基因诊断-2009学习班
“诊断学是基础医学和临床医学的桥梁”的论文
诊断学——基础医学和临床医学的桥梁2009级临床医学班学生:施俊华学号:200912781摘要:诊断学(diagnostics)是应用问诊、体格检查、实验室及辅助检查等方法,进行调查研究,达到正确认识健康与疾病的一门课程。
诊断学是一座连接基础医学与临床医学的桥梁。
是临床医学生过渡到临床工作的基本基础和技能。
因此我们要把诊断学、基础医学与临床医学联系起来,在这里称为“渗透式”学习法。
关键词:诊断学基础医学临床医学渗透式1 基础医学向临床医学渗透,诊断学是桥梁诊断学是一座连接基础医学与临床医学的桥梁。
是临床医学生过渡到临床工作的基本基础和技能,基础医学的重要性也是不言而喻的,对医学生日后的发展起决定性作用。
要培养一名高级临床医师,必须把诊断学、基础医学紧密联系起来,才能为临床医学解决问题。
一个临床医师没有雄厚的基础医学知识,就不能在医疗工作中有所创新,有所开拓,只能知其然,而不知其所以然。
因此,在学习中必须注重诊断学、基础医学同临床医学的联系。
如在讲述生物化学氨基酸分解代谢内容时,介绍了谷氨酸脱羧酶催化谷氨酸脱羧生产γ-氨基丁酸(GABA),GABA是一种大脑神经递质,对中枢神经有抑制作用。
谷氨酸脱羧酶的辅助因子是VitaB6,由此说明VitaB6与临床医学的联系;又进一步解释,指出在应用VitaB6治妊娠呕吐时,有可能造成新生儿抽搐症,这是由于孕妇长期服用VitaB6造成胎儿对VitaB6的需要量增加,出生后出现“戒断现象”,中枢神经的兴奋性增高,容易出现惊吓表现,而在临床上易被误诊为VitaD缺乏症。
这样我们对VitaB6的知识有了更多的认识,为以后的临床知识学习打下了良好的基础。
另外,基础教师和临床教师都必须认识到学科间相互联系的重要性,加强交流。
以水电解质与酸碱平衡为例,生理学、生物化学、病理生理学、外科学都讲,在生物化学课中,我们自觉地联系临床,使学生认识到基础医学与临床医学有如此广泛的联系,并且十分重要。
登革热诊断与实验室检测
特异性
检测时机
登革热不同诊断方法的可操作性和可信性
直接检测
可操作性
间接检测
病毒分离 核酸检测 NS1检测
可信性
IgM检测
IgG检测
登革病毒结构
细胞间病毒(未成熟)
细胞外病毒(成熟)
包膜糖蛋白
前M
(双体) 基质蛋白
核衣壳蛋白 (C蛋白)
登革病毒基因组结构
结构蛋白
非结构蛋白
登革病毒分离
细胞
昆虫细胞: C6/36、AP61 哺乳动物细胞: Vero、BHK21
YF PRNT 80% 减少 DV抗体用捕获法化学发光
接种17D疫苗后黄热和登革抗体
登革病毒感染后的黄热和登革抗体
检测登革病毒IgM抗体的试剂比较
真核rEIII蛋白MacELISA法检测早期登革病人血清
OD Value
3.5
dengue virus patients sera
3.0
hantan virus patients sera
登革分型实时PCR
登革抗体检测方法
检测IgM MacELISA、免疫层析(ICT)
检测IgG 间接法ELISA、GacELISA、IFA、 免疫层析(ICT)
中和试验 特异性高,可以用于分型
登革病人血清和乙脑交叉反应
乙脑、黄热和登革热的抗体交叉反应
登革病人血清和乙脑交叉反应
黄热病毒中和抗体和登革病毒抗体
NS1为50kD的糖蛋白 以300kD的六聚体形式分泌到血液中
DHF患者血清中NS1明显升高 激活补体 血管内皮细胞功能不全 血管通透性增加
NS1抗原特点及其应用
一、分泌性表达,易于检测 二、出现早,发病或发病前即可检出 三、浓度高,可达50 ug/ml 四、持续时间长,初次感染可持续9-12天 五、大量临床应用验证 六、NS1抗体可能用于血清分型 七、再次感染不易检测,在发病5-7天后很少能检出 八、高浓度NS1患者发病较重 九、可检测蚊子中的NS1抗原,用于监测
福建医科大学
────医科大学────一、我校2009年39个专业方案招收硕士研究生600名。
实际招收人数以国家下达的招生规模为准,并结合各专业实际上线人数作适当调整。
二、我校各专业均接收外校推荐免试生,欢送各兄弟院校向我校推荐优秀应届毕业生。
三、考生所提供的材料必须真实,否则一经发现,立即取消其报考资格或录取资格。
四、综合类试题:1、生物综合:细胞生物学、分子生物学、生物化学。
2、口腔综合:口腔科学、口腔颌面外科学、口腔修复学、口腔正畸学、口腔解剖生理学。
3、卫生综合:职业卫生与职业医学、环境卫生学、营养与食品卫生学、流行病学。
4、药学综合:生物化学、分析化学、有机化学。
5、管理综合:管理学根底、行政管理学、组织行为学。
五、带“●〞的学科专业具有博士学位授予权。
研究方向后括号为导师〔按研究方向排序〕,导师相关信息可查阅我校研究生处学位工作中导师队伍介绍。
六、同等学力人员不得跨专业报考,且在报考前须取得英语四级考试合格证书或考试成绩达425分以上,复试时应提供英语四级证书或成绩单复印件及毕业证书复印件,原件交验。
复试时须加试两门大学本科主干课程〔生理学、神经生物学、遗传学、细胞生物学、口腔临床医学专业加试:病理学、免疫学;影像医学与核医学、外科学、妇产科学、眼科学、耳鼻咽喉科学、肿瘤学、麻醉学专业加试:人体解剖学、病理学;生物化学与分子生物学、流行病与卫生统计学、劳动卫生与环境卫生学、营养与食品卫生学、儿少卫生与妇幼保健学、卫生毒理学专业加试:病理学、细胞生物学;社会医学与卫生事业管理加试:卫生法学、全科医学;其余专业加试:生物化学、生理学〕。
七、考生身体安康,符合我校体检要求。
八、目录中所提供的书目为主要参考书目〔除有特殊说明外,均为人民卫生出版〕。
