标准的PCR实验室简介
PCR实验室设计
PCR实验室设计PCR实验室是进行聚合酶链反应(PCR)的地方,它是生物学研究中非常重要的一个实验室,用于复制和扩增DNA片段。
设计一个高效的PCR实验室,不仅需要考虑实验室的空间大小、设备等基本因素,还需要考虑实验室的安全性、环境条件和实验流程等细节。
下面将详细介绍如何设计一个高效的PCR实验室。
一、实验室布局:1.实验室面积:根据实验人员数量和需要进行PCR实验的频率确定实验室的面积,通常每个实验员需要4-6平方米的工作空间。
2.工作流程:实验室的布局应该考虑实验流程的合理性和高效性,例如将实验室分为样品准备区、PCR反应区和实验结果分析区等不同功能区域,便于实验员分工合作。
3.设备安放:PCR实验室需要安放PCR仪器、振荡器、离心机等设备,要确保设备之间有足够的空间,且易于实验员操作和维护。
4.实验室设施:实验室应该有充足的通风系统和洁净工作台,确保实验环境的清洁和无菌。
二、实验室设备:1.PCR仪器:PCR实验室必备的设备是PCR仪,用于DNA片段的扩增和复制,选择品牌好、性能稳定的PCR仪器。
2.离心机:用于离心PCR反应液,分离DNA片段和其他细胞成分,选择转速稳定、操作简单的离心机。
3.振荡器:用于振荡PCR反应管中的混合液,促使反应液均匀混合,选择振幅可调、操作便捷的振荡器。
4.电泳仪:用于检测PCR反应结果,分析DNA片段的长度和浓度,选择具有高分辨率、高灵敏度的电泳仪。
5.冰箱和冰盒:用于暂存PCR反应物和样品,确保PCR反应的成功进行。
6.光谱仪:用于检测PCR反应结果的准确性和一致性,选择灵敏度高、准确性好的光谱仪。
三、实验室安全:1.实验员培训:所有进入PCR实验室的人员都需要接受PCR实验操作的培训,了解实验室的安全规范和操作流程。
2.实验室标志:实验室内应该有清晰的标志和警示标识,提醒实验员注意实验室的安全规定。
3.废物处理:PCR实验产生的废物需要正确处理,避免对环境和人员造成危害。
pcr实验室建设要求
pcr实验室建设要求
PCR实验室,又称为临床基因扩增实验室,是专门用来检验艾滋病、乙型肝炎、禽疫病等病毒感染性疾病的实验室。
在建设上,需要遵循以下规范:
1. 实验室布局应合理、紧凑,符合实际使用需求。
为避免交叉污染,各区域之间应相互独立。
此外,根据《临床基因扩增检验实验室基本设置标准》的要求,PCR实验室一般由试剂储备区、标本制备区、扩增区、扩增分析区4个区域组成。
2. 实验室设备的选择十分关键,应优先考虑高品质、高可靠性的品牌和型号,且满足实际使用需求。
3. 考虑到实验室的安全性,建筑结构应稳固,能够承受可能的振动和冲击。
同时,材料选择上,应使用不燃或难燃的材料,并符合相应的防火和防爆要求。
4. 对于实验室的装修,耐腐蚀、易清洁的材料如瓷砖、玻璃等更为合适。
5. 除了上述要素,还需要考虑到环境安全,例如通过独立区域设计和压差控制等方式来保证实验室的安全独立性。
综上所述,PCR实验室的建设不仅需要考虑功能性和实用性,还需兼顾安全和舒适性。
在实际建设过程中,还需要根据具体需求和规范进行细致的规划和设计。
pcr实验室设计标准
pcr实验室设计标准
PCR实验室设计的标准通常包括以下几个方面:
1. 空间分配:实验室空间应考虑到PCR反应的敏感性,避免
受到外界环境的干扰。
实验室应划分为不同的区域,如样品处理区、试剂准备区、PCR反应区、电泳分析区等,以避免交
叉污染。
2. 生物安全:PCR实验室需要具备生物安全级别,按照不同
的实验需求,可分为不同的生物安全级别实验室,如BSL-1、BSL-2等。
必要时需要采取措施,如为实验室设置生物安全柜、密封门、气流控制等,以确保实验人员和环境的安全。
3. 温度控制:PCR反应对温度的控制要求较高,因此实验室
应具备稳定的温度控制设备,如恒温干燥箱、恒温水浴等,能够提供所需的温度范围,并能保持温度的稳定性。
4. 洁净度要求:PCR实验中需要避免DNA污染,因此实验室
应具备洁净的条件,并保持无尘、无菌的环境。
实验室内的工作台、仪器、耗材等应经过适当的消毒处理。
5. 通风系统:PCR实验室应具备良好的通风系统,以保持空
气的流动和新鲜,减少实验室内可能存在的污染风险。
6. 实验室设备:PCR实验室应具备必要的设备,如PCR仪、
电泳装置、显微镜、离心机等,并根据实验需求选择合适的设备型号和规格。
7. 安全措施:为了保护实验人员和实验室环境的安全,需要设置相应的安全措施,如个人防护用品、紧急处理设施、紧急灭火装置等。
总之,PCR实验室的设计应考虑实验的特殊要求,如温度控制、生物安全和洁净度要求,并采取相应的措施保障实验质量和人员安全。
同时,根据实验规模和需求,适当选择合适的设备和器材,提高实验效率和可靠性。
PCR实验室要求
PCR实验室要求PCR(聚合酶链反应)实验室是一个进行分子生物学研究的重要场所,用于扩增、复制和检测DNA片段。
为了保证实验室的安全性和实验结果的准确性,有一些基本的实验室要求需要遵守。
实验室安全要求:1.穿戴适当的个人防护设备,包括实验服、手套、护目镜和口罩等,以避免对自己和他人构成伤害。
2.定期清洁实验室设备和工作台面,以确保实验环境的整洁和卫生。
3.耐火实验台和化学柜等必要的安全设备应齐全,并且应定期维护和检查以确保正常运行。
实验条件要求:1.实验室温度应保持在适宜的范围,一般建议在20℃-25℃之间。
2.实验室应保持相对湿度在50%-60%之间,以维持DNA样品的良好质量。
3.实验台面及试剂架应保持整洁,杂物应及时清理,以避免交叉污染。
实验物质要求:1.所使用的试剂和材料应符合质量标准,以确保实验结果的准确性和可重复性。
2.所有试剂的保存条件和有效期要求应被认真遵守,过期或损坏的试剂应予以丢弃。
3.实验室应妥善管理和保存各种试剂和材料,并保证其可及性和易查找性。
实验操作要求:1.进行实验前,应仔细阅读实验方法和步骤,了解实验目的和要求,并按照步骤正确操作。
2.各种操作台和设备应进行适当的消毒和清洁处理,以减少样品污染和结果偏差。
3.实验人员应保持手部的卫生和洁净,经常使用酒精进行消毒,并避免触摸脸部、口、鼻等部位。
实验数据记录要求:1.实验操作过程中所得数据、实验记录和结果应详细且准确地记录下来。
2.所有记录和数据应妥善保存,并按照实验室的相关规定进行归档和保管。
实验废弃物处理要求:1.实验产生的所有废弃物,包括试剂盒、塑料管、废液等应按照相关规定分类、包装和处理。
2.避免直接将废弃物倒入排水口或垃圾桶,应选择合适的废弃物容器妥善处理。
总结:PCR实验室要求安全、整洁和高效的操作环境,以确保实验结果的准确性和可靠性。
遵守实验室要求不仅能保护实验人员的安全,也能提高实验效率和科研水平。
因此,对于PCR实验室人员来说,严格遵守上述要求是非常重要的。
pcr实验室设计标准
pcr实验室设计标准PCR实验室设计标准是保证PCR实验室正常运行和实验结果准确可靠的基础。
PCR(聚合酶链反应)是一种基因分析技术,广泛应用于分子生物学、医学诊断、犯罪侦查等领域。
为了确保PCR实验的可靠性和重复性,合理设计PCR实验室的空间布局、设备配置、环境条件等是至关重要的。
本文将从空间布局、设备配置和环境条件三个方面,详细探讨PCR实验室设计标准。
一、空间布局PCR实验室的空间布局应充分考虑操作流程和安全要求。
首先,应将整个实验流程划分为不同区域,包括样本处理区、试剂配制区、反应体系制备区和扩增反应区等。
各个区域之间要有明确的界限,避免交叉污染。
其次,在样本处理区设置洗手池,并配备充足的洗手液和纸巾供使用者清洁双手。
此外,在试剂配制区设置专用台面,并配备必要的试剂瓶架和称量设备,保证试剂配制过程无误差。
为了确保PCR实验的准确性,反应体系制备区应与样本处理区和试剂配制区隔离开,以避免样本和试剂的交叉污染。
反应体系制备区应配备必要的实验仪器,如电动移液器、离心机等。
同时,为了减少实验误差,反应体系制备区内要保持整洁,并定期清理和消毒。
扩增反应区是PCR实验室的核心区域。
为了保证扩增反应的准确性和可重复性,扩增反应区要与其他实验室设备隔离开,并且在温度、湿度等环境条件上进行严格控制。
在扩增反应区内设置PCR仪器,并配备必要的试剂、耗材等。
二、设备配置PCR实验室的设备配置是保证实验结果准确可靠的重要保障。
