分子标记的实验原理及操作流程

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分子标记——AFLP原理和操作步骤

分子标记——AFLP原理和操作步骤

分子标记——AFLP原理和操作步骤一、原理AFLP也是通过限制性内切酶片段的不同长度检测DNA多态性的一种DNA分子标记技术。

但AFLP是通过P CR反应先把酶切片段扩增,然后把扩增的酶切片段在高分辨率的顺序分析胶上进行电泳,多态性即以扩增片段的长度不同被检测出来。

实验中酶切片段首先与含有与其共同粘末端的人工接头连接,连接后的粘末端顺序和接头顺序就作为以后PCR反应的引物结合位点。

实验中,根据需要通过选择在末端上分别填加了1~3个选择性核苷的不同引物,可以达到选择性扩增的目的。

这些选择性核苷酸使得引物能选择性地识别具有特异配对顺序的内切酶片段,进行结合,导致特异性扩增。

二、实验试剂Taq酶、EcoRI/ MseIEcoRI/ MseI接头、E+A引物M+C引物、T4DNALigaseE和M引物、琼脂、过硫酸胺、丙烯酰胺、尿素、硝酸银、甲酰胺、dNTPs、二甲苯青、冰醋酸、玻璃硅烷、50bpMark三、操作步骤(一)基因组DNA提取和纯化A、参考实验一的大量提取DNA实验方法,B、DNA的纯化:用0.8%琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)电泳检测片段大小,取出其中的1/3已提取的基因组D NA进行纯化,首先用TE缓冲液补满至总体积50ul,再等体积苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)、氯仿/异戊醇(2 4∶1)各抽提一次,离心吸上清液于Eppendorf管中,加入1/10体积的NaAC和二倍体积预冷的无水乙醇,-20℃放置2h以上,10000g离心10min,用70%的乙醇漂洗DNA沉淀2次,风干后溶于30μlTE缓冲液中,U V-2401PC(岛津)紫外分光光度计检测A260、A280值并定量,再用0.8%琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)电泳检测片段大小。

注:0.1-0.2g组织可用100ul溶液E溶,0.5g组织,溶液E可增加至300ul,此时DNA浓度大约为100ng/ul。

(二)限制性酶切及连接在0.2ml离心管中加入:模板量约为250ng,2.5μl 10×酶切缓冲液, 2.5μl 10×T4DNA连接酶切缓冲液,5U EcoRⅠ,5U MseⅠ,2U T4连接酶,50pmol MseⅠ接头(序列见表2),双蒸水补至25μl。

分子标记技术的原理和应用

分子标记技术的原理和应用

分子标记技术的原理和应用1. 简介分子标记技术是一种用于标记和检测生物分子的方法。

通过在目标分子上引入特定标记物,可以实现对这些分子进行定量、定位及特异性检测。

本文将介绍分子标记技术的原理和应用。

2. 原理分子标记技术主要通过以下步骤来实现对目标分子的标记和检测:•选择标记物:标记物通常是具有特异性的分子或结构,如荧光染料、酶、金纳米颗粒等。

根据标记物的特性和应用需求,选择合适的标记物。

•引入标记物:将选定的标记物与目标分子进行结合。

这可以通过化学反应、酶促反应或物理吸附等方法实现。

•检测标记物:使用适当的检测方法,如光谱分析、电化学方法等,对标记物进行定量或定性检测。

这些方法可以根据标记物的特性和需求选择。

3. 应用分子标记技术在许多领域都有广泛的应用。

以下是一些主要的应用领域:3.1 生物医学研究•免疫组织化学:通过标记特定抗体来检测组织中的蛋白质,用于研究疾病诊断、治疗反应和组织学研究。

•分子诊断:使用分子标记技术检测体液中的特定生物分子,如DNA、RNA和蛋白质,用于早期疾病诊断和个体化治疗。

•药物研发:利用分子标记技术对药物与靶标的相互作用进行研究,加速药物研发过程。

3.2 食品安全检测•农药残留检测:使用分子标记技术检测食品中的农药残留物,保证食品安全。

•食品成分分析:通过标记特定分子,检测食品中的成分和添加物。

3.3 环境监测•水质检测:使用分子标记技术检测水中的有害物质和污染物,保护环境和人类健康。

•大气污染监测:通过标记特定分子,检测大气中的污染物,评估空气质量。

3.4 基因组学研究•基因定位:使用分子标记技术对基因组中特定序列进行定位和研究。

•基因表达分析:通过标记RNA或蛋白质,研究基因在各个组织中的表达情况。

4. 总结分子标记技术以其高灵敏度、高特异性和高可视性等优势,在生物医学研究、食品安全检测、环境监测和基因组学研究等领域具有广泛的应用前景。

随着技术的不断发展和创新,相信分子标记技术将在未来发挥更大的作用,并为各个领域的研究和应用带来更多的突破。

ssr分子标记原理

ssr分子标记原理

ssr分子标记原理SSR分子标记原理引言:SSR分子标记(SSR molecular tagging)是一种用于分析和鉴定生物体内特定分子的技术。

它基于分子生物学和生物化学的原理,通过特定的标记物,可以在细胞、组织或体液中准确地检测和定位目标分子。

本文将介绍SSR分子标记的原理及其在科研和医学领域的应用。

一、SSR分子标记的原理SSR分子标记是一种基于DNA序列多态性的分子标记技术。

它利用了DNA序列中的简单重复序列(simple sequence repeat, SSR),即由1-6个碱基重复组成的核酸序列。

SSR序列在基因组中广泛存在,具有高度变异性和遗传稳定性,因此可以作为DNA分子标记的候选序列。

SSR分子标记的原理可以简单概括为以下几个步骤:1. DNA提取:从样品(如细胞、组织或体液)中提取总DNA。

2. SSR标记物设计:根据目标分子的序列信息,设计特异性引物,引物的两端分别包含互补的SSR序列。

3. PCR扩增:利用PCR技术,使用设计好的引物对DNA进行扩增,扩增产物中包含了目标分子的序列和SSR序列。

4. 电泳分析:将PCR扩增产物进行电泳分析,根据SSR序列的长度变异性,可以将不同样品中的目标分子进行定性和定量分析。

二、SSR分子标记的应用SSR分子标记技术在科研和医学领域具有广泛的应用价值,以下是几个典型的应用案例:1. 遗传多样性研究:SSR分子标记可以用于研究不同物种或不同个体间的遗传多样性。

