柳蘑生物学特性及ITS序列分析
柳松茸“陕As-018”生物学特性研究
1 2 1 母 种 培养基 采 用综 合 P ) . . IA培 养基 。
1 2 2 碳 源 测 定 基 础 培 养 基 蛋 白胨 0 5 , . . .
KH2 O1 . , g O . 5 , . 0mg 1琼 P 1 M S 0 0 VB 1 / , 0
摘 要 : 柳 松 茸“ As 1 ” 生 物 学 特性 进 行 了初 步 研 究 。 比 较 了 不 同 温 度 、 H 值 、 齐基 含 水 量 、 对 陕 一0 8 的 p 培 碳
源 、 源条 件 下 茵 丝 生 长 情 况 。试 验 结 果表 明 : 松 茸 “ As 0 8 菌 丝 生 长 最 适 温度 为 2 , 适 p 值 为 氮 柳 陕 一 1” 5C 最 H
陕
农
业
科
学
柳 松 茸 “ As " 物 学 特性 研 究 陕 一0 生 1 8
雷 萍 , 文 隽 吴 亚 召 张 , ,孙 小 娟 。 刘 博 文 , , 黎 涛 。 (. 西 省 微 生 物研 究 所 , 西 西 安 1陕 陕 7 0 4 ;. 西 三 原 玉 圆食 用 菌 专 业 合 作 社 , 西 三 原 7 0 ) 10 3 2 陕 陕 l 8 0 3
温培养 7d 以平板 培 养基 卜 落直 径作 为菌丝 生 , 菌 长量 的指标 。实 验重复 5次 , 其菌落 直径 的平 均 取 值, 比较菌 丝生长情况 , 选择菌 丝最适 p 值 。 H
1 3 3 菌丝 对培 养 基含 水量 的 选择 试验 收 烘 . . 干 的栽培 料 ( 料均 在 6 ℃下 烘 干 至衡 重 ) 分 圳 原 O , 按 培 养 基 含 水 量 5 、 5 、 O 、 5 、 O 、 O 5 6 6 7 7 配 料 , 入 3 i×2 0II 试 管 。每 h 5 装 0mr 1 0 11  ̄i 弋 管 装入 干料 2 , 0g 每组 巾 l 0个试 管 组成 , f 松 将 9 l J 茸 “ As 0 8 菌 种 接 人 制 备 好 的 酞 僻 【 , - 陕 一 1” } 。 l 2 5 C下 恒温 培养 7d 进 行菌 丝生 长情 况测 定 ,
ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中的应用
2 ITS 在真菌分子检测中的应用
目前 , 关于真菌分子检测的研究主要是针对致病真菌进 行的。 传统病原真菌的检测主要基于形态学特征 、致病性测定 等。 但是这种方法耗时长、程序繁琐,不宜从发病初期的植株中 分离鉴定病原菌,难以做到对病害的早期检测 。 随着生物学的 发展,很多生物技术应用于检测领域 ,如酶联免疫荧光技术。 但 是该方法利用多克隆抗体进行检测 ,特异性不强 ,实际应用中 存在漏检现象[22]。 近年来 ,利用 PCR 扩增病原真菌核糖体 ITS 基因片段进行病原菌检测得到了很大发展 。 由于核糖体基因
统发育研究上。 在国内,虽然起步较晚,但在西瓜炭疽病菌[15-16]、 辣椒疫病菌 [17]、大丽轮枝菌 [18]等植物病原菌的系统发育研究上 已取得较大的进展 。
[19]
3
前景与展望 利用 ITS 序列对真菌进阔的应用前景 。 ITS 区域在不同 菌株间存在丰富的变异 。 对 ITS 区进行序列分析不仅丰富了真 核生物核糖体基因 ITS 的序列信息 ,为病原菌的分类鉴定及系 统发育等研究提供了十分重要的依据 ,而且为建立病原菌的分 子监测与疫病的快速诊断技术奠定了基础 ,对植物病害的防治 具有一定意义 。 随着科学家的研究深入 ,对真菌的 ITS 分子检 测已经应用到动物致病菌的范围 。彭慧等[28]采用 PCR-RFLP 方 法对因眼外伤摘除的眼球活组织中培养分离出的一株形态特 异的尖端赛多孢子菌的 ITS 序列进行了分析 。 结果发现 ,形态 特异的尖端赛多孢子菌与标准株及其他同种菌株具有相同的 酶切图谱 , 从而证实该标准菌株的 ITS 序列酶切图谱可供快 速、准确地鉴定尖端赛多孢子菌 。 王英等[29]采用 2 对内转录间 隔区 ITS 的种特异性引物和通用引物对念珠菌悬浮液进行扩 增。 结果发现,采用通用引物结合快速检测法可快速 、简便 、特 异、敏感地检测出念珠菌,并能同时鉴定到种 ,这对念珠菌病的 早期诊断和治疗有潜在的应用价值 。
ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中的应用
ITS序列分析在真菌分类鉴定和分子检测中的应用
白树猛;田黎
【期刊名称】《畜牧与饲料科学》
【年(卷),期】2009(030)001
【摘要】笔者介绍了ITS序列结构特点,综述了ITS序列在植物病原真菌分类鏊定和分子检测中的应用,并对其应用前景进行了展望.