首先,PCR仪是PCR实验室不可或缺的核心设备之一。
在选择PCR仪时,需要考虑其温度控制精度、均匀性以及操作便捷性等因素。
其次,在样本处理和试剂配制过程中需要使用电动移液器、离心机等常规分析仪器。
为了避免交叉污染,PCR实验室应配置专用的试剂瓶架、试剂瓶盖、移液枪等。
试剂瓶架应具备防滴漏功能,避免试剂的外泄。
移液枪应具备可调节容量的功能,以满足不同实验需求。
此外,PCR实验室还需要配备必要的消毒设备和生物安全柜。
pcr实验室国家标准
pcr实验室国家标准PCR(聚合酶链反应)是一种在生物科学研究和医学诊断中广泛应用的技术。
为了确保PCR实验室的操作安全、实验结果的准确性和重复性,制定了PCR实验室国家标准。
本文将详细介绍PCR实验室国家标准的主要内容,以及对实验室运营的指导意义。
1. 实验室环境与设备1.1 实验室环境要求PCR实验室应位于独立的房间或隔离区,以防止杂交污染。
实验室应具备良好的通风系统,以保持空气流通并排除可能的有害气体。
实验室内温度和湿度应符合实验要求,避免对PCR反应产生影响。
1.2 实验设备要求PCR实验室应配备干净的台面和实验室用具,如PCR扩增仪、电脑、离心机、冷冻设备等。
所有设备应定期检修和维护,确保其正常运行并避免故障对实验结果的干扰。
2. 人员要求与操作规范2.1 实验人员要求PCR实验室的工作人员应具备相关的生命科学或医学背景,并接受PCR实验的专业培训。
实验人员应了解PCR实验的原理、方法和常见问题处理,掌握实验操作的规范和安全要求。
2.2 实验操作规范PCR实验室应制定实验操作规范和操作程序,明确实验步骤、操作顺序和使用的试剂、仪器。
实验人员在操作前应戴上实验手套、穿戴实验服,并按照规定的实验室行为规范进行操作。
实验完成后,实验室应及时清洁和消毒,保持实验环境的卫生。
3. 试剂与储存管理3.1 试剂采购与管理PCR实验室应从正规渠道购买试剂,并保证试剂的质量和纯度,以避免对PCR反应结果的影响。
实验室应建立试剂的进货、使用和库存管理制度,确保试剂的有效期和保存条件符合要求。
3.2 试剂储存管理PCR试剂应按照厂家规定的保存条件储存,避免温度过高或过低、光照等因素对试剂稳定性的影响。
试剂的存储应分类,并标注名称、批号、有效期等信息,以便实验人员快速找到所需试剂。
同时,实验室应定期对试剂进行检查和更新,避免使用过期或质量受损的试剂。
4. 实验质量控制与数据分析4.1 实验质量控制PCR实验室应建立质量控制制度,包括检测PCR反应的阴性对照和阳性对照,并按照设定的标准进行质量控制样品的处理和记录。
pcr实验室标准
pcr实验室标准PCR实验室标准。
PCR(聚合酶链式反应)是一种常用的分子生物学技术,广泛应用于基因克隆、基因表达分析、疾病诊断等领域。
在PCR实验室中,严格遵循一系列标准操作程序对实验室环境、试剂、设备和操作人员进行管理,对PCR实验的准确性和可靠性至关重要。
本文将介绍PCR实验室的标准操作流程,帮助实验室工作人员规范实验操作,提高实验效率和结果可靠性。
实验室环境管理。
PCR实验室应具备良好的实验环境,包括洁净、无菌、无尘、无霉、无细菌等特点。
实验室内空气应保持流通,避免气味、异物等对实验产生干扰。
实验室内的工作台面、仪器设备、试剂瓶等应定期进行清洁消毒,保持干净整洁。
试剂管理。
PCR实验室应建立完善的试剂管理制度,对试剂的储存、使用、保管和报废进行严格管理。
试剂的储存温度和有效期应进行标注,避免使用过期试剂进行实验。
在使用试剂时,应按照操作规程准确称量、混合和稀释,避免试剂误用或交叉污染。
设备管理。
PCR实验室的设备应定期进行检测和维护,确保设备的正常运行和准确性。
在使用设备前,应进行预热、平衡和校准,避免设备误差对实验结果产生影响。
实验室应建立设备使用记录,及时发现设备故障并进行维修或更换。
操作人员管理。
PCR实验室的操作人员应接受相关的培训和考核,熟悉实验操作流程和安全注意事项。
在进行实验操作时,应严格按照操作规程进行,避免个人操作失误对实验结果产生影响。
操作人员应穿戴实验服、手套、口罩等个人防护用品,避免人为污染对实验产生影响。
实验操作流程。
PCR实验操作流程包括样品处理、反应体系配置、PCR扩增、扩增产物分析等步骤。
在进行实验操作时,应按照标准操作程序进行,避免操作失误对实验结果产生影响。
在每一步操作后,应及时记录实验数据和结果,以备后续分析和验证。
实验结果分析。
PCR实验结果的分析应准确、可靠、重复性好。
在进行实验结果分析时,应对实验数据进行统计和比对,排除实验误差和干扰因素,确保实验结果的准确性和可靠性。
pcr实验室设计标准及规范
pcr实验室设计标准及规范PCR实验室设计标准及规范。
PCR实验室是进行聚合酶链式反应(PCR)实验的重要场所,其设计标准和规范对实验室工作的顺利进行具有重要意义。
本文将就PCR实验室的设计标准及规范进行详细介绍,以期为相关工作提供参考和指导。
首先,PCR实验室的设计应符合相关的安全规范和实验室设计标准。
实验室内部应设置有足够的通风设施,以确保实验室内空气的流通和清洁。
此外,实验室内应设置紫外线消毒设备,以对实验室进行定期消毒和清洁,保证实验室内部的卫生安全。
其次,PCR实验室的设计应考虑实验室的使用需求和实验流程。
实验室内部应设置有充足的实验台和工作区域,以满足实验操作的需要。
实验室内部的设施和设备应按照实验流程进行合理布局,以提高实验的效率和准确性。
此外,实验室内应设置有充足的储存设施,以存放实验所需的试剂和材料。
另外,PCR实验室的设计应考虑实验室的安全性和实验操作的规范性。
实验室内部应设置有相关的安全警示标识,以提醒实验人员注意实验操作的安全性。
实验室内部应设置有相关的实验操作规范,以规范实验人员的操作行为,确保实验操作的规范性和准确性。
最后,PCR实验室的设计应考虑实验室的管理和维护。
实验室内部应设置有相关的管理制度和管理人员,以确保实验室的管理和维护工作得到有效的开展。
实验室内部的设施和设备应定期进行检查和维护,以确保实验室设施和设备的正常使用和安全性。
综上所述,PCR实验室的设计标准及规范对实验室工作的顺利进行具有重要意义。
实验室的设计应符合相关的安全规范和实验室设计标准,考虑实验室的使用需求和实验流程,确保实验室的安全性和实验操作的规范性,以及管理和维护实验室。
希望本文对PCR实验室的设计提供了一定的参考和指导,为相关工作的开展提供了有益的帮助。
PCR实验室
PCR实验室PCR实验室设计方案一、设计要求1.概述PCR实验室是用于临床基因扩增实验的专门实验室,可检测艾滋病、乙型肝炎、禽疫病等病毒感染性疾病。
该实验方法具有灵敏度高、特异性高、快捷、对样品要求低等优点,但需要配置合理的实验室和非常规范的操作为前提。
本文主要从实验室平面布局、空调通风系统设计、气流控制和污染防制几个方面对PCR实验室进行设计。
2.PCR实验室平面布局为避免交叉污染,实验室应分为四个单独的工作区域:试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区、扩增产物分析区。
各实验区之间的试剂及样品传递应通过传递窗进行。
3.实验室空调通风系统设计及压力控制为保证各实验区的压力要求和避免交叉污染,宜采用全送全排的气流组织形式,并严格控制送、排风的比例。
4.污染的预防与控制实验室应采用防护措施,如安装紫外线灯、使用消毒剂等,避免污染的发生。
二、设计方案根据设计要求,实验室平面布局应分为四个单独的工作区域。
各区域之间应通过传递窗进行试剂及样品传递,避免交叉污染的可能性。
空调通风系统应采用全送全排的气流组织形式,并严格控制送、排风的比例,以保证各实验区的压力要求。
同时,实验室应采用防护措施,如安装紫外线灯、使用消毒剂等,避免污染的发生。
三、设计图纸1.平面布局图2.风口平面图3.通风管道布局图4.照明线路分布图5.插座线路分布图6.电力系统图1.严格控制实验室人员进出,非实验相关人员禁止随意进出,必要时应设置独立通道和进出门。
2.实验区域应使用带有明显标志的工作服,不得将本区工作服带至其他区域。
3.尽量减少在实验区内不必要的走动,以减少交叉污染的可能性。
4.扩增产物分析区是最主要的污染来源,废液和一次性材料应经消毒液浸泡后远离实验室处理。
