传多样性分析韩广振，韩粉霞*，孙君明，于绍轩，张金巍，闫淑荣，杨华（中国农业科学院作物科学研究所，农业部北京大豆生物学重点实验室，农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程，北京100081）摘要：为了解核盘菌［Sclerotinia sclerotiorum （Lib．）de Bary ］遗传多样性和进化关系，利用SSＲ分子标记对采自不同地区和寄主来源的32个核盘菌分离物进行分析，17对SSＲ引物共检测到69个多态性位点，平均每对引物检测到4．06个位点。
其中，引物AF377908－1/AF377908－2和AF377922－1/AF377922－2的等位变异数目最多，高达8个，而引物AF377903－1/AF377903－2和AF377925－1/AF377925－2的等位变异数目最少，为2个。
17个SSＲ引物的多态性信息量（PIC ）的平均值为0．56，引物AF377922－1/AF377922－2的PIC 最高，为0．78。
聚类分析显示，32个核盘菌分离物可划分为5个组群，来自同一地区的大部分核盘菌分离物聚在相同或相近的组内，表明核盘菌群体内的SSＲ遗传背景基本一致，而群体间的遗传变异较大。
关键词：核盘菌；遗传多样性；进化；SSＲ标记中图分类号：S435．654文献标识码：A文章编号：1007－9084（2014）02－0244－06Genetic diversity of Sclerotinia sclerotiorum isolates from different regions and host plants by SSＲmarkersHAN Guang －zhen ，HAN Fen －xia *，SUN Jun －ming ，YU Shao －xuan ，ZHANG Jin －wei ，YAN Shu －rong ，YANG Hua（Institute of Crop Science ，Chinese Academy of Agricultural Sciences ，MOA Key Laboratory of Soybean Biology （Beijing ），the National Key Facility for Crop Gene Ｒesources and Genetic Improvement ，Beijing 100081，China ）Abstract ：Sclerotinia stem rot caused by Sclerotinia sclerotiorum （Lib．）de Bary has a wide host range．Genet-ic diversity of 32isolates of S．sclerotiorum collected from different geographical regions and host plants were detec-ted by SSＲmarkers．A total of 69alleles were observed using 17pairs of primers with an average of 4．06alleles for each pair of primers．The alleles with the largest numbers （8）were found in 2pairs of primers （AF377908－1/AF377908－2and AF377922－1/AF377922－2），and the least number of alleles （2）occurred in the other 2primer pairs （AF377903－1/AF377903－2and AF377925－1/AF377925－2）．The mean value of DNA poly-morphic information content （PIC ）was 0．56．The highest PIC value was 0．78detected with AF377922－1/AF377922－2．In cluster analysis ，32isolates were divided into 5groups．Most isolates from the same region were grouped in the same or a close population ，suggesting that Sclerotinia genetic loci within populations were relatively consistent but significantly different among populations．Key words ：Sclerotinia sclerotiorum ；Genetic diversity ；Evolution ；SSＲmarker 收稿日期：2013-08-12基金项目：转基因生物新品种培育重大专项（2013ZX08004－004；2011ZX08004－004）；国家科技支撑计划（2011BAD35B06）；中国农业科学院科技创新工程作者简介：韩广振（1984－），男，硕士，研究方向为作物抗病育种，E －mail ：hanguangzhenfly@126．com *通讯作者：韩粉霞（1965－），研究员，主要从事作物遗传育种研究，E －mail ：hanfenxia@caas．cn 菌核病是由核盘菌［Sclerotinia sclerotiorum（Lib．）de Bary ］侵染寄主植株所引起。