我办一律不代购任何参考书及历年试卷。
九、欢送光临医科大学, .。
未尽事宜请与我校研究生招生办公室联系。
单位代码:10392 地址:省市上街学园路1号邮政编码:350108联系部门:研究生招生办公室:07 联系人:洪霞.. >- -12.. >。
非小细胞肺癌EGFR基因突变检测培训课件
~7%
亚敏感
T790M alone; 20 ins
~3%
不敏感
EGFR检测样本来源
组织活检 (肿瘤蜡片)
目前检测金标准
细胞学标本 (恶性胸水)
样本品质和 肿瘤细胞含量可能比 组织样本较低
Median PFS mo
Tumor (n=106)
9.7
Plasma (n=65)
10.2
Median PFS
ctDNA作为EGFR检测的有效补充
所有突变类型
N=74/106
50/65
22/37
Tumor EGFR mutation-positive
Tumor EGFR mutation-positive Plasma EGFR mutation-positive
血液标本 (ctDNA)
-
当无法获取组织或细胞学样本的晚期转移患者,作需要高敏感度技术
+
+
+
-
-
+
-
-
侵入性
每个病人 都适用
动态检测
对于组织和胸水都取不到的患者,血液样本是一个很好的补充
Pirker R et al. J Thorac Oncol 2010;5:1706–1713; Savic S et al. Br J Cancer 2008; 98:154–160; Rekhtman N et al. J Thorac Oncol 2011;6:451–458; Tanaka T et al. Cancer Sci 2007;98:246–252;
45.8, 53.4
967/995 (97.2)
96.0, 98.1
关注人类的遗传病培训课件
(4)确定是常染色体遗传还是伴X遗传
①在已确定是隐性遗传的系谱中 a.若女患者的父亲和儿子都患病,则为伴X隐性
遗传; b.若女患者的父亲和儿子中有正常的,则为常
染色体隐性遗传。
关注人类的遗传病
22
②在已确定是显性遗传的系谱中 a.若男患者的母亲和女儿都患病,则最可能为
【答案】 C
关注人类的遗传病
34
(2009年高考全国卷Ⅰ)下列关于
人类遗传病的叙述,错误的是
()
A.单基因突变可以导致遗传病
B.染色体结构的改变可以导致遗传病
C.近亲婚配可增加隐形遗传病的发病风险
等。 (2)隐性遗传病:由 ④隐性致病基因 引 起的,如镰刀型细胞贫血症、白化病、先天性聋 哑、苯丙酮尿症等。
关注人类的遗传病
4
2.多基因遗传病:受⑤两对以上的等位基因
控制的人类遗传病。
(1)特点:在群体中发病率比较高,容易受环境影
响。
(见2)病类,型⑥如:原主发要性包高括血一压些、先冠天心性病发、育哮异喘常病和和一青些少常
关注人类的遗传病
12
多基因遗 ① 家族聚集现象 ;② 易受环
相等
传病
境影响 ;③ 群体发病率高
染色体异 往往造成严重后果,甚至胚胎 相等 常遗传病 期引起流产
关注人类的遗传病
13
易 错 警 示 与人类常见遗传病有关的3点提示
(1)家族性疾病不一定是遗传病,如传染病。 (2)大多数遗传病是先天性疾病,但有些遗传病可在个体生长 发育到一定年龄才表现出来,所以,后天性疾病也可能是遗 传病。 (3)携带遗传病基因的个体不一定会患遗传病,如白化病携带 者;不携带遗传病基因的个体也可能患遗传病,如染色体异 常遗传病。
必修二5-3人类遗传病
必修二5-3人类遗传病一、选择题1.人类遗传病种类较多,发病率高。
下列选项中,属于染色体异常遗传病的是() A.抗维生素D佝偻病B.苯丙酮尿症C.猫叫综合征D.多指症答案 C解析猫叫综合征是由5号染色体部分缺失引起的,属于染色体变异。
2.下列关于人类遗传病的叙述,正确的是() A.一个家族仅一代人中出现过的疾病不是遗传病B.一个家族几代人中都出现过的疾病是遗传病C.携带遗传病基因的个体一定患遗传病D.不携带遗传病基因的个体也会患遗传病答案 D3.关于多基因遗传病特点的叙述,错误的是() A.起源于遗传因素和环境因素B.受多对基因控制C.在同胞中发病率高D.在群体中发病率高答案 C解析多基因遗传病在群体中的发病率相对较高,在同胞中发病率相对较低。
4.在下列人类生殖细胞中,哪两种生殖细胞的结合会产生先天愚型的男性患儿()①23A+X②22A+X③21A+Y④22A+YA.①③B.②③C.①④D.②④答案 C解析先天愚型是由于体细胞中多了一条常染色体(第21号染色体是3条),其原因是减数分裂进行时,第21号同源染色体没有分离,形成具有24条染色体的精子或卵细胞。
5.优生,就是让每个家庭生育健康的孩子。
下列与优生无关的措施是() A.适龄结婚,适龄生育B.遵守婚姻法,不近亲结婚C.进行遗传咨询,做好婚前检查D.产前诊断,以确定胎儿性别答案 D解析产前诊断是为了确定胎儿是否患有某种遗传病或先天性疾病,不是为了确定胎儿性别。
该题考查了优生的措施。
6.下列哪项不属于常染色体隐性致病基因引起的() A.白化病B.先天性聋哑C.苯丙酮尿症D.进行性肌营养不良(假肥大型)答案 D解析进行性肌营养不良是X染色体上隐性基因控制的一种遗传病。
7.(2009·广东理基)多基因遗传病是一类在人群中发病率较高的遗传病,下列遗传病属于多基因遗传病的是()①哮喘病②21三体综合征③抗维生素D佝偻病④青少年型糖尿病A.①②B.①④C.②③D.③④答案 B() A.常染色体显性遗传B.X染色体显性遗传C.X染色体隐性遗传D.Y染色体上的遗传答案 D解析从图中可以看出,患者全为男性,而且男性患者的儿子必然患病,因而最可能的遗传方式是伴Y染色体遗传。
嗜铬细胞瘤的诊治