5.扩增产物分析区可能用到有毒物质,应特别注意实验人员的安全防护。
完备的实验室配套设施是保证实验工作必要条件,应根据实验内容配备相应设备和仪器,如超净工作台、离心机、加样器等。
pcr实验室的标准
PCR实验室标准
一、实验室内环境要求
1. 实验室的布局应合理,功能分区明确,避免交叉污染。
2. 实验室的温度和湿度应适宜,一般温度应控制在20-25℃,湿度控制在50-70%。
3. 实验室的空气洁净度应符合相关规定,确保无尘、无菌。
4. 实验室的通风和排气系统应良好,确保空气流通。
5. 实验室地面应耐腐蚀、防滑、易清洁。
6. 实验室的墙面、天花板和门窗应无缝隙、无渗漏。
二、实验室设备要求
1. 实验室应配备必要的仪器设备和实验器材,如PCR仪、电泳仪、离心机、水浴箱等。
2. 设备应定期进行维护和保养,确保其正常运行。
3. 实验器材应选用符合要求的材料,保证实验结果的准确性。
三、实验操作规范
1. 实验前应熟悉实验原理、操作步骤及注意事项。
2. 实验操作应严格按照规定的程序进行,不得随意更改操作步骤或省略实验步骤。
3. 实验过程中应注意观察实验现象,及时发现并处理异常情况。
4. 实验结束后应及时清理实验现场,确保实验室整洁有序。
四、实验室安全要求
1. 实验室应配备必要的安全设施,如灭火器、急救箱等。
2. 实验室应建立完善的安全管理制度,确保实验室安全运行。
3. 实验人员应掌握基本的安全知识和应急处理技能,遵守安全操作规程。
4. 对于高风险实验,应采取必要的安全措施,确保实验人员的人身安全。
五、实验室质量管理
1. 实验室应建立完善的质量管理体系,确保实验结果的准确性和可靠性。
2. 实验室应定期进行内部质量审核和管理评审,及时发现并纠正问题。
PCR实验室介绍
PCR实验室介绍PCR(聚合酶链式反应)是一种常用的实验技术,可以通过扩增DNA 序列来检测、定量和克隆DNA。
PCR实验室是进行PCR实验的地方,常见于生物学、医学和法医学等领域。
下面介绍PCR实验室的一般设置和主要实验步骤。
PCR实验室的设置通常包括实验台、PCR仪、离心机、显微镜和PCR 试剂等设备。
实验台上应有充足的工作空间以进行实验操作,PCR仪是进行PCR扩增的主要设备,离心机用于洗涤和收集扩增产物,显微镜用于观察PCR反应结果,PCR试剂包括引物、模板DNA和酶等。
PCR实验的主要步骤包括样品准备、PCR体系配置、PCR扩增和PCR 产物分析。
首先,需要准备样品,通常是提取DNA,可以从细胞、组织或者生物体液中提取DNA。
然后,根据实验的需要,配置PCR体系,包括引物、模板DNA、反应缓冲液、酶和dNTPs等。
引物是用于选择性扩增目标序列的DNA片段,模板DNA是进行扩增的起始物质,反应缓冲液提供适宜的酶反应条件,酶是催化PCR反应的关键物质,dNTPs是构建新DNA链所需的碱基。
配置好PCR体系后,将PCR反应管放入PCR仪中,按照设定的温度和时间进行PCR扩增。
PCR扩增的主要步骤包括变性、退火和延伸。
首先,将PCR反应管加热至高温,使DNA双链解开,即变性。
然后,降低温度使引物与目标序列结合,即退火。
最后,提高温度,酶开始双链延伸,合成新的DNA链。
通过循环进行这些步骤,可以使目标DNA序列迅速扩增。
PCR扩增的循环次数可以根据需要设定,常见的程序包括30-40个循环。
PCR扩增完成后,可以通过凝胶电泳、实时荧光PCR或者测序等技术对PCR产物进行分析。
凝胶电泳是常用的方法,可以根据PCR产物的大小进行分离和检测。
实时荧光PCR可以实时监测PCR反应过程中的产物累积情况,可以定量测定PCR产物的数量。
测序是对PCR产物进行序列测定,可以确定PCR扩增的准确性和特异性。
PCR实验室的质量控制非常重要,需要严格控制实验操作、反应条件和试剂质量。
pcr实验室设计标准
pcr实验室设计标准PCR实验室是进行聚合酶链反应(PCR)等分子生物学实验的重要场所。
为了确保实验的准确性、安全性和高效性,PCR实验室的设计需要遵循一定的标准。
以下是一些常见的PCR实验室设计标准:1. 实验室空间:PCR实验室应具有足够的空间容纳所需的设备和工作区域,同时还需要考虑到安全通行的空间,例如通道和出口。
2. 区域划分:PCR实验室应根据实验的不同阶段划分为不同的区域,例如前实验区、样品处理区和PCR扩增区等。
这有助于避免交叉污染。
3. 材料流动:PCR实验室的设计应考虑材料和人员的流动方式,以避免交叉污染。
通常,从“干净”区域到“脏”区域的单向流动是推荐的。
4. 安全设施:PCR实验室应配备必要的安全设施,例如生物安全柜、紫外线灭菌器、手套箱、防护眼镜和实验室外循环空气系统等,以确保实验过程的安全性。
5. 温控系统:PCR实验室需要具备恒定的温度控制能力,以支持PCR反应的温度要求。
此外,还需要确保实验室内的温度均匀性,避免热阱效应对PCR反应的影响。
6. 声度和振动:PCR实验室应考虑噪声和振动控制措施,因为这些因素可能会对PCR实验结果产生干扰。
7. 液体废弃物处理:PCR实验室应设有适当的液体废弃物处理设施,以确保废弃物的合规处理,避免对环境造成污染。
8. 通风系统:PCR实验室应配备适当的通风系统,以确保实验室内的空气质量,减少潜在的气体和有害物质积聚。
9. 实验室家具:PCR实验室的家具应选择耐腐蚀、易清洁和耐高温的材料,以适应PCR实验中常用的试剂和溶剂。
10. 标识和安全标志:PCR实验室应在适当的位置设置标识和安全标志,提醒实验室人员注意实验室规范和安全注意事项。
以上是一些常见的PCR实验室设计标准,具体的设计标准可能会因实验室用途和实验要求而有所不同。
在设计PCR实验室时,还应参考相关标准和法规,以确保实验室的合规性和安全性。
标准的PCR实验室简介
标准的PCR实验室简介临床基因扩增实验室采用PCR技术用于临床基因诊断,由于PCR技术对所检测的核酸模板进行大量扩增,容易出现实验室污染导致临床检测标本假阳性结果;另外实验过程处理不当易导致核酸模板无扩增现象,导致临床标本假阴性结果。
因此临床基因扩增检验实验室技术验收和规范化管理是PCR技术本身需要,也是在临床上顺利应用该技术前提。
PCR 实验室基本要求1.PCR 实验室依据所使用的方法可分为试剂准备、标本制备、扩增、产物分析等三或四个区域。
只是使用实时荧光PCR仪、HIV病毒载量测定仪的PCR实验室,有上述前面三个区域即可。
各区域应完全独立分隔,不应有任何的空气直通。
2.标准的PCR实验室产物分析区或三个区域的最后一个区域(即扩增及产物分析区),空气流向应由室外向室内,可通过在室内设置通风橱、排风扇或其他排风系统达到空气流由室外向室内流动的要求。
3.PCR实验室各区域仪器设备配备通常如下:3.1标准PCR实验室——试剂准备区:仪器设备主要应有加样器、冰箱、低速离心机、混匀器、可移动紫外灯等。
可使用超净工作台作为试剂配制操作台面。
加样器推荐使用德国Eppendorf品牌,其他可根据需要购置。
3.2标准PCR实验室——标本制备区仪器设备主要应有生物安全柜(BSL-2),可避免提取核酸在柜内反复循环,造成标本间交叉“污染”,出现假阳性结果。
此外还应配备加样器、台式高速离心机(冷冻及常温)、台式低速离心机、恒温设备(水浴或干浴仪)、冰箱、混匀器和可移动紫外灯等。
(部分仪器见下图)3.3标准的PCR实验室——扩增区主要仪器就是核酸扩增热循环仪(PCR仪,实时荧光或普通的,常见仪器见下方简介)。
热循环仪的电源应专用,并配备一个稳压电源或UPS,以防止由于电压的波动对扩增测定的影响。
此外,根据工作需要,还可配备加样器、超净台等。
常见实时荧光定量PCR仪:ABI7500ABI7500是ABI第三代PCR产品,目前市场占有率最高。
pcr基因扩增实验室建设布局
基因扩增实验室又称PCR实验室,是以临床诊断治疗为目的,以扩增检测DNA或RNA 为方法的检测技术。
如聚合酶链反应(PCR)、连接酶链反应(LCR)、转录依赖的放大系统(TAS)自主序列复制系统(3SR)和链替代扩增(SDA)等。
PCR实验室分为4各区即试剂准备区、标本制备区、扩增区和产物分析区。
PCR实验室建设布局:工作区域应设置缓冲间,工作间和缓冲间之间要配备连锁装置,实验室之间不能直通,不同的实验室应有独立的空间环境。