【总页数】3页(P52-53,189)
【作者】白树猛;田黎
【作者单位】青岛科技大学生物系,山东,青岛,266042;青岛科技大学生物系,山东,青岛,266042
【正文语种】中文
【中图分类】Q949.32;Q522.6
【相关文献】
1.ITS序列分析在真菌分类鉴定中的应用 [J], 陈剑山;郑服丛
2.ITS序列分析及其在植物真菌病害分子检测中的应用 [J], 赵杰
3.rDNA-ITS序列分析在植物病原真菌分类鉴定中的应用 [J], 李依韦;银玲
4.rDNA-ITS序列分析法与传统分类法相结合在真菌鉴定中的应用 [J], 朱洪庆;王盼盼;张萌;陈嘉慧;丁祥
5.ITS序列分析鉴定大型真菌在生物学野外实习中的应用 [J], 俞皓鸣;蔡毅鸣;王珂;程源九;肖义平;王英明;张文驹;乔守怡
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
基于ITS序列分析的外生菌根真菌的分子鉴定研究
摘要本实验是利用采自内蒙古贺兰山的外生菌根真菌子实体作为研究对象,通过常规CTAB法对该子实体进行基因组DNA提取,并利用真菌特有的引物ITS1F和ITS4对特异的DNA片段进行PCR扩增,将扩增产物在浓度为1%的琼脂糖凝胶中电泳进行检测,并在紫外透射反射分析仪下观察检测的结果,对于较好的扩增产物利用回收试剂盒进行纯化,后将纯化产物送由上海生工进行DNA测序,将测序所得到的序列输入GeneBank数据库中的局部相似性查询(Basic Local Alignment Search Tool,BLAST)程序进行比对,列出数据库中与所测得到的序列同源性较高的序列信息并进行分类鉴定,然后运用软件raxmlGUI进行系统发育树构建。
最终的研究结果显示该菌种属于报道的choiromyces helanshanensis。
关键词:外生菌根真菌;ITS序列;分子生物学;鉴定AbstractIn this experiment, an ectomycorrhizal fungi collected from Helan Mountain, Inner Mongolia, was used as the research object. The extraction of genomic DNA of the fruiting body of ectomycorrhizal fungi was carried out by the conventional CTAB method. The specific primers ITS1F and ITS4 were used to amplify the specific DNA sequences by PCR amplification. The amplified products were tested by electrophoresis with a 1% agarose molecular biology grade gel, and the results of the gel were observed under the ultraviolet transmission reflectance analyzer. The better amplification products were purified by using a recovery kit. Then, the purified products were sent to Shanghai Shenggong for DNA sequencing. The sequence obtained by sequencing was input into the Basic Local Alignment Search Tool(BLAST) program in the GeneBank database for comparsion. In the database, find out the sequences with higher homology with the sequencedsequences and perform the classification and identification. The phylogenetic tree was constructed by using the software raxmlGUI. The final results showed that the strain belongs to the reported Choiromyces helanshanensis in Helan Mountain, Inner Mongolia.Key words:ectomycorrhizal fungi; ITS sequence; molecular biology; identification目录引言 (1)1 材料与方法 (3)1.1 实验材料 (3)1.2 实验设备及药品 (3)1.2.1 试剂配方 (3)1.3 实验方法 (3)1.3.1 基因组DNA的提取 (3)1.3.2 rDNA ITS区段的PCR扩增 (4)1.3.3 PCR扩增产物的回收和纯化 (5)1.3.4 DNA测序分析 (5)2 结果与分析 (6)2.1 PCR产物的检测 (6)2.2 提纯效果的检测 (6)2.3 rDNA ITS序列的同源性分析 (7)2.4 raxmlGUI系统发育树分析 (9)3 结论与讨论 (10)参考文献 (11)致谢 (12)引言贺兰山坐落于宁夏回族自治区的西北部,是银川平原的原始屏障,也是三北防护林建设的重点地段[1]。
菌株 its 序列
菌株its序列简介菌株its序列是一种用于分析真菌的种属和物种鉴定的标志性分子位点。