嗜铬细胞瘤:起源于肾上腺髓质产生儿茶酚胺的嗜铬细胞肿 瘤
副神经节瘤:肾上腺外沿交感及副交感神经节分布的嗜铬组 织肿瘤
肾上腺髓质增生:临床表现与嗜铬细胞瘤相似,确诊依靠病 理学检查
高儿茶酚胺血症
副神经节瘤 ( Paragangliomas PGL)
腹主动脉旁(约10%~15%)、肾门、肾上极、肝 门区、肝-下腔静脉之间、胰头部、髂窝或附 近、血管旁(直肠后、卵巢、膀胱内)
MRI
MIBG
诊断PCC的敏感性/特异性分别为 85-88%和 70100%
131I-MIBG具有治疗恶性PPGL的作用 转移性、复发性PPGL、位于颅底和颈部、胸腔、
膀胱PGL,与SDHx基因相关PPGL检出敏感性较低 拟交感神经药、阻断CA转运药物如可卡因和三环
类抗抑郁药、钙同等阻滞剂、α及β肾上腺素能 受体阻滞剂可减少123I-MIBG浓聚,需停药2周
似),若无阳性发现,继以颈部和胸部扫描 儿童也可采用腹部超声 在大多数病例的定位诊断过程中联合使用CT和MR已经足够 MIBG: If CT/MRI negative
Large adrenal tumor paraganglioma PET SRS
良恶性鉴别困难:病理
根据病理切片上的组织形态来判定很困难 瘤细胞的形态异常不能作为良恶性的诊断依据 镜下呈恶性改变,临床却表现为良性 有的瘤细胞呈良性形态,但在术后1~15年内复发 在良、恶性的肿瘤细胞中都可看到重的嗜铬性颗粒、
症状不典型且多变:提高警惕!
传统观念认为:超过一半的患者有高血压发作或危象 实际上:大多数嗜铬细胞瘤是临床上没有料到的(特别是非
内分泌科医师),甚至在与肿瘤相关的致命后果发生时 美国Mayo Clinic尸检:证实的PCC患者中,生前从未被怀疑
基因诊断技术临床应用及研究进展
versil8
malignant
tlllnor8[J].Cancer Res,2004,64(8):2898—
W,et a1.A six—nuchotide insertion—
[6]Sun
with
T,Gao Y,Tan
deletion
polymorphi锄in
究了22种人类乳头瘤病毒的基因型以及其感染与
万方数据
存在bcr/abl融合基因;急性淋巴细胞白血病
因组5 7非编码区(5 7NCR)设计出的特异性探针。 制成基因芯片可以检测丙型肝炎病毒并鉴别基因型 和基因亚型。随着对人类基因组研究的不断深入, 研究者发现一些特定基因的存在或突变使得人体对 某些病毒、细菌等病原体的易感性显著增加,如果 对这类携带特定易感基因的高危人群及早采取预防 措施,或进行直接的医学干预,就可以降低感染 率。基因诊断因具有高度的敏感性和特异性,且简 便、快捷,目前主要在病毒、细菌、支原体、衣原 体、立克次体及寄生虫感染的早期诊断中得到了广 泛应用。 综上所述,人类的一切疾病都与基因受损有 关。因为凭借人体基因密码可以预测相关疾病的风 险性,做到早检测、早预防、早治疗,所以科学家 们越来越重视在后基因组时代如何发展和利用基因
J O bstet C.ynecol,2003,188
a1.PCR assay for the inversion
(1):56. [13]Livache
oil
瑚嘣I唔sevel-e
Hemophilia A and its
application[J].Chin
T,Fouque
B,Ro时A,et
a1.Polyyrrole DNA chip
[3]梁晶.大肠癌早期基因诊断研究的现状与展望[J]. 2009,32(1):76—78. [4]Ueki
生物化学及分子生物学(人卫第九版)-26基因诊断与基因治疗
基因诊断与基因治疗
作者 : 李存保 单位 : 内蒙古医科大学
目录
第一节 基因诊断
第二节 基因治疗
重点难点
掌握
基因诊断与基因治疗的概念
熟悉
基因诊断技术、基因治疗的基本策略和基本程序
了解
基因诊断和基因治疗在医学中的应用
第1节
基因诊断
一、基因诊断的概念与特点
(1) 基因诊断的概念:
是指利用分子生物学技术和方法直接检测基因结构及其表达水平是否正常,从而 对疾病作出诊断的方法。
(2)直接体内疗法
临床上可用于基因诊断的样品有血液、组织块、羊水和绒毛、精液、毛发、唾液 和尿液等。
三、基因诊断的基本技术
(一)核酸分子杂交技术
1. Southern 印迹法 其可以区分正常和突变样品的基因型,并可获得基因缺失或插入片段大小等信息。 DNA印迹一般可以显示50 bp~20 kbp的DNA片段,片段大小的信息是该技术诊断基因缺 陷的重要依据。 2. Northern 印迹法 Northern印迹法(Northern blot)能够对组织或细胞的总RNA或mRNA进行定性 或定量分析,及基因表达分析。Northern印迹杂交对样品RNA纯度要求非常高,限制了 该技术在临床诊断中的应用。
是以改变人遗传物质为基础的生物医学治疗,即通过一定方式将人 正常基因或有治疗作用的DNA片段导入人体靶细胞以矫正或置换致病基因 的治疗方法。它针对的是疾病的根源,即异常的基因本身。
一、基因治疗的基本策略
(一)缺陷基因精确的原位修复
1.基因矫正 gene correction 致病基因的突变碱基进行纠正 2.基因置换 gene replacement 用正常基因通过重组原位替换致病基因 这两种方法属于对缺陷基因精确的原位修复,既不破坏整个基因组的结构,又可达到治 疗疾病的目的,是最为理想的治疗方法。
地中海贫血基因检测和结果分析
12 种见于中国人群的 2/ 1珠蛋白基因点突变
显性突变
5’
EXON 1 IVS 1
EXON 2
IVS 2 EXON 3
3’
启动子突变 异常剪接 起始密码突变 移码突变 无义突变 3’UTR突变