各区之前如果是紧密相连,需要安装物品传递窗。
每个工作区域的顶部应安装紫外灯。
紫外灯的波长为254nm,安装数量为每20m?an安装一支40w打的紫外线。
实验室较为理想的布局模式为有一个专用走廊,试剂准备区、标本制备区、扩增区和产物分析区很规范的排列在一起,前三个区各有一个缓冲间,可供换工作服和工作鞋使用,顶上可装一紫外线。
内实验室应设为正压状态,缓冲间为负压状态,每一区域都须有明确的标记,工作按试剂准备区、标本制备区、扩增区至产物分析区单一流向进行,各区的仪器设备包括工作服、鞋、实验室记录本和笔等都必须专用。
如果无法做到以上模式,以下基本要求必须做到:1、四个区域必须是相互独立的。
2、各区的仪器设备及各种物品必须专用的。
3、各区完全独立,缓冲间可有可无,如果一个区套一个区的模式,区间不能直通,应有缓冲间,拱换工作服及鞋子用,并保证两个区间始终处于完全的分隔状态。
4、产物分析区应安装排风扇或其他抽风装置,维持负压。
5、PCR实验室通风系统及压力控制。
6、各区域之间应具备单向的实验工艺流、气流、物流,形成单向流程的保护屏障,避免实验之间的相互干扰,防止气溶胶扩散对实验过程造成污染。
PCR实验室并没有严格的净化要求,为了能够避免交叉污染应采用全送全排的气流组织形式,严格控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求。
临床PCR实验室介绍
临床PCR实验室介绍临床PCR实验室是一种用于分子诊断的实验室,在医疗领域扮演着重要的角色。
PCR(聚合酶链式反应)是一种用于扩增DNA片段的技术,通过PCR实验室可以快速、准确地检测出各种病原体,帮助医生进行疾病诊断和治疗方案制定。
首先,临床PCR实验室是一个高度专业化的实验室。
实验室设备先进、精密,保证实验结果的可靠性和准确性。
实验室内常见的设备包括PCR仪、电泳装置、纯化系统等。
所有设备都经过严格的质量控制,确保实验的准确性和一致性。
其次,临床PCR实验室的人员配备专业。
实验室通常由一支由临床检验师和技术员组成的团队负责操作和分析实验结果。
临床检验师具有丰富的临床实验室经验,负责实验的设计、数据分析和结果解读。
技术员则负责具体的实验操作、设备的维护和数据记录。
每个实验室都有一位负责人,负责协调实验室的日常事务和人员培训。
临床PCR实验室的工作流程一般包括样本的收集、DNA的提取、PCR扩增、电泳分析和结果的解读。
首先,医生会收集患者样本,例如血液、尿液、唾液等,并将样本送到实验室进行分析。
实验室的工作人员将样本进行预处理,提取其中的DNA。
DNA提取是临床PCR实验室中非常关键的一个步骤,它决定了后续PCR扩增的成功与否。
然后,实验室将DNA样本与适当的引物和核酸酶混合,使用PCR仪进行扩增。
扩增结束后,实验室将扩增产物进行电泳分析,以确定目标基因是否存在,并确定其大小。
最后,实验室将分析结果进行解读,并生成一份实验报告,发送给医生进行诊断和治疗指导。
临床PCR实验室的应用非常广泛。
首先,它可以用于检测病原体的存在和种类,例如细菌、病毒、真菌等。
临床PCR可以快速检测出各种病原体,成为常见的病原体检测方法之一,帮助医生进行疾病的准确诊断和治疗方案的选择。
其次,临床PCR还可以用于遗传病的检测和筛查。
通过对患者DNA进行PCR扩增,可以快速检测出一些常见的遗传病基因突变,帮助家庭了解自己的遗传病风险,从而采取相应的预防措施。
PCR实验室(相关资料)
PCR:即聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction),利用DNA在体外95℃时解旋(变性),55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合(退火),再调温度至72℃左右,DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链(延伸)。
PCR仪实际就是一个温控设备,能在95℃,55℃,72℃之间很好地进行温度控制。
根据DNA扩增的目的和检测的标准可以将PCR仪分为:普通PCR仪,梯度PCR 仪,原位PCR仪,实时荧光定量PCR仪等几类。
普通PCR仪:一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪,称之为普通PCR仪,也就是传统的PCR仪。
如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行。
普通PCR仪主要应用于科研、教学、临床医学、检验、检疫等。
如:启步BSW-2P,BSW-3P,ABI 2720型梯度PCR仪:PCR反应能否成功,退火温度是关键,梯度PCR仪每个孔的温度可以在指定围按照梯度设置,根据结果,一步就可以摸索出最适反应条件。
一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件(通常12种温度梯度)的称之为梯度PCR仪。
不同的DNA片段其最适合的退火温度不同,通过设置一系列的梯度退火温度进行扩增,从而一次性PCR扩增就可以筛选出表达量高的最适合退火温度进行有效的扩增。
梯度PCR仪主要用于研究未知DNA退火温度的扩增,这样既节约时间,也节约成本。
在不设置梯度的情况下亦可当做普通的PCR用。
梯度PCR仪多应用于分子生物学、医学、食品工业、司法科学、生物技术、环境科学、微生物学、临床诊断、流行病学、遗传学、基因芯片、基因检测、基因克隆、基因表达等领域以聚合酶链式反应(Picymerase Chain Reaction , PCR)为特征的、以检测DNA/RNA为目的的各种病原体检测及基因分析。
如:启步BSW-2T,BSW-3T,ABI 9700,ABI Veriti, Bio-Rad T100型原位PCR仪:PCR是提取细胞或组织中的DNA进行基因扩增反应,而原位PCR是保持细胞或组织的完整性,使PCR反应体系渗透到组织和细胞中,在细胞的靶DNA所在的位置上进行基因扩增。
第一节:PCR实验室简介及仪器设备熟悉;(移液枪介绍等)
第一节:PCR实验室及仪器设备简介一、PCR实验室PCR实验室又叫基因扩增实验室。
PCR是聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)的简称。
是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。
通过DNA基因追踪系统,能迅速掌握患者体内的病毒含量,其精确度高达纳米级别,精确检测乙肝病毒在患者体内存在的数量、是否复制、是否传染、传染性有多强、是否必要服药、肝功能有否异常改变能及时判断病人最适合使用哪类抗病毒药物、判断药物疗效如何、给临床治疗提供了可靠的检验依据。
PCR 实验室基本要求PCR 实验室依据所使用的方法可分为试剂准备、标本制备、扩增、产物分析等三或四个区域。
只是使用实时荧光PCR仪、HIV病毒载量测定仪的PCR实验室,有上述前面三个区域即可。
各区域应完全独立分隔,不应有任何的空气直通;试剂准备区:专门用于准备各种反应试剂的区域,这个区域必须保持干净,而且没有来自克隆和样品准备的污染。
样本制备区:这个区域专门用作样品的准备,在制备和操作用于核酸提取的试剂时应该采取预防措施:1)PCR产物和带有要扩增序列的DNA克隆不能在这个房间操作。
2)组织培养物、组织标本和血清样品都带进样品准备间处理,以根据应用的需要提取DNA或RNA。
3)用于样品处理的工具不能被用作普通分子克隆的工具,也不能用作操作靶序列。
4)DNA样品应该用有专门的防护或正压活塞式移液管操作,以防止在吸取样品时有气溶胶遗留。
5)大体积样品应该用单独包装的无菌一次性移液管吸取。
6)管子打开前都要简短离心以减少气溶胶的产生,而且管子不能用力崩开,这样会产生气溶胶。
7)任何时候都应该穿实验服和带手套,手套要经常更换,尤其在抽提过程中每一步之间都要更换。
实验服要专门用于样品准备间,经常清洗。
核酸扩增区扩增目的片段,产物用于分析产物分析区PCR完成以后,需要分析样品并解释数据,应该留出一个专门用于反应后处理样品的地方。
标准的PCR实验室简介
标准的PCR实验室简介1、主体结构:主体为彩钢板、铝合金型材。