在分类学和生态学研究中,通过检测和比较菌株中的its序列差异,可以对真菌的分类、进化和多样性进行深入的研究。
its序列的定义菌株its序列即真菌内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS),位于真核生物的rDNA中,包括ITS1、5.8S rRNA和ITS2三个区域。
其中,ITS1和ITS2是高变区,可以用于研究种属和物种间的变异。
ITS序列在物种鉴定中的应用ITS序列由于其具有高变性和物种特异性的特点,在真菌物种鉴定中得到广泛应用。
通过与数据库中已知的ITS序列比对,可以准确地将不同的菌株归类到其相应的物种或属级分类。
基于ITS序列的物种鉴定方法,可以实现快速、准确和高通量的真菌鉴定。
ITS序列的分析方法收集菌株样本在进行ITS序列分析之前,首先需要收集菌株样本。
可以选择不同环境中的真菌,如土壤、水体、植物等,或者从已知物种中选取不同的菌株进行分析。
提取菌株DNA从收集的菌株中提取总DNA,可以利用商用的DNA提取试剂盒进行提取。
保证提取的DNA质量和浓度足够用于后续的PCR扩增反应。
PCR扩增ITS序列利用特异性引物对ITS序列进行PCR扩增。
常用的引物对包括ITS1和ITS4。
在扩增过程中,需要根据反应条件进行优化,如温度、循环数等。
扩增后的产物可以通过琼脂糖凝胶电泳进行检测。
分离和纯化PCR产物对PCR扩增得到的产物进行分离和纯化。
可以使用商用的PCR产物纯化试剂盒,或者通过凝胶切割和DNA回收的方法进行纯化。
测序和序列比对将纯化的PCR产物进行测序,可以选择传统的Sanger测序方法,也可以选择高通量测序技术。
得到测序结果后,进行序列比对,可以使用BLAST等序列比对软件进行比对和比对结果的分析。
物种鉴定和系统发育分析根据ITS序列比对结果,可以进行物种鉴定和系统发育分析。
rDNA-ITS序列分析法与传统分类法相结合在真菌鉴定中的应用
rDNA-ITS序列分析法与传统分类法相结合在真菌鉴定中的应用朱洪庆;王盼盼;张萌;陈嘉慧;丁祥【摘要】采集了四川马尔康地区3种真菌,根据其形态学特征结合卯晓岚的《中国大型真菌》图谱,初步确定其疑似为黄菇、松乳菇、红菇3个种.为提高鉴定的准确性,通过构建基因池;用特异性引物进行PCR扩增,并对扩增产物进行测序;将测得的实验样品的序列在GeneBank中进行BLAST比对;并与相似性较高的已知的种,利用DNA-MAN、Clustalx1.83和MEGA5.0软件采用N-J法构建进化树,探寻他们与已知物种的相关关系.结果表明,三种疑似菌株扩增出的目的条带为500-750bp,J1、J2、J3号菌株分别与臭黄菇、松乳菇、红菇的序列相似度最高.并利用序列的相似性做出了它们各自的进化树.最终得出结论:J1号菌株为臭黄菇(Russula foetens),J2号菌株为松乳菇(Lactarius deliciosus),J3号菌株为红菇(Russula.).利用rDNA-ITS序列分析法和形态学分类法相结合的方法鉴定菌种,不仅丰富了三种真菌的基因库,而且也克服了单纯的rDNA-ITS序列分析法因受基因库的完善程度、高度相似性序列的多少以及具体物种ITS区的可变程度等限制而不能鉴定出所有真菌的缺点,提高了真菌分类鉴定中一些模糊性状的区分度.【期刊名称】《西华师范大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2016(037)003【总页数】6页(P264-269)【关键词】真菌;鉴定;rDNA;ITS;PCR;测序【作者】朱洪庆;王盼盼;张萌;陈嘉慧;丁祥【作者单位】西华师范大学生命科学学院,四川南充637009;西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川南充637009;西华师范大学生命科学学院,四川南充637009;西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川南充637009;西华师范大学生命科学学院,四川南充637009;西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川南充637009;西华师范大学生命科学学院,四川南充637009;西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川南充637009;西华师范大学生命科学学院,四川南充637009;西华师范大学西南野生动植物资源保护教育部重点实验室,四川南充637009【正文语种】中文【中图分类】Q939.5传统的真菌鉴定方法主要通过培养后观察菌落形态和显微特征,或辅以生理、生化、营养实验来鉴定。
评价ITS、BenA和CaM序列分析在曲霉菌种鉴定方面的应用
力 。方 法
对 1 6 9株 曲 霉 临 床 分 离 株 分 别 进 行 I TS 、 B e n A和C a M 序列测定 , 并在 G e n b a n k数 据 库 中 进 行 比对 分 析 以获 得
其 菌 种 鉴 定 信 息 。结 果 1 6 9株 曲霉 经 I T S 、 B e n A 和C a M 序列 分析分别有 5 2 . 7 、 6 6 . 3 、 9 7 . 6 菌株鉴定 至种水平 , 4 7 . 3 、 3 3 . 7 、 2 . 4 菌 株 鉴 定 至属 水 平 , 3 个 序列 对 曲霉 均 不存 在无 法 鉴 定 情 况 。 结 论 I TS 、 B e n A和 C a M 均 可 用 于 曲霉 菌 种鉴定 , 其中以 C a M 的鉴 定 能 力 最 强 。 【 关 键 词】 内转 录间 隔 区 ( I T S ) ; 微 管 蛋 白基 因 ( B e n A) ; 钙 调 蛋 白基 因 ( C A M) ; 序列分析 ; 曲霉 ; 菌 种 鉴 定 【 中 图 分 类 号】 R 3 7 9 . 6 【 文 献标 识码 】 A 【 文章编号】 1 6 7 3 ~ 3 8 2 7 ( 2 0 1 7 ) 1 2 - 0 0 7 4 — 0 4