通过对多个基因座进行SSR分子标记,可以获得物种或个体的遗传背景信息,进而推断种群结构、基因流动和进化关系等。

2. 基因定位和图谱构建:SSR分子标记可以用于构建遗传图谱,帮助研究人员定位和克隆感兴趣的基因。

通过SSR标记物在遗传图谱上的位置,可以确定目标基因的大致区域,为后续的克隆工作提供有力的指导。

3. 疾病诊断和预后评估:SSR分子标记在医学诊断中的应用也日益广泛。

通过对特定基因的SSR序列进行分子标记,可以检测和鉴定与疾病相关的突变或多态性。

dna分子标记技术概述

dna分子标记技术概述

DNA分子标记技术概述1. 引言DNA分子标记技术是现代生物学和医学领域中非常重要的一项技术。

它可以通过特定的标记方法,在DNA分子上进行特异性地标记,从而实现对DNA序列的检测、定位和分析。

本文将对DNA分子标记技术进行全面、详细、完整和深入地探讨。

2. DNA分子标记技术的原理2.1 标记物选择在进行DNA分子标记之前,需要选择合适的标记物。

常用的DNA分子标记物包括荧光染料、辣根过氧化物酶标记物、生物素标记物等。

这些标记物具有不同的优势和适用范围,可以根据具体实验需求来选择合适的标记物。

2.2 标记方法DNA分子标记方法有多种,常用的包括直接标记法和间接标记法。

直接标记法是将标记物直接连接到DNA分子上,常用于荧光标记。

间接标记法是通过先引入标记物、再进行特定的反应来实现标记,常用于酶标记和生物素标记等。

2.3 标记效率和准确性DNA分子标记技术的效率和准确性是衡量其优劣的重要指标。

高效率和准确性可以保证实验结果的可靠性和准确性。

因此,在选择标记物和标记方法时,需要考虑到其标记效率和准确性,以及对实验结果的影响。

3. DNA分子标记技术的应用领域3.1 DNA测序和基因组学研究DNA分子标记技术在DNA测序和基因组学研究中有广泛的应用。

通过标记技术,可以对DNA序列进行检测和定位,从而实现对基因组的研究和分析。

3.2 分子诊断和疾病检测DNA分子标记技术在分子诊断和疾病检测中起到关键作用。

通过标记技术,可以检测和分析与疾病相关的基因或基因突变,从而实现早期诊断和治疗。

3.3 人类遗传学研究DNA分子标记技术对人类遗传学研究具有重要意义。

通过标记技术,可以进行人类遗传多样性和遗传变异的研究,为疾病发生机制和个体差异提供重要的参考和依据。

3.4 动植物遗传改良DNA分子标记技术在动植物遗传改良中有广泛应用。

通过标记技术,可以进行动植物基因分型和基因定位,为遗传改良工作提供重要的科学依据和技术支持。

分子标记技术原理方法及应用

分子标记技术原理方法及应用

分子标记技术原理方法及应用分子标记技术是一种用于检测和定位特定分子的方法。

其原理是通过将一种特殊的化学物质(标记物)与目标分子结合,然后利用标记物的性质来对目标分子进行分析和检测。

分子标记技术被广泛应用于生物医学研究、生物学检测和药物研发等领域。

常用的分子标记技术有荧光标记、酶标记和放射性标记等。

荧光标记是一种将目标分子与荧光染料结合的技术。

荧光标记的原理是通过荧光染料的特性,使得目标分子在荧光显微镜下显示出特定的荧光信号,从而对其进行定位和分析。

荧光标记可以在细胞、组织和体内进行,具有灵敏度高、分辨率高和实时监测的优点。

常见的荧光标记方法有间接免疫荧光标记、原位杂交荧光标记和荧光蛋白标记等。

荧光标记技术广泛应用于细胞定位、蛋白质相互作用研究、细胞分析和分子诊断等领域。

酶标记是一种利用酶与底物反应的方法进行分子标记。

通常,酶标记将目标分子与特定的酶(如辣根过氧化酶、碱性磷酸酶等)结合,然后通过对底物的催化作用产生显色或荧光信号。

酶标记在生物学检测中得到广泛应用,特别是在酶联免疫吸附试验(ELISA)中。

酶标记具有灵敏度高、稳定性好的特点,可以用于检测蛋白质、核酸和小分子等生物分子。

放射性标记是利用放射性同位素与目标分子结合的技术。

放射性同位素具有高灵敏度和长时间半衰期的特点,可以用于追踪和测定目标分子的存在和分布。

放射性标记技术广泛应用于细胞和分子影像学、放射性定位和药物代谢等领域。

分子标记技术在生物医学研究、生物学检测和药物研发等领域有着广泛的应用。

在生物医学研究中,分子标记技术可以用于研究细胞和分子的结构和功能,探索疾病的发生机制和药物的作用机理。

在生物学检测中,分子标记技术可以用于检测和定位特定的生物分子,如蛋白质、核酸和小分子等,从而实现对生物过程的观察和分析。

在药物研发中,分子标记技术可以用于筛选和评价药物的活性和毒性,以及研究药物的代谢和药理学特性。

总之,分子标记技术的发展和应用为生物医学研究和生物学检测提供了强大的工具,有助于我们深入理解生命的奥秘和开发有效的治疗手段。

分子标记的实验原理及操作流程

分子标记的实验原理及操作流程

AFLP分子标记实验扩增片段长度多态性 Amplified fragment length polymorphism(AFLP 是在随机扩增多态性(RAPD和限制性片段长度多态性(RFLP技术上发展起来的DNA多态性检测技术,具有RFLP技术高重复性和RAPD技术简便快捷的特点,不需象RFLP 分析一样必须制备探针,且与RAPD标记一样对基因组多态性的检测不需要知道其基因组的序列特征,同时弥补了 RAPD技术重复性差的缺陷。

同其他以PCR为基础的标记技术相比,AFLP技术能同时检测到大量的位点和多态性标记。

此技术已经成功地用于遗传多样性研究,种质资源鉴定方面的研究,构建遗传图谱等。

其基本原理是:以PCR(聚合酶链式反应为基础,结合了 RFLP、RAPD的分子标记技术。

把DNA进行限制性内切酶酶切,然后选择特定的片段进行PCR扩增(在所有的限制性片段两端加上带有特定序列的’接头”用与接头互补的但3-端有几个随机选择的核苷酸的引物进行特异PCR扩增,只有那些与3-端严格配对的片段才能得到扩增,再在有高分辨力的测序胶上分开这些扩增产物,用放射性法、荧光法或银染染色法均可检测之。