46 种见于中国南方人群的-珠蛋白基因点突变
中国南方人群最为常见的地贫类型
地贫基因分析诊断报告单( alpha 地贫)
新修改的报告单
α珠蛋白基因缺失和发生的三联体基因座的分子机制
四、最新的地中海贫血检测方法
4、DHPLC(变性高效液相色谱)
用于缺失型和突变型地贫都可以
李倩,南方医科大学论文,2010
四、最新的地中海贫血检测方法
5、基因序列测定(PCR+毛细管电泳)
用于未知突变位点或确定缺失片段的位置 由于仪器比较贵重,技术要求高,目前尚未在临床一线 推广,只在科研实验室里开展。
9.3~16.7 72~90
—
缺 失
Gγ Aγ -HPFH 东南亚 型
29.7±0.5
型
-
Aγ -HPFH 196(C→
Aγ
T)
14.1~ 27.0
14.3~ 20.9
57~63
越南、柬埔 寨人
81~95 意大利人
Gγ Aγ δ β 地贫
29(A→G
)
β
22.3
40
—
世界地中海贫血的流行分布
广西地中海贫血的流行分布
Azam Amirian MSc, et al. Archives of Iranian Medicine. 2011
四、最新的地中海贫血检测方法
6、母体血浆中胎儿游离核酸的测定
山东省继续医学教育委员会关于公布2009年我省第一批国家级省级继续医学教育项目的通知
山东省继续医学教育委员会关于公布2009年我省第一批国家级省级继续医学教育项目的通知文章属性•【制定机关】山东省继续医学教育委员会•【公布日期】2009.01.19•【字号】鲁继医教委发[2009]1号•【施行日期】2009.01.19•【效力等级】地方规范性文件•【时效性】现行有效•【主题分类】教育综合规定正文山东省继续医学教育委员会关于公布2009年我省第一批国家级省级继续医学教育项目的通知(鲁继医教委发〔2009〕1号)各市卫生局及继续医学教育委员会,省(部)属有关医疗卫生单位:2009年第一批国家级、省级继续医学教育项目评审工作已经结束,经全国继续医学教育委员会审定,我省共有77个项目获准为 2009年第一批国家级继续医学教育项目;经省继续医学教育委员会审核批准460个项目(其中备案项目176个)为2009年省级继续医学教育项目,现予公布(详见附件,同时在“山东卫生教育网”上公布,网址:)。
本文件及网上所公布项目均可作为各地各单位继续医学教育管理部门进行项目管理、学分审核的依据。
为加强继续医学教育项目的管理,各项目举办单位要严格按照卫生部及我省有关规定,认真做好项目的执行与管理工作,确保项目质量。
项目执行过程中不得随意更改项目编号、名称、学时、学分,不得随意增删项目内容,如有违反,将视情节轻重给予相应处理。
省继续医学教育委员会办公室委托省继续医学教育中心具体负责我省国家级、省级继续医学教育项目的日常管理、监督检查和质量监控工作。
项目举办前,各项目主办单位应将办班通知、日程安排及教材或讲义送省继续医学教育中心审核,并办理国家级、省级《继续医学教育项目学分证书》领购事宜。
为加强管理、搞好服务,经审核符合要求的,中心可免费在“山东卫生教育网”上发布项目举办通知。
各单位要在项目举办结束后一个月内将举办项目的通知、日程安排、教材、项目备案表、项目执行情况汇报表、学员备案表、总结、考试样题及学员原始答卷报送省继续医学教育中心,以上材料除学员原始答卷外须提供书面和电子版两种形式。
湖北省卫生厅关于公布2009年第一批省级继续医学教育项目的通知
湖北省卫生厅关于公布2009年第一批省级继续医学教
育项目的通知
文章属性
•【制定机关】湖北省卫生厅
•【公布日期】2009.03.16
•【字号】
•【施行日期】2009.03.16
•【效力等级】地方规范性文件
•【时效性】现行有效
•【主题分类】卫生医药、计划生育综合规定
正文
湖北省卫生厅关于公布2009年第一批省级继续医学教育项目
的通知
各市、州、县卫生局,有关医疗卫生单位,高等医学院校:
经省继续医学教育委员会学科组评审,省继续医学教育委员会确定551个项目获准为2009年第一批省级继续医学教育项目(其中备案项目118项),现将项目予以公布。
并可在湖北省卫生厅网站()和湖北省医学会网站()查询。
未获批准项目原因在省级CME项目网上申报及信息反馈系统中公布。
各主办单位要严格按照相关规定,自觉接受省级继续医学教育委员会的监管,认真组织实施承办的继续医学教育项目。
主办单位应在项目举办2周前将办班通知、日程等相关资料报省级继续医学教育委员会办公室备案,并及时将项目完成情况和有关资料报湖北省医学会继续教育部。
附件:2009年第一批省级继续医学教育项目
二○○九年三月十六日附件:2009年第一批省级继续医学教育项目。
人教版高二生物选修2精品导学案:第1章生物科学与健康第2节基因诊断与基因治疗
第2节基因诊断与基因治疗1.说出基因诊断的基本含义和基本原理。
2.描述基因诊断在恶性肿瘤早期诊断中的突出作用。
3.简述基因芯片的基本含义及在生物医学方面的应用。
4.说出基因治疗的基本含义、基本步骤、优点及其前景。
一、基因诊断技术的原理1.引起人类疾病的原因一类是由入侵病原微生物____________引起的;另一类是人类自身的遗传物质__________而引起的。
2.基因诊断指用______________(如32P)、荧光分子等标记的____________做探针,利用________________原理,鉴定被检测样本上的__________,从而达到检测疾病的目的。
3.基因诊断的过程构建__________→获得待测组织____________→对待测单链DNA分子进行________技术扩增,将扩增获得的DNA热处理得到大量的DNA单链→将待测DNA转移到含__________的尼龙膜上→将____________与尼龙膜上的DNA探针进行杂交,如果尼龙膜上含有突变基因,就会形成特定颜色的________。