b a n k d a t a b a s e . Re s u l t s Th e t e s t e d s t r a i n s we r e i d e n t i f i e d t o s p e c i e s l e v e l wi t h i d e n t i f i c a t i o n r a t e s o f 5 2 . 7 ( 8 9 / 1 6 9 ) , 6 6 . 3
李 颖 徐英 春
基于形态学特征和ITS序列分析秦巴山区天麻萌发菌的亲缘关系
基于形态学特征和ITS序列分析秦巴山区天麻萌发菌的亲缘关系摘要:利用拮抗试验,萌发试验和ITS序列分析技术对秦巴山区12个天麻萌发菌菌株进行了亲缘关系分析。
结果表明:12个萌发菌菌株分为两大类,其中8103-4、8103-6、8103-7、8103-8这4个菌株与其他菌株拮抗反应明显,并且ITS序列分析显示在同一个分支上,亲缘关系相近;萌-3、萌-7、萌MD-2、萌发菌、石斛-1、石斛-2、萌-云南此8个菌株拮抗反应不明显,ITS序列分析显示在同一个分支上,8103-3、萌发菌与标准菌种Mycena citrinomarginata亲缘关系相近,萌MD-2、石斛小菇-1、萌-3、萌-7、石斛小菇-2、萌-云南与Mycena purpureofusca亲缘关系相近。
关键词:天麻萌发菌;拮抗;rDNA序列;亲缘关系中图分类号:S182文献标志码:A文章编号:1002-1302(2016)05-0245-04萌发菌隶属于担子菌纲(Basidiomyeetes)伞菌目(Agarieales)口蘑科(Trieholomataeeae)小菇属(Myeena)[1],主要包括紫萁小菇(M . mosmundicola)、石斛小菇(M . mdendrobii)和开唇小菇(M . manoectochila)三大类属。
天麻萌发菌主要分布于我国陕西、云南、甘肃、河南、河北、湖南、湖北、贵州、新疆、四川、安徽、黑龙江、吉林、广西、海南、福建、内蒙古、西藏及台湾等省区[2],为天麻(Gastrodia elata)有性繁殖时的必要共生菌。
天麻种子细小如粉尘,无胚乳及其营养贮备,无外源营养供给,种子不能发芽。
它的萌发靠小菇属(Mycena)一类真菌菌丝侵染种胚提供营养,促使其萌发[3]。
随着天麻药用需求不断增加,野生资源日益匮乏,且人工栽培中以无性繁殖来连续种植,天麻球茎明显退化,侧芽发芽率低等原因,经过有性繁殖培育0代天麻或1代天麻,再通过无性繁殖扩大种植已成为天麻稳产和高产的重要途径[4-5]。
柳杉论文
利用ITS序列鉴定真菌
利用ITS序列鉴定真菌一、实验目的1,了解利用ITS序列鉴定真菌的原理;2,掌握用ITS序列鉴定真菌的方法步骤二、实验原理菌物是真核生物的重要类别,传统的菌物分类以子实体形态特征和生理生化指标为分类基础,由于部分菌物的子实体不易获得,形态特征不易掌握,少数形态特征和生理生化指标随着环境的变化而不稳定,使传统的菌物鉴定工作困难或分类系统意见分歧。
内转录间隔区ITS,位于18S和5.8S rDNA(ITS1)之间以及5.8S和28S rDNA之间(ITS2),ITS1和ITS2常被合称为ITS,并且5.8S RNA基因也被包括在ITS之内。
近年来,利用真核生物在rDNA的ITS区段既具保守性又在科、属、种水平上均有特异性序列的特性,对ITS区进行PCR 扩增、测序。
随着核糖体rDNA ITS序列分析技术在菌物研究中的应用,一些分类地位不明确、亲缘关系不清楚的物种通过该技术得到了解决,一些重要的菌物遗传信息得到阐明。
三、实验材料仪器用具:恒温水浴锅,移液器,离心机,核酸蛋白分析仪,琼脂糖凝胶电泳系统,凝胶成像系统,PCR仪,离心管,微量移液器,枪头,一次性手套, PCR管 (0.2ml);材料:金针菇试剂:1,基因组DNA提取试剂:氯仿-异戊醇(25︰1);无水乙醇;蒸馏水;70%乙醇;TRIS饱和酚(pH 8.0) 提取液(Tris–HCl 1mol/L pH 8.0)2,特异性片段的PCR扩增试剂:MgCl2(25mM);琼脂糖;DNA分子量标准物(100bp ladder);10x缓冲液(Mg2+free);dNTP(10mM each);Tag酶(5U/μL);DNA模板;10μM引物:upper (31bp);lower (30bp)3,ITS引物四、实验方法与步骤1,金针菇因组DNA的提取(TRIS 饱和酚一步法)。
⑴称取新鲜金针菇约0. 5 g ,置于洁净的小研钵中;⑵向研钵中直接加入1 ml TRIS饱和酚(pH值为8.0) 提取液,充分研磨至糊状;⑶用尖端剪除0. 5 cm的蓝色吸头将糊状物全部转移到2 ml的离心管中,充分振荡约1 min ,随即加入0. 5 ml的氯仿-异戊醇(25︰1) ,轻轻振荡混匀;⑷将离心管于4 ℃,12 000 r/ min 离心10 min ,吸取上清于新离心管中,每管加入2 倍体积的无水乙醇,冰上放置10 min ;⑸4℃,12000 r/ min离心10 min ,弃上清;⑹沉淀用70 %乙醇漂洗2 次,超净工作台中吹干后,加50μl的蒸馏水溶解, - 20 ℃保存备用。
its序列在真菌鉴定中的作用
its序列在真菌鉴定中的作用在真菌的世界里,ITS序列可是个明星哦!你可能在想,ITS是什么鬼?简单来说,ITS就是“内部转录间隔区”的缩写,听起来有点拗口,但其实它在真菌鉴定中简直是无可替代的好帮手。