一、实验材料采用青稞叶片提取总DNA实验设备1. 美国贝克曼库尔特CEQ8000毛细管电泳系统,2. 美国贝克曼库尔特台式冷冻离心机,3. 美国MJ公司PCR仪,4. 安玛西亚电泳仪等。

三、实验试剂1. 试剂:请使用高质量产品,推荐日本东洋坊TOYOBO公司的相关产品DNA提取试剂盒;EcoRI酶,Msel酶,T4连接酶试剂盒;Taq 酶,dNTP, PCR reactio n buffer;琼脂糖电泳试剂:琼脂糖,无毒GeneFinder核酸染料替代传统EB染料;超纯水(18.2M ? • cm2. 其他实验需要物品微量移液枪(一套及相应尺寸Tip头,PCR管,冰浴等。

四、实验流程1、总DNA提取使用DNA提取试剂盒提取植物基因组DNA,通过紫外分光光度计检测或用标准品跑胶检测。

分子印迹技术的原理

分子印迹技术的原理

分子印迹技术的原理分子印迹技术(Molecular Imprinting Technology,MIT)是一种通过专门设计合成分子再加上聚合物化学方法生成特定空腔结构的方法,用于选择性识别和捕获特定目标分子的技术。

分子印迹技术的原理主要包括以下几个步骤:模板选择、功能单体选择、预聚合体形成以及模板分子的去除。

1. 模板选择:分子印迹技术的第一步是选择目标分子作为模板。

模板可以是一种有机小分子、蛋白质、胞内分子或其他化合物。

根据目标分子的性质和应用需求,选择合适的目标分子进行印迹。

模板的物化性质对印迹物的形成和识别能力具有很大影响。

2. 功能单体选择:在印迹物的选择方面,通常选择具有与目标分子相互作用的功能单体。

功能单体可以通过与目标分子之间的氢键键合、离子键作用、范德华力等非共价作用力或共价键作用来选择和固定目标分子。

3. 预聚合体形成:选择合适的功能单体后,需要将其与交联剂共聚合形成三维聚合物网络。

功能单体通过与交联剂的共聚合,在高分子聚合物中形成特定的空腔结构。

这些空腔与目标分子的大小、形状和化学特性相适应,可以使目标分子在聚合物中得到选择性的识别和捕获。

4. 模板分子的去除:在印迹物形成后,需要将模板分子从聚合物中去除,以形成分子印迹空腔。

常用的去模板方法包括溶剂洗提、酸碱水解、热解、微波辅助去模板等。

经过去模板后,留下了与模板分子形状和功能相匹配的空腔结构,实现了对目标分子的高度选择性识别。

分子印迹技术的原理主要基于分子的空间结构和相互作用力。

通过在高分子聚合物中形成与目标分子形状和性质相适应的空腔结构,可以实现对目标分子的高度选择性识别和捕获。

在识别过程中,分子印迹物与目标分子之间发生分子识别反应,通过非共价作用力或共价键作用,实现了对目标分子的特异性识别。

与其他识别方法相比,分子印迹技术具有选择性好、稳定性高、重复性好、操作简单等优点。

分子印迹技术在生命科学、分析化学、环境监测等领域具有广泛的应用。

分子标记方法

分子标记方法

分子标记方法:AFLP原理和操作步骤AFLP原理:AFLP也是通过限制性内切酶片段的不同长度检测DNA多态性的一种DNA分子标记技术。

但AFLP是通过PCR反应先把酶切片段扩增,然后把扩增的酶切片段在高分辨率的顺序分析胶上进行电泳,多态性即以扩增片段的长度不同被检测出来。

实验中酶切片段首先与含有与其共同粘末端的人工接头连接,连接后的粘末端顺序和接头顺序就作为以后PCR反应的引物结合位点。

实验中,根据需要通过选择在末端上分别填加了1~3个选择性核苷的不同引物,可以达到选择性扩增的目的。

这些选择性核苷酸使得引物能选择性地识别具有特异配对顺序的内切酶片段,进行结合,导致特异性扩增。

实验试剂Taq酶、EcoRI/ MseIEcoRI/ MseI接头、E+A引物M+C引物、T4DNALigaseE和M引物、琼脂、过硫酸胺、丙烯酰胺、尿素、硝酸银、甲酰胺、dNTPs、二甲苯青、冰醋酸、玻璃硅烷、50bpMark操作步骤(一)基因组DNA提取和纯化参考大量提取DNA实验方法提取基因组DNA。

DNA的纯化:用0.8%琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)电泳检测片段大小,取出其中的1/3已提取的基因组DNA进行纯化,首先用TE缓冲液补满至总体积50ul,再等体积苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)、氯仿/异戊醇(24∶1)各抽提一次,离心吸上清液于Eppendorf 管中,加入1/10体积的NaAC和二倍体积预冷的无水乙醇,-20℃放置2h以上,10000g 离心10min,用70%的乙醇漂洗DNA沉淀2次,风干后溶于30μlTE缓冲液中,UV-2401PC 紫外分光光度计检测A260、A280值并定量,再用0.8%琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)电泳检测片段大小。

注:0.1-0.2g组织可用100ul溶液E溶,0.5g组织,溶液E可增加至300ul,此时DNA 浓度大约为100ng/ul。

(二)限制性酶切及连接在0.2ml离心管中加入:模板量约为250ng,2.5μl 10×酶切缓冲液,2.5μl 10×T4DNA 连接酶切缓冲液,5U EcoRⅠ,5U MseⅠ,2U T4连接酶,50pmol MseⅠ接头,双蒸水补至25μl。

分子标记——AFLP原理和操作步骤

分子标记——AFLP原理和操作步骤

分子标记——AFLP原理和操作步骤一、原理AFLP也是通过限制性内切酶片段的不同长度检测DNA多态性的一种DNA分子标记技术。

但AFLP是通过P CR反应先把酶切片段扩增,然后把扩增的酶切片段在高分辨率的顺序分析胶上进行电泳,多态性即以扩增片段的长度不同被检测出来。

实验中酶切片段首先与含有与其共同粘末端的人工接头连接,连接后的粘末端顺序和接头顺序就作为以后PCR反应的引物结合位点。

实验中,根据需要通过选择在末端上分别填加了1~3个选择性核苷的不同引物,可以达到选择性扩增的目的。

这些选择性核苷酸使得引物能选择性地识别具有特异配对顺序的内切酶片段,进行结合,导致特异性扩增。

二、实验试剂Taq酶、EcoRI/ MseIEcoRI/ MseI接头、E+A引物M+C引物、T4DNALigaseE和M引物、琼脂、过硫酸胺、丙烯酰胺、尿素、硝酸银、甲酰胺、dNTPs、二甲苯青、冰醋酸、玻璃硅烷、50bpMark三、操作步骤(一)基因组DNA提取和纯化A、参考实验一的大量提取DNA实验方法,B、DNA的纯化:用0.8%琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)电泳检测片段大小,取出其中的1/3已提取的基因组D NA进行纯化,首先用TE缓冲液补满至总体积50ul,再等体积苯酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)、氯仿/异戊醇(2 4∶1)各抽提一次,离心吸上清液于Eppendorf管中,加入1/10体积的NaAC和二倍体积预冷的无水乙醇,-20℃放置2h以上,10000g离心10min,用70%的乙醇漂洗DNA沉淀2次,风干后溶于30μlTE缓冲液中,U V-2401PC(岛津)紫外分光光度计检测A260、A280值并定量,再用0.8%琼脂糖凝胶(含EB0.5μg/ml)电泳检测片段大小。