核盘菌是一种世界性分布、寄主范围广泛且具有破坏性的植物病原真菌，可侵染450种植物［1］。
近年来，利用分子生物学技术研究核盘菌的遗传多样性受到重视，利用ＲAPD 技术分析不同核盘菌菌株及其近缘种的遗传多样性，发现核盘菌菌株之间的遗传相似系数高于核盘菌、三叶草核盘菌（S．trifoliorum ），小核盘菌（S．minor）和雪腐核盘菌（S．nivalis）之间的遗传相似系数［2］；对不同地区和寄主来源的菌核病分离物进行遗传多样性和群体结构分析，发现S．scleroti-orum分离物间的遗传相似性相当高，来自同一地区的大部分个体都聚在同组或相邻组内［3］。
可溶性蛋白质和同工酶电泳技术难以测定异源核盘菌菌株之间的遗传多样性［4］。
SSＲ标记对菌核病菌株的个体间和群体间的遗传多样性分析非常有效，但菌核病病菌对SSＲ标记的多态性位点较少［5］。
赵晖等［6］对来自日本和我国且寄主不同的3株雪腐核盘菌（S．nivalis Saito）的核糖体基因转录间隔区（ITS）DNA序列进行了测定，并与GenBank中的同源序列进行比较，没有发现序列完全相同的真菌种类；通过软件DNAStar比对分析，发现雪腐核盘菌菌株Let－19与日本的2个雪腐核盘菌菌株AGT和C－1－2的ITS序列没有差异性，说明不同地域、不同寄主来源的雪腐核盘菌的ITS序列非常保守。
Kohn等［7］利用ＲFLP技术对来自美国油菜菌核病分离物进行了分子鉴定，得到了特异性DNA指纹图谱。
Hsiang 等［8］利用IGS－ＲFLP和ＲAPD两种标记方法对来自加拿大和日本的191个S．homoeocarpa菌株进行鉴定，发现在S．homoeocarpa群体内和群体间都有多态性，共区分出了151个基因型，日本和加拿大菌株之间的遗传距离较远。
Carpenter等［9］利用克隆重复序列pLK44．20作为探针对4个群体的75个菌核病分离物进行DNA－DNA杂交检测，结果显示47个不同的指纹图谱在群体内和群体间都显示出了较高的变异水平。
在菌核病不同分离物遗传分类的分子标记中，微卫星标记由于其在真核基因组中广泛分布，且稳定性高［10］，比ＲAPD有更高的特异性、重复性和多态性，又是一种共显性标记，己被广泛应用于区分像核盘菌这样的微生物群体间和个体间的遗传差异。
本研究利用微卫星标记鉴定32个不同地区和寄主来源的核盘菌分离物的遗传多样性，分析不同地区病原菌的遗传进化关系，以期为菌核病防控和抗病育种提供依据。
1材料与方法1．1材料核盘菌分离物32个（寄主和来源见表1）。
表132个核盘菌分离物来源Table1Origins of32Sclerotinia sclerotiorum isolates来源Origin核盘菌分离物名称（编号）Name of Sclerotinia sclerotiorum isolate（Code number）寄主Host plant份数Number中国东北Northeast region，China吉春1（1）、黑安4（2）、黑绥1（3）、黑绥农（4）、黑饶24（5）、黑西5（6）、黑饶1（7）、黑饶2（8）Jichun1（1），Heian4（2），Heisui1（3），Heisuinong（4），Heirao24（5），Heixi5（6），Heirao1（7），Heirao2（8）大豆Soybean8中国青海省Qinghai Province，China Qin24（9）、Qin25（10）、Qin47（11）、Qin15（12）、Qin30（13）、Qin23（14）、Qin19（15）、Qin37（16）油菜Oilseed rape8中国安徽省Anhui Province，China Hef50（17）、Hef42（18）、Hef21（19）、Hef44（20）、Hef18（21）、Hef14（22）油菜Oilseed rape6波兰Poland SC11（23）、SC22（24）、SC13（25）、SC6（26）、SC10（27）、SC5（28）油菜Oilseed rape6加拿大Canada SSCar2000－8（29）、SSCar2000CE－3（30）、SSCar2000－23（31）、SSCar H4．6（32）胡萝卜Carrot4合计Total321．2方法1．2．1菌丝体的培养核盘菌菌核经50%的乙醇消毒30s，无菌水冲洗3次，转至PDA培养基上，用Parafilm膜密封，室温下培养7 10d后，取直径0．5 cm带有菌丝体的接种体，转至25mL PGB液体培养基上，封口，7 10d后取出菌丝体，用滤纸吸干水份，放置液氮中冷冻保存，备用。