想象一下,我们身边那些五颜六色、形状各异的蘑菇,如果没有这个小小的序列,它们就像失去了身份证,谁知道它们是谁呢?在这片神秘的领域,ITS序列就像真菌的身份证明,帮助科学家们快速识别出各种真菌。
你可能会问,这ITS序列到底有什么厉害之处?就拿真菌的分类来说吧,真菌的种类多得让人眼花缭乱,有些长得像个小伞,有些则像块奇形怪状的橡皮泥。
没有这个序列,真菌的鉴定就像是在大海捞针,简直不知从何下手。
科学家们通过分析ITS序列,可以迅速了解真菌的种类,甚至了解它们的进化关系。
这就像翻开一本神秘的书,一下子就能读懂真菌的家谱,真是太酷了!有些朋友可能会觉得,识别真菌不就是看看它们的外形吗?其实不然。
真菌的外形变化多端,有些长得真是让人捉摸不透。
你在公园里看到的一些蘑菇,可能在不同的环境下长出完全不同的样子,真是千变万化。
这时候,ITS序列就派上用场了,科学家们不再依赖那些模糊的外形特征,而是通过基因序列来给真菌下定义。
你看,科技的力量就是这么神奇。
在科研的舞台上,ITS序列可不止是个“身份证”,它还帮助我们发现新的真菌种类呢!就像挖宝一样,科学家们通过采集不同地方的真菌样本,分析它们的ITS序列,结果往往会惊喜连连,有时候能找到全新的真菌种类。
这就像玩“寻宝游戏”,每一份样本都可能藏着一个全新的秘密,让人充满期待。
ITS序列还不仅限于学术研究哦。
在农业、环境监测等领域,它的用武之地也不少。
比如说,在农田里,真菌的种类和数量直接影响作物的生长。
有些真菌可能是农作物的好帮手,帮助植物吸收养分;而有些真菌则是个害虫,反而会影响作物的健康。
这时候,通过ITS序列的分析,农民们可以及时识别出有益和有害的真菌,从而采取针对性的措施,简直是“药到病除”!当然了,ITS序列的应用不仅仅局限于地面上的真菌。
用rDNA-ITS方法鉴别内蒙古多种野生食用菌
用rDNA-ITS方法鉴别内蒙古多种野生食用菌刘晓婷;郭九峰;王淑妍;李亚娇;那日【期刊名称】《食药用菌》【年(卷),期】2015(000)005【摘要】采用rDNA-ITS分子标记对内蒙古地区市场11种常见野生食用菌,以2个已知长期人工栽培可食用菌种香菇和双孢蘑菇为比照进行分子鉴定;通过优化DNA提取方法及PCR反应条件,用通用引物rrSl/rrS4扩增出650~800bp的目的DNA片段,经PCR产物直接测序,然后与DNA序列数据库中的信息资源进行比对,鉴定出11个样品分属于卷边网褶菌、香杏丽蘑、野蘑菇、马鞍菌、杨树口蘑、蒙古口蘑和白鳞蘑菇。
利用DNAMAN8软件,分析13个材料rDNA中ITS区序列,做同源性矩阵,绘制NJ树,得出13种常见食用菌亲缘关系的结论。
结果表明:rDNA-ITS分析方法可以有效地划分不同种属的菌种,可以区分出常见野生食用菌。
【总页数】6页(P301-306)【作者】刘晓婷;郭九峰;王淑妍;李亚娇;那日【作者单位】内蒙古大学物理科学与技术学院,内蒙古呼和浩特010021【正文语种】中文【中图分类】S646【相关文献】1.多种剥蚀厚度恢复方法在内蒙古雅布赖盆地侏罗系和白垩系中的应用及其地质意义 [J], 田涛;任战利;杨鹏;曹展鹏;杨甫2.多种方法组合在内蒙古二连-东乌旗地区航磁异常查证中的应用--以蒙C-2007-9-1为例 [J], 高学生;苏永军;梁建刚;张国利;李建国;张素荣;滕菲3.多种物探方法在内蒙古二道河铜铅锌银矿勘查中的应用研究 [J], 牛兴国;党月辉;杨发亭4.多种物探方法在内蒙古水泉沟地区找矿效果分析 [J], 张荣;穆海旗;孙引强;周文博;刘彤5.多种物探方法在内蒙古水泉沟地区找矿效果分析 [J], 张荣;穆海旗;孙引强;周文博;刘彤因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
基于ITS序列分析鉴定栓孔菌属物种
基于ITS序列分析鉴定栓孔菌属物种孙晓琳;商圆圆;张恩奎;霍存录;贺新生【期刊名称】《食品与发酵科技》【年(卷),期】2013(000)002【摘要】以采自四川盆地的栓孔菌属的12个标本作为研究材料,对形态特征进行初步鉴定,结合来自GenBank的6个最相似物种(Trametes ochraceae、Trametes obstinata、Trametes purpurea、Trametes villosa、Trametes pubeacens、Tram-etes velutina)共计18种栓孔菌属的rDNA ITS区段进行序列同源性分析。
结果表明,三大类群中,粗毛栓孔菌和偏肿栓菌的菌株各自聚为1组。
云芝栓孔菌属的菌株聚为三组,其中,HE2807和HE21006以98%,HE2925与来自Gen-Bank上的5个菌株,HE21080、HE21084和HE2905分别以较高的同源性聚为一起。
说明根据形态特征观察的同时, ITS序列分析在近缘种的分类鉴别上有一定价值,但是只能作为大型真菌分类鉴定的参考依据。
【总页数】4页(P85-88)【作者】孙晓琳;商圆圆;张恩奎;霍存录;贺新生【作者单位】西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳 621010;西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳 621010;金堂县林业局,四川金堂 610400;西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳 621010;西南科技大学生命科学与工程学院,四川绵阳 621010【正文语种】中文【中图分类】S646.2【相关文献】1.基于rDNA ITS序列分析的桑黄真菌菌株分子鉴定 [J], 谢丽源;张勇;邓科君;彭卫红;甘炳成;李洪军2.利用分子分类学对栓菌属菌物分类鉴定的研究进展 [J], 崔岱宗;向冰冰3.基于ITS序列分析鉴定灵芝属菌种 [J], 黄龙花;杨小兵;张智;胡惠萍;张一帆;吴清平4.一株野生古巴栓孔菌的鉴定及系统发育分析 [J], 史维丽;班立桐;黄亮;杨红澎;王玉;孙宁;李奕葶5.奶油栓孔菌的鉴定及其生物学特性 [J], 郝金斌;孟国良;吴龙月;叶丽云;吴小平因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