4.基因诊断的特点既客观又______。
思考:用基因诊断技术可检测哪些疾病?二、神奇的基因芯片1.基因芯片是将大量特定序列的____________(探针)有序地固定在尼龙膜、玻片或硅片上,从而能大量、快速、平行地对DNA分子的__________进行测定和定量分析。
基因芯片实际上是一种高密度的____________。
2.基因芯片的应用举例(1)发现疾病的__________。
(2)用于________的检测。
(3)基因芯片技术与医学行为的改变。
①基因芯片不仅能做到______、______地诊断疾病,还可指导医生针对不同患者的基因活动特点,使用不同的治疗方法,进行________的治疗。
②基因芯片技术还有助于发现不同个体对疾病________的差异。
思考:如果将来把每个人的基因都做成基因芯片,你设想一下,会有什么作用?三、初露曙光的基因治疗1.基因治疗就是把特定的__________导入有__________的细胞中,从而达到治疗疾病的目的。
基因诊断与性传播疾病课件模板-020(共30)
《基因诊断与性传播疾病》:第七节 实验室检查
第七节 实验室检查:
Manos等设计的HPVL1通用引物 MY11:GCMCAGGGWCATAAYAATGG MY09:CGTCCMARRGGAWACTGATC 表1 HPV型MY11的第1个硷基位置MY09的第1个 硷基位置PCR产物长度(bp) 667227170448116707715544816658470354 5118655870124543365396987448 M=A+C, R=A+G,W=A+T,Y= C+T 表2列述了Manos等设计的寡核苷酸探针。
《基因诊断与性传播疾病》:第六节 临床表现
第六节 临床表现:
男性患者好发于包皮系带、冠状沟、包皮、 尿道、阴茎、肛门周围和阴囊。病初为淡 红或污红色粟状大小赘生物,性质柔软, 顶端稍尖,逐渐长大或增多。可发展成乳 头状或囊状,基底稍宽或有带,表面有颗 粒。在肛门部常增大,状如菜花,表面湿 润或有出血,在颗粒间常积存有脓液,散 发恶臭气味,搔抓后可继发感染。
《基因诊断与性传播疾病》:第七节 实验室检查
第七节 实验室检查:
3。PCR扩增方法和程序:以100μlPCR反 应液,用无菌0.5ml硅化塑料离心管为反应 管进行扩增反应。 (1)实验前配制预混反应试剂并分装。 预混反应试剂包括除标本DNA外的其它各 种PCR反应试剂。每支反应管中含有的PCR 反应试剂见表3。 表3每支反应管中的PCR反应试剂 反应试剂体积(μl)终浓度10×PCR缓冲 液101×PCR缓冲液dNTP贮备液 2200μmol/L每种dNTPMY11贮备液
《基因诊断与性传播疾病》:第七节 实验室检查
第七节 实验室检查:
在作细胞学检查的同时,将标本放入5ml 含有0.05%硫柳汞的PBS中,用PBS离心 (3000g,10min)洗涤2次,沉积细胞重 悬于1mlPBS中,取0.5ml细胞悬液抽提DNA。 2。标本核酸的提取:按1体积细胞悬液加 10倍体积的细胞裂解液(10mmol/l TrisHCl,pH 7.4,10mmol/L EDTA, 150mmol/L NaCl,0.4%SDS,1.0mg/ml蛋 白酶K)37℃下处理过夜;且等体积酚/氯 仿(1:1),氯仿/异戊醇(24:1)各抽提2 次;加1/10体积3mol/l NaAc(pH5.2)及
胎儿血fⅧ:c结合基因检测在甲型血友病产前诊断中的临床应用
山东大学硕士学位论文胎儿血FⅧ:C结合基因检测在甲型血友病产前诊断中的临床应用姓名:***申请学位级别:硕士专业:妇产科学指导教师:***20090518胎儿血FⅧ:C结合基因检测在甲型血友病产前诊断中的临床应用作者:张燕学位授予单位:山东大学1.期刊论文赵耘.梁燕.王战勇.肖白.ZHAO Yun.LIANG Yan.WANG Zhan-yong.XIAO Bai胎儿甲型血友病的基因诊断-中华妇产科杂志2008,43(4)目的 探讨胎儿甲型血友病的产前基因诊断方法的临床应用价值.方法 2002年1月至2006年12月对北京朝阳医院妇产科19个甲型血友病家系进行基因携带者检测,应用长距离PCR(LD-PCR)技术检测其凝血因子Ⅷ(FⅧ)内含子22倒位情况,出现倒位者直接行脐静脉穿刺抽取脐带血进行胎儿血友病基因的产前诊断;非倒位者则联合应用多位点基因连锁分析技术先对携带者进行筛查,而后进行胎儿血友病基因的产前诊断.同时进行胎儿脐带血FⅧ水平的检测.结果 (1)对19例孕妇的22次妊娠的胎儿进行了产前诊断,平均脐静脉穿刺孕周为23周(17~34周),所有穿刺均获成功,无穿刺导致的胎儿丢失.(2)19个甲型血友病家系中,有14个家系检测出内含子22倒位,对其16次妊娠胎儿行产前甲型血友病基因诊断,其中10例胎儿诊断为甲型血友病;6例诊断为正常胎儿.(3)多位点基因连锁分析技术产前诊断甲型血友病胎儿6例,其中包括1例孕妇先后2次妊娠甲型血友病胎儿.(4)22例胎儿中有16例进行了FⅧ水平检测(未行检测的6例为孕周低于20周或因经济原因患者家属拒绝),FⅧ水平在0~198%之间,有11例胎儿FⅧ水平<10%,其中除1例FⅧ水平为2%,诊断为正常胎儿并随访1年FⅧ水平正常外,其余10例胎儿均诊断为甲型血友病.结论 应用LD-PCR和多位点基因连锁分析技术可以快速有效地进行甲型血友病携带者的确认;胎儿脐带血FⅧ水平的检测有助于初步诊断,但确诊胎儿是否患病仍须有基因诊断结果.2.期刊论文綦凌燕.金春莲.林长坤.