注:0.1-0.2g组织可用100ul溶液E溶,0.5g组织,溶液E可增加至300ul,此时DNA浓度大约为100ng/ul。

(二)限制性酶切及连接在0.2ml离心管中加入:模板量约为250ng,2.5μl 10×酶切缓冲液, 2.5μl 10×T4DNA连接酶切缓冲液,5U EcoRⅠ,5U MseⅠ,2U T4连接酶,50pmol MseⅠ接头(序列见表2),双蒸水补至25μl。

分子标记的实验原理及操作流程

分子标记的实验原理及操作流程

一 AFLP 分子标记实验扩增片段长度多态性 Amplified fragment length polymorphism(AFLP 是在随机扩增多态性 (RAPD 和限制性片段长度多态性 (RFLP 技术上发展起来的 DNA 多态性检测技术, 具有 RFLP 技术高重复性和 RAPD 技术简便快捷的特点, 不需象 RFLP 分析一样必须制备探针, 且与 RAPD 标记一样对基因组多态性的检测不需要知道其基因组的序列特征,同时弥补了 RAPD 技术重复性差的缺陷。

同其他以 PCR 为基础的标记技术相比, AFLP 技术能同时检测到大量的位点和多态性标记。

此技术已经成功地用于遗传多样性研究, 种质资源鉴定方面的研究,构建遗传图谱等。

其基本原理是:以 PCR(聚合酶链式反应为基础, 结合了 RFLP 、 RAPD 的分子标记技术。

把 DNA 进行限制性内切酶酶切,然后选择特定的片段进行 PCR 扩增(在所有的限制性片段两端加上带有特定序列的“ 接头” , 用与接头互补的但 3-端有几个随机选择的核苷酸的引物进行特异 PCR 扩增, 只有那些与 3-端严格配对的片段才能得到扩增 , 再在有高分辨力的测序胶上分开这些扩增产物,用放射性法、荧光法或银染染色法均可检测之。

一、实验材料采用青稞叶片提取总 DNA 。

二、实验设备1. 美国贝克曼库尔特 CEQ8000毛细管电泳系统,2. 美国贝克曼库尔特台式冷冻离心机,3. 美国 MJ 公司 PCR 仪,4. 安玛西亚电泳仪等。

三、实验试剂1. 试剂:请使用高质量产品,推荐日本东洋坊 TOYOBO 公司的相关产品。

DNA 提取试剂盒;EcoRI 酶,MseI 酶,T4连接酶试剂盒;Taq 酶,dNTP, PCR reaction buffer;琼脂糖电泳试剂:琼脂糖,无毒 GeneFinder 核酸染料替代传统 EB 染料; 超纯水(18.2M Ω ·cm2.其他实验需要物品微量移液枪(一套及相应尺寸 Tip 头,PCR 管,冰浴等。

SSR分子标记实验流程

SSR分子标记实验流程

实验流程及操作SSR分子标记开发的流程主要有DNA提取、DNA质量监测、PCR扩增反应和非聚丙烯酰胺凝胶电泳。

1油棕DNA的提取DNA的提取一般有改良的CTAB法和SDS法,本实验室采用的是CTAB提取法。

由于购买液氮不变,提取液用的是CTAB提取缓冲液,其配方是:2%(w)CTAB,50 mol·L-1Tris·HCl (pH8.0),1.4 mol·L-1NaCl,20 mmol·L-1EDTA,2%(!) β- 巯基乙醇。

具体操作方法如下:取2g嫩叶片在约600ulCTA提取液进行磨样,直至所磨样品看不到嫩叶残渣为止;将磨好的样品分装到对应离心管中,之后在65℃的水浴锅中煮45min-1h 后,期间每隔10分钟左右将其拿起来轻轻摇匀约30次,水浴时间到后降温至室温;在水浴好后的离心管中加入500ul氯仿异戊醇并缓慢混匀30次,静置5min;在把样品配平后,在离心机中以10000rmp,25℃,离心8min;离心好后用移液枪吸取上清液,加入等体积冰冻的无水乙醇,轻轻混匀后静置10min;最后将DNA用枪头挑出,用75%乙醇或乙醇铵浸泡过夜,让其风干;风干后DNA用50ulddH2O培养于-20℃冰箱中。

2DNA质量检测将获得的DNA样品稀释1000倍后,用紫外分光光度计分别测定不同样品的DNA溶液在260、280nm波长下的OD值,以及OD260/OD280的比值,计算样品的纯度,并通过260nm处的吸光值计算样品中的DNA含量。

取1ulDNA,,加1ul10×loading buffer 和8ulddH2O 于ρ= 0.008 g·mL-1琼脂糖凝胶电泳,电压100v,电泳45min,于紫外透射仪下检测DNA降解情况[5~7]。

其中,水平电泳的步骤是:①、制胶:1﹪琼脂糖凝胶:1×TAE 50ml;REGULAR (琼脂糖) 0.5g;Goldview Nuleie 4ul∕Bioteko Corporation 2ul(染色剂)。

常用分子标记技术原理及应用

常用分子标记技术原理及应用

常用分子标记技术原理及应用分子标记技术是现代分子生物学、生物化学和生物医学研究中常用的重要方法之一,其原理是利用特定的物质(分子标记)与待检测分子结合,从而实现对待检测分子的定位、测定和分析。