柳树菇珍稀菌种
辽宁天天菌业成功培育珍稀菌种“柳树菇”已批量上市以往需要腐生在柳树上的柳树菇,如今生长在辽宁食用菌农业基地的大棚里。
近日,采用天天野生菇菌种,经过三个多月的人工培育,该食用菌专业合作社终于成功培育出珍稀食用菌种“柳树菇”,现已批量上市。
辽宁天天食用菌专业合作社理事长李含:柳树菇属于二十种珍惜食用菌当中的一种,在我们东北各地有野生的,每年秋季当地人有采食的习惯,现在我们把它成功地人工驯化,并且投入了批量生产,丰富我们菜蓝子,让当地人能吃上名贵稀有的柳树菇。
柳树菇学名黄伞,又名柳蘑、柳钉、金柳菇,野生柳树菇生长于柳树上,经人工驯化后可利用棉籽、麸皮等材料在大棚里种植。
据了解,柳树菇肉质肥厚、脆嫩、味道鲜美,营养丰富,具有一定的药用价值和保健作用。
柳树菇培育技术员李洪峰:柳树菇有很高的人体吸收的氨基酸,还有特殊的抗癌活性物质,它对提高人体免疫功能有很好的作用,特别是对迅速恢复体力和脑力有很好的补充作用。
柳树菇的试种成功进一步拓宽了菜农的致富渠道,柳树菇在当地的批发价为每公斤20元,在其它县市市场最高价达到了每公斤80元。
据该专业合作社理事长李含介绍,他试种的两分地柳树菇,现在每天能向市场投放将近50公斤,全年下来两分地收入可达到10万块钱以上。
由于市场前景看好,每天都有当地农菜民前来参观学习,希望通过加入合作社来增加收入。
辽宁天天菌业:野生柳树菇驯化项目成功辽宁天天食用菌研究中心主任龚永祥介绍说,此次实验使用原料2吨,生产成本约3元/公斤,共产出蘑菇2.1吨,按照批发价最低16元/公斤计算,每吨原料可实现净利润1.3万元以上,经济效益十分可观。
按每茬蘑菇培养到收获用时3个月计算,如果控制好温室生长条件,每年可种四茬。
辽宁天天菌业的野生柳树菇生长期一般在6月中旬至10月初,前后持续3个多月。
柳树菇属木生菌类,蛋白质含量高达19.55%,其中所含氨基酸种类达18种(包括人体必需的8种氨基酸),并含有丰富的B族维生素和钾、钠、钙、镁、铁、锌等元素。
柳蘑高产栽培技术
柳蘑高产栽培技术
闫秀英;王占斌
【期刊名称】《中国食用菌》
【年(卷),期】2009(028)006
【摘要】柳蘑在分类学上属担子菌门,为低温型野生菌,常见于8月-10月的柳树树干或枯枝基部.柳蘑是目前很有开发前途的食用菌新品种之一.本研究通过不同培养料栽培试验,对柳蘑的高产栽培技术进行研究,为柳蘑的研究开发提供基础资料与参考依据.研究结果显示,阔叶树木屑配方1有利于柳蘑子实体生长;培养料1、培养料3、培养料5中柳蘑有较高的生物转化率;麦麸(玉米面)最适添加量为15%;配合料(稻草、玉米桔杆等)添加量最适为10%~20%.
【总页数】3页(P62-64)
【作者】闫秀英;王占斌
【作者单位】四平市园林管理处,吉林,四平,1360010;东北林业大学林学院,黑龙江,哈尔滨,150040
【正文语种】中文
【中图分类】S646.9
【相关文献】
1.柳蘑生物学特性及ITS序列分析 [J], 张薇;谢凤颖;王占斌
2.柳蘑多糖对角质形成细胞作用实验研究 [J], 宋晶心;董村;张理涛;王晋;王玺
3.贺兰山野生柳黄蘑菌株特性及驯化栽培技术 [J], 牛瑛萍;贺永喜;王卫东
4.柳蘑的化学成分及药理作用研究进展 [J], 尹昭晔;孔炯炜;刘湘;赵引利
5.柳蘑菌丝体高产多糖发酵条件优化及其多糖组分分析 [J], 赵楠楠;朱晓冉;李德海;周聪
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
基于形态特征和ITS序列对新疆芦苇根蘑菇的分类鉴定
基于形态特征和ITS序列对新疆芦苇根蘑菇的分类鉴定桂明英;何容;郭永红;罗孝坤;张微思【期刊名称】《食用菌》【年(卷),期】2014(000)004【摘要】以采自新疆库尔勒博斯腾湖芦苇荡的蘑菇为研究材料,在进行初步鉴定形态特征的基础上,对其核糖体DNA的内转录间隔区(Internal transcribed space,ITS)序列进行克隆测序及序列分析。
从GenBank数据库进行同源性检索比对,与获得的相关序列一起构建了蘑菇属系统发育树。
结果显示:基于ITS序列对菌株的鉴定结果为绵毛蘑菇(Agaricus vaporarius)。
【总页数】3页(P14-16)【作者】桂明英;何容;郭永红;罗孝坤;张微思【作者单位】云南省食用菌工程技术研究中心中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明,650221;云南省食用菌工程技术研究中心中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明,650221;云南省食用菌工程技术研究中心中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明,650221;云南省食用菌工程技术研究中心中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明,650221;云南省食用菌工程技术研究中心中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所,云南昆明,650221【正文语种】中文【相关文献】1.基于形态特征和ITS序列对新疆博乐蘑菇的分类鉴定 [J], 刘伟;李建辉;张亚平2.基于形态特征和ITS序列对7个鹅膏菌属菌株的分类鉴定 [J], 李海波;吴学谦;魏海龙;付立忠;吴庆其3.基于形态特征和ITS序列分析对湖南松菌的分类鉴定 [J], 郭亮;刘君昂;周国英;李河4.基于形态学特征和psbA-trnH叶绿体编码基因序列明确五指山野生茶的分类地位 [J], 苏凡;杨小波;李东海5.基于形态特征和多基因联合序列鉴定卵孢长根菇蛛网病病原菌 [J], 刘国丽;李红;龚娜;邓会超;张敏因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