任梅红.董文翰.孙开来.QI Ling-yan.JIN Chun-lian.LIN Chang-kun.RENMei-hong.DONG Wen-han.SUN Kai-lai F8基因倒位检测及其在甲型血友病基因诊断中的应用-中华医学遗传学杂志2007,24(4)目的 建立F8基因第22内含子倒位突变检测新方法,应用于甲型血友病(hemophilia A)基因诊断.方法 应用长距离PCR(long distance-polymerase chain reaction,LD-PCR)、倒位PCR (inversion -PCR,I-PCR)技术检测31例甲型血友病患者F8基因22内含子倒位;对于倒位突变阳性患者的母亲应用上述两种方法进行携带者诊断;而对倒位携带者孕妇于孕中期抽取羊水,进行产前基因诊断. 结果 31例甲型血友病患者中查出7例存在倒位突变;4例倒位突变阳性患者的母亲有3例为倒位携带者;对1例倒位携带者孕妇进行了产前诊断,确定其胎儿无倒位突变.结论 LD-PCR、I-PCR技术可快速检测F8基因22内含子倒位突变,可应用于患者及携带者基因诊断;I-PCR可用于F8基因22内含子倒位的产前基因诊断.3.期刊论文张燕.王谢桐.李红燕.张雪芹.ZHANG Yan.WANG Xie-tong.LI Hong-yan.ZHANG Xue-qin胎儿脐静脉血凝血因子Ⅷ活性检测联合基因测序在甲型血友病产前诊断中的应用-中华围产医学杂志2010,13(5)目的 探讨应用胎儿脐静脉血凝血因子Ⅷ活性(coagulation factor Ⅷ activity,F Ⅷ:C)检测结合基因诊断对甲型血友病高危胎儿进行产前诊断的临床可行性. 方法对1996年10月至2008年10月的79例妊娠20~35周的甲型血友病高危且为男胎的孕妇,经腹B超引导下行胎儿脐静脉穿刺取血术.应用一期法和酶联免疫吸附法分别测定FⅧ:C及vWF抗原(von Willebrand factor antigen,vWF:Ag),对近1年来FⅧ:C<10%的胎儿血(6例)采用长片段聚合酶链反应(long distance polymerase chain reaction,LD-PCR)检测内含子22倒位,对倒位阳性胎儿的孕母应用LD-PCR检测倒位携带者;对非倒位阳性胎儿及其孕母应用基因测序方法检测基因突变位点. 结果 79例孕妇血FⅧ:C为52%~139%,平均(99.60±28.10)%.胎儿血FⅧ:C<10%者23例,平均(2.64±1.92)%,均引产;其中8例胎儿血FⅧ:C<1%,15例胎儿血FⅧ:C>1%.胎儿血FⅧ:C 10%~30%者12例,平均(19.78±6.71)%,5例引产,7例继续妊娠.44例胎儿血FⅧ:C>30%,平均(58.60±12.12)%,继续妊娠,所有51例未引产者生后随访至今尚未发现子代异常.在行基因诊断的6例(胎儿血FⅧ:C<10%)中,内含子22倒位2例,另4例胎儿血基因测序尚未找到突变位点.结论 应用胎儿血FⅧ:C及vWF:Ag浓度测定可以对甲型血友病高危孕妇进行产前诊断,结合LD-PCR技术可准确的对甲型血友病内含子22倒位者进行产前诊断及携带者诊断,但基因测序检测突变位点仍需要进一步研究.4.期刊论文王修海.王培林.杜嗣廉.苏爱.王兰.徐健甲型血友病携带者的PCR-RFLP检测-青岛医学院学报1999,35(3)①目的探讨甲型血友病携带者的基因诊断方法.②方法应用聚合酶链反应(PCR)结合限制性酶切片段长度多态(RFLP)分析技术,对5个甲型血友病家系的29名成员进行了FⅧ基因外显子18和内含子22两个多态位点的扩增片段限制酶切长度多态性连锁分析.并对其中的1个家系进行了产前基因诊断.③结果5个家系中有5名女性被确定为携带者,1个家系的男性胎儿被确定为病人.④结论 PCR-RFLP方法可对多数甲型血友病进行基因诊断.5.学位论文陈淑芬甲型血友病基因诊断及产前基因诊断的研究2009目的:建立利用DHPLC技术筛查非倒位患者14外显子点突变的方法来提高甲型血友病的基因诊断及产前基因诊断率,防止新患儿出生、降低该病发病率,减轻家庭和社会负担,对优生优育有深远意义。
武汉马凡氏综合征基因诊断
武汉马凡氏综合征基因诊断武汉马凡氏综合征基因诊断引言马凡氏综合征(Marfan syndrome,MFS)是一种常见的遗传性结缔组织疾病,以系统性、进展性的韧带骨骼和肌肉疾患为特征。
MFS主要由纤维连接蛋白FBN1(Fibrillin-1)基因突变所引起,表现为身材高大、四肢异常细长、关节过度活动、眼部异常、心血管异常等多种症状。
一、马凡氏综合征基因FBN1的发现与功能1.1 FBN1基因的发现1986年,Jacques et al.首次发现了FBN1基因。
该基因位于15号染色体上,全长约为235 kb,包含65个外显子和64个内含子,编码一种大约为350 kDa的蛋白——纤维连接蛋白1(Fibrillin-1)。
1.2 FBN1蛋白的功能Fibrillin-1蛋白主要存在于体内的胶原纤维中,是结缔组织最主要的组成部分之一。
Fibrillin-1蛋白通过封闭残缺而形成的微纤维,为弹性纤维提供了支持,并在弹性纤维和胶原纤维的交界处稳定结合。
此外,Fibrillin-1还能与其他细胞外基质蛋白相互作用,参与信号传导和细胞外基质的形成。
二、马凡氏综合征基因突变与病理机制2.1 FBN1基因突变的类型FBN1基因突变主要包括错义突变、无义突变、剪切突变和删除/插入突变,其中最常见的是错义突变。
2.2 突变导致的FBN1蛋白结构异常突变引起的FBN1蛋白结构异常,破坏了其稳定性和功能,导致纤维连接蛋白含量的减少,使结缔组织中的微纤维不能正确形成和组织,进而引起马凡氏综合征的各种症状。