常用的分子标记技术包括荧光标记、酶联免疫法(ELISA)、放射性同位素标记和生物素标记等,下面将详细介绍其中的原理及应用。

1.荧光标记技术荧光标记技术是一种基于物质固有性质的分子标记方法,其原理是将待检测物质与荧光染料结合,通过荧光信号的激发和发射实现对物质的定位和检测。

荧光标记技术具有高灵敏度、多重标记、高分辨率和实时监测等优点,在生物学研究和临床诊断中得到广泛应用。

例如,荧光标记技术可应用于细胞内分子定位、蛋白质相互作用研究和病原体检测等领域。

2.酶联免疫法(ELISA)酶联免疫法是一种常用的免疫学实验方法,其原理是将待检测物质与特异性抗体结合,然后再用酶标记的二抗对抗体进行反应,通过酶底物的转化反应实现对待检测物质的定性和定量分析。

酶联免疫法具有高灵敏度、高特异性和简单易行等特点,在医学诊断和生物分析中被广泛应用。

例如,酶联免疫法可用于检测临床血清中的肿瘤标志物、抗体和炎症因子等,对于早期疾病诊断、药物研发和治疗效果评估具有重要意义。

3.放射性同位素标记技术放射性同位素标记技术是一种基于放射性元素的分子标记方法,其原理是将待检测物质与放射性同位素结合,通过放射性同位素的放射衰变实现对物质的定位和追踪。

放射性同位素标记技术具有极高的灵敏度和追踪性,广泛应用于核医学、分子显像和生物研究等领域。

例如,放射性同位素标记技术可用于肿瘤显像、药物代谢研究和放射免疫测定等,对于肿瘤早期诊断、药物研发和治疗效果评估有着重要的作用。

4.生物素标记技术生物素标记技术是一种基于生物素-亲和素相互作用的分子标记方法,其原理是将待检测物质与生物素结合,通过生物素和亲和素之间的特异性结合实现对物质的定位和检测。

生物素标记技术具有高特异性、高亲和力和多重标记等优势,在生物学研究和生物医学中得到广泛应用。

分子标记实验流程

分子标记实验流程

实验方案:
1 DNA的提取
1.1 DNA浓度与纯度的测定
注意纯度的评判标准。

1.3 DNA完整性的检测:
琼脂糖凝胶电泳:操作过程以及所用相关试剂的配制
2 RAPD/ISSR分析
2.1 体系的优化
包括:DNA浓度、Taq DNA聚合酶用量、dNTP浓度、mg离子浓度、引物浓度
2.1.1 正交优化试验
2.1.2 单因素试验
2.2 PCR反应程序优化
包括:引物退货温度的选择;循环次数的选择
2.3 遗传多样性分析
所用软件:NTSYS;POPGENE等。

遗传相似性系数;群居总遗传多样性(Ht);居群内遗传多样性(Hs);各居群间的遗传分化指数(Gst);基因流(Nm);nei’s遗传距离,有效等位基因数(Ne)等。

具体参考文献!。

分子标记详细教程

分子标记详细教程

分子标记详细教程分子标记是一种广泛应用于生物学和生物化学研究中的技术,它能够帮助科学家们定位、观察和分析分子的位置和功能。

在这个教程中,我们将详细介绍分子标记的原理和方法,并讲解如何正确地进行分子标记实验。

一、分子标记的原理分子标记是利用特定的化学物质(标记物)对目标分子进行标记,从而使其在实验中能够被观察和检测到。

常用的分子标记方法包括荧光标记、放射性标记和酶标记等。

这些方法都基于不同的原理,但最终目的都是通过标记物的特性来实现对目标分子的检测和定位。

二、分子标记的方法1.荧光标记:荧光标记是最常用的分子标记方法之一。

它利用具有荧光特性的染料或荧光蛋白对目标分子进行标记,然后利用荧光显微镜等设备观察荧光信号。

这种方法可以实现对分子位置、形态和数量的检测。

2.放射性标记:放射性标记是利用放射性同位素对目标分子进行标记。

通过测量目标分子放射出的射线,可以得到目标分子的定量和定位信息。

这种方法在一些需要高灵敏度和高分辨率的实验中被广泛应用。

3.酶标记:酶标记是利用酶对目标分子进行标记。

酶标记的原理是将酶与目标分子结合,然后通过酶的催化作用来检测目标分子的存在和活性。

常用的酶标记方法包括辣根过氧化物酶(HRP)标记和碱性磷酸酶(AP)标记等。

三、分子标记实验步骤1.选择适合的标记物:根据实验需求和目标分子的特性,选择合适的标记物进行标记。

常用的标记物包括荧光染料、放射性同位素和酶等。

2.标记物与目标分子的结合:将标记物与目标分子进行反应,使它们发生特异性结合。

这一步骤需要注意反应条件的控制,以确保标记物与目标分子的结合效率和特异性。

3.纯化标记产物:通过一系列的纯化步骤,将标记物和未反应的物质进行分离,得到纯净的标记产物。

纯化的方法可以根据标记物的特性和实验需求选择。

4.标记物的检测和定位:利用相应的检测方法对标记物进行检测和定位。

具体的方法可以根据标记物的特性和实验需求选择,如荧光显微镜、放射性计数器和酶标仪等。

高中生物分子标记实验教案

高中生物分子标记实验教案

高中生物分子标记实验教案
实验目的:通过分子标记实验,掌握分子标记的原理和方法,了解如何利用分子标记技术进行生物研究。

实验材料:离心管、标记试剂、DNA溶液、电泳仪、琼脂糖凝胶板、UV灯等。

实验步骤:
1. 提取样品DNA:将待检测的样品(如甲骨文)通过DNA提取试剂盒提取出DNA溶液。

2. 标记DNA:在离心管中加入标记试剂和提取的DNA溶液,轻轻摇匀,放置一段时间进行反应。

3. 准备琼脂糖凝胶板:将琼脂糖溶液熔化后倒入凝胶板,待凝固。

4. 电泳分析:将已标记的DNA溶液加载到凝胶板上,进行电泳分析,根据标记物在凝胶板上不同位置形成的条带进行分析。

5. 结果分析:观察凝胶板上的条带图案,根据不同条带的位置和强度判断标记DNA的情况,并得出实验结论。

实验注意事项:
1. 操作过程要保持洁净,避免污染样品。

2. 操作中要注意避免标记物的接触,避免误伤。

3. 谨慎操作电泳仪,避免发生安全事故。

实验拓展:
1. 可以尝试不同的标记试剂,比较不同标记试剂的效果。

2. 可以通过改变电泳条件,比如电场强度和运行时间,观察对分子迁移的影响。

实验总结:
通过本实验,学生将掌握分子标记技术的基本原理和方法,培养实验操作能力和数据分析能力,为将来从事生物研究奠定基础。

分子标记原理和技术

分子标记原理和技术

分子标记原理和技术分子标记原理和技术是一种用于研究和检测生物分子的方法。

分子标记是通过给生物分子附上一种特定的标记物,使其能够被观察和测量。

分子标记技术在生物医学研究、临床诊断、药物研发和环境监测等领域都有广泛的应用。

分子标记的原理是利用化学反应将标记物与待检测的生物分子结合起来,然后通过适当的方法观察或检测标记物。

常见的标记物有荧光染料、放射性同位素、酶和金纳米粒子等。

标记物的选择要考虑其化学性质、稳定性、检测灵敏度和特异性等因素。

分子标记技术有很多种,下面列举几种常见的技术:1.荧光标记:荧光标记是最常用的分子标记技术之一、通过给生物分子附加荧光染料,可以通过荧光显微镜观察其分布和表达水平。