ITS分析步骤2
构建真菌ITS系统发育树的步骤一、获取序列(一)没有现成序列时1、打开NCBI网站(如果没有收藏,就在GOOGLE中输入,搜索到的第一项就是)2、选择nucleotide 库3、输入“生物的拉丁属名(如fusarium)internal transcribed spacer not sp. notunclutured”4、结果出来后,在右边选“tree”,然后选取“fungi”或其中的一个科、目、纲5、点击 download6、选FASTA7、保存(二)已知序列时8、在BASIC BLAST 中选择blast 运行9、在BASIC BLAST中选择 nucleotide blast 运行10、在 Enter Query Sequence 中输入 accession number , gi , or FASTASequence11、在 Choose Search Set 中选择 Others12、单击BLAST13、“select all”14、单击 get selected sequences 运行点击Display Settings选择FASTA点击Apply点击send选择“file”选择“FASTA”点击create file对话框中选“保存”选择一个文件名保存二、序列整理15、把FASTA格式的文件用记事本的格式打开,把所有序列复制到word文档中整理(第一行只保留序列号、属名缩写如F.,和菌系号)选择“编辑”中的替换中的高级中的通配符,输入gi|* | 全部替换成空白,再用把“.1|”全部替换成空白。
16、整理好的序列复制到原来的FASTA记事本中17、保存三、建立系统进化树18、用MEGA打开FASTA格式文件19、Select All20、Alignment Align by Clustalw → OK 序列比对若暂停选择 Ignore21、比对完成后保存(两种文件格式)Data save sessionData Export alignment MEGA Format22、关闭FASTA格式文件23、自动打开.MEGA文件24、在MEGA4中选Phylogeny → Construct Phylogeny(序列数多于20)或bootstrap ((序列数少于20))Neighbor joining → model nucleotide → kimura 2 parameters25、(在Gaps/Missing Data 选择 Pairwise Deletion)26、Compute构建发育树。
4种乳菇属真菌的形态学与rDNA-ITS鉴定
4种乳菇属真菌的形态学与rDNA-ITS鉴定田慧敏;李江【期刊名称】《中国瓜菜》【年(卷),期】2024(37)1【摘要】为明确内蒙古赤峰地区常见有毒乳菇种类,准确、快速地识别有毒乳菇,将采集的4个乳菇属Lactarius真菌标本采用传统形态学分类方法进行鉴定,同时提取子实体DNA,使用真菌通用引物ITS1/ITS4进行PCR扩增,用Blast对扩增产物纯化测序所得的序列进行比对,采用MEGA5.1软件构建系统发育树确定属和种。
结果表明,2种方法鉴定结果一致,标本CFSZ10167为毛头乳菇[Lactarius torminosus(Schaeff.)Pers.],标本CFSZ10216为绒边乳菇[Lactarius pubescens(Fr.ex Kronbh.)Fr.],标本CFSZ13021为灰褐乳菇[Lactarius pyrogalus(Bull.)Fr.],3种均为胃肠炎型毒菌,CFSZ10044为皱乳菇(Lactarius ruginosus Romagn),为中国新记录种,主要特点是菌盖棕褐色、浅褐色,有绒质感,盖缘呈齿状,孢子球形具小刺,食毒不明。
对4个种的形态学特征进行了详细描述,并附有生境图片和显微图像,研究结果为乳菇属物种鉴定和资源分布提供了重要补充,并为常见毒菌识别提供了理论依据。
【总页数】8页(P56-63)【作者】田慧敏;李江【作者单位】赤峰学院化学与生命科学学院【正文语种】中文【中图分类】Q939.5【相关文献】1.内蒙古五个环柄菇形态学及rDNA-ITS鉴定2.中国乳菇属真菌一新记录种——思芽乳菇3.四个口蘑科真菌形态学及rDNA-ITS测序鉴定4.中国腐霉属新记录种Pythium nunn的形态学鉴定及rDNA-ITS系统发育分析5.一株渤海丝状海洋真菌的形态学及18S rDNA-ITS鉴定因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
- 1、下载文档前请自行甄别文档内容的完整性,平台不提供额外的编辑、内容补充、找答案等附加服务。
- 2、"仅部分预览"的文档,不可在线预览部分如存在完整性等问题,可反馈申请退款(可完整预览的文档不适用该条件!)。
- 3、如文档侵犯您的权益,请联系客服反馈,我们会尽快为您处理(人工客服工作时间:9:00-18:30)。
柳 蘑 生物 学 特性及 I TS序 列 分 析
张 薇 , 凤 颖 , 占斌 谢 王 ( 北 林 业 大 学 林 学 院 , 龙 江 哈 尔滨 10 4 ) 东 黑 5 0 0
氨 酸 ( IHI (6 l 。 C 9 。 ))_ N7 J
1 2 方 法 .