2.3 FBN1基因突变的遗传方式马凡氏综合征呈常染色体显性遗传,患者的一个健康父母常有50%的概率将马凡氏综合征突变基因遗传给子代。
三、马凡氏综合征的临床表现及诊断3.1 骨骼肌肉系统马凡氏综合征患者常表现为身材高大、四肢异常细长、关节过度活动、驼背、胸骨凸出、关节软骨钙化等。
3.2 心血管系统马凡氏综合征患者常合并心血管异常,如主动脉根部扩张、二尖瓣脱垂、乳头肌脱离、主动脉瘤等。
基因检测在精准医疗中的应用
目录
1 基因检测相关背景和国家政策
2 检验科已开展的基因检测项目介绍 3 其他基因检测项目的临床应用
精准医疗
个体化医学
2016年度 “精准医学研究”
重点专项
精准医学
高地行动计划 31611工程
6个科技创新品台
个体化医学 精准医学
精准医学的两个方面
CFDA监测网络收到药品 不良反应/事件报告呈上升趋势
ApoE基因分型检测
E4型
易患疾病:老年痴呆,冠心病,脑梗塞、视网膜色素变性 血脂表现:甘油三脂不高,LDH-C高;HDL低,载脂蛋白E
浓度:最低 保健饮食:
低脂饮食最好,忌鱼油;忌饮酒
宜用降脂药物(与E2相反):普罗布考,辛伐他汀
不能用降脂药物:阿托伐他汀,普伐他汀, 洛伐他汀
MTHFR(亚甲基四氢叶酸还原酶基因)
MTHFR 基因检测指导孕妇个体化的叶酸补充方案
《妇幼保健医疗临床遗传检测项目资料汇编》,第六卷.临床应用指南之二十一《叶酸 利用能力》
Septin 9基因甲基化检测---大肠癌筛查
结直肠癌诊断方法现状
人群筛查
便潜血检测
CEA检测
有/无症状的适龄就诊、
无症状适龄人
体检人群
群
危险分层
结直肠癌筛查风
指导华法林用药
消旋混合物,由同分异构体 R型和S型构成
S-华法林的活性为R-华法林的3
倍以上。
S-华法林主要由CYP2C9代谢, 其代谢产物仅有微弱的抗凝作用。
华法林主要是抑制维生素环氧化 物还原酶复合体(VKORC1), 阻碍外源性凝血因子的合成而发 挥抗凝作用。
其他基因检测项目的临床应用
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301医院基础所分子生物室 司艺玲 2009.7
目前临床疾病的诊断方法
临床诊断 血清免疫学诊断 生化学诊断 基因诊断
从基因水平提供更早期、更加准确的诊断依据
概 述
几乎所有的疾病均在一定程度上与基因有某种联系,
基因的改变,或是疾病发生的原因,或是疾病发生 的结果,或是疾病发生时的伴随现象,而这些现象 的出现是有规律的。因此,可以通过检测基因的改 变来反映疾病的发生和发展,疗效和预后。 基因诊断:是以DNA或RNA为诊断材料,通过检查 基因的存在、缺陷或表达异常,对人体状态和疾病 作出诊断的方法和过程。
双链DNA
待检核酸滤膜 固定化
变性 单链DNA
预 杂 交
探针标记
DNA结合到膜上 膜
杂 交
加入标记 核酸探针
预杂交后,同标记 DNA探针(-)温育 互补DNA 杂交 洗涤去除未参与 杂交的标记探针
去除未参与杂 交的标记探针
检测杂交信号
固相载体: 尼龙膜、硝酸纤 维素膜、磁珠、 微量滴定板
检测杂交信号
特点
特异性强、灵敏度高、操作简便、省时 对待检材料质量要求低
㈠ PCR过程
由DNA模板变性、模板与引物结合(退
火)、引物延伸3个步骤组成的不断重复过 程。每次重复的3个步骤称为1个周期。
步骤转换通过
温度转换来控 制。
在自动化热循
延伸 74℃
变性 94℃
环仪上实施。
退火 50℃
㈡ PCR反应体系
126 bp
四、 PCR相关技术
经典PCR 反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR) 套式PCR(nested primers-PCR,RT-PCR) 多重PCR PCR-RFLP (PCR-restriction fragment length polymorphism ) PCR-单链构象多态性分析(PCR-single strand conformation
标 记 杂 交 带
由凝胶上掀取结合了 DNA的尼龙膜 凝胶
放射自显影观察到标记 DNA探针与互补的DNA 杂交带
标记DNA探针与 分离的DNA杂交 密封杂交袋
缓冲液中标记 DNA探针
Northern印迹杂交 与Southern印迹杂交不同的是,它的检测靶物是RNA, 将RNA样本通过变性琼脂糖凝胶电泳进行分离。 操作程序 与Southern印迹杂交基本一致。 操作中必须防止RNA降解,所用器皿、工具及反应 体系要经无RNA酶化处理。 用途 将杂交的mRNA分子在电泳中的迁移位置与标准分子 量分子进行比较,即可知道特定基因转录的mRNA 分子的大小;对杂交信号强弱的比较,可评估其表 达强度。
随机引物延伸法
随机引物 通常为6个寡 聚核苷酸片段,含有各 种可能排列顺序,可与 任意核酸序列杂交,起 到聚合酶引物的作用。
加随机引物, 变性、复性
DNA聚合酶Klenow片段
32P
32P
32P
5′
3′
TCGACGTAACG AGCTGCATTGC
3′ 5′
三、核酸分子杂交检测流程
待检核酸制备 制备探针 核酸片段
酶切DNA 片段溶液
凝胶
铂丝电极 缓冲液
通电、电泳
-电极 +电极
取出凝胶溴化 乙锭染色,紫 外检测仪下拍 照。
重物 吸水纸
玻璃板
未标记酶 切DNA 变性处理 已知分子大小 标记DNA 尼龙膜 含DNA的 琼脂 糖凝胶 容器
滤纸
滤纸
琼脂糖 凝胶
两端浸于转移 液中的滤纸 搭于容器上 的核璃板 转移液
标记 的标 准物 位置
四、杂交信号检测
放射自显影
通过X线片检测放射性核素探针杂交信号。
非放射性探针的检测