荧光标记还可以用于流式细胞术、酶联免疫吸附实验等。

荧光标记可以选择多种不同的荧光染料,如草莓红、FITC和PE等。

2.放射性标记:放射性标记是利用放射性同位素将标记物与生物分子结合起来。

这种标记方法可以通过放射性计数器或放射影像技术来检测,具有极高的灵敏度。

常用的放射性同位素有3H(氚)、14C(碳14)和32P(磷32)等。

3.酶标记:酶标记是利用酶与底物之间的反应来检测生物分子。

常用的酶有辣根过氧化物酶(HRP)和碱性磷酸酶(AP)。

酶标记技术可以通过底物的颜色变化或荧光信号来观察酶的活性和分布。

4. 化学标记:化学标记是利用特定化学反应将标记物与生物分子结合起来。

常见的化学标记方法有SNAP标记、CLIP标记和Biotin-avidin 标记等。

化学标记的优点是反应选择性高,标记物的稳定性和特异性好。

5.金纳米粒子标记:金纳米粒子标记是一种新兴的分子标记技术。

金纳米粒子可以通过调节粒子大小和表面修饰来实现对生物分子的特异性识别。

金纳米粒子标记可以通过紫外-可见吸收光谱或扫描电镜观察。

分子标记技术在生物学研究中扮演着重要角色,能够帮助科学家观察和分析生物分子的功能和相互作用。

此外,分子标记技术还被广泛应用于临床诊断和药物研发领域,例如用于检测肿瘤标记物、鉴定药物靶点和筛选药物库。

分子标记原理和技术

分子标记原理和技术

分子标记原理和技术分子标记是一种用于追踪和分析生物分子的技术,在生命科学研究中得到广泛应用。

它通过在特定分子上加上标记物,如荧光染料、放射性同位素或酶等,来实现对这些分子的检测和定位。

分子标记技术的原理主要包括标记物的选择和绑定、信号的检测和分析等方面。

分子标记技术的核心是选择适合的标记物,并将其与目标分子进行特异性的结合。

常用的标记物包括荧光染料、放射性同位素和酶等。

荧光染料是一类可发光的化学物质,可以通过荧光显微镜来检测其存在和分布情况。

放射性同位素则利用放射性衰变的原理,通过放射性测量仪来检测其辐射信号。

酶则是一类能够催化特定化学反应的蛋白质,通过对酶反应进行检测来间接地确定目标分子的存在。

标记物与目标分子的结合方式多种多样,常用的方法包括共价结合、亲和结合和非共价结合等。

共价结合是指通过化学反应将标记物与目标分子共同连接起来,常用的反应有偶氮化反应、醛基化反应等。

亲和结合则是利用亲和分子对目标分子进行特异性结合,常用的亲和分子包括抗体、配体等。

非共价结合则是通过分子间的非共价相互作用来实现标记物与目标分子的结合,如疏水相互作用、静电相互作用等。

分子标记技术中信号的检测和分析是至关重要的一步。

对于荧光标记物,需要使用荧光显微镜来观察目标分子的荧光信号,并通过图像处理和分析来定量分析目标分子的数量和分布情况。

对于放射性同位素标记物,需要使用放射性测量仪来测量目标分子的放射性信号,并通过计数方法来确定目标分子的数量。

对于酶标记物,需要使用酶反应底物来触发酶催化反应,产生可测量的信号,如颜色变化、发光等,通过光谱仪或分光光度计来检测和分析。

分子标记技术具有许多优点,如高灵敏度、高特异性、高分辨率等。

它可以用于检测和定位生物分子,如蛋白质、核酸等,也可以用于研究生物分子的相互作用、代谢途径等。

分子标记技术在生命科学研究中的应用非常广泛,如免疫组织化学、原位杂交、蛋白质定位、细胞追踪等。

2. Saha K, Agasti SS, Kim C, Li X, Rotello VM. Gold nanoparticles in chemical and biological sensing. Chem Rev. 2024;112(5):2739-2779.。

分子标记等实验步骤

分子标记等实验步骤

实验一植物DNA的提取与分离一、目的:学习并掌握CTAB法提取植物总DNA的原理和操作步骤。

二、原理和方法关于植物总DNA的提取方法相关文献报道很多,但从提取原理上看主要有二种:CTAB法及SDS法。

1、CTAB(十六烷基三乙基溴化铵)法:CTAB是一种去污剂,可溶解细胞膜,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中(0.7mol/L NaCl)是可溶的。

采用氯仿/异戊醇抽提蛋白质,通过离心就可将CTAB与核酸的复合物同蛋白质、多糖类物质分开,然后将CTAB与核酸的复合物溶液加入乙醇使核酸沉淀,CTAB能溶解于乙醇。

CTAB法提取DNA最初用于冷冻干燥的材料。

其程序及试剂比例经适当改动后也于新鲜植物组织及细胞器DNA的提取。

用冷冻干燥材料提取时,使用1×CTAB。

用新鲜材料提取时使用2×CTAB缓冲液。

实验需要注意的问题是CTAB溶液在15℃以下会发生沉淀,所以含CTAB 的溶液不能在低温下离心。

与SDS法相比,CTAB法的最大优点是能很好地去除糖类杂质,对于含糖较高的材料可优先采用,该方法另一个特点是在提取的前期能同时得到高含量的DNA和RNA。

2、SDS(十二烷基硫酸钠)法:其原理是利用高浓度的SDS,在较高温度( 55~65℃ )条件下裂解细胞,使染色体离析,蛋白质变性,释放出核酸,然后采用提高盐浓度及降低温度的作法使蛋白质及多糖杂质沉淀 (有的是加 5mol/L的KAC于冰上保温,在低温条件下 KAC与蛋白质及多糖结合成不溶物),离心除去沉淀后,上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,反复抽提后用乙醇沉淀水相中的DNA。