室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝,从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。
结构牢固,线条简明,美观大方,密封性好。
2、标准的三区分隔和气压调节:将PCR过程分成试剂准备、标本制备和PCR扩增检测三个独立的实验区。
整个区域有一个整体缓冲走廊。
每个独立实验区设置有缓冲区,同时各区通过气压调节,使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。
可打开缓冲区I,缓冲区II和PCR扩增区的排风扇往外排气,在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风,空气通过回风向室内换气。
3、消毒:在三个实验区和三个缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯,供消毒用。
在试剂准备区和标本制备区还设置移动紫外线灯,对实验桌进行局部消毒。
4、机械连锁不锈钢传递窗:试剂和标本通过机械连锁不锈钢(不建议使用电子连锁方式)传递窗传递,保证试剂和标本在传递过程中不受污染(人物分流)。
5、地面地面建议使用PVC卷材地面或自流坪地面,整体性好。
便于进行清扫,耐腐蚀。
没有条件的也可采用水磨石地面,或大块的瓷砖(至少8mm X 8mm)接缝需要小于2mm6、照明灯具要选用净化灯具,能达到便于清洗、不积尘的特点。
在建设的过程中应注意:•规范的安装流程和全面的服务流程。
•严格按照规范科学设计的安装流程。
•安装前需要确定以下安装条件,如:电源电压,电源进线位置,电话网络线进线位置,进水水压,最小安装空间,地面平整度,通风孔、进水管和下水管的位置等,理想状态的空间尺寸和通风尺寸。
实验室净化工程[详细内容]p2 实验室就是Physical Containment Level 2 Laboratory在PC2 lab中工作一定要穿实验服鞋子要完全包住脚.不能吃东西和喝水.离开后一定要锁门.PC2 lab可以处理unclearbiological.实验记录本要和实验台分开实验服不可以带出实验室(除非拿去洗).P2实验室即二级生物安全实验室,相当于BSL-2实验室。
PCR实验室(相关资料)
PCR:即聚合酶链式反应Polymerase Chain Reaction;利用DNA在体外95℃时解旋变性;55℃时引物与单链按碱基互补配对的原则结合退火;再调温度至72℃左右;DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖5'-3'的方向合成互补链延伸..PCR仪实际就是一个温控设备;能在95℃;55℃;72℃之间很好地进行温度控制..根据DNA扩增的目的和检测的标准可以将PCR仪分为:普通PCR仪;梯度PCR 仪;原位PCR仪;实时荧光定量PCR仪等几类..普通PCR仪:一般把一次PCR扩增只能运行一个特定退火温度的PCR仪;称之为普通PCR仪;也就是传统的PCR仪..如果要用它做不同的退火温度则需要多次运行..普通PCR仪主要应用于科研、教学、临床医学、检验、检疫等..如:启步BSW-2P;BSW-3P;ABI 2720型梯度PCR仪:PCR反应能否成功;退火温度是关键;梯度PCR仪每个孔的温度可以在指定范围内按照梯度设置;根据结果;一步就可以摸索出最适反应条件..一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件通常12种温度梯度的称之为梯度PCR仪..不同的DNA片段其最适合的退火温度不同;通过设置一系列的梯度退火温度进行扩增;从而一次性PCR扩增就可以筛选出表达量高的最适合退火温度进行有效的扩增..梯度PCR仪主要用于研究未知DNA退火温度的扩增;这样既节约时间;也节约成本..在不设置梯度的情况下亦可当做普通的PCR用..梯度PCR仪多应用于分子生物学、医学、食品工业、司法科学、生物技术、环境科学、微生物学、临床诊断、流行病学、遗传学、基因芯片、基因检测、基因克隆、基因表达等领域以聚合酶链式反应Picymerase Chain Reaction ; PCR为特征的、以检测DNA/RNA为目的的各种病原体检测及基因分析..如:启步BSW-2T;BSW-3T;ABI 9700;ABI Veriti; Bio-Rad T100型原位PCR仪:PCR是提取细胞或组织中的DNA进行基因扩增反应;而原位PCR是保持细胞或组织的完整性;使PCR反应体系渗透到组织和细胞中;在细胞的靶DNA所在的位置上进行基因扩增..不但可以检测到靶DNA;而且还可以了解靶DNA存在于何种细胞中;更有利于探讨靶DNA与细胞之间的关系..原位PCR仪主要应用于:1检测外源性基因片段;提高检出率;集中在病毒感染的检查上;如HIV、HPV、HBV、CMV等;2观察病原体在体内分布规律;3内源性基因片段;如人体的单基因病、重组基因、易位的染色体、Ig的mRNA片段、癌基因片段等;4检测导入基因;5遗传病基因检测如β-地中海贫血..实时荧光定量PCR仪:在普通PCR仪设计基础上增加荧光信号采集系统和计算机分析处理系统;形成了具有荧光定量功能的PCR仪器..其PCR扩增原理和普通PCR扩增原理相同;在PCR扩增时加入的引物是利用同位素、荧光素等进行标记;使用引物和荧光探针同时与模板特异性结合扩增..扩增的结果通过荧光信号采集系统实时采集信号连接输送到计算机分析处理系统;得出量化的实时结果输出..荧光定量PCR仪有单通道;双通道和多通道之分..当只用一种荧光探针标记的时候;选用单通道;有多种荧光标记的时候使用多通道..单通道也可以检测多荧光的标记和目的基因表达产物;因为一次只能检测一种目的基因的扩增量;需多次扩增才能检测完不同的目的基因片段的量..多通道利于做多重PCR;实现一次检测多种目的基因的功能..荧光定量PCR仪主要应用于临床医学检测、生物医药研发、食品行业、科研院校等..荧光定量检测技术在临床诊断方面很多;主要集中在各种病原体引起疾病的临床诊断;如肝炎类疾病、性病、与优生优育相关的疾病以及肺结核等等..通道:channel指的是针对每一种荧光的检测器;比如你在一个管中做多个颜色;针对多个靶基因..每个颜色需要一个检测器来检测荧光信号的强弱;每一个针对不同颜色的检测器;就是一个通道..在使用有些厂家5通道的荧光定量仪时;为了确保实验结果的精确性和准确性都要在实验中使用ROX一种荧光染料;ROX 是作为内参的;即参照和校正实验结果..在ABI的机器里显示为红色的水平线..如果你的扩增线在刚开始的时候就高于ROX 证明有基因组DNA污染..或专用的Reference dye ;这些荧光染料都必须单独使用一个检测通道..这样以来;真正能检测多重PCR荧光信号的有效通道只有4个;而且使用校正染料可能会增加后期的使用成本..有的荧光定量PCR的检测通道是只为自已厂家的专用的荧光染料或试剂开放的;有效检测通道也绝非像宣传资料中宣称的那么多..选择单通道实验还是多通道实验这是要根据实验需要来选择的;如果有一个、两个或是三个基因要进行比较;并用看家基因进行对照;可以考虑选择多通道实验..多通道实验的好处是可以消除样本加样的误差..但要克服的困难也比较多;一是条件的优化比较麻烦;即多种PCR反应以及探针要在同一个反应条件下进行;并且效率都要比较高;另一个困难是要求相互之间没有干扰;因为干扰会影响到实验结果..还有一个困难是当一个基因的模板数显著大于其他基因时;因为共用核苷酸等资源的原因;会让模板数少的基因的定量值变小或变为零..因此一般两通道的实验比较多些;即一个基因进行多样本比较;用看家基因进行对照..硬件设计:传统的96孔板的荧光定量PCR可以容纳的样本量大;而且无需特殊的耗材..有些传统的96孔板的仪器采用卤钨灯激发、CCD检测;这些光学结构在96孔板的顶部;每个样品孔距光源和检测器的光程各不相同——边缘效应;对结果产生影响..为了保证精确、准确的实验结果;这类仪器在实验过程中通常会使用ROX一种荧光染料或专用的Reference dye作为参照校正实验结果..卤钨灯的使用寿命短、更换成本较高已经成为很多用户头痛的问题..