质 、 水 化合 物 、 碳 维生 素及 多 种矿 物质 元 素 , 食之
黏 滑 爽 口 , 道 鲜 美 , 味 独 特 , 人 体 精 力 、 力 味 风 对 脑 的 恢 复 有 良好 效 果 , 且 具 有 抗 癌 作 用 [ 。 并 ]
柳 蘑 f h l t d p s F . Qu 1 属 担 子 i oi aa i oa( r ) e ] P o . 菌 门 ( a iimyoa , 菌 目 ( ai ls , 盖 B s o c t) 伞 d Ag r ae ) 球 c
1 材 料 与方 法
1 1 材 料 .
菇科 ( t p ai ee , 伞 属 ( h l t ) 别 称 S r h r ca ) 鳞 o a P oi a , p 多脂鳞 伞 、 蘑 、 柳 菇 等 。柳 蘑 属 低 温 型野 生 黄 黄 菌, 常见 于 8 0月份 的柳 树树 干或枯枝 基部 , ~1 主 要 分布黑龙 江 、 林 、 宁 、 吉 辽 内蒙 古 、 北 、 江 、 河 浙 甘
虽 然柳蘑 营养 保健 价 值 高 , 国 内对 柳 蘑 的 但
开发起 步较 晚 , 关 柳 蘑 的 研究 2 有 O世 纪 末 至 2 1
1 2 1 不 同温度 对 菌丝 生长 的影响 采用 P A . . D
培 养 基 , 处 理 3次 重 复 , 养 皿 接 种 后 分 别 在 每 培 5 1 、O 2 、0 3 ¨ 培 养 , 察 记 录 菌 丝 生 长 、O 2 、 5 3 、 5 C下 观 情 况并定 期测量 菌落直 径 。 1 2 2 不 同 光 照 条 件 对 茵 丝 生 长 的 影 响 采 用 . . P DA 培 养 基 , 处 理 3次 重 复 , 种 后 分 别 在 全 每 接 黑 暗 、 光 照 和 光 暗 交 替 ( 1 ) 全 各 2h 3种 不 同 的 光 照 条件下 培养 , 察菌丝 生长情 况并记 录 。 观 1 2 3 不 同酸 碱 度 对 柳 蘑 菌 丝 生 长 的 影 响 采 . .
畅销 , 而且价 格 昂贵 。随 着人 们 对柳 蘑 食 ( ) 药 用 价 值 认 识 的逐 步 深 入 , 在 食 品 及 药 品 行 业 的 需 其 求也将 越来越 大l j _ 。 { 核糖 体基 因 I TS区 段 属 于 保 守 的 区 段 , 保 其
守 性 基 本 上 表 现 为 种 内 相 对 一 致 , 间 差 异 较 为 种
摘要 : 对柳 蘑 生物 学 特性 进 行 比较 研 究 , 果 表 明 : 蘑 菌 丝 生 长 适 宜 温 度 为 2 ~3 ℃ , 适 温 适 光 照 条件 是 全 黑 暗 ; 生长 的 p 为 5 1 , 适 生 长 p 为 6; 适 碳 源 为蔗 糖 , 萄糖 次之 ; 适 氮 源 H ~ 1最 H 最 葡 最 为 硝 酸 钾 , 氨 酸 次之 。核 糖 体 转 录 间 隔 区 (n en lTrn c ie p c r P 谷 I tr a a srb d S a e ) CR扩 增 结 果 表 明 , 属 担 子 茵 与 其 已知 大 型真 菌 Ph loaa i oa序 列 同源性 达 9 。 oit d p s 9 关 键词 : 蘑 ; 物 学特 性 ; 糖体 转 录 间隔 区 柳 生 核 中 图分 类 号 : 6 6 1 S 4 . 9 文献 标 识 码 : A 文章 编 号 : 0 22 6 ( O 1 0 一0 8O 1 0 — 7 7 2 1 ) 3O 1 一 3
用 P DA 培 养 基 , p 调 至 5、 7 8 9 1 l 、 将 H 6、 、 、 、 0、 l 1 , 处 理 3次 重 复 , 种 后 置 于 2 ℃ 培 养 箱 中 2每 接 5
世 纪 初 才 逐 渐 开 始 。 近 年 来 , 国 和 E本 已 对 柳 我 t 蘑 的 人 工 驯 化 栽 培 进 行 了 研 究 , 由 于 对 柳 蘑 的 但 生 物 学 特 性 了 解 不 够 完 善 , 工 栽 培 产 量 比较 低 、 人 因 而 未 得 到 全 面 开 发 , 柳 蘑 在 日本 和 我 国非 常 但
肃 、 海、 南 、 西 、 青 河 广 四川 等 地 n 。该 菇 富 含 蛋 白 ]
11 1 试 验 菌种 . .
柳 蘑 ( 伞 ) P oi d p — 黄 ( h l aa i o t
s ) 吉林敦 化石 门子林场 分离得 到 。 a从 112 培 养 基及 药 品 P A 培养 基 : 铃 薯 、 .. D 马 琼
脂、 萄 糖 ( 糖 ) 水 ; 氏 培 养 基: a O 、 葡 蔗 和 查 N N 3 K HP ) K 1Mg 、 e O 、 糖 ( H ( 、 C、 S F S 4蔗 d C O 。 、 ) 琼 脂 和 水 ; 它 药 品 : 粉 ( 6 O ) K O 和 谷 其 淀 C 。 s 、 N a H
明显 , 种 特点 使 I 这 TS区 段 的 DNA 序 列 非 常 适 合 作 为 从 分 子 水 平 上 鉴 定 物 种 的 靶 序 列 。现 对 柳 蘑 生 物 学 特 性 进 行 比较 研 究 , 进 行 核 糖 体 基 因 并 I S区段 的特异 性 扩增 , 而 为 更科 学 地 划 分 物 T 从 种提 供依据 。