SDS法操作简单,温和,也可提取到分子量较高的DNA,但所得产物含糖类杂质较多。

三、材料、试剂和仪器1试验材料:新鲜或超低温冷冻干燥植物组织0.2g2试剂:无水乙醇,70%乙醇,氯仿2%CTAB提取缓冲液:2g/100ml CTAB100mmol/L Tirs·Cl(pH=8.0)50mmol/L EDTA(pH=8.0)700mmol/L Nacl(pH=8.0)3 仪器设备:恒温水浴锅,离心机,移液器及配套枪头,离心管,研钵四、步骤1)取约0.2g叶在含有750ul左右提取缓冲液的研钵中磨碎,后转至1.5ml 的离心管中,60℃水浴30min~1h,其间轻轻颠倒2-3次;2)取出冷至室温,然后用等体积氯仿-异戊醇(24:1)轻轻混匀并颠倒约5~10min,然后10000r/min离心10min;3)轻轻取出,用一新的离心管移出上清液,然后用2倍体积的预冷(-20℃)无水乙醇沉淀;4)待DNA收缩成团后,将其用70%乙醇洗1~2次后,干燥,然后用无离子水溶解后保存在-20℃冰箱中备用。

RAPD分子标记的实验原理及操作流程

RAPD分子标记的实验原理及操作流程
一、实验材料
不同来源的()。
二、实验设备
仪,管或硅化的 管,电泳装置,凝胶成像仪。
三、试剂
、引物:购买成品引物序列合成。
、酶
、缓冲液
、:。
、:。
四、操作步骤:
.在反应体系中,加入
模板()
引物(约)
酶单位()

混匀稍离心,加一滴(约)矿物油。
.在仪中预变性c分钟,然后循环:°C分钟,°C分钟,°C分钟,共轮循环。
分子标记的实验原理及操作流程
标记原理
技术的全称是随机扩增多态性(),此技术建立于基础之上,使用一系列 具有个左右碱基的单链随机引物, 对基因组的全部进行扩增,以检测多态性。由 于整个基因组存在众多反向重复序列,因此须对每一随机引物单独进行,单一引 物与反向重复序列结合,使重复序列之间的区域得以扩增。引物结合位点序列的 改变以及两扩增位点之间碱基的缺失、插入或置换均可导致扩增片段数目和长度 的差异,经琼脂糖凝胶电泳分离后通过染色以检测片段的多态性。
.循环结束后,c分钟,C保存。
.在产物中加上样缓冲液()于琼脂糖胶上电成像仪观察、拍照。
注:样品可以采用新鲜样品,硅胶干燥样品,标本等
提取可采用或法
质量检测可用紫外分光光度计法和电泳法
操作流程简图:

ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记的实验原理及操作流程

ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记的实验原理及操作流程

ISSR(inter-simple sequence repeat)分子标记的实验原理及操作流程ISSR(inter-simple sequence repeat)标记是一种类似RAPD,但利用包含重复序列并在3’或5’锚定的单寡聚核酸引物对基因组进行扩增的标记系统,即用SSR引物来扩增重复序列之间的区域。

其原理具体是,ISSR 标记根据生物广泛存在 SSR的特点,利用在生物基因组常出现的SSR本身设计引物,无需预先克隆和测序。

关键词:标记分子ISSRinter-simplesequencerepeatSSR引物RAPD分子标记单寡聚核酸ISSR标记ISSR(inter-simple sequence repeat)标记是一种类似RAPD,但利用包含重复序列并在3’或5’锚定的单寡聚核酸引物对基因组进行扩增的标记系统,即用SSR引物来扩增重复序列之间的区域。

其原理具体是,ISSR标记根据生物广泛存在SSR的特点,利用在生物基因组常出现的SSR本身设计引物,无需预先克隆和测序。

用于扩增的引物一般为16-18个碱基序列,由1-4个碱基组成的串联重复和几个非重复的锚定碱基组成,从而保证了引物与基因组DNA 中SSR的5’或3’末端结合,导致位于反向排列、间隔不太大的重复序列间的基因组节段进行PCR扩增。

一、实验材料不同来源的DNA(30-50ng/ul)。

二、实验设备PCR仪,PCR管或硅化的0.5ml eppendorf管,电泳装置,凝胶成像仪。

三、试剂1、ISSR引物:购买成品或根据加拿大British Columbia大学设计的ISSR引物序列(见附录)自己合成。

2、Taq酶3、10xPCR 缓冲液4、MgCl2:25mmol/L。

5、dNTP:2.5mmol/L。

四、操作步骤:1. 在25ul反应体系中,加入模板DNA 1ul (30-50ng)ISSR引物1ul (约5pmol)10xPCR Buffer 2.5ulMgCl22uldNTP 2ulTaq酶1单位(U)加ddH2O 至25ul混匀稍离心, 加一滴(约20 ul)矿物油。