通过酶促显色或荧光、发光反应来显示; 酶促显色法; 需经偶联和显色二步反应进行检测。
地高辛标记探针杂交信号检测
作用底物:
5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸 (BCIP) 硝基蓝四氮唑(NBT)
五、核酸分子杂交相关方法
基因诊断的基本概念
是从决定表型的主宰因素,即基因水平(基因结构及其表达
功能)对 人体状态和疾病做出诊断。
分子遗传学中心法规 ( 遗传信息的流向)
逆向遗传学
亚细胞结构
细胞
组织或 器官
系统
有机体
表 型 形 成
检测靶物
DNA 探查基因结构; 甲基化分析 mRNA 在基因转录水平分析其表达功能 DNA甲基化:DNA胞嘧啶(C)的第五位碳原子加上甲基(mC) CpG二联体
abl-RT
探针: P ,位于bcr与abl结合点两侧序列
溴化乙锭染色琼脂 糖凝胶,紫外检测 仪下观察拍照
Southern 印迹杂交
3. 多重PCR
PCR 反应中通常只有一对引物,而多重PCR则是用几对 引物在同一个PCR反应体系中进行扩增,可以同时扩增
出几个不同专一靶区域片段。 用途 无明显突变热点的遗传疾病诊断,筛查感染疾病病原 体等。 视网膜毋细胞瘤RB1基因微小缺失检测突变型RB1基
继续热循环
RT-PCR的各种方法
用套式PCR检测慢性粒细胞白血病bcr-abl融合 基因mRNA序列
90%~95%的慢性粒细胞
正常染色体 易位染色体
白血病(CML)病人9号和22号 染色体长臂远端的一部分 发生相互易位。9号染色体 abl原癌基因易位到22号染 色体bcr基因断裂点集簇区 上,形成载短22号染色体 (Ph染色体),产生bcr-abl融 合基因。bcr-abl mRNA是 CML持有的分子标志 .
限制性酶切分析法
设计的引物,使扩增片段 包括某一种或数个限制酶识 别序列,PCR反应后用限制 酶消化扩增产物,电泳检测 酶切片段长度的变化。
限制性核酸内切酶 (restyiction endonuclease)
是一类能识别双链DNA分子中特异核苷酸序列的DNA水解酶。
几种限制性核酸内切酶
酶
Eco RⅠ
+
一、 探针的特征及种类
核酸探针(probe) 是一段与被检测的核苷酸序列(靶 基因顺列)互补的带标记的核苷酸片段;工作探针应 是单链,应具有高度持异性、敏感性和稳定性。 探针的种类 根据核酸分子探针的来源及性质,可分为: ① 基因组DNA探针 可选自克隆化的各种基因酸片段; ④ RNA探针 以mRNA作为探针,单链、易降解。
polymorphism,PCR-SSCP)
原位-PCR (in situ PCR,ISPCR)
⒈ RT-PCR
以RNA为起始材料(被检物),经逆转录反应产生 cDNA,再以cDNA为模板进行PCR扩增而检测基因 转录产物,分析基因表达异常。
2. 套式PCR
该法要设计“外”、“内”两对引物。在实施 PCR中,首先以外引物进行第一次扩增反应,扩 增靶基因中较大区域片段,然后用内引物对获得 的扩增产物再扩增其内小区域片段。经两次连续 放大,提高了PCR检测灵敏度和特异性。
通过限制性片段长度多态性性(RFLP)分析等进 行
第二阶段:应用PCR技术 第三阶段:应用基因芯片技术
第一阶段:20世纪80年代,以DNA分子杂交为基础,
核酸分子杂交
核酸分子杂交
是依据DNA双链碱基互补、 变性和复性原理,用已知 碱基序列的单链核苷酸片 段作为探针检测样本中是 否存在与其互补的同源核 酸序列的方法。
聚合酶链反应技术
◎聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)
定义
这是一种在体外由引物(primers)介导的DNA序列 酶促合成反应,又称基因扩增技术。 耐热DNA聚合酶 TaqDNA聚合酶由嗜热水生菌(Thermus aquaticus, Taq)YT-1菌株中分离提取的。
因是视网膜母细胞瘤的易感基因。 视网膜母细胞瘤有遗传型、及散发型。RB1基因在该肿 瘤可发生各种缺失、插入和点突变,分布于27个外显子 ,未发现热点突变。
检测流程 提取全血基因组
DNA
突变PCR产物序列分析
病例 突 变 位 点
外显子
16
序 列
Asn480 Wt AATGACAACATTTTT mut AATGACATTTTT
密码子的第3位。
引物5′端 引物之间 引物自身
可被修饰:加酶切位点、标记生物素等
不应互补,尤应避免3′端的互补 不应存在互补序列
三、 PCR扩增产物分析
凝胶电泳分析法 通过凝胶电泳检测扩增产物片段大小,若特异扩 增出一条带,该法即可判断结果。
注意平行对照: DNA分子量标准物 阳性对照 阴性对照 内参照
斑点杂交,也称
点杂交 (dot blot hybridization) 将DNA变性后直接点样 吸附于硝酸纤维素膜 上,然后用标记探针 与之杂交。
Southern 印迹杂交法
Southern印迹是指将电泳分离的DNA片段转移到某种固 相支持物上的过程。 用途 基因突变分析、 限制性片段长度 多态性分析等。 操作流程 如图所示
二、 探针标记
标记物 放射性核素:32P、35S
非放射性标记物: 地高辛(Dig)、生物素、荧光素
标记方法 通常采用酶促标记法
将标记物预先标记在某种单核苷酸分子上,利用酶促聚合 反 应将其掺入到待标记的核酸中,或将核苷酸分子上的标记基团 交换到核酸分子上。 切口平移法 随机引物延伸法 PCR法 末端标记法
预测性遗传筛查,可预防和阻止各种严重的遗传性或先天
性疾病的发生,对推动人口优生优育中有重大意义。
对分析某些重大传染性流行病病原体的优势流行株、新毒
株的地域来源、病原体进化过程的规律,有独特优势。