在实验过程中卤钨灯作为一种热光源;产生较多热能对实验结果有一定的影响D最大的优点就是可以同时扫描所有样品中的荧光信号;但是灵敏度较低;而且同时检测样品间的荧光信号存在干扰..像ABI、Bio-rad 公司生产的荧光定量PCR就属于这一种..只能收集单个荧光信号;但是检测灵敏度高..但这类仪器运行速度非常快;但也存在样本量小、耗材昂贵、没有梯度功能、存在时间积分等缺点..Corbett 的Rotor-gene系列和Roche 的Lightcycler系列均为这一类仪器..在荧光定量PCR仪的众多技术参数中;升降温速度也是厂家喜欢大力宣传的指标..更快的升降温;可以缩短反应进行的时间;而且缩短了可能的非特异性结合、反应的时间;提高PCR的特异性..PCR实验室内部分区图图 1 试剂储存区图 2 标本制备区图 3 扩增区图 4 产物分析区PCR实验室原则上为试剂准备区、样品制备区、扩增区和扩增产物分析区四个单独的工作区域并设有专用走廊;各工作区域应设缓冲间;工作区与缓冲间宜安装连锁装置..不同功能的工作区应是分隔独立的;各工作区有明显的标志;不能直通;如果紧密相连;需安装物品传递窗..前两区为扩增前区;后两区为扩增后区;扩增前区与扩增后区应严格分开..实验材料、试剂、记录纸、笔、清洁材料等;只能从扩增前区流向扩增后区;即从试剂准备区→样品制备区→扩增区→扩增产物分析区;不得逆向流动..实验室的气流也应从扩增前区流向扩增后区;不得逆向流动..各工作区顶部应安装紫外灯;紫外灯的波长为254nm;每20㎡一支40W的紫外灯..二、PCR实验室各区功能及主要设备试剂和用于样品制作的材料应直接运送至该区;不得经过其它区域..试剂原材料必须贮存在本区内;并在本区内制备成所需的试剂..本区主要设备有天平、冰箱、离心机、加样器、振荡器等..对于气流压力的控制;本区并没有严格的要求..2DNA的合成..本区主要设备有冰箱、生物安全柜、离心机、加样器、振荡器、恒温水浴等..本区的压力梯度要求为:相对于邻近区域为正压;以避免从邻近区进入本区的气溶胶污染.. 3、扩增区:主要进行DNA扩增..此外;已制备的DNA模板来自样品制备区的加入和主反应混合液来自试剂准备区制备成反应混合液等也可在本区内进行..本区主要设备有:扩增仪、冰箱、离心机、加样器等..本区的压力梯度要求为:相对于邻近区域为负压;以避免气溶胶从本区漏出..4本区主要设备有酶标仪、洗板机、加样器和水浴箱等..本区的压力梯度的要求为:相对于邻近区域为负压;以避免扩增产物从本区扩散至其它区域..三、PCR实验室通风系统及压力控制各区域之间应具备单向的实验工艺流、物流、人流与气流;形成单向流程的保护屏障;避免实验之间的相互干扰;防止气溶胶扩散对实验过程造成污染..PCR实验室并没有严格的净化要求;但是为避免各个实验区域交叉污染的可能性;宜采用全送全排的气流组织形式;严格控制送、排风的比例以保证各实验区的压力要求..实验室围护结构应牢固、气密性好;所有阴阳角宜采用圆弧过渡;墙体内壁光洁、不积尘、耐腐蚀、易清洗消毒;地面使用PVC卷材或环氧树脂自流坪;材料应满足无缝隙、无渗漏、光洁、耐腐蚀的要求..五、PCR实验室注意事项1、几个区域的大小设置情况;试剂准备区、扩增区、扩增产物分析区;空间可以相对小一些;样品制备区要放置生物安全柜和低温冰箱;空间应大一些..2、试剂准备区、样品制备区设紧急洗眼器;以保证操作人员的安全..3、PCR实验室没有严格的净化要求;可以根据用户的使用情况和资金的投入选择..病理科病理诊断试剂及配套设备全系列的产品;涵盖了液基细胞学、免疫组织化学和分子基因诊断..产品包括液基细胞学系列产品、荧光原位杂交技术、荧光定量PCR技术、一代测序技术、液相基因芯片技术等先进技术相关的仪器、试剂和耗材..沉降式全自动制片染色系统:根据人体不同类型细胞其比重不同的特点;尤其是病变细胞比重大、沉降速度快;与特殊处理后的载玻片相互吸引;从而最大程度地捕捉病变细胞和具有诊断价值的成分;自动湿染色;最终制成背景清晰、诊断线索明确的单层细胞薄片..全自动沉降式制片染色系统每批次可以处理1-24个标本;每天7小时可以处理300张制片;单片独立滴染;染液一次性使用;避免样本交叉污染..沉降式全自动液基细胞学制片染色系统广泛应用于宫颈癌筛查;同时诊断痰细胞、尿液细胞、浆膜腔细胞、针吸细胞和内窥镜细胞..荧光原位杂交FISH:FISH是在细胞水平上检测染色体数目和基因数目及结构异常的分子生物学技术;其基本原理是用荧光标记的核酸探针;经过变性退火;和样本中碱基互补序列特异性结合成DNA双链;然后通过荧光显微镜检测分析..由于FISH技术具有直观、快速、敏感性高和方便灵活的特性;已经广泛应用于肿瘤遗传学、基因相关疾病的分型和肿瘤个体化治疗等领域..液相芯片技术是以100种不同荧光编码的微球作为探针的载体;生物分子间的反应在悬浮液态体系中进行的一类新的生物芯片技术..在这个灵活和开放的平台中可进行蛋白质、核酸等生物大分子的检测.液相芯片较传统的固相芯片的优势在于检测准确、信息质量稳定、可重复性好..液相芯片以其易于操作、高通量、高灵敏度、高准确度、高精密度以及宽的线性测定范围的特点;逐渐进入了临床诊断领域..液相基因芯片:将预先人工合成的寡核苷酸探针共价连接于微球表面构成..液相基因芯片除具有一般固相基因芯片的功能如核苷酸测序、单核苷酸多态性分析、基因作图等;还具有精确的同时定性、定量分析特征..液相蛋白芯片:临床检测包括:1 抗原抗体定量定性检测;2 细胞因子检测..测序技术第一代----Sanger链终止法一代测序技术是20世纪70年代中期由Fred Sanger及其同事首先发明..其基本原理是;聚丙烯酰胺凝胶电泳能够把长度只差一个核苷酸的单链DNA分子区分开来..一代测序实验的起始材料是均一的单链DNA分子..第一步是短寡聚核苷酸在每个分子的相同位置上退火;然后该寡聚核苷酸就充当引物来合成与模板互补的新的DNA链..用双脱氧核苷酸作为链终止试剂双脱氧核苷酸在脱氧核糖上没有聚合酶延伸链所需要的3-OH基团;所以可被用作链终止试剂通过聚合酶的引物延伸产生一系列大小不同的分子后再进行分离的方法..测序引物与单链DNA模板分子结合后;DNA聚合酶用dNTP延伸引物..延伸反应分四组进行;每一组分别用四种ddNTP双脱氧核苷酸中的一种来进行终止;再用PAGE分析四组样品..从得到的PAGE胶上可以读出我们需要的序列..第二代----大规模平行测序大规模平行测序平台massively parallel DNA sequencing platform的出现不仅令DNA测序费用降到了以前的百分之一;还让基因组测序这项以前专属于大型测序中心的“特权”能够被众多研究人员分享..新一代DNA测序技术有助于人们以更低廉的价格;更全面、更深入地分析基因组、转录组及蛋白质之间交互作用组的各项数据..市面上出现了很多新一代测序仪产品;例如美国Roche Applied Science公司的454基因组测序仪、美国Illumina公司和英国Solexa technology公司合作开发的Illumina测序仪、美国Applied Biosystems公司的SOLiD测序仪..Illumina/Solexa Genome Analyzer测序的基本原理是边合成边测序..在Sanger等测序方法的基础上;通过技术创新;用不同颜色的荧光标记四种不同的dNTP;当DNA聚合酶合成互补链时;每添加一种dNTP就会释放出不同的荧光;根据捕捉的荧光信号并经过特定的计算机软件处理;从而获得待测DNA的序列信息..以Illumina测序仪说明二代测序的一般流程;1文库制备;将DNA用雾化或超声波随机片段化成几百碱基或更短的小片段..用聚合酶和外切核酸酶把DNA片段切成平末端;紧接着磷酸化并增加一个核苷酸黏性末端..然后将Illumina测序接头与片段连接..2簇的创建;将模板分子加入芯片用于产生克隆簇和测序循环..芯片有8个纵向泳道的硅基片..每个泳道内芯片表面有无数的被固定的单链接头..上述步骤得到的带接头的DNA 片段变性成单链后与测序通道上的接头引物结合形成桥状结构;以供后续的预扩增使用..通过不断循环获得上百万条成簇分布的双链待测片段..3测序;分三步:DNA聚合酶结合荧光可逆终止子;荧光标记簇成像;在下一个循环开始前将结合的核苷酸剪切并分解..4数据分析..