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MgCl2
1.6ul
dNTPs(2.5mM) 1.6ul
Taq 酶(1U/ul) 1ul
10×Buffer
2ul
预扩增程序:
94℃ 2min
94℃ 20s
56℃ 30s 20cycles
72℃ 2min
60℃ 30min
6、选择性扩增(20ul 体系/样品)
sample
4ul(预扩增产物稀释 20 倍)
进的荧光标记技术和毛细管电泳分离技术进行实验,扩增产物在高分辨率毛细管中电泳 分离,采用激光激发荧光采集数据,灵敏度极高,电泳结果通过软件自动统计分析并转 换成“0、1”矩阵,便于对结果进一步深入分析研究,整个电泳、数据采集和数据分析 过程由软件来控制完成,最大程度避免了人工操作造成的误差,提高了数据的可靠性。
T4 DNA Ligase
2ul(1U/ul)
10×Buffer
2ul
sample(双酶切产物)
10ul
Mse1 Adaptor
1ul
22℃ 3hrs
65℃ 10min 终止反应
EcoR1 Adaptor
1ul
ddH2O
4ul
5、预扩增(20ul 体系/样品)
sample
4ul
Primer(Mse1/EcoR1)
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Fax: +86 532 80998005
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E-ACC: 5-GACTGCGTACCAATTCACC-3
M-CAA: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACAA-3 M-CAC: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACAC-3 M-CAG: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACAG-3 M-CTA: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACTA-3 M-CAT: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACAT-3 M-CTC: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACTC-3 M-CTG: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACTG-3 M-CTT: 5-GAT GAG TCC TGA GTA ACTT-3
1ul
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AFLP Core Mix
15ul
* AFLP Core Mix 配方:
ddH2O
13.8ul
一、 实验材料 采用青稞叶片提取总 DNA。
二、 实验设备 1.美国贝克曼库尔特 CEQ8000 毛细管电泳系统, 2.美国贝克曼库尔特台式冷冻离心机, 3.美国 MJ 公司 PCR 仪, 4.安玛西亚电泳仪等。
三、 实验试剂 1. 试剂:请使用高质量产品,推荐日本东洋坊 TOYOBO 公司的相关产品。
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E-AAC: 5-GACTGCGTACCAATTCAAC-3
E-ACA: 5-GACTGCGTACCAATTCACA-3
E-AGC: 5-GACTGCGTACCAATTCAGC-3
E-ACT: 5-GACTGCGTACCAATTCACT-3
E-AAG: 5-GACTGCGTACCAATTCAAG-3
四、操作步骤:
1. 在 25ul反应体系中,加入
模板DNA 1ul (30-50ng)
ISSR引物 1ul (约 5pmol)
10xPCR Buffer 2.5ul
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Fax: +86 532 80998005
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产物电泳数据采集在 CEQ8000 遗传分析系统上进行(图 1),得到的数据(图 2)
用第三方软件再进一步统计分析。 图 1 AFLP 分子指纹图谱
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Primer(Mse1-XXX/EcoR1-XXX) 1ul
AFLP Core Mix
15ul
选择性扩增程序:
94℃ 2min
94℃ 20s
66℃ 30s
每循环降 1℃,共 10 个循环
72℃ 2min
94℃ 20s
56℃ 30s
20 个循环
72℃ 2min
60℃ 30min
7、产物电泳检测
上样液:Loading Buffer
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Panel A: AFLP fingerprints of control maize DNA using EcoR1 primer E-AGG with eight Mse1 primers: M-CAA (1), M-CAC (2), M-CAG (3), M-CAT (4), M-CTA (5), M-CTC (6), M-CTG (7), and M-CTT (8).
DNA 提取试剂盒; EcoRI 酶,MseI 酶,T4 连接酶试剂盒; Taq 酶,dNTP, PCR reaction buffer; AFLP 引物;
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琼脂糖电泳试剂:琼脂糖,无毒 GeneFinder 核酸染料替代传统 EB 染料; 超纯水(18.2MΩ·cm) 2.其他实验需要物品 微量移液枪(一套)及相应尺寸 Tip 头,PCR 管,冰浴等。
附录 2:AFLP 传统垂直板电泳(银染法检测)介绍: 原理与方法同前,区别:1.选择性扩增引物不带荧光标记;2.电泳方法不同,采用测序
胶垂直板电泳;3.电泳结果采用银染法,比较直观,但条带的统计与分析全人工化,工作量 大,银染法灵敏度比荧光标记法要低。
示例:下图为玉米(maize)DNA 的 AFLP 图谱。
四、 实验流程
1、 总 DNA 提取
使用 DNA 提取试剂盒提取植物基因组 DNA,通过紫外分光光度计检测或用标准品跑
胶检测。一般来说,100ng 的基因组 DNA 作为反应模板是足够的。
2、 EcoR1 酶消化(20ul 体系/样品)
EcoR1
1ul (10U/ul)
10×Buffer
2ul
37℃ 2hrs
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MgCl2 2ul dNTP 2ul Taq酶 1 单位(U) 加ddH2O 至 25ul 混匀稍离心, 加一滴(约 20 ul)矿物油。 2. 在PCR仪中预变性 94℃ 2 分钟, 然后循环: 94℃ 1 分钟,45℃-68℃ 40 秒,72℃ 1-2 分钟,共 40 轮循环。 3. 循环结束后, 72℃ 10 分钟,4℃保存。 4. 取PCR产物 15ul加 3ul上样缓冲液(6x)于 1.6% 或 1.8% 琼脂糖胶上电泳, 稳压 50-100 V(电压低带型整齐, 分辨率高)。 5. 电泳结束,溴化乙锭染色 20 分钟。 6. 用凝胶成像仪观察、拍照。
其基本原理是:以PCR(聚合酶链式反应)为基础,结合了RFLP、RAPD的分子标记技术。 把DNA进行限制性内切酶酶切,然后选择特定的片段进行PCR扩增(在所有的限制性片段两 端加上带有特定序列的“接头”,用与接头互补的但3-端有几个随机选择的核苷酸的引物进行 特异PCR扩增,只有那些与3-端严格配对的片段才能得到扩增),再在有高分辨力的测序胶上 分开这些扩增产物,用放射性法、荧光法或银染染色法均可检测之。
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一 AFLP 分子标记实验
扩增片段长度多态性Amplified fragment length polymorphism(AFLP)是在随机扩增多 态性(RAPD)和限制性片段长度多态性(RFLP)技术上发展起来的DNA 多态性检测技术, 具有RFLP技术高重复性和RAPD技术简便快捷的特点,不需象RFLP分析一样必须制备探针, 且与RAPD标记一样对基因组多态性的检测不需要知道其基因组的序列特征,同时弥补了 RAPD技术重复性差的缺陷。同其他以PCR为基础的标记技术相比,AFLP技术能同时检测到 大量的位点和多态性标记。此技术已经成功地用于遗传多样性研究,种质资源鉴定方面的研 究,构建遗传图谱等。
20ul
Size standard-600
0.2ul
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Fax: +86 532 80998005
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Sample
3ul(稀释 10 倍)
四、实验结果与分析 本实验使用贝克曼库尔特(BeckmanCoulter)公司 CEQ8000 遗传分析系统,运用先
Tel: +86 532 80998002
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二 ISSR 分子标记的实验原理及操作流程
ISSR(inter-simple sequence repeat)标记是一种类似 RAPD,但利用包含重复序列 并在 3’或 5’锚定的单寡聚核酸引物对基因组进行扩增的标记系统,即用 SSR 引物来扩增重 复序列之间的区域。其原理具体是,ISSR 标记根据生物广泛存在 SSR 的特点,利用在生物 基因组常出现的 SSR 本身设计引物,无需预先克隆和测序。用于扩增的引物一般为 16-18 个碱基序列,由 1-4 个碱基组成的串联重复和几个非重复的锚定碱基组成,从而保证了引物 与基因组 DNA 中 SSR 的 5’或 3’末端结合,导致位于反向排列、间隔不太大的重复序列间的 基因组节段进行 PCR 扩增。
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