-第三代----高通量、单分子测序被称为第三代的测序的He-licos单分子测序仪;PacificBioscience的SMRT技术和Oxford Nanopore Technologies 公司正在研究的纳米孔单分子测序技术正向着高通量、低成本、长读取长度的方向发展..不同于第二代测序依赖于DNA模板与固体表面相结合然后边合成边测序;第三代分子测序;不需要进行PCR扩增..(1)Helico BioScience 单分子测序技术..该测序是基于边合成边测序的思想;将待测序列随机打断成小分子片段并用末端转移酶在 3' 末端加上 polyA;以及在polyA的末端进行荧光标记和阻断;把这些小片段与带有polyT的平板杂交成像来获得已经杂交模板所处的位置;建立边合成边测序的位点加入聚合酶和被Cy3荧光标记脱氧核苷酸进行DNA 合成;每次只加入一种脱氧核苷酸;然后将未参与合成的dNTP和DNA聚合酶洗脱;直接对Cy3成像;观测模板位点上是否有荧光信号;然后化学裂解核苷酸上的燃料并释放加入下一种脱氧核苷酸和聚合酶的混合物;进行下一轮反应..2Pacific BioscienceSMRTT 技术..该测序也是基于边合成边测序的原理;这项技于使用了Zero-ModeWaveguideZMW零级波导..测序的过程:被荧光标记磷酸集团的核苷酸在聚合酶活性位点上与模板链结合每种脱氧核苷酸被不用颜色的染料标记;被激发出荧光;在荧光脉冲结束后;被标记的磷酸集团被切割并释放;聚合酶转移到下一个位置;下一个脱氧核苷酸连接到位点上开始释放荧光脉冲;进行下一个循环..3Oxford Nanopore Technologies 的纳米孔单分子测序技术..大多数纳米孔测序技术的基本原理是当DNA分子或者它的组成碱基从一个孔洞经过时而检测到被影响的电流或光信号..OxfordNanopore 测序技术是以α- 溶血素来构建生物纳米孔;核酸外切酶依附在孔一侧的外表面;一种合成的环糊精做为传感器共价结合到纳米孔的内表面..这个系统被镶嵌在一个脂双分子层内;为了提供既符合碱基区分检测又满足外切酶活性的物理条件;脂双分子层两侧为不同的盐浓度在适合的电压下;核酸外切酶消化单链 DNA;单个碱基落入孔中;并与孔内的环糊精短暂的相互作用;影响了流过纳米孔原本的电流;腺嘌呤与胸腺嘧啶的电信号大小很相近;但胸腺嘧啶在环糊精停留是时间是其他核苷酸的2-3倍;所以每个碱基都因其产生电流干扰振幅是特有的而被区分开来..唐氏筛查唐氏综合症又叫做21三体综合征;先天愚型;是说患者的第21对染色体比正常人多出一条正常人为一对;是最常见的染色体非整倍体疾病..期、体重、年龄和采血时的孕周等;计算生出先天缺陷胎儿的危险系数的检测方法..如果唐筛检查结果显示胎儿患有唐氏综合症的危险性比较高;就应进一步进行确诊性的检查--羊膜穿刺检查或绒毛检查..根据卫生部最新的产前筛查标准;具有相应资质的检测单位根据开展的筛查方案;在5%假阳性率前提下;孕中期二联;三联筛查和四联筛查;对唐筛检出率分别应大于60%;70%和80%..需要明确的是;唐筛检查只能帮助判断胎儿患有唐氏症的机会有多大;但不能明确胎儿是否患上唐氏症..检查血清AFP、HCG、uE3、Inhibin A还可筛查出神经管缺损NTD、18-三体综合征及13-三体综合征的高危孕妇..筛查时间:最佳时间是在孕15~20周..16~18周之间唐氏综合征还没有比较有效的治疗方法;最好是终止妊娠..。
PCR实验室介绍
PCR实验室介绍引言:PCR(Polymerase Chain Reaction)是一种被广泛应用于分子生物学研究的技术,它可以在较短时间内从一小段DNA片段扩增出大量的复制品。
PCR实验室是进行PCR实验的专门实验室,本文将介绍PCR实验室的设备、工作流程和安全措施等方面的内容。
设备介绍:除了PCR仪,实验室还需要细胞培养箱和离心机。
细胞培养箱用于创建和维持生长细胞的理想环境,以供后续的PCR实验使用。
离心机则是在PCR实验过程中常用的实验设备之一,用于将液体样品离心,以分离DNA、RNA和蛋白质等。
此外,PCR实验室还配备聚丙烯酰胺凝胶电泳系统,用于检测PCR反应产物,并确定扩增的DNA片段大小。
在PCR实验室中还常见的设备有微量分光光度计,用于定量分析PCR反应体系中的核酸。
工作流程:首先,实验者需要进行实验计划,确定实验目的、设计引物、选择合适的模板DNA和引物。
在计划阶段,还需要考虑质量控制措施和实验室安全措施。
接下来,实验者需要准备样品。
这涉及到从生物体中收集并提取DNA。
实验者需要根据实验需求,采用适当的方法提取纯度高、浓度适当的DNA样品。
在样品准备完成后,实验者需要准备PCR反应体系。
PCR反应体系一般由模板DNA、引物、dNTP、缓冲液、酶和辅助添加剂等组成。
组装反应体系时,需要严格按照实验方案中的要求和浓度比例来配置反应体系。
实验者在配置PCR反应体系后,将其转移到PCR仪中进行扩增反应。
PCR反应具有多个循环的过程,每个循环通常包括三个步骤:变性、退火和延伸。
PCR仪将按照预设的温度参数控制循环反应的过程,持续进行若干个循环。
完成PCR反应后,实验者需要将PCR产物进行分离和检测。
这一步骤通常涉及到聚丙烯酰胺凝胶电泳,以测定PCR反应产物的大小和纯度。
分离和检测之后,实验结果可以用于后续的分析和实验目的。
安全措施:为了确保实验的安全进行,PCR实验室需要采取一系列安全措施。
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标准的PCR实验室简介1、主体结构:主体为彩钢板、铝合金型材。
室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝,从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。
结构牢固,线条简明,美观大方,密封性好。
2、标准的三区分隔和气压调节:将PCR过程分成试剂准备、标本制备和PCR扩增检测三个独立的实验区。
整个区域有一个整体缓冲走廊。
每个独立实验区设置有缓冲区,同时各区通过气压调节,使整个PCR实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染并降低扩增产物对人员和环境的污染。
可打开缓冲区Ⅰ,缓冲区Ⅱ和PCR扩增区的排风扇往外排气,在实验区的外墙上和各扇门上都安装有风量可调的回风口,空气通过回风口向室内换气。
3、消毒:在三个实验区和三个缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯,供消毒用。
在试剂准备区和标本制备区还设置移动紫外线灯,对实验桌进行局部消毒。
4、机械连锁不锈钢传递窗:试剂和标本通过机械连锁不锈钢(不建议使用电子连锁方式)传递窗传递,保证试剂和标本在传递过程中不受污染(人物分流)。
5、地面地面建议使用PVC卷材地面或自流坪地面,整体性好。
便于进行清扫,耐腐蚀。
没有条件的也可采用水磨石地面,或大块的瓷砖(至少800mm×800mm)接缝需要小于2mm。
6、照明灯具要选用净化灯具,能达到便于清洗、不积尘的特点。
标准的PCR实验室在建设的过程中应注意:●规范的安装流程和全面的服务流程。
●严格按照规范科学设计的安装流程。
●安装前需要确定以下安装条件,如:电源电压,电源进线位置,电话网络线进线位置,进水水压,最小安装空间,地面平整度,通风孔、进水管和下水管的位置等,理想状态的空间尺寸和通风口尺寸。
PCR实验室基本要求PCR 实验室依据所使用的方法可分为试剂准备、标本制备、扩增、产物分析等三或四个区域。
只是使用实时荧光PCR仪、HIV病毒载量测定仪的PCR实验室,有上述前面三个区域即可。
各区域应完全独立分隔,不应有任何的空气直通。
标准的PCR实验室产物分析区或三个区域的最后一个区域(即扩增及产物分析区),空气流向应由室外向室内,可通过在室内设置通风橱、排风扇或其他排风系统达到空气流由室外向室内流动的要求。
PCR实验室各区域仪器设备配备通常如下:标准的PCR实验室试剂准备区:仪器设备主要应有加样器、冰箱、天平、低速离心机、混匀器、可移动紫外灯等。
可使用超净工作台作为试剂配制操作台面。
标准的PCR实验室标本制备区仪器设备主要应有生物安全柜(最好为B2, 可避免提取核酸在柜内反复循环,造成标本间交叉“污染”,出现假阳性结果。
此外还应配备加样器、台式高速离心机(冷冻及常温)、台式低速离心机、恒温设备(水浴和/或干浴仪)、冰箱、混匀器和可移动紫外灯等。
标准的PCR实验室扩增区主要仪器就是核酸扩增热循环仪(PCR仪,实时荧光或普通的)。
热循环仪的电源应专用,并配备一个稳压电源或UPS,以防止由于电压的波动对扩增测定的影响。
此外,根据工作需要,还可配备加样器、超净台等。
标准的PCR实验室产物分析区:本区所使用的仪器设备可能有加样器、电泳仪(槽)、电转印仪、杂交炉或杂交箱、水浴箱、DNA测序仪、酶标仪和洗板机等。
在理想情况下,PCR实验室试剂准备、标本制备、扩增三个区域可设置缓冲间。
在缓冲间内,可设置正压,使室内空气不流向室外,室外空气不流向室内。
PCR实验室平面布置示意图一般实验室间隔材料分:彩钢板,不锈钢板,理化板等,价格依次而上,主要考虑不产尘,不滋菌,容易清理就行一般实验室间隔材料分:彩钢板,不锈钢板,理化板等,价格依次而上,主要考虑不产尘,不滋菌,容易清理就行**卫生部PCR研究员李金明(卫生部临床检验中心临床免疫室主任,研究员)的PCR建设方案再说吧!国外的资料不一定是最好。
个人觉得李金明的实验室区正压(扩增分析区因为没有缓冲,所以为负压),缓冲间负压的作法可以更好的防止气体的外泄及防止试剂准备区、标本制备区、产物扩增区、扩增分析区四区之间的气体相互渗漏。
PCR实验室也可以分为三个区,即第三、四区合为一区,必须设立缓冲间。
有条件建设实验室采用三十万级的标准来建设。
空调系统采用制冷剂各区独立循环,可以防止气流交叉。
**疾病预防控制中心实验室建设之PCR 实验室基本要求:PCR实验室可以是分散形式,也可以是组合形式。
完成一组PCR实验,通常应经过试剂配制、样品处理、核酸扩增及产物分析四个实验过程,若实验工艺需要,还应增加样品粉碎过程。
一、分散形式PCR实验室所谓分散形式PCR实验室,是指完成上述实验过程的实验用房彼此相距较远,呈分散布置形式。
对于这种布置形式的PCR实验室,由于各个实验之间不易相互干扰,因此无需特殊条件要求。
二、组合形式PCR实验室所谓组合形式PCR实验室, 是指完成PCR四个实验过程的实验用房相邻布置,组成独立实验区域的形式。
对于组合形式PCR实验室,由于各个实验间集中布置,容易造成相互干扰,因此,对总体布局以及屏障系统具有一定的要求。
各室在入口处设缓冲间,以减少室内外空气交换。
试剂配制室及样品处理室宜呈微正压,以防外界含核酸气溶胶的空气进入,造成污染;核酸扩增室及产物分析室应呈微负压,以防含核酸的气溶胶扩散出去污染试剂与样品。
如果使用荧光PCR仪,扩增室和产物分析室可以合并。
若房间进深允许,可设PCR内部专用走廊。
需要指出的是在减少室内外空气交换方面,缓冲间比专用走廊更有意义。
**PCR实验区的设置,几个要注意的问题:1、几个区域的大小设置情况,应该是试剂准备区、产物扩增区、扩增分析区,要小一些。
标本制备区应大一些。
因为,标本制备室要放置一个生物安全柜为一个低温冰箱。
2、试剂准备区、标本制备区就设立紧急洗眼器,以备不时之需。
3、PCR实验室的洁净度可以根据用户的实际使用情况和资金的投入来设计。
**临床基因扩增检验实验室基本设置标准根据《临床检验扩增检验实验室管理暂行办法》,制定本标准一、临床基因扩增检验实验室区域设置原则(一)临床基因扩增检验实验室区域设置原则1、试剂储存和准备区2、标本制备区3、扩增反应混合物配制和扩增区4、扩增产物分析区如使用全自动分析仪,区域可适当合并。
(二)各工作区域必须有明确的标记,避免不同工作区域内的设备、物品混用。
(三)进入各工作区域必须严格按照单一方向进行,即试剂储存和准备区—>标本制备区—>扩增反应混合物配制和扩增区—>扩增产物分析区。
(四)不同的工作区域使用不同的工作服(例如不同的颜色)。
工作人员离开各工作区域时,不得将工作服带出。
二、工作区域仪器设备配置标准(一)试剂储存和准备区1、2-8C和-15C冰箱2、混匀器3、微量加样器(覆盖1-1000ul)4、移动紫外灯(近工作台面)5、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)6、专用工作服和工作鞋7、专用办公用品(二)标本制备区1、2-8C冰箱、-20C或-80C冰箱2、高速台式冷冻离心机3、混允器4、水浴箱或加热模块5、微量加样器(覆盖1-1000ul)6、可移动紫外灯(近工作台面)7、超净工作台8、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)9、专用工作服和工作鞋10、专用办公用品如需处理大分子DNA,应具有超声波水浴仪。
(三)扩增反应混合物配制和扩增区1、核酸扩增仪2、微量加样器(覆盖1-1000ul)3、可移动紫外灯(近工作台面)4、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、耐高压处理的离心管和加样器吸头(带滤心)5、专用工作服和工作鞋6、专用办公用品(四)扩增产物分析区视检验方法不同而定。
基本仪器设备如下:1、微量加样器(覆盖1-1000ul)2、可移动紫外灯(近工作台面)3、消耗品:一次性手套、一次性吸水纸、加样器吸头(带滤心)4、专用工作服和工作鞋5、专用办公用品为了对以个特定序列进行PCR做重复检测,需要三个不同的区域,每一个区域的具体技术操作和试剂在下面详细列出.1、样品准备区这个区域专门用作样品的准备,在制备和操作用于核酸提取的试剂时应该采取预防措施:1)PCR产物和带有要扩增序列的DNA克隆不能在这个房间操作。
2)组织培养物、组织标本和血清样品都带进样品准备间处理,以根据应用的需要提取DNA或RNA。
3)用于样品处理的工具不能被用作普通分子克隆的工具,也不能用作操作靶序列。
4)DNA样品应该用有专门的防护或正压活塞式移液管操作,以防止在吸取样品时有气溶胶遗留。
5)大体积样品应该用单独包装的无菌一次性移液管吸取。
6)管子打开前都要简短离心以减少气溶胶的产生,而且管子不能用力崩开,这样会产生气溶胶。
7)任何时候都应该穿实验服和带手套,手套要经常更换,尤其在抽提过程中每一步之间都要更换。
实验服要专门用于样品准备间,经常清洗。
2、样品准备和RNA-PCRRNA-PCR的额外步骤需要额外的样品操作,这样增加了样品之间污染的机会。
为了避免这一问题,反转录一步可以在样品准备区进行。
在RNA-PCR中应用UNG以防止污染的方法也有报道。
3、前PCR区必须有专门用于准备各种反应的区域,这个区域必须保持干净,而且没有来自克隆和样品准备的污染。
前PCR区必须要有试剂和准备,特别是专门用于前PCR区的正压活塞式移液管。
4、PCR实验室试剂的操作1)所用的所有溶液都应该没有核酸和(或)核酸酶(DNase和RNase)污染。
2)所有PCR试剂中使用的水都应该是高质量的-新鲜蒸馏的去离子水,用μm过滤的,并且是高压灭菌。
3)在20℃到25℃贮存的试剂建议加点像叠氮钠一类的抗微生物剂,在扩增试剂或样品制备试剂中加入%的叠氮钠不抑制扩增反应。
4)所用试剂都应该以大体积配制,实验一下看试剂是否满意,然后分装成仅够一次使用的量进行贮存。
5)所有试剂和样品准备过程中都要使用一次性灭菌的瓶子和管子。
6)新配制的试剂在用于准备新的标本之前应该加以检验。
7)样品准备和前PCR区所使用的移液管在不使用时都应该小心保存。
5、在前PCR区建立PCR混合物1)可以把即刻可用的“主混合物”溶液配好、分装并保存在-20℃或4℃,在实验室只涉及到扩增一种或少数几种特异序列时这样做很有用。
2)如果你的实验室使用多套引物,以致于配制包括所有试剂的单一反应混合物不够经济,可以考虑分装保存够一天的PCR成分。
3)作为一个规则,应该保存一套阴性、弱阳性和强阳性对照样品来分析样品配制和PCR 前过程的效率和洁净程度。
而且,你也希望通过使用一个已知的弱阳性样品来验证你的样品缓冲液以证明里面不含扩增抑制物。
4)阴性样品要与每组样品同时做,以分析是否存在样品与样品之间的污染以及是否存在PCR产物的污染,阴性对照应该包括核酸以外的所有试剂。
5)当做阳性对照时,有两个理由决定了应该使用最少